02第一章 蛋白质
生物化学 01-第一章 蛋白质的结构与功能(一)
34
谢谢
3、氧化供能
5
元素组成 The composition of chemical elements
碳 (C, Carbon) 50-55% 氢 (H, Hydrogen) 6-8% 氧 (O, Oxygen) 20-23% 氮 (N, Nitrogen) 15-17% 硫 (S, Sulfate) 0-3% 其他微量
23
R CH COOH NH2
R CH COOH
NH3 +
+H+
+OH-
R CH COONH3 +
R CH COONH2
pH<pI
pH=pI
pH>pI
阳离子
氨基酸的兼性离子
zwitterion
24
阴离子
氨基酸的等电点
等电点(isoelectric point, pI):在某一pH环境中,氨 基酸解离成阳性离子及阴性离子的趋势相基酸所处环境 的pH值称为该氨基酸的等电点。
含有苯环、酚基、吲哚基 苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸
15
16
4. 酸性氨基酸(2)
水溶解度较好,带有负电荷,侧链有羧基 天冬氨酸、谷氨酸
17
18
5. 碱性氨基酸(3)
水溶解度较好,带有正电荷,侧链有氨基、 胍基、咪唑基 精氨酸、赖氨酸、组氨酸
19
20
脯氨酸(亚氨基酸)
21
半胱氨酸
-OOC-CH-CH2-SH + HS-CH2-CH-COO-
+NH3
第一章蛋白质的结构与功能
蛋白质的分类
单纯蛋白质和结合蛋白质 • 前者只含有氨基酸后者除蛋白质部 分外还含有非蛋白质部分 纤维状蛋白质和球状蛋白质 • 前者多为结构蛋白质较难溶于水, 作为细胞坚实的支架或连接各细胞 组织器官的细胞外成分,如胶原蛋 白,弹性蛋白,角蛋白等。 • 后者多数可溶于水许多具有生理学 功能的蛋白质如酶,转运蛋白,蛋 白质类激素等。ຫໍສະໝຸດ α -螺旋 β-折叠
β-转角和无规转曲
无规转曲是用来阐述没 有确定规律性的那部分 肽链结构
模体
在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级 结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的 空间构象,被称为模体
氨基酸残基的侧链影响二级结构的形成
蛋白质的二级结构是以一级结构为基础的。一段肽 链其氨基酸残基的侧链适合形成α -螺旋或β-折叠, 他就会出现相应的二级结构。
第一章蛋白质的结构与功能
蛋白质的分子结构包括
一级结构,
二级结构,三级结构,四级结构→高级结构
蛋白质的一级结构
• 定义 蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的排列 顺序 • 主要的化学键 肽键,有的蛋白质含有双硫键
蛋白质中的二级结构
定义 • 蛋白质分子中某一段肽链的局部空 间结构,就是该段肽链主链骨架原 子的相对空间结构,并不涉及氨基 酸残基侧链的构象。 主要的化学键 • 氢键
蛋白质的三级结构
定义 • 整条肽链中全部氨基酸残基的相对 位置。即肽链中所有原子在三维空 间排布的位置。 主要的化学键 • • • • 疏水键 盐键 氢键 范德华力
生物化学名词解释全
生物化学名词解释全生物化学名词解释全————————————————————————————————作者: ————————————————————————————————日期:生物化学名词解释集锦第一章蛋白质1.两性离子(dipolarion)2.必需氨基酸(essentialaminoac id)3.等电点(isoelectric point,pI)4.稀有氨基酸(rare amino acid)5.非蛋白质氨基酸(nonprotein aminoacid)6.构型(configuration)7.蛋白质的一级结构(protein primary structure)8.构象(conformation)9.蛋白质的二级结构(proteinsecond ary structure)10.结构域(domain)11.蛋白质的三级结构(protein tertiary structure)12.氢键(hydrogen bond)13.蛋白质的四级结构(protein quaternary structure)14.离子键(ionic bond)15.超二级结构(super-secondary structure)16.疏水键(hydrophobic bond)17.范德华力( vander Waals force) 18.盐析(salting out)19.盐溶(salting in)20.蛋白质的变性(denaturation)21.蛋白质的复性(renaturation) 22.蛋白质的沉淀作用(precipitation)23.凝胶电泳(gel electrophoresis)24.