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临床标本的细菌学检查-精品文档

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法尿 和液 操标 作本 流细 程菌
检 验 方
Uricult 操作步骤
Uricult 菌落比密图
临床标本的细菌学检查
第一节 血液及骨髓标本
一 血液标本
血液标本的细菌培养是诊断菌血症或败血 症的基本方法。
如从患者血液中检出细菌,一般应视为病 原菌。
常见的病原菌主要有金黄色或表皮葡萄球 菌、链球菌(A、B群、肺炎链球菌等)、 肠球菌、产单核细胞李斯特菌、脑膜炎奈 瑟菌、伤寒及副伤寒沙门菌和厌氧菌等。
(2)结核分枝杆菌涂片检查 (3)新生隐球菌涂片检查 2. 分离培养 3. 报告方式 培养48小时,仍无菌生长者报告“培养 2天无细菌生长”。查见细菌报告细菌,报告菌名和 药敏结果。
第三节 呼吸系统标本
下呼吸道的痰液是无细菌的,而经口腔咳出的痰 带有多种上呼吸道的正常寄生菌(如草绿色链球 菌)。若从患者痰标本中查见致病菌或条件致病 菌,提示有上呼吸道感染。
脑脊液无论涂片或培养必须于 采集后立即送检不宜将其置于 冰箱保存,否则影响检出率。
法脑 和脊 操液 作标 流本 程细 图菌
学 检 验 方
(二)检验方法和操作流程
1. 涂片检查 (1) 一般细菌涂片检查: 例如:革兰阴性、凹面相对的球菌,可能是脑膜
炎奈瑟菌;链状排列的革兰阳性球菌;长丝状等多形 态性的革兰阴性杆菌,可能是流感嗜血杆菌。
验呼 方吸 法系 和统 操标 作本 流细 程菌
学 检
(二)检验方法和操作流程
1. 肉眼观察
2. 涂片检查 其一依据100×镜下观察白细胞和
上皮细胞数目多少来评定(如表);其二是初步判 定是否有病原存在。
痰标本镜下分类
分级 A B C
白细胞(个) >25 >25 <10

芽孢杆菌_精品文档

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芽孢杆菌芽孢杆菌是一种常见的细菌,被广泛应用于环境科学、医学、农业和食品工业等领域。

本文将对芽孢杆菌的基本特征、分类、生物学特性以及其在不同领域的应用进行详细介绍。

一、芽孢杆菌的基本特征芽孢杆菌(Bacillus),是一类芽孢形成的革兰氏阳性细菌。

其细胞形态为直杆状,不产生芽孢时呈链状分布。

在产生芽孢时会形成芽孢杆,芽孢杆中包含生命活动所需的营养物质,能够在极端条件下存活很长时间。

芽孢杆菌是非常耐久的细菌,可以在干燥、高温、低温、强光等恶劣环境中存活,并且可以通过气溶胶和尘土传播。

二、芽孢杆菌的分类芽孢杆菌属下包含着众多种类的细菌,根据形态、生理特性以及基因序列的差异进行了分类。

常见的包括枯草杆菌(Bacillus subtilis)、解脂芽孢杆菌(Bacillus cereus)等。

三、芽孢杆菌的生物学特性1. 生长条件:芽孢杆菌可以在各种环境中生长繁殖,包括土壤、水体、空气中以及植物、动物体内等。

它们能够利用多种碳源和氮源进行代谢。

2. 营养需求:芽孢杆菌对营养物质的需求较耐受,能够利用很多有机物质进食,例如蛋白质、糖类和脂类等。

此外,它们还具有耐受酸碱度的能力。

3. 代谢产物:芽孢杆菌产生许多有益的代谢产物,如溶解酶、抗生素、对害虫有毒的物质等。

其中溶解酶可以分解一些有机物质,促进植物生长。

四、芽孢杆菌在环境科学中的应用1. 土壤改良:芽孢杆菌能够分解有机物质,改善土壤结构,提高土壤肥力。

因此,使用芽孢杆菌来改良农田土壤、废弃土地等可以增加作物产量,提高土壤质量。

2. 污水处理:芽孢杆菌广泛应用于污水处理中。

它们可以分解有机废物、去除废水中的污染物质,使得废水能够得到有效处理,达到排放标准。

3. 生物农药:一些芽孢杆菌产生的抗生素对一些害虫有毒作用,可以用作生物农药,在农业中控制害虫的繁殖,减少化学农药的使用。

五、芽孢杆菌在医学领域的应用1. 抗菌药物:一些芽孢杆菌产生的抗生素具有抗菌作用,可以用于治疗一些细菌感染疾病。

第九章_细菌类疫苗

第九章_细菌类疫苗
效的灭活剂,我国多用甲醛,终浓度不超过1%。 杀菌检查:取样接种于不含琼脂的硫乙醇酸盐培养基、琼脂斜面及碱性
琼脂斜面各一支,37℃培养5 d,应无本菌生长。
表 几种灭活菌苗(jūn miáo)的灭活方法
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5 浓缩
为提高某些灭活菌苗的免疫力,在培养过程中采取提高菌数的基础上,再 通过浓缩方法达到(dá dào)目的。
定浓度 镜检:涂片染色,至少观察10个视野,应菌型典型,
无杂菌 凝集试验:血清型定型凝集试验,应呈阳性反应 无菌试验: 需氧菌、厌氧菌及真菌试验应阴性 免疫力试验: 原液保存:(2-8℃,3-4年有效)
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7.配苗及分装 由于灭活菌苗所用的佐剂不同,所以配苗方法也不相同。
氢氧化铝菌苗:可在加入甲醛灭活的同时(tóngshí),按比 例加入氢氧化铝胶配制;也可在菌液经甲醛灭活后再按 比例加入氢氧化铝胶配苗。 有的厂油佐剂菌苗的配制程序为:于灭菌的油乳剂135 m1 10号白油、 11.4m1 Span-85、3.6 ml Tween80混合液中,在边搅拌下加入等量甲醛灭活菌液 配制。
①菌株 我国现用两个菌株生产疫苗: 国际通用Ty2株 国内代表株 ②培养基及培养方法 采用马丁琼脂、肉汤琼脂或其他经批准的培养 基,主要(zhǔyào)采用固体培养法,也可进行
发酵生产 接种后35~37℃培养18~24h。
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③成品检定 鉴别试验、外观、化学检定、无菌试验、异常 毒性试验、菌形及纯度检查(jiǎnchá) ④疫苗规格及有效期 每安瓿瓶5ml,每人用剂量含伤寒菌6×107~ 3×108,2~8℃避光保存和运输,有效ún)的细 菌性疫苗
卡介苗 百日咳疫苗 脑膜炎球菌疫苗 伤寒疫苗 精制破伤风疫苗(类毒素) 霍乱弧菌疫苗 痢疾(lìji)疫苗 用法:i.d., s.c., d.s., i.m., p.o.

