pAAV-hSyn-EGFP腺病毒载体说明(图)
活体实验的利器:AAV腺相关病毒来了!
活体实验的利器:AAV腺相关病毒来了!
“AAV”是“Adeno-associated virus”,也即是腺相关病毒的缩写。
AAV病毒是一种理想的外源基因导入细胞的工具,无法自主进行复制,安全性高。
AAV病毒直径只有20-30 nm(慢病毒直径90-110 nm),相对容易穿透血脑屏障,在活体注射实验上有更大优势。
相对地,AAV能包装的基因片段也比慢病毒小,通常能包装3kb 以下的基因片段。
不同病毒的生物学特性比较
不同血清型AAV的组织嗜亲性
AAVPrime™ 腺相关病毒颗粒
12种血清型可选
预制腺相关病毒颗粒折后低至1190元
直接用于活体实验
定制包装服务范围:ORF cDNA, shRNA, CRISPR sgRNA,SaCas9
高滴度:纯化型AAV病毒滴度高达10^14 GC/ml (genome copies/ml)
*AAV克隆可选启动子
CMV, EF-1α, CAG, CBh, CAMKlla, hSYN, MHC
*AAV对照颗粒选择
GFP, IRES-GFP, LacZ, CRE, mCherry, FLuc, GLuc
AAV应用
可用于基因过表达,敲低,敲除的体内或体外实验。
pAAV-hSyn-RFP腺病毒载体说明(图)
pAAV-‐hSyn-‐RFP编号 载体名称 北京华越洋VECT10040 pAAV-‐hSyn-‐RFPpAAV-‐hSyn-‐RFP载体基本信息:载体名称: pAAV-‐hSyn-‐RFP质粒类型: 腺病毒载体;荧光报告载体高拷贝/低拷贝: 高拷贝克隆方法: 限制性内切酶,多克隆位点启动子: human S ynapsin 1载体大小: 5909 b p5' 测序引物及序列: -‐-‐3' 测序引物及序列: SP6 5'ATTTAGGTGACACTATAG 3'载体标签: -‐-‐载体抗性: 氨苄青霉素筛选标记: 红色荧光蛋白DsRedExpress克隆菌株: Stbl3 或 NEB S tble宿主细胞(系): 神经细胞备注: pAAV-‐hSyn-‐RFP载体含有human s ynapsin 1 启动子,适合在神经细胞中表达。
稳定性: 稳表达组成型/诱导型: 组成型病毒/非病毒: 腺病毒pAAV-‐hSyn-‐RFP载体质粒图谱和多克隆位点信息:pAAV-‐hSyn-‐RFP载体序列:ORIGIN1 G TGGATAACC G TATTACCGC C TTTGAGTGA G CTGATACCG C TCGCCGCAG C CGAACGACC61 G AGCGCAGCG A GTCAGTGAG C GAGCGAGCG C GCAGAGAGG G AGTGGCCAA C TCCATCACT 121 A GGGGTTCCT T GTAGTTAAT G ATTAACCCG C CATGCTACT T ATCTACGTA G CCATGCTCT181 A GAGGATCCT T CGAAAAGCT T CTGCAGAGG G CCCTGCGTA T GAGTGCAAG T GGGTTTTAG 241 G ACCAGGATG A GGCGGGGTG G GGGTGCCTA C CTGACGACC G ACCCCGACC C ACTGGACAA 301 G CACCCAACC C CCATTCCCC A AATTGCGCA T CCCCTATCA G AGAGGGGGA G GGGAAACAG 361 G ATGCGGCGA G GCGCGTGCG C ACTGCCAGC T TCAGCACCG C GGACAGTGC C TTCGCCCCC 421 G CCTGGCGGC G