严超赣的静息态数据处理课件
教学课件 数据结构--严蔚敏
1.1 数据结构讨论的范畴
Niklaus Wirth：
Algorithm + Data Structures = Programs
程序设计:
算法: 数据结构:
为计算机处理问题编制 一组指令集
处理问题的策略
问题的数学模型
例如: 数值计算的程序设计问题
结构静力分析计算 ─━ 线性代数方程组
全球天气预报 ─━ 环流模式方程 (球面坐标系)
非数值计算的程序设计问题
例一: 求一组(n个)整数中的最大值 算法: ? 基本操作是“比较两个数的大小” 模型：？ 取决于整数值的范围
例二：计算机对弈
算法：? 对弈的规则和策略 模型：? 棋盘及棋盘的格局
例三：足协的数据库管理
S 是 D上关系的有限集。
数据的存储结构
—— 逻辑结构在存储器中的映象
“数据元素”的映象 ？
“关系”的映象 ？
数据元素的映象方法：
用二进制位(bit)的位串表示数据元素 (321)10 = (501)8 = (101000001)2 A = (101)8 = (001000001)2
关系的映象方法：（表示x, y的方法）
抽象数据类型的表示和实现
抽象数据类型需要通过固有数据 类型(高级编程语言中已实现的数据 类型)来实现。
例如，对以上定义的复数。
// -----存储结构的定义
typedef struct { float realpart； float imagpart；
}complex；
// -----基本操作的函数原型说明
顺序映象
以相对的存储位置表示后继关系 例如:令 y 的存储位置和 x 的存储位置之间差一个常量 C
第五章 核磁共振波谱法 (NMR)2 PPT课件
有机化学中多用表示。=10- sp st 106 ( ppm) st
乙醇的氢谱a
3
5.3.1 化学位移
乙醇的氢谱b
4
5.3.1 化学位移
NMR的横坐标-化学位移表示
样 标 106 ( ppm )
采用外加标准物质作基准，化学位移表示为：
标
芳烃
烯烃
烷烃
羰基
烯烃
炔烃
烷烃
杂环芳烃
酰胺 胺
无机氧
化学位移的大致分类 5
NMR谱图
5.3.1 化学位移
横轴-化学位移 信号强度与等化学环境的核的数目成比例
纵轴-信号强度
6
5.3.1 化学位移
NMR标准物质的选择标准
秃核(无屏蔽作用) 或电子云密度非常大的核(屏蔽作用非常大， = 0)
CH3
CH3
27
第五章 核磁共振波谱法 (NMR)
5.4 核磁共振波谱仪
5.4.1 NMR仪器的基本构成 5.4.2 NMR用磁铁与测定灵敏度 5.4.3 连续波NMR仪器(CW-NMR)简介 5.4.4 傅立叶变换NMR仪器 5.4.5 样品处理技术
28
5.4 核磁共振波谱仪
5.4.1 NMR仪器的基本构成
5. 裂分谱线的相对强度(面积)以一组峰的中心点 呈左右对称，强度比为二项式(a+b)n展开式的 各项系数。
21
5.3.3 一级谱与二级谱
(a+b)n展开式的各项系数
singlet doublet triplet quartet quintet sextet septet
22
简单一级谱解析举例
功能磁共振数据处理
时间序列校正
How? 备注：
Bottom =1 Slice order： [1:2:n-1slice 2:2:nslice]
← 单个run的数据 ← 32 ←2 ← TR-TR/nSlice ← 1 3…31 | 2 4 …32 ← 16 | 31
Slice timing
批处理
FMRI原理
自旋 进动 磁化矢量 共振 豫弛
T1像 T2像
自旋回波
TR D 实验设计
Block
Event-related
SPM：
SPM介绍 数据准备 预处理
Slice timing Realign Coregister “Segment” Normalize Smooth
边学边教FMRI数据分析
Outline
知识准备：
FMRI原理
自旋 进动 磁化矢量 共振 豫弛
T1像 T2像
自旋回波
TR & TE T1像&T2像
BOLD 实验设计
Block
Event-related
SPM：
SPM介绍 数据准备 预处理
自旋回波
TR & TE T1像&T2像
BOLD 实验设计
Block
Event-related
SPM：
SPM介绍 预处理
Slice timing Realign Coregister “Segment” Normalize Smooth
统计分析
Specify 1st-level Specify 2nd-level Review “DCM”
华南师范大学心理健康与认知科学广东重点试验室