常见细菌_范文

常见细菌_范文

03
免疫治疗:使用免疫调节药物,如干扰素、白细胞介素等
04
物理治疗:使用物理方法,如紫外线、红外线等
05
手术治疗:对于严重感染,可能需要进行手术治疗
疫苗开发
谢谢
常见细菌
演讲人
目录
01.
细菌分类
02.
细菌特性
03.
细菌与人类
04.
细菌的防治
细菌分类
细菌种类
球菌:球形,如肺炎球菌、葡萄球菌等
01
螺旋菌:螺旋状,如幽门螺杆菌、霍乱弧菌等
03
杆菌:杆状,如大肠杆菌、沙门氏菌等
02
放线菌:丝状,如链霉菌、诺卡菌等
04
支原体:无细胞壁,如肺炎支原体、生殖支原体等 Nhomakorabea03
耐药性:细菌对某些抗生素产生耐药性,导致治疗困难
04
预防措施:保持个人卫生,避免接触感染源,接种疫苗等
细菌与环境
细菌在环境中的分布:土壤、水体、空气等
01
细菌对环境的影响:分解有机物、促进物质循环、维持生态平衡
02
环境对细菌的影响:温度、湿度、pH值等
03
细菌与人类的关系:有益菌、有害菌、共生菌等
04
细菌的防治
预防措施
1
保持个人卫生:勤洗手、洗澡、换洗衣物
2
保持环境清洁:定期打扫、消毒、通风
3
避免接触感染源:避免接触病患、污染环境
4
增强免疫力:保持良好的生活习惯,如饮食均衡、运动锻炼、充足睡眠等
治疗方法
01
抗生素治疗:使用抗生素药物,如青霉素、头孢菌素等
02
抗病毒治疗:使用抗病毒药物,如阿昔洛韦、利巴韦林等
细菌与人体健康

硝化菌_精品文档

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硝化菌硝化菌是一类在自然环境中广泛存在的微生物,它们具有重要的生态功能和应用潜力。

硝化菌主要参与氮循环中的硝化过程,将氨氮转化为亚硝酸盐和硝酸盐,从而使得氮的形态发生变化。

本文将从硝化菌的分类、生理特性、环境影响以及应用领域等方面进行探讨,以加深对硝化菌的了解。

首先,我们来了解一下硝化菌的分类。

硝化菌属于细菌界,可以分为两个主要类型:氨氧化菌(Ammonia-oxidizing bacteria,AOB)和亚硝酸盐氧化菌(Nitrite-oxidizing bacteria,NOB)。

氨氧化菌主要包括亚硝化细菌属(Nitrosomonas)、亚硝化假单胞菌属(Nitrosospira)和亚硝化硝化螺旋菌属(Nitrosolobus),而亚硝酸盐氧化菌则包括亚硝化细菌属(Nitrobacter)和亚硝酸盐氧化亚线虫属(Nitrospira)。

这些硝化菌根据其不同的生理特性和生态习性,在氮循环中发挥着各自独特的作用。

硝化菌的生理特性是其广泛存在和生态适应能力的基础。

首先,硝化菌对氧气敏感,通常生活在氧含量较高的环境中,如土壤和水体中。

其次,硝化菌需要一定的温度和pH条件才能正常生长和代谢活动,一般适宜温度为25-30摄氏度,适宜pH为6-8。

此外,硝化菌也对有机物质的供应和氨氮浓度有一定的要求。

在环境中,硝化菌通常与其他微生物共同存在,并通过竞争和合作的方式与它们相互作用,从而维持了一个相对稳定的生态系统。

硝化菌在环境中的影响是多方面的。

首先,硝化菌通过将氨氮氧化成亚硝酸盐和硝酸盐,参与了氮的形态转化过程。

这一过程对于维持土壤和水体中氮素的平衡至关重要。

其次,硝化菌通过氧化亚硝酸盐来释放出反应过程中产生的能量,并产生硝酸盐。

硝酸盐是一种常见的水体和土壤中的氮源,对植物的生长具有重要的影响。

此外,硝化菌还参与了一些特殊环境中的生物地球化学过程,如海洋中的硝酸盐还原过程和氮气生成过程等。

硝化菌的研究和应用在很多领域具有重要意义。

细菌的分类

细菌的分类
• 分类:属于衣原体门(Chlamydiales),衣原体纲(Chlamydiae) • 特点:具有特殊的生活周期,需用显微镜观察,寄生在细胞内,具有多种代谢途 径,部分衣原体具有致病性,如沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)
放线菌、酵母菌与真菌的分类与特点
• 放线菌(Actinomycetes) • 分类:属于放线菌门(Actinomycetes),放线菌纲(Actinomycetales) • 特点:具有分支状菌丝体,需用显微镜观察,具有多种代谢途径,部分放线菌具有致病性,如结核分枝杆菌( Mycobacterium tuberculosis)
生长环境
• 厌氧细菌主要分布在缺氧环境中,如肠道、沼泽、土壤 等 • 厌氧细菌可与其他细菌共生,形成复杂的微生物生态系 统
厌氧细菌的主要类群与代表物种
梭菌科(Clostridiaceae)
• 代表物种:梭状芽孢杆菌(Clostridium)、肉毒梭菌(Clostridium botulinum) 等 • 生理特性:严格厌氧,可产生多种毒素,如肉毒毒素、破伤风毒素等
02 弧菌科(Vibrionaceae)
• 代表物种:霍乱弧菌(Vibrio cholerae)、副溶血性弧 菌(Vibrio parahaemolyticus)等 • 生理特性:好氧或兼性厌氧,代谢多样性,可产生多种 酶和毒素,部分菌种具有致病性
03 嗜血杆菌科(Haemophilusaceae)
生长繁殖方式: 革兰氏阳性细 菌主要通过二 分裂方式进行 生长繁殖,生 长速度较快
革兰氏阳性细菌的主要类群与代表物种
01 链球菌科(Streptococcaceae)
• 代表物种:链球菌(Streptococcus)、乳球菌 (Lactococcus)等 • 生理特性:嗜氧或兼性厌氧,代谢多样性,可产生多种 酶和毒素

工业生产常用的微生物及要求-精品文档

工业生产常用的微生物及要求-精品文档

载体
能在大肠杆菌中自主复制
对某些限制酶来说只有一个切口,并
在酶作用后不影响其自主繁殖能力。 从细菌核酸中易于分离和纯化。 在宿主中能以多拷贝形式存在,有利 于插入的外源基因表达,能在宿主中 稳定地遗传
引入宿主细胞
质粒:重组DNA以转化的方式进入宿 主细胞 λ噬菌体:重组DNA以转染的方式进入 宿主细胞 柯斯质粒:以转导的方式进入宿主细胞
菌体的前处理
菌体的培养时间 融合剂的浓度 融合剂作用的时间 阳离子浓度 融合的温度及体系的pH值等
影响原生质体再生的主要因素
菌体自身的再生性能
原生质体制备的条件 再生培养基成分 再生培养条件等
DNA重组病毒、质粒、或其它载 体系统中,组成新的遗传物质,并转 入宿主细胞内进行繁殖的过程。
§工业生产常用的微生物及要求
一、工业生产常用的微生物
细菌(bacteria):常用的有枯草芽
孢杆菌、醋酸杆菌、棒状杆菌、短杆 菌等。 酵母菌(yeast):属单细胞真核生 物,主要分布于含糖较多的酸性环境 中。常用的有:啤酒酵母、假丝酵母、 短杆菌 棒状杆菌 类酵母等。
yeasts 啤酒酵母 棒状杆菌
菌种培养基营养过于丰富不利于孢子形成, 影响发酵;菌种培养基营养贫乏,菌种在 营养贫乏的培养基中多次传代会使菌体细 胞内缺乏某些生长因子而衰退甚至死亡 因此培养基应选择具有传代后生产能力不 发生明显下降、菌落不易衰老和自溶的正 常形态菌落,孢子丰富的培养基。