层析(chromatography)第二章核酸1.单核苷酸(mononucleotide)2.磷酸二酯键(phosphodiester bonds) 3.不对称比率(dissymmetry ratio) 4.碱基互补规律(complementary base pairing)5.反密码子(anticodon)6.顺反子(cistron)7.核酸的变性与复性(denaturation、renaturation)8.退火(annealing)9.增色效应(hyper chromiceffect) 10.减色效应(hypo chromiceffect)11.噬菌体(phage)12.发夹结构(hairpin structure) 13.DNA 的熔解温度(m eltingtemperatureTm)14.分子杂交(molecularhybridization)15.环化核苷酸(cyclic nucleotide)第三章酶与辅酶1.米氏常数(Km 值)2.底物专一性(substrate specificity)3.辅基(prosthetic group)4.单体酶(monomeric enzyme)5.寡聚酶(oligomericenzyme)6.多酶体系(multienzyme system)7.激活剂(activator)8.抑制剂(inhibitor inhibiton) 9.变构酶(allostericenzyme)10.同工酶(isozyme)11.诱导酶(induced enzyme)12.酶原(zymogen)13.酶的比活力(enzymaticcompare energy)14.活性中心(active center)第四章生物氧化与氧化磷酸化1.生物氧化(biological oxidation)2. 呼吸链(respiratory chain)3. 氧化磷酸化(oxidativephosphorylation)4. 磷氧比P/O(P/O)5.底物水平磷酸化(substrate level phosphorylation)6. 能荷(energy charg第五章糖代谢1.糖异生(glycogenolysis)2.Q 酶(Q-enzyme)3.乳酸循环(lactate cycle)4.发酵(fermentation)5.变构调节(allosteric regulation)6.糖酵解途径(glycolytic pathway)7.糖的有氧氧化(aero bic oxidation) 8.肝糖原分解(glycogenolysis)9.磷酸戊糖途径(pentose phosphatepathway)10.D-酶(D-enzyme)11.糖核苷酸(sugar-nucleotide)第六章脂类代谢1. 必需脂肪酸(essentialfattyacid)2.脂肪酸的α-氧化(α-oxidation) 3. 脂肪酸的β-氧化(β-o xidation) 4.脂肪酸的ω-氧化(ω-oxidation) 5. 乙醛酸循环(glyoxylate cycle)6.柠檬酸穿梭(citriate shuttle) 7. 乙酰CoA 羧化酶系(acetyl-CoAcarnoxylase)8. 脂肪酸合成酶系统(fatty acid synthase system)第八章含氮化合物代谢1.蛋白酶(Proteinase)2.肽酶(Peptidase)3.氮平衡(Nitrogen balance)4.生物固氮(Biologicalnitrogenfixation)5.硝酸还原作用(Nitrate reduction)6.氨的同化(Incorporation ofammonium ionsintoorganic molecules)7.转氨作用(Transamination)8.尿素循环(Urea cycle)9.生糖氨基酸(Glucogenic amino acid)10.生酮氨基酸(Ke togenic amino acid)11.核酸酶(Nuclease)12.限制性核酸内切酶(Restriction en donuclease)13.氨基蝶呤(Aminopterin)14.一碳单位(One carbon unit)第九章核酸的生物合成1.半保留复制(semiconservativereplication)2.不对称转录(asymmetrictrancription)3.逆转录(reverse transcriptio n)4.冈崎片段(Okazaki fragment)5.复制叉(replicationfork) 6.领头链(leading strand)7.随后链(lagging strand)8.有意义链(sense strand)9.光复活(photoreactivation)10.重组修复(recombination repair)11.内含子(intron)12.外显子(exon)13.基因载体(genonic vector)14.质粒(plasmid)第十一章代谢调节1.