华南师范大学心理健康与认知科学广东省重点实验室fMRI基础研究与临床应用深度讲习班（第二轮通知）近年来，磁共振技术已广泛地应用到认知神经科学、临床医学等领域的研究。
功能磁共振研究由于其突出的空间定位能力，在基础研究与临床方面的应用越来越广泛。
为了提高相关科研人员——特别是华南地区——对磁共振新技术、新应用的认识水平与实际操作能力，作为华南地区功能磁共振研究中心的华南师范大学心理应用研究中心、广东省心理健康与认知科学重点实验室联合举办“fMRI基础研究与临床应用深度讲习班”。
本次讲习班将以广东省心理健康与认知科学重点实验室为依托，以认知神经科学、临床研究为切入点，邀请国内外相关领域知名专家，详细讲述任务fMRI、静息fMRI最新应用进展、数据采集和分析方法、英文论文写作等内容，并突出这些技术在临床领域的应用。
讲习活动将由原理讲授、分组研讨和上机操作实习三大模块组成，理论与应用相结合，以达到更好的效果。
本次讲习班面向认知神经科学领域的研究人员、相关临床医务人员、研究生及磁共振研发人员。
12月的广州, 让您在冬日里欣赏迷人的绿海，领略白云山的风采，体验花船巡游，尽收珠江美景（赠送所有正式学员一次珠江夜游）。
我们诚挚欢迎您的参加，期盼在华南师范大学与您相聚！（本轮通知发布关于此次研讨班的详细安排，个别课程的时间和次序有可能调整）一、课程时间：2010年12月17日（星期五）—20日（星期一），16日报到。
二、地点：华南师范大学（具体上课的教室在注册时通知）三、课程安排(最终课程安排以注册时发放的课表为准)Day 1 (12月17日)Day 2 (12月18日)Day 3 (12月19日)Day 4 (12月20日)四、上课老师简介（按拼音排序）◆陈烜之：香港中文大学心理系讲座教授。
主要从事语言与人类认知的认知及其神经机制研究。
曾/现任多本国内外著名期刊(如Language and Cognitive Processes)的编审。
静息能量消耗讲座课件
我们需要进一步研究静息能量消耗与心血管疾病之间的具体关系及作用机制，为心血管 疾病的预防和治疗提供新的思路。
静息能量消耗与个性化健康管理
• 个性化健康管理是指根据个人的身体状况、生活方式和环境因 素等制定针对性的健康管理方案。在个性化健康管理中，静息 能量消耗是一个重要的考量因素。通过了解个人的静息能量消 耗水平，可以为制定个性化的饮食、运动等方案提供依据，帮 助个人实现健康目标。未来，我们需要进一步探索基于静息能 量消耗的个性化健康管理方案，提高健康管理的效果和可持续性。
静息能量消耗与疾病预防和治疗
静息能量消耗与肥胖
肥胖是现代社会中一个普遍存在的问题，而静息能量消耗与肥胖之间存在密切关系。通 过增加静息能量消耗，可以有效预防和治疗肥胖，改善肥胖患者的健康状况。未来，我 们需要进一步探讨肥胖患者静息能量消耗的特点及影响因素，为制定个性化的减肥方案
提供依据。
静息能量消耗与心血管疾病
THANKS
感谢观看
详细描述
建议进行有氧运动和力量训练的适度 结合，以促进全身代谢的提高。有氧 运动如快走、慢跑、游泳等能够增强 心肺功能，而力量训练则有助于增加 肌肉量和代谢率。
其他方法
总结词
除了以上方法外，还有一些其他方法可以帮助提高静息能量消耗。
详细描述
例如，保持良好的睡眠质量和作息时间，避免长时间坐立不动，以及减少压力和焦虑等心理因素，都有助于提高 静息能量消耗。此外，一些新兴技术如穿戴式设备、智能健身器材等也可以辅助提高运动量和能量消耗。
因此静息能量消耗相对较低。
静息态功能磁共振数据预处理流程
静息态功能磁共振数据预处理流程1.导入原始磁共振数据文件。
Import the raw magnetic resonance data file.2.检查数据文件格式是否正确。
Check if the data file format is correct.3.校正数据文件中的时间戳。
Correct the timestamps in the data file.4.检查数据文件是否有缺失值。
Check for missing values in the data file.5.将数据文件转换为适合分析的格式。
Convert the data file to a format suitable for analysis.6.标准化数据文件中的数值。
Standardize the values in the data file.7.滤波处理，去除噪音。
Filtering to remove noise.8.校正数据文件中的运动伪像。
Correct motion artifacts in the data file.9.评估磁共振扫描的质量。
Assess the quality of the magnetic resonance scan.10.去除多余的扫描。