菌种的复壮
提供良好的环境条件 定期纯化菌种 防止自身突变
可以从复杂的DNA分子中分离出单
独的DNA片段。 可以大量生产高纯度的基因片段及其 产物。 可以在大肠杆菌中研究来自其它生物 的基因。 在高等动植物中也可以发展和建立这 种基因操作系统。

微生物总结表格

微生物总结表格

微生物总结球菌总结附录:1.IMViC试验:吲哚、甲基红、VP、枸橼酸盐试验。

凡IMViC试验示++——的判断为正常的典型的大肠埃希菌,表明被检物有粪便污染,有传播肠道传染病的危险!大肠埃希菌在克氏双糖管中,斜面和底层均产酸产气,硫化氢阴性,动力阳性。

可同沙门菌、志贺菌等区别。

3.卫生细菌学检查卫生细菌学中常以大肠菌群数(总大肠菌群)作为饮水、食品等粪便污染的指标之一!(1).总大肠菌群:一群需氧及兼性厌氧的,在37℃生长时能使乳糖发酵并在24h内产酸产气的G-无芽胞杆菌(埃希菌属、枸橼酸杆菌属、克雷伯菌属及肠杆菌属)。

(2).我国生活饮用水卫生标准(GB5749-85):总大肠菌群:≤3 个/L;每100 mL水样中不得检出细菌总数:≤100 个/ml4.肥达试验结果分析(1). 正常效价伤寒沙门菌O抗体<1:80,H抗体< 1:160;副伤寒沙门菌H抗体<1:80(2). 动态观察2份血清,第二次效价增长4倍以上有意义(3). O、H抗体的诊断意义O-Ab-IgM(出现早,持续短,难重现);H-Ab-IgG(出现晚,持续长,易重现)O高H高很可能是肠热症O不高H不高很可能不是肠热症O不高H高预防接种或者非特异性回忆反应O高H不高感染早期或与其他伤寒沙门菌O抗原有交叉反应的其他沙门菌感染(4). 其他5. E. coli O157:H7EHEC的重要血清型牛是主要的储存宿主产生Vero毒素(VT),亦称志贺样毒素(Shiga-like toxin,SLT)弧菌总结菌毛:细菌定居于小肠的必须因子,只有黏附定居后方可致病。

霍乱肠毒素:1、CT=1个A亚基+5个B亚基;2、蛋白酶裂解A亚基成A1和A2两个多肽;3、B亚基结合真核细胞表面GM1神经节苷脂受体;4、CT-GM1复合物被内吞到细胞内;5、A1具有ADP-核糖转移酶活性,可活化腺苷酸环化酶,使ATP以不正常的高效率转化为cAMP,导致肠腺上皮细胞分泌功能亢进,大量水和电解质在肠腔堆积,引起剧烈腹泻。

