细菌的分类与命名
细菌的分类与命名
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的某一株细菌
Salmonella sp.
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的若干菌株
Salmonella spp.
亚种用subsp.表示 表示 亚种用
Pasteurella multocida subsp. septica
第三节 细菌的分类体系
目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 描述了各个属的性状及属内各种的简明比较 。 “国际系统与进化微生物学杂志”（International 国际系统与进化微生物学杂志” Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSEM）是细菌分类命名的世界公认 ） 的权威期刊。 的权威期刊。
第四节 细菌的鉴定
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。 一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的 分子水平的 鉴定主要限于专业实验室或作研究之用 。 1.形态学检查：标本涂片镜检 形态学检查： 形态学检查 2.病原菌分离鉴定 病原菌分离鉴定 分离培养：一般 ℃ 分离培养：一般37℃ 16-24h 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 血清学试验
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。 细菌命名与书写的基本原则。
Escherichia coli 属名 种名 属名+种名 Salmonella pullorum (S. pullorum)
几种不同的书写情况： 几种不同的书写情况：
属名重复出现，可缩写 属名重复出现，
大肠杆菌）； 如：E.coli （大肠杆菌）；
S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌） 鸡白痢沙门氏菌）
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌得分类与命名细菌分类学细菌分类学（ｔaｘｏｎomy）就是指对细菌进行分类、命名与鉴定得一门学科。
它得任务就是在全面了解细菌得生物学特征得基础上,研究它们得种类，探索其起源、演化以及与其她类群之间得亲缘关系，进而提出能反映自然发展得分类系统，并将细菌加以分门别类.它包括三个方面：分类(claｓsificatiｏn）、命名（ｎomencｌature)与鉴定（iｄentiｆicatｉoｎ)。
一、基本概念1、细菌分类就是根据每种细菌各自得特征,并按照它们得亲缘关系分门别类,以不同等级编排成系统。
分类有两种:①以细菌得形态与生理生化特性为依据得表型特征分类法，包括有传统分类法（classicａｌclassｉｆｉcａｔiｏｎ)与数值分类法(numeｒiｃａl clasｓifｉcatｉｏn）;②用化学分析与核酸分析，以细菌大分子物质(核酸、蛋白质）结构得同源程度进行分类称种系分类(phylogenetic ｃｌassｉficaｔｉoｎ）或自然分类（natural cｌassfｉcａtioｎ）。
2、细菌命名在分类基础上,给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中相互交流成为可能。
按照细菌命名得法规，能保证所有得科研工作者以同样方式给予细菌命名。
3、细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置与已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌得分类地位。
若与已知细菌相同即采用已知菌得名称,不同者则按命名原则确定一个新名称。
二、分类等级细菌得分类等级与其她生物相同，依次为界(kinｇdom）、门(divｉsiｏn）、纲（cｌass）、目(order)、科(fａmilｙ）、属（genus）、种（species）。
细菌属于原核生物界（procarｙoｔae），包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体.分类等级拉丁字尾比较固定，表示方法如下:目—aｌeｓ、亚目-ｉneae、科-aceae、亚科—oideａae、族—eａe、亚族-inａe。
细菌的分类及命名[知识研究]
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着研究的深入科属的划分会发生变动
专业知识
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1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
专业知识
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一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名与鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细
专业知识