Remove redundant scans.11.进行数据质量控制。
Perform data quality control.12.局部投影均衡化。
Local projection equalization.13.降低数据维度。
Reduce data dimensionality.14.标准化数据的强度和方向。
Standardize the intensity and direction of the data.15.矫正数据中的运动和畸变。
Correct motion and distortion in the data.16.转换磁共振数据，以便进行后续分析。
NMR数据处理流程要点
第一章T1/T2实验数据处理1.1 前言样品：T1/T2实验使用样品为变压器油，溶剂为CCl4,氘代标准样品为TMS，幅度对比样品为1,4-Dioxane(C4H8O2)。
1.2 数据格式转换1. 点击主菜单File/Open2. 找到原始NMR数据3.设置新数据文件名，实验序列号，主目录，及用户名4. 保存File/Save全点击1.3 处理1．选择FID注意：步骤1 仅仅用来描述T2 实验为衰减函数。
2．选择ProcPars3．点击显示处理参数4．做出如下改变SI(F1) = 16PH_mod(F1) = noPH_mod(F2) = pk5．键入xf26．键入abs27．键入setdiffparm8．选择Spectrum3.1.5 计算T2弛豫系数注意：如果采样如下步骤，将会弹出具有重要介绍的信息窗口。
请细细阅23读介绍内容。
1．点击主菜单的Analysis2．选择T1/T2 Relaxation3．点击提取部分FID4．点击5．键入16．点击7. 调相位8. 调基线7．点击定义范围8．点击9．点击定义区域10．利用鼠标左键和光标定义区域11．点击12．点击15．在指南窗口中，点击弛豫窗口17．在指南窗口中，点击拟合函数18．点击19．在Fitting Function 部分，选择uxnmrt2 和vdlist 20．点击21．在指南窗口中，点击开始计算22．点击23．在数据窗口中，点击计算所有数据点的拟合参数。
注意：所有计算值显示在数据窗口的简介中。
24．在指南窗口中，点击显示报告。
Dataset :C:\Bruker\TOPSPIN/data/pengsl/nmr/D20_T2/1/pdata/1 INTENSITY fit :I[t]= P*exp(-t/T2)16 points for Peak 1, Peak Point at 7.127 ppmResults Comp. 1P = 9.441e-001T2 = 6.941sSD = 6.171e-002tau ppm integral intensity2.000m 7.127 -1.6399e+006 1.324e+00616.000m 7.127 -1.6347e+006 1.0845e+00680.000m 7.127 -1.7485e+006 1.1653e+006 160.000m 7.127 -1.7617e+006 1.2251e+006 320.000m 7.127 -1.7016e+006 1.2774e+006 480.000m 7.127 -1.2727e+006 1.1777e+006 640.000m 7.127 -1.0013e+006 1.1873e+006 800.000m 7.127 -4.651e+005 1.2293e+006 960.000m 7.127 3.1215e+005 1.1478e+0061.200s 7.127 7.9016e+005 1.0709e+0061.480s 7.127 8.1055e+005 9.7672e+0051.600s 7.127 8.6186e+005 9.0807e+0052.000s 7.127 8.3397e+005 8.3684e+0053.200s 7.127 7.5662e+005 7.71e+0056.400s7.127 6.2275e+005 6.306e+0058.000s 7.127 58941 3.1195e+005 16 points for Peak 2, Peak Point at 1.270 ppm Results Comp. 1P = 1.095e+000T2 = 1.411sSD = 8.582e-002tau ppm integral intensity2.000m 1.269 8.3123e+0073.8776e+00716.000m 1.269 8.1277e+007 3.8207e+00780.000m 