RTPCR和western Blot
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一、RT-PCR步骤RNA提取(-70℃保存)
1. 组织剪碎加入1ml Trizol,冰上匀浆(边匀浆边暂停)
2. 转入一新EP管中(1.5ml),室温保存5min
3. 加氯仿0.2ml,振荡混合(手摇剧烈),室温放置5min
4. 10000 rpm 4℃离心15min
5. 转移上层水相(吸70%)到一新EP管中,加异丙醇0.5ml,振荡混合,室温保存10min
6. 12000rpm 4℃离心15min
7. 倒掉上清,加1ml 75%无水乙醇(4℃保存),振荡混合,10000rpm 4℃离心5min
8. 倒掉上清,室温或37℃放置20min(EP管倒置在滤纸上)使RNA沉淀干燥
9. 加20ul DEPC水至EP管中
10. 在60℃孵育3-5min(或手握3-5min),使RNA充分溶解测RNA浓度
二、上机操作
1.10ul的反应体系,冰上操作,稍后短时间离心
Template 1ul
Primer 1 3ul
Primer 2 3ul
Master 5ul
ddH2O 补至10ul
2.PCR循环:
Stage1:预变性
95℃30s
Stage2:PCR反应
95℃5s
60℃20s
40 Cycles
2.3 Western Blot检测蛋白变化
2.3.1 蛋白样品制备
2.3.1.2 裂解蛋白
1)适量组织(最好放入液氮中反复研磨成粉状)加入裂解液中。一般100mg组织加1mlRIPA+10ulPMSF
2) 将组织匀浆转入1.5ml的EP管中(eppendorf 管、离心管)。12000r/min 4℃离心15min。离心后EP管中液体分三层,提取中间无色液相,移入新的EP管中。可-80℃保存。
2.3.1.3 蛋白浓度测定及蛋白样品制备
1) 分别向5 个1.5ml 的EP 管中加入无菌水800μl;然后加入BSA(2mg/ml)标准蛋白,分别为0、1、2、4、8μl;
2) 向0.5ml 的EP 管中加入400μl无菌水,然后加入1μl 蛋白样品;
3) 向标准管和样品管中分别加入200μl和100μl 蛋白染液;
4) 上下颠倒混匀EP管中的溶液;
5) 从每管中取出200μl 混合液加入96 孔板内中;
6) 使用酶标仪测定吸光值;
7) 依据标准蛋白吸光值绘制蛋白标准曲线,然后计算出蛋白样品的浓度;
8) 制备一定质量的蛋白样品,进行Western Blot检测;
9) 蛋白样品95℃变性5min,保存在-20℃的冰箱在或直接进行SDS凝胶电泳。
2.3.2 SDS-PAGE
2.3.2.1制胶
根据配方配制所需的12%分离胶和5%浓缩胶。
2.3.2.2 灌胶
10) 清洁玻璃板,然后固定于制胶器中,用水检测是否密封,然后开始灌胶;
11) 加入12%分离胶7 ml,再加入水饱和正丁醇200 μl消泡并隔绝空气。,等一段时间后分离胶凝固,倒出正丁醇,去离子水冲洗净残留的正丁醇,加入5%浓缩胶并插入与玻璃板规格匹配的梳子;
12) 浓缩胶凝固后,小心拔出梳子,待用。
2.3.2.3 上样
将样品在95℃下变性5 min,然后加入到加样孔中,电泳槽中的缓冲液是1×Running Buffer。
2.3.2.4
90 V电压下样品被压缩到浓缩胶与分离胶的分界处,然后将电压提高为120 V,当溴酚蓝跑至玻璃板边缘处停止电泳。
2.3.3 转膜
1) 根据胶的大小裁剪PVDF膜并做好标记,使用前甲醇活化1 min;
2) 将转膜使用的滤纸、垫子、夹子以及活化好的PVDF膜浸泡在转膜缓冲液中。
3) 从电泳槽中拿出玻璃板并用切胶器撬开,去掉浓缩胶以及多余的分离胶部分,将剩下的分离胶移入转膜缓冲液中;
4) 在转膜的夹子上,先放垫子,然后滤纸,再在滤纸上放胶、最后PVDF正面盖上胶,用切胶器去除PVDF膜和胶之间的气泡,然后再盖上滤纸和垫子,合上夹子,放进转膜槽中,加适量-20℃预冷的转膜缓冲液。电压150 V转膜2-3 h,期间转膜槽需冰浴,避免转膜过程产热影响转膜效果;
5) 转膜结束后用镊子取出PVDF膜,丽春红染色,观察转膜效果,然后用1×PBS-T脱色。
6) 5%脱脂奶粉溶液封闭PVDF膜,摇床上缓慢摇动孵育1h后,倒掉脱脂奶粉溶液,1×PBS-T洗PVDF膜,5 min/次,洗三次;
2.3.4 免疫反应
1) 用一抗稀释液孵育PVDF膜,在4℃冰箱中,摇床上缓慢摇动孵育过夜;
2) 回收一抗溶液,然后用1×PBS-T洗膜,10 min/次,洗2次;
3) 将膜置于3%脱脂奶粉稀释的二抗溶液中孵育1 h,弃二抗,1×PBS-T液洗膜,10 min/次,洗3次;
2.3.5显影:
等体积混合Millipore Immobilon Western 化学发光HRP底物A液和B液,将PVDF膜浸在液体,孵育5 min,然后用保鲜膜包好,用吸水纸吸去残余液体,膜正面朝上固定在压片夹中,暗室中将感光胶片放入压片夹中,适当时间后,取出胶片放入显影机中显影。