水稻线粒体atpA基因的克隆及其与细胞质雄性不育的关系
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缓冲液洗一次,回 收的效果可通过紫外光下检
查负极端胶条中有无 D A来确定。将上面提 N 到的 20 含有回收 D A 的溶液, 5川 N 用等体积 酚和酚一 氯仿混合液各抽提 一次,乙醇 沉淀, D A 溶于少量 T N E中, 用微电泳检测, 并估计 D A 的量, N 其余部分置 4 ℃下保存备用。 结 果
码的C ,, 1 7 其它几个亚基由核基因编码。 ,I 4 水稻是重要的粮食作物,研究 其 线 粒 体 粒体 。p 基因探针为爱丁堡大学 L ae tA evr教
授提供, . b的 Hid 4k 8 nI I I酶切片段中含有完 整的玉米线粒体 ap 基因I 菠菜叶绿体 tA s ] 。 ap 基因探针为我所 15 tA 0 组提供, . k 2 5 4 b的 Sl aI 酶切片段中含有完整的叶绿体 。p 基 aA 因。克隆所用载体为 pR 2质粒, B 3 2 受体菌为
用限制性内切酶完全酶解, 以玉米线粒体 。 A基因和菠菜叶绿体 。 A基因做为探针,进行分子杂 t p t p
交, 将保持系线粒体 。 A 基 因定位在 35 的 Bm 酶 切片段上 , t p .k b aH I 并且以 p R 2 E 32为载体 , 克隆了
这一片段.另外, a H 在Bm I完全酶解谱带的杂交结果中, 不育系线粒体基因组中有两条阳性杂交带, 分 别是35 29 而保持系线粒体基因组中只有 35 .k b和 .k, b .k b一条阳性杂交带, 因而认为水稻不育系线
和水稻细胞质雄性不育分子机制,都是非常有 意义的。本研究首先克隆了水稻线粒体 。p tA 基因,初步探讨了它在水稻细胞质雄性不育系 和可育系线粒体基因组中的差异。
材料和方法
( 一)实验材料 实验所用材料为水稻 B T型细胞质雄性不
取黄化苗, 0 一2℃冷冻保存备用。
( 四)水稻线粒体 DN 的提取及纯化 A 参照 K m l8和 C ae eb[ e, hs[ 方法, 2 1 经修改 用于水稻线粒体 D A 的提取纯化, N 详细步骤 可参照我们实验室以前的报道[0 [ 1 9 1 ( 五)特异 D NA 片段的回收 完全酶解后的线粒体 D A在琼脂糖凝胶 N 上电泳后,E B染色, 在长波紫外光下观察, 切 下含有特异 D A片段的区域, N 胶条用 T E缓 抖液冲洗数次, , 装入用半透膜封好的转移槽中, 加人灭菌电泳缓冲液, 0V电泳 4 10 小时, 结束 电泳前加一个反向电流,然后在转移槽的正极 端吸取最下部的 20 0 , 溶液, u 1 并再用 5 f T 0 E & 1
功能基因如果位于重复顺序的边缘,就有可能 在重复顺序发生重组时受到影响,引起基因结 构的表化, 可育型玉米中。p 基因有两个拷贝, tA
位于 6k 7 b质粒状 DNA分子上靠近 1k 2b同向
重复顺序的一端, 而三种类型不育型 ( MSC C -, C -, - )玉米中,ap 基因只有 1 MSS C T MS tA 个拷贝。研究发现, 不育型玉米的 1k 2b同向重 复顺序至少有部分是缺失的113 5 ,。另外, OI ,1 13 CX 基因[, X 基 因,1S 6 C I 1 O I 8 NA基 因,2S r R 6
图 2 t A 基因在水稻 ( 光 B ap 秋 )线 粒休 D A 限制 N 性 内切酶谱带上的定位 A A . NA . c R - H n I ; B m I消化的水 D E o I id B a H I - I . I 稻线粒体 DNA C H n ; id川 消化的水稻线粒体 DNA; .