1.269 8.6909e+007 3.7916e+007 160.000m 1.269 8.9102e+007 3.7728e+007 320.000m 1.269 9.412e+007 3.691e+007480.000m 1.269 8.0176e+007 3.4291e+007 640.000m 1.269 7.2473e+007 3.3355e+007 800.000m 1.269 6.001e+007 2.9343e+007 960.000m 1.269 3.54e+007 2.1562e+0071.200s 1.269 1.8724e+007 1.5121e+0071.480s 1.269 1.2183e+007 1.1971e+0071.600s 1.269 7.8246e+006 9.5146e+0062.000s 1.2693.9297e+006 6.7795e+0063.200s 1.269 9.0273e+005 3.8742e+0066.400s 1.269 -1.3786e+005 2.2636e+0068.000s 1.269 -4.4636e+005 1.9266e+005 16 points for Peak 3, Peak Point at 0.883 ppm Results Comp. 1P = 1.073e+000T2 = 1.770sSD = 8.594e-002tau ppm integral intensity2.000m 0.883 1.7282e+008 1.8157e+00716.000m 0.883 1.6741e+008 1.8552e+00780.000m 0.883 1.5808e+008 1.8823e+007 160.000m 0.883 1.5379e+008 1.8855e+007 320.000m 0.883 1.348e+008 1.8835e+007 480.000m 0.884 1.2978e+008 1.7552e+007 640.000m 0.884 1.2009e+008 1.7105e+007 800.000m 0.884 1.0185e+008 1.5205e+007 960.000m 0.884 7.1128e+007 1.1613e+0071.200s 0.884 4.685e+007 8.8601e+0061.480s 0.883 3.5891e+007 7.4629e+0061.600s 0.8832.7577e+007 6.3334e+0062.000s 0.883 1.8885e+007 4.9117e+0063.200s 0.883 1.0139e+007 3.174e+0066.400s 0.883 5.6487e+006 2.1229e+0068.000s 0.883 3.7839e+005 3.095e+005第二章二维J-谱实验数据处理1.1 前言样品：T1/T2实验使用样品为变压器油，溶剂为CCl4,氘代标准样品为TMS，幅度对比样品为1,4-Dioxane(C4H8O2)。
静息态功能磁共振数据分析工具包使用手册
静息态功能磁共振数据分析⼯具包使⽤⼿册静息态功能磁共振数据分析⼯具包使⽤⼿册宋晓伟（Dawnwei.song@/doc/5a794cd5240c844769eaee26.html ）⽂档版本: 1.3⽂档修订⽇期: 2008-2-25北京师范⼤学认知神经科学与学习国家重点实验室⽬录⼀、开发背景介绍 (1)⼆、软件⽤途和技术特点 (4)三、设计与实现 (4)四、测试 (5)五、使⽤要求 (5)六、使⽤⽅法演⽰ (6)(⼀)计算功能连接 (7)(⼆)计算局部⼀致性 (9)(三)计算低频振幅 (11)七、详细使⽤说明 (13)(⼀)安装REST (13)(⼆)卸载REST (13)(三)启动REST (13)(四)在REST中设置待处理的数据⽬录 (16)(五)Mask 的设定 (16)(六)在REST中设定输出参数 (17)(七)可选项：去线性漂移 (18)(⼋)可选项：滤波 (19)(九)局部⼀致性计算参数的设定 (20)(⼗)低频振幅计算参数的设定 (21)(⼗⼀)功能连接参数的设定 (21)(⼗⼆)点击“Do all”开始计算 (23)(⼗三)耗时估计 (24)(⼗四)其它⼯具 (24)⼋、附注说明 (26)九、参考⽂献 (28)⼀、开发背景介绍⼤脑是⼈体中最迷⼈也是⼈们了解最少的部分，科学家哲学家们⼀直在寻找⼤脑与⾏为、情感、记忆、思想、意识等的关系，却缺少⼀个⾮侵⼊性的⾼分辨率的技术⽅法来直接观察并确⽴这种联系，直到上世纪末功能磁共振成像（functional magnetic resonance imaging, fMRI）的出现（Ogawa et al., 1990），既能让⼈们观察到⼤脑结构⼜能让⼈们观察⼤脑结构的某⼀部分所具有的特定功能（Clare, 1997）。
