定量PCR基本原理
荧光定量 pcr 的基本原理和步骤
荧光定量PCR的基本原理和步骤
荧光定量PCR(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)是一种常用的分子生物学技术,可以用于检测和定量DNA或RNA分子。
其基本原理是在PCR过程中加入荧光探针,通过监测荧光信号的强度来定量PCR产物的数量。
下面是荧光定量PCR的基本步骤:
1. 样品处理:首先需要从待检测样品中提取DNA或RNA,并进行适当的处理,例如反转录、扩增等。
2. 设计引物:根据待检测的目标序列设计特异性引物。
3. PCR反应体系的制备:将引物、荧光探针、dNTPs、PCR缓冲液等混合,制备PCR反应体系。
4. PCR反应:将样品DNA或RNA与PCR反应体系混合,进行PCR反应。
5. 荧光定量:在PCR反应过程中,荧光探针会结合到目标序列上,并通过荧光信号的产生来检测PCR产物的数量。
在荧光定量PCR中,通常采用SYBR Green或TaqMan探针来检测PCR产物的数量。
6. 数据分析:通过对荧光信号的强度进行分析,计算出样品中目标序列的数量,并进行比较和分析。
需要注意的是,在荧光定量PCR中,需要选择合适的荧光探针和荧光信号检测系统,以确保准确和可靠的结果。
此
外,为了避免PCR过程中的污染和误差,需要严格控制PCR 反应条件和操作流程。
定量pcr的方法
定量pcr的方法定量聚合酶链反应(Quantitative Polymerase Chain Reaction,qPCR)是一种在实验室中常用的分子生物学技术,旨在定量测定DNA或RNA分子的相对丰度。
本文将详细介绍定量PCR的原理、操作步骤以及应用领域。
一、定量PCR的原理定量PCR的原理基于聚合酶链反应(PCR)技术,该技术通过复制模板DNA 或RNA分子的特定片段来实现特异性扩增,从而产生大量复制产物。
在定量PCR 中,引入一种特定的荧光探针,该荧光探针与扩增产物结合,并在每个扩增周期的末端释放荧光信号。
荧光信号的数量与初始模板分子量成正比,因此可以通过测量荧光信号的强度来定量PCR产物中的特定DNA或RNA分子序列的相对丰度。
二、定量PCR的操作步骤1. 制备PCR反应体系:将反应缓冲液、模板DNA或RNA、引物、荧光探针、聚合酶、核苷酸和水混合制备反应体系。
反应体系中的核苷酸是用来提供DNA 或RNA的基本成分。
2. 热循环条件设置:选择合适的PCR仪,并设置合适的热循环条件。
热循环的三个步骤包括变性、退火和扩增。
3. 变性步骤:将反应体系加热至高温,通常为94-98,使DNA或RNA解性,即DNA双链分离,RNA变性为单链,使模板分子可供扩增。
4. 退火步骤:降低温度到引物特异性结合的温度,引物会与模板分子特异性结合,这通常在50-65之间进行。
5. 扩增步骤:将退火的反应体系加热至合适的温度,通常为72,此时聚合酶开始合成新的DNA链,延伸引物。
该步骤重复多次,每次扩增会产生两倍数量的DNA或RNA分子。
6. 荧光检测:在PCR反应进行过程中,荧光探针会与扩增产物结合,并在每个扩增周期的末端释放荧光信号。
荧光信号的强度与扩增产品的数量成正比。
7. 数据分析:使用特定的软件来分析荧光信号数据,将其转化为反应物的初始模板浓度。
可以通过比较不同样本的荧光信号强度来定量比较DNA或RNA的相对丰度。
荧光定量pcr的原理方法
荧光定量pcr的原理方法
荧光定量PCR(Fluorescent Quantitative PCR,qPCR)是一种用荧光信号量化检测PCR产物的方法,用于定量分析目标DNA或RNA的含量。
荧光定量PCR的基本原理如下:
1.引物设计:设计特异性引物,使其能够特异性地扩增目标DNA或RNA序列。
2.模板DNA或RNA的提取:从样品中提取目标DNA或RNA。
3.cDNA合成:对于RNA样品,需要首先将RNA反转录成cDNA,作为PCR 的模板。
4.Real-time PCR扩增反应:将模板DNA或cDNA与引物和荧光探针一起加入PCR反应体系中,进行实时PCR扩增。
PCR反应体系中还包括核苷酸,聚合酶和缓冲液等。
5.荧光信号检测:随着PCR的进行,荧光探针被解旋成单链,释放出与之配对的荧光染料。
荧光染料产生荧光信号,信号强度与扩增产物的数量成正比。
6.荧光信号检测系统:荧光信号检测系统实时检测PCR反应体系中的荧光信号,并将其转换成数值。
7.标准曲线绘制:通过使用已知浓度的标准品进行一系列稀释,绘制出标准曲线。
标准曲线将荧光信号强度与目标DNA或RNA的初始浓度之间建立了一个标准关系。
8.样品定量:通过对样品的荧光信号强度进行测量,并使用标准曲线进行插值计算,确定样品中目标DNA或RNA的初始浓度。
荧光定量PCR具有高灵敏度、高特异性、宽动态范围、低检测限和快速分析等优点,广泛应用于分子生物学和疾病诊断等领域。
概述荧光定量PCR技术的基本原理
概述荧光定量PCR技术的基本原理
荧光定量PCR技术是一种用于定量测量目标DNA序列数量的技术。
它基于普通PCR技术,但在PCR反应中引入了一种荧光探针,以实现对产物扩增过程的实时监测和定量测量。
实现荧光定量PCR的基本原理如下:
1. 选择适当的引物和荧光探针:引物用于特异性扩增目标DNA序列,而荧光探针用于标记并检测PCR产物的存在。
