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小鼠TREM-1分子CDR1保守区的克隆、原核表达及纯化的开题报告

小鼠TREM-1分子CDR1保守区的克隆、原核表达
及纯化的开题报告
一、研究背景
小鼠TREM-1 （Triggering receptor expressed on myeloid cells-1）是一种跨膜受体分子，在免疫响应和炎症过程中发挥重要作用。

其CDR （Complementarity-determining region）序列是重要的抗体识别位点，是制备抗体及开发药物的重要依据。

因此，对小鼠TREM-1分子的CDR1保守区进行研究具有重要科学意义和应用价值。

二、研究内容
1. CDR1保守区的克隆
本研究采用基因克隆技术，利用PCR扩增小鼠TREM-1分子的CDR1保守区片段，并进行酶切、连接、转化等步骤，将其插入到原核表达载体中，构建重组表达质粒。

2. 原核表达
构建好的表达质粒在大肠杆菌系统中进行表达。

在进行表达之前，先行优化合适的诱导条件，包括诱导剂种类、浓度、诱导时间等因素。

利用SDS-PAGE进行蛋白质表达情况检测。

3. 纯化
对表达并经过诱导后的细菌进行离心，收集细胞上清液。

利用亲和纯化技术，将目标蛋白从杂质中纯化出来，并进行蛋白质浓度的定量。

三、研究意义
本研究成功克隆并表达了小鼠TREM-1分子CDR1保守区，为进一步研究该分子的生理和病理作用奠定了基础。

此外，纯化后的CDR1保守区蛋白可以作为制备抗体、开发药物等研究的重要基础。

Affymetrix生物芯片简介

Affymetrix⽣物芯⽚简介Affymetrix⽣物芯⽚解决⽅案概述Affymetrix公司作为全球销量第⼀的基因芯⽚⼚家，以其完备的芯⽚设计，稳定可靠的分析结果和强⼤的⽣物信息学分析能⼒，帮助研究⼈员在最短的时间内获得⼤量可靠的结果，为后续研究提供重要的线索和帮助。

Affymetrix公司⽬前已经在纳斯达克上市，在基因芯⽚领域中成为⾏业标准。

Affymetrix公司的巨⼤优势在于为客户提供“完整的基因芯⽚解决⽅案”，即提供全套的基因芯⽚相关产品。

包括：1. 性能优异、种类齐全的各类研究应⽤系列芯⽚产品；2. Affymetrix基因芯⽚相关试剂和试剂盒；3. 基因芯⽚杂交、洗涤、扫描检测仪器系统及相关分析软件⼯具；4. 基因芯⽚相关技术⼿册及使⽤指南等。

相关⽬录：z GeneChip? 独特的原位光刻技术z GeneChip? 独特的PM-MM探针设计z GeneChip? 严密的质控步骤z GeneChip? 种类齐全，应⽤⼴泛z GeneChip? 强⼤的配套分析软件z GeneChip? 强⼤的⽹上注释及分析⼯具z GeneChip? 发表的研究论⽂z GeneChip? 项⽬合作及技术培训GeneChip?独特的原位光刻技术美国著名的Affymetrix公司率先开发的寡聚核苷酸原位光刻专利技术，是⽣产⾼密度寡核苷酸基因芯⽚的核⼼关键技术。

该⽅法的最⼤优点在于⽤很少的步骤可合成⼤量的DNA阵列。

Affymetrix的原位合成技术可制作的点阵密度⾼达106~1010/cm2。

⾸先，使固相⽚基羟基化，并⽤光敏保护基团将其保护起来，然后选取适当的避光膜（mask）使需要聚合的部位透光，其他部位不透光。

这样，当光通过避光膜照射到⽀持物上时，受光部位的羟基就会发⽣脱保护⽽活化，从⽽可以反应结合碱基。

由于参与合成的碱基单体⼀端可以进⾏固相合成，另⼀端受光敏基团的保护，所以原位合成后，可进⾏下⼀轮的光照、脱保护和固相合成。

小鼠OX40原核表达载体的构建及表达

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实时定量PCR阵列检测小鼠大脑组织microRNA表达谱