Leabharlann Baidu
体 D A 并进行了琼脂糖凝胶电泳分析。 图 N,
1 显示的是水稻线粒体 D A在 0 外 琼脂糖 N . 8 凝胶上的电泳结果。秋光A和秋光 B 都有 1 条 主带 D A分子和三条小的质粒状分子带。秋 N 光 A较秋光B多出 1 1 k 条 9 b左右的质粒状分 子带。将提取的线粒体 D A用限制性内切酶 N B m a HI和 Hid nI I I完全酶解, 1 在 0 的琼脂 % o 糖凝胶上电泳,E B染色后在 2k 以上的地方 0b 不存在主带 D A分子( N 如图2 所示) 。将电泳 后的 D A分子转移到硝酸纤维素滤膜上,用 N 3 2 p标记的 ap 基因探针进行分子杂交。 杂 tA 交结果显示,在 B m a HI和 Hid nI I I酶切谱 带中各有 1 条阳性杂交带,B m a H I酶切谱带 中的阳性杂交带略低于 Hid nI I I酶切谱带 中 的阳性杂交带,大小约为 3 k . b左右 ( 2. 5 图 ) 这表明在秋光B线粒体基 因组 中,含有 1 个 ap 基因的拷贝, tA 存在于 B m 和Hid aH I nI I I 酶切谱带的 3 k 左右的片段上。 .b 5 ( 二)水稻线粒体 a p 基因的克隆和 tA
遗传
2 H R DT S(e n ) () E E IA Bi g 1 4
1 4 9 - 19 0
水 粒 aA基因 克 及 与 胞 稻线 体 t p 的 隆 其 细 质
雄性不育的关系
李 大东 王 斌
( 中国科学院遗 传研究所 , 北京)
本研究以水稻 B 型细 胞质雄性不育 系秋 光A和 相应 的保持系秋 光 B T 为材料 , 取线 粒体 D A 提 N ,
ap 基因的结构、 tA 表达及其在不育系和可育系
中的差异,对全面了解核质间基因的协调表达
大肠杆菌 190 52
( 三)材料处理和培养 取水稻种子 10 0 克,用 3 多安替福民表面 消毒 1 分钟, 0 自来水冲洗 1 分钟, 0 再用无菌水
洗涤 3 -,次。种于铺于无菌水打湿的纱布上, 3 ℃ 黑暗培养,每天换水 2 0 -3次,7 -8天剪
为载体, 克隆这些片段, 通过抗菌素筛选得到重
组质粒。
由于受体菌基因组和植物线粒体基因组中 的 ap 基因有一定的同源性, tA 因此,无法用 菌落杂交方法来进一步筛选含有 。p tA基因的
克隆。我们用碱裂解法快速提取重组质粒,电 鉴 定, 泳检查质粒的大小,选出含有 3 k 左右插人 .b 5 经 B m I完全酶解 的 秋 光 B线 粒 体 a H 片段的重组质粒,将这些质粒 D NA分子总印 DNA ,在 1 的琼脂糖凝胶上, 0 4 电泳 外 6 V, ℃ 吸附在硝酸纤维滤膜上, a 标记的 ap 用S p tA基 过夜,E B染色后在长波紫外光下切取含有 3 . 因探针进行分子杂交,结果如图 3 X 胶片上 5 , 一 k b左右 D A 片段的区域,用电转移的方法 显示出阳性杂交点,可初步认为显示阳性杂交 N 回收其中所含的 D A片段,以pR 质粒 反应的质粒 D N B 32 2 NA 分子中含有 。p 基因的 tA 同源顺序。 将杂交中表现阳 性 反 应 的 质 粒 D A 分子用 B m N a HI消化,电泳后将 D A N 片段转移至硝酸纤维素滤膜上,用 3 2 p标记 的 ap t A基因探针进行分子杂交, 结果如图 4 在 , 3 k 处显示 3 .b 5 条阳性杂交带, 对应于电泳后的 3 条插人 D A 片段, N 表明这 3 个重组质粒都 含有水稻线粒体 ap 基因。 zA ( 三)u p 基因在水稻秋光A和秋光B tA 线粒体基因组中拷贝数的差异 秋光A和秋光 B 线粒体 D A 经 Bm N a HI 完全消化, 1 在 多琼脂糖凝胶上电泳过夜,E B 图 3 N 点 印杂交筛选含有 ap 基因的正组 D A tA 染色后将 D A片段转移至硝酸纤 维素滤膜 N 质粒 箭头指 示出阳性杂 交点, 可能含有 。 A 基 t p 因的插人片段。 上,ap 基因探针杂交结果如图5 tA 所示:在
rN R A基因, 在某些植物线粒体基因组中 都表
现多拷贝。研究表明,这时它们都和重复顺序 相邻。根据我们的实验结果,在水稻细胞质雄 性不育系线粒体基因组中有两个 。p tA基因拷 贝,而可育系水稻线粒体 基因组 中只有 1 个 ap 基因拷贝。这种 。p 基因多拷贝的现 tA tA 象很可能是由于线粒体基因组中的重复顺序间 发生重组, 影响到其周围的功能基因而造成的, 这种变化以后在进化中得到固定,这样便使不 育系线粒体基因组中 。 A基因表现为两个拷 t p
