园艺作物叶色黄化突变体研究进展
一个水稻苗期黄化叶突变体基因的定位
浙 江省 优秀 科技 期刊 一等 奖
一
个 水稻苗期 黄化 叶突变体 基 因的定位
项 显 波 ,吴 晶 ,丁 沃 娜 ,朱 世 华
( 1 . 宁波大学 海洋学院,浙江 宁波 3 1 5 2 1 1 ; 2 . 宁波大学 科学技术 学院,浙江 宁波 3 1 5 2 1 1 )
摘 要:通过 筛选 甲基 磺 酸 乙 ̄ i R ( E t h y l Me t h a n e S u l f o n a t e , E MS ) 诱 变的籼 稻 K a s a l a t h突 变体 库,得 到 一个 黄化 叶 突 变体 O s y l l ( O r y z a s a t i v a y e l l o W l e a f ) ,在 二 叶期前 该 突 变体 叶 色黄化 , 后 期 突变 体 叶 色逐 渐恢 复到 野 生型水 平.遗传 分析 显 示 O s y l l突变性状 受一对 隐性基 因控 制,经 图位 克 隆
因的 克 隆 打 下基 础 .
关键词 :水稻 :黄 化 叶 突变体:基 因定位
中 图分 类 号ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ: S 5 1 1
文 献标 志码 : A
文章 编 号: 1 0 0 1 — 5 1 3 2( 2 0 1 5 )0 3 — 0 0 0 5 — 0 4
叶片作为主要 的光合作用器官 , 对 水稻的产 量和 品质 有着 重 要影 响 ….叶片 的 光合作 用 首 先要
而 O s DV R和 Y G L 1 3 8 ( t ) 基 因功 能 缺 失 引 起 的黄
化叶色 则维持 水稻整个生命周期… . 研 究发现
一
些 黄 化 叶 色 相 关 基 因 的 表 达 与 光 照 相 关 ,如
植物叶色突变体
植物生理学通讯 第 42 卷 第ຫໍສະໝຸດ 1 期,2006 年 2月3
图1 被子植物叶绿素生物合成途径(Beale 2005) 标有数字的箭头涉及表 1 中所列的酶;根据有效底物发生反应 1 2 或 1 3 ;反应 1 4 可利用 2 种底物。
1995)等关键酶在叶绿素合成过程中的功能。 4.2 血红素→光敏色素生色团生物途径中基因突变 叶绿素生物合成和血红素生物合成是四吡咯生物 合成途径的两个分支,原卟啉 IX 与 Mg 2+ 螯合产 生镁原卟啉 I X ,与 F e 2 + 螯合形成血红素,血红 素经一系列反应最终形成光敏色素生色团(图 2)。 叶绿素合成速率受细胞内血红素含量影响,若血 红素→光敏色素生色团途径受阻、细胞内血红素含 量上升,过剩的血红素将反馈抑制叶绿素合成, 引起突变体叶色变异(Terry和Kendrick 1999)。
基因沉默引起的叶色突变体主要用于分析特 定基因功能。目前仅从烟草(Monde 等 2000)、拟 南芥(Kumar和Soll 2000)等少数植物中分离出基因 沉默叶色突变体。 3 叶色突变体的遗传方式
叶色变异种类繁多,不同突变体的遗传规律 相差很大。叶色突变可能是数量性状,也可能是 质量性状;可能是细胞核遗传,也可能是细胞质 遗传。例如,芽黄突变体多数受单隐性核基因控 制,少数受两对核基因控制(肖松华等 1995),在 大豆中还发现了细胞质遗传芽黄突变体(马国荣等 1994)。与细胞核遗传叶色突变体相比,已发现的 细胞质突变体较少,仅在小麦(王保莉等 1996)、 大豆(马国荣等 1994)、烟草(Monde 等 2000; Barak 等 2000)等作物中有少量报道。这可能与植物细胞 中含有多个细胞器(叶绿体、线粒体) DNA 分子有 关。 4 叶色突变的分子机制
甘蓝型油菜黄化突变体的光合特性及叶绿素荧光参数分析
云南农业 大学烟 草学 院,云南 昆 明 6 5 0 2 0 1 ; 贵州 省油料研 究所 ,贵州 贵阳 5 5 0 0 0 6 ; 。 贵 州省生物 技术研 究所,贵州贵 阳 5 5 0 0 0 6
摘 要:调查 油菜 自发黄 化突变体 ( NY) 、野 生型( NG) 及其 正反 交后代 材料( F 和r F ) 的光 合色素 含量 、光合 特性 、叶 绿 素荧 光参数 及农艺 性状 ,分析 五叶期 各参数 的变化 规律 。结果 表明,突变体 叶绿 素 a 、叶绿素 b 、类胡 萝 b 素 和总
作物 学报
A C T A A GR O NO MI C A S I N1 C A 2 0 1 3 , 3 9 ( 3 ) : 5 2 0 — 5 2 9
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I SS N 0 49 6 — 3 4 90 ; CODEN TS HP A9
PhO t Os y nt he t i c Cha r a c t e r i s t i c s a nd Chl o r o phy l l Fl uo r e s c e nc e Ki ne t i c Pa r a me —
t e r s A na l y s e s o f Ch l o r o ph yl l - Re duc e d M ut a nt i n Br a s s i c a na pus L.
XI AO Hu a — Gui ’ , YANG Hu a n— We n ’ , RA0 Yo n g , , YANG Bi n ,a nd ZHU Yi n g
水稻叶色突变分子机制的研究进展
_1 1 l
、
O C 2 表 1。 sA0 i等( “ )
不正 常的 白化 、 黄化 、 浅绿 、 白、 绿 白翠 、 黄绿 、 黄和条 绿 纹等 [ 3 1 。突变基 因直接或间接影响 叶绿素 的合成和降
解 , 变叶绿 素含量 , 以大部分叶色 突变体 同时也是 改 所
5 氨基 乙酰丙 酸( L 的合 成是植物 四吡咯物质 一 A A) 合成途径 的关键 步骤 ,也是 整个叶绿素合成途径 中的
( 中国水稻研究所 国家水 稻改良中心 水稻生物学 国家重点实验室 , 浙江 杭州 30 0 ;通讯作者 , - a :qag 2 . m) 10 6 E m i stn@16 o l c 摘 要: 叶色突变表型明显 、 易于鉴别 , 在高等植物叶绿素代谢 、 叶绿体结构 、 功能和发育机理等基础研究 中具有
限速步骤 。谷 氨酰一R A还原酶 ( l R) A A合成 tN Gu 是 L T
叶绿 素突变体 。叶色突变通常在苗期表达 , 与其 他突 变体相 比具有表 型明显 、 易于鉴别 、 图位克 隆周期短等 特点 。 目前 在水 稻中 已经定位约 8 叶色突变 位点 , 0个
过程 中第一个 关键酶 , H M 由 E A基 因家族编码 。拟南 芥 中已经鉴定 出三个 H MA基 因-, E l 水稻 谷氨 酰一R 2 1 t— N A还原酶基 因 O Gu s 已经被克隆 , sl 也 R 其突变体表现 为叶片 黄化 , 呈现温 度特异性 , 并 株高 降低 , 抽穗 期推
二步 由 A A形成 原卟啉 I L X;第三步为原 卟啉 I x在镁 离子螯合酶 、叶绿 素合 成酶 以及叶绿素 a 氧化酶 的作 用下 最终合成 叶绿 素 a 叶绿素 b 和 。双子 叶模式植 物
专题07孟德尔两大遗传定律-2023年高考真题和模拟题生物分项汇编(全国通用)(学生版)
专题07 孟德尔两大遗传定律2023年高考真题一、单选题1.(2023·广东·统考高考真题)下列叙述中,能支持将线粒体用于生物进化研究的是()A.线粒体基因遗传时遵循孟德尔定律B.线粒体DNA复制时可能发生突变C.线粒体存在于各地质年代生物细胞中D.线粒体通过有丝分裂的方式进行增殖2.(2023·全国·统考高考真题)某种植物的宽叶/窄叶由等位基因A/a控制,A基因控制宽叶性状:高茎/矮茎由等位基因B/b控制,B基因控制高茎性状。
这2对等位基因独立遗传。
为研究该种植物的基因致死情况,某研究小组进行了两个实验,实验①:宽叶矮茎植株自交,子代中宽叶矮茎∶窄叶矮茎=2∶1;实验①:窄叶高茎植株自交,子代中窄叶高茎∶窄叶矮茎=2∶1。
下列分析及推理中错误的是()A.从实验①可判断A基因纯合致死,从实验①可判断B基因纯合致死B.实验①中亲本的基因型为Aabb,子代中宽叶矮茎的基因型也为AabbC.若发现该种植物中的某个植株表现为宽叶高茎,则其基因型为AaBbD.将宽叶高茎植株进行自交,所获得子代植株中纯合子所占比例为1/43.(2023·全国·统考高考真题)水稻的某病害是由某种真菌(有多个不同菌株)感染引起的。
水稻中与该病害抗性有关的基因有3个(A1、A2、a);基因A1控制全抗性状(抗所有菌株),基因A2控制抗性性状(抗部分菌株),基因a控制易感性状(不抗任何菌株),且A1对A2为显性,A1对a为显性、A2对a为显性。
现将不同表现型的水稻植株进行杂交,子代可能会出现不同的表现型及其分离比。
下列叙述错误的是()A.全抗植株与抗性植株杂交,子代可能出现全抗:抗性=3:1B.抗性植株与易感植株杂交,子代可能出现抗性:易感=1:1C.全抗植株与易感植株杂交,子代可能出现全抗:抗性=1:1D.全抗植株与抗性植株杂交,子代可能出现全抗:抗性:易感=2:1:14.(2023·山西·统考高考真题)某研究小组从野生型高秆(显性)玉米中获得了2个矮秆突变体,为了研究这2个突变体的基因型,该小组让这2个矮秆突变体(亲本)杂交得F1,F1自交得F2,发现F2中表型及其比例是高秆:矮秆:极矮秆=9:6:1。
番茄叶色黄化突变体的遗传分析及SSR分子标记[1]
中国蔬菜 2010(14):31-35CHINA VEGETABLES番茄叶色黄化突变体的遗传分析及SSR分子标记郭 明 张 贺 李景富*(东北农业大学园艺学院,黑龙江哈尔滨 150030)摘 要:在番茄普通栽培品种中蔬4号06884中发现能稳定遗传的叶色黄化突变体06883,该突变体新出叶最初为绿色,四叶一心时第一片真叶开始转黄,果实转色慢,硬度大耐贮藏。
通过该突变体和栽培品种中蔬4号的正反交试验的遗传分析证明,该突变材料的叶片黄化性状由1对隐性主效核基因控制,该性状可以用来作为指示性状鉴定杂种纯度。
应用SSR分子标记技术对该突变基因进行初步定位,经连锁分析表明,该基因与LEaat006、LEtat002和Tom196-197连锁,与它们的连锁距离分别为8.9、16.3和18.7 cM。