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基因表达谱芯片数据分析及其Bioconductor实现

基因表达谱芯片数据分析及其Bioconductor实现1.表达谱芯片及其应用表达谱DNA芯片（DNA microarrays for gene expression profiles）是指将大量DNA片段或寡核昔酸固定在玻璃、硅、塑料等硬质载体上制备成基因芯片，待测样品中的mRNA被提取后，通过逆转录获得cDNA,并在此过程中标记荧光，然后与包含上千个基因的DNA芯片进行杂交反应30min~20h后，将芯片上未发生结合反应的片段洗去，再对玻片进行激光共聚焦扫描，测定芯片上个点的荧光强度，从而推算出待测样品中各种基因的表达水平。

用于硏究基因表达的芯片可以有两种：①cDNA芯片；② 寡核昔酸芯片。

cDNA芯片技术及载有较长片段的寡核昔酸芯片采用双色荧光系统：U前常用Cy3—dUTP （绿色）标记对照组mRNA, Cy5—dUTP （红色）标记样品组mRNAUl。

用不同波长的荧光扫描芯片，将扫描所得每一点荧光信号值自动输入计•算机并进行信息处理，给出每个点在不同波长下的荧光强度值及其比值（ratio值），同时计算机还给出直观的显色图。

在样品中呈高表达的基因其杂交点呈红色，相反，在对照组中高表达的基因其杂交点呈绿色，在两组中表达水平相当的显黄色，这些信号就代表了样品中基因的转录表达情况⑵。

基因芯片因具有高效率，高通量、高精度以及能平行对照研究等特点，被迅速应用于动、植物和人类基因的研究领域，如病原微生物毒力相关基因的。

基因表达谱可直接检测mRNA的种类及丰度，可以同时分析上万个基因的表达变化，来揭示基因之间表达变化的相互关系。

表达谱芯片可用于研究：①同一个体在同一时间里，不同基因的表达差异。

芯片上固定的已知序列的cDNA或寡聚核昔酸最多可以达到30 000多个序列，与人类全基因组基因数相当，所以基因芯片一次反应儿乎就能够分析整个人的基因⑶。

②同一个体在不同时间里，相同基因的表达差异。

③不同个体的相同基因表达上的差异。

对小鼠apoE基因表达谱的分析

对小鼠apoE基因表达谱的分析载脂蛋白E(apo1ipoprotein E,apo E)是乳糜微粒(CM)、极低密度脂蛋白(VLDL)、高密度脂蛋白(HDL)的重要组分。

继人类apoE基因于1973年首次发现后,陆续在小鼠、大鼠、猪、狗、牛、猴子等动物体内也发现了它的踪影。

而且在一些动物中,apoE基因的结构有较高的相似性,如人、猪和小鼠的apoE基因均由4个外显子和3个内含子组成。

apoE基因编码的apoE蛋白在稳定微管蛋白结构、细胞内信号传导、免疫调节、糖代谢、氧化应激、脂质代谢及其他细胞过程中发挥重要作用,与人类的衰老,心血管疾病密切相关,apoE基因的多态性及其表达越来越受到研究者的关注,其中小鼠被广泛用作该基因作用机制研究的动物模型。

如apoE 基因敲除小鼠的出现,增加了一个可用于评估研究人类衰老性疾病的动物模型,它有助于深化研究apoE基因的功能,为多种疾病的治疗提供了药物筛选的平台。

尽管小鼠被广泛用作该基因作用机制研究的动物模型,但未见该基因在小鼠各种组织表达的研究报道。

本研究通过对小鼠apoE基因表达谱的分析,为小鼠的apoE基因的研究及其动物模型的利用积累基础性的资料。

1、材料与方法1.1试验动物:健康清洁级昆明种小鼠3只,雌性,40d龄,平均每只体重(28±3)g(广西医科大学实验动物中心提供,批号************)。

处死动物前禁食12h,仅供饮水。

颈椎脱臼处死动物,取心、肝、脾、肺、肾、脑、脊髓、胃、小肠、胸腺、肾上腺、胰腺、膀胱、子宫、主动脉、血液、腹肌等17种组织,每样组织标本约100mg,分别放入含有500μLRNA保存液(北京康为世纪生物科技公司)的1.5mLEP管中备用。

