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文献阅读报告教学要点PPT课件
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2020/3/19
12
3、阅读的文献信息量大
*为本专业权威或重要(核心)期刊 *避免重要遗漏:公认的观点、最新的进展 *反映该领域主要研究结论和发展过程 *每次报告的文献数量3—5篇
2020/3/19
13
PPls联合抗生素根除 幽门螺杆菌感染
消化内科学员 2012、9
2020/3/19
14
参考文献
1.张川.幽门螺杆菌根除失败原因及对策;山东医药,2011,5(1):1011.
2.Malfcrtheiner P ,Megrand F, O’Mnrain C, et a1.Current concepts in the management of Helicobacter pylori infection the Maastrieht III Consensus Report[J]. Gut, 2007, 56: 772
求(首先自己要做好) *代缴的临床药师学员未完全领会要求 (然后带领学员做好) 没有体现在带教上,须提示师资学员。
2020/3/19
30
2、师资学员主持报告会不够规范 *对会场的引导、管控能力欠缺 (引导其他学员踊跃提出问题、现场讨论等) *对学员报告的点评分析不够到位 (明确指出报告的两点、存在的问题、改进
2、参考标准
2020/3/19
28
指标
查阅文 献
论证分 析
观点设 想
表达能 力
带教药师签名: 年月 日
2020/3/19
考核等级(分值)
得分
A
B
C
D
30-26 25-22 20-18 17-0
总分:
29
六、师资培训效果评估
1、师资培训学员与带教学员的整理落差 *师资学员自身“文献阅读报告”基本符合要
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2
为什么要进行文献汇报
汇报人学习和掌握本学科前沿进展,避免“闭 门造车
以牛人大家的工作为参照,学习研究思路, Idea
对自己工作水平的判断 组内其它成员了解相关领域的知识,拓宽视野 提高个人写文章的能力,制作PPT的能力和讲
演能力 督促学习
3
怎样进行文献汇报
选择文献 阅读目标文献及重要参考文献 研究文献 文献汇报 组内讨论(非文献本身)
文献汇报
2015/12/2
1
什么是文献汇报
文献汇报是指汇报人对一篇或多篇文献进行深 入阅读研究后,对文献研究背景,研究目的, 研究方法、研究手段和研究结果以及对汇报人 有何启示等方面以书面形式进行的报告。
作者为什么要进行研究?怎么样研究?研究结 果如何?
对汇报人的启发?新课题的启示?对自己工作 的指导意义?
4
文献汇报的结构
文献简介 (发表时间,杂志,作者,作者研 究领域)
文献结构 文献思路和文献内容 有何启发
5
如何选择文献
课题相关 层次深,影响力强(IF) 内容新颖 经典文献,最新文献,仪器方法,科普宣传,
综述文献
6
如何查找文献
一般eb of science, 中国知网,
Alexander M. Spokoyny, Bradley L. Pentelute1 & Stephen L. Buchwald1 5. 作者研究领域:Organic methodology (Buchwald-Hartwig reaction)
12
文献背景(大背景和小背景)
大 背 景 ( 研 究 意 义 和 研 究 难 点 ) : Post-translational modifications
为什么要进行文献汇报
汇报人学习和掌握本学科前沿进展,避免“闭 门造车
以牛人大家的工作为参照,学习研究思路, Idea
对自己工作水平的判断 组内其它成员了解相关领域的知识,拓宽视野 提高个人写文章的能力,制作PPT的能力和讲
演能力 督促学习
3
怎样进行文献汇报
选择文献 阅读目标文献及重要参考文献 研究文献 文献汇报 组内讨论(非文献本身)
文献汇报
2015/12/2
1
什么是文献汇报
文献汇报是指汇报人对一篇或多篇文献进行深 入阅读研究后,对文献研究背景,研究目的, 研究方法、研究手段和研究结果以及对汇报人 有何启示等方面以书面形式进行的报告。
作者为什么要进行研究?怎么样研究?研究结 果如何?
对汇报人的启发?新课题的启示?对自己工作 的指导意义?