关键词:番茄;叶色黄化突变;SSR;基因定位中图分类号:S634 文献标识码:A 文章编号:1000-6346(2010)14-0031-05 Genetic Analysis and SSR Molecule Marker on Tomato Yellow Leaf MutantGUO Ming, ZHANG He, LI Jing-fu*(College of Horticulture, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, Heilongjiang, China) Abstract:A natural yellow leaf mutant named 06883, found in tomato(Lycopersicon esculentum Mill.)variety‘Zhongshu No.4’, can be inherited stably. Originally the leaves were green, but the first true leaf color turned into yellow during the period of four leave and one shoot. The fruits turned to red slowly, and became hard which is good for storage. The mutant was reciprocally crossed with tomato variety ‘Zhongshu No.4’, and the genetic analysis indicated that the mutant is nucleolus inheritance and controlled by one recessive gene. It can be used as a phonotypical marker to identify purity of F1 hybrids. We roughly mapped the mutant gene using SSR molecular markers. Three SSR markers LEaat006, LEtat002 and Tom196-197 were linked to the mutant gene. They were 8.9 cM, 16.3 cM and 18.7 cM apart from the mutant gene, respectively.Key words:Tomato; Yellow leaf mutant; Simple sequence repeat(SSR)marker; Molecular mapping叶色突变是自然界比较常见的一种突变,由于突变基因往往是直接或间接影响叶绿素的合成和降解,改变叶绿素含量,所以叶色突变体也称为叶绿素突变体(何冰 等,2006)。
水稻新型黄化转绿叶色突变体的遗传分析与育种利用
mo r p h o l o g i c a l o b s e r v a t i o n ,g e n e t i c a n ly a s i s a n d b r e e d i n g u t i l i z a t i o n ,t h e ma i n a g r o n o mi c t r a i t s o f mu t a n t a n d i t s wi l d t y p e wa s c o mp a r i z e d ,c l a s s i c a l g e n e t i c a n a l y s i s wa s p e r f o r me d b y c o n s t r u c t i o n o f g e n e t i c p o p u l a t i o n s f r o m c r o s s e s b e t we e n mu t a n t wi t h n o r ma l g r e e n r i c e ma t e ia r l s .A n e w r i c e C MS l i n e wi t h l e a f c o l o r ma r k e r wa s d e v e l o p e d b y b a c k c r o s s b r e e d i n g .T h e mu t a n t mu t a n t w a s a s p o n t a n e o u s mu t a n t i s o l a t e d f r o m a h y b id r r i c e
一个新的黄瓜叶色黄化突变体的生理特性分析
一个新的黄瓜叶色黄化突变体的生理特性分析李万青;高波;杨俊;陈鹏;李玉红【摘要】叶色黄化突变体是开展光合系统的结构和功能、叶绿素生物合成及其调控机制研究的理想材料.以叶色黄化突变体(C528)及其野生型(CCMC)为材料,对其光合色素质量分数、光合作用指标和抗氧化酶活性进行研究,并初步调查突变体的农艺性状.结果表明,突变株C528从子叶期开始表现出叶片黄化,叶片的黄化性状不随发育而转变,其株高、茎粗等显著小于野生型;光合色素质量分数及净光合效率(Pn)显著低于野生型;通过对保护酶活性及丙二醛质量摩尔浓度等指标的测定,结果表明,SOD、POD和CAT活性及丙二醛(MDA)质量摩尔浓度均高于野生型.此研究结果可为阐明黄瓜叶色黄化突变机理及图位克隆突变基因提供基础资料.【期刊名称】《西北农业学报》【年(卷),期】2015(024)007【总页数】6页(P98-103)【关键词】黄瓜;叶色黄化突变体;光合特性;抗氧化酶活性;丙二醛质量摩尔浓度【作者】李万青;高波;杨俊;陈鹏;李玉红【作者单位】西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100【正文语种】中文【中图分类】S642.2植物叶色变异是一种常见的突变性状,而叶色突变基因常常直接或间接影响叶绿素的合成与降解,从而改变叶绿素质量分数,所以植物叶色突变体有时也称为叶绿素突变体。
在育种工作中,叶绿素突变体可作为标记性状,在苗期剔除影响种子纯度的植株,不但能简化良种繁育过程也能够提高种子纯度;利用叶色突变体可选育优良的种质资源[1]。
在基础研究中,叶色突变体是开展植物光合作用机制、光形态建成、叶绿体结构功能与遗传发育调控机理等研究的理想材料[2-5],利用突变体对分析鉴定基因功能,了解基因间互作、基因表达调控等机制均具有重要理论意义。
芹菜黄色突变体的遗传及生长表现研究
长度 、 质 量 、 质 量 显 著 低 于 正 常 绿 色 自交 系 , 柄 宽 度 、 物 质 含 量 、 溶 性 固形 物 含 量 无 显 著 差 异 ; 化 突 变 体 鲜 干 叶 干 可 黄 C 18 的粗 纤 维 含 量 是 正 常 C 1 8 E 8H E 8 L的 12 . 3倍 。黄 色 性 状 遗 传 稳 定 可 作 为苗 期 标 记 性 状 在 芹 菜 杂 种 种 子 的生 产 和
自交 系 C 1 8 ( E E , C 1 8 为 近 等 基 因 系 ) E 8L YLYL 与 E8H 的株 高 、 开 度 、 柄 长 度 、 柄 宽 度 、 质 量 、 质 量 , 及 叶 绿 展 叶 叶 鲜 干 以 素 、 溶 性 固形 物 和粗 纤 维 含 量 , 果 表 明 , 黄 化 突 变 体 叶 片 中 叶 绿 素 含 量 仅 为 正 常 株 的 5 . 4 ; 化 突 变 体 可 结 该 56% 黄 C 18 E 8 H在 整 个 生 长 过 程 中 叶片 数 量 多 于 正 常 绿 色 自交 系 C 1 8 , 均 为 C 1 8 E 8L 平 E 8 L的 1 1 . 8倍 , 株 高 、 开 度 、 柄 但 展 叶
( 国农 业 大 学 农 学 与生 物 技 术 学 院 , 京 10 9 ) 中 北 0 13
摘 要 : 了研 究 芹 菜 黄 化 突 变 的 遗 传 规 律 及 黄 化 突 变 体 与 正 常 个 体 的生 长 表 现 差 异 , 黄 化 突 变 自交 系 C 1 8 为 对 E 8H
与正常绿色 自交 系 C 15 E 5 杂交 的 F 分离群体进行 了性 状观察 分析 , 经卡平方 ( 2分析证 明黄 化突变 与正常 绿色 的 x)
纯 度 鉴定 中 应 用 。
两个水稻叶色突变体的鉴定和基因定位的开题报告
两个水稻叶色突变体的鉴定和基因定位的开题报告一、研究背景:水稻(Oryza sativa L.)是我国重要粮食作物之一,是我国主要的食品作物之一,也是世界上最重要的粮食作物之一。
随着人口的增加和生活水平的提高,对水稻的需求也在不断增加。
因此,提高水稻产量和品质,以满足人们需求,已成为目前水稻育种的主要研究方向之一。
水稻的叶色是水稻生长发育过程中的一个重要指标,也是水稻叶绿素合成和代谢的反应之一。
然而在育种过程中,有时会出现水稻叶色发生突变的情况,这可能对水稻的生长发育和产量产生负面影响。
因此,对水稻的叶色突变体进行鉴定和基因定位,对于深入了解水稻的叶色形成机理,提高水稻品质和产量具有重要意义。
二、研究目的:本研究旨在对两个水稻叶色突变体进行鉴定和基因定位,以研究其叶色形成机理和对水稻生长发育和产量的影响,为水稻育种提供理论依据和实践经验。
三、研究内容:1. 对两个水稻叶色突变体进行外观观察和鉴定,分析其叶绿素合成和代谢的差异;2. 利用基因组学、遗传学、生物化学等方法对这两个突变体的基因进行定位和功能鉴定,探究其叶色形成机理;3. 对比分析这两个突变体与野生型水稻在形态、植株生长和发育、生理生化特性、农艺性状等方面的异同;4. 在不同生态条件下对这两个突变体的生长发育和产量进行场试,验证其对水稻生长发育和产量的影响;5. 对这两个突变体的遗传育种利用进行探讨,为水稻育种提供理论依据和实践经验。
四、研究意义:1. 探究水稻叶色形成的机理,对水稻育种具有重要意义;2. 鉴定和基因定位水稻叶色突变体,可以为深入了解水稻叶色形成机理提供新的思路和方法;3. 研究水稻叶色突变体对水稻生长发育和产量的影响,可以为水稻育种提供理论基础和实践经验;4. 在育种过程中利用这两个突变体,可以加速水稻优异品种的选育和培育。
体细胞无性系变异技术在园艺植物育种中的应用
获得的相 关结果还 是很有 限。S toaV( 9 9 等通 过离 体 oi v 19 ) r
培养番茄 “ r t”和“ '2 C iy s L 4一l ”两种 基因 型花粉囊 。 得 3 获 抗番 茄 腐 烂 病 突变 体 C mm( l iat i i nne sbp Ca bc rm c g es u s v e ha mi i nne , c g es) 在连续三代的继 代后 , ha 证明抗番茄 腐烂病 突变
观察r0植株的倍数性rl植株中表型性状的分离和r1种子的发芽力等性状结果表明不同的培养基获得的变异不同并表现出不同的性状包括白果树形状叶片黄绿叶绿素突变体及父本和母本花的花冠有锯齿边缘等突变体13
维普资讯
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专题 综述・
北 方 园 艺 2 6 )8 5 0 ( : ~0 05 4
园 艺 作 物 的 约 17 0个 品 种 中 观 察 到 变 异 。 异 类 型 包 括 果 0 变