组织样本采集均于处死动物后30min 之内完成,所用解剖工具和EP管均用0.1%DEPC(北京天根生化科技公司)水浸泡过夜后高温高压消毒。

1.2方法1.2.1总RNA抽提:总RNA提取选用上述小鼠的心、肝等17种不同组织,取80~100mg组织样在无RNA酶的研磨器中匀浆后采用Trizol-异丙醇(美国Invitrogen公司)沉淀法提取总RNA,1%的琼脂糖凝胶电泳验证RNA的完整性,并于-70℃保存备用,具体操作按照Invitrogen公司提供的RNA提取试剂盒说明书进行。

小鼠缺氧实验报告

小鼠缺氧实验报告缺氧是指由于各种原因使人体内氧气供应不足的情况，一定程度上有害于生命健康。

在科学研究中，通过对小鼠进行缺氧实验，可以更好地了解缺氧的生理学效应以及应对方法。

本文将介绍一个小鼠缺氧实验的基本流程和结果分析。

实验方法1. 实验动物本实验使用12只2-3月龄的小鼠，体重在20-25g之间。

小鼠是实验动物中最为常用的种类之一，其生理特征与人体较为接近，这也是选择小鼠作为实验动物的原因之一。

2. 组织样本制备将小鼠放置在缺氧室中，实行8小时长期缺氧训练，然后立即用三氯乙酸酚麻醉动物。

随后，取出小鼠大脑、心脏和肝脏等器官，将其冰冻保存，以备后续组织样本制备。

3. RT-PCR分析通过RT-PCR反应体系，提取所需组织样本中的RNA。

随后运用高保真度反转录酶进行反转录，获得相应的cDNA模板。

根据所需基因及其引物调整试剂体系，进行PCR扩增反应。

扩增结束后，取样本进行凝胶电泳检测，分析其PCR扩增产物的特征和大小，以判断该基因的表达情况。

实验结果1. 缺氧训练引起小鼠组织缺氧损伤缺氧训练后，小鼠被发现缺氧受损明显，心脏等器官出现不同程度的缺氧损伤，包括细胞膜破损，线粒体肿胀、减少和形态改变等。

同时，高浓度染料染色显示，组织细胞核周围空隙的体积显著增大，这也表明缺氧训练引起了细胞凋亡和坏死。

2. 缺氧训练重构小鼠的基因表达谱RT-PCR分析结果显示，在缺氧训练后，小鼠的基因表达谱出现了显著变化。

在实验中选择的神经元特异性烯化酶（NeuN）和中性粒细胞介素-1β（IL-1β）基因的表达水平均有所变化。

其表达水平明显下降，表明大脑和心脏细胞缺氧损伤后，神经元的表达产物发生异常变化，进而影响了细胞内环境进一步发生的改变。

3. 缺氧训练影响小鼠免疫系统实验后，采用血清免疫学试验探究缺氧训练对小鼠免疫系统的影响，结果表明，缺氧训练对小鼠免疫系统造成了一定程度的负面影响，如分泌免疫球蛋白（IgG）的水平显著下降。

表达谱基因芯片技术及其在动物基因组研究中的应用

业科学，ｕａｏＡｈｉ．ｅ．０６３（０：０６２６，０６ＪｒｌｆｎｕＡＳｉ２０，４１）２６－０７２７ｏｎ
责任编辑曹淑华责任校对曹淑华
表达谱基因芯片技术及其在动物基因组研究中的应用
行大规模的检测，而对这些基因表达的个体特异性、从组织
特异性、发育阶段特异性、分化阶段特异性、病变特异性、刺
激特异性进行综合的分析和判断［２１。
２表达谱基因芯片的原理
表达谱基因芯片最一般的原理与Ｎｒｅｌ一样，ｏｔｍｂｔｈｏ仍然是基于碱基互补的核酸分子杂交。把大量的已知序列的基因探针有序地固定到固相介质上，这样基因芯片阵列中每个点的位置信息实际上就代表了某个特定基因，然后用荧光染料如Ｃ３绿色）Ｃ５红色）ｙ（和ｙ（对样本中总的ｍＮＲＡ进行标记，片进行常规的分子杂交，用特有的荧光波与芯再长扫描芯片，得到每个点在不同波长下的荧光强度值即比值，个比值就反映了样本中靶基因ｍＮ这ＲＡ的比例，并将得到的荧光信号值输入计算机进行信息处理，最终得到这些基因在不同组织中的表达差异的重要信息１３１。３表达谱基因芯片的分类和技术流程３分类．１表达谱基因芯片根据使用探针的种类可以分为２，种即以寡核苷酸为探针的表达谱基因芯片和以ｃＮＤＡ为探针的表达谱基因芯片。它们不仅在杂交前操作程序上不同，而且还存在其他方面的区别（１。表）

