一种检测黄牛SREBP1C基因SNP多态性的方法
一种畜禽品种鉴定遗传标记snp的筛选方法及其应用
一种畜禽品种鉴定遗传标记snp的筛选方法及其应用在畜禽品种鉴定领域，遗传标记SNP（单核苷酸多态性）的筛选方法一直备受关注。
本文将详细介绍一种畜禽品种鉴定遗传标记SNP的筛选方法及其应用，以期为相关领域的研究提供参考。
一、畜禽品种鉴定遗传标记SNP的筛选方法1.样本收集与DNA提取首先，从不同品种的畜禽中收集血液或组织样本。
然后，采用酚-氯仿法、磁珠法等方法提取样本中的DNA。
2.SNP位点选择根据已有研究，筛选出与畜禽品种鉴定相关的基因，并从中选取具有潜在价值的SNP位点。
同时，考虑到实验成本和效率，选取中等或高频率的SNP 位点。
3.PCR扩增与测序针对所选SNP位点，设计特异性引物，进行PCR扩增。
将PCR产物进行测序，以获取SNP位点的基因型。
4.数据分析（1）基因型频率分析：计算各品种中SNP位点的基因型频率，分析品种间基因型频率的差异。
（2）遗传距离计算：基于SNP位点的基因型频率，计算品种间的遗传距离，评估品种间的遗传关系。
（3）群体结构分析：利用STRUCTURE软件对品种进行群体结构分析，判断品种间的遗传分化程度。
5.鉴定模型的构建根据上述分析结果，选取具有显著差异的SNP位点，采用逻辑回归、支持向量机等方法构建畜禽品种鉴定模型。
二、畜禽品种鉴定遗传标记SNP的应用1.品种鉴定：利用所建立的鉴定模型，对未知品种的畜禽进行基因型分析，实现品种的快速鉴定。
2.品种选育：结合品种鉴定结果，进行优良品种的选育，提高畜禽生产性能。
3.遗传资源保护：通过对遗传资源的调查和品种鉴定，制定合理的遗传资源保护措施，防止珍贵遗传资源的流失。
4.畜禽疾病诊断：基于SNP位点的基因型分析，研究畜禽疾病与遗传因素的关系，为疾病诊断和治疗提供依据。
总结：本文介绍了一种畜禽品种鉴定遗传标记SNP的筛选方法及其应用。
通过对SNP位点的筛选和鉴定模型的构建，实现了畜禽品种的快速鉴定，为品种选育、遗传资源保护及疾病诊断等领域提供了有力支持。
一种检测黄牛Leptin基因单核苷酸多态性的方法[发明专利]
![一种检测黄牛Leptin基因单核苷酸多态性的方法[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/f3baed28a1c7aa00b42acba8.png)
专利名称：一种检测黄牛Leptin基因单核苷酸多态性的方法专利类型：发明专利
发明人：马云,付玮玮,陈宁博,郝瑞杰,李芬,李俊雅,张路培,张琼琼,刘云云
申请号：CN201610003228.5
申请日：20160104
公开号：CN105506114A
公开日：
20160420
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种检测黄牛Leptin基因单核苷酸多态性的方法，以包含Leptin基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，采用PCR法扩增黄牛Leptin基因的第二外显子片段，然后用限制性内切酶Pst？I消化PCR扩增产物，再对酶切后的片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，根据电泳结果鉴定黄牛Leptin基因第12265位点的单核苷酸多态性。
由于Leptin基因在调控动物生长、脂肪分化及肉质形成方面具有重要的生物学功能，本发明提供的检测方法为Leptin基因的SNPs与生长性状关联的建立奠定了基础。
本发明还发现，Leptin基因12265(T/C)位点对南阳牛早期生长性状初生重、体重、胸围指数有显著影响。
申请人：信阳师范学院
地址：464000 河南省信阳市长安路237号
国籍：CN
代理机构：北京国坤专利代理事务所(普通合伙)
代理人：姜彦
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一种黄牛HGF基因单核苷酸多态性的检测方法及应用[发明专利]
![一种黄牛HGF基因单核苷酸多态性的检测方法及应用[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/af841d8658fafab068dc0287.png)
专利名称：一种黄牛HGF基因单核苷酸多态性的检测方法及应用
专利类型：发明专利
发明人：陈宏,蔡含芳,蓝贤勇,李爱民,周扬,雷初朝
申请号：CN201310206816.5
申请日：20130529
公开号：CN103320510A
公开日：
20130925