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例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
专业知识
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金黄色葡萄球菌的学名为：
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
专业知识
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3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用 第一个字母，为避免混肴，也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
专业知识
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5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
微生物的分类与命名
微生物的分类与命名微生物是指以肉眼不可见的微小形态存在的生物体，包括细菌、真菌、病毒等多种类型。
对微生物进行分类与命名是为了方便对其进行研究和了解其特性。
本文将介绍微生物的分类与命名，包括细菌、真菌和病毒的分类方法及相应的命名规范。
一、细菌的分类与命名细菌是最常见的一类微生物，广泛存在于自然环境中。
细菌的分类主要基于形态、生理特性、生长条件、代谢方式等多个方面。
1. 形态分类根据细菌的形态特征，可以将其分为球菌（cocci）、杆菌（bacilli）、弧菌（vibrios）、螺旋菌（spirilla）等类型。
其中，球菌为球状或椭圆状，杆菌为长形或短杆状，弧菌为弧形，螺旋菌为螺旋形。
2. 生理特性分类细菌的生理特性也是分类的重要指标之一。
比如，光合细菌（photosynthetic bacteria）能利用光合作用合成有机物质，厌氧细菌（anaerobic bacteria）能在缺氧条件下生存和繁殖。
3. 生长条件分类根据细菌的生长条件不同，可以将其分为嗜热菌（thermophile）、嗜酸菌（acidophile）、嗜盐菌（halophile）等类型。
嗜热菌适应高温环境，嗜酸菌适应酸性环境，嗜盐菌适应高盐浓度环境。
细菌的命名通常遵循国际细菌命名法规定的规范。
该规范要求使用拉丁文或拉丁化的词根作为细菌的属名（genus），并加上表征特定种类的表名（specific epithet）。
例如，大肠杆菌（Escherichia coli）中，“Escherichia”为属名，“coli”为表名。
二、真菌的分类与命名真菌是一类具有真核细胞结构的微生物，包括酵母菌和霉菌等。
真菌根据其生活方式、营养特性和菌丝形态等进行分类。
1. 营养分类真菌的营养方式主要分为 saprophytes（腐生菌）和 parasites（寄生菌）。
腐生菌通过分解死物质为自己提供营养，寄生菌则寄生于其他寄主生物体上。
2. 菌丝形态分类真菌的菌丝形态也是分类的依据之一。
细菌的分类与命名
细菌的分类方法
传统分类法是临床细菌学检验的基础和依据。这种分
类法的参考书是：
Bergey’s manual of systemic bacteriology
Manual of clinical microbiology
世界畅销书
Diagnostic microbiology
全国临床检验操作规程
中文教科书
标准菌株的用处
(1)标准菌株的典型特征是实验室菌株分 类和鉴定的依据，其种名也是实验室菌 株命名的依据。 (2)标准菌株是临床细菌学检验质量控制 的标准。 (3)在科研中，如涉及细菌，必须使用标 准菌株作为参考菌株或直接使用标准菌 株作为实验材料，否则论文不能公开发 表或不能参加科研成果评定。
2．细菌的命名
(2)数值分类法：分类标记不分主次，而是同等重要看
待（等重要原则）。一般要选用50项以上的生物学特
征作为分类的依据，此分类法是细菌鉴定仪器化、自
动化、电算化的基础和原则，此法称数值分类法。
2．遗传学分类法：CDC分类系统
(1)DNAG+Cmol%测定：用加热变性法测定 两株菌G+Cmol%鉴别 1)不同属:两株菌DNAG+Cmol%相差1015%及以上 2)同属:两株菌DNAG+Cmol%之差<10-15% 3)同种不同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 ≤4-5% 4)同种同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 <2%
因为细菌的分类常使用科、属、种、型等分类单位，
细菌的科、属、种、型的数量大，为满足细菌分类需
要，常要求对细菌的科、属、种等进行命名，如
沙门
福氏志贺菌
志贺菌属 鲍特志贺菌
细菌的分类及命名
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球菌 杆菌
葡萄球菌 链球菌 粪肠球菌 微球菌
产芽胞
梭菌 芽胞杆菌 炭疽杆菌
抗酸染色阳性
分支杆菌
牛分支杆菌和禽分支杆菌 鼠麻风杆菌 副结核分支菌
无芽胞
抗酸染色阴性
棒状杆菌 化脓放线菌 马红球菌
产单核李氏杆菌
猪丹毒杆菌
丝状或树枝状
MZN染色阴性
牛放线菌 粘性放线菌
MZN染色pp阳t课件性完整
星形奴卡菌 刚果嗜皮菌
