细菌的分类与命名.球菌119页PPT

细菌分类与命名ppt课件

种
菌株是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可
以有许多菌株，其主要性状应完全相同，其次要性状可稍有差异。
二、细菌的命名构成：细菌的学名(scientific name)------拉丁文名
命名依据：国际细菌命名法则：双名法（林奈）
兽医微生物学
由“属名+种名”构成，用拉丁文表示，属名在前，
S（沉降系数） rRNA(核糖体RNA)
③16S rRNA碱基序列的相似性
兽医微生物学
细菌分类鉴定的特征和技术（一）形态学和生理生化特征
（二）血清学试验与噬菌体分型（三）氨基酸的顺序和蛋白质的分析（四）核酸的碱基组成和分子杂交
（一）形态学和生理生化特征
1．形态学特征
兽医微生物学
（1）细菌形态：形状、大小、排列（2）培养特征：菌落特征
（3）特殊结构：鞭毛、芽孢、荚膜、孢
子
（4）染色反应：革兰、抗酸
1．血清学试验
（二）血清学试验与噬菌体分型
兽医微生物学
细菌细胞与病毒等都含有蛋白质、脂白
蛋、脂多糖等有抗原性的物质，由于不
同微生物抗原物质结构不同，赋予它们
同的噬菌型和利用噬菌体裂解这样的特异性进
行细菌鉴定.
（三）氨基酸的顺序和蛋白质的分析
蛋白质是基因的产物,蛋白质的氨基酸顺
序直接反映mRNA顺序而与编码基因密切相关。
兽医微生物学
可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的
比较来分析不同生物系统发育关系 ,序列相似性越高,其亲缘关系愈近。
可以根据蛋白质的氨基酸序列资料构建系
兽医微生物学
新名称的发表
根据细菌命名法规的规定，有效发表新的细菌名称应在公开发行的刊物上进行。若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合格发表，也不能取得国际上的承认。发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。

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科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
着研究的深入科属的划分会发生变动
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1、属（genus）性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属，与其他属有明显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本单元，生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种。
3、菌株（strain）是不同来源的某一种细菌的纯培养物。
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二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界，现在划为：原核生物
古菌细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要地位
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2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、螺旋体、放线菌等→对动物和人具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
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细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并按照亲缘关系分类，以不同等级编排系统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法，称种系分类或自然分类。
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2、细菌命名：在分类基础上，给每种细菌一个科学名称，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则，确定细菌的分类地位。

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界 Kingdom (拉：Regnum)
门 Phylum (拉：Phylum))
纲 Class (拉：Classis)
目 Order (拉：Ordo)

科 Family (拉：Familia)

属 Genus（拉：Genus）

种 Species（拉：Species）
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
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四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型(phenotype)特征
形态染色培养细胞壁结构生理生化抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的
作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有
应用价值。
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2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据是细菌的种系发生关系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而确定分类地位。
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二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界，现在划为：原核生物
古菌细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要地位
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2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、螺旋体、放线菌等→对动物和人具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
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3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
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例如大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。

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1. 数值分类法
其分类范畴的基本单位是种，根据比较细菌在形态、生理和生化等方面的特性，计算出相似值来确定种的分类归属。
2．分子生物学分类法（种系发生）
1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定
（G+C）mol%含量：某一生物 DNA中的 G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的百分数。（反映该生物遗传性能的一种本质特征）。
大家应该也有点累了，稍作休息
大家有疑问的，可以询问和交 Nhomakorabea五、细菌种的划分和种以下的分类单位
(一) 种（Species) 种是生物分类的基本单位。凡属同种的生物，均具有共同的基本性状特征。它是生物在一定演化阶段，具有相对稳定的一定性状特征的实体。
(二) 种以下的分类单位
1.亚种(subspecies)：种内可能存在一些
细菌的分类与命名
二、细菌分类的指征
1. 形态学特性 2. 培养特性
3. 生活方式
4. 生理生化特性
5. 抗原构造
6. 对噬菌体的敏感性
7．对抗生素及其他化学物质的敏感性
8．病原性
9．遗传学特征。
三、细菌分类的方法
1、数值分类法 2．分子生物学分类法 3．血清学方法：共同抗原 4．化学分类法：比较细菌各种细胞成分
测定方法：梯度密度离心法、解链温度法 (Tm)等。
2）DNA或RNA同源性的测定
DNA-DNA杂交试验(hybridization)
原理：同源DNA单链或非同源DNA单链，只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互补的部分，就可产生不同程度的结合。
应用：通过在体外测定菌株间DNA的杂合率，据此推算出DNA的相似程度，判断它们在亲缘关系上的亲疏，帮助分类鉴定。