1 ChIP-chip

康成生物ChIP-on-chip 技术服务ChIP-on-chip（染色体免疫共沉淀和芯片结合的技术）的出现超越了以往传统的芯片分析方法。

传统的芯片检测方法只能对基因调控做管中窥豹式的研究，然而事实上转录是一个非常复杂的过程，它涉及到多种形式的相互作用以及大量组分间的精妙的互相结合。

ChIP-on-chip是染色体免疫共沉淀与芯片技术的结合，用于分析在活体细胞中调节蛋白与基因组DNA之间的相互作用。

调节蛋白与基因组DNA结合控制着染色体的复制和基因的激活（或抑制），是细胞调控网络的开关。

由于对于整个细胞调控网络我们还有很多是未知的，对这部分的理解和认识将有助于研究人员确认调控这些通路的新的靶基因及新的治疗方法。

ChIP-on-chip研究获得的新信息再结合之前获得的基因表达谱数据，能够大大促进疾病和新药开发领域的研究。

ChIP-on-chip这个新的研究转录调控——包括研究转录的激活和抑制的检测平台主要是通过精确确认调节蛋白与基因组DNA序列的结合位置来实现的。

ChIP-on-chip技术能为一些重要机制的研究提供线索，包括DNA复制、修饰、修复，更重要的还有甲基化以及组蛋白修饰等等；还能帮助我们更好的理解一些疾病的发生机理比如糖尿病、白血病、乳腺癌等。

除此之外，ChIP-on-chip技术也已在一些至关重要的生命过程中为我们提供了重要的线索，包括细胞增殖、细胞分化、癌症发生、细胞周期、细胞凋亡以及神经生成等过程。

●研究基因启动子部位组蛋白的甲基化乙酰化或磷酸化水平改变●研究所以基因启动子部位DNA甲基化水平改变●研究转录因子与其结合的所有基因启动子DNA结合水平改变Agilent ChIP-on-chip 芯片Agilent的ChIP-on-chip （染色体免疫共沉淀和芯片结合的技术）是推动新一代芯片平台的强大技术。

Richard Young 等国际知名学者，利用Agilent的ChIP-on-chip 芯片在Nature、Science、Cell上已发表大量文献。

小鼠数据库总结

小鼠数据库总结小鼠数据库总结随着基因组测序技术的发展和逐渐成熟，研究人员能够深入了解物种的遗传信息以及其与相关疾病之间的关联。

小鼠是生物医学研究中最常用的模式动物之一，其基因组序列与人类相似度较高，具有许多与人类相关的遗传特征。

小鼠数据库是为了便于研究者查询、分享和分析小鼠基因组数据而建立的一个集成化平台。

本文将对目前常用的小鼠数据库进行综述，以便于读者更好地了解和应用这些资源。

1. 小鼠基因组数据库小鼠基因组数据库是整个小鼠数据库的核心，其中包含了小鼠的基因组序列、基因注释信息以及其他相关的遗传数据。

NCBI (National Center for Biotechnology Information)的小鼠基因组数据库（Mouse Genome Database，MGD）是最权威的小鼠基因组数据库之一，提供了丰富的基因组信息、遗传标记、表达谱和突变模型等数据。

另外，Ensembl和UCSC Genome Browser也提供了小鼠基因组数据的浏览和查询功能，研究者可以根据自己的需要选择合适的数据库进行数据检索。

2. 小鼠突变模型数据库小鼠突变模型是研究小鼠基因功能和相关疾病的重要工具。

小鼠突变模型数据库收集和整理了数千种小鼠基因突变模型的信息，为研究者提供了一个方便的平台用于查询和分析这些模型。

例如，International Mouse Phenotyping Consortium (IMPC)的数据库中包含了大量基因敲除或突变的小鼠模型，研究者可以通过该数据库了解和比较不同基因突变模型的表型特征和影响等。

3. 小鼠表达谱数据库小鼠表达谱数据库收集了小鼠不同组织和发育阶段的基因表达信息，供研究者查询和分析。

Gene Expression Omnibus (GEO)和Expression Atlas是两个常用的小鼠表达谱数据库，研究者可以根据自己的研究目的查询特定基因在不同组织或条件下的表达情况，并进行差异分析和功能注释等。