4
文献汇报的结构
文献简介 (发表时间,杂志,作者,作者研 究领域)
文献结构 文献思路和文献内容 有何启发
5
如何选择文献
课题相关 层次深,影响力强(IF) 内容新颖 经典文献,最新文献,仪器方法,科普宣传,
综述文献
6
如何查找文献
一般eb of science, 中国知网,
Alexander M. Spokoyny, Bradley L. Pentelute1 & Stephen L. Buchwald1 5. 作者研究领域:Organic methodology (Buchwald-Hartwig reaction)
12
文献背景(大背景和小背景)
大 背 景 ( 研 究 意 义 和 研 究 难 点 ) : Post-translational modifications
研究生文献阅读报告PPT模板共54页
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研究生文献阅读报告PPT模板
1、战鼓一响,法律无声。——英国 2、任何法律的根本;不,不成文法本 身就是 讲道理 ……法 律,也 ----即 明示道 理。— —爱·科 克
3、法律是最保险的头盔。——爱·科 克 4、一个国家如果纲纪不正,其国风一 定颓败 。—— 塞内加 5、法律不能使人人平等,但是在法律 面前人 人是平 等的。 ——波 洛克
谢谢你的阅读
❖ 知识就是财富 ❖ 丰富你的人生
71、既我沿着这条路走下去。——康德 72、家庭成为快乐的种子在外也不致成为障碍物但在旅行之际却是夜间的伴侣。——西塞罗 73、坚持意志伟大的事业需要始终不渝的精神。——伏尔泰 74、路漫漫其修道远,吾将上下而求索。——屈原 75、内外相应,言行相称。——韩非
1、战鼓一响,法律无声。——英国 2、任何法律的根本;不,不成文法本 身就是 讲道理 ……法 律,也 ----即 明示道 理。— —爱·科 克
3、法律是最保险的头盔。——爱·科 克 4、一个国家如果纲纪不正,其国风一 定颓败 。—— 塞内加 5、法律不能使人人平等,但是在法律 面前人 人是平 等的。 ——波 洛克
谢谢你的阅读
❖ 知识就是财富 ❖ 丰富你的人生
71、既我沿着这条路走下去。——康德 72、家庭成为快乐的种子在外也不致成为障碍物但在旅行之际却是夜间的伴侣。——西塞罗 73、坚持意志伟大的事业需要始终不渝的精神。——伏尔泰 74、路漫漫其修道远,吾将上下而求索。——屈原 75、内外相应,言行相称。——韩非
《文献阅读汇报》PPT课件
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地高辛中毒?
原因分析
4
文献分析
电解质紊乱
低钾低镁均可诱发和加重地高辛中毒,镁是Na+_K+ATP酶的 辅酶,低镁可诱发和加重心肌细胞失钾,提高心肌对地高辛的敏感性。 案例:血浆地高辛浓度1.4ng/ml,血钾从4mmol/L降至3mmol/L,地 高辛中毒危险从11%增至26%。【1】
【1】王万迎,维持量地高辛中毒原因探讨[J].中国实用医药杂志,2007,35(2):124
2.中毒患者心率失常发生率为51.6%
10
95例地高辛中毒原因分析
主要原因 合并用药
404例地高辛血药浓度监测结果分析
中毒原因 合并用药 肾功能异常 血钾异常 其他
11
构成比 67.40% 21.10% 12.60% 5.30%
讨论(用药监护)
1.老年人特殊的生理结构是导致SDC升高的主要原因 a.骨骼肌减少:地高辛吸收后50%与骨骼肌结合,因而老
文献阅读汇报-地高辛中毒原因分 析及临床监护要点
主要内容
1.地高辛中毒原因分析
2.地高辛监护要点
2
文献摘要
❖ 基本情况:2009.01-2011.04,地高辛中毒患者24例,男6例, 女18例,年龄45-97岁,平均年龄63岁。
❖ 基础疾病:风湿性心脏病合并心力衰竭2例,冠心病合并心力衰竭4
例,高血压心脏病合并心力衰竭4例,扩张性心力衰竭合并心力衰
竭1例,肺源性心脏病合并心力衰竭9例。
常规维持剂量 口服地高辛0.25mg/d
0.125m g/d更不 易出现血 药浓度中 毒,
3
一周及一个月后
❖ 患者出现恶心,呕吐,色觉异常,房室传导阻滞13例,严重窦性心 动过缓5例。