dl第7章细菌的分类与命名

第七章细菌的分类与命名
主讲：微生物学检验教研室
第七章细菌的分类与命名
第一节细菌的分类单位与命名
种、标准株双命名法
第二节细菌的分类方法
数值分类法
第一节细菌的分类单位与命名
一、细菌的分类单位
❖ 分类等级：界、门、纲、目、科、属、种 1）种：细菌分类的基本单位。生物学性状相同的细
菌群体构成一个种；同一菌种的细菌在某些方面有一些差异可分为亚种、亚种以下分型、亚型 2）株：不同来源的相同菌种称为菌株。其性状可以完全相同，也可有某些差异。具有某种细菌典型的生物学特征的菌株为该菌的标准株。标准株作为细菌分类、鉴定、命名、质量控制的依据和标准
B.stearothermophilus Bacillus.subtilis(Ehreberg) Cohn 1872（在细菌分类
单元的后面附上命名人的姓氏、命名年代，括号内为原命名人的姓氏。）
第二节细菌的分类方法
❖ 传统分类方法
以细胞壁的结构特点作为最高一级分类依据，按细胞形态、革兰氏染色性、鞭毛及生化特性作为较高一级分类依据
二、细菌的命名
❖ 举例：
芽孢杆菌属（Bacillus原意为小杆菌）中的几个种：枯草芽孢杆菌： Bacillus. subtilis 或 B.subtilis 蜡样芽孢杆菌： Bacillus.cereus 或 B.cereus 嗜热脂肪芽孢杆菌：Bacillus.stearothermophilus 或
第一节细菌的分类单位与命名
二、细菌的命名
❖ 双命名法：即种的学名。包括属名、种名加词。它们都是由拉丁文、希腊文或拉丁化的其他词组成，要求印刷成斜体或书写时在名称下划线。
1）第一个词是属名，单数主格名词或作为名词的形容词表示；第一个字母大写或缩写为大写的单个或几个字母表示

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细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并按照亲缘关系分类，以不同等级编排系统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法，称种系分类或种细菌一个科学名称，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则，确定细菌的分类地位。
❖ 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 ❖ 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分
组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium
perfringens） ▪ 属名在前，字首字母要大写，其余小写
▪ 整个属名及种名在出版物中应排成斜体
▪ 中文译名，种名在前，属名在后
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属名和种名之后，往往还要加上首次定名人（加括号）、现名定名人和现名定名年份，这些均用正体排字。 ▪ 一般兽医学及医学微生物学文献中，属名和种名之后的部分均予省略。 ▪ 如：Escherichia coli
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型(phenotype)特征
形态染色培养细胞壁结构生理生化抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据是细菌的种系发生关系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而确定分类地位。
3）rRNA寡核苷酸编目分析
金黄色葡萄球菌的学名为命名年份
Staphylococcus aureus Rosenbach
1884 属名葡萄球菌种名金黄色命名人的姓

细菌的分类与命名PPT资料(正式版)

为1
二、微生物的命名
微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创立的“双名法” 每一种微生物都用属与种命名，由2个拉丁词或希腊词或拉丁化了的其他文字组成。属名和种名用斜体表达属名在前，用拉丁名词表示微生物的构造、形态、某科学家名字等，描述微生物的主要特征。第一字母大写种名在后，第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等在种名后，附上命名者的姓和命名年份
蛋白质水平 mol%、生态分布等特征为主
鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。如放线菌中的链霉菌属内的种归为1
基因组水平真核生物：真菌、藻类、原虫
分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的后代即为分离物 2．培养特性：培养基上的表现，菌落特征生物变型——表示特殊的生化或生理特征《伯杰氏系统细菌学手册》如放线菌中的链霉菌属内的种归为1 第一字母大写种名在后，第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等在种名后，附上命名者的姓和命名年份
《伯杰氏系统细菌学手册》
Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) second edition 2001 以生理生化、G + C mol%、系统发育地位等为主——体现了现代分子生物学的研究成果尚未出齐
细菌的分类
一、细菌在生物中分类地位
目前公认“四界分类系统”
分类学的任务
分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中命名（Nomenclature）：是按照国际命名法规给予有机体一个科学的名称鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。

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dl第7章 细菌的分类与命名

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dl第7章细菌的分类与命名