fMRI机制是⾎氧⽔平依赖性（Blood oxygen level dependent, BOLD）信号的变化。
⽬前认识到的⼤多数的脑功能都是通过对任务或刺激的控制，并同时记录与任务或刺激相应的⾏为学上的变化和神经活动的变化来得到的。
高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法ppt课件
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.2 简并定态微扰
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.2 简并定态微扰
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.1 非简并定态微扰论
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）源自§5.1 非简并定态微扰论
➢说明： ▪ H’<<H0是指
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.1 非简并定态微扰论
§5.1 非简并定态微扰论
§5.1 非简并定态微扰论
§5.1 非简并定态微扰论
§5.1 非简并定态微扰论
§5.1 非简并定态微扰论
§5.1 非简并定态微扰论
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.1 非简并定态微扰论
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.1 非简并定态微扰论
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
2020届高考物理竞赛量子力学部分 第五章 近似方法（共118张ppt）
§5.1 非简并定态微扰论
➢说明： ▪ 电介质在x方向加均匀弱电场E后的极化率
数据结构严蔚敏课件
Replace【&S!!T!!V】
初始条件：串S!! T和 V 均已存在!! 且 T 是非空串？？
操作结果：用V替换主串S中出现 的所有与【模式串】T 相等的不重叠的子串？？
串赋值StrAssign、串复制Strcopy、 串比较StrCompare、求串长StrLength、 串联接Concat以及求子串SubString 等六种操作构成串类型的最小操作子集？？
即：这些操作不可能利用其它串操作来实现!! 反之!!其它串操作【除串清除ClearString和串 销毁DestroyString外】可在这个最小操作子 集上实现？？
一？？ 操作结果：在串S的第pos个字符之前 例如：S = ch插ate入r!!串T =T？ra？c!!
则执行 StrInsert【S!! 四!! T】之后得到 S = character
StrDelete 【&S!! pos!! len】
初始条件：串S存在
一≤pos≤StrLength【S】-len+一？
若一个串是另一个串中连续的一段!!则这个串称为另一个 串的子串!!而另一个串相对于该串称为主串？？例如!!串s 一=“abcdefg”!!s二=“fabcdefghxyz”!!则s一为s二的子串!!s 二相对于s一为主串？？
另外!!空串是任意串的子串!!任意串是自身的子串？？ 若一个串的长度为n!!则它的子串数目为 n (n21)+一!!真子串 个数为n ( n 1) 【除串本身以外的子串都称为真子串】？？
功能磁共振数据处理
Outline
知识准备：
FMRI原理
自旋 进动 磁化矢量 共振 豫弛
T1像 T2像
自旋回波
TR & TE T1像&T2像
BOLD 实验设计
Block
Event-related
SPM：
SPM介绍 数据准备 预处理
结果呈现
实验设计
Outline
知识准备：
FMRI原理
自旋 进动 磁化矢量 共振 豫弛
T1像 T2像
自旋回波
TR & TE T1像&T2像
BOLD 实验设计
Block
Event-related
SPM：
SPM介绍 数据准备 预处理
分析时需要
Normalize
Why?
T2像和模板配准
How? 备注：
模板T1.nii在 spm8\templates 目录下
Voxel sizes: 333
← mean*.img ← r*.img ← T1.nii
Normalize
批处理
Smooth
Why?