❖ 血药浓度监测结果2.ห้องสมุดไป่ตู้6至4.00ng/ml(安全范围:0.8-4.00ng/ml)
研究生经典文献汇报ppt幻灯片课件
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通过对比分析和实证研究,我们验证了经典文献中的某些观点和理论,进一步证实了其学术价值和影响 力。
汇报范围
01
经典文献的定义和范围
02 所选文献的背景、作者、主要内容及学术 价值
03
文献阅读过程中的心得体会和收获
04
对于所选文献的批判性思考和未来研究方 向的展望
02
经典文献概述
文献来源与筛选
学术期刊
浏览学术期刊,关注领域内的重 要论文和研究成果。
专家推荐
请教领域内的专家,获取经典文 献推荐。
数据处理与清洗
对收集到的数据进行预处理,包括数据清洗 、转换和整合等,确保数据质量。
数据分析方法
运用统计学和数据分析技术对数据进行描述 性、推断性和预术选择
根据研究需要选择合适的技术手段,如生物技术、信息技术等。
技术操作与实现
详细介绍技术手段的操作步骤和实现过程,确保技术的可行性和可 重复性。
核心观点2
支持核心观点1的证据和理由,包括数据、案 例、理论等
论据2
支持核心观点2的证据和理由,包括实验、调 查、比较等
创新点与特色
创新点1
文献在研究方法、理论或实践方面的创新之 处
创新点2
文献在解决问题或推动领域发展方面的贡献
特色1
文献在研究视角、思路或结论方面的独特之 处
特色2
文献在学术价值、实践意义或社会影响方面 的突出表现
学术价值与影响
学术价值
分析经典文献的学术价值,包括创新性、理论深度和实证结果等 方面。
学术影响
评估经典文献的学术影响,包括被引频次、下载量、影响因子等 指标。
研究启示
总结经典文献对后续研究的启示和意义,提出未来研究方向和展 望。
汇报范围
01
经典文献的定义和范围
02 所选文献的背景、作者、主要内容及学术 价值
03
文献阅读过程中的心得体会和收获
04
对于所选文献的批判性思考和未来研究方 向的展望
02
经典文献概述
文献来源与筛选
学术期刊
浏览学术期刊,关注领域内的重 要论文和研究成果。
专家推荐
请教领域内的专家,获取经典文 献推荐。
数据处理与清洗
对收集到的数据进行预处理,包括数据清洗 、转换和整合等,确保数据质量。
数据分析方法
运用统计学和数据分析技术对数据进行描述 性、推断性和预术选择
根据研究需要选择合适的技术手段,如生物技术、信息技术等。
技术操作与实现
详细介绍技术手段的操作步骤和实现过程,确保技术的可行性和可 重复性。
核心观点2
支持核心观点1的证据和理由,包括数据、案 例、理论等
论据2
支持核心观点2的证据和理由,包括实验、调 查、比较等
创新点与特色
创新点1
文献在研究方法、理论或实践方面的创新之 处
创新点2
文献在解决问题或推动领域发展方面的贡献
特色1
文献在研究视角、思路或结论方面的独特之 处
特色2
文献在学术价值、实践意义或社会影响方面 的突出表现
学术价值与影响
学术价值
分析经典文献的学术价值,包括创新性、理论深度和实证结果等 方面。
学术影响
评估经典文献的学术影响,包括被引频次、下载量、影响因子等 指标。
研究启示
总结经典文献对后续研究的启示和意义,提出未来研究方向和展 望。
文献阅读 ppt课件
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本文将借鉴“属性感知→ 价值判断→态度形成→行为意向”的消费决策过 程,探索导致大学生在手机初购与再购行为差异的影响因素。文章将首先采 用专家调查法来确定影响大学生手机消费的影响因素,接着通过T-检验来验 证这些因素对大学生手机初购与再购行为影响的差异。通过对110名大学生 手机初购和再购行为的影响因素的实际调查,文章发现品牌声誉、手机价格、 手机功能、手机质量、外观设计、社会从众心理、情感价值、手机企业的宣 传是影响大学生手机消费的影响因素,且这些因素对初购行为和再购行为的 影响有显著性的差异。
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23
例1:区域创新网络中的技术合作与转移 仿真研究
区域发展的竞争力与区域创新网络之间的联系,越来越引起学者的关注。