诱导酶(Inducibleenzyme)2.标兵酶(Pacemakerenzyme)3.操纵子(Operon)4.衰减子(Attenuator)5.阻遏物(Repressor)6.辅阻遏物(Corepressor)7.降解物基因活化蛋白(Catabolic gene act ivator protein) 8.腺苷酸环化酶(Adenylate cyclase) 9.共价修饰(Cova lent modification)10.级联系统(Cascadesystem)11.反馈抑制(Feedback inhibition)12.交叉调节(Cross regulation)13.前馈激活(Feedforwardactivation)14.钙调蛋白(Calmodulin)第十二章蛋白质的生物合成1.密码子(codon)2.反义密码子(synonymous codon)3.反密码子(anticodon)4.变偶假说(wobble hypothesis)5.移码突变(frameshiftmutant)6.氨基酸同功受体(isoacceptor)7.反义RNA(antisense RNA)8.信号肽(signal peptide)9.简并密码(degeneratecode)10.核糖体(ribosome)11.多核糖体(poly some)12.氨酰基部位(aminoacyl site)13.肽酰基部位(peptidysite)14.肽基转移酶(peptidyl transferase)15.氨酰- tRNA 合成酶(amino acy-tRNA synthetase)16.蛋白质折叠(protein folding)17.核蛋白体循环(polyribosome) 18.锌指(zine finger)19.亮氨酸拉链(leucinezipper) 20.顺式作用元件(cis-acting elemen t)21.反式作用因子(trans-acting factor)22.螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix)第一章蛋白质1.两性离子:指在同一氨基酸分子上含有等量的正负两种电荷,又称兼性离子或偶极离子。
第一章 食品营养学之蛋白质(共享版)
第一章蛋白质第一节蛋白质1.根据营养价值,蛋白质可分为完全蛋白质、半完全蛋白质、不完全蛋白质。
完全蛋白(优质蛋白):所含必需氨基酸种类齐全、数量充足、比例恰当,不但能维持成人的健康,并能促进儿童的生长发育。
常见于蛋类、奶昔、肉、豆类等。
半完全蛋白质:所含必需氨基酸种类齐全、但数量不尽充足、比例也不恰当,可维持生命,但不能促进儿童生长发育。
常见于小麦、大麦、土豆等。
不完全蛋白质:所含必需氨基酸种类不全,既不能维持生命,也不能促进生长发育。
常见于玉米胶蛋白、结缔组织、动物皮等。
思考一下,如何评价一种食物的蛋白营养价值?必然丢失氮:机体无蛋白膳食时,每天有皮肤、毛发、粘膜的脱落,妇女月经期的失血及肠道菌体死亡的死亡排除等损失约20g以上,这种蛋的丢失是机体不可避免的。
2.蛋白质生理功能◆机体和生命的物质基础蛋白质具有催化、调节生理功能、运输、肌肉收缩、支撑等重要作用。
◆建造和修复更新组织蛋白质是机体氮元素来源之一,在机体周转很快,能快速更新机体损伤部位。
◆参与机体功能机体碳水化合物和脂肪功能不足或者蛋白质摄入过量时,参与机体功能。
◆重要的功能特性第二节氨基酸1.常将侧链不同的20种氨基酸常分为2类:必需氨基酸和非必需氨基酸。
必需氨基酸——EAA,非必需氨基酸——NEAA。
常见必需氨基酸8种,其中婴儿必需氨基酸9种,另加了组氨酸(His)。
2.蛋氨酸——半胱氨酸、苯丙氨酸——洛氨酸,因此常将半胱氨酸和洛氨酸称作“半必需氨基酸”。
3.限制氨基酸(LAA):某一种或几种必需氨基酸缺少或数量不足,将使食物蛋白质合成机体蛋白过程受到限制,也应此限制了此种蛋白质营养价值。
将食物蛋白质中各种必需氨基酸与人体需要量模式进行比较,相对不足氨基酸称为限制性氨基酸。
缺乏最多的限制性氨基酸称为第一限制性氨基酸。
食物中最主要的限制性氨基酸是赖氨酸和蛋氨酸。
氨基酸模式:必需氨基酸之间相互搭配的比例关系成为必需氨基酸模式。
常将需要量最少的色氨酸作为1,以方便计算。
生物化学——第一章蛋白质
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
非极性氨基酸
O H 2N CH C OH
CH CH 3 CH 3
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
谷氨酸(二羧基一氨基) pK1 pK2 pK3
碱性氨基酸:pI = (pK2 + pK3 )/2
赖氨酸(一pK羧1 基二p氨K2基pK)3
• 中性氨基酸pI一般为6.0答案:
• 提问:为什么偏酸性?
• -COOH解离程度略大于-NH2 • 提问:酸性氨基酸的pI(更偏酸、更偏碱)?