微生物种类

微生物种类

微生物种类微生物是一类微小生物体,广泛存在于自然界中,包括细菌、真菌、病毒等多种类型。

微生物的种类繁多,对于生命系统的平衡和稳定起着重要作用。

以下是关于微生物种类的介绍和分类:细菌细菌是一类单细胞的微生物,其细胞结构简单,没有真核细胞的细胞器。

细菌按形态和生理特性可分为球菌、杆菌、螺旋菌等不同类型。

细菌在自然界中广泛存在,有益菌和致病菌都是细菌。

益菌可以参与分解有机物质、固氮等生态功能,而致病菌则可能引起疾病。

真菌真菌是一类多细胞的微生物,其细胞结构包含细胞核,并具有真菌壁和分支的菌丝体。

真菌包括霉菌、酵母菌等多种类型。

真菌在自然界中扮演着重要的角色,如参与分解和循环有机物质,促进土壤肥沃等作用。

病毒病毒是一种非细胞的微生物,由核酸(DNA或RNA)和蛋白质外壳组成。

病毒依靠寄生在其他生物细胞内才能复制自身。

病毒具有高度的感染性,可以引起多种传染病,如流感、艾滋病等。

其他微生物除了细菌、真菌和病毒外,还有一些其他类型的微生物,如原生动物、蓝藻等。

原生动物是一类单细胞的微生物,常见于水体中,起着捕食、寄生等作用。

蓝藻是一种原核生物,具有光合作用能力,对水体的氮磷循环有一定影响。

微生物在生态系统中的作用微生物在生态系统中扮演着重要的角色,参与了有机物质的分解、循环以及能量转化等过程。

微生物还可以影响植物生长发育、土壤肥力、水体清洁等方面。

同时,一些微生物还可以作为生物防治和生物修复的工具,发挥着重要的环保作用。

综上所述,微生物种类繁多,各具特点,对于生态系统的平衡和稳定起着不可忽视的作用。

我们应当重视微生物的保护和研究,促进与微生物的和谐共生,共同实现生态环境的可持续发展。

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细菌分类环丝菌属(Brochothri)李斯特氏菌属(Literia)(Paenibacillaceae)(Ammoniphilu)(Aneurinibacillu)(Brevib acillu)(Cohnella)(Oalophagu)(Paenibacillu)(Thermicanu)(Thermobac illu)(Planococcaceae)(Filibacter)(Kurthia)(Planococcu)(Planomicrobium)(Sporoarcina)芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)(Marinococcu)(Sinococcu)芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillu)(Tuberibacillu)葡萄球菌科(Staphylococcaceae)孪生菌属(Gemella)(Joetgalicoccu)(Macrococcu)(Salinicoccu)葡萄球菌属(Staphylococcu)(Thermoactinomycetaceae)(Laceyella) (Mechercharimyce)(Planifilum)(Seinonella)(Shimazuella)(Thermoactinomyce)(Thermoflavimicrobium)(Turicibacteraceae)( Turicibacter)科未定(Pullulanibacillu)乳杆菌目(Lactobacillale)气球菌科(Aerococcaceae)(Abiotrophia)气球菌属(Aerococcu)(Doloicoccu)(Eremococcu)(Facklamia)(Globicatella)(Ignavigran um)肉杆菌科(Carnobacteriaceae)(Agitococcu)(Alkalibacterium)(Allofuti)(Alloi ococcu)(Atopococcu)(Atopotipe)肉杆菌属(Carnobacterium)德库菌属(Deemzia)(DSMZ,德国微生物与细胞保藏中心)(Doloigranulum)(Granulicatella)(Iobaculum)(Lactophaera) (Marinilactibacillu)(Trichococcu)肠球菌科(Enterococcaceae)(Atopobacter)(Catellicoccu)肠球菌属(Enterococcu)(Meliococcu)(Pilibacter)(Tetragenococcu)漫游球菌属(Vagococcu)乳杆菌科(Lactobacillaceae)乳杆菌属(Lactobacillu)(Paralactobacillu)片球菌属(Pediococcu)明串珠菌科(Leuconotocaceae)明串珠菌属(Leuconotoc)(Oenococcu)(Weiella)颤螺旋菌科(Ocillopiraceae)颤杆菌克(Ocillibacter)颤螺旋菌属(Ocillopira)链球菌科(Streptococcaceae)乳球菌属(Lactococcu)(Lactovum)链球菌属(Streptococcu)科未定(Acetoanaerobium)互营球菌属(Syntrophococcu)梭菌纲(Clotridia)梭菌目(Clotridiale)梭菌科(Clotridiaceae)(Acetanaerobacterium)(Acetivibrio)(Acidaminobacte r)(Alkaliphilu)(Anaerobacter)(Anaerotruncu)(Anoynatronum)(Bryant ella)(Caloramator)(Caloranaerobacter)(Caminicella)(Clotridiialibacter)梭菌属(Clotridium)(Coprobacillu)(Dorea) (Ethanoligenen)(Faecalibacterium)(Fatidioipila)(Garciella) (Gracilibacter)(Guggenheimella)(Hepellia)(Natronincola)(Ooba cter)(Paraporobacterium)八叠球菌属(Sarcina)(Soehngenia)(Sporacetigenium)(Sporobacter)(Subdoligranulum)(Tepidibacter )(Tepidimicrobium)(Thermobrachium)(Thermohalobacter)(Tindallia)优杆菌科(Eubacteriaceae)醋杆菌属(Acetobacterium)(Alkalibacter)(Anaerofuti)(Anaerovora)优杆菌属(Eubacterium)(Mogibacterium)(Peudoramibacter)太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)太阳杆状菌属(Heliobacillu)太阳杆菌属(Heliobacterium)嗜日菌属(Heliophilum)(Helioreti)毛螺旋菌科(Lachnopiraceae)(Acetitomaculum)(Anaerofilum)(Anaerotipe)丁酸弧菌属(Butyrivibrio)(Catenibacterium)(Catonella)粪球菌属(Coprococcu)(Johnonella)(Lachnobacterium)毛螺旋菌属(Lachnopira)(Moryella)(Oribacterium)假丁酸弧菌属(Peudobutyrivibrio)(Roeburia)瘤胃球菌属(Ruminococcu)(Shuttleworthia)(Sporobacterium)消化球菌科(Peptococcaceae)(Carboydothermu)(Cryptanaerobacter)(Dehalobacter) (Deulfitobacterium)(Deulfonipora)(Deulfoporoinu)(Deulfotomac ulum)(Pelotomaculum)消化球菌属(Peptococcu)(Syntrophobotulu)(Thermincola)(Thermoterrabacterium)消化链球菌科(Peptotreptococcaceae)(Anaerococcu)(Filifactor) (Finegoldia)(Fuibacter)(Gallicola)(Helcococcu)微单胞菌属(Parvimona)(原名Micromona)(Peptoniphilu)消化链球菌属(Peptotreptococcu)(Sedimentibacter)(Sporanaerobacter)(Tiierella)互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)(Aminiphilu)(Aminobacterium)(Aminomona)(Ana erobaculum)(Anaerobranca)(Caldicelluloiruptor)(Carboydocella)(Dethioulfovibrio)(Pelop ora)互营单胞菌属(Syntrophomona)(Syntrophopora)互营热菌属(Syntrophothermu)(Thermaerobacter)(Thermanaerovibrio)(Thermohydr