CGCGCCACC G CCGCCTCAG C ACTGAAGGC G CGCTGACGT C ACTCGCCGG 481 T CCCCCGCAA A CTCCCCTTC C CGGCCACCT T GGTCGCGTC C GCGCCGCCG C CGGCCCAGC541 C GGACCGCAC C ACGCGAGGC G CGAGATAGG G GGGCACGGG C GCGACCATC T GCGCTGCGG 601 C GCCGGCGAC T CAGCGCTGC C TCAGTCTGC G GTGGGCAGC G GAGGAGTCG T GTCGTGCCT 661 G AGAGCGCAG T CGAGGCGCG C CGAGCTCGG A TCCTGAGAA C TTCAGGGTG A GTCTATGGG 721 A 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pShuttle-‐CMVpAAV-‐Syn-‐Rluc pAAV-‐hSyn-‐RFPpAAV-‐CMV-‐iRFP pAAV-‐UbCpDC415 pAAV-‐CAG-‐FlucpAAV-‐LacZ pNTAP-‐Shuttle-‐BpDC316 pDC516pAAV-‐CA pDC416pNTAP-‐Shuttle-‐C pDC311pDC512 pAAV-‐hrGFPpDC411 pAAV-‐RCpAdTrack pacAd5 C MVK-‐NpA pAdEasy-‐1 pDC315pAAV-‐MCS pShuttlepHelper pBApo-‐CMV-‐neo pShuttle-‐CMV-‐lacZ pBApo-‐CMVpAAV-‐TRE-‐Syn-‐Fluc pBApo-‐CMV-‐PurpAAV-‐minCMV-‐mCherry。
2021年真核细胞常见表达载体
真核细胞常见表达载体欧阳光明(2021.03.07)真核细胞, 表达载体1、pCMVp-NEO-BAN载体特点:该真核细胞表达载体分子量为6600碱基对,主要由CMVp启动子、兔β-球蛋白基因内含子、聚腺嘌呤、氨青霉素抗性基因和抗neo基因以及pBR322骨架构成,在大多数真核细胞内都能高水平稳定地表达外源目的基因。
更重要的是,由于该真核细胞表达载体中抗neo基因存在,转染细胞后,用G418筛选,可建立稳定的、高表达目的基因的细胞株。
插入外源基因的克隆位点包括Sal1、BamH1和EcoR1位点。
注意在此载体中有二个EcoR1位点存在。
2、pEGFP, 增强型绦色荧光蛋白表达载体(Enhanced Fluorecent Protein Vector)特点: pEGFP表达载体中含有绿色荧光蛋白,在PCMV启动子驱动下,在真核细胞中高水平表达。
载体骨架中的SV40origin使该载体在任何表达SV40 T抗原的真核细胞内进行复制。
Neo抗性盒由SV40早期启动子、Tn5的neomycin/kanamycin抗性基因以及HSV-TK基因的聚腺嘌呤信号组成,能应用G418筛选稳定转染的真核细胞株。
此外,载体中的pUC origin 能保证该载体在大肠杆菌中的复制,而位于此表达盒上游的细菌启动子能驱动kanamycin抗性基因在大肠杆菌中的表达。
用途: 该表达载体EGFP上游有Nde1、Eco47111和Age1克隆位点,将外源基因扦入这些位点,将合成外源基因和EGFP的融合基因。
借此可确定外源基因在细胞内的表达和/或组织中的定位。
亦可用于检测克隆的启动子活性(取代CMV启动子,Acet1-Nhe1)。
3、pEGFT-Actin, 增强型绿色荧光蛋白/人肌动蛋白表达载体特点:pEGFP-Actin表达载体中含有绿色荧光蛋白和人胞浆β-肌动蛋白基因,在PCMV启动子驱动下,在真核细胞中高水平表达。