• 更酸(3.0 左 右)
非极性氨基酸
O H 2 N CH C OH
CH 2 CH CH 3 CH 3
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
非极性氨基酸
O H 2 N CH C OH
CH CH 3 CH 2 CH 3
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
非极性氨基酸
H N
CO OH
吡咯
丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
2、分类
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同。 20种基本氨基酸按R的极性可分为: (1)非极性氨基酸 (2)极性氨基酸 (不带电荷氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸)
第一章 蛋白质的结构和功能
Ve logM=a-b V
M=
SRT
D(1-υρ)
M:分子量,υ:蛋白质偏微比容,ρ:溶剂 密度,D:扩散系数,S:沉降系数,R:气体 常数,T:绝对温度。
二、蛋白质的变性:在某些物理和 化学的因素作用下,使蛋白质分子 的空间构象发生改变或破坏,导致 其理化性质的改变及生物活性的丧 失的现象称蛋白质的变性。 1、变性的本质 (1)蛋白质变性后分子从规则的紧密 结构变为无规则的松散状态 (2)变性只涉及次级键的断裂
Hb
Myoglobin
O2
Hemoglobin
O2
0毛细 血管中的PO2
肺泡中的PO2
血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线
三、蛋白质的结构与生物进化
第五节 蛋白质的性质 一、蛋白质分子的大小、形状及分子 量的测定 蛋白质分子量一般在1×104~ 1×106Da范围或更大。 凝胶过滤法 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳法 超速离心法 质谱法
(2)β-折叠( β-片层β-pleated sheet structure) β-片层的结构要点: ①肽链相对伸展成锯齿状,侧链基团 伸在肽链的上下两侧。 ②两条以上肽链(或同一条多肽链的不 同部分)平行排列,相邻肽键相互交替 形成许多氢键。氢键是维持β-片层的 主要次级键。 ③肽链平行的走向有顺式和反式两种, 肽链的N端在同侧为顺式,N端不在同 侧称反式。
(五)蛋白质的三级结构(tertiary structure): 多肽链在二级结构的基础上所进行的折 叠和盘旋。或多肽链中个元素在空间的 相对位置。
N
Lys41 His119 His12
C
细胞色素c分子的空间结构
不变的AA残基
(六)蛋白质的四级结构(quarternary structure):两条或两条以上肽链构成 的蛋白质,其中每条多肽链均具有独 立的三级结构,每条多肽链称为一个 亚基。由亚基相互聚合而成的结构称 四级结构。
蛋白质的概念
蛋白质的概念
《蛋白质的概念》
第一章绪论
1.1 蛋白质的概念
蛋白质是生物体中的一种重要物质,它可以被定义为由氨基酸残基构成的一种大分子化合物。
蛋白质有许多不同的功能,可以在生物体中扮演重要的角色,如催化化学反应、转运物质、定向移动和提供力量等。
它们还具有抗微生物免疫的作用,具有保护功能,以及在发育生长和修复过程中的作用。
1.2 蛋白质结构
蛋白质由氨基酸残基组成,每个氨基酸残基都具有不同的结构和特性,氨基酸残基组装成蛋白质的结构可以由三种不同的结构来构成:主要结构、二级结构和三级结构。
其中,主要结构指的是蛋白质由氨基酸残基组成的序列构成,二级结构是指蛋白质氨基酸残基组成的连续环状结构,而三级结构则是指蛋白质在化学环境中所呈现出的三维结构。
1.3 蛋白质的功能
蛋白质有着多种功能,主要有催化、转运、吸收、抗微生物免疫、稳定蛋白质和信号转导等。
蛋白质可以催化酶以便完成生物体中的各种生化反应,可以转运生物体中的特定物质,可以吸收阳光、营养物质和水分,可以抵抗微生物入侵,保护生物体不受病害的侵害,还可以稳定蛋白质结构,并起到信号传导的作用。
生物化学 复习资料 重点+试题 第一章 蛋白质
第一章蛋白质一、知识要点〔一〕氨基酸的结构蛋白质是重要的生物大分子,其组成单位是氨基酸。
组成蛋白质的氨基酸有20种,均为α-氨基酸。
每个氨基酸的α-碳上连接一个羧基,一个氨基,一个氢原子和一个侧链R基团。
20种氨基酸结构的差异就在于它们的R基团结构的不同。
根据20种氨基酸侧链R基团的极性,可将其分为四大类:非极性R基氨基酸〔8种〕;不带电荷的极性R基氨基酸〔7种〕;带负电荷的R基氨基酸〔2种〕;带正电荷的R基氨基酸〔3种〕。