Affymetrix表达谱芯片

Affymetrix表达谱芯片Affymetrix 人表达谱芯片服务芯片名称：Affymetrix GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0 NEW！芯片介绍：Affymetrix 最新开发此款芯片为您提供支持所有转录本异构体的全转录组分析。

同时，针对超过40,000个非编码转录本的探针设计，还可帮助您对非编码RNA进行分析。

数据来源于RefSeq，En sembl，UCSC，MGC，nocode，lncRN db及Broad Institute, Human Body Map lincRNAs and TUCP catalog。

芯片名称：Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array芯片介绍：此款芯片包含了47,000个转录本，代表了38,500个明确的人类基因。

数据库来源于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database(Build 159 January 25 2003)、Washington Universit y EST trace repository、NCBI human genome assembly(Build 31)。

芯片名称：GeneChip Human Gene 2.0 ST Array芯片介绍：Affymetrix 新一代全转录本芯片，一张芯片上可同时检测mRNA和lincRNA，在其上一代1.0 ST Array的基础上内容进一步丰富并更新了数据库。

全面覆盖转录组，可以同时检测>30,000个编码的转录本和>11,000个长链非编码转录本；探针设计最大程度覆盖所有外显子，可检测选择性拼接/转录本变体。

每个转录本覆盖特异探针的数目中值达到21种，每种探针的长度为25bp，这意味着每个转录本将被检测的碱基数中值高达525个，高重复性，高灵敏度。

（完整版）小鼠表达谱芯片及服务

（完整版）小鼠表达谱芯片及服务小鼠表达谱芯片及服务热点推荐芯片名称：Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K HOT！芯片介绍：安捷伦基于G3平台最新设计的小鼠表达谱芯片。

涵盖39,430 条Entrez Gene RNAs 外，及16,251条lincRNA。

除了检测蛋白编码RNA表达量变化，还能检测非编码lincRNA 的表达量变化。

探针设计参照的数据库为：RefSeq Build 37；Ensembl Release 55；Unigene Build 176；GenBank (April 2009)；RIKEN 3。

lincRNA探针是Agilent和John Rinn 实验室（麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所）共同设计的。

Agilent 小鼠表达谱芯片服务芯片名称：Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K NEW！芯片介绍：安捷伦基于G3平台最新设计的小鼠表达谱芯片。

涵盖39,430 条Entrez Gene RNAs 外，及16,251条lincRNA。

除了检测蛋白编码RNA表达量变化，还能检测非编码lincRNA 的表达量变化。

探针设计参照的数据库为：RefSeq Build 37；Ensembl Release 55；Unigene Build 176；GenBank (April 2009)；RIKEN 3。

lincRNA探针是Agilent和John Rinn 实验室（麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所）共同设计的。

芯片推荐：Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray （4×44K）芯片介绍：Agilent小鼠全基因组表达谱芯片，真正代表小鼠基因组中所有已知基因及其产生的转录本，代表了超过41,174 个小鼠基因和转录本。