技术合作与技术转移作为企业创新的有效方式正受到越来越多的企业青睐。
技术合作与转移通常研不究仅目仅的在两及家意企义业之间互动,更多的时候是在一个社会
网络结构中。
本文对区域创新网络的相关理论进行梳理,分析了日本以及台湾新竹地区
技巧二:随时整理
对于特别重要的文献,做一个读书笔记,摘录其 中的重要观点和论述。这样一步一个脚印,到真正开 始写论文时就积累了大量“干货”,可以随时享用。
例2:产业集聚、创新网络与集群企业技术能 力——基于绍兴市14262份问卷的调查与分析
从产业集聚、创新网络两重视角,分析了集群企业技术能力的影 响因素,并在此基础上,运用绍兴市纺织产业集群的14262份问卷实 证检验了产业集群、创新网络对集群企业技术能力的影响。
结果表明,产业集聚、创新网络对集群企业的技术能力有明显的促 进作用;产业集聚与创新网络的所有子效应,对不同技术子能力的影 响程度均存在明显差异。
ppt课件
30
文献综述的写法
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23
例1:区域创新网络中的技术合作与转移 仿真研究
区域发展的竞争力与区域创新网络之间的联系,越来越引起学者的关注。
技术合作与技术转移作为企业创新的有效方式正受到越来越多的企业青睐。
技术合作与转移通常研不究仅目仅的在两及家意企义业之间互动,更多的时候是在一个社会
网络结构中。
本文对区域创新网络的相关理论进行梳理,分析了日本以及台湾新竹地区
技巧二:随时整理
对于特别重要的文献,做一个读书笔记,摘录其 中的重要观点和论述。这样一步一个脚印,到真正开 始写论文时就积累了大量“干货”,可以随时享用。
例2:产业集聚、创新网络与集群企业技术能 力——基于绍兴市14262份问卷的调查与分析
从产业集聚、创新网络两重视角,分析了集群企业技术能力的影 响因素,并在此基础上,运用绍兴市纺织产业集群的14262份问卷实 证检验了产业集群、创新网络对集群企业技术能力的影响。
结果表明,产业集聚、创新网络对集群企业的技术能力有明显的促 进作用;产业集聚与创新网络的所有子效应,对不同技术子能力的影 响程度均存在明显差异。
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30
文献综述的写法
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地高辛中毒?
原因分析
4
文献分析
电解质紊乱
低钾低镁均可诱发和加重地高辛中毒,镁是Na+_K+ATP酶的 辅酶,低镁可诱发和加重心肌细胞失钾,提高心肌对地高辛的敏感 性。案例:血浆地高辛浓度1.4ng/ml,血钾从4mmol/L降至 3mmol/L,地高辛中毒危险从11%增至26%。【1】
【1】王万迎,维持量地高辛中毒原因探讨[J].中国实用医药杂志,2007,35(2):124
肾功能异常
血钾异常
其他
构成比
主要原因 合并用药
中毒原因 合并用药 肾功能异常 血钾异常 其他
构成比 67.40% 21.10% 12.60% 老年人特殊的生理结构是导致SDC升高的主要原因 a.骨骼肌减少:地高辛吸收后50%与骨骼肌结合,因而老
年人的分布容积低于年轻人。 b.肾脏排泄,老年人肾功能减退,地高辛半衰期延长,导
致体内蓄积,易发生中毒。 c.老年人组织中的Na+-K+—ATP酶减少,机体对地高辛
敏感性增强,易发生中毒反应 d.老年人肝血流量减少,可使地高辛代谢能力下降 e:游离血红蛋白减少导致游离地高辛量增加有关。
12
小结
1.SDC:监测能较好反应地高辛临床药效,为临 床个体化给药提供依据,但由于影响因素太多, 不能简单的根据SDC来判断中毒还是剂量不足。 2.临床药师必须与临床医师紧密配合,制定个体 化给药方案,减少毒性反应的发生。
9
404例地高辛血药浓度监测结果分析 1.中毒患者消化道反应发生率为58.9%
2.中毒患者心率失常发生率为51.6%
10
95例地高辛中毒原因分析
80.00% 70.00% 60.00% 50.00% 40.00% 30.00% 20.00% 10.00%
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注:染色体、基因、block和SNP这四者大致是什么关系?