2. 引物和荧光探针的设计:引物的设计要确保特异性扩增目标DNA序列,而荧光探针通常由一个荧光染料和一个荧光淬灭器组成,荧光染料在引物与目标DNA序列结合时发荧光信号,而荧光淬灭器则抑制荧光信号。
3. PCR反应条件的设置:包括扩增温度、循环数等参数的设置,以确保高效的PCR扩增反应。
4. 实时监测PCR反应:在PCR反应过程中,荧光探针与目标DNA序列结合并发荧光信号,荧光信号的增加与PCR产物的扩增过程成正相关。
通过荧光信号的强度可以定量测量目标DNA序列的数量。
5. 分析数据:根据荧光信号的强度和扩增循环数,可以绘制荧光增幅曲线,并通过内部标准物质或标准曲线来计算目标DNA序列的浓度。
荧光定量PCR技术具有高灵敏度、高特异性和高准确性的优点,可以用于基因表达分析、突变检测、病原体检测等领域。
定量PCR基本原理及方法
FRET 定量分析,熔解曲线分析,基因型分析
Ampliflour Probe,LUX 定量分析
➢ 基因型分析
利用扩增信号的种类来分型 —— Taqman 根据熔解曲线的不同来分型 —— FRET, Molecular Beacon
➢ 荧光定量PCR的定量原理
RePaCl-Rti的m理e论C方he程m:isYt=rxie×s(1+ Ev)n
Y:扩增物数量; X :起始模板数量;Ev:扩增效率;n:扩增循环数
1. 终点法定量原理 前提:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同 原理:根据扩增产物的量计数反应物中原始分子数,即: lnx=lnY-n×ln(1+Ev)=lnY - b (b为常数)
R
3’
3’
3’
5’
QQQ
Q
5’
分子信标(Molecular Beacon Probe)
R ExcitatEiomnission Q
Excitation
荧光共振能量传递(FRET Probe)
Oligo 1: Fluorescein Excitation
Transfer
Oligo 2: LC Red 640 Emission
2. 实时检测法定量原理 前提:在最佳实验、相同Ev以、扩增产物量相同 原理:反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n)成反比, 由此计算出标本中靶分子的准确含量,即: LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)
✓ n: 扩增循环数的确定
PCR efficiency =[10(-1/slope)]-1 Where slope=1/m
定量PCR 简介
定量PCR简介聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)是微量核酸扩增的有效工具,由于其灵敏、特异、快速等优点,在医学上已广泛应用与病毒、细菌病原体及遗传病、肿瘤的早期诊断。
随着PCR技术的发展,特别是病毒或肿瘤的治疗监测、疾病的诊断、机体基因表达调控方面,不仅需要检测其存在是否;而且还需要得知扩增前标本中的模板的数量,因而必须对PCR进行定量检测,即定量PCR技术,本文将对定量PCR的定量原理、技术类型以及相关进展方面综述如下:一、定量PCR的基本原理:在PCR实验条件下(Mg++、缓冲液、Taq酶、dNTP、引物、模板),经变性→退火→延伸的一个循环,引物在退火阶段与相应的模板结合,在延伸阶段进行复制,此时产物为:Yn=Yn-1×(1+Ev) ,Yn:n个PCR循环后PCR产物的分子数;Yn-1:为n-1个热循环后PCR产物的分子数;Ev:为扩增效率,0≤Ev≤1;若n个热循环中其Ev是一致的话,经n个循环后的扩增产物的分子数(Y)和反应物中原始分子数(X)之间关系,可描述为:Y=x×(1+ Ev)n。
1. 终点法定量原理:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同的前提下,根据扩增产物的量可以计数出反应物中原始分子数,若核酸提取效率相同(与标准品),进而计算出标本中靶分子的准确含量,即:lnx=lnY-n×ln(1+Ev)=lnY - b (b为常数)2. 实时检测法定量原理:在最佳实验、相同Ev以及相同扩增产物的情况下,反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n)成反比,若核酸提取效率相同(与标准品),进而计算出标本中靶分子的准确含量,即:LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)3. 扩增效率(Ev)的影响因素:以上所述的定量原理均假定反应体系中扩增效率是不变,但是,实际上,Ev在不同的扩增管之间和同一扩增管的不同循环次数之间是不同,如何控制及解决Ev的变异以及标本制备的可靠性是PCR定量的可靠性所在,也是定量PCR的发展方向,那么,Ev的影响因素有:a. 引物和靶序列的结合能力(G+C%及突变),扩增产物的长度,G+C含量。
荧光定量PCR技术原理与结果分析
荧光定量PCR技术原理与结果分析一、荧光定量PCR技术原理1.基本原理荧光定量PCR技术基于传统的PCR技术,其中关键的步骤是DNA的扩增。
PCR过程中,DNA模板会通过聚合酶链式反应在多个循环中进行指数级扩增。
在扩增过程中,每一个循环都包括三个主要步骤:变性,引物结合和扩增。