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种黄牛HGF基因单核苷酸多态性的检测方法及应用，以包含黄牛HGF基因的全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增获得黄牛HGF基因，PCR产物经限制性内切酶HincII消化后，进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛HGF基因组第72801位的单核苷酸多态性。
由于HGF基因功能涉及肌肉及机体各个组织器官的正常生长发育，本发明所阐述的方法能够快速的检测黄牛HGF基因的单核苷酸多态性，为HGF基因的SNP与生长性状关系的建立奠定基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择（MAS）育种提供基础资料，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
申请人：西北农林科技大学
地址：712100 陕西省西安市杨凌区邰诚路3号
国籍：CN
代理机构：西安通大专利代理有限责任公司
代理人：汪人和
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一种用于检测BRAC1基因SNP的试剂盒与方法[发明专利]
![一种用于检测BRAC1基因SNP的试剂盒与方法[发明专利]](https://img.taocdn.com/s3/m/477d43f8fc4ffe473368abfb.png)
专利名称：一种用于检测BRAC1基因SNP的试剂盒与方法专利类型：发明专利
发明人：马立新,何如怡,王飞,李文强,王洋
申请号：CN201910689043.8
申请日：20190729
公开号：CN110331202A
公开日：
20191015
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明提供了一种用于检测BRAC1基因SNP的试剂盒与方法，所述试剂盒包括(1)SNP位点的上下游引物组：分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示；(2)DNA guides：分别如SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.12所示；(3)不同荧光基团标记的分子信标：如SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.16所示；(4)DNA编辑酶PfAgo；该方法特异性强，灵敏度高。
申请人：湖北大学
地址：430062 湖北省武汉市武昌区友谊大道368号
国籍：CN
代理机构：武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人：易贤卫
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延边黄牛SREBP1基因多态性与肌内脂肪酸组成的相关性研究.
延边黄牛SREBP1基因多态性与肌内脂肪酸组成的相关性研究.李海峰;耿爽;金鑫;戢爽;吴健;夏广军【期刊名称】《延边大学农学学报》【年(卷),期】2017(039)004【摘要】为探讨SREBP1基因多态性及其与肌内脂肪酸的相关性,选取30月龄,健康无病,体重相近的延边黄牛29头,屠宰后采集肉样与血样,进行DNA提取与脂肪酸含量测定,利用 PCR方法检测固醇调节元件结合蛋白(Slerol regulatory element binding factor 1,SREBP1)基因第5内含子的多态性,并与肌内脂肪沉积性状进行相关性分析.结果表明:在延边黄牛SREBP1基因第5内含子发现84 bp插入缺失突变,且与肌内脂肪酸组成显著相关.AB型个体的月桂酸(C12:0)、棕榈油酸(C16:1)、硬脂酸(C18:0)、亚油酸(C18:2)含量显著高于AA型个体(P<0.05).说明延边黄牛SREBP基因第5内含子存在84 bp插入缺失突变,且这一位点的多态性影响肌肉脂肪酸组成.【总页数】5页(P68-72)【作者】李海峰;耿爽;金鑫;戢爽;吴健;夏广军【作者单位】延边大学农学院,吉林延吉133000;延边大学农学院,吉林延吉133000;延边大学农学院,吉林延吉133000;延边大学农学院,吉林延吉133000;吉林省农业科学院畜牧分院,吉林四平136100;延边大学农学院,吉林延吉133000【正文语种】中文【中图分类】S823【相关文献】1.FASN基因与牦牛肌内脂肪酸组成的相关性研究 [J], 秦文;吴晓云;李天科;阎萍2.动物源肌内磷脂及其脂肪酸含量、组成与生理功效研究进展 [J], 薛山3.苹果籽、南瓜籽饲料脂肪酸组成与团头鲂鱼体脂肪酸组成相关性研究 [J], 代小芳;叶元土;蔡春芳;尹晓静;邱燕;谭芳芳;张俊;戴修赢;王文娟4.饲喂发酵甜叶菊废渣对猪肌内氨基酸和脂肪酸组成的影响 [J], 郭礼荣;苏州;孔智伟;黄际发;钟如意;郭添福5.日粮能量水平对肥育猪肌内脂肪含量、肌内和皮下脂肪组织脂肪酸组成的影响[J], 徐海军;印遇龙;都文;李亚君;汤文杰;刘志强;谭碧娥;孔祥峰;黄瑞林;刘玉兰因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