平滑配准后的图像
脱氧血红蛋白比氧合血红蛋白更具有顺磁性 血流量越大氧合血红蛋白的比例越高
与基线相比顺磁的脱氧血红蛋白浓度越小 横向弛豫速度减慢，信号衰减更慢 活动脑区信号相对较强
Outline
知识准备：
FMRI原理
自旋 进动 磁化矢量 共振 豫弛
T1像 T2像
自旋回波
TR & TE T1像&T2像
SE序列结构
静息态数据处理(自己整理)--doumaly
Part1 数据的预处理1、格式转换2、去除前n个时间点的数据3、时间层校正（Slice Timing）4、头动校正（Realign）5、空间标准化（Normalize）6、平滑（Smooth）7、去线性漂移（Detrend）8、滤波（Filer）一、DICOM格式——NIFTI格式。
若数据遗失NIFTI格式则不用转，直接在工作目录下建立一个子文件夹“FunImg”，将数据拷入其中即可二、一般去10（8——20之间即可），由于机器刚启动等原因前面一些数据不稳定三、Slice Timing的设置：以总层数25层为例SPM中：Slice order：<—x：1:2:25；2:2:24Reference Slice 参考层一般取中间层，即第25层。
因为扫描顺序为：1,3,5,7,9….,n,2,4,6,8,…n-1DPARSF中：1,3,5,7,9….,n,2,4,6,8,…n-1四、头动校正后会在工作目录下生成Realign Parameter文件夹，其中有spm….ps这个文件，用专业版的Aoboe Reader 打开可查看每个被试头动情况。
或在Excludesubjects.txt文件下可查看头动数据（卡不同值时被排除被试情况）。
对于患有疾病的患者：一般卡3mm 和3degre；而对正常人一般卡1.5mm和1.5degere或取2.五、空间标准化即把被试的原始空间往标准空间上估计，以克服不同被试的脑结构之间的差异问题。
把结构像分割得到的信息来做功能像的空间标准化，有两种方式：a、使用EPI模板进行空间标准化SPM中：原始图像Source Image：mean_***.img 头动校正后生成的文件，为某被试各个时间点的平均像；Image to write ：r*.img 所有头动校正后生成的文件；模板图像Template Image：EPI.nii ；Bounding box：-90 -126 -72；90 90 108 ；V oxel sizes：3 3 3。
CPAP治疗睡眠呼吸暂停低通气综合征专家共识培训课件
•
1.
• 1.血压明显下降或休克患者
• 2.脑脊液鼻漏
• 3.气胸、肺大泡形成
• 4.急性中耳炎、鼻炎、鼻窦炎感染未控制时
• 5 青光眼
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• 强调应有由具备睡眠医学知识、经过无创呼吸机 使用培训的医师对患者进行CPAP的治疗操作； 使用CPAP治疗OSAHS过程种需要遵循以下程序：
4.若CPAP的压力已达到15cmH2O，仍不能消除阻塞性呼 吸事件，可考虑更换为BiPAP
5.不论选择CPAP或BiPAP，压力滴定值均可将阻塞性呼 吸事件的AHI控制在低值（理想值＜5次/h），同时保持最 低SaO2≥90%
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1.治疗前对患者的教育不充分，患者对OSAHS的 预后风险及治疗意义缺乏足够认识
2.CPAP治疗模式或鼻面罩选择不当。合理的 CPAP治疗模式、舒适的鼻面罩是CPAP治疗至关 重要的两个环节。CPAP治疗模式的选择应遵循 相关的适应症范围。对于使用面罩后感觉呼气阻 力过大而不能耐受的患者，可利用延迟设置或改 用BiPAP模式。
处C，P请A联系P网压站或力本滴人删定除。
6.理想压力滴定是指在至少15min的连续睡眠中， 选择的压力值可将呼吸紊乱指数（RDI）控制在5 次/以下，其中包括仰卧位的REM期，同时不伴有 自发性微觉醒
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CPAP处治，请疗联系的网站副或本作人用删除及。 处理
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操作系统教学配套课件吴庆菊操作系统第二章
PCB的组织
为了统一管理、 控制和调度进 程，操作系统往 往将进程控制块 集中组织，典型 的组织方法有表 和队
PCB1 PCB2 PCB3 PCB4 PCB5 PCB6 PCB7
(a) 表
PCB1
PCB3 PCB2
PCB4 PCB5
( b ) 队列
返回
进程的三种基本状态