2.荧光标记3.荧光信号检测与分析在PCR反应的扩增过程中,荧光强度会随着PCR产物的扩增而增加。
荧光信号的强度与扩增目标DNA的数量成正比。
因此,通过测量PCR反应中发出的荧光信号的强度,可以确定目标DNA的起始数量。
二、荧光定量PCR技术结果分析1.标准曲线2.反应效率反应效率是PCR扩增的关键因素之一、反应效率是通过标准曲线的斜率来表示的,斜率越接近1,表示反应效率越高。
较低的PCR反应效率可能是由于试剂的浓度不足、PCR条件不合适或者目标DNA的起始浓度低。
3.CT值CT值是PCR反应过程中,荧光信号由背景噪声中分离出来的阈值周期数。
在荧光定量PCR实验中,CT值用于计算目标DNA的起始浓度。
CT值越小,表示目标DNA的起始数量越多。
4.荧光指数荧光指数是指测量PCR反应中特定周期(一般为指定阈值之后的周期)的荧光信号的增加量。
荧光指数也可以用来评估PCR的效果和目标DNA的起始数量。
荧光指数越高,表示目标DNA的起始数量越多。
5.目标基因的相对表达量总结起来就是,荧光定量PCR技术通过引入荧光标记的引物和探针,在PCR反应中实时监测荧光信号的强度变化来定量分析目标DNA的起始数量。
通过制备标准曲线、测量CT值和荧光指数,可以对PCR反应的效果和目标DNA的表达量进行定量分析。
此外,荧光定量PCR还可以用于研究目标基因的相对表达量。
1定量PCR基本原理
1定量PCR基本原理定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)是一种用于检测和测量DNA或RNA分子数量的分子生物学技术。
它是常用的基因表达和检测技术。
以下是定量PCR的基本原理。
定量PCR的基本原理可以分为三个主要步骤:扩增反应、检测荧光信号和标准曲线计算。
第一步是扩增反应。
PCR反应通常在一个热循环中进行,每个循环包括三个步骤:变性、退火和延伸。
变性步骤通过高温将DNA双链分离成两条单链。
然后,在退火步骤中,引物通过与目标DNA序列特异性碱基配对,使其结合到模板DNA上。
最后,在延伸步骤中,DNA聚合酶将新的DNA链合成为与模板DNA相匹配的互补链。
这个循环过程被重复多次,每个循环使得目标序列的数量翻倍,从而进一步扩增目标DNA序列。
第二步是检测荧光信号。
PCR反应中通常会引入一个特定的探针或染料,其结构包括与目标DNA序列特异性结合的引物,并带有一个发光染料和一个参考染料。
扩增反应进行时,DNA聚合酶会催化探针与模板DNA结合,并释放出发光信号。
发光信号的强度与目标DNA序列的数量成正比。
参考染料发出的信号用于校正可能因扩增反应条件变化而引起的信号差异。
第三步是用标准曲线计算目标序列的数量。
标准曲线是通过基于已知浓度的一系列标准样品构建的。
这些标准样品包含与待测样品相同的目标序列,但其浓度已知。
将标准曲线上的荧光信号强度与标准样品的浓度进行比较,可以建立一个线性关系模型。
然后,通过将待测样品的荧光信号强度与标准曲线进行比较,可以计算出待测样品中目标序列的初始浓度。
定量PCR的结果可以用于不同的应用,如基因表达研究、病原体检测、遗传病诊断等。
通过定量PCR,可以准确测量目标序列的数量,并比较不同样品之间的差异。
总结一下,定量PCR通过扩增反应、检测荧光信号和标准曲线计算三个主要步骤来定量测量DNA或RNA分子的数量。
这种技术在许多生物学研究和医学诊断中发挥着重要作用。
定量pcr的技术原理
定量pcr的技术原理定量PCR(quantitative polymerase chain reaction)是一种用于DNA分子的定量分析技术。
它通过特定的引物和荧光探针来放大目标DNA序列,并结合荧光信号的强弱来确定初始DNA的数量。
其技术原理基于PCR(聚合酶链式反应)的基本步骤。
PCR 由三个主要步骤组成:变性、退火和延伸。
在定量PCR中,这些步骤与传统PCR相似,但引入了一种特殊荧光探针。
首先,通过热变性步骤将待测DNA样本的双链DNA分离为两个单链DNA。
接下来,将温度降低,使引物(由两个短DNA片段组成)与待测DNA序列上的特定区域结合。
这称为退火步骤,可选择性地将引物定位到目标序列。
然后,引物承担引导延伸的作用。
在延伸步骤中,通过添加DNA聚合酶酶和适当的碱基(dNTPs),引物沿待测DNA序列定向添加互补的碱基。
这样,每个引物在反应中逐渐延伸,生成新的DNA链,并将之前分离的双链DNA恢复成双链状态。
在定量PCR中的一个关键步骤是引入荧光探针。
这些荧光探针具有一个荧光染料和一个荧光猝灭器,其能力在其未结合目标序列时发出荧光信号。
在PCR过程中,当引物逐渐与目标序列结合并延伸时,荧光探针能特异性地与目标序列结合,导致荧光染料和荧光猝灭器之间的距离缩短,猝灭效应减弱,从而大大增加荧光信号的强度。
通过PCR反应进行若干循环,每一个循环都会使目标DNA序列的数量呈指数级增加,同时也会使荧光信号不断增强。
定量PCR的关键是要确定荧光信号的阈值,也就是荧光信号强度达到一个特定的临界值,被定义为测定阈值(Ct,Cycle threshold)。
Ct值与最初待测DNA的数量成反比,因此,Ct值越小,待测DNA的初始数量越多。
最后,通过与标准曲线比较Ct值,可以通过插值法确定待测样本中目标DNA的初始浓度。
定量PCR是一种快速、高效、灵敏且准确的DNA定量分析方法,广泛应用于基因表达研究、疾病诊断、病原体检测等领域。