〔二〕氨基酸的性质氨基酸是两性电解质。
由于氨基酸含有酸性的羧基和碱性的氨基,所以既是酸又是碱,是两性电解质。
有些氨基酸的侧链还含有可解离的基团,其带电状况取决于它们的pK值。
由于不同氨基酸所带的可解离基团不同,所以等电点不同。
除甘氨酸外,其它都有不对称碳原子,所以具有D-型和L-型2种构型,具有旋光性,天然蛋白质中存在的氨基酸都是L-型的。
酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸具有紫外吸收特性,在280nm 处有最大吸收值,大多数蛋白质都具有这些氨基酸,所以蛋白质在280nm处也有特征吸收,这是紫外吸收法定量测定蛋白质的根底。
氨基酸的α-羧基和α-氨基具有化学反响性,另外,许多氨基酸的侧链还含有羟基、氨基、羧基等可解离基团,也具有化学反响性。
较重要的化学反响有:〔1〕茚三酮反响,除脯氨酸外,所有的α-氨基酸都能与茚三酮发生颜色反响,生成蓝紫色化合物,脯氨酸与茚三酮生成黄色化合物。
〔2〕Sanger反响,α-NH2与2,4-二硝基氟苯作用产生相应的DNB-氨基酸。
〔3〕Edman反响,α-NH2与苯异硫氰酸酯作用产生相应的氨基酸的苯氨基硫甲酰衍生物〔PIT-氨基酸〕。
Sanger反响和Edmen反响均可用于蛋白质多肽链N端氨基酸的测定。
氨基酸通过肽键相互连接而成的化合物称为肽,由2个氨基酸组成的肽称为二肽,由3个氨基酸组成的肽称为三肽,少于10个氨基酸肽称为寡肽,由10个以上氨基酸组成的肽称为多肽。
第一章 蛋白质
第一节 蛋白质的化学组成
一、蛋白质的元素组成 碳 (C) 50% ---55% 氢 (H) 6%---7% 氧 (O) 19%~24% 氮 (N) 16% 硫 (S) 0%~3% 少量的磷 (P) ,铁 (Fe) ,铜 (Cu),锌
(Zn) 和碘 (I)等
蛋白质含量的测定: ---凯氏定氮法(测定氮的经典方法)
丙氨酸 alanine Ala A 6.00
缬氨酸 valine
Val V 5.96
亮氨酸 leucine Leu L 5.98
异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02
苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48
脯氨酸 proline
Pro P 6.30
目录
2. 非电离极性側链氨基酸 色氨酸 tryptophan Try W 5.89
* 由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽 (oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的 肽称多肽(polypeptide)。
* 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不 全,被称为氨基酸残基(residue)。
多肽和蛋白质
* 多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基 酸之间以肽键连接而成的一种结构。
半透膜原理
三、蛋白质的变性
1 、概念:天然蛋白质受到物理、化学 因素的影响,导致其空间结构的破坏, 从而使蛋白质的理化性质发生改变和 生物功能的丧失称为蛋白质的变性作 用
2 、引起蛋白质变性的因素: 物理因素:加热,紫外线,超声
波,剧烈震荡,X-射线等。 化学因素:强酸、强碱、重金属
离子、尿素、丙酮、乙醇等。
存在形式:链状 维系键:肽键(- CO-NH-,主)
第一章 蛋白质的结构和功能
此反应可使氨基酸的羧基活化,使之容易与另一氨基酸的氨 基结合,因此常用于多肽化学合成。
另一酰化试剂是丹磺酰氯(dansyl chloride, DNS-Cl),它与氨基酸的氨基反应生成DNS-氨基 酸,反应式如下:
反应生成的DNS-氨基酸在紫外光下产生强 烈的黄色荧光,有很高的灵敏度。因此该反应被 用于多肽链氨基末端氨基酸的标记和微量氨基酸 的定量测定。
(2)它们是物质代谢过程的中间产物或重要代谢物 的前体,活泼地参与体内各种代谢反应。如鸟氨酸 (ornithine)、瓜氨酸(citrullirne)、同型半胱氨酸(高半胱 氨酸,homocysteine)、S-腺苷甲硫氨酸(Sadenosylnlethionine)、β-上常用的抗 生素或抗代谢药物。如重氮乙酰丝氨酸 (Azaserine),它由一种链丝菌产生或合成,能抑 制嘌呤的生物合成,导致染色体畸变。
非极性R基团氨基酸:
侧链基团均为非极性基团,呈现疏水性。