ogenium)(Thermoyntropha)(Thermovirga)韦荣氏菌科(Veillonellaceae)(Acetonema)氨基酸球菌属(Acidaminococcu)(Allionella)(Anaeroarcu)(Anaeroglobu)(Anaeromua) (Anaeroinu)(Anaerovibrio)(Centipeda)(Dendroporobacter)(Dialiter)(Megamona)(Megaphaera)光冈菌属(Mituokella)(Papillibacter)(Pectinatu)(Peloinu)(Phacolarctobacterium)(Propionipira)(Propionipora)(Quinella) (Schwartzia)新月形单胞菌属(Selenomona)鼠孢菌属(Sporomua)(Sporotalea)(Succiniclaticum)(Succinipira)(Thermoinu)韦荣氏菌属(Veillonella)(Zymophilu)科未定(Anaerovirgula)(Dethioulfatibacter)(Geoporobacter)(Howardella)(Proteiniboru)盐厌氧菌目(Halanaerobiale)盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)盐厌氧菌属(Halanaerobium)(Halocella)(Haloincola)(Halothermothri)盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)(Acetohalobium)(Halanaerobacter)盐拟杆菌属(Halobacteroide)(Halonatronum)(Natroniella)(Orenia) (Selenihalanaerobacter)(Sporohalobacter)盐碱厌氧菌目(Natranaerobiale)盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)盐碱厌氧菌属(Natranaerobiu)热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriale)热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)(Acetogenium)(Ammonife)(Caldanaerobacter)(Carboydibrachium)(Coprothermobacter)(Deulfovirgula)(Gelria) (Mahella)(Moorella)(Sporotomaculum)(Tepidanaerobacter)(Thermacetogenium)热厌氧单胞菌属(Thermanaeromona)(Thermoanaerobacter)(Thermoanaerobium) (Thermoanaerobacterium)热厌氧菌属(Thermoanaerobium)(Thermobacteroide)(Thermoediminibacter)(Thermo venabulum)热脱硫菌科(Thermodeulfobiaceae)热脱硫菌属(Thermodeulfobium)目未定(Deulfitibacter)(Symbiobacterium)热石杆菌纲(Thermolithobacteria)热石杆菌目(Thermolithobacterale)热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)热石杆菌属(Thermolithobacter)梭杆菌门(Fuobacteria)梭杆菌纲(Fuobacteria)梭杆菌目(Fuobacteriale)梭杆菌科(Fuobacteriaceae)梭杆菌属(Fuobacterium)(Ilyobacter)纤毛菌属(Leptotrichia)(Propionigenium)(Sebaldella)(Sneathia) (Streptobacillu)科未定(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadete)芽单胞菌纲(Gemmatimonadete)芽单胞菌目(Gemmatimonadale)芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)芽单胞菌属(Gemmatimona)黏胶球形菌门(Lentiphaerae)黏胶球形菌纲(Lentiphaerae)黏胶球形菌目(Lentiphaerale)黏胶球形菌科(Lentiphaeraceae)黏胶球形菌属(Lentiphaera)食物谷菌目(Victivallale)食物谷菌科(Victivallaceae)食物谷菌属(Victivalli)硝化螺旋菌门(Nitropirae)硝化螺旋菌纲(Nitropira)硝化螺旋菌目(Nitropirale)硝化螺旋菌科(Nitropiraceae)钩端螺菌属(Leptopirillum)硝化螺旋菌属(Nitropira)磁杆菌属(Magnetobacterium)热脱硫弧菌属(Thermodeulfovibrio)浮霉菌门(Planctomycete)浮霉菌纲(Planctomycetacia)浮霉菌目(Planctomycetale)浮霉菌科(Planctomycetaceae)(Blatopirellula)(Gemmata)(Iophaera)小梨形菌属(Pirellula)浮霉菌属(Planctomycete)红小梨形菌属(Rhodopirellula)(Schleneria)科未定(均未能分离培养,见厌氧氨氧化菌)(Brocadia)(Kuenenia)(Scalindua)海绵杆菌门(Poribacteria)变形菌门(Proteobacteria)α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)柄杆菌目(Caulobacterale)柄杆菌科(Caulobacteraceae)(Aticcacauli)短波单胞菌属(Brevundimona)柄杆菌属(Caulobacter)苯基杆菌属(Phenylobacterium)(Kordiimonadale)(Kordiimonadaceae)(Kordiimona)短小盒菌目(Parvularculale)短小盒菌科(Parvularculaceae)短小盒菌属(Parvularcula)根瘤菌目(Rhizobiale)橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)橙单胞菌属(Aurantimona)(Fulvimarina)(Martelella)巴通体科(Bartonellaceae)巴通体属(Bartonella)(Grahamella)(Rochalimaea)拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)(Chelatococcu)(Methylocapa)(Methylocella)慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)阿菲波菌属(Afipia)农单胞菌属(Agromona)(Balneimona)芽生杆菌属(Blatobacter)(Boea)慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)硝化杆菌属(Nitrobacter)(Oligotropha)(Rhodoblatu)红假单胞菌属(Rhodopeudomona)布鲁氏菌科(Brucellaceae)布鲁氏菌属(Brucella)(Crabtreella)(Daeguia)支动菌属(Mycoplana)苍白杆菌属(Ochrobactrum)(Peudochrobactrum)黏着杆菌科(Cohaeibacteraceae)黏着杆菌属(Cohaeibacter)生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)(Ancalomicrobium)(Angulomicrobium)水杆菌属(Aquabacter)芽绿菌属(Blatochlori)(Devoia)(Dichotomicrobium)(Filomicrobium)(Gemmiger)生丝微菌属(Hyphomicrobium)(Methylorhabdu)土微菌属(Pedomicrobium)甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)(Meganema)甲基杆菌属(Methylobacterium)(Microvirga)(Protomona)甲基孢囊菌科(Methylocytaceae)(Albibacter)甲基孢囊菌属(Methylocyti)(Methylopila)(Methyloinu)(Pleomorphomona)(Teraakiel la)叶杆菌科(Phyllobacteriaceae)(Aminobacter)(Aquamicrobium)(Defluvibacter)( Hoeflea)中慢生根瘤菌属(Meorhizobium)(Nitratireductor)叶杆菌属(Phyllobacterium)(Peudaminobacter)根瘤菌科(Rhizobiaceae)土壤杆菌属(Agrobacterium)异根瘤菌属(Allorhizobium)嗜碳菌属(Carbophilu)螯合杆菌属(Chelatobacter)剑菌属(Enifer)(Kaitia)韧皮杆菌属(Liberibacter)根瘤菌属(Rhizobium)中华根瘤菌属(Sinorhizobium)红菌科(Rhodobiaceae)(Andereniella)(Parvibaculum)红菌属(Rhodobium)玫瑰螺菌属(Roeopirillum)黄色杆菌科(anthobacteraceae)(Ancylobacter)(Azorhizobium)(Labry) (Peudolabry)(Starkeya)黄色杆菌属(anthobacter)科未定(Sneathiella)红杆菌目(Rhodobacterale)生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae)(Hirchia)生丝单胞菌属(Hyphomona)(Maricauli)(Oceanicauli)(Robiginitomaculum)红杆菌科(Rhodobacteraceae)(Ahrenia)(Albidovulum)(Amaricoccu)(Antarctobac ter)(Catellibacterium)(Citreicella)(Citreimona)(Dinoroeobacter)( Donghicola)(Gemmobacter)(Haematobacter)(Jannachia)(Ketogulonicigenium)(Labrenzia)(Leiingera)(Loktanella)(Maribiu)(Marinovum)(Maritimibacter)(Methylarcula)(Nereida)(Neiotobacter)(Oceanibulbu)海洋生菌属(Oceanicola)(Octadecabacter)(Palleronia)(Pannonibacter)副球菌属(Paracoccu)(Pelagibaca)(Phaeobacter)假红杆菌属(Peudorhodobacter)(Peudovibrio)(Rhodobaca)红杆菌属(Rhodobacter)(Rhodothalaium)小红卵菌属(Rhodovulum)(Roeibacterium)(Roeibium)(Roeicyclu) (Roeinatronobacter)(Roeialinu)(Roeiviva)玫瑰杆菌属(Roeobacter)(Roeovariu)(Rubellimicrobium)(Rubrimona)(Ruegeria)(Sagittula)(Salipiger )(Shimia)(Silicibacter)(Staleya)(Stappia)(Sulfitobacter)(Tateyamaria)(Thalaobacter)(Thalaobiu)(Thalao coccu)(Thioclava)硫球形菌属(Thiophaera)(Weninia)木洞菌属(Woodholea)杨氏菌属(Yangia)红螺菌目(Rhodopirillale)醋杆菌科(Acetobacteraceae)醋杆菌属(Acetobacter)(Acidicaldu)嗜酸菌属(Acidiphilium)酸球形菌属(Acidiphaera)酸胞菌属(Acidocella)酸单胞菌属(Acidomona)(Aaia)(Belnapia)脆弱球菌属(Craurococcu)葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)葡糖杆菌属(Gluconobacter)(Granulibacter)(Kozakia)鼠球菌属(Muricoccu)(Neoaaia)(Paracraurococcu)红球状菌属(Rhodopila)(Rhodovariu)玫瑰球菌属(Roeococcu)玫瑰单胞菌属(Roeomona)(Rubritepida)(Saccharibacter)(Stella)(Swaminathania)(Teichococcu)(Zavarzinia)红螺菌科(Rhodopirillaceae)固氮螺菌属(Azopirillum)(Conglomeromona)(Defluviicoccu)(Inquilinu)磁螺菌属(Magnetopirillum)(Phaeopirillum)(Rhodocita)红螺旋菌属(Rhodopira)红螺菌属(Rhodopirillum)红弧菌属(Rhodovibrio)玫瑰螺旋菌属(Roeopira)(Skermanella)(Telmatopirillum)(Thalaopira)(Titrella)立克次体目(Rickettiale)无形体科(Anaplamataceae)(Aegyptianella)无形体属(Anaplama)(Cowdria)埃里希体属(Ehrlichia)新立克次体属(Neorickettia)沃巴赫体属(Wolbachia)(enohalioti)全孢菌科(Holoporaceae)全孢菌属(Holopora)立克次体科(Rickettiaceae)(Orientia)立克次体属(Rickettia)SAR11群远洋杆菌属(Pelagibacter)科未定(Lyticum)(Odyella)(Peudocaedibacter)(Symbiote)(Tectibacter)鞘脂单胞菌目(Sphingomonadale)赤杆菌科(Erythrobacteraceae)(Altererythrobacter)赤杆菌属(Erythrobacter)赤微菌属(Erythromicrobium)紫杆菌属(Porphyrobacter)鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)芽单胞菌属(Blatomona)柠檬酸微菌属(Citromicrobium)赤单胞菌属(Erythromona)新鞘脂菌属(Novophingobium)(Sandaracinobacter)(Sandaracinorhabdu)鞘脂菌属(Sphingobium)鞘脂单胞菌属(Sphingomona)(Sphingopyi)(Sphingoinicella)发酵单胞菌属(Zymomona)目未定(Albimona)(Caenipirillum)(Inolitipirillum)(Novipirillum)β-变形菌纲(Betaproteobacteria)伯克氏菌目(Burkholderiale)产碱菌科(Alcaligenaceae)无色杆菌属(Achromobacter)(Advenella)产碱菌属(Alcaligene)(Azohydromona)博德氏菌属(Bordetella)(Brackiella)(Catellaniela)德克斯氏菌属(Deria)(Kerteria)(Oligella)(Pelitega)(Pigmentiphaga)(Puillimona)(Sutterella)(Taylorella)(Tetrathiobacter)伯克氏菌科(Burkholderiaceae)伯克氏菌属(Burkholderia)(Chitinimona)(Cupriavidu)(Lautropia)(Limnobacter)( Pandoraea)(Paucimona)(Polynucleobacter)青枯菌属(Raltonia)(Thermothri)沃特氏菌属(Wauteria)代尔夫特菌属(Delftia)(Diaphorobacter)(Giebergeria)噬氢菌属(Hydrogenophaga)(Hylemonella)(Lampropedia)(Macromona)(Malikia)(O ttowia)(Pelomona)(Polaromona)(Ramlibacter)红育菌属(Rhodofera)(Schlegelella)(Simplicipira)贪食菌属(Variovora)(enophilu)草酸杆菌科(Oalobacteraceae)(Collimona)(Duganella)(Herbapirillum)(Herminiimona)(Janthinobacterium)(Mailia)(Nai bacter)(Oalicibacterium)草酸杆菌属(Oalobacter)(Telluria)(Undibacterium)科未定(Aquabacterium)(Aquincola)(Ideonella)纤发菌属(Leptothri)(Methylibium)(Mituaria)(Paucibacter)(Roeatele)红长命菌属(Rubriviva)(Sphaerotilu)(Tepidicella)(Tepidimona)(Thiobacter)硫单胞菌属(Thiomona)(ylophilu)嗜氢菌目(Hydrogenophilale)嗜氢菌科(Hydrogenophilaceae)嗜氢菌属(Hydrogenophilu)(Petrobacter)(Tepidiphilu)硫杆状菌属(Thiobacillu)嗜甲基菌目(Methylophilale)嗜甲基菌科(Methylophilaceae)(Methylobacillu)嗜甲基菌属(Methylophilu)(Methylotenera)(Methylovoru)奈瑟菌目(Neieriale)奈瑟菌科(Neieriaceae)(Alyiella)(Andreprevotia)水螺菌属(Aquapirillum)(Aquitalea)(Bergeriella)(Chitinibacter)(Chitinilyt icum)色杆菌属(Chromobacterium)(Conchiformibiu)(Deefgea)艾肯氏菌属(Eikenella)(Formivibrio)(Gulbenkiania)(Iodobacter)金氏菌属(Kingella)鸥杆菌属(Laribacter)(Leeia)(Microvirgula)(Morococcu)奈瑟菌属(Neieria)(Paludibacterium)(Prolinoboru)(Silvimona)(Simoniella)(U ruburuella)(Vitreocilla)(Vogeella)亚硝化单胞菌目(Nitroomonadale)嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)嘉利翁氏菌属(Gallionella)亚硝化单胞菌科(Nitroomonadaceae)亚硝化叶菌属(Nitroolobu)亚硝化单胞菌属(Nitroomona)亚硝化螺旋菌属(Nitroopira)螺菌科(Spirillaceae)螺菌属(Spirillum)普罗卡杆菌目(Procabacteriale)普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae)普罗卡杆菌属(Procabacter)红环菌目(Rhodocyclale)红环菌科(Rhodocyclaceae)固氮弓菌属(Azoarcu)(Azoneu)(Azopira)(Azovibrio) (Dechloromona)(Dechlorooma)(Denitratioma)(Ferribacterium)(Me thyloveratili)丙酸杆菌属(Propionibacter)(Propionivibrio)(Quatrionicoccu)红环菌属(Rhodocyclu)(Shinella)(Sterolibacterium)陶厄氏菌属(Thauera)(Uliginoibacterium)动胶菌属(Zoogloea)δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)蛭弧菌目(Bdellovibrionale)(Bacteriovoracaceae)(Bacteriovora)(Peredibacte r)蛭弧菌科(Bdellovibrionaceae)蛭弧菌属(Bdellovibrio)(Micavibrio)(Vampirovibrio)脱硫盒菌目(Deulfarculale)脱硫盒菌科(Deulfarculaceae)脱硫盒菌属(Deulfarculu)脱硫杆菌目(Deulfobacterale)脱硫杆菌科(Deulfobacteraceae)(Deulfatibacillum)(Deulfatiferula)(Deulfatirh abdium)脱硫杆菌属(Deulfobacter)(Deulfobacterium)(Deulfobacula)(Deulfobotulu)(Deul focella)(Deulfococcu)(Deulfofaba)(Deulfofrigu)(Deulfomua)(Deulfo