定量PCR基本原理及方法-PPT精品文档
成反比,由此计算出标本中靶分子的准确含量,即:
LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)
Ampliflour Probe,LUX
定量分析
基因型分析
利用扩增信号的种类来分型 —— Taqman
根据熔解曲线的不同来分型 —— FRET, Molecular Beacon LC Green
利用扩增信号的种类来分型 双Taqman探针法检测野生型和突变型
在基因型分析中,可采用两种不同的Taqman探针(分别针对野生型和突变型),即一个突 变型探针以一种荧光素(Flr)标记,而野生型探针则用不同的荧光物(Tet)标记。如果只有 一种信号被扩增出来,则样本为对应的基因型(野生型或突变型)的纯合子;如二者都被有效 地扩增出来,则样本为杂合型。
后来用与双链DNA有更强结合力的SYBR Green I取代EB
荧光定量PCR的定量原理
PCR的理论方程: Y=x×(1+ Ev)n Real-time Chemistries
Y:扩增物数量; X :起始模板数量;Ev:扩增效率;n:扩增循环数
1. 终点法定量原理
前提:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同
定量PCR基本原理及方法
基因有限公司 黄妤
内 容
一. 荧光定量PCR基本原理 二. 荧光定量PCR标记方法 三. 荧光定量PCR不同方法学的应用
一.荧光定量PCR基本原理
荧光定量pcr的基本原理讲稿
荧光定量pcr的基本原理讲稿荧光定量聚合酶链反应(qPCR)是一种基于PCR技术的高灵敏度、高特异性的DNA定量方法。
该方法通过在PCR反应过程中使用特定的荧光信号,实时监测扩增产物的累积情况,从而确定起始模板的数量。
本文将以1500字以上的篇幅,详细介绍荧光定量PCR的基本原理。
一、PCR的基本原理PCR是一种体外扩增DNA特定片段的技术,它基于DNA的复制过程。
PCR反应体系中包含目标DNA序列、引物、dNTPs、聚合酶和缓冲液等多种组分。
PCR 反应主要分为三个步骤:变性、退火和延伸。
1. 变性PCR反应开始时,反应体系中的DNA双链被高温(通常为94-98C)变性为两条单链,并释放出目标序列片段。
2. 退火PCR反应体系降温至退火温度(通常为55-65C),引物特异性结合到目标序列的两条单链上。
引物的选取通常需要考虑引物的长度、GC含量、特异性等因素。
3. 延伸PCR反应体系升温至延伸温度(通常为72C),聚合酶沿引物向下游延伸合成新的DNA链。
该过程有高效率的DNA合成。
以上三个步骤组成了PCR的循环体系,反复进行循环扩增,可在短时间内从一条目标DNA序列扩增到数百万条,从而实现了DNA定性和定量。
二、荧光定量PCR的原理荧光定量PCR(qPCR)基于PCR技术,引入了用于荧光信号的特定探针,通过实时监测荧光信号的强度来定量目标DNA。
荧光定量PCR主要包括两种类型的探针:DNA靶向探针和荧光染料。
1. DNA靶向探针DNA靶向探针是一种特异性结合到目标序列的短链DNA分子,其中至少含有一个荧光物质和一个阻尼剂。
典型的DNA靶向探针包括TaqMan探针、分子别探针、Beacon探针等。
这些探针与目标序列的结合会导致探针内的荧光物质被释放出来,从而产生荧光信号。
2. 荧光染料荧光染料是一种无靶向结合到DNA的分子,其荧光性能会受到DNA的存在而发生变化。
典型的荧光染料包括SYBR Green、EvaGreen等。
1定量PCR基本原理
1定量PCR基本原理定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)是一种利用DNA复制技术进行定量测定DNA数量的方法。
它是PCR技术的一种改进,在遗传学、疾病诊断、药物研发等领域有广泛应用。
以下是定量PCR的基本原理的详细介绍:1.反应体系组成:定量PCR所需的反应体系包括DNA模板、引物、荧光探针、聚合酶、缓冲液、dNTPs和MgCl2等组分。
DNA模板是待测DNA的起始材料,引物是用于扩增特定DNA片段的寡核苷酸引物,荧光探针则会结合到PCR产物上生成荧光信号用于检测和计量。
2.PCR扩增步骤:定量PCR扩增过程包括三个主要步骤:变性、退火和延伸。
首先,将反应体系加热至95°C,使DNA双链解开变性为两条单链。
然后,将温度降低至特定的温度,使引物能够与DNA靶序列结合。
引物结合后,聚合酶开始在两条单链DNA上合成新的DNA链。
这一过程称为延伸。
随着循环的进行,PCR产物的数量呈指数增加。
3.荧光信号检测:定量PCR中使用特定的荧光探针来检测扩增产物的数量。
这些荧光探针一般由两个部分组成:探针序列和荧光染料。
探针序列与待测DNA的靶序列互补配对,而荧光染料则位于探针的末端。
在PCR过程中,引物扩增到接近探针的位置时,3'末端荧光染料会与5'末端的荧光信号发生共振能量转移(FRET),从而发出荧光信号。
通过测量这些信号的强度,可以推断PCR产物的数量。
4.标准曲线和计量:为了进行定量测定,标准曲线是必不可少的。
标准曲线是一系列已知浓度的标准品所构建的,通过对标准品进行PCR扩增并测量荧光信号的强度,可以建立起PCR产物浓度与荧光强度之间的关系。
通过测量待测样品的荧光强度,并根据标准曲线进行插值计算,可以得出待测样品中特定DNA序列的浓度。