载体骨架中的SV40origin使该载体在任何表达SV40 T抗原的真核细胞内进行复制。
腺病毒载体AVV的作用
腺病毒载体AVV的作用
典型的腺病毒载体系统如:穿梭质粒pCA13/腺病毒基因组质粒pBHG11/包装细胞293细胞。
pCA13/的HCMV IE啟动子-多克隆位点-SV40 AN(poly A)构成外源基因的表达盒,该表达盒的插入使腺病毒E1基因缺失,但是保留其两端侧翼序列(左侧的1~3bp的ITR,右侧从3.5kb到末端的维持病毒装配和活力的蛋白IX的基因),也保留了腺病毒的包装信号φ(194~358bp);pBHG11则保留了腺病毒基因组的绝大部分,但是缺失了包装信号φ、0.5~3.7图距(mu)部分的E1区、77.5~86.2mu的E3区,293细胞是整合有Ad5 E1基因的人胚肾细胞系。
pBHG11因為缺失包装信号及E1区而不能复制,pCA13带有包装信号及E1的侧翼序列,但是缺失E1区及腺病毒绝大部分基因组,同样不能复制。
外源目的基因插入pCA13后,与pBHG11共转染,进入293细胞。
pCA13与pBHG11在细胞内发生同源重组,同时,293细胞提供E1蛋白,从而包装產生腺病毒颗粒。
该病毒的蛋白质外壳同野生型腺病毒相似,具有同样的感染力进入靶细胞的能力,但是基因组DNA的E1区被外源目的基因取代,即进入靶细胞后病毒不能复制,但可以表达目的蛋白。
腺相关病毒操作手册--汉恒生物
汉恒生物科技(上海)有限公司 400‐092‐0065 1汉恒生物---腺相关病毒操作手册一、腺相关病毒(Adeno-Associated Viral Vector ,AAV )简介腺相关病毒属微小病毒科( parvovirus),为无包膜的单链线状 DNA 病毒。
AA V 的基因组约 4700bp ,包括上下游两个开放读码框架(ORF),位于分别由 145 个核苷酸组成的2个反向末端重复序列(ITR)之间。
基因组中有 3 个启动子(P5、P19 和 P40) 和 2 个开放阅读读框(ORF),rep 和 cap ,如图 1 所示。
rep 编码 4 个重叠的多功能蛋白,即 Rep78、Rep68、Rep52 和 Rep40,其中 Rep78 与 Rep68 参与 AA V 的复制与整合,Rep52 和 Rep40 具有解螺旋酶和 ATP 酶活性,与 Rep78、Rep68 共同参与单链基因组的复制;cap 编码的 VP1、VP2、VP3是装配成完整病毒所需要的衣壳蛋白,它们在 AA V 病毒整合、复制和装配中其重要作用。
图 1. AA V 基因组结构二、腺相关病毒的优点1. 安全性高:迄今从未发现野生型A A V 对人体致病,重组A A V 基因组序列上去除了大部分的野生型A A V 基因组元件,进一步保证了安全性;2. 免疫原性低:AA V2 的基因组仅 4681 个核苷酸,便于用常规的重组 DNA 技术进行操作,而且进行动物实验时造成的免疫反应小;3. 宿主范围广:能感染分裂细胞和非分裂细胞;4. 表达稳定:能介导基因的长期稳定表达;5. 物理性质稳定:在60℃不能被灭活,能抗氯仿;三、重组腺相关病毒载体系统简介汉恒生物科技(上海)有限公司 400‐092‐0065 2AAV 是一种复制缺陷型微小病毒,其增殖复制需要腺病毒或疱疹病毒的辅助。
AAV 无辅助病毒系统(AAV Helper-Free System )可以在无辅助病毒的条件下生产出重组腺相关病毒。
腺病毒载体的分类及包装方法
腺病毒载体的分类及包装方法1.腺病毒载体分类第一代腺病毒载体:指E1或E3基因缺失的腺病毒载体。