nema)(Deulforegula)(Deulfoarcina)(Deulfopira)(Deulfotignum)(Deul fobulbaceae)(Deulfobulbu)(Deulfocapa)(Deulfofuti)(Deulfopila)(De ulforhopalu)(Deulfotalea)(Nitropinaceae)(Nitropina)脱硫弧菌目(Deulfovibrionale)(Deulfohalobiaceae)(Deulfohalobium)(Deulfonatronovibrio)(Deulfonauticu)(Deulfothermu)(Deulfover miculu)(Deulfomicrobiaceae)(Deulfomicrobium)(Deulfonatronaceae)( Deulfonatronum)脱硫弧菌科(Deulfovibrionaceae)(Bilophila)(Deulfomona)脱硫弧菌属(Deulfovibrio)(Lawonia)硫还原菌目(Deulfurellale)硫还原菌科(Deulfurellaceae)硫还原菌属(Deulfurella)(Hippea)除硫单胞菌目(Deulfuromonadale)除硫单胞菌科(Deulfuromonadaceae)除硫单胞菌属(Deulfuromona)(Deulfuromua)(Malonomona)(Pelobacter)地杆菌科(Geobacteraceae)(Geoalkalibacter)地杆菌属(Geobacter)(Geopychrobacter)(Geothermobacter)(Trichlorobacter)黏球菌目(Myococcale)孢囊杆菌亚目(Cytobacterineae)孢囊杆菌科(Cytobacteraceae)(Anaeromyobacter)(Archangium)孢囊杆菌属(Cytobacter)(Hyalangium)(Melittangium)(Stigmatella)黏球菌科(Myococcaceae)(Angiococcu)(Corallococcu)黏球菌属(Myococcu)(Pyidicoccu)侏囊菌亚目(Nannocytineae)(Haliangiaceae)(Haliangium)(Kofleriaceae)(Kofleri a)侏囊菌科(Nannocytaceae)(Enhygromya)侏囊菌属(Nannocyti)(Pleiocyti)堆囊菌亚目(Sorangineae)多囊菌科(Polyangiaceae)(Byovora)(Chondromyce)(Haploangium)(Jahnella)多囊菌属(Polyangium)堆囊菌属(Sorangium)互营杆菌目(Syntrophobacterale)互营菌科(Syntrophaceae)(Deulfobacca)(Deulfomonile)(Smithella)互营菌属(Syntrophu)互营杆菌科(Syntrophobacteraceae)(Deulfacinum)(Deulfoglaeba)(Deulforhabdu)( Deulfovirga)互营杆菌属(Syntrophobacter)(Thermodeulforhabdu)ε-变形菌纲(Epilonproteobacteria)弯曲菌目(Campylobacterale)弯曲菌科(Campylobacteraceae)弓形杆菌属(Arcobacter)弯曲菌属(Campylobacter)(Dehalopirillum)硫磺单胞菌属(Sulfuropirillum)螺杆菌科(Helicobacteraceae)螺杆菌属(Helicobacter)(Sulfuricurvum)(Sulfurimona)(Sulfurovum)(Thiovulum)沃林氏菌属(Wolinella)氢单胞菌科(Hydrogenimonadaceae)氢单胞菌属(Hydrogenimona)(Nautiliale)(Nautiliaceae)(Caminibacter)(Lebetimo na)(Nautilia)(Nitratifractor)(Nitratiruptor)(Thioreductor)γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)酸硫杆状菌目(Acidithiobacillale)酸硫杆状菌科(Acidithiobacillaceae)酸硫杆状菌属(Acidithiobacillu)热硫杆状菌科(Thermithiobacillaceae)热硫杆状菌属(Thermithiobacillu)气单胞菌目(Aeromonadale)气单胞菌科(Aeromonadaceae)气单胞菌属(Aeromona)(Oceanimona)(Oceaniphaera)(Tolumona)(Zobellella)琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae)厌氧螺菌属(Anaerobiopirillum)反刍杆菌属(Ruminobacter)琥珀酸单胞菌属(Succinimona)琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)交替单胞菌目(Alteromonadale)交替单胞菌科(Alteromonadaceae)(Aetuariibacter)(Agarivoran)(Alihewanella)交替单胞菌属(Alteromona)(Glaciecola)(Marinimicrobium)海杆菌属(Marinobacter)海细菌属(Marinobacterium)产微球茎菌属(Microbulbifer)(Saccharophagu)(Salinimona)(Colwelliaceae)(Colwel lia)(Thalaomona)(Ferrimonadaceae)(Ferrimona)(Paraferrimona)(Idiomarinaceae)(Idiomarina)(Peudidiomarina)(Moritellaceae)(Moritella)假交替单胞菌科(Peudoalteromonadaceae)(Algicola)假交替单胞菌属(Peudoalteromona)冷单胞菌科(Pychromonadaceae)冷单胞菌属(Pychromona)希万氏菌科(Shewanellaceae)希万氏菌属(Shewanella)科未定(Teredinibacter)(Endobugula)心杆菌目(Cardiobacteriale)心杆菌科(Cardiobacteriaceae)心杆菌属(Cardiobacterium)(Dichelobacter)(Suttonella)着色菌目(Chromatiale)着色菌科(Chromatiaceae)(Allochromatium)(Amoebobacter)着色菌属(Chromatium)盐着色菌属(Halochromatium)(Iochromatium)(Lamprobacter)(Lamprocyti)(Marichr omatium)亚硝化球菌属(Nitroococcu)芬尼氏菌属(Pfennigia)棍着色菌属(Rhabdochromatium)(Rheinheimera)热着色菌属(Thermochromatium)硫碱球菌属(Thioalkalicoccu)硫橄榄菌属(Thiobaca)硫匣菌属(Thiocapa)硫球菌属(Thiococcu)硫囊菌属(Thiocyti)硫网菌属(Thiodictyon)硫黄球菌属(Thioflavicoccu)硫盐匣菌属(Thiohalocapa)(Thiolamprovum)(Thiopedia)硫红球菌属(Thiorhodococcu)硫红弧菌属(Thiorhodovibrio)硫螺菌属(Thiopirillum)外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodopiraceae)碱湖生菌属(Alkalilimnicola)碱螺菌属(Alkalipirillum)(Aquialimona)(Arhodomona)(Ectothiorhodoinu)外硫红螺旋菌属(Ectothiorhodopira)盐红螺旋菌属(Halorhodopira)(Natronocella)硝化球菌属(Nitrococcu)硫碱螺旋菌属(Thioalkalipira)硫碱弧菌属(Thialkalivibrio)硫红螺旋菌属(Thiorhodopira)颗粒状球菌科(Granuloicoccaceae)颗粒状球菌属(Granuloicoccu)盐硫杆状菌科(Halothiobacillaceae)盐硫杆状菌属(Halothiobacillu)(Thiovirga)肠杆菌目(Enterobacteriale)肠杆菌科(Enterobacteriaceae)(Arenophonu)(Brenneria)布赫纳氏菌属(Buchnera)(Budvicia)布丘氏菌属(Buttiauella)(Calymmatobacterium)西地西菌属(Cedecea)柠檬酸杆菌属(Citrobacter)(Dickeya)爱德华氏菌属(Edwardiella)肠杆菌属(Enterobacter)欧文氏菌属(Erwinia)埃希氏菌属(Echerichia)(包含大肠杆菌)(Ewingella)哈夫尼菌属(Hafnia)克雷伯氏菌属(Klebiella)克吕沃氏菌属(Kluyvera)(Leclercia)(Leminorella)(Levinea)(Moellerella)(Morganella)(Obeumbacterium)泛菌属(Pantoea)(Pectobacterium)(Phlomobacter)(Photorhabdu)邻单胞菌属(Pleiomona)(Pragia)变形杆菌属(Proteu)普罗维登斯菌属(Providencia)(Rahnella)(Raoultella)糖杆菌属(Saccharobacter)沙门氏菌属(Salmonella)(Samonia)沙雷氏菌属(Serratia)志贺氏菌属(Shigella)(Sodali)(Tatumella)(Thorellia)(Trabuliella)(Wigglewort