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To identify new susceptibility loci for blood pressure in Chinese population.
To investigate whether the blood pressure variants would contribute to the traditional cardiovascular risk factors including lipid levels, plasma glucose, and BMI.
7
GWAS-hypertension
目的&对象
PART TWO
PART TWO 研究目的
To evaluate whether the previous reported loci associated with blood pressure could be generalized to the Chinese population.
• 数量性状定位分析(QTL 分析，Quantitative Trait Locus) 它指的是定位控制数量性状的基因在基因组中的位置，实际上是借助一些分子标记分析数量性状的 关系，将数量性状对应的QTL定位于分子标记间。
• 表达数量性状定位分析(eQTLs分析，expression quantitative trait locus analysis) 将基因的表达水平作为数量性状，采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs)，一个eQTL是 染色体上的一个位点，可包含若干个基因，这些基因控制某个基因的遗传表达。
Genome-wide association study in Chinese identifies novel loci for blood pressure and hypertension
GWAS-hypertension
目录
• Hypertension is a common disorder and the leading risk factor for cardiovascular disease and premature deaths (早死)worldwide.
9
PART TWO 研究对象
The writer conducted a large scale GWAS of blood pressure and hypertension that
eQTLs analysis (expression quantitative trait locus analysis)
表达数量性状定位分析，将基因的表达水平作为数量性状，采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs)
4
PART ONE 背景知识
全基因组关联分析 Genome-wide association study
1.限制性片段长度多态性RFLP 限制性酶切位点多态性→切割基因组时产生的片段数目及长度不一；
2.可变数目串联重复序列VNTRS 一些短的核苷酸序列重复次数不同所致；小卫星DNA&微卫星DNA遗传标志
；
3.单核苷酸多态性SNP 基因组中核苷酸的变异引起的DNA序列多样性，包括点突变、单个碱基插入、缺失、置换。
• 最早于1996 年提出，将人类复杂疾病的研究从 候选基因转向全基因组水平，在群体水平检测 全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗 传关联，用更大规模的检测得到与疾病相关的 每一个基因。
5
PART ONE 背景知识
基因多态性 Polymorphism
• 多态性是指处于随机婚配的群体中，同一基因位点可存在两种以上的基因型。如果某位点上所有的 等位基因频率均大于0.01，携带该等位基因的杂合子频率大于2%，则认为该基因座具有多态性。
• Genome-wide association studies (GWASs) in the European population have identified multiple chromosomal regions associated with blood pressure, and the identified loci(基因位点)altogether explain only a small fraction of the variance for blood pressure.
注：染色体、基因、block和SNP这四者大致是什么关系？
6
PART ONE 背景知识
表达数量性状定位分析 expression quantitative trait locus
• 数量性状(QT，Quantitative Trait) 生物体的一些性状是由多基因共同控制的，其测量值可以用连续的数量进行表示，这些性状统称为 数量性状。
背景知识
PART ONE
目的&对象
PART TWO
研究设计
PART THREE
统计分析
PART FOUR
研究结果
PART FIVE
研究意义
PART SIX
2
源自文库WAS-hypertension
背景知识
PART ONE
PART ONE 背景知识
GWAS(Genome-wide association study)
• To identify novel genetic variants ( 基 因 多 态 性 )affecting blood pressure variation, the writer conducted a meta -analysis of GWASs of blood pressure and hypertension in 11816 subjects followed by replication studies(重复试验) including 69146 additional individuals.
全基因组关联分析，是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），从中筛选 出与疾病相关的SNPs。
SNPs(single nucleotide polymorphism)
单核苷酸多态性，是指基因组中核苷酸的变异而引起的DNA序列多样性，包括点突变、单个碱基的插入、缺失 和置换。
To investigate whether the blood pressure variants would contribute to the traditional cardiovascular risk factors including lipid levels, plasma glucose, and BMI.
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GWAS-hypertension
目的&对象
PART TWO
PART TWO 研究目的
To evaluate whether the previous reported loci associated with blood pressure could be generalized to the Chinese population.
• 数量性状定位分析(QTL 分析，Quantitative Trait Locus) 它指的是定位控制数量性状的基因在基因组中的位置，实际上是借助一些分子标记分析数量性状的 关系，将数量性状对应的QTL定位于分子标记间。
• 表达数量性状定位分析(eQTLs分析，expression quantitative trait locus analysis) 将基因的表达水平作为数量性状，采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs)，一个eQTL是 染色体上的一个位点，可包含若干个基因，这些基因控制某个基因的遗传表达。
Genome-wide association study in Chinese identifies novel loci for blood pressure and hypertension
GWAS-hypertension
目录
• Hypertension is a common disorder and the leading risk factor for cardiovascular disease and premature deaths (早死)worldwide.
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PART TWO 研究对象
The writer conducted a large scale GWAS of blood pressure and hypertension that
eQTLs analysis (expression quantitative trait locus analysis)
表达数量性状定位分析，将基因的表达水平作为数量性状，采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs)
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PART ONE 背景知识
全基因组关联分析 Genome-wide association study
1.限制性片段长度多态性RFLP 限制性酶切位点多态性→切割基因组时产生的片段数目及长度不一；
2.可变数目串联重复序列VNTRS 一些短的核苷酸序列重复次数不同所致；小卫星DNA&微卫星DNA遗传标志
；
3.单核苷酸多态性SNP 基因组中核苷酸的变异引起的DNA序列多样性，包括点突变、单个碱基插入、缺失、置换。
• 最早于1996 年提出，将人类复杂疾病的研究从 候选基因转向全基因组水平，在群体水平检测 全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗 传关联，用更大规模的检测得到与疾病相关的 每一个基因。
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PART ONE 背景知识
基因多态性 Polymorphism
• 多态性是指处于随机婚配的群体中，同一基因位点可存在两种以上的基因型。如果某位点上所有的 等位基因频率均大于0.01，携带该等位基因的杂合子频率大于2%，则认为该基因座具有多态性。
• Genome-wide association studies (GWASs) in the European population have identified multiple chromosomal regions associated with blood pressure, and the identified loci(基因位点)altogether explain only a small fraction of the variance for blood pressure.
注：染色体、基因、block和SNP这四者大致是什么关系？
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PART ONE 背景知识
表达数量性状定位分析 expression quantitative trait locus
• 数量性状(QT，Quantitative Trait) 生物体的一些性状是由多基因共同控制的，其测量值可以用连续的数量进行表示，这些性状统称为 数量性状。
背景知识
PART ONE
目的&对象
PART TWO
研究设计
PART THREE
统计分析
PART FOUR
研究结果
PART FIVE
研究意义
PART SIX
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源自文库WAS-hypertension
背景知识
PART ONE
PART ONE 背景知识
GWAS(Genome-wide association study)
• To identify novel genetic variants ( 基 因 多 态 性 )affecting blood pressure variation, the writer conducted a meta -analysis of GWASs of blood pressure and hypertension in 11816 subjects followed by replication studies(重复试验) including 69146 additional individuals.
全基因组关联分析，是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），从中筛选 出与疾病相关的SNPs。
SNPs(single nucleotide polymorphism)
单核苷酸多态性，是指基因组中核苷酸的变异而引起的DNA序列多样性，包括点突变、单个碱基的插入、缺失 和置换。