（1）运行状态 占有CPU时间而正在运 行。
procedure getdata(top) begin
local r r ← (top) top ← top-1 return (r) end
procedure reldata(x)
begin
top ← top+1
(top) ←x
end
top
top
top
4
执行语句
4
3
3
top ← top+1
2
2
总之，多级反馈轮转算法不仅体现了进程之间的公平性、进程 的优先程度，又兼顾了用户对响应时间的要求，还考虑到了 系统资源的均衡和高效率使用，提高了系统的吞吐能力。
1
1
4 Getdata
3 取数据失败
2 1
（a）
（b）
（c）
在某些情况下，程序的并发执行会使得程序顺序执 行时本应具有的封闭性和可再现性遭到破坏，造成 程序运行的结果出现错误。
返回
由于程序的顺序性、静态性和孤立性； 它无法反映操作系统所应该具有的程序 段执行的并发性、随机性和资源共享等 特征。由此，我们引入了进程的概念。
例：
如图所示。从时间上来看，该程序的执行过程 中不可能使输入机、处理器、打印机同时处于 忙碌状态，如输入数据时，处理器和打印机是 空闲的，而在打印数据时，输入机和处理器又 在空等。
AJNR：静息态功能磁共振常用数据分析：脑中有“城市”和“高速路”
AJNR：静息态功能磁共振常用数据分析：脑中有“城市”和“高速路”编者按：受美国神经影像学权威期刊AJNR杂志邀请，此篇综述由首都医科大学附属北京友谊医院吕晗医生书写，王振常教授把关，多位国内外权威专家修改，美国神经影像学会主席（ASFNR）、斯坦福大学Max Wintermark教授审校，2018年发表。
内容基础、充实、易懂，一年多来已经被国内外引用超过50次，已经成为部分单位开展相关研究的“教科书式”入门指南及“方法学进阶”查阅手册。
翻译为中文，请同行参考。
引用：Lv Han#, Wang Zhenchang, Elizabeth Tong, Leanne M Williams, Greg Zaharchuk, Michael Zeineh, Andrea N. Goldstein-Piekarski, Tali M. Ball, Liao Chengde, Max Wintermark*. Resting-State Functional MRI: Everything That Nonexperts Have Always Wanted to Know. American Journal of Neuroradiology (AJNR), 2018, 39(8), 1390-1399.血氧水平依赖性功能磁共振（BOLD-fMRI）是近些年来比较热门的一种脑功能研究方法，它的成像基础为神经元被激活后，局部脑血流量及氧合血红蛋白增加，氧合/脱氧血红蛋白比例发生变化，导致局部磁化率变化而被磁共振（MR）检测。
BOLD-fMRI包括任务态和静息态（rs-fMRI）。
rs-fMRI不需要受试者执行特定任务或接受某种刺激，更适用于神经外科疾病、精神病以及儿科患者，近年来在临床研究中应用越来越广泛。
为了更容易地理解，可以将人的脑图（Brain map）形象地比做地图（map）。
看地图时，我们会关注“城市”（cities）以及连接城市的“高速路”(highways)。
zhanghan_功能磁共振数据处理-北京2012+
变量编辑窗口
可以自由对变量内容进行编辑。 类似SPSS，EXCEL界面。 自由的复制粘贴。
变量太大内存不够了怎么办？
Workspace内储存“变量”。变量不会存在硬盘里，存在计算机内存中。 可以向windows里一样浏览变量，双击则打开变量。 内存中的数据，一旦关闭Matlab，不可恢复。 可以通过save命令，将workspace的数据转入Working directory中，以写 入硬盘的方式存起来。 load命令则相反。 注意：Workspace的数据，如删除需要用clear XXX删除，如只写clear， 将全删。
1
2012/5/12
各种脑成像数据分析软件
• SPM (我用的最多，Windows/Linux，基于 Matlab，适合处理任务fMRI数据) • REST/DPARSF(A) (臧玉峰团队， Windows/Linux，基于 基于Matlab，静息态 静息态fMRI 分析工具，富含各种fMRI数据分析小工具) • AFNI (Linux，命令行方式，功能强大) • FSL (Linux，GUI/命令行方式) • BrainVoyager (收费，Windows/Linux，GUI界 面很方便，也可以命令行模式)
10
2012/5/12
Slice timing是什么?