【CN109971828A】贵州地方黄牛IGF1基因多态筛选方法【专利】
(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201910285565.1(22)申请日 2019.04.10(71)申请人 贵州大学地址 550025 贵州省贵阳市花溪区贵州大学北校区科学技术处(72)发明人 陈祥 吴雨 陈伟 (74)专利代理机构 贵阳中新专利商标事务所52100代理人 李亮 程新敏(51)Int.Cl.C12Q 1/6806(2018.01)(54)发明名称贵州地方黄牛IGF-1基因多态筛选方法(57)摘要本发明公开了一种贵州地方黄牛IGF -1基因多态筛选方法。
本发明通过贵州地方黄牛IGF -1基因多态筛选方法，成功筛选出3个SNP位点，分别为Intron2-A5123G、Intron3-C56464A、Exon3-G56419A。
为探讨IGF -1基因对贵州本地牛种生长发育的调节作用奠定基础，同时也为贵州地方黄牛的从分子方面选种培育提供理论依据，避免在筛选贵州地方黄牛IGF -1基因多态性摸索时繁琐的步骤。
权利要求书1页 说明书3页 附图1页CN 109971828 A 2019.07.05C N 109971828A权 利 要 求 书1/1页CN 109971828 A1.一种贵州地方黄牛IGF-1基因多态筛选方法，其特征在于：收集贵州省内4个以上不同地区的贵州地方黄牛的牛血样，利用血液基因组提取试剂盒进行血液DNA提取，将提取合格的DNA作为模板进行IGF-1基因引物PCR扩增而获得目的片段，最后将扩增获得的目的片段采用直接测序检测，找出其中的多态位点。
2.根据权利要求1所述的贵州地方黄牛IGF-1基因多态筛选方法，其特征在于：所述的PCR扩增采用的引物包括上游引物IGF-1F1、IGF-1F2、IGF-1F3、IGF-1F4及下游引物IGF-1R1、IGF-1R2、IGF-1R3、IGF-1R4：上游引物序列为：IGF-1F1：5’-ACGCCCGGTAGAAAGTTAA-3’；IGF-1F2：5’-GACCCAGGAGGAAGATGA-3’；IGF-1F3：5’-CAGGAGTTGTTGGAGGAGC-3’；IGF-1F4：5’-GACCACCTGTTCTCAATG-3’下游引物序列为：IGF-1R1：5’-CAAGCCCTGAAGAAGTGGA-3’；IGF-1R2：5’-GCAGAATAGTTGCGAGAAA-3’；IGF-1R3：5’-CCAGAAGTCTATGAGGGTATGA-3’；IGF-1R4：5’-TCTTAGTCTTTCTTTCCTCC-3’。
牛亲子鉴定技术研究进展
牛亲子鉴定技术研究进展亲子鉴定是确定亲属关系的一种科学方法，旨在确认一个人是否为另一个人的亲生父母或亲生子女。
牛亲子鉴定技术作为畜牧业中的一项重要技术，用于牛只的亲源关系确认和遗传背景鉴定。
牛亲子鉴定技术依据牛只间的遗传关系，通过检测牛只的DNA序列的相似性来判断亲子关系。
目前，牛亲子鉴定技术的研究进展主要体现在以下几个方面：1. DNA分析方法的改进：DNA分子是每个个体在遗传上的唯一表示，因此牛亲子鉴定主要通过对牛只DNA样本进行分析。
随着分子生物学和生物技术的发展，PCR（聚合酶链式反应）技术和DNA测序技术的应用使得牛亲子鉴定的准确性得到了大幅提高。
研究人员通过对牛只DNA片段进行PCR扩增，再通过DNA测序或者核苷酸序列特征分析来判断牛只之间的亲子关系。
2. SNP标记的应用：SNP（单核苷酸多态性）是DNA序列中最常见的变异形式，它通常以两个等位基因存在于不同的个体中。
研究人员发现，SNP标记可以用于牛亲子鉴定中的个体识别和亲子关系鉴定。
SNP标记有许多优点，如高度多态性、广泛分布以及高度稳定性等。
通过对牛只基因组中SNP标记进行筛选和分析，可以准确地鉴定牛只之间的亲子关系。
3. 亲子鉴定数据库的建立：为了提高牛亲子鉴定的准确性和可信度，一些研究机构和畜牧企业建立了亲子鉴定数据库。
这些数据库中收集了大量牛只的DNA样本和亲子关系的信息，可以作为亲子关系鉴定的参照和对照。
通过比对待鉴定牛只的DNA序列与数据库中的已知信息，可以更准确地判定亲子关系。
4. DNA采集和保存技术的改进：牛亲子鉴定需要采集和保存牛只的DNA样本，而传统的采集方法通常需要使用一些有创性的技术，如取毛发、血液或组织样本。
近年来，研究人员开发了一些非侵入性的DNA采集技术，如唾液采集、皮下毛囊采集等，降低了对牛只的伤害，并提高了采样的效率和准确性。
牛亲子鉴定技术研究在DNA分析方法、SNP标记的应用、亲子鉴定数据库的建立以及DNA采集和保存技术等方面取得了重要进展。