(2)不解离的极性R基团氨基 酸这一组包括丝氨酸、苏氨酸、 酪氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、 天冬酰胺及甘氨酸等7种。它们 的侧链中含有不解离的极性基团, 能与水形成氢键。因此比非极性 R基团氨基酸易溶于水。
(3)荷正电R基团氨基酸共有3种。其中赖氨酸 除α-氨基外,在烃链ε位上还有一个氨基;精氨酸 含有一个胍基;组氨酸有一个弱碱性的咪唑基。 这一组氨基酸的R基团在pH 7溶液中,可质子化 而使分子带正电荷。因此,通常将这3种氨基酸 称为碱性氨基酸。
根据20种蛋白质氨基酸分子结构的这种特点, 可按R基团的化学结构,将其分为脂肪族、芳香族 和杂环族氨基酸三类。 脂肪族氨基酸:有甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、 亮氨酸、异亮氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、 甲硫氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、天冬氨、谷氨酸、 赖氨酸及精氨酸; 芳香族氨基酸:有苯丙氨酸及酪氨酸; 杂环族氨基酸:有色氨酸、组氨酸及脯氨酸。
第一章 蛋白质讲解
2、芳香族氨基酸:Phe、Tyr 、 Trp 3、杂环氨基酸:His、Pro
氨基酸的结构
(二)从营养学角度分类
• 必需氨基酸(人类不能自行合成,依赖食物供给)
谐音记忆:"笨蛋来宿舍,晾一晾鞋"
笨(苯丙氨酸)蛋(蛋氨酸)来(赖氨酸)宿(苏 氨酸)舍(色氨酸),晾(亮氨酸)一晾(异亮氨 酸)鞋(缬氨酸) 半必须氨基酸:半斤组[精(斤)氨酸,组氨酸] 非必需氨基酸(人类能自行合成)
• 结合蛋白 conjugated protein
多肽链+辅助因子 由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成
• 清蛋白和球蛋白
简 • 广泛存在于动物组织 单 • 谷蛋白和醇溶谷蛋白 蛋 植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸/碱 白 • 精蛋白和组蛋白 碱性蛋白存在于细胞核
• 硬蛋白
结 • 核蛋白:简单蛋白+核酸 合 • 脂蛋白:简单蛋白+脂类结合 蛋 白 • 糖蛋白:简单蛋白+糖类物质
此外,蛋白质还在遗传信息的表达、 生物膜的功能以及高等动物的记忆、识别, 细胞的生长和分化等方面起重要的作用
三、蛋白质的分类
1、从外形分 纤维蛋白:多为结构蛋白 球蛋白:具有广泛的生物学功能。如酶、蛋白类 激素等。
2、从组成分
• 简单蛋白 simple protein
单纯蛋白,完全由氨基酸组成
(三)、根据R基团极性分类:
非极性氨基酸:Ala、Val 、Leu、Ile、Pro、 Phe、 Trp、 Met 极性不带电荷:Gly、 Ser、Thr、 Cys、 Tyr、 Gln、Asn 极性带正电荷: Lys、Arg、 His 极性带负电荷: Glu、Asp
非极性氨基酸8种
极性R基团氨基酸 (8种):
生物化学生物化学第一章蛋白质
PAGE
垂
直
平
低浓度浓缩胶
板
电
泳
高浓度分离胶
示
意
图
生物化学生物化学第一章蛋白质
生物化学生物化学第一章蛋白质
生物化学生物化学第一章蛋白质
生物化学生物化学第一章蛋白质
生物化学生物化学一章蛋白质
• 肌红蛋白和血红蛋白的每条链都含一个血 红素辅基。
• 血红素由四个吡咯环构成的原卟啉Ⅸ和一 个铁离子组成。作为亚铁离子,可形成6个 配位键:其中4个与卟啉与环的氮原子连接, 第五个与His93相连,第六个与氧可逆结合 附近有个His64辅助氧的结合。
生物化学生物化学第一章蛋白质
肌红蛋白与血红蛋白的结构与功能
生物化学生物化学第一章蛋白质
目录
• 肌红蛋白(Mb)由153个氨基酸残基组成,血 红蛋白(Hb)的α亚基有141个氨基酸,β亚基 有146个氨基酸残基。Mb and Hb的两种亚 基氨基酸残基数和序列均有变化,但它们 的三级结构几乎完全相同。
• 同功能蛋白质:不同生物体中表现同一功 能的蛋白质,又称同源蛋白质。
生物化学生物化学第一章蛋白质
• 对比不同生物的同源蛋白质的氨基酸序列 可以发现,它们长度相同或相近,而且许 多位置的氨基酸是相同的。这些相同的氨 基酸残基称为不变残基。
• 不变残基对于同源蛋白的功能是必需的。
生物化学生物化学第一章蛋白质
• 说明肌红蛋白和血红蛋白的α亚基和β亚基 都起源于一个共同的祖先。
生物化学生物化学第一章蛋白质
• 在血红蛋白和肌红蛋白分子中与辅基血红 素相连的氨基酸都是组氨酸。说明不同氨 基酸序列中只有关键的氨基酸不变才能产 生相同的构象,执行相同的功能。