性系变异可 以用于选育不 同的抗虫 、 抗病 、 除草剂的 品种, 抗 是一种有效的育种工具。虽然体细胞无性 系的机制还未完全 清楚, 不过已经有一些研究表 明, 因的改 变、 基 点突变、 因重 基 排、 NA改变、 D 编码插入或 者换 位丢失及 D NA甲基化等都是 可能的因素。 尽管体细胞无性系变异 有诸多 的优点, 已经在 大 田和 且 观赏植物作物育种 中取 得了可喜 的进展, 不过在 园艺作 物上
体 胞 性 变 技 在 艺 物 种 的 用 细 无 系 异 术 园 植 育 中 应 张源自 硕 , 明 方 , 景 华 张 杨
( 浙江大学农业 与生物技术学院。 州 30 2 ) 杭 10 9
摘
要: 综述 了因艺作物 中体 细胞 无性 系变异诱 变技术在育种 中的应 用, 以及利 用离体诱 导技 术结合物
押新高考卷 遗传与进化(含解析)-备战2024年高考生物临考题号押题(新高考通用)
押非选择题备战2024年高考生物临考题号押题(新高考通用)遗传与进化考向01 遗传与进化1.(2023·河北·高考真题)某家禽等位基因M/m控制黑色素的合成(MM与Mm的效应相同),并与等位基因T/t 共同控制喙色,与等位基因R/r共同控制羽色。
研究者利用纯合品系P1(黑喙黑羽)、P2(黑喙白羽)和P3(黄喙白羽)进行相关杂交实验,并统计F1和F2的部分性状,一、基因型和表型的推断“先分开,后组合”将多对等位基因的自由组合分离为若干分离定律问题分别分析,再运用乘法原理进行组合。
1.求配子种类及比例(以AaBbCCDd为例)结果见表。
实验亲本F1F21P1×P3黑喙9/16黑喙,3/16花喙(黑黄相间),4/16黄喙2P2×P3灰羽3/16黑羽,6/16灰羽,7/16白羽回答下列问题:(1)由实验1可判断该家禽喙色的遗传遵循定律,F2的花喙个体中纯合体占比为。
(2)为探究M/m基因的分子作用机制,研究者对P1和P3的M/m基因位点进行PCR扩增后电泳检测,并对其调控的下游基因表达量进行测定,结果见图1和图2。
由此推测M 基因发生了碱基的而突变为m,导致其调控的下游基因表达量,最终使黑色素无法合成。
(3)实验2中F1灰羽个体的基因型为,F2中白羽个体的基因型有种。
若F2的黑羽个体间随机交配,所得后代中白羽个体占比为,黄喙黑羽个体占比为。
(4)利用现有的实验材料设计调查方案,判断基因T/t和R/r 在染色体上的位置关系(不考虑染色体交换)。
调查方案:。
结果分析:若(写出表型和比例),则T/t和R/r位于同一对染色体上;否则,T/t 和R/r位于两对染色体上。
2.(2023·重庆·高考真题)科学家在基因型为mm的普通玉米(2n=20)群体中发现了杂合雄性不育突变体,并从中(1)求产生配子种类数(2)求产生ABCD配子的概率基因型Aa Bb CC Dd结果产生配子A B C D配子比例1/21/211/2相乘得1/8 (3)求配子间结合方式AaBbCCDd自交,配子之间的结合方式为(2×2)×(2×2)×(1×1)×(2×2)=64(种)。
菊花黄化突变体初步研究
菊花黄化突变体初步研究卢珍红;莫锡君;蒋亚莲;余蓉培;周旭红;田敏;杨晓;桂敏【摘要】The photosynthetic pigment content and de novo RNA-Seq were investigated in leaf-color mutant and normal plant of Dendranthema morifolium'Xiaguang Feiyue'.The results showed that the photosynthetic pigment content had decreased greatly of mutant plants,only about 18 percent of normal plants,but the Chl a/b observably increased in mutant plant.We generated 4.75 Gb and 4.96 Gb clean datum from the mutant and normal plant leaves using transcriptome sequencing,respectively.De novo assembly yielded 105 456 unigenes with 15 493 of length greater than 1 kb,1 556 bp of N50.For unigenes expression analysis,we got 3 762 differentially expressed genes (DEGs),and obtained 2 741 annotations by functional annotation of the ing GO and KEGG enrichment analyses,and qPCR verification,results indicated that forming reason of the chlorina mutant of D.morifolium 'Xiaguang Feiyue'may be expressed at low level of dmGLK2 and dmGLK1 not expressed cause chloroplast development and division blocked,chloroplast number is greatly reduced in leaf cells,thus the content of chlorophyll is overall declined.And the study will supply meaning information to the future studies on leaf-color mutants and directional breeding of D.morifolium.%以菊花‘霞光飞跃’叶色突变体和正常植株为试验材料,对其叶绿素含量进行测定,并进行无参转录组测序分析.结果表明:突变体与正常植株相比,叶绿素含量有较大幅度的下降,仅为正常植株的18%左右,叶绿素a/b比值(Chl a/b)显著升高.利用转录组测序技术分别从突变体与正常植株叶片中获得4.75 Gb和4.96 Gb有效数据(Clean Data),de novo组装后得到105 456条通用基因(Unigenes),其中长度大于1 kb的有15 493条,N50为1556 bp.对Unigenes表达分析,共获得3 762条差异表达基因(DEGs).对得到的DEGs进行生物学功能性注释,获得总注释信息为2741.通过对注释信息进行GO和KEGG富集分析,结合定量PCR验证表明,菊花‘霞光飞跃’叶色突变体形成的原因可能是dmGLK2低水平表达和dmGLK1不表达导致叶绿体合成和分裂受阻,叶片细胞内叶绿体数量大大降低,进而叶绿素含量下降.【期刊名称】《西南林业大学学报》【年(卷),期】2017(037)002【总页数】9页(P60-68)【关键词】菊花;突变体;无参转录组测序;差异基因【作者】卢珍红;莫锡君;蒋亚莲;余蓉培;周旭红;田敏;杨晓;桂敏【作者单位】云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100;云南丰岛花卉有限公司,云南昆明650100;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650100【正文语种】中文【中图分类】S722.3叶色变异是高等植物中常见的可以自然发生的性状变异,普遍存在于各种植物中,运用理化诱变和组织培养等方式更易诱发叶色变异,获得叶色突变体[1]。
黄化苗文献综述
黄化苗文献综述黄化苗是一种以黄色为主色调的观赏植物,含有多种色素,赋予了它鲜艳的颜色。
在生长过程中,如果环境中有过量的干扰素、病毒、病菌等,会导致水稻出现黄化症状。
黄化苗的黄化症状是由于叶绿素含量下降和类胡萝卜素含量增加,导致氯黄色素积聚在叶片内部形成。
选取7-10天生长的黄化苗,浸泡在细菌素和酶解液混合液中,然后放到振动培养箱中,进行振动培养,使其细胞质体充分释放。
过滤细胞悬液,去除细胞膜,细胞核等杂质。
再用不同的离心速度分离出不同的组分。
水稻原生质体的制备选择黄化苗作为优质材料的原因在于,黄化苗相比于正常的苗期生长受到了一定的抑制和干扰,使得其细胞质中含有更多的植物生长素和细胞分裂素。
这种差异性质可以为原生质体的制备提供优质的材料。
黄化苗含有丰富的类黄酮,包括芸香黄素、异酮路芪素、芍药苷等。
这些成分不仅可以增加黄化苗的色彩饱和度和留存时间,还具有较强的抗氧化性和抗炎作用。
此外,它还含有叶黄素,这是一种天然的类胡萝卜素,是植物生长过程中必不可少的营养物质。
叶黄素可以保护植物组织,吸收紫外线,从而防止紫外线对植物组织的损伤。
黄化苗是一种具有观赏性和营养价值的植物,其独特的黄色色调和丰富的色素成分可以作为植物育种和农业生产的优质材料。
同时,对于水稻原生质体的制备来说,黄化苗是一种优质的制备材料,可以通过对其色素和营养物质的提取和分析,进一步了解其生理特性和生态价值。
黄化苗在育种领域有多个应用:1.提高作物抗病性:黄化苗的基因型和抗病性之间存在一定的关联,因此可以通过黄化苗的筛选和培育,提高作物的抗病性,如番茄、茄子、辣椒、黄瓜、西瓜、甜瓜、烟草等作物。
2.辅助作物育种:黄化苗的出现与植物体内叶绿素含量下降和类胡萝卜素含量增加有关。
这种变化使得黄化苗的叶片呈现黄色,与正常植株的绿色叶片形成鲜明对比。
这为育种工作者提供了直观的筛选条件,可以快速地发现并选择具有优良性状的黄化苗,如抗病性强、产量高等。
3.提取和生产天然色素:黄化植物中所含的一些次生代谢产物具有显著的抗氧化活性和抗菌作用,可以用于食品添加剂,提高食品的质量和保鲜期。
植物黄化原因及对光合特性的影响综述
被植 物所 吸收 。
系、 叶片 等植物 组织 , 干扰 植 物 正 常 的 生 理生 化 代 谢 或 破 坏 植物 正常 的结构 引起 的 叶片黄 化 、 失绿 。导 致 病理 性 黄
化 的病 原菌 主要有 植原 体 ( L 、 立 克 次 氏体 ( L 、 M O)类 R O)
类 细菌 ( L 、 菌 、 菌 、 B O) 真 细 病毒 、 原 线 虫 等 。常 见 的 病 病 害 种类有 泡桐 丛枝 病 、 疯 病 、 橘 黄 龙 病 、 楝 丛 枝 病 、 枣 柑 苦 桉 树黄化 病等 。病 原微 生 物 导 致 的植 株 黄 化 的 机 理不
响 叶绿 素 的形 成 , 使植 株纤细 、 株黄 化 , 株 的抗 性 降 致 植 植 低 , 受侵 染 。 易 122 矿质 营养 元 素失调 引起 黄化 症状 矿 质 营养 元素 ..