5.分析和解释结果:定量PCR的结果可以通过多种途径进行分析。
一种常见的方法是计算待测样品和标准样品之间的CT值差,通过该差值来比较两者的浓度。
定量pcr的名词解释
定量pcr的名词解释引言:随着科学技术的不断发展,分子生物学领域的研究取得了长足的进展。
其中,定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术作为一种用于快速、敏感和准确测定特定DNA序列数量的方法,成为了该领域中最重要的分子生物学工具之一。
本文将对定量PCR的原理、应用和优势进行阐述,并探讨其在医学、生态学和食品安全等领域中的重要性。
1. 定量PCR的原理定量PCR是基于传统PCR技术的基础上进行改进而成的,它通过不断倍增特定DNA序列来实现对目标DNA的定量测定。
相较于传统PCR,定量PCR引入了一种特殊的荧光探针,这种荧光探针可以结合到PCR反应体系中的目标DNA序列上,并释放出荧光信号。
2. 定量PCR的应用2.1在医学领域中的应用定量PCR技术在医学领域具有广泛的应用价值。
例如,在疾病的早期诊断中,可以利用定量PCR技术快速检测出少量的病原体DNA,从而提高疾病的准确性。
此外,在肿瘤学研究中,定量PCR技术也被用于检测肿瘤标志物的表达水平,既可以评估肿瘤的发展程度,又可以指导治疗方案的制定。
2.2在生态学研究中的应用定量PCR技术在生态学研究中的应用也越来越受到关注。
与传统的实验室方法相比,定量PCR技术可以更快速、准确地测定环境中某一种类的特定基因在不同时期的丰度变化,进一步研究生态系统的结构和功能。
这项技术在生物多样性保护和生态系统健康评估方面有着重要的推动作用。
2.3在食品安全中的应用食品安全一直是人们关注的焦点,定量PCR技术在食品安全中的应用也备受重视。
比如,生产商可以利用定量PCR技术检测食品中的病原微生物,从而确保食品质量的安全性;政府部门也可以通过定量PCR技术对食品中的农药残留、转基因成分和掺杂品等进行快速检测和准确测定。
3. 定量PCR的优势3.1 高度灵敏和快速相比传统的PCR技术,定量PCR具有更高的灵敏度和检测速度。
其可以在短时间内对样本进行高通量的定量检测,且能够有效避免由于实验误差带来的不确定性。
定量PCR基本原理
定量PCR基本原理定量PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种用于测定DNA样品中特定序列的数量的技术。
它是通过扩增目标DNA序列并将其与已知浓度的标准样品进行比较来实现的。
以下是定量PCR的基本原理。
1.反应组分准备:在定量PCR中,需要准备一系列的反应组分,包括DNA模板、引物、酶和缓冲液。
引物是专门设计用于扩增目标序列的短片段DNA,它们会在PCR反应中与DNA模板结合并使其扩增。
酶是一种聚合酶,用于将单链DNA合成为双链DNA。
缓冲液用于提供适当的pH和离子浓度,以维持PCR反应的稳定性。
2.PCR反应步骤:定量PCR通常包括三个主要的温度周期:变性、退火和扩增。
-变性:在初始变性步骤中,PCR反应体系中的DNA双链会被加热至95-98°C,使其解离为两条单链DNA。
这个步骤一般持续数秒至数分钟。
-退火:在退火步骤中,PCR反应体系中的温度会降低至45-68°C,这样引物就可以与DNA模板结合起来。
引物将寻找目标DNA序列中的互补序列,并结合在其上。
这个步骤一般持续数秒至数分钟。
-扩增:在扩增步骤中,PCR反应体系中的温度会升高至64-72°C。
聚合酶会结合到DNA模板上,并在引物指导下合成新的DNA链。
这个步骤一般持续数分钟至数小时。
3. 反应过程监测:定量PCR通常通过监测反应过程中累积的产物数量来确定目标序列的浓度。
有多种检测方法可供选择,包括荧光探针、SYBR Green染料和分子质量测定。
-荧光探针:荧光探针是由一个荧光染料和一个荧光猝灭器构成的DNA探针。
当荧光探针与目标序列结合时,它会在PCR反应中被降解并释放出荧光信号。
通过监测荧光信号的强度,可以确定目标序列的浓度。
- SYBR Green染料:SYBR Green是一种荧光染料,它可以结合到所有双链DNA上。
当SYBR Green与扩增产物结合时,它会发出荧光信号。
定量pcr原理
定量pcr原理定量PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种利用DNA聚合酶链式反应技术量化检测目标DNA数量的方法。
该方法基于DNA的反链合成原理,通过多次反复复制目标DNA序列,将其扩增到可检测范围。
定量PCR主要包括准备试剂、反应体系的构建、PCR扩增条件的优化和PCR产物的检测四个步骤。
首先,准备试剂包括模板DNA、引物(前向引物和反向引物)、DNA聚合酶、dNTP(即四种脱氧核苷酸)、缓冲液和MgCl2等。
其次,构建反应体系。
通过将模板DNA、引物、DNA聚合酶、dNTP、缓冲液和MgCl2混合,得到PCR反应液。
引物是特异性序列,可与目标DNA的两个端点互补结合,成为PCR反应的开始和结束点。
然后,优化PCR扩增条件。
这涉及到温度条件和PCR循环数的调整。
PCR反应通常包括三个步骤:变性、退火和延伸。