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随
着研究的深入科属的划分会发生变动
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1、属（genus）性状相近、关系密切的若 干菌种组成一个菌属，与其他属有明显 差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3、菌株（strain）是不同来源的某一种 细菌的纯培养物。
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1、分类方法 数值分类法：根据细菌的各种性状的数值
分析，借助计算机，将拟分类的细菌按其 性状的相似程度归类定位。
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在进行数值分类时
需要选择分类单位（菌株、种或属）→将 性状编码→按公式计算出相似度（S矩阵） →进行系统聚类→画出相似矩阵图→最后 转绘树状普（dendrogam）
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5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
细菌的分类单位、系统及命名
（一）细菌的分类单位细菌的分类等级（分类单位）和其他生物相同，为界、门、纲、目、科、属、种。
临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。
种是细菌分类的基本单位。
形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成属；相近的属归为科，依次类推。
在两个相邻等级之间可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属、亚种等。
同一菌种不同来源的细菌称该菌的不同菌株。
它们的性状可以完全相同，也可以有某些差异。
具有该种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准菌株，在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据，标准菌株也可作为质量控制的标准。
（二）细菌的命名国际上一个细菌种的科学命名采用拉丁文双命名法，由两个拉丁字组成，前一字为属名，用名词，首字母大写；后一字为种名，用形容词，首字母小写，印刷时用斜体字。
中文译名则是以种名放在前面，属名放在后面。
例如：Mycobacteriumtuberculosis（结核分枝杆菌），Salmonellatyphi（伤寒沙门菌）等。
有时某些常见的细菌也可用习惯通用的俗名，如Tuberclebacillus（结核杆菌）、Typhoidbacillus（伤寒杆菌）等。
（三）细菌的分类系统细菌分类系统有多种，为了便于文献资料的相互比较、分析和交流，目前国际上普遍采用伯杰分类系统。
也有采用CDC（美国疾病预防和控制中心）分类系统。
包括有细菌的鉴定以及细菌分类资料。
目前以细菌细胞壁的结构特点作最高一级分类依据，将原核生物界分为4个菌门；薄壁菌门、坚壁菌门、软壁菌门和疵壁菌门。
微生物检验知识之细菌的分类与命名
微生物检验知识之细菌的分类与命名微生物检验知识之细菌的分类与命名细菌如何分类你知道吗?你对细菌的分类了解吗?下面是yjbys店铺为大家带来的关于细菌的分类的知识，欢迎阅读。
一、微生物在生物化学分类中的地位(一)细菌与原核生物界细菌、衣原体、立克次体、螺旋体、放线菌、支原体归属于原核生物界其分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种(二)真菌与真菌界真菌是真核细胞型微生物，归属真菌界(三)病毒与病毒界病毒没有典型的细胞结构，归属于病毒界病毒的`分类等级依次为科、属、种二、细菌的分类单位、系统和命名(一)细菌的分类单位细菌的分类等级为界、门、纲、目、科、属、种。
临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。
种是细菌分类的基本单位。
形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种;性状相近、关系密切的若干菌种组成属;相近的属归为科，依次类推。
标准菌株：具有该种细菌典型特征的菌株在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据标准菌株也可作为质量控制的标准(二)细菌的命名采用拉丁文双命名法：属名 (名词大写) + 种名 (形容词小写)(印刷用斜体)例: Mycobacterium tuberculosis中文名: 种名 + 属名例: 结核分枝杆菌(三)细菌的分类系统目前国际上普遍采用伯杰分类系统。
也有采用CDC(美国疾病预防和控制中心)分类系统。
三、细菌的分类方法(一)生理学与生物化学分类法1.传统分类法原则：生物的基本性质主次原则。
按细胞形态、革兰染色性、鞭毛及代谢特点作为较高一级分类依据。
科、属、种的分类主要依靠生化特性和抗原结构。
2.数值分类法原则：细菌的基本性质同等重要原则采用标准化、成品化和配套生化反应试剂条，检测细菌的数十个生理生化特性。