6
PART ONE 背景知识
表达数量性状定位分析 expression quantitative trait locus
• 数量性状(QT,Quantitative Trait) 生物体的一些性状是由多基因共同控制的,其测量值可以用连续的数量进行表示,这些性状统称为 数量性状。
Replication 3
The meta-analysis and replication 1 & 2 found
4 novel regions and 4 potential Chinese-
specific variants.
To minimize the chance of false discovery, we
additional 69146 samples in three independent replication studies, involving a total
of 80962 subjects from Chinese Han ancestry.
10
GWAS-hypertension
方法设计
eqtlsanalysisexpressionquantitativetraitlocusanalysis表达数量性状定位分析将基因的表达水平作为数量性状采用qtl分析定位控制该基因表达的qtleqtlspartone背景知识genomewideassociationstudy全基因组关联分析最早于1996年提出将人类复杂疾病的研究从候选基因转向全基因组水平在群体水平检测全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗传关联用更大规模的检测得到与疾病相关的每一个基因
• 数量性状定位分析(QTL 分析,Quantitative Trait Locus) 它指的是定位控制数量性状的基因在基因组中的位置,实际上是借助一些分子标记分析数量性状的 关系,将数量性状对应的QTL定位于分子标记间。
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究目的
医院职工总人数是一项衡量医院规模、人力资源数量的重要 指标,是表达和评价医院人员储藏的数量指标,通过对其分 析找出影响医院职工总人数的主要因素,能给医院领导或卫 生行政主管部门进行相关抉择提供依据。
运用多重线性回归模型分析影响医院职工总人数的主要因素。
资料来源
本研究样本来源于 2021 武汉卫生计生年鉴所收录的武 汉市地区 44 家公立医院职工总人数、实际开放床位数、 门急诊人次数、出院病人数、住院病人 手术人次数据,数据真实可信。
THANK YOU !
BEATIT’S PPT STUDIO
0统2 计分析方法
线性的相关分析
采用多重线性回归前首先要满足资料间具有线性相关性, 以职工总人数为因变量,实际开放床位数、急门诊人次数、 出院病人数、住院手术病人数作为自变量,做线性的相关 分析,得准确性为0.795,证明满足线性相关的要求。
独立性检验
对总职工人数进行独立性检验,只需要检验残差间相互独 立,采用Durbin-Watson统计量来判断,其结果〔DW值〕 一般为0-4,越接近于2独立性越好。对总职工人 数进行 的独立性检验DW值为1.507,接近于2,满足独立性。
01课题概况
文章来源
现代医院,2021,16〔10〕:15391540
研究类型
解释性研究 解释性研究也称为因果性研究。这种研究类型主 要探索某种假设与条件因素之间的因果关系,即 在认识到现象是什么以及其状况怎样的根底上, 进一步弄清是或明白事物和现象的为什么是这样。 解释性研究是指探寻现象背后的原因,掲示现象 发生或变化的内在规律,答复为什么的科学研究
结论2:主要因 经逐步回素归分析,实际开放床位数(X1)、门急诊人次数(X2)
是影响医院职工总人数的两个主要因素
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前者结果中唯一一致的改变是WT Apc allele 以不分离方式缺失,且这一改变足以引起肿物 向腺瘤方向发展。
落木清寒
17
Min和p53联合突变:胰腺肿瘤 Apc1638N和p53联合突变:硬纤维瘤增多
两者均无GI tract 肿瘤增多的发现。
落木清寒
18
给予Apc突变鼠系两种不同的饮食:低脂、 高纤/高脂、低钙、低VD。
结果:后者肿瘤发生增加且一些肿瘤在大 肠中发生,而前者息肉形成减少。
结论:由于小鼠遗传背景相同,且其饮食 成分可调,使得在这些模型中明确基因-环 境相互作用成为可能。
落木清寒
19
Moml(modifier of Min locus):编码分泌 性磷脂酶A2。
Combination of Min and Mom1 leads to an increase of lifespan and reduced tumor number.