生 理失调 也会 导致 植 物 引 发 黄化 病 的发 生 。土 壤 中 营养 元 素 的多 少及 p H值 的高低 等影 响 着植 物 的 生理 需 求 , 从 而诱 发植 物各 种 黄 化 病 症 。 。通 过 研 究 已 经发 现 与植 物 黄化有 关 的主要 矿质元 素有 铁 、 、 、 、 、 、 等 , 镁 锰 氮 钾 锌 铜 这些 元素 的缺 失对 于 植 株 来讲 都 会 表 现 出 黄化 症 状 。对 于 缺失元 素表 现 的黄 化 机 理 也不 尽 相 同 。植 物 缺铁 性 黄 化症 状最 先在 幼嫩 的 叶片或枝 条 上表现 出来 , 渐 向老 叶 逐 片发 展 。 由初 期 的叶脉绿 色 、 肉组织 黄化 转变 为 叶 片成 叶 黄 白色 , 逐渐 变褐 干枯 至植 株死 亡 。造 成植 物缺 铁 黄化 的 主要 原 因在于 植物 对铁 的吸 收和利 用能 力低 ; 一 方 面是 另 土壤 因子 对铁 有效 性 的影 响 。铁 主要 以二 价 铁 的形 式 被 植物 吸 收 , 较 高 p 情 况 下 , 液 中铁 的活 性 减 小 不 易 在 H 溶
一个水稻苗期黄化叶突变体基因的定位
一个水稻苗期黄化叶突变体基因的定位项显波;吴晶;丁沃娜;朱世华【摘要】Leaf color mutants are useful resource for rice genomics research and development of rice cultivars with high photosynthetic efficiency. In this research, a rice yellow leaf mutant is isolated from an EMS (ethyl methane sulfonate)-generated rice mutant library of Kasalath background, and Oryza sativa yellow leaf 1(Osyl1) is thus obtained. The Osyl1 shows a yellow leaf phenotype before the second leaf stage and later leaves gradually turn back to green similar to the wild type. Genetic analysis suggests that the phenotype of Osyl1 is controlled by a single recessive nuclear gene. By map-based cloning, the OsYL1 is mapped to a 483 kb region between the markers S5362 and S5845 on chromosome 3. No report on yellow leaf related gene has been found in this region. The result of this study is expected to provide useful reference for cloning and characterizing OsYL1.%通过筛选甲基磺酸乙酯(Ethyl Methane Sulfonate, EMS)诱变的籼稻Kasalath突变体库,得到一个黄化叶突变体Osyl1(Oryza sativa yellow leaf 1),在二叶期前该突变体叶色黄化,后期突变体叶色逐渐恢复到野生型水平。
植物突变体库的构建及突变体检测研究进展_郭建秋
收稿日期:2009-12-11基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2009CB118400)作者简介:郭建秋(1972-),男,河南新安人,助理研究员,主要从事大豆品质改良利用研究。
E-ma il:guojianqiu.2008@植物突变体库的构建及突变体检测研究进展郭建秋,雷全奎,杨小兰,马 雯,张向召(洛阳市农业科学研究院,河南洛阳471022)摘要:突变体是研究基因功能的重要材料,为此,介绍了创造突变体的方法,特别是理化诱变方法以及突变体的检测方法等方面的研究进展。
关键词:植物突变体;构建;检测方法中图分类号:Q319 文献标识码:A 文章编号:1004-3268(2010)06-0150-06 随着大量基因序列和EST 资料的积累,后基因组时代诞生了。
功能基因组学是后基因组时代的重点研究内容,主要研究生物有机体内各种基因的生物学功能,进而了解所有基因如何协调发挥作用,完成一系列的生长发育过程。
要精确了解每个基因的功能及基因间的相互作用,必须分析单个基因和多个基因的突变表型以及它们的时空表达剖面。
随着新技术新方法的不断创新开发,分析鉴定基因功能的方法越来越多,并逐渐形成功能基因组学的分支学科。
目前已经发展了多种分析鉴定基因功能的方法,其中最直接最有效的方法是构建饱和的基因突变体库,通过突变体分析鉴定基因功能。
因此,突变体库的构建是功能基因组学的基础。
为此,综述了创造突变体的方法以及突变体的检测筛选方法等方面的研究进展。
1 创造突变体的方法突变体库有不同的分类方法[1]。
按照产生突变体的方法大致可分为自发突变体库、体细胞无性系变异突变体库、理化诱变突变体库和插入突变体库4类。
1.1 自发突变自发突变是指自然条件下发生的突变,是生物变异的重要来源,是自然进化的基础。
自发突变为人类提供了极有价值的研究材料。
李玮等[2]在芥菜型油菜品系L638-g 中发现了几株无致死效应的天然叶片黄化突变体,并研究揭示了该突变体的黄化机理及生物学特性。
BSA_联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因
江苏农业学报(JiangsuJ.ofAgr.Sci.)ꎬ2024ꎬ40(1):165 ̄173http://jsnyxb.jaas.ac.cn张朝阳ꎬ程㊀瑞ꎬ徐兵划ꎬ等.BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因[J].江苏农业学报ꎬ2024ꎬ40(1):165 ̄173.doi:10.3969/j.issn.1000 ̄4440.2024.01.018BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因张朝阳ꎬ㊀程㊀瑞ꎬ㊀徐兵划ꎬ㊀顾㊀妍ꎬ㊀黄大跃ꎬ㊀孙玉东(江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所/淮安市设施蔬菜重点实验室ꎬ江苏淮安223001)收稿日期:2022 ̄11 ̄28基金项目:淮安市农业科学研究院发展基金项目(HAN201714)ꎻ淮安市自然科学研究技术专项(HAB202079)ꎻ国家西甜瓜产业技术体系淮安综合试验站项目(CARS ̄25)作者简介:张朝阳(1982-)ꎬ男ꎬ江苏连云港人ꎬ硕士ꎬ副研究员ꎬ从事西甜瓜遗传育种研究ꎮ(E ̄mail)287362703@qq.comꎮ程瑞为共同第一作者ꎮ通讯作者:孙玉东ꎬ(E ̄mail)sunyudong@jaas.ac.cn㊀㊀摘要:㊀叶片是植物重要的功能器官之一ꎬ不仅是植株进行光合作用的主要场所ꎬ也可作为重要的形态标记ꎬ应用于育种中ꎮ叶片颜色作为形态标记ꎬ不仅可用于苗期杂种的清除ꎬ亦可用于种子纯度的测定ꎮ以西瓜全生育期叶片黄化突变体纯合自交系ly104为母本(P1)㊁绿叶自交系w3为父本(P2)ꎬ通过杂交创制F1代㊁F2代㊁BC1代群体ꎮ遗传分析结果表明ꎬ该突变体的叶片黄化由单隐性基因控制ꎮ采用混合分组分析(BSA)进行初定位ꎬ通过简化基因组测序(RAD)开发全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记构建西瓜高密度遗传图谱ꎬ将西瓜叶片黄化基因定位于2号染色体13950306~15517591bp(大小约为1 57Mb)ꎮ以西瓜97103v2为参考基因组ꎬ该区间包含24个注释基因ꎮ对P1(P1Y)㊁P2(P2G)和F2代群体中黄叶(F2Y)㊁绿叶(F2G)株系进行转录组水平分析ꎬ结果表明ꎬ目标区间内基因Cla97C02G035950㊁Cla97C02G036010㊁Cla97C02G036020㊁Cla97C02G036060在黄化叶片与正常绿叶材料中的表达量差异显著ꎬ可能是西瓜叶片的黄化候选基因ꎮ研究结果可为进一步解析西瓜叶片黄化基因功能和生物学特性奠定重要基础ꎮ关键词:㊀西瓜ꎻ黄化ꎻBSAꎻ遗传图谱ꎻ基因定位中图分类号:㊀S651.01㊀㊀㊀文献标识码:㊀A㊀㊀㊀文章编号:㊀1000 ̄4440(2024)01 ̄0165 ̄09IdentificationofcandidategenesforwatermelonleafyellowingbasedonBSAandtranscriptomeanalysisZHANGChao ̄yangꎬ㊀CHENGRuiꎬ㊀XUBing ̄huaꎬ㊀GUYanꎬ㊀HUANGDa ̄yueꎬ㊀SUNYu ̄dong(HuaiyinInstituteofAgriculturalSciencesoftheXuhuaiDistrictofJiangsuProvince/HuaianKeyLaboratoryforFacilityVegetablesꎬHuaian223001ꎬChina)㊀㊀Abstract:㊀Theleafisoneoftheimportantfunctionalorgansofplants.Itisnotonlythemainplaceforphotosynthesisofplantsꎬbutalsocanbeusedasanimportantmorphologicalmarkerinbreeding.Asamorphologicalmarkerꎬleafcolorcanbeusednotonlyforremovinghybridsattheseedlingstageꎬbutalsofordeterminingseedpurity.InthisstudyꎬF1ꎬF2ꎬandBC1populationswerecreatedbyhybridizationꎬandthemutanthomozygousinbredlinely104inthewholegrowthperiodofwatermelonwasusedasthefemaleparent(P1)ꎬandthegreenleafinbredlinew3wasusedasthemaleparent(P2).Geneticanalysisshowedthatleafyellowingwascontrolledbyasinglerecessivegene.Thebulkedsegregantanalysis(BSA)wasusedforprimarymappingꎬandgenome ̄widesinglenucleotidepolymorphism(SNP)markersweredevelopedbyrestriction ̄siteassociatedDNA ̄sequencing(RAD)toconstructahigh ̄densitygeneticmapofwatermelon.Thewatermelonleafyellowinggenewaslocalizedonchromosome2at13950306 ̄15517591bp(about1.57Mb).Watermelon97103v2wasusedasthereferencegenomeandthein ̄tervalcontained24annotatedgenes.ThetranscriptomelevelsofP1(P1Y)ꎬP2(P2G)andyellowleaf(F2Y)andgreenleaf(F2G)linesinF2populationwereanalyzed.TheresultsshowedthattheexpressionlevelsofCla97C02G035950ꎬCla97C02G036010ꎬCla97C02G036020andCla97C02G036060inthetargetintervalweresignificantlydifferentbetweenetio ̄latedleavesandnormalgreenleaves.Thesegenesmightbecandidategenesforetiolationofwatermelonleaves.There ̄561sultsofthisstudycanlayanimportantfoundationforfurtheranalysisofthefunctionandbiologicalcharacteristicsofwatermelonleafyellowinggenes.Keywords:㊀watermelonꎻetiolationꎻBSAꎻgeneticmapꎻgenelocation㊀㊀叶片是植物进行光合作用最主要的器官ꎬ对植物的生存具有重要意义ꎬ叶片颜色在很大程度上决定了植物的光合效率[1]ꎮ植物叶色突变不仅是研究叶绿素相关基因功能及植物发育的重要材料[2]ꎬ也是优良的形态标记性状ꎬ在实际生产中常被用来进行品种纯度鉴定[3]ꎮ关于水稻㊁大麦㊁小麦㊁玉米㊁棉花㊁大豆㊁蚕豆㊁番茄㊁拟南芥等多种植物叶色突变的研究已有报道[4]ꎬ叶色突变类型丰富多样ꎬ包括白化㊁黄化㊁黄绿化等[5 ̄6]ꎮ植株叶色的形成不仅受到叶绿体生物合成途径㊁叶绿素降解途径㊁血红素代谢途径㊁类胡萝卜素代谢途径等与光合色素代谢途径相关基因的影响ꎬ受到与叶绿体发育相关基因的调控ꎬ还与光㊁温度㊁植物激素㊁矿物元素和金属离子等外界环境因素息息相关[6 ̄9]ꎮ目前ꎬ关于水稻㊁玉米㊁拟南芥等模式植物中叶色的研究较为深入ꎬ水稻㊁玉米中已报道的叶色突变体均超200个[10 ̄13]ꎬ对拟南芥的研究发现ꎬ叶色突变以隐性遗传为主ꎬ目前已经发现27个编码15种叶绿素生物合成酶的核基因ꎬ它们的任何异常突变都会导致叶绿素缺乏ꎬ从而产生黄色突变[14]ꎮ近年来ꎬ随着高通量测序技术的应用ꎬ关于辣椒㊁甜瓜和黄瓜等一些重要经济作物的叶色突变研究也逐渐展开[15 ̄19]ꎮ西瓜是全球十大水果之一ꎬ中国西瓜栽培面积和消费量均居世界首位ꎮ随着杂交育种的发展ꎬ西瓜育种已基本实现杂种一代化ꎬ对制种纯度提出了更大挑战ꎬ叶形㊁叶色虽是重要的形态标记性状ꎬ但尚未应用于育种中ꎮ西瓜的遗传基础狭窄ꎬ自然突变率低ꎬ目前有关西瓜叶色突变的报道有斑驳突变类型[20]㊁白化突变类型[21 ̄22]㊁不完全显性黄叶突变类型[22]㊁后绿突变类型[23]㊁黄化突变类型[24 ̄25]等ꎬ但研究主要集中于遗传规律㊁生理特性[21 ̄25]ꎮ西瓜基因组的公布和测序技术的快速发展为西瓜重要性状定位㊁关键基因功能研究奠定了重要生物学基础[26 ̄29]ꎮKidanemariam[30]发现ꎬ西瓜后绿突变体Houlv中的ClCG03G010030基因存在1个单核苷酸多态性(SNP)变异ꎬ导致该基因编码的FtsH胞外蛋白酶序列中精氨酸突变为赖氨酸ꎬFtsH蛋白主要参与叶绿体早期发育ꎬ进而影响西瓜叶片颜色ꎮZhu等[25]对叶片黄化突变西瓜材料w ̄yl进行精细定位ꎬ认为基因Cla97C02G036040㊁Cla97C02G036050和Cla97C02G036060可能是导致西瓜叶片黄化的主要基因ꎮ探索叶片颜色变异机制可为遗传改良提供理论依据ꎬ满足人们在生产㊁选种和育种等方面的需求ꎻ开发叶色形态标记ꎬ能够有效缩短育种周期ꎬ提高育种效率与制种纯度ꎮ本研究拟以全生育期叶片黄化西瓜材料ly104和绿叶西瓜材料w3为试验材料ꎬ通过混合分组分析(BSA)测序初步定位叶片黄化基因在染色体中的位置ꎬ进一步利用简化基因组(RAD)测序开发全基因组SNP分子标记ꎬ利用F2代群体构建高密度遗传图谱进行西瓜叶片黄化基因定位ꎬ结合转录组测序及基因功能注释锁定关键候选基因ꎮ本研究结果可为进一步全面解析西瓜叶片黄化基因及其生物学功能奠定重要基础ꎮ1㊀材料与方法1.1㊀试验材料2014年ꎬ利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变获得的稳定遗传的叶片黄化西瓜材料ꎬ经5代连续自交获得相对纯合的叶片黄化突变材料ly104ꎮ本研究以ly104为母本(P1)ꎬ以正常绿叶西瓜材料w3为父本(P2)构建F1代㊁F2代㊁BC1代群体ꎬ群体的构建与表型调查试验均于淮安市农业科学研究院科研创新基地进行ꎬ群体配制过程严格自交㊁杂交ꎬ整个生育期采取商品化管理ꎮ1.2㊀形态观察与遗传规律分析以第1张完全展开的真叶进行表型统计与分析ꎬ采用人工观察和便携式色差仪RM200QC(爱色丽X ̄Riteꎬ美国)对叶片颜色指数进行测定ꎬ测定指标为亮度值(L∗)㊁红绿值(a∗)和黄蓝值(b∗)3个颜色参数ꎮ对F1代㊁F2代㊁BC1代群体分离表型进行统计ꎬ分析西瓜叶片黄化遗传规律ꎬ并进行卡方检验ꎮ1.3㊀通过BSA测序进行叶片黄化初定位BSA测序即混合分组分析法ꎬ是一种简单快速的目标性状定位方法ꎬ已被广泛应用于多种园艺作物重要性状的基因定位[31]ꎮ本研究从F2代西瓜群体中选取黄叶㊁绿叶极端表型植株各20株ꎬ采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法[32]提取植株幼叶基661江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期因组DNA并检测其浓度ꎬ通过等量混匀构建2个极端混池ꎬ利用亲本DNA构建亲本池进行测序分析ꎬ送至上海凌恩生物科技有限公司ꎬ利用IllunimaHiSeq4000进行测序ꎬ亲本测序深度为10ˑꎬ混池测序深度为20ˑꎬ测序读长为150bpꎮ对原始序列(Read)进行过滤ꎬ去除接头ꎬ过滤掉包含未确定碱基(N)>15%和低质量的read(质量值ɤ20的碱基数占整个Read的10%以上)ꎬ将获得的干净序列(Cleanread)用于后续分析ꎮ使用BWA软件[33]将高质量的Cleanread映射到西瓜基因组97103v2(ht ̄tp://cucurbitgenomics.org/organism/21)上ꎮ然后用GATK[34]㊁SnpEff[35]软件对突变位点进行检测和注释ꎬ用SNP ̄index算法进行关联分析ꎬ阈值为0 5ꎮ1.4㊀西瓜高密度遗传图谱的构建为了更精确地定位获得西瓜叶片黄化突变位点ꎬ本研究根据F2代群体中黄叶㊁绿叶分离比选取共100份单株ꎬ分别提取基因组DNAꎬ采用RAD建库方式构建长度范围在300~500bp的双端文库ꎮ将产物送至上海凌恩生物科技有限公司ꎬ利用IllunimaHiSeq进行测序ꎬ测序读长为150bpꎮ对原始Read采用以下标准进行质控:(1)去除Read中的接头序列ꎻ(2)修剪测序质量较低的Read末端(测序质量值小于Q20)ꎻ(3)去除含N比例达到10%的Readꎻ(4)舍弃接头及质量修剪后长度小于100bp的小片段ꎮ用BWA软件将Cleanread比对至参考基因组97103v2ꎬ并对映射结果进行统计分析ꎮ用GATK软件进行变异位点检测获得SNPꎮ对获得的SNP按以下标准进行过滤:(1)去除比对Read质量值小于20的位点ꎬ同时过滤掉缺失率大于50%的SNPꎻ(2)删除无义SNP位点ꎻ(3)用joinmap4.0软件[36]对过滤后的SNP进行卡方测验ꎬ先后过滤掉P<0 01和缺失率30%以上的标记ꎬ对于最终获得的SNPꎬ采用joinmap4.0软件进行西瓜遗传图谱构建ꎬ选用Kosamb s参数ꎮ1.5㊀转录组分析从亲本及其F2代群体中取ly04和w3单株各3份ꎬ当第1张真叶完全展开后取样进行转录组分析ꎮ用PlantRNAPurificationReagent试剂盒(购自上海凌恩生物科技有限公司)提取植物总RNAꎬ并构建转录组测序文库ꎮ送至上海凌恩生物科技有限公司采用IlluminaHiSeq进行测序ꎬRead长度为150bpꎮ测序数据经质控过滤获得Cleanreadꎬ用Hisat2软件[37]将其映射到西瓜基因组97103v2上ꎮ用每个基因在一个样本中所对应的基因转录本数(FPKM)计算基因表达水平ꎮ基于KEGG(http://www.ge ̄nome.jp/kegg/)和GO(http://www.geneontology.org/)数据库进行基因注释和功能分析ꎮ差异表达基因以差异倍数(Foldchange)ȡ1 5㊁Pɤ0 005为标准ꎮ1.6㊀候选区域功能注释与候选基因筛选结合遗传规律分析及BSAꎬ利用RAD测序开发全基因组SNP标记ꎬ加入叶色表型标记进行西瓜2号染色体图谱的构建ꎬ对西瓜叶片黄化基因进行定位ꎮ以97103v2为参考基因组对定位区间基因进行注释ꎬ通过基因序列分析及转录组测序差异表达情况分析进一步筛选并确定候选基因ꎮ2㊀结果与分析2.1㊀西瓜叶片黄化特性及遗传规律分析经EMS诱变获得叶片黄化的西瓜材料ꎬ经5代连续自交后ꎬ获得遗传稳定的叶片黄化材料ly104ꎬ该材料从子叶期至果实收获时的叶片均保持黄化状态(图1A)ꎮ通过对ly104㊁w3的叶片颜色指标进行测定ꎬ发现叶片黄化西瓜材料与绿叶西瓜材料在叶片颜色指标上存在极显著差异(图1B)ꎮ㊀㊀分析结果显示ꎬly104和w3的杂交F1代所有植株叶片均呈绿色ꎬ表明控制黄色和绿色的基因是等位基因ꎬ黄色的突变基因为隐性遗传ꎮF2代群体中有174个单株为绿叶ꎬ63个单株为黄叶(表1)ꎮ在F1代与叶片黄化亲本(P1)回交群体后代中ꎬ有73个单株为绿叶ꎬ63个单株为黄叶ꎮ卡方检验发现ꎬF2代群体的分离比符合3ʒ1的孟德尔分离比[χ2(1ꎬn=237)=0.31646ꎬP=0.5737>0 0500ꎬn为群体样本数量]ꎬBC1群体的分离模式符合1ʒ1的孟德尔分离比[χ2(1ꎬn=136)=0.73529ꎬP=0.3912>0 0500](表1)ꎬ说明西瓜叶片的黄色突变符合单基因控制的隐性遗传规律ꎬ叶片绿叶对黄色表现为显性遗传ꎮ表1㊀F2代和BC群体中叶片黄化突变型与野生型的分离比Table1㊀Segregationratioofyellow ̄leafmutantandwildtypeinF2andBCpopulations群体类型群体数量绿叶植株数量黄叶植株数量期望分离比卡方检验值(χ2)BC113673631ʒ10.74F2237174633ʒ10.32χ2检验采用0.05水平ꎮ761张朝阳等:BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因A:表型ꎻB:颜色指数ꎮL∗:亮度(阈值0~100)ꎻa∗:红绿色范围(阈值-128~+127)ꎻb∗:黄蓝色范围(阈值-128~+127)ꎻMT:突变体叶片黄化材料ꎻWT:野生型材料ꎮ∗∗表示不同材料间差异极显著(P<0 01)ꎮ图1㊀西瓜绿叶和黄叶突变体的表型及颜色指数Fig.1㊀Phenotypeandcolorindexofwatermelongreen ̄leafmutantandyellow ̄leafmutant2.2㊀西瓜叶片黄化基因的BSA初定位原始Read经质控过滤ꎬ2个混池共获得12.4Gb高质量CleanreadꎬQ30在93 0%以上ꎬ与参考基因组97103v2的平均比对率在98 0%以上ꎮ使用GATK软件进行变异检测ꎬ共获得523303个SNPꎬ经过滤后用SNP ̄Index算法对性状相关侯选区域进行选择ꎬ作图窗口大小为1Mbꎬ作图步移为10kbꎬ阈值为0 5ꎬ结果表明ꎬ西瓜叶色黄化基因定位于2号染色体8490001~26410000bp(大小约为17 92Mb)(图2A)ꎮ2.3㊀高密度西瓜遗传图谱的构建与叶片黄化基因的定位㊀㊀根据分离比ꎬ从F2代群体中选取76株绿叶㊁24株黄叶西瓜单株进行RAD测序ꎬ共获得69 17Gb高质量CleanreadꎬQ30在91 3%以上ꎬ与参考基因组的平均比对率在97 6%以上ꎮ使用GATK软件进行变异检测ꎬ共获得229704个SNPꎬ经过滤筛选ꎬ最终确定4273个SNP用于西瓜高密度遗传图谱的构建ꎮ西瓜遗传图谱总长度为1602.44cMꎬ平均遗传距离为0 39cMꎬ最大间隔为7 38cM(表2)ꎮ㊀㊀为了进一步精确定位西瓜叶片黄化基因ꎬ用RAD测序结果对西瓜2号染色体上的SNP标记进行过滤筛选ꎬ剔除检测率低于40%的样品单株和标记ꎬ最终用91份单株(68份绿叶ꎬ23份黄叶)㊁286个SNP标记进行叶片黄化基因定位ꎬ叶片颜色标记(Leafcolor)用绿叶(D)㊁黄叶(B)表示ꎬ用joinmap4进行西瓜叶片黄化基因的定位ꎮ结果显示ꎬLeafcol ̄or定位于Clas97Chr02 ̄13950306与Clas97Chr02 ̄15517591标记之间(大小约为1 567Mb)(图2B)ꎬ以西瓜97103v2为参考基因组ꎬ该区间包含24个注释基因(图2C㊁表3)ꎮ表2㊀西瓜高密度遗传图谱构建结果Table2㊀Constructionofhighdensitygeneticmapofwatermelon基因组位置标记数量遗传长度(cM)平均遗传距离(cM)标记最大间隔(cM)Lg01437161.150.372.62Lg02504185.490.372.32Lg0310960.130.553.16Lg04628278.320.443.87Lg05314114.810.372.87Lg0638095.080.252.75Lg07481186.900.392.82Lg0820572.030.352.17Lg09437147.520.342.21Lg10459121.600.262.40Lg11319179.410.567.38合计42731602.440.39-861江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期2.4㊀西瓜黄化叶片转录组分析及候选基因的筛选RNA ̄seq共检测12个样本ꎬ其中P1㊁P2分别选取3个样本ꎬF2代群体中叶片黄化类型㊁绿叶类型分别选取3个样本ꎬ每个样本平均获得6 4Gb高质量Cleanread数据ꎬQ30在92 0%以上ꎬ平均基因组比对率为91 4%ꎮ分别以P2G(亲本绿叶)与P1Y(亲本黄叶)和F2G(F2代绿叶)与F2Y(F2代黄叶)为对比组进行独立分析ꎬ其中P2G与P1Y对比组中共检测到1356个差异表达基因ꎬ其中上调表达的基因529个ꎬ下调表达的基因827个ꎻF2G与F2Y对比组中共检测到4180个差异表达基因ꎬ其中上调表达的基因1378个ꎬ下调表达的基因2802个(图3Aꎬ图3B)ꎮP2G与P1Y对比组和F2G与F2Y对比组中均显著下调表达的基因共有327个㊁均显著上调表达的基因共有132个(图3A)ꎮ以上结果表明ꎬ亲本中黄叶和绿叶差异表达基因数量显著小于F2代群体ꎬ说明P1和P2已相对纯合ꎻGO和KEGG富集分析结果表明ꎬ差异表达基因富集通路多与光合㊁应激反应等有关ꎬ说明黄叶和绿叶西瓜植株在光合作用等方面存在较大差异ꎮ表3㊀候选区间注释基因Table3㊀Genefunctionannotationinformationincandidateinterval基因㊀㊀染色体起始位置(bp)终止位置(bp)基因方向基因功能注释㊀㊀㊀㊀㊀Cla97C02G035890染色体21395641713957327-acanthoscurrin ̄1 ̄likeCla97C02G035900染色体21402996814031110-未知的蛋白质Cla97C02G035910染色体21403120214032265-acanthoscurrin ̄1 ̄likeCla97C02G035920染色体21403358014037379-未知的蛋白质Cla97C02G035930染色体21405567614057378-含BPTI/Kunitz结构域的蛋白质2亚型X2Cla97C02G035940染色体21415712214158310+未知的蛋白质Cla97C02G035950染色体21420137314202375-与TMA7相关的翻译机制蛋白质Cla97C02G035960染色体21426731014270809-B类锌指蛋白质转录因子ꎬ包含DUF1664结构域Cla97C02G035970染色体21427090614274847+脂质结合血清糖蛋白质Cla97C02G035980染色体21427768614278904-蛋白质核融合缺陷6ꎬ叶绿体/线粒体样亚型X1Cla97C02G035990染色体21428304714283329+未知的蛋白质Cla97C02G036000染色体21437008614372002+抗坏血酸氧化酶同源物Cla97C02G036010染色体21437643914376782+未知的蛋白质Cla97C02G036020染色体21446137614464307-双组分反应调节蛋白质Cla97C02G036030染色体21449460714497114+双组分反应调节蛋白质Cla97C02G036040染色体21454976514550425+包含DUF679结构域的蛋白质Cla97C02G036050染色体21455062614551935-DNAJ同源亚家族B成员13Cla97C02G036060染色体21467069314671707+蛋白质Ycf2Cla97C02G036070染色体21483721914875277-U11/U12小核核糖核蛋白(相对分子质量65000)蛋白质亚型X2Cla97C02G036080染色体21499052014990719-未知的蛋白质Cla97C02G036090染色体21505989915063209+环型E3泛素转移酶Cla97C02G036100染色体21515520915157456+含五肽重复的家族蛋白质Cla97C02G036110染色体21516514215226986+尼曼 ̄匹克C1蛋白样亚型X2Cla97C02G036120染色体21523146015231976-锌指家族蛋白质+ 表示基因注释在染色体正链ꎻ - 表示基因注释在染色体负链ꎮ㊀㊀对西瓜2号染色体13950306~15517591bp(大小约为1 