在变性步骤中,PCR反应液在高温下使目标DNA双链解离为两条单链;在退火步骤中,引物与目标DNA的单链以互补碱基配对的方式结合;在延伸步骤中,DNA聚合酶将dNTP加入到引物的5'端扩增产物的3'端,从而合成一个新的DNA链。
最后,检测PCR产物。
这可以通过凝胶电泳、荧光定量PCR或实时定量PCR等方法进行。
实时定量PCR是一种通过荧光信号实时监测PCR反应进程的方法,可以准确地测量PCR产物的数量。
根据荧光信号的增加,可以定量计算出起始DNA 模板的数量。
总的来说,定量PCR是一种可靠且高敏感的方法,可以准确地测量目标DNA的数量。
它在医学诊断、基因表达研究、遗传学分析等领域具有广泛的应用价值。
定量PCR基本原理
定量PCR基本原理基本原理:定量PCR通过引入一种用于测量PCR反应进程的探针或染料来获取结果。
这些探针或染料具有与目标序列相互作用的特性。
当目标序列被放大并到达一定浓度时,探针或染料与之结合,产生荧光信号。
这个荧光信号的强度与目标序列的数量成正比。
下面是定量PCR的主要步骤:1.反应物准备:反应物主要包括样本DNA或RNA、引物和探针(如果使用)等。
引物是位于目标序列两侧的短DNA寡核苷酸片段,用于定向放大DNA。
探针是一种染料与荧光标记分子结合的DNA片段,用于鉴别和定量检测目标序列。
2.反应体系的配置:根据反应物的需求,将引物、探针、双链DNA模板、dNTPs、酶和缓冲液等组合在一起,形成反应混合物。
3.PCR反应:将反应混合物置于PCR仪中,进行多轮的反应循环。
每一个反应循环包括三个步骤:变性、退火和延伸。
-变性:在高温条件下,双链DNA被解开成两条单链DNA。
-退火:在较低温度下,引物与目标序列的互补部分结合。
-延伸:在适当酶的作用下,引物延伸成为与目标序列相互补的DNA 链。
4.目标序列的定量测量:反应循环完成后,可以通过测量荧光信号的强度来定量PCR反应中的目标序列。
对于使用探针的定量PCR,荧光信号强度与目标序列的拷贝数呈正相关。
探针通常在引物的5'端带有一种荧光染料,并在3'端带有另一种荧光染料。
当探针与目标序列结合时,这两种染料距离变近,导致荧光共振能量转移(FRET)。
这种能量转移的效应会导致双荧光染料之间的荧光信号发生变化,从而提供了目标序列的相对丰度的定量信息。
需要注意的是,为了准确测量目标序列的拷贝数,还需要使用内参基因或标准曲线。
内参基因是一个稳定的基因,它在样本中的拷贝数相对稳定,可以作为PCR反应的参考。
标准曲线是一系列含有已知拷贝数的DNA 标准品,它们在PCR反应中被共同放大,用来建立目标序列拷贝数和荧光信号强度之间的关系。
综上所述,定量PCR是一种基于PCR技术的分子生物学方法,通过测量荧光信号的强度来定量PCR反应中的目标序列。
定量pcr的原理和应用
定量PCR的原理和应用一、定量PCR的概述定量PCR(Quantitative PCR,简称qPCR)是一种用于精确测定DNA或RNA 在样本中的相对或绝对数量的技术。
相比传统的定性PCR,定量PCR能提供更加准确和可靠的分子生物学定量分析结果。
本文将介绍定量PCR的原理、方法和应用。
二、定量PCR的原理定量PCR基于传统PCR技术,通过测量PCR产物的实时累积情况来确定起始模板的数量。
其主要原理包括:1.设计引物和探针:定量PCR需要使用特异性引物和荧光探针来扩增和检测目标序列,引物的设计应考虑碱基配对的特异性和温度互补性。
2.实时检测:在PCR反应过程中,荧光探针与目标序列发生特异性结合,形成荧光信号。
通过实时监测PCR产物的荧光信号强度,可以确定目标序列的起始数量。
3.标准曲线法:定量PCR通常需要构建标准曲线来确定目标序列的起始数量。
标准曲线是由一系列已知起始数量的标准品制备而成,根据标准曲线上的荧光信号强度和已知起始数量的关系,可以推断出未知样本中目标序列的起始数量。
三、定量PCR的步骤定量PCR通常包括以下步骤:1.样本处理:将待测样本中的DNA或RNA提取和纯化,以获得高质量的核酸模板。
2.引物和探针设计:根据目标序列的特异性和相关基因信息,设计引物和荧光探针。
3.PCR反应体系的配置:根据实验需求和PCR仪器要求,配置PCR反应混合液,包括引物、荧光探针、DNA模板和PCR反应缓冲液等。
4.PCR反应条件的设置:确定PCR反应的温度和时间参数,包括退火温度、延伸时间和扩增周期数等。
5.实时荧光监测:将PCR反应体系加载到实时荧光PCR仪中,监测PCR反应过程中荧光信号的强度变化。
6.数据分析:利用实时荧光PCR仪软件对荧光信号数据进行分析,绘制标准曲线和计算目标序列的起始数量。
四、定量PCR的应用定量PCR在生物学研究和临床诊断中具有广泛的应用。
以下是定量PCR的主要应用领域:1.基因表达分析:通过定量PCR可以测定不同组织或细胞中特定基因的表达水平,揭示基因在生物学过程中的功能和调控机制。
定量pcr的应用原理
定量PCR的应用原理什么是定量PCR?定量PCR(Quantitative PCR,qPCR)是一种用于测定特定DNA分子数目的技术。
它可以精确测量DNA样本中的目标序列的相对或绝对含量。
定量PCR技术在许多领域都有广泛的应用,包括医学诊断、基因表达分析、遗传研究等。
定量PCR的原理定量PCR的原理基于传统的聚合酶链式反应(PCR)技术,在其基础上引入了定量测量方法。
定量PCR一般通过荧光信号检测来实现,荧光信号的强度与PCR 反应的产物数量成正比。
定量PCR的关键步骤包括DNA样本的准备、引物设计、标准曲线的建立和荧光信号的检测。