6、携带MMR(如Mlh1、Msh5)基因突变的 小鼠表现错配修复缺陷,容易发生胃肠道肿瘤、 淋巴瘤和其他器官系统肿瘤。
7、携带Pms2基因突变的小鼠易于发生淋巴瘤 和其他肿瘤。
8、携带Msh6基因突变的小鼠有碱基配对缺陷 并表现出肿瘤易感性。
9、携带Mlh1、Pms2和Msh5复合基因突变的 小鼠有减数分裂缺陷,提示这些基因在生殖细 胞发生过程中有独特的作用。
落木清寒
3
※前言
CRC分类: Most frequent(85%):sporadic CRC Second(5%):HNPCC Least:FAP
落木清寒
4
FAP是一种AD疾病。
肠道内症状:患者在20岁左右时结直肠中 出现多发腺瘤。具有癌变倾向,获得侵袭 性,产生肝脏转移。
落木清寒
17
Min和p53联合突变:胰腺肿瘤 Apc1638N和p53联合突变:硬纤维瘤增多
两者均无GI tract 肿瘤增多的发现。
落木清寒
18
给予Apc突变鼠系两种不同的饮食:低脂、 高纤/高脂、低钙、低VD。
结果:后者肿瘤发生增加且一些肿瘤在大 肠中发生,而前者息肉形成减少。
结论:由于小鼠遗传背景相同,且其饮食 成分可调,使得在这些模型中明确基因-环 境相互作用成为可能。
落木清寒
19
Moml(modifier of Min locus):编码分泌 性磷脂酶A2。
Combination of Min and Mom1 leads to an increase of lifespan and reduced tumor number.
6、携带MMR(如Mlh1、Msh5)基因突变的 小鼠表现错配修复缺陷,容易发生胃肠道肿瘤、 淋巴瘤和其他器官系统肿瘤。
7、携带Pms2基因突变的小鼠易于发生淋巴瘤 和其他肿瘤。
8、携带Msh6基因突变的小鼠有碱基配对缺陷 并表现出肿瘤易感性。
9、携带Mlh1、Pms2和Msh5复合基因突变的 小鼠有减数分裂缺陷,提示这些基因在生殖细 胞发生过程中有独特的作用。
落木清寒
3
※前言
CRC分类: Most frequent(85%):sporadic CRC Second(5%):HNPCC Least:FAP
落木清寒
4
FAP是一种AD疾病。
肠道内症状:患者在20岁左右时结直肠中 出现多发腺瘤。具有癌变倾向,获得侵袭 性,产生肝脏转移。
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▪ Agents-as-software: 如果所有agent都处于设计者的控制之中, 则身份和边界的问题就变得比较简单
❖ 战略反映(Strategic Reflectivity) ❖ 理性的利己主义(Rational Self-interest)
13 2020/3/30
i*框架设计过程中的几个关键问题 ❖ 自治性(Autonomy) ❖ 意识(Intentionality) ❖ 社会性(Sociality) ❖ 身份与边界(Identity and Boundary) ❖ 战略反射(Strategic Reflectivity)
12 2020/3/30
i*框架设计过程中的几个关键问题 ❖ 自治性(Autonomy) ❖ 意识(Intentionality) ❖ 社会性(Sociality) ❖ 身份与边界(Identity and Boundary)
▪ Agents-in-the-world: 边界和身份的变化,通常是社会化、谈判和 权力的转移等社会过程的结果
3 2020/3/30
QSAR with CoMFA® 建立3D-QSAR模型(CoMFA)
QSAR 的工作原理
❖ Quantitive Structure Activity Relationships
❖ 建立生理活性与可计算的分子性质之间的关系
▪ 以数值的方式描述活性 ▪ 以数值的方式来描述分子的性质 ▪ 合理的统计方法使活性与描述符相关
▪ 任务相关性(task dependency): the depender depends on
the dependee to carry out an activity.
▪ 资源相关性(resource dependency): the depender depends on the dependee for the availability of an entity (physical or informational).
