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i*框架设计过程中的几个关键问题 自治性（Autonomy） 意识（Intentionality） 社会性（Sociality） 身份与边界（Identity and Boundary） 战略反射（Strategic Reflectivity）
Agents-in-the-world: agents需要参照或比较完成任务的替代方 式，而不是不带疑问地执行任务 Agents-as-softwHale Waihona Puke re: 在软件运行的过程中，潜在的完成
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SD模型是一个图，每个节点代表角色，角色间的连接意味 着为了达到某种目标，一个角色在某些方面需要依赖于另 一个角色。
SD模型表达了角色希望从其它角色那里得到什么，因此可被看成 是一个相关性的网络 Depender Dependee dependum
将相关性的强度划分为三种不同的程度：开放的（open/
uncommitted）、受约束的（committed）和关键的（critical）
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SD模型关注于角色之间的关系，而SR模型为每个角色对 它们有意识的关系进行推理提供建模支持
SR模型是一个图，图中的节点代表目标、任务、资源和软目标， 它们可以通过手段-目的链或任务分解链进行连接
Agents-in-the-world: 为了说明现实世界的不确定性和开放性， 诸如目标、信仰等意识相关的概念非常重要 Agents-as-software: 意识作为一种特性，可以用来产生agent的 行为
社会性（Sociality） 身份与边界（Identity and Boundary） 战略反映（Strategic Reflectivity） 理性的利己主义（Rational Self-interest）
资源相关性（resource dependency）: the depender depends on the dependee for the availability of an entity (physical or informational). 软目标相关性（softgoal dependency）: a depender depends on the dependee to perform some task that meets a softgoal.
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i*框架设计过程中的几个关键问题 自治性（Autonomy） 意识（Intentionality） 社会性（Sociality）
Agents-in-the-world: 具有自治性的实体拥有它们自己的意识， 而且并不必要与外部的要求或愿望相适应。自治性的agent可以根 据自身的条件，在不同程度上选择是否合作 Agents-as-software: 意识是指软件的一种特性，能够使软件表 现出丰富的行为规律
意识（Intentionality） 社会性（Sociality） 身份与边界（Identity and Boundary） 战略反映（Strategic Reflectivity） 理性的利己主义（Rational Self-interest）
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i*框架设计过程中的几个关键问题 自治性（Autonomy） 意识（Intentionality）
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4 Agents-in-the-World versus Agents-as-Software i*框架设计过程中的几个关键问题 自治性（Autonomy）
Agents-in-the-world:需要意识到它们周围的不确定性。同时，它 们也是这个世界中不确定性的来源 Agents-as-software:自治性是指在没有人或其它主体直接干涉的 情况下，软件独立行动的能力
身份与边界（Identity and Boundary） 战略反映（Strategic Reflectivity） 理性的利己主义（Rational Self-interest）
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i*框架设计过程中的几个关键问题 自治性（Autonomy） 意识（Intentionality） 社会性（Sociality） 身份与边界（Identity and Boundary）
理性的利己主义（Rational Self-interest）
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i*框架设计过程中的几个关键问题 自治性（Autonomy） 意识（Intentionality） 社会性（Sociality） 身份与边界（Identity and Boundary） 战略反映（Strategic Reflectivity） 理性的利己主义（Rational Self-interest）
人们开始认识到需求的重要性，而且给予环境更多地关注 在软件Agent中，引入社会和组织的一些概念 工作流（workflow）建模方法 The Tropos Project致力于发展一套软件开发的方法论
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6 Engineering of Agent-Oriented Software vs. Agent-Oriented Engineering of Software 面向agent的软件工程：就是采用agent概念作为核心的计 算抽象概念的软件工程 Agent的抽象概念和模型提供了传统符号所没有的表示和 灵活性。 软件工程的许多挑战不是技术性的，而是社会性和组织性 的，如可重用性、可维护性、可扩展性、易理解性、外包、 综合集成等
Agents-in-the-world: 每个agent选择它们各自的策略，实现自身 利益的最大化 Agents-as-software: 按照目标和信念，调整自身的行为
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5 Related Work
当前面向agent的软件工程的大多数的工作来源自程序设计 和人工智能/分布式人工智能系统的观点，随着技术基础的 成熟，我们需要更加关注软件工程及其应用方法论的问题
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为了表明两个角色之间关系的自由性与控制性的本质，将 相关性区分为4种类型：
目标相关性（goal dependency）: the depender depends on the dependee to bring about a certain state of affairs in the world. 任务相关性（task dependency）: the depender depends on the dependee to carry out an activity.
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QSAR with CoMFA® 建立3D-QSAR模型(CoMFA)
QSAR 的工作原理
Quantitive Structure Activity Relationships
建立生理活性与可计算的分子性质之间的关系
以数值的方式描述活性 以数值的方式来描述分子的性质 合理的统计方法使活性与描述符相关
Agents-in-the-world: 边界和身份的变化，通常是社会化、谈判 和权力的转移等社会过程的结果 Agents-as-software: 如果所有agent都处于设计者的控制之中， 则身份和边界的问题就变得比较简单
战略反映（Strategic Reflectivity） 理性的利己主义（Rational Self-interest）
CoMFA通过图形技术将结构与活性的关系展示出来
–CoMFA自问世以来，由于其预测能力强，模型形象、直观，已逐 渐成为应用最为广泛的3D-QSAR方法
立体场
绿色：增加体积会增强活性 黄色：减少体积会增强活性
静电场
蓝色：增加正电荷能增强活性 红色：增加负电荷能增强活性 通过等势图，可以判断空间中哪些位置分子场的变化会与活性变化是相 关的。活性
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重要的影响因素
models must be predicitive - or they’re useless（可预测性） models should be interpretable - where possible（可解释性）
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QSAR with CoMFA® 建立3D-QSAR模型(CoMFA)
计算机辅助药物设计与SYBYL软 件的应用
——PPT总结汇报
汇报人：刘培培 2014.10
内容摘要
SYBYL-X软件简介 SYBYL_X软件的应用 SYBYL_X中COMFA的步骤 COMFA的结果展示
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1 introduction SYBYL Base包括了用于分子模拟的丰富工具：结 构搭建、优化、比较；结构及相关数据的图形显 示；标注、图形输出；多种精确的力场。 SYBYL基础软件包含分子建模的基础模块和工具， 可以实现分子结构搭建、优化、比较，结构和相 关数据的可视化，注释，硬拷贝，抓屏以及多种 分子力场的研究。SYBYL基础软件与SYBYL应用软 件整合在一起，使其更加有利于用户的科研工作。 SYBYL基础应用中的QSAR可以通过构建模型来预测 位置化合物的活力