特点:(1)外源基因容量为6.5-8Kb;(2)适用于大多数基因治疗,且容易获得高滴度的病毒;(3)可用于表达重组蛋白质或将外源基因导入对其他转染方法不敏感的细胞株中;(4)若未经纯化使用,容易引发机体产生强烈的炎症反应和免疫反应,纯化后可安全使用。
第二代腺病毒载体:指E2A或E4基因缺失的腺病毒载体。
特点:(1)外源基因容量增加,可达14Kb;(2)病毒蛋白表达降低,引发机体的免疫反应比第一代弱;(3)外源基因表达时间较长;(4)病毒产量较低,且滴度降低。
第三代腺病毒载体:也称为空壳载体或辅助病毒载体,指全部或大部分腺病毒基因组缺失,仅可保留ITR和包装信号序列的腺病毒载体。
特点:(1)外源基因容量大幅度提高,可达37Kb;(2)无病毒蛋白表达,降低了机体的免疫反应,提高了安全性;(3)外源基因可长期稳定表达;(4)需要一个腺病毒突变体作为辅助病毒;(5)可反复应用,无需考虑机体的抗腺病毒中和抗体的影响。
2.腺病毒载体包装方法传统的双质粒共转染法将插入了外源基因的穿梭载体质粒与携带腺病毒基因组的质粒共转染293细胞,这两种质粒在293细胞内通过随机的同源重组(同源序列的DNA分子之间或者分子之内的重新组合),形成重组腺病毒载体基因组,并包装成病毒颗粒。
局限性:(1) 操作较复杂,因其易被亲代病毒污染,需经过多次纯化和鉴定;(2) 重组效率低,耗费时间较长。
注:此方法适用于临床。
(1)Ad-Easy法将克隆了外源基因的腺病毒穿梭质粒与携带腺病毒大部分基因组的质粒共转染RecA+细菌,在细菌RecA 重组酶的作用下,经抗性筛选获得重组腺病毒基因组质粒,将其酶切纯化后转染293细胞,包装成重组病毒颗粒。
特点:(1) 酶切和连接步骤少,操作简便;(2) 可选择的穿梭载体多;(3) 同源重组率达60%以上,效率相对较高;局限性:(1) 某些腺病毒基因容易发生突变;(2) 设备和技术要求较高。
模板:腺相关病毒载体
腺相关病毒载体腺病毒相关病毒(adenovirus associated virus,AA V)是一类单链线状DNA缺陷型病毒。
其基因组DNA小于5 kb,无包膜,外形为裸露的20面体颗粒。
AA V 不能独立复制,只有在辅助病毒(如腺病毒、单纯疱疹病毒、痘苗病毒)存在时,才能进行复制和溶细胞性感染,否则只能建立溶源性潜伏感染。
腺相关病毒载体是利用天然存在的腺相关病毒某些特性经过基因工程改造后产生的一种可供人工转基因的载体。
腺相关病毒(adeno-associated virus,AA V)是简单的非致病性单链DNA病毒,需要辅助病毒参与生活周期,辅助病毒通常为腺病毒(Ad)或者单纯疱疹病毒(HSV)。
基因组两端为末端反向重复序列(ITR),中间基因组编码两个蛋白:Cap和Rep。
ITRs对于病毒的复制和包装具有决定性作用。
Cap蛋白为病毒衣壳蛋白,Rep蛋白参与病毒的复制和整合。
AA V 能感染多种细胞。
Rep蛋白存在时,病毒基因组很容易整合到人类第19号染色体的特异位点:AA VS1位点。
这是已知的唯一能够定点整合的哺乳动物DNA病毒。
重组腺相关病毒载体(rAA V)源于非致病的野生型腺相关病毒,由于其安全性好、宿主细胞范围广(分裂和非分裂细胞)、免疫源性低,在体内表达外源基因时间长等特点,被视为最有前途的基因转移载体之一,在世界范围内的基因治疗和疫苗研究中得到广泛应用。
优点:以潜伏感染为主;AA V可以高效定点整合至人染色体中:可以避免随机整合可能带来的抑癌基因失活和原癌基因激活的潜在危险性,而且外源基因可以持续稳定表达。
缺点:AA V载体容量小,目前最多只能容纳5 kb外源DNA片段;感染效率比逆转录病毒载体低。
在40%-80%的成人中存在过感染,可能会引起免疫排斥。
AA V选择的条件1. 治疗基因的长度不能过大。