❖ 战略反映(Strategic Reflectivity) ❖ 理性的利己主义(Rational Self-interest)
13 2020/3/30
i*框架设计过程中的几个关键问题 ❖ 自治性(Autonomy) ❖ 意识(Intentionality) ❖ 社会性(Sociality) ❖ 身份与边界(Identity and Boundary) ❖ 战略反射(Strategic Reflectivity)
12 2020/3/30
i*框架设计过程中的几个关键问题 ❖ 自治性(Autonomy) ❖ 意识(Intentionality) ❖ 社会性(Sociality) ❖ 身份与边界(Identity and Boundary)
▪ Agents-in-the-world: 边界和身份的变化,通常是社会化、谈判和 权力的转移等社会过程的结果
3 2020/3/30
QSAR with CoMFA® 建立3D-QSAR模型(CoMFA)
QSAR 的工作原理
❖ Quantitive Structure Activity Relationships
❖ 建立生理活性与可计算的分子性质之间的关系
▪ 以数值的方式描述活性 ▪ 以数值的方式来描述分子的性质 ▪ 合理的统计方法使活性与描述符相关
▪ 任务相关性(task dependency): the depender depends on
the dependee to carry out an activity.
▪ 资源相关性(resource dependency): the depender depends on the dependee for the availability of an entity (physical or informational).
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• Genome-wide association studies (GWASs) in the European population have identified multiple chromosomal regions associated with blood pressure, and the identified loci(基因位点)altogether explain only a small fraction of the variance for blood pressure.
eQTLs analysis (expression quantitative trait locus analysis)
表达数量性状定位分析,将基因的表达水平作为数量性状,采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs)
4
PART ONE 背景知识
全基因组关联分析 Genome-wide association study
注:染色体、基因、block和SNP这四者大致是什么关系?
6
PART ONE 背景知识
表达数量性状定位分析 expression quantitative trait locus
• 数量性状(QT,Quantitative Trait) 生物体的一些性状是由多基因共同控制的,其测量值可以用连续的数量进行表示,这些性状统称为 数量性状。
• 最早于1996 年提出,将人类复杂疾病的研究从 候选基因转向全基因组水平,在群体水平检测 全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗 传关联,用更大规模的检测得到与疾病相关的 每一个基因。
5
PART ONE 背景知识
基因多态性 Polymorphism
• 多态性是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在两种以上的基因型。如果某位点上所有的 等位基因频率均大于0.01,携带该等位基因的杂合子频率大于2%,则认为该基因座具有多态性。
背景知识
PART ONE
目的&对象
PART TWO
研究设计
PART THREE
统计分析
PART FOUR
研究结果
PART FIVE
研究意义
PART SIX
2
GWAS-hypertension
背景知识
PART ONE
PART ONE 背景知识
GWAS(Genome-wide association study)
• 数量性状定位分析(QTL 分析,Quantitative Trait Locus) 它指的是定位控制数量性状的基因在基因组中的位置,实际上是借助一些分子标记分析数量性状的 关系,将数量性状对应的QTL定位于分子标记间。
• 表达数量性状定位分析(eQTLs分析,expression quantitative trait locus analysis) 将基因的表达水平作为数量性状,采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs),一个eQTL是 染色体上的一个位点,可包含若干个基因,这些基因控制某个基因的遗传表达。
To identify new susceptibility loci for blood pressure in Chinese population.
To investigate whether the blood pressure variants would contribute to the traditional cardiovascular risk factors including lipid levels, plasma glucose, and BMI.
9
PART TWO 研究对象
The writer conducted a large scale GWAS of blood pressure and hypertension that
1.限制性片段长度多态性RFLP 限制性酶切位点多态性→切割基因组时产生的片段数目及长度不一;
2.可变数目串联重复序列VNTRS 一些短的核苷酸序列重复次数不同所致;小卫星DNA&微卫星DNA遗传标志
;
3.单核苷酸多态性SNP 基因组中核苷酸的变异引起的DNA序列多样性,包括点突变、单个碱基插入、缺失、置换。
7
GWAS-hypertension
目的&对象
PART TWOБайду номын сангаас
PART TWO 研究目的
To evaluate whether the previous reported loci associated with blood pressure could be generalized to the Chinese population.
