王镜岩《生物化学》课后习题详细解答
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生物化学(第三版)课后习题详细解答
第三章氨基酸
提要
α-氨基酸是蛋白质的构件分子,当用酸、碱或蛋白酶水解蛋白质时可获得它们.蛋白质中的氨基酸都是L型的.但碱水解得到的氨基酸是D型和L型的消旋混合物。
参与蛋白质组成的基本氨基酸只有20种。此外还有若干种氨基酸在某些蛋白质中存在,但它们都是在蛋白质生物合成后由相应是基本氨基酸(残基)经化学修饰而成.除参与蛋白质组成的氨基酸外,还有很多种其他氨基酸存在与各种组织和细胞中,有的是β-、γ-或δ—氨基酸,有些是D型氨基酸。
氨基酸是两性电解质。当pH接近1时,氨基酸的可解离基团全部质子化,当pH在13左右时,则全部去质子化.在这中间的某一pH(因不同氨基酸而异),氨基酸以等电的兼性离子(H3N+CHRCOO-)状态存在。某一氨基酸处于净电荷为零的兼性离子状态时的介质pH称为该氨基酸的等电点,用pI表示。
所有的α—氨基酸都能与茚三酮发生颜色反应。α—NH2与2,4-二硝基氟苯(DNFB)作用产生相应的DNP-氨基酸(Sanger反应);α—NH2与苯乙硫氰酸酯(PITC)作用形成相应氨基酸的苯胺基硫甲酰衍生物( Edman反应).胱氨酸中的二硫键可用氧化剂(如过甲酸)或还原剂(如巯基乙醇)断裂.半胱氨酸的SH基在空气中氧化则成二硫键.这几个反应在氨基酸荷蛋白质化学中占有重要地位。
除甘氨酸外α—氨基酸的α-碳是一个手性碳原子,因此α-氨基酸具有光学活性.比旋是α-氨基酸的物理常数之一,它是鉴别各种氨基酸的一种根据.
参与蛋白质组成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有光吸收,这是紫外吸收法定量蛋白质的依据。核磁共振(NMR)波谱技术在氨基酸和蛋白质的化学表征方面起重要作用。
氨基酸分析分离方法主要是基于氨基酸的酸碱性质和极性大小。常用方法有离子交换柱层析、高效液相层析(HPLC)等。
习题
1。写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。[见表3-1]
2、计算赖氨酸的εα—NH320%被解离时的溶液PH。[9.9]
解:pH = pKa + lg20% pKa = 10.53 (见表3—3,P133)
pH = 10。53 + lg20% = 9.83
3、计算谷氨酸的γ-COOH三分之二被解离时的溶液pH。[4。6]
解:pH = pKa + lg2/3% pKa = 4.25
pH = 4.25 + 0。176 = 4.426
4、计算下列物质0。3mol/L溶液的pH:(a)亮氨酸盐酸盐;(b)亮氨酸钠盐;(c)等电亮氨酸。[(a)约1.46,(b)约11.5,(c)约6.05]
5、根据表3—3中氨基酸的pKa值,计算下列氨基酸的pI值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。[pI:6.02;5。02;3。22;10。76]
解:pI = 1/2(pKa1+ pKa2)
pI(Ala) = 1/2(2。34+9.69)= 6.02
pI(Cys) = 1/2(1。71+10。78)= 5。02
pI(Glu) = 1/2(2。19+4.25)= 3.22
pI(Ala) = 1/2(9。04+12。48)= 10。76
6、向1L1mol/L的处于等电点的甘氨酸溶液加入0.3molHCl,问所得溶液的pH是多少?如果加入0。3mol NaOH以代替HCl时,pH将是多少?[pH:2.71;9。23]
7、将丙氨酸溶液(400ml)调节到pH8.0,然后向该溶液中加入过量的甲醛,当所得溶液用碱反滴定至Ph8.0时,消耗0。2mol/L NaOH溶液250ml。问起始溶液中丙氨酸的含量为多少克?[4。45g]
8、计算0.25mol/L的组氨酸溶液在pH6.4时各种离子形式的浓度(mol/L).[His2+为1。78×10-4,His+为0。071,His0为2。8×10-4]
9、说明用含一个结晶水的固体组氨酸盐酸盐(相对分子质量=209。6;咪唑基pKa=6。0)和1mol/L KOH配制1LpH6。5的0。2mol/L组氨酸盐缓冲液的方法[取组氨酸盐酸盐41.92g(0.2mol),加入352ml 1mol/L KOH,用水稀释至1L]
10、为什么氨基酸的茚三酮反映液能用测压法定量氨基酸?
解:茚三酮在弱酸性溶液中与α—氨基酸共热,引起氨基酸氧化脱氨脱羧反映,(其反应化学式见P139),其中,定量释放的CO2可用测压法测量,从而计算出参加反应的氨基酸量。
11、L-亮氨酸溶液(3。0g/50ml 6mol/L HCl)在20cm旋光管中测得的旋光度为+1。81º。计算L—亮氨酸在6mol/L HCl中的比旋([a])。[[a]=+15。1º]
12、标出异亮氨酸的4个光学异构体的(R,S)构型名称。[参考图3-15]
13、甘氨酸在溶剂A中的溶解度为在溶剂B中的4倍,苯丙氨酸在溶剂A中的溶解度为溶剂B中的两倍。利用在溶剂A和B之间的逆流分溶方法将甘氨酸和苯丙氨酸分开。在起始溶液中甘氨酸含量
甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一号分溶管中含量最高?(2)在这样的管中每种氨基酸各为多少毫克?[(1)第4管和第3管;(2)51.2mg Gly+24mg Phe和38。4mgGly+36mg Phe]
解:根据逆流分溶原理,可得:
对于Gly:Kd = C A/C B = 4 = q(动相)/p(静相) p+q = 1 = (1/5 + 4/5)
4个分溶管分溶3次:(1/5 + 4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/125
对于Phe:Kd = C A/C B = 2 = q(动相)/p(静相) p+q = 1 = (1/3 + 2/3)
4个分溶管分溶3次:(1/3 + 2/3)3=1/27+6/27+12/27+8/27
故利用4个分溶管组成的分溶系统中,甘氨酸和苯丙氨酸各在4管和第3管中含量最高,其中:
第4管:Gly:64/125×100=51。2 mg Phe:8/27×81=24 mg
第3管:Gly:48/125×100=38.4 mg Phe:12/27×81=36 mg
14、指出在正丁醇:醋酸:水的系统中进行纸层析时,下列混合物中氨基酸的相对迁移率(假定水相的pH为4.5):(1)Ile, Lys; (2)Phe, Ser (3)Ala, Val, Leu; (4)Pro, Val (5)Glu, Asp;(6)Tyr, Ala, Ser, His.
[Ile> lys;Phe,〉 Ser;Leu〉 Val > Ala,;Val >Pro;Glu>Asp;Tyr> Ala>Ser≌His]
解:根据P151 图3—25可得结果。
15.将含有天冬氨酸(pI=2。98)、甘氨酸(pI=5.97)、亮氨酸(pI=6。53)和赖氨酸(pI=5。98)的柠檬酸缓冲液,加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱,并分别收集洗出液,这5种氨基酸将按什么次序洗脱下来?[Asp, Thr, Gly, Leu, Lys]
解:在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)〉中性氨基酸(A+)>酸性氨基酸(A0)。因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸,由于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:Asp, Thr, Gly, Leu, Lys。