B. a A 基因探针杂 交 结 果; 在 水 稻 线 粒 体 'C. ' t p B m 和 Hn I 酶切 aH I id I I 谱带中 各有 1 条阳性杂交 带,
分子 量大约为35 .k. b
不清楚, 因此将 ap 基因定位在限制性酶切 tA 图谱上是非常必要的。首先我们提取水稻线粒
粒体基因组 中可能 有两个 。 A 基 因拷 贝,而 相应的保持系线粒体基因组中 只有 一 个 。 A 基 因 拷 t p t p
贝。
关 键词 :水稻 , 细胞质 雄性不 育,a A 基 因 t p
。此材料 植物线粒体内膜上的 A P合成酶在能量 育系秋光A及其相应的保持系秋光 B T 产物的形成过程中起重要作用。 合成酶由 F 由北京市农科院作物所洪立芳先生提供。 , ( 二)ap 墓因探针 tA 和F 。两部分构成,F 是酶蛋白的膜外区域, : 实验中使用了玉米线粒体 。 A基因探针 i p 具有催化 A TP合成的功能,由 5 个亚基组成 tA 用两种探针分 (q , , ), ,; 。 a , 丫 “ 。〔】, F 是酶蛋白的膜内区 和菠菜叶绿体 ap 基因探针, 8 q ,巧, ‘ ] 得到的结果是一致的, 玉米线 域, 具有质子跨膜传输功能, 至少由4个亚基组 别进行杂交实验, 成(, 8 9[。在酵母和动物细胞中, , 6 7 , 1 , )6 1 F部 分的所有亚基均由核基因编码阴,在高等植物 中则不同,A P酶 。亚基是由线粒体基因编 T 一
贝。
在正常可育水稻线粒体基因组中只有 1 个 ap tA基因的拷贝, 说明植物线粒体基因组中有 1 个正常功能的 ap 基因, tA 植物即可正常生 B. a A 基因 'C. ' s p 探针杂 交结果, 秋光A 谱带中 长繁殖。在雄性不育水稻线粒体基因组中有两 有356 . b .k 和29 两条阳 k 性杂交带, 秋光B 谱带中 个 。p 基因拷贝, tA 这种变异和细胞质雄性不 只 35 有 .k b一条阳 性杂交带。 育会有怎样的关系呢?很多人认为细胞质雄性 N 秋光 A的酶切谱带上有两条阳性杂交带,1 条 不育是由于线粒体 D A 分子突变和重组造成 91 ,, 1 3 k 1 2 k; . b,条 . b而秋光B线粒体 D A 5 9 N 的酶 的[0那么涉及线粒体编码的功能基因的突变 切谱带中只有 1 3 k 的阳性杂交带,我们 和重组对雄性不育的形成是不是更有作用?这 条 . b 5 认为,由于两系酶切谱带中都有共 同的 3 k 些问题都有待进一步研究。 . b 5 的阳性杂交片段,而且 3 条杂交带在X胶片上 参 考 文 献 表现相同的亮度。 可以认为, 秋光A线粒体基因 组中含有两个 ap 基因拷贝, iA 比秋光B基因 [] Bur, ,M. iut A. feu 18. Bo. 」 ot M y B qe r , G f : 3 J i o a 9 . l
L D d n e a. Rc ap G n C o ig n i o g l ie A e e lnn ad a t : t R lt nhp t C tpai c ae rl y eai si w h uo ls o i mi M l Sei t t i 本文于 18 年 3 9日收到。 9, 月
图 ; Suhr 交签定重组质拉 oten杂
A .NA・ cR + H n I ; . . D E oI idI B I -D 酶切后重组 质粒 ;B-D' ap 基 因探 针杂交结果 。 三个重 ' . A t 组质粒 中的插人片段都可和 ap 基因探针杂 交, sA 确证重组片段 中含有 ap 基因。 tA
( 一)水稻秋光B线粒体 。p t A基因在限 制性内切酶图谱上的定位 迄今我们未见有水稻线粒体基因组的物理 图谱, 关于 ap 基因的定位、片段大小还都 iA
图 1 水稻线粒体 D A 电泳结果 N
A ; , DNA・ c R 十 Hid ; E o I n1 B 1 1 .秋光 A线粒体 D ; 秋光 B NA C . 线粒体 D .除 主带 D NA NA分子 外, 秋光 A和秋光 B线粒体 D NA 中都 存在 3 低分 条 子量带 ( N, N, ,, 秋光 A 粒体 D N) 线 NA 中有 1 条特异 的 1k 左右低分子量带。 9b