细菌的分类与命名

细菌的分类方法
传统分类法是临床细菌学检验的基础和依据。这种分
类法的参考书是：
Bergey’s manual of systemic bacteriology
Manual of clinical microbiology
世界畅销书
Diagnostic microbiology
全国临床检验操作规程
中文教科书
标准菌株的用处
(1)标准菌株的典型特征是实验室菌株分 类和鉴定的依据，其种名也是实验室菌 株命名的依据。 (2)标准菌株是临床细菌学检验质量控制 的标准。 (3)在科研中，如涉及细菌，必须使用标 准菌株作为参考菌株或直接使用标准菌 株作为实验材料，否则论文不能公开发 表或不能参加科研成果评定。
2．细菌的命名
(2)数值分类法：分类标记不分主次，而是同等重要看
待（等重要原则）。一般要选用50项以上的生物学特
征作为分类的依据，此分类法是细菌鉴定仪器化、自
动化、电算化的基础和原则，此法称数值分类法。
2．遗传学分类法：CDC分类系统
(1)DNAG+Cmol%测定：用加热变性法测定 两株菌G+Cmol%鉴别 1)不同属:两株菌DNAG+Cmol%相差1015%及以上 2)同属:两株菌DNAG+Cmol%之差<10-15% 3)同种不同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 ≤4-5% 4)同种同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 <2%
因为细菌的分类常使用科、属、种、型等分类单位，
细菌的科、属、种、型的数量大，为满足细菌分类需
要，常要求对细菌的科、属、种等进行命名，如
沙门
福氏志贺菌
志贺菌属 鲍特志贺菌
微球菌科
微球菌属 藤黄微球菌 玫瑰微球菌 金黄色葡萄球菌
葡萄球菌属 表皮葡萄球菌
细菌种的命名
（二）细菌的分类方法
1.形态学、生理生化学和免疫血清学分类方法 此方法是按照细菌形态学、生理生化学和免疫 血清学的生物学性状（分类标记）进行分类或 分类鉴定。 (1)传统分类法：传统分类的原则是将一些分 类标记分为主要的和次要的，分类的各级都有 一定的主要和次要的分类标记，分类或鉴定时 以主要和次要标记(主次原则)，从高一级到低 一级逐级分类或鉴定，直到种。临床细菌科、 属、种的分类(鉴定)主要依靠生化特征和抗原 结构。
遗传学分类法
(2)核酸同源值测定：用核酸杂交技术测定两株的
DNA相似度和亲缘关系，即测定同源性。
两株菌DNA同源值鉴别
DNA杂交率(结合率,同源值) 同源性 菌种鉴别
100%
高度同源性 相同菌
80-90%
高度同源性 同种同亚种
60-70%
大部同源 同种不同亚种
20-60%
部分同源 同属不同种
<20%
三、细菌的分类方法
细菌的特征很多，细菌的哪些特征可以作为分类的依 据（分类标记）？细菌的分类方法是什么？这是临床 检验人员必须弄清楚的问题。 （一）细菌的分类标记 1．形态学分类标记：形态、大小、革兰染色性、抗酸 染色性、特殊结构（芽胞、荚膜、鞭毛） 2．生理学分类标记：营养条件、生长因子、生长条件 （气体、温度、pH）、生长情况（固体培养基—菌落 特点，液体和半固体培养基的生长情况）等。
细菌的分类与命名
细菌的分类单位
（菌）株也是常使用的名词，但不是分类单位。 （菌）株：指同一菌种不同来源的细菌或者仅 指不同来源的细菌（不论其科别、属别、种别） 实验室菌株：指某一实验室从标本中分离出的 细菌，实验室需要鉴定到种或型。 标准菌株：具有种典型特征的并公认的该种细 菌，称为该种菌的标准菌株。
细菌种的命名
细菌种的学名一般只有一个，如学名发 生改变必须注明原有学名。 细菌学名的应用： ①细菌检验必须使用细菌学名。 ②科研论文必须使用细菌学名。 ③生产菌种要尽量应学名。
细菌种的命名
(2)俗名：习惯名，一般用一个名词或一个形 容词命名。在名词或形容词后面加菌即成。名 词可以是地名、动物名、病名、人名等。如李 斯特菌、肠炎杆菌、鼠伤寒沙门菌。 型的命名：属名+种名+型名 型名可以是数字、地名、人名、动物名等。如 霍乱弧菌ElTor型，福氏志贺菌2a型。
细菌的种的名称一般有学名和俗名两种。 (1)学名：按林奈氏双名法命名（拉丁语的双 命名法），即属名+种名。属名在前，用名词， 首字母大写；种名在后，用形容词，首字母小 写，用斜体字；属名可用第一个字母大写代表。 学名中文译名是种名在前，属名在后。 细菌种的学名命名是十分慎重，一般经细菌分 类学家提出名称（提案），经国际系统细菌学 杂志发表得到世界公认后，由国际细菌命名委 员会裁定、编组、分类和公布，再由菌名批准 目录刊行才能应用。
（二）细菌的分类系统
细菌的分类系统是关于细菌“目”、科、属、种、 型的分类以及各目、各科、各属、各种、各型的 特征（分类依据）的描述，因此细菌的分类系统 是细菌分类和临床细菌分离培养和鉴定的依据， 对于临床细菌检验十分重要，目前国际上普遍采 用的细菌分类系统是伯杰（Bergey）分类系统， 叙述这一系统的权威书籍是伯杰系统细菌学手山 （Bergey’s Maunal of Systemic Bacgeriology）。此外，也采用CDC分类系统。 CDC即美国疾病控制和预防中心的缩写（Center for disease control and prevention, CDC）
细菌分类标记
3．生物化学分类标记：对糖类、有机酸、蛋 白质、氨基酸等的利用种类及其分解代谢产物， 合成代谢产物（酸、毒素、特殊有机物）的种 类 4．免疫血清学分类标记：抗原和抗原结构 5．遗传学分类标记：DNA G+Cmol%、 DNA碱基序列、核蛋白体RNA碱基序列、 DNA基因组、核酸杂交率等。
非同源性 不同属
遗传学分类法
(3)核酸碱基序列测定：用仪器测定核酸 碱基序列比较两菌DNA或rRNA的相似 性。 (4)基因芯片技术：一种新型的核酸杂交 技术，可以大规模地测定核酸基因级差 异和碱基序列。
谢谢