(完整版)SDS-PAGE蛋白电泳方法
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SDS-PAGE
一. 实验原理
SDS 是一种阴离子表面活性剂,在蛋白质溶液里加入 SDS 和巯基乙醇后,巯基乙醇能使蛋白质分子中的二硫键还原, SDS 能使蛋白质的氢键、疏水键打开并结合到蛋白质分子上,形成蛋白质-SDS 复合物。在一定条件下,SDS 与大多数蛋白质的结合比例为 1.4:1。由于十二烷基磺酸根带负电,使各种蛋白质的SDS-复合物都带上相同密度的负电荷,它的量大大超过了蛋白质原有的电荷量,因而掩盖了不同种类蛋白质间原有的电荷差别。SDS与蛋白质结合后,还引起了蛋白质构象的改变。蛋白质-SDS复合物的流体力学和光学性质表明,它们在水溶液中的形状,近似于雪茄烟形的长椭圆棒,不同蛋白质的 SDS 复合物的短轴长度都一样,约为 1.8nm ,而长轴则随蛋白质的 Mr 成正比的变化。基于上述原因,蛋白质-SDS 复合物在凝胶电泳中的迁移率,不再受蛋白质原有电荷和形状的影响,而只与椭圆棒的长度有关,也就是蛋白质 Mr 的函数。
二. 试剂器材
30%凝胶贮液(100mL):称取试剂Acr 29.2g和Bis 0.8g置于100mL烧杯中,向烧杯中加入约60mL双蒸水,充分搅拌溶解后加双蒸水定容至100mL,置于棕色瓶内4℃贮存,每过1-2个月应重新配制;
注意:丙稀酰胺具有很强的神经毒性,并可通过皮肤吸收,其作用有积累性,配制时应戴手套和口罩等。
分离胶缓冲液(1.5 mol/L Tris-HCl,pH 8.8,100mL):称取Tris 18.2g 溶于约80mL 双蒸水,用6mol/L的HCl 调整pH值至8.8,加双蒸水定容到100mL,4℃ 贮存;堆积胶缓冲液(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8,100mL):称取Tris 6.0g溶于约80mL双蒸水,用1mol/L的HCl 调整pH值至6.8,加双蒸水定容到100mL,4℃ 贮存;
电泳缓冲液(1L):称取试剂Tris 3.03g和甘氨酸 14.4g置于500mL烧杯中,向烧杯中加入约400mL双蒸水充分溶解,再加入10%SDS溶液1.0mL,以双蒸水定容至1L (自然pH值为8.3,无需再调),4℃ 贮存,可重复使用5-6次;
2×加样缓冲液(10mL):取下列试剂置于10mL塑料离心管中
0.5mol/L Tris-HCl缓冲液(pH6.8) 2.0mL
10%SDS溶液 4.0mL
甘油 2.0mL
巯基乙醇 2.0mL
溴酚蓝 0.02g,
混匀后1mL分装,-70℃可贮存6个月;
10%AP:称取(NH4)2S2O3 1.0 g,溶于10.0mL双蒸水中,分装成每份1mL,-20℃贮存;
TEMED:分装成每份1mL,4℃避光贮存;
水饱和正丁醇(100mL):在玻璃瓶中加入50mL双蒸水和50mL正丁醇,振摇。上层相即水饱和正丁醇,室温下可长期保存。
染色液(100mL):称取考马斯亮蓝R-250 0.25g,加入双蒸水40.0mL、甲醇50.0mL 和乙酸10.0mL,搅拌溶解后滤纸过滤除去不溶颗粒;
脱色液(1L):分别取甲醇50mL和乙酸75mL,加双蒸水875mL稀释。
其他器材:
容量瓶(1L、100ml、10ml)、烧杯、离心管(15ml、1.5ml)、移液器、移液器吸头、干燥器、涡旋振荡器和废液缸等。
分离胶配方(100mL,4块胶)
贮液分离胶中丙烯酰胺的终浓度(%)
8.0 9.0 10.0 11.0 12.0 13.0 14.0 15.0 16.0 17.0 18.0 凝胶贮液(mL) 26.67 30.00 33.33 36.67 40.00 43.33 46.67 50.00 53.33 56.67 60.00 分离胶缓冲液(mL) 25
双蒸水 (mL) 46.53 43.20 39.87 36.53 33.20 29.87 26.53 23.20 19.87 16.53 13.20 10%SDS (mL) 1.0
10%AP (mL) 0.75
TEMED (mL) 0.05 (抽气后添加)
堆积胶配方(40mL,4块胶)
堆积胶中丙烯酰胺的终浓度(%)
贮液
3.0
4.0
5.0
凝胶贮液(mL) 4.00 5.36 6.66
分离胶缓冲液(mL) 10.0
双蒸水(mL) 25.36 24.00 22.70
10%SDS(mL) 0.4
10%AP(mL) 0.2
TEMED(mL) 0.04 (抽气后添加)
三. 操作步骤
样品处理:
在密封的螺盖微量离心管中,用2×加样缓冲液按1:1稀释蛋白质样品溶液,于100℃煮沸3-5min,分子质量标准品也经上述处理。
凝胶制备:
将玻璃板用蒸馏水清洗干净,再用75%的酒精去脂,干燥后固定在灌胶支架上;
配制12%的分离胶,加入TEMED前抽真空10min以除去丙烯酰胺溶液中的空气;加入TEMED后轻轻振荡混匀,迅速注入安装好的玻璃板的间隙中,
给堆积胶留出约1cm的空间。在丙烯酰胺溶液上覆盖一层水饱和的正丁醇,以防止空气扩散到凝胶中抑制聚合作用,并保证凝胶表面水平;在室温条件下,凝胶应在30min-50min内聚合完成。凝胶聚合后凝胶和上层液相之间可见折射率的变化;
倒掉覆盖层并用蒸馏水清洗凝胶顶部数次,并用滤纸条吸净残留的蒸馏水,注意勿破坏凝胶表面;制备堆积胶并迅速注入分离胶上,立即插入干净的梳子,不要混入气泡,以一定的角度将梳子插入堆积胶能减少气泡的产生。堆积胶聚合后小心移去梳子,避免破坏加样孔,用蒸馏水小心清洗加样孔,以除去未聚合的丙烯酰胺。
加样:
将凝胶固定在电泳装置上,电泳上槽内加入电泳缓冲液没过加样孔,并检查有无渗漏。倾斜整个装置以赶走凝胶下面可能留有的气泡;按预定顺序加样,每孔加入20μL,在对照孔中加入分子质量标准品6-7 μL,如有空置的加样孔,加入等体积的1×加样缓冲液。
电泳:
将电泳装置与电源相连,正极接下槽、负极接上槽进行电泳,样品在堆积胶阶段电压为80V,而在分离胶阶段电压调整为120V。直到溴酚蓝到达分离胶的底部后,关闭电源,断开电极。从电泳装置上卸下玻璃板,用小铲子剥下凝胶后切除一角以标注凝胶方位。
染色:
将凝胶浸泡在染色液中,置于摇床上染色4hr,染色液可回收重复利用。脱色:
染色结束后,将凝胶浸泡在脱色液中,置于摇床上脱色过夜,其间更换脱色液3次.
记录:
将显示蛋白条带的凝胶用凝胶成像仪拍照,记录试验结果,并根据分子质量标准品计算目标蛋白的分子量。