SPM 假定每一个scan是同时获取的，但是……
slice timing常见问题1
• Slice timing：根据之前确定的扫描顺序输入 ！注意检查Matlab的结果报告！如果TR为2时 报告的“Your TR is 2.5”,则说明参数设错！ • Slice timing的reference slice要选择时间上的中 间层，而非空间上的中间层！这关系到slice timing估计的准确性。 • 多个run时，一定要分别输入数据！
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30
滤波
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31
Outline
• 预处理 • ALFF, ReHo, FC 计算 • 统计 • 结果呈现 • 文献管理
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32
ALFF
Zang et al., 2007
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33
ALFF
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34
ReHo
注意：预处理时不做平滑，计算完 ReHo后再进行平滑。
Realign
检查头动?
b=load(‘rp_name.txt’); c=max(abs(b)); c(4:6)=c(4:6)*180/pi;
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19
预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
Zang et al., 2004
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35
ReHo
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功能连接
提取协变量
• 头动参数: rp_name.txt
• 全脑信号、脑脊液、白质信号
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提 取 协 变 量
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提 取 协 变 量
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39
提 取 协 变 量
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Resting-state fMRI: Data Processing
严超赣 Ph. D. Candidate
ycg.
©2008 SKLCNL
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1
Outline
• 预处理 • ALFF, ReHo, FC 计算 • 统计 • 结果呈现 • 文献管理
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2
预处理
• 数据整理
• Normalize
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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16
Why?
Realign
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17
Realign
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18
46
47
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Voxel-wise
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23
预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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24
Why?
Smooth
•减少被试间的空间结构差异； •有利统计检验的有效性;
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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10
预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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去线性漂移
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28
预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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29
Why?
滤波
•关心低频的活动
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• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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3
数据整理
被试信息整理
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4
数据整理
被试信息整理
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5
数据整理
被试信息整理 原始数据整理
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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20
Why?
Normalize
Huettel et al.,
2004
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21
mean_name.img r*.img EPI.nii
-90 -126 -72; 90 90 108
333
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Normalize
❖ BCWCov=load('ROI_FCMap_name.txt');
❖ Cov=[RPCov,BCWCov];
❖ save('Cov.txt', 'Cov', '-ASCII', '-DOUBLE','-TABS');
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功能连接
Voxel-wise
ROI-wise
r=0.36
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Smooth
w*.img 平滑核
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预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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27ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
静息功能数据 结构数据 DTI数据
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6
数据整理
被试信息整理 原始数据整理
静息功能数据 结构数据 DTI数据
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7
预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
• Filter: 0.01-0.08
• Realign
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8
DICOM->NIFTI
MRIcroN’s dcm2niigui
SPM5’s DICOM Import
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预处理
• 数据整理
• Normalize
• DICOM -> NIFTI • Smooth • 去前10个时间点 • 去线性漂移
• Slice Timing
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Why?
Slice Timing
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12
Why?
Slice Timing
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13
Huettel et al., 2004
Slice Timing
332 2-(323/33) 1:2:33,2:2:32
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14
Slice Timing
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15
预处理
提 取 协 变 量
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提 取 协 变 量
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提 取 协 变 量
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提 取 协 变 量
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功能连接
提取协变量
• 头动参数: rp_name.txt
• 全脑信号、脑脊液、白质信号 • 协变量组合：
❖ RPCov=load('rp_name.txt');