56Mb)内的24个注释基因进行功能分析和转录组表达差异分析ꎬ结果显示ꎬ24个注释基因中有17个在植株叶片中表达ꎬ仅有基因Cla97C02G036060㊁961张朝阳等:BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因A:BSA定位结果ꎮB:西瓜2号染色体遗传图谱及叶色黄化标记定位ꎮC:根据西瓜参考基因组97103v2注释候选区域的基因ꎮSNPindex:单核苷酸多态性指数ꎮ图2㊀西瓜叶片黄化基因精细定位Fig.2㊀FinemappingofleafyellowinggenesinwatermelonA:P2G与P1Y对比组及F2G与F2Y对比组上调和下调基因数量Venn图ꎻB:P2G与P1Y对比组及F2G与F2Y对比组上调和下调基因数量柱形图ꎻC:F2G与F2Y对比组差异基因火山图ꎬ标注基因为候选区间基因ꎮP1Y:亲本黄叶ꎻP2G:亲本绿叶ꎻF2G:F2代绿叶ꎻF2Y:F2代黄叶ꎮ图3㊀西瓜黄叶与绿叶转录组差异表达基因分析Fig.3㊀Analysisofdifferentiallyexpressedgenesinthetranscriptomeofwatermelonyellowleafandgreenleaf071江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期Cla97C02G035950㊁Cla97C02G036010㊁Cla97C02G036020在叶片黄化植株与绿叶植株中的表达存在显著差异ꎬCla97C02G036060在P2G和F2G中均显著上调表达(图3C)ꎬ其注释功能为Ycf2蛋白编码基因ꎬ该编码基因为被子植物中最重要的质体基因ꎬ与植物光合作用有关ꎮ3㊀讨论与结论化学EMS诱变是人工创造突变体最常用的处理方式之一ꎬ叶片黄化是最常见的诱变表型[22]ꎮ笔者所在课题组前期通过EMS诱变西瓜种子ꎬ获得稳定遗传的西瓜叶片黄化材料ꎬ其整个生育期均可保持黄化状态ꎮ植物叶片黄化突变ꎬ又称叶绿素缺乏突变ꎬ通常是由叶绿素合成或降解途径被破坏所致[38]ꎮ目前ꎬ研究者已经在水稻[39]㊁番茄[40]㊁黄瓜[19]㊁拟南芥[41]等植物中发现了黄化突变体ꎮ有研究发现ꎬ不同类型的叶色突变的遗传规律差异较大ꎬ有些叶色突变可能是核遗传ꎬ也可能是细胞质遗传ꎬ水稻[42]㊁玉米[43]㊁小麦[44]㊁黄瓜[45]㊁番茄[46]等都由1对或2对隐性核基因控制ꎮZhang等[21]研究证实ꎬ西瓜叶片白化突变是由1对隐性等位基因(jaja)控制的ꎮProvvidenti[20]发现ꎬ西瓜叶色斑驳突变由1对隐性基因(slv)控制ꎮKidanemariam等[30ꎬ47]发现ꎬ西瓜叶色后绿突变是由1个隐性基因(dgdg)控制的ꎮZhu等[25]研究发现ꎬ西瓜黄化突变体w ̄yl由1对隐性核基因控制ꎬ与本研究结果一致ꎮ西瓜作为重要的园艺经济作物[48 ̄51]ꎬ在中国的栽培面积和产量均居世界首位ꎮ经长期人工选择ꎬ栽培西瓜遗传背景狭窄ꎬ多态性分子标记开发受限ꎬ致使西瓜分子标记辅助育种及品种改良进展缓慢ꎮ高密度遗传图谱的构建不仅是开发西瓜重要农艺性状遗传基因/QTL紧密连锁分子标记的重要手段ꎬ亦是深入挖掘和解析西瓜重要农艺性状基因的基础ꎬ通过遗传图谱构建进行基因/QTL定位研究已经在西瓜多种性状研究中得到成熟应用[52 ̄53]ꎮ本研究基于BSA定位ꎬ将西瓜叶片黄化基因定位于2号染色上ꎬ为了进一步获得可靠定位基因ꎬ本研究开发了SNP标记ꎬ用于构建高密度西瓜遗传图谱ꎬ并将西瓜叶片黄化基因定位到2号染色体13950306~15517591bp(大小约为1 56Mb)ꎬ比对西瓜参考基因组97103v2发现ꎬ在候选区段内包含24个注释基因ꎬ17个基因在叶片中表达ꎬ4个基因在黄叶与绿叶转录组分析中存在显著差异表达ꎬ其中基因Cla97C02G036060是Ycf2蛋白的编码基因ꎬYcf2/FtsH调控的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 ̄苹果酸脱氢酶是叶绿体或非光合质体在黑暗中产生腺嘌呤核苷三磷酸的关键酶[54]ꎬ是光合生长必需的酶[55]ꎮ目前ꎬYcf2基因已被证实是被子植物中最重要的质体基因[56]ꎬ它在高等植物中发挥着重要功能[57]ꎮ在本研究中ꎬ由于双亲重测序深度不高ꎬ候选区间注释基因编码区中未发现可靠突变ꎬ但转录组结果显示ꎬYcf2在叶片黄化西瓜材料中的表达量显著下调ꎬ说明叶片黄化西瓜材料的光合作用系统可能与正常绿叶植株光合系统存在显著差异ꎬ相关机制需要进一步研究ꎮ本研究结果可为进一步挖掘叶片黄化植株光合作用机制奠定一定科学基础ꎮ参考文献:[1]㊀陈婷婷ꎬ符卫蒙ꎬ余㊀景ꎬ等.彩色稻叶片光合特征及其与抗氧化酶活性㊁花青素含量的关系[J].中国农业科学ꎬ2022ꎬ55(3):467 ̄478. 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洋葱黄色条纹突变体叶绿体基因组测序及嵌合体验证
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结果表明,测序获得突变体叶绿体基因组153585bp,与洋葱叶绿体参考基因组比对筛选出5个差异位点,PCR扩增及测序分析发现叶绿体基因组碱基的突变、插入并不导致黄条纹突变;突变果夹黄化程度与母株上种子出苗后黄化程度成正比,果夹越黄,种子出苗叶片越黄,3个分子标记对同一株黄色和绿色组织进行PCR验证,发现绿色与黄色组织扩增条带不一致。
综上所述,洋葱叶片黄色条纹突变是一种嵌合体突变。
关键词:洋葱;黄条纹;叶绿体;嵌合体;基因组测序 中图分类号:S633.201 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2023)20-0043-06收稿日期:2022-11-30基金项目:江苏省连云港市财政专项(编号:QNJJ2206);连云港市第六期“521工程”科研项目(编号:LYG06521202134)。
作者简介:惠林冲(1988—),男,江苏灌南人,硕士,助理研究员,从事蔬菜育种、栽培及分子生物学研究。
E-mail:huilinchong@yeah.net。
通信作者:潘美红,硕士,副研究员,从事蔬菜育种、栽培及利用研究。
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一个水稻“斑马叶”叶色突变体基因zebra leaf2(zl2)的图位克隆
一个水稻“斑马叶”叶色突变体基因zebra leaf2(zl2)的图位克隆刘胜;魏祥进;邵高能;唐绍清;胡培松【期刊名称】《中国水稻科学》【年(卷),期】2013(027)003【摘要】从粳稻品种Asominori组培后代中获得一个稳定遗传的黄绿相间叶色突变体(zebra leaf2,zl2).该突变体在苗期表现为黄绿相间的斑马状,分蘖后期斑马叶性状逐渐减弱,到抽穗期叶片逐渐变为淡黄色.与野生型相比,zl2在3叶期、分蘖盛期、抽穗期及成熟期叶片的叶绿素、类胡萝卜素含量显著降低,成熟后其结实率、千粒重、株高也显著下降.电镜观察结果显示,苗期zl2叶片黄色部分叶肉细胞中叶绿体显微结构发生了明显的异常,而绿色部分与野生型基本一致.遗传分析结果表明,zl2突变性状受一对隐性核基因控制.从zl2与籼稻品种南京11衍生的F2群体中挑选1607株表现为突变性状的分离单株,最终将该突变基因定位于第11染色体约164.3 kb的区域内.基因预测表明该区域内存在13个ORFs,其中ORF12编码一个类胡萝卜素异构酶,序列分析表明突变体中的该基因第10个内含子与第11外显子的交界处碱基A突变为T,导致cDNA发生错误剪切,缺失4个碱基,产生移码突变,并于第395个氨基酸处提前终止.RT-PCR分析表明,相对野生型在突变体中ZL2的表达量显著下降,同时叶色相关基因PORA、Rbc、RbcS、Cab1、Cab2、psaA、psbA、OsD VR表达量也显著下降,而HEMA1、YGL1、V1、V2、SPP、OsPPR的表达量显著上升.结果表明ZL2在水稻叶绿素合成及叶绿体发育中起着重要作用.【总页数】9页(P231-239)【作者】刘胜;魏祥进;邵高能;唐绍清;胡培松【作者单位】中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州310006;杭州师范大学生命与环境科学学院,浙江杭州310036;中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州310006;中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州310006;中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州310006;中国水稻研究所国家水稻改良中心水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州310006【正文语种】中文【中图分类】Q343.5;Q754;Q944.56【相关文献】1.水稻斑马叶突变体zebra524的表型鉴定及候选基因分析 [J], 李燕群;钟萍;高志艳;朱柏羊;陈丹;孙昌辉;王平荣;邓晓建2.水稻斑马叶突变体zebra1349的表型鉴定及基因精细定位 [J], 郭国强;孙学武;孙平勇;尹建英;何强;袁定阳;邓华凤;袁隆平3.水稻叶色白化转绿及多分蘖矮秆基因hw-1(t)的图位克隆 [J], 郭涛;黄永相;黄宣;刘永柱;张建国;陈志强;王慧4.一个水稻斑马叶突变体的遗传分析和基因定位 [J], 陈海元;朱晓妹;张所兵;张云辉;方先文5.一个新的水稻细条纹叶色突变体特性分析和基因克隆 [J], 甘树仙;李东宣;李娟;冯德党;熊海波;朱骞;张慧;张小玲;陈丽娟因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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《园艺作物叶色黄化突变体研究进展》摘要:目前,叶色黄化突变体的研究多见于大田作物,园艺作物相关报道较少,仅在甘蓝型油菜[9-10]、芥菜型油菜[11]、甜瓜[12-13]、甘蓝[14]、番茄[15-17]、辣椒[18]、黄瓜[19-22]、胡萝卜[23]、花椰菜[24]、西瓜[25]、菊花[26]、兰[27-28]、芹菜[29]、烤烟[30]、小白菜[31]等园艺作物中有报道,其中自发突变的概率很低,突变基因很难获得,但是这种自然突变不涉及转基因等生物安全问题,可直接用于常规育种工作,甘蓝型油菜[9]、芥菜型油菜[11]、甜瓜[13]、甘蓝[14]、辣椒[18]、黄瓜[19]、胡萝卜[23]、花椰菜[24]、西瓜[25]、菊花[26]、兰[27]、小白菜[31]、番茄[32]等园艺作物中均已发现自发突变的叶色黄化突变体,目前发现的园艺作物叶色黄化突变多数是由细胞核隐性基因控制,在甘蓝型油菜[9]、甘蓝[14]、番茄[16]、辣椒[18]、黄瓜[19-21]、胡萝卜[23]、花椰菜[24]、西瓜[25]、芹菜[29]等中均有报道摘要:叶色黄化是叶色突变的一种重要类型突变,是研究植物光合系统、叶绿体结构、叶绿素生物合成途径等的重要材料,对育种工作有重要应用价值。