1.DNA样本的准备定量PCR需要使用目标DNA序列作为模板,因此首先需要从样品中提取DNA。
常用的DNA提取方法有酚-氯仿法、柱式纯化法、磁珠法等。
2.引物设计引物是定量PCR中起关键作用的核心组成部分。
引物的设计需要考虑目标序列的特异性和一致性。
通常需要设计一个前向引物和一个反向引物,引物的长度通常在15-30个碱基对之间。
3.标准曲线的建立定量PCR一般需要在同一批次的实验中用一系列已知浓度的标准品进行定量测定。
通过标准曲线可以将荧光强度与目标序列的浓度建立一个量化关系,进而推算出未知样品中目标序列的浓度。
4.荧光信号的检测定量PCR通常采用荧光染料来标记PCR反应产物。
常见的荧光染料有SYBR Green和TaqMan探针等。
在PCR反应进行过程中,荧光信号逐渐增加,可以通过荧光检测仪器实时监测荧光信号的强度变化。
定量PCR的优势定量PCR相较于传统PCR具有以下几点优势:1.高灵敏度定量PCR可以在非常低的模板浓度下进行测定,可以检测到非常稀有的目标序列。
2.高精确度定量PCR具有较高的准确性和精确性,可以测定目标序列的绝对或相对数量。
3.动态范围广定量PCR能够测定广泛范围内目标序列的数量,适用于不同浓度的DNA样本。
4.实时监测定量PCR可以在PCR反应进行过程中实时监测荧光信号的变化,得到即时的结果。
简述实时荧光定量pcr技术基本原理
简述实时荧光定量pcr技术基本原理实时荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种用于检测和定量DNA分子的方法。
其基本原理可以分为以下几个步骤:1. DNA模板准备:从样品中提取目标DNA并纯化。
2. 反应混合物制备:将目标DNA模板与一对引物(Primer)和一种DNA聚合酶(如Taq聚合酶)一同混合。
引物是特异性的DNA片段,用于引导DNA合成的起始。
3. PCR反应:反应开始时,立即开始DNA聚合酶的活性。
DNA聚合酶会从引物的3'端开始合成新的DNA链,直到另一条模板DNA链的末端。
该过程包括三个步骤:变性、扩增和延伸。
- 变性:将DNA模板的双链解链,得到两条单链DNA。
- 扩增:引物结合到模板DNA上,并通过DNA聚合酶的活性引导新的DNA链的合成。
- 延伸:DNA聚合酶在模板链的5'到3'方向上合成新的DNA 链。
4. 荧光探针监测:实时PCR使用一种带有荧光染料的DNA探针,例如SYBR Green或TaqMan探针。
这些探针能够与新合成的DNA片段结合,并发出荧光信号。
- SYBR Green:该荧光染料会与双链DNA结合并发出荧光。
当PCR反应进行时,DNA的数量增加,SYBR Green的荧光信号也增加。
通过检测荧光信号的强度,可以确定PCR反应的进程和目标物质的数量。
- TaqMan探针:TaqMan探针包含一个与目标DNA片段互补的序列,并在其一端有一个荧光染料,如荧光素(FAM)和荧光素内部荧光质体(TAMRA)。
当TaqMan探针与目标DNA结合时,聚合酶开始进行DNA合成,并在过程中释放探针分子。
聚合酶的活动断开荧光染料和荧光质体之间的特定连接,导致发出另一种荧光信号。
通过监测这两种荧光信号,可以确定PCR反应的进程和目标物质的数量。
5. 数据分析:荧光信号的强度与反应温度和时间关联,通过计算PCR循环的阈值周期(CT值),可以确定目标DNA的起始数量。
定量pcr技术的原理
定量pcr技术的原理
定量PCR技术是一种用于确定DNA数量的方法。
其原理基于聚合酶链反应(PCR),同时结合了荧光探针技术。
定量PCR的关键步骤包括:DNA模板的反应体系制备、荧光
探针设计、扩增曲线分析等。
首先,DNA模板的反应体系制备是定量PCR的基础。
该反应
体系通常包括目标DNA序列、DNA引物、聚合酶、反应缓冲液以及二苯基酚等反应成分。
其中,DNA引物是专门设计的,能够与所需检测的DNA序列互补结合并进行扩增。
聚合酶则
在PCR反应中起到催化DNA模板扩增的作用。
其次,荧光探针设计是定量PCR的关键步骤之一。
荧光探针
通常包括一个荧光染料和一个荧光猝灭剂。
在PCR反应过程中,如果目标DNA序列存在,荧光探针会与目标序列互补结合,并被引物延伸酶切割,导致荧光染料与猝灭剂分离而产生荧光信号。
荧光信号的强度与目标DNA序列的数量成正比。
最后,扩增曲线分析是定量PCR的关键步骤之一。
在PCR过
程中,荧光信号的强度会随着每个PCR循环的进行而增加。
通过测量特定循环数后的荧光信号强度,可以建立标准曲线来确定目标DNA序列的初始数量。
标准曲线中会设置一系列已
知浓度的目标DNA样品作为参照,通过比对测试样品的荧光
信号,可以推算出测试样品中目标DNA序列的初始数量。
综上所述,定量PCR技术利用聚合酶链反应和荧光探针技术,
通过测量PCR反应产生的荧光信号强度,能够准确测定目标DNA序列的数量。
这种技术在生物学研究、分子诊断和环境监测等领域具有广泛的应用。
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线性图谱
9
指数增长期内扩增曲线具有高度重复性
96 次重复
可变的平台期
荧光信号
指数增长期内重复性好
循环数
10
定量PCR扩增曲线的各种概念
Ct 值
∆Rn
阈值线
基线
Cycles
11
什么是基线?