hia)致病杆菌属(enorhabdu)耶尔辛氏菌属(Yerinia)(包含鼠疫杆菌)(Yokenella)军团菌目(Legionellale)柯克斯体科(Coiellaceae)(Aquicella)柯克斯体属(Coiella)立克次小体属(Rickettiella)军团菌科(Legionellaceae)(Fluoribacter)军团菌属(Legionella)(Sarcobium)(Tatlockia)甲基球菌目(Methylococcale)甲基球菌科(Methylococcaceae)甲基杆菌属(Methylobacter)甲基暖菌属(Methylocaldum)甲基球菌属(Methylococcu)甲基盐菌属(Methylohalobiu)甲基微菌属(Methylomicrobium)甲基单胞菌属(Methylomona)甲基八叠球菌属(Methyloarcina)(Methylooma)甲基球形菌属(Methylophaera)甲基热菌属(Methylothermu)海洋螺菌目(Oceanopirillale)食碱菌科(Alcanivoraceae)食碱菌属(Alcanivora)(Fundibacter)(Kangiella)河氏菌科(Hahellaceae)盐单胞菌科(Halomonadaceae)(Carnimona)色盐杆菌属(Chromohalobacter)(Cobetia)(Deleya)盐单胞菌属(Halomona)(Halotalea)(Halovibrio)(Modicialibacter)(Salicola)(Volcaniella)发酵杆菌属(Zymobacter)岸生菌科(Litoricolaceae)岸生菌属(Litoricola)海洋螺菌科(Oceanopirillaceae)(Amphritea)巴氏发菌属(Balneatri)海单胞菌属(Marinomona)海螺菌属(Marinopirillum)(Neptuniibacter)(Neptunomona)(Nitrincola)海洋杆菌属(Oceanobacter)海洋螺菌属(Oceanopirillum)油螺旋菌属(Oleipira)假螺菌属(Peudopirillum)(Reinekea)(Thalaolituu)嗜油菌科(Oleiphilaceae)嗜油菌属(Oleiphilu)糖螺菌科(Saccharopirillaceae)糖螺菌属(Saccharopirillum)巴斯德氏菌目(Pateurellale)巴斯德氏菌科(Pateurellaceae)放线杆菌属(Actinobacillu)(Aggregatibacter)(Avibacterium)(Biberteinia)(Gall ibacterium)嗜血菌属(Haemophilu)(Hitophilu)(Lonepinella)(Mannheimia)(Nicoletella)巴斯德氏菌属(Pateurella)(Phocoenobacter)(Volucribacter)假单胞菌目(Peudomonadale)莫拉菌科(Moraellaceae)不动杆菌属(Acinetobacter)(Alkanindige)布兰汉氏菌(Branhamella)(Enhydrobacter)莫拉菌属(Moraella)(Perlucidibaca)冷杆菌属(Pychrobacter)假单胞菌科(Peudomonadaceae)(Azomona)(Azomonotrichon)(Azorhizophilu)(Azotobacter)纤维弧菌属(Cellvibrio)(Chryeomona)(Flavimona)(Meophilobacter)假单胞菌属(Peudomona)根瘤杆菌属(Rhizobacter)皱纹单胞菌属(Rugamona)蛇形菌属(Serpen)咸水球形菌目(Saliniphaerale)咸水球形菌科(Saliniphaeraceae)咸水球形菌属(Saliniphaera)硫发菌目(Thiotrichale)(Franciellaceae)(Franciella)鱼立克次体科(Picirickettiaceae)(Cycloclaticu)(Hydrogenovibrio)(Methylophaga)鱼立克次体属(Picirickettia)(Sulfurivirga)(Thioalkalimicrobium)(Thiomicropira)硫发菌科(Thiotrichaceae)无色菌属(Achromatium)贝扎托菌属(Beggiatoa)亮发菌属(Leucothri)硫杆菌属(Thiobacterium)硫珠菌属(Thiomargarita)硫辫菌属(Thioploca)硫螺旋菌属(Thiopira)硫发菌属(Thiothri)科未定(Caedibacter)(Fangia)弧菌目(Vibrionale)弧菌科(Vibrionaceae)(Aliivibrio)异单胞菌属(Allomona)(Beneckea)链状球菌属(Catenococcu)肠弧菌属(Enterovibrio)(Grimontia)(Litonella)(Lucibacterium)发光杆菌属(Photobacterium)(Salinivibrio)弧菌属(Vibrio)黄色单胞菌目(anthomonadale)华杆菌科(Sinobacteraceae)(Hydrocarboniphaga)(Nevkia)华杆菌属(Sinobacter)黄色单胞菌科(anthomonadaceae)水单胞菌属(Aquimona)(Arenimona)(Apromona)(Dokdonella)(Dyella)(Frateuria)(F ulvimona)(Ignatzchineria)(Luteibacter)(Luteimona)(Lyobacter)假黄色单胞菌属(Peudoanthomona)(Rhodanobacter)(Silanimona)(Stenotrophomona)热单胞菌属(Thermomona)黄色单胞菌属(anthomona)(ylella)目未定碱单胞菌属(Alkalimona)(Bowmanella)聚集杆菌属(Congregibacter)(Methylohalomona)(Methylonatrum)(Sedimenticola)( Solimona)(Thiohalomona)(Thiohalophilu)螺旋体门(Spirochaete)螺旋体纲(Spirochaete)螺旋体目(Spirochaetale)短螺旋体科(Brachypiraceae)短螺旋体属(Brachypira)小蛇菌属(Serpulina)钩端螺旋体科(Leptopiraceae)纤线菌属(Leptonema)钩端螺旋体属(Leptopira)(Turneriella)螺旋体科(Spirochaetaceae)疏螺旋体属(Borrelia)(Brevinema)(Clevelandina)(Critipira)(Diplocaly)(Hollan dina)(Pillotina)螺旋体属(Spirochaeta)密螺旋体属(Treponema)柔膜菌门(Tenericute)柔膜菌纲(Mollicute)无胆甾原体目(Acholeplamatale)无胆甾原体科(Acholeplamataceae)无胆甾原体属(Acholeplama)植原体属(Phytoplama)厌氧原体目(Anaeroplamatale)厌氧原体科(Anaeroplamataceae)厌氧原体属(Anaeroplama)无甾醇原体属(Ateroleplama)虫原体目(Entomoplamatale)虫原体科(Entomoplamataceae)虫原体属(Entomoplama)中间原体属(Meoplama)螺原体科(Spiroplamataceae)螺原体属(Spiroplama)支原体目(Mycoplamatale)支原体科(Mycoplamataceae)(Allobaculum)(Eperythrozoon)(Haemobartonella)支原体属(Mycoplama)脲原体属(Ureaplama)目未定丹毒丝菌科(Eryipelothrichaceae)(Bulleidia)丹毒丝菌属(Eryipelothri)(Holdemania)(Solobacterium)热脱硫杆菌门(Thermodeulfobacteria)热脱硫杆菌纲(Thermodeulfobacteria)热脱硫杆菌目(Thermodeulfobacteriale)热脱硫杆菌科(Thermodeulfobacteriaceae)(Thermodeulfatator)热脱硫杆菌属(Thermodeulfobacterium)热微菌门(Thermomicrobia)热微菌纲(Thermomicrobia)热微菌目(Thermomicrobiale)热微菌科(Thermomicrobiaceae)热微菌属(Thermomicrobium)热袍菌门(Thermotogae)热袍菌纲(Thermotogae)热袍菌目(Thermotogale)热袍菌科(Thermotogaceae)(Fervidobacterium)(Geotoga)(Marinitoga)(Petrotoga)(Thermoiph o)(注:正确形式似应为Opituti)丰祐菌目(Opitutale)丰祐菌科(Opitutaceae)交替球菌属(Alterococcu)丰祐菌属(Opitutu)紫红球菌目(Puniceicoccale)紫红球菌科(Puniceicoccaceae)(Ceraicoccu)(Coraliomargarita)(Pelagicoccu)突柄杆菌属(Prothecobacter)(Rubritalea)门未定(Jonquetella)纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)纤线杆菌目(Ktedonobacterale)纤线杆菌科(Ktedonobacteraceae)纤线杆菌属(Ktedonobacter)(Fervidobacterium)(Geotoga)(Marinitoga)(Petrotoga)(Thermoiph o)(注:正确形式似应为Opituti)丰祐菌目(Opitutale)丰祐菌科(Opitutaceae)交替球菌属(Alterococcu)丰祐菌属(Opitutu)紫红球菌目(Puniceicoccale)紫红球菌科(Puniceicoccaceae)(Ceraicoccu)(Coraliomargarita)(Pelagicoccu)突柄杆菌属(Prothecobacter)(Rubritalea)门未定(Jonquetella)纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)纤线杆菌目(Ktedonobacterale)纤线杆菌科(Ktedonobacteraceae)纤线杆菌属(Ktedonobacter)。

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