该文综述了园艺作物叶色黄化突变体的来源、突变发生的生理机制、遗传机制、分子研究进展及其应用价值,旨在为园艺作物叶色黄化突变研究提供理论基础。
关键词:园艺作物;叶色黄化突变;研究进展中图分类号 S603 文献标识码 A 文章编号 1007-7731(2016)18-0023-04Research Progress on Yellow Leaf Mutant in Horticultural CropsYang Chong1 et al.(1Agricultural University of Hebei,National Engineering Research Center for Agriculture in Northern Mountainous Areas,Baoding 071000,China)Abstract:Yellow leaf is an important type of leaf mutations and an important material for the study of plant photosynthetic system,the structure of chloroplasts,chlorophyll biosynthetic pathway,it also has important applications on breeding work. We review the research progress about source,physiological mechanism,genetic,molecular advances and application of yellow leaf mutant in horticultural crops,in order to provide theoretical basis for the research of yellow leaf mutant in horticultural crops.Key words:Horticultural crops;Yellow leaf mutant;Research progress植物叶色突变来源广泛,主要来源于自发突变和人工诱导突变[1]。
叶色突变大多在苗期表达,少部分植株在生长后期表现出叶色黄化现象[2]。
Gustaffsson[3]将叶色突变体分为浅绿(virids)、白化(albina)、条纹(striata)、黄化(xanthan)、斑点(tigrina)五类;后来Awan[4]又将叶色突变体划分为黄化、绿黄、白化和条纹等8种类型,其中,叶色黄化是一种重要突变类型。
黄化突变体是由于叶片的叶绿素含量改变了,净光合速率降低,植株的生产力降低,甚至死亡。
过去叶色黄化突变总被认为无意义,但越来越多作物中发现了叶色黄化突变,其价值获得了广泛的重视,叶色黄化突变体不仅利用苗期黄化突变性状快速鉴定品种纯度[1],还可以用于研究植物的叶绿素生物合成调控[5]、叶绿体超微结构及其发育趋势[6-9]、光合生理和基因表达调控[5]等方面。
目前,叶色黄化突变体的研究多见于大田作物,园艺作物相关报道较少,仅在甘蓝型油菜[9-10]、芥菜型油菜[11]、甜瓜[12-13]、甘蓝[14]、番茄[15-17]、辣椒[18]、黄瓜[19-22]、胡萝卜[23]、花椰菜[24]、西瓜[25]、菊花[26]、兰[27-28]、芹菜[29]、烤烟[30]、小白菜[31]等园艺作物中有报道。
本文将近年来园艺作物叶色黄化突变体相关研究进行整理综述。
1 园艺作物叶色黄化突变来源园艺作物叶色黄化突变体主要来源于自发突变和人工诱导。
其中自发突变的概率很低,突变基因很难获得,但是这种自然突变不涉及转基因等生物安全问题,可直接用于常规育种工作,甘蓝型油菜[9]、芥菜型油菜[11]、甜瓜[13]、甘蓝[14]、辣椒[18]、黄瓜[19]、胡萝卜[23]、花椰菜[24]、西瓜[25]、菊花[26]、兰[27]、小白菜[31]、番茄[32]等园艺作物中均已发现自发突变的叶色黄化突变体。
利用组织培养方式、物理射线等、化学品亚硝酸等和太空诱变的人工诱导增大了获得叶色黄化突变的几率,可缩短获得突变的时间。
谭河林等[33]采用EMS诱变甘蓝型油菜双11,单株收获诱变后第一代,第一代自交得到第二代,播种并筛选鉴定第二代,获得叶片叶色稳定突变的甘蓝型油菜种质资源62份,其中叶色黄化突变株系较多,占得到的突变株系的34%。
人工诱导获得的园艺作物黄化突变还有油菜[34-36]和黄瓜[20-21,37]。
目前在园艺作物中尚未发现基因沉默和插入突变获得叶色黄化突变体的报道。
2 园艺作物叶色黄化突变的生理机制2.1 色素组成与含量高等植物叶片主要含叶绿素类、胡萝卜素类和花色素苷化合物,叶片的颜色形成复杂,取决于色素化合物的种类、含量和分布的位置[38],园艺作物叶色黄化突变体叶片中光合色素的组成没有发生改变,是各种色素含量或比例发生了变化,叶绿素总含量明显降低,大部分能够完成整个生育期。
苗晗等[39]对黄瓜黄绿叶突变体的研究表明黄化突变体在叶色素成分上与野生型无显著差异,光合色素含量显著低于野生型。
大部分叶色黄化突变体的叶绿素a/b(Chl a/b)比值高于野生型[9,11,13],还有些叶色黄化突变体的Chl a/b与野生型无显著差异[14,39]。
叶色黄化突变体的叶绿素缺乏造成光合能力下降,天线色素捕获的光能量减少,从而导致净光合速率(Pn)显著下降[14,40]。
2.2 叶绿素合成中间物质被子植物叶绿素合成途径共有15步,15种酶[41],中间任何一步反应变化都可能引起叶绿素含量变化,不同园艺作物叶色黄化突变体在不同反应中发生了变化,一旦叶绿素合成受阻,受阻位点之前的化合物含量显著上升,位点之后的物质含量显著下降。
邵勤等[13]对甜瓜叶色黄化突变体9388-1的研究表明,突变体叶绿素的合成在胆色素原(PBG)转化形成尿卟啉原Ⅲ(Urogen Ⅲ)过程之中受到阻碍;黄瓜叶色突变体9110Gt原叶绿素合成受阻造成了Chla、Chlb合成减少,光合色素含量降低,成分相对含量改变,导致叶色黄化[39];王彩霞等[27]分析了10份文心兰叶色黄化突变体的叶绿素生物合成,结果发现突变体Y1、Y2、Y3、Y5和Y6叶绿素合成在粪卟啉原Ⅲ(Coprogen Ⅲ)到原卟啉Ⅸ(Proto Ⅸ)位点受阻,突变体Y4在ProtoⅨ到镁原卟啉Ⅸ(Mg-ProtoⅨ)这步反应受阻;吕明等[42]对芥菜型油菜黄化突变体进行研究,表明突变体的叶绿素合成受到阻碍的位点为在粪卟啉原Ⅲ(Coprogen Ⅲ)到原卟啉Ⅸ(Proto Ⅸ)之间。
2.3 叶绿体超微结构类囊体存在于叶绿体基质中,膜上分布着光合色素,光合作用中光能到化学能的转化在这里发生。
园艺作物黄化突变体叶绿体的透射电镜观察说明,大多黄化突变体的叶绿体超微结构出现了不同程度的变异。
甘蓝叶色黄化突变体YL-1叶绿体透射电镜观察结果表明[14],YL-1叶绿体的结构缺乏完整性,基粒数量少,基粒片层数少,基粒排列不整齐,部分细胞内部结构模糊不清,没有明显的膜结构,发育后期,叶色恢复一些绿色之后,叶绿体的结构正常,但基粒数目和基粒片层仍然比野生型少,这与肖华贵等[9]对甘蓝型油菜叶色黄化突变体叶绿体的研究结果一致。
菊花叶色黄化突变体黄色叶片中类囊体膜的功效缺失,光系统Ⅱ和I不能完全发挥功效,导致光合能力降低[26]。
3 园艺作物叶色黄化突变的遗传机制目前发现的园艺作物叶色黄化突变多数是由细胞核隐性基因控制,在甘蓝型油菜[9]、甘蓝[14]、番茄[16]、辣椒[18]、黄瓜[19-21]、胡萝卜[23]、花椰菜[24]、西瓜[25]、芹菜[29]等中均有报道。
也有部分园艺作物的叶色黄化突变体是受两对不同隐性细胞核基因所调控,田颖等[43]报道的芥蓝型油菜黄化突变体L638-y即为此类型。
还有一些叶色黄化突变体是受不完全显性基因控制的,在马蹄纹天竺葵和金鱼草中有报道[44],叶色黄化突变体与野生型杂交获得F1,F1自交后代表型分离,叶色颜色表现为黄色(白色)、黄绿色和绿色,分离比为1∶2∶1,但叶色黄化(白化)大多是致死型。
Hosticka等[45]在番茄中还发现了不同的突变类型,这种叶色突变是受细胞质体变异导致的。
4 园艺作物叶色黄化的分子机制叶片呈色机理复杂,涉及到很多基因,与叶绿素合成相关的基因变异都可能改变叶色,相比大田作物叶色黄化突变而言,园艺作物黄化突变分子机制方面报道较少,仅在部分园艺作物中有报道。
Nothnagel等[23]利用BSA分析法混合胡萝卜叶色黄化突变体群体,提取DNA,然后用分子标记技术对胡萝卜叶色黄化突变体进行定位,获得了与目的基因连锁的10个AFLP分子标记。
郭明[31]利用SSR标记初步定位番茄自发叶色突变体06883,筛选得到了3个与目的基因紧密连锁的SSR标记,LEaat006、LEtat002和Tom196-197,与目标基因的连锁距离分别为8.9cm、16.3cm和18.7cm,确定了目标基因位于第11号染色体上。
王全等[46]利用BSA方法和AFLP技术,对黄瓜自发叶色黄化突变体及其野生型进行基因组筛选,得到了一个与叶色基因紧密连锁的AFLP标记。