•基线是扩增曲线的水平部分
基线
对数图谱
基线
线性图谱
12
基线扣除
Rn
Before subtraction
DRn
Module1:实时荧光定量PCR技术原理
陈 涛
Field Application Scientist
Tel: 800 820 8982 / 400 820 8982
The world leader in serving science 1
什么是实时荧光定量PCR?
•一种实时监控核酸扩增的技术
在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的变化对PCR过程进行 实时监控,以此实现对初始模板的定量分析。
2
定量PCR如何工作?
• PCR反应液加入了
各种类型的荧光标记物
一个PCR循环
3
定量PCR如何工作?
• 在扩增过程中,荧光信号随着PCR产物的增加而增强
PCR 产物
PCR
PCR
大量PCR产物
4
定量PCR仪如何工作?
• 所有的定量PCR仪器都有三个共同的组成部分 2. 光路系统
3. 检测器
1. 热循环模块
~520
~550 ~620
•StepOnePlus™实时荧光定量PCR系统
Channel 1 2 Dye Examples FAM™, SYBR® VIC®, JOE™ Excitation Wave Lenthgh 455~485nm 510~530nm Emission Wave Lenthgh ~520 ~550
激发光
激发光
能量
荧光共振能量转移,FRET
20
变性 (95º C)
21
退火 (60º 7
?
28
5′-3′外切酶活性 水解探针,使报告基团和淬 灭基团分离
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
53
SYBR® Green I 染料
54
SYBR® Green I作用机理
55
SYBR® Green I作用机理
56
SYBR® Green I作用机理
57
实时记录每个循环后荧光信号的变化
荧光 循环数
58
SYBR® Green I 方法的局限性
任何双链,非特异结合
非特异产物信号
不准确结果
59
•ViiA™ 7实时荧光定量PCR系统
Channel 1 2 3 4 5 6 Dye Examples FAM™, SYBR®, SYTO®9 (MeltDoctor™), Fluorescein, SYPRO® Orange VIC®, JOE™, TET™, HEX™ NED™, BODIPY® TMR-X,TAMRA™ ROX™, Texas Red® LIZ™ Alexa Fluor®, Joda-4 Excitation Wave Lenthgh 455~485nm 510~530nm 540~550nm 570~590nm 630~650nm 650~670nm Emission Wave Lenthgh ~520nm ~550nm ~580nm ~620nm ~680nm ~710nm
After subtraction
13
什么是阈值?
•阈值是一个荧光强度值,穿过阈值与X轴平行的直线称为阈值线
阈值 阈值线 阈值 阈值线
对数图谱
线性图谱
14
什么是Ct值?
•Ct值是阈值线与扩增曲线的交点对应在X轴上的值
对数图谱
Ct
Ct
线性图谱
15
如何使用Ct值计算结果?
绝对定量 相对定量
Ct values 0 1 2 3 4 5 6 7 Log copy number
46
47
48
Burp !
49
实时记录每个循环后荧光信号的变化
荧光
循环数
50
荧光标记组合
报告荧光: 6-FAM、JOE、VIC、NED、CY3、Texas Red、CY5 淬灭荧光: MGB-NFQ、TAMRA、BHQ 参比荧光: ROX
常用的荧光组合: FAM VIC NED ROX
目的基因1 目的基因2/内对照 目的基因3 参比荧光
51
荧光染料组合
•StepOne™实时荧光定量PCR系统
Channel Dye Examples Excitation Wave Lenthgh Emission Wave Lenthgh
1
2 3
FAM™, SYBR®
VIC®, JOE™ ROX™, Texas Red®
455~485nm
510~530nm 570~590nm
16
定量PCR的化学原理
17
两种化学方法
TaqMan探针法 染料法
18
TaqMan探针法
•TaqMan水解探针:5′ 端 荧光报告基团 与靶基因特异性结合的序列
3′ 端 荧光淬灭基团
报告基团
淬灭基团
19
TaqMan水解探针作用机理
•完整的探针: 检测不到报告荧光 •切断的探针: 检测到报告荧光
通过熔解曲线检查产物特异性
• Tm值: DNA的双螺旋结构打开一半时的温度。
荧光
温度
60
单一PCR产物的熔解曲线
荧光
温度
61
多个PCR产物的熔解曲线
非特异扩增 引物二聚体
62
Questions ?
63
3
4
NED™,TAMRA™
ROX™, Texas Red®
540~550nm
570~590nm
~580
~620
52
荧光染料组合
•7500实时荧光定量PCR系统
Channel 1 2 3 4 5 Dye Examples FAM™, SYBR® VIC®, JOE™ NED™, Cy3,TAMRA™ ROX™, Texas Red® CY5 Dye™ Excitation Wave Lenthgh 455~485nm 510~530nm 540~550nm 570~590nm 630~650nm Emission Wave Lenthgh ~520 ~550 ~580 ~610 ~650
5
定量PCR如何工作?
• 每个循环结束后,定量PCR仪器通过光学系统记录荧光信号的增
加
循环1 滤光片 A 样品 1 Level:
6
定量PCR如何工作?
• 最后,定量PCR软件计算出数据,用于实验结果的分析
7
定量PCR的数学原理
8
PCR动力学曲线和四个阶段
平台期
线性增长期 指数增长期 基线期
对数图谱