Genome-wide association study in Chinese identifies novel loci for blood pressure and hypertension
GWAS-hypertension
目录
• Hypertension is a common disorder and the leading risk factor for cardiovascular disease and premature deaths (早死)worldwide.
• To identify novel genetic variants ( 基 因 多 态 性 )affecting blood pressure variation, the writer conducted a meta -analysis of GWASs of blood pressure and hypertension in 11816 subjects followed by replication studies(重复试验) including 69146 additional individuals.
全基因组关联分析,是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),从中筛选 出与疾病相关的SNPs。
SNPs(single nucleotide polymorphism)
单核苷酸多态性,是指基因组中核苷酸的变异而引起的DNA序列多样性,包括点突变、单个碱基的插入、缺失 和置换。
eQTLs analysis (expression quantitative trait locus analysis)
表达数量性状定位分析,将基因的表达水平作为数量性状,采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs)
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PART ONE 背景知识
全基因组关联分析 Genome-wide association study
注:染色体、基因、block和SNP这四者大致是什么关系?
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PART ONE 背景知识
表达数量性状定位分析 expression quantitative trait locus
• 数量性状(QT,Quantitative Trait) 生物体的一些性状是由多基因共同控制的,其测量值可以用连续的数量进行表示,这些性状统称为 数量性状。
• 最早于1996 年提出,将人类复杂疾病的研究从 候选基因转向全基因组水平,在群体水平检测 全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗 传关联,用更大规模的检测得到与疾病相关的 每一个基因。
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PART ONE 背景知识
基因多态性 Polymorphism
• 多态性是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在两种以上的基因型。如果某位点上所有的 等位基因频率均大于0.01,携带该等位基因的杂合子频率大于2%,则认为该基因座具有多态性。
背景知识
PART ONE
目的&对象
PART TWO
研究设计
PART THREE
统计分析
PART FOUR
研究结果
PART FIVE
研究意义
PART SIX
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GWAS-hypertension
背景知识
PART ONE
PART ONE 背景知识
GWAS(Genome-wide association study)
• 数量性状定位分析(QTL 分析,Quantitative Trait Locus) 它指的是定位控制数量性状的基因在基因组中的位置,实际上是借助一些分子标记分析数量性状的 关系,将数量性状对应的QTL定位于分子标记间。
• 表达数量性状定位分析(eQTLs分析,expression quantitative trait locus analysis) 将基因的表达水平作为数量性状,采用QTL分析定位控制该基因表达的QTL(eQTLs),一个eQTL是 染色体上的一个位点,可包含若干个基因,这些基因控制某个基因的遗传表达。
To identify new susceptibility loci for blood pressure in Chinese population.
To investigate whether the blood pressure variants would contribute to the traditional cardiovascular risk factors including lipid levels, plasma glucose, and BMI.
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PART TWO 研究对象
The writer conducted a large scale GWAS of blood pressure and hypertension that
1.限制性片段长度多态性RFLP 限制性酶切位点多态性→切割基因组时产生的片段数目及长度不一;
2.可变数目串联重复序列VNTRS 一些短的核苷酸序列重复次数不同所致;小卫星DNA&微卫星DNA遗传标志
;
3.单核苷酸多态性SNP 基因组中核苷酸的变异引起的DNA序列多样性,包括点突变、单个碱基插入、缺失、置换。
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GWAS-hypertension
目的&对象
PART TWOБайду номын сангаас
PART TWO 研究目的
To evaluate whether the previous reported loci associated with blood pressure could be generalized to the Chinese population.
Genome-wide association study in Chinese identifies novel loci for blood pressure and hypertension
GWAS-hypertension
目录
• Hypertension is a common disorder and the leading risk factor for cardiovascular disease and premature deaths (早死)worldwide.
• To identify novel genetic variants ( 基 因 多 态 性 )affecting blood pressure variation, the writer conducted a meta -analysis of GWASs of blood pressure and hypertension in 11816 subjects followed by replication studies(重复试验) including 69146 additional individuals.
全基因组关联分析,是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),从中筛选 出与疾病相关的SNPs。
SNPs(single nucleotide polymorphism)
单核苷酸多态性,是指基因组中核苷酸的变异而引起的DNA序列多样性,包括点突变、单个碱基的插入、缺失 和置换。