分子生物学 基因与蛋白质组学
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1.什么是SNP?试述研究SNP的意义。
单核苷酸多态性(SNP)---由基因组DNA上的单个碱基的变异引起的DNA序列多态性。
包括置换、颠换、缺失和插入。从理论上来看每一个SNP位点都可以有4种不同的
变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2:1。SNP在CG
序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T,原因是CG中的C常为甲基化的,自发
地脱氨后即成为胸腺嘧啶。
SNPs的研究意义:
①具有已知性、可遗传性、可检测性,用于疾病基因的定位、克隆和鉴定。寻找疾病相关的
突变位点,发展疾病预防策略。
②研究SNP本身对机体的影响,尤其是疾病的易感性、个性化医疗。通过对药物靶点个体
差异性分析,个性化药物、方法治疗。SNP可以作为新的“遗传标志”,人体许多表型
差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。
③法医学研究。人类基因组是一个结构十分稳定的体系,同时又是一个变异的体系。在长期的进化过程中,基因组DNA的序列不断发生变异。这些变异有些被保存下来,导致了不同种族、群体和个体间基因组的差异和多态性,除同卵双生子外,没有两个个体基因组是完全相同的。
④器官移植中供体/受体配对分析。预测启动子SNP位点与转录因子结合的改变,编码区SNP 对蛋白质的空间结构,生物功能的影响等。
⑤人类基因组计划。人类基因组单体型图谱的逐渐绘制完成,提供了详尽的人类DNA序列
的变异信息,对人类个体遗传背景的研究提供了强大的机遇和挑战。
2.简述蛋白质组学研究中,蛋白质分离常用的方法及其原理。
⑴双向凝胶电泳:其基本原理是:先将蛋白质根据其等电点在pH梯度胶内进行等电聚焦,
即按照它们等电点的不同进行分离。然后按照它们的相对分子质量大小进行SDS-PAGE
第二次电泳分离。样品中的蛋白经过等点电和分子质量的两次分离后,可以得到分子的等
电点、分子质量和表达量等信息。
⑵液相色谱法(LC)
对在双向电泳中难以分离鉴定的高分子量、低分子量、极酸性、极碱性和疏水性强的
蛋白进行有效的分离鉴定。
液相色谱分离系统由两相---固定相和流动相组成。液相色谱的固定相可以是吸附剂、
化学键合固定相、离子交换树脂或多孔性凝胶;流动相是各种溶剂。被分离混合物由流动
相液体推动进入色谱柱。根据各组分在固定相及流动相中的吸附能力、分配系数、离子交
换作用或分子尺寸大小的差异进行分离。色谱分离的实质是样品分子与溶剂以及固定相分
子间的作用,作用力的大小,决定色谱过程的保留行为。
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