• 这种关键氨基酸通常提供形成蛋白质构象 的必要基团。
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D-甘油醛
互为旋光异构体 ,也称为 对映异构体(实物与镜像) 如果测定结果使偏振光左旋 l 或 - 表示 右旋 d 或 +表示
CHO HO
CHO H H
COOH OH H
C
C
C
CH3
OH
CH2OH
CH2OH
L-(+)-甘油醛
COO H3N
D-(-)-甘油醛
OOC
D-(-)-乳酸
OOC
C
CH3
H
H3C H
极性R基团氨基酸: Tyr(酪氨酸) Cys(半胱氨酸) Ser(丝氨酸) Thr(苏氨酸) Asn(天冬酰胺) Gln(谷氨酰胺) Met (蛋氨酸) Trp(色氨酸) 非极性R基团氨基酸: Gly(甘氨酸) Ala(丙氨酸) Ile(异亮氨酸) Pro(脯氨酸)
Val(结氨酸)
Leu(亮氨酸)
体内的基本所有的物质代谢(合成,分解),物质的消化吸收 物质转运与利用等都由蛋白质参与,如,神经兴奋传导,遗传 信息传递,机体的免疫等重要生命过程都需要蛋白质。
• 蛋白质是一类含氮有机化合物。
1.1 蛋白质的分子组成
元素组成:碳、氢、氧、氮、硫。某些蛋白质还含有其他一些 元素,主要是磷、铁、碘、锌、钼和铜等。这些元素在蛋白质 中的组成百分比约为:
碳 氢 氧 氮 硫 磷
50-52% 7% 23% 16% 0-3% 0.6%
N 16%
PS 其他 1% 2%1% C 50% 他
蛋白质的含氮量
• 蛋白质中的氮占生物组织中所有含氮物质的绝 大部分。因此,可以将生物组织的含氮量近似 地看作蛋白质的含氮量。由于大多数蛋白质的
当溶液浓度为某一pH值时,氨基酸分子中所含的-NH3+和-COO数目正好相等,净电荷为0。这一pH值即为氨基酸的等电点, 简称 pI
OH-
R—CH—COOH │ NH3+
pH < pI
H+
R—CH—COO│ NH3+
pH = pI
OHH+
R—CH—COO│ NH2
pH > pI
COOH H3N
+
C H R
2.2.2 氨基酸的光吸收
构成蛋白质的20种氨基酸在可见 光区都没有光吸收,但在远紫外 区(<220nm)均有光吸收。 在近紫外区(220-300nm)只有酪 氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收 光的能力。
257 、275、280
组成天然蛋白质分子的20种氨基酸中,只有色氨酸、酪氨酸和 苯丙氨酸对近紫外光有光吸收。其吸收峰在280nm左右,以色 氨酸吸收最强。
第二节 蛋白质的分子组成
2.氨基酸
蛋白质的水解 常见方法包括:酸水解、碱水解、酶水解 1. 酸水解 以5-10倍于蛋白质的20%HCl煮沸并回流16-24小时,或高压 121度水解12小时。 优点:水解彻底,终产物是L-氨基酸,没有旋光异构体产生 HCl可以直接加热挥发而除去 缺点: 色氨酸几乎全部被破坏; 经常生成黑色物质,如:腐黑质,水解产物为黑色; 丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸也部分被破坏
第一章
蛋白质化学
生物资源与环境科学学院
胡
疆
第一节 蛋白质(protein)及其生物学功能 • 生物化学的基本内容包括: • 发现和阐明构成生命物体的分子基础- 生物分子的化学组成、结构和性质; • 生物分子的功能与生命现象的关系; • 生物分子在生物机体中的相互作用及其 变化规律。
蛋白质
1 2 3 4 概述 氨基酸 多肽 蛋白质的结构 5 6 蛋白质的重要性质 蛋白质的分离与提纯
以甘氨酸(Gly)为例讨论氨基酸的两性解离和等电点
COOH H3N
+
C H R
-H pK1 ' +H
+
+
COO H3N
+
-
C H R
-H pK2 ' +H
+
+
COO R
pH=10
R– (+) ( –) (+)
R± (–)
在pH5.9时,溶液中 [R+]=[R- ]
静电荷为零时溶液的pH就是该氨基酸的等电点
氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不是以游离的羧基或氨基 形 式 存 在 , 而 是 离 解 成 偶 极 离 子 (Dipolarion) 或 兼 性 离 子 (Zwiterion)的形式存在。 兼性离子:在同一分子上带有等量的正负电荷,即所带净电荷
可利用此性质采用紫外分分光度法测定蛋白质的含量。 酪氨酸的max=275nm,275=1.4x103;
苯丙氨酸的max=257nm,257=2.0x102;
色氨酸的max=280nm,280=5.6x103;