阴阳性结果—数字—电子计算机进行计算—比较、测定相似度—区分细菌的种群—确定细菌亲缘关系(二)遗传学分类法以细菌的核酸、蛋白质等在组成上的同源程度分类。
目前较为稳定的遗传学的分类方法有下列几种：1.DNA G+C mol测定，简称G-C比。
细菌的分类与命名
志”（IJSEM）原名“国际系统细菌学杂志” （IJSB）发表，如在其他杂志发表，必须提
交论文副本给该杂志公布，两年后无异议，
所提出的新细菌名称才能生效。
第二节 细菌的命名
• 细菌的命名依据国际细菌命名法规采用 “双名法”命名。即用“属名”加“种名” 来表示一个生物的学名。
• 书写时“属名”在前，用拉丁文或拉丁化 的名词表示，且第一个字母大写；“种名” 在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词 所有格，小写。译成中文时，种名在前， 属名在后。
最重要和最基本的分类单元
• 在微生物分类中种是最重要和最基本 的分类单元，相似的种划归到一起构 成属，相似属构成科，依此类推，最 高的分类单元为界。
• 目前科和科以上的划分在细菌学中还 不太完善，而且随着研究的深入，科、 属的划分还会发生变动。
三、种和种以下分类单位及含义
1、种（species）
第1卷 一般医学和工业方面重要的G-细菌（1984年） 第2卷 放线菌以外的G＋细菌（1986年） 第3卷 古细菌、蓝细菌及其他G－细菌（1989年） 第4卷 放线菌（1989 年）
• 从2001年开始发行第2版，共分5卷，计划在数 年内出齐，内容将反映分子水平的细菌分类。
• 该书的姐妹篇是“伯吉氏细菌鉴定手册”
目前分类主要的依据 • 主要是根据种系发生关系，即分析其 基因的同源性，从而确定分类地位。 方法主要采用三种： 测定DNA分子中碱基(G+C)mol% 核酸分子杂交 16SrRNA寡核苷酸编目
五、细菌的分类体系
• 《伯吉氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual of Systematic Bacterology），由美国细菌学家Holt 主编，共四卷：
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2．分子生物学分类法 （种系发生） 1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定 （ G+C ） mol% 含量：某一生物 DNA 中的 G+C 配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的 百分数。（反映该生物遗传性能的一种本 质特征）。 测定方法：梯度密度离心法、解链温度法 (Tm)等。
2）DNA或RNA同源性的测定 DNA-DNA杂交试验(hybridization) 原理：同源DNA单链或非同源DNA单链， 只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互 补的部分，就可产生不同程度的结合。 应用：通过在体外测定菌株间 DNA 的杂 合率，据此推算出 DNA 的相似程度，判 断它们在亲缘关系上的亲疏，帮助分类 鉴定。
3）rRNA的分析 rRNA 在遗传信息传递中起重要作用， 特别是16S rRNA能反映各种细菌间在 系统发生方面的关系。从该rRNA的碱
基序列可绘制系统发生树。
四、细菌的分类体系
细菌分类有三个主要体系
前苏联、法国、美国
《）。并于1994年 出版了《伯杰氏鉴定细菌学手册》第9 版，将细菌门分为33个部分，其中与兽 医学和医学有关的计13个部分。
3.菌株(strain)（品系）：是指同种细菌 中不同来源的纯培养物。
具有典型特征的菌株称为典型株或代
表株或标准株。
不同菌株可能性状完全相同，也可能
有某种微小差异。
六、细菌的命名 “双名法”命名（国际细菌命名规约） 由属名和种名两部分组成。属名（第一 字母大写）在前，种名在后。均用拉丁 文或拉丁化的文字表示。 翻译时，种名在前，属名在后。 如Staphylococcus aureus 未确定种名的细菌命名 ：在属名后加 上sp.或spp.。 新种的命名：在学名之后加注sp. nov. （novo species）。 亚种的命名：subsp.
五、细菌种的划分和种以下的分类单位 (一) 种（Species)
种是生物分类的基本单位。凡属同种 的生物，均具有共同的基本性状特征。 它是生物在一定演化阶段，具有相对稳 定的一定性状特征的实体。
(二) 种以下的分类单位 1.亚种(subspecies)：种内可能存在一些
在某些性状上相互差异的类别。 2.型(type)与亚型(subtype)：仅仅是某一 方面的性状， 如血清型。型内还可按 进一步的性状差异区分为不同亚型。
4. 生理生化特性
5. 抗原构造
8．病原性
6. 对噬菌体的敏感性
9．遗传学特征。
7．对抗生素及其他化学物质的敏感性
三、细菌分类的方法 1、数值分类法 2．分子生物学分类法 3．血清学方法： 共同抗原
4．化学分类法：比较细菌各种细胞成分
1. 数值分类法 其分类范畴的基本单位是种，根 据比较细菌在形态、生理和生化 等方面的特性，计算出相似值来 确定种的分类归属。
第六章 细菌的分类与命名
一、生物的分类
六界：动物界、植物界、真菌界、
原生生物界、原核生物界、病毒界。
细菌分类层次与其他生物相同，即：
界 、 门 、 纲 、 目 、 科 (Family) 、 属 (Genus)、种(Species)。
二、细菌分类的指征
1. 形态学特性
3. 生活方式
2. 培养特性