小鼠大脑基因表达谱

小鼠大脑基因表达谱
小鼠大脑基因表达谱指的是小鼠大脑中各个基因在特定条件下的表达水平。

这样的研究有助于理解小鼠大脑的生物学功能、神经发育、神经系统疾病等方面的机制。

以下是关于小鼠大脑基因表达谱的一些要点：
1.技术手段：为了研究小鼠大脑基因表达谱，科学家通常使用高通量测序技术，如RNA测序（RNA-Seq）。

这可以提供关于大脑中数千个基因的详细信息，包括它们在特定条件下的表达水平。

2.发育阶段和区域差异：小鼠大脑基因表达谱可能在发育的不同阶段以及不同的脑区域表现出差异。

这有助于研究神经元的发育、突触形成以及大脑各个部分的功能特性。

3.神经系统疾病研究：通过比较正常小鼠和患有神经系统疾病的小鼠的基因表达谱，科学家可以识别与疾病相关的基因和通路。

这为神经系统疾病的理解和治疗提供了重要信息。

4.表达调控网络：除了单一基因的表达水平外，研究人员还关注基因之间的相互作用和调控网络。

这有助于揭示基因调控的复杂性，以及在大脑功能中的协同作用。

5.数据共享与分析：研究人员通常将小鼠大脑基因表达谱的数据分享给科学界，以促进更广泛的研究。

同时，对这些大规模数据的分析和解释也是一个重要的领域，需要使用生物信息学和统计学等方法。

小鼠大脑基因表达谱的研究对于理解脑功能、神经疾病的机制以及新药研发等方面都有重要意义。

这类研究不仅有助于深入了解生物学过程，也为未来治疗方案的制定提供了有力支持。

表达谱及甲基化芯片是什么？表达谱及甲基化芯片应用

表达谱及甲基化芯片是什么？表达谱及甲基化芯片应用
一、简介
DNA甲基化是核酸和蛋白质的一种重要修饰方式，通过影响染色质结构，DNA构象，稳定性以及与蛋白质相互作用等方式来调节基因的表达和关闭，与各种细胞功能、胚胎发育、癌症发生、衰老等许多生理性状相关，是表观遗传学的重要研究内容之一。

威斯腾生物能够为您提供个性化甲基化芯片技术服务，您只需提供保存好的组织或细胞样本，威斯腾生物的技术服务团队将会为您提供完整的甲基化检测技术服务，提供完整的实验报告。

二、芯片特点
■ 自定义芯片，满足各种实验需求
对任何已测序基因组，均可定制个性化的甲基化检测芯片，方便快捷。

■ 增加适用性，减少费用
根据您感兴趣的区域，采取适当的探针密度，优化甲基化芯片检测方式。

三、应用领域
■ 表观遗传学研究
在维持正常的细胞功能，染色体结构，X染色体失活等方面起作用。

■ 早期癌症检测
启动子高度甲基化是恶性肿瘤基因转录的常见现象，被视为细胞恶性转化的标记。

■ 胚胎发育研究
在遗传印记，胚胎发育过程中担任的重要作用。

■ iPS和干细胞研究
干细胞分化过程和iPS细胞的甲基化分析和检测。

表达谱基因芯片技术及其在动物基因组研究中的应用

表达谱基因芯片技术及其在动物基因组研究中的应用
顾以韧;李学伟;朱砺;梁艳
【期刊名称】《安徽农业科学》
【年(卷),期】2006(034)010
【摘要】将对表达谱基因芯片的原理、分类、技术流程、优点和在动物基因组研究中的应用以及存在问题作一综述,并对其应用前景进行展望.
【总页数】3页(P2066-2067,2076)
【作者】顾以韧;李学伟;朱砺;梁艳
【作者单位】四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014;四川农业大学动物科技学院,四川,雅安,625014
【正文语种】中文
【中图分类】Q343.1
【相关文献】
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2.表达谱芯片技术在动物胚胎发育研究中的应用进展 [J], 吴伟伟;宫平;哈尼克孜;石晓雷;于丽娟;徐新明;田月珍;田可川
3.抑制消减杂交联合基因芯片技术及其在动物基因差异表达研究中的应用 [J], 姜俊芳;宋雪梅;蒋永清
4.表达谱基因芯片在猪肉基因组研究中的应用 [J], 顾以韧;李学伟;朱砺;李明洲;梁
艳
5.表达谱基因芯片在猪肉基因组研究中的应用 [J], 顾以韧; 李学伟; 朱砺; 李明洲; 梁艳
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【视频讲解】-小鼠表达芯片数据整合分析

【视频讲解】-小鼠表达芯片数据整合分析
本讲涉及到的芯片分别是：
•GSE7762
•GSE62346
•GSE50382
视频里的示例会带领大家使用GEOquery包里面的getGEO函数下载每个表达芯片数据在GEO数据库里面的数据，解析获得表达矩阵及对应的分组信息。

并且对表达矩阵进行简单QC，分析原因。

使用limma来进行表达芯片数据的差异分析，并且创建input文件供GSEA软件使用。

对芯片差异分析结果进行注释基因ID，并绘制火山图，判断具有统计学显著的差异基因列表。

并且对差异基因列表进行下游的GO/KEGG注释！
因为是两年前的视频，所以里面有些代码还比较稚嫩，但是对初学者来说应该是比较容易理解的，现在写的代码都是各种函数包装，导致初学者无法理解和解析。

不过我已经在持续和一位神秘嘉宾沟通这个芯片数据处理课程啦，预计一个月左右会出炉，我的很多数据处理技巧会经由其录制给大家。