由于都含有苯环结构,共轭体系
2.2.3 两性解离及等电点
氨基酸分子是一种两性电解质。
HS CH2 CH2 NH2 C COOH H
NH2 C COOH H
NH2 C COOH H
甲硫氨酸生物合成的中间产物 Thr,Asp,Met代谢的中间产物 尿素生成的中间产物 尿素生成的中间产物
HO CH2 CH2
H2N CH2
CH2
CH2
O NH2 H2N C NH CH2 CH2 CH2 C COOH H
2.氨基酸
2. 碱水解
条件:6mol/L NaOH或4mol/L Ba(OH)2煮沸6小时可完全水解 成氨基酸
优点:色氨酸没有被破坏,水解产物清亮 缺点:产物氨基酸发生旋光异构现象,出现D-氨基酸,而D氨基酸人体不能吸收,不能分解,营养价值减半。
丝氨酸、苏氨酸、赖氨酸、胱氨酸大部分破坏。
一般很少采用
-H pK1 ' +H
+
+
COO H3N
+
-
C H R
-H pK2 ' +H
+
+
COO R
-
H2N C H
PH 净电荷
1 +1 正离子
7 0 两性离子 等电点PI
10 -1 负离子
取不同pH下的Gly溶液进行电泳,其结果可用如下的示意图表示:
(正极) 样品
(负极) pH=2.0 R+ (+) (–) pH=5.9
2.氨基酸
3. 酶水解 蛋白质在蛋白酶的作用下发生的水解反应 优点:水解条件温和,常温36-60度,常压和pH保持中性 氨基酸基本不被破坏,不发生旋光异构现象。
2.氨基酸
组成蛋白质的基本单位是氨基酸(amino acid,AA) 。如将天然的蛋
白质完全水解,最后都可得到约二十种不同的氨基酸。除脯氨酸 和甘氨酸外,其余均属于L-α-氨基酸
溶菌酶(卵清) 肌红蛋白(马心) 卵白蛋白 血红蛋白(人) a—淀粉酶
13700
13900 16900 44000 64000 97000
糖原磷酸化酶(牛肝)
脲 酶 甲状腺球蛋白 短枝病毒蛋白(番茄) 斑纹病毒蛋白(烟叶)
370600
480000 650000 7600000 40000000
某些蛋白质是由两个或更多个蛋白质亚基(多肽链)通过非共价 结合而成的,称寡聚蛋白质。有些寡聚蛋白质的分子量可高达 数百万甚至数千万。
含氮量接近于16%,所以,可以根据生物样品
中的含氮量来计算蛋白质的大概含量:
• 蛋白质含量(克%)=每克生物样品中含氮的克数 6.25
即:含氮量为1g 的样品中,蛋白质的含量为
1 16%
=6.25g
6.25:是蛋白质的特征常数,也是经典蛋白质测定方法—凯式定氮法的基础
蛋白质的大小与分子量
• 蛋白质是分子量很大的生物分子。
C
NH3
R H
C
NH3
L-丙氨酸
L-丙氨酸
L-氨基酸通式
2.氨基酸
按照化学结构分类:
2. 氨基酸
按照化学结构分类:
2.1 氨基酸的分类
根据R侧链基团解离性质的不同,可将氨基酸进行分类: 1. 酸性氨基酸 Glu,Asp;侧链基团在中性溶液中解离后带负 电荷的氨基酸。 2. 碱性氨基酸 His,Arg,Lys;侧链基团在中性溶液中解离 后带正电荷的氨基酸。 3.中性氨基酸—侧链基团在中性溶液中不发生解离,因而不带 电荷的氨基酸。可分为:
7
蛋白质的分析测定
1.蛋白质概述
蛋白质 (protein) 是由氨基酸为单位组成的一类重要 的生物大分子,是生命的物质基础。 蛋白质存在于所有的生物细胞中,是构成生物体最基 本的结构物质和功能物质。
不同生物体内蛋白质的含量相差很大,植物中一般含量在10- 15%,人和动物中蛋白质含量 一般比较高,干重超过45%, 在动物体中,肝脏,心脏,肺,肌肉中,含量高达68-80%。
H
α碳原子
R – C – COOH NH3 L-α-氨基酸的结构通式 甘油醛
2.1.1 结构与分子构型
旋光性:物质能使平面偏振光的偏振面发生偏转的性质。 能使平面偏振光的偏振面发射功能偏转的物质:旋光物质或 旋光体
2.1 单糖的结构
2.1.1 结构与分子构型
• 手性碳原子:即不对称碳原子,指连接四个不同原子 和基团的碳原子。
NH2 C COOH H CH3 NH2 HOOC C C COOH H H
抗菌素
天冬霉素
2.2 氨基酸的理化性质
2.2.1旋光性
除甘氨酸外,氨基酸均含有一 个手性-碳原子,因此都具有 旋光性。
比旋光度是氨基酸的重要物理 常数之一,是鉴别各种氨基酸 的重要依据(d/l)
天然的蛋白分离出的氨基酸都是L-构型的,人体不能利用D-氨 基酸。 在细菌中含有多种D-氨基酸,如: 细菌细胞壁成分 D-丙氨酸 短杆菌肽D、放线菌素D D-胱氨酸 短杆菌肽D、 多粘菌肽 D-亮氨酸 枯草菌肽A D-天门冬氨酸 细菌肽聚糖 D-谷氨酸 少数D-氨基酸在人体也有生理意义,如青霉素中的D-半胱氨酸 转化成L-半胱氨酸则没有抗菌的功能