AA V的总容量4.7kb,还要包括AA V自身的ITR,启动区和RNA加尾信号;2. 基因需要持续表达,蛋白可以是分泌型,也可以是非分泌型;3. 长期表达目的基因,没毒副作用;4. 不需要目的基因立刻表达;5. 不需要基因高水平表达;6. AA V载体对靶细胞具有较高的转导效率。
pAAV-hrGFP腺病毒载体说明(图)
pAAV-‐hrGFP编号 载体名称 北京华越洋VECT10048 pAAV-‐hrGFPpAAV-‐hrGFP载体基本信息:载体名称: pAAV-‐hrGFP, pAAV h rGFP, p AAVhrGFP质粒类型: 腺病毒相关载体表达水平: 高启动子: CMV载体大小: 5.3 k b3‘ 端测序引物: Beta-‐globin-‐F:ATTCTGAGTCCAAGCTAGGC 5‘ 端测序引物: hGH-‐PA-‐R: C CAGCTTGGTTCCCAATAGA载体标签: -‐-‐载体抗性: 氨苄备注: -‐-‐稳定性: /组成型: -‐-‐病毒/非病毒: 腺病毒pAAV-‐hrGFP载体质粒图谱和多克隆位点信息:pAAV-‐hrGFP其他腺病毒表达载体:pNTAP-‐Shuttle-‐B pAAV-‐CAG-‐RFP pAAV-‐CaMKIIa-‐EGFP pCTAP-‐Shuttle-‐A pAAV-‐CMV-‐Rluc pNTAP-‐Shuttle-‐A pAAV-‐CAG-‐GFP pBHGloxdelE13cre pCTAP-‐Shuttle-‐C pDC511pDC515 pDC312pAdTrack-‐CMV pAAV-‐IRES-‐hrGFP pShuttle-‐IRES-‐hrGFP-‐1 pShuttle-‐CMV-‐EGFP-‐C pacAd5 9.2-‐100 pacAd5 C MV-‐GFP pAAV-‐Syn-‐Rluc pCMV-‐MCS pShuttle-‐IRES-‐hrGFP-‐2 pShuttle-‐CMV pAAV-‐Syn-‐Rluc pAAV-‐hSyn-‐RFP pAAV-‐CMV-‐iRFP pAAV-‐UbCpDC415 pAAV-‐CAG-‐Fluc pAAV-‐LacZ pNTAP-‐Shuttle-‐B pDC316 pDC516pAAV-‐CA pDC416pNTAP-‐Shuttle-‐C pDC311pDC512 pAAV-‐hrGFPpDC411 pAAV-‐RC pAdTrack pacAd5 C MVK-‐NpA pAdEasy-‐1 pDC315pAAV-‐MCS pShuttlepHelper pBApo-‐CMV-‐neo pShuttle-‐CMV-‐lacZ pBApo-‐CMVpAAV-‐TRE-‐Syn-‐Fluc pBApo-‐CMV-‐Pur pAAV-‐minCMV-‐mCherry。
维真生物AAV病毒产品说明书
病毒产品说明书项目信息基因名称基因序列号滴度体积小鼠RNF20基因AAV8NM_0011632637.94×1013vg/ml100μl AAV8-TBG无 1.09×1013vg/ml100μl产品使用说明根据不同细胞的MOI(MOI是multiplicity of infection的缩写,中文译为感染复数,实际的含义即为每个细胞被多少个有活力病毒所感染)和需要感染的细胞量以及病毒滴度,计算所需要的病毒量,然后将所需的病毒加入事先准备好的细胞培养体系中,培养12小时左右即可换成完全培养基正常培养。
一般培养至第24-48小时,可在荧光显微镜下观察病毒感染细胞情况。
我们强烈建议您在使用我们的产品前进行预实验摸索最适MOI值或查阅相关文献后再进行实验。
注:由于AAV的组织特异性,体外感染细胞的效率比较低,所以我们强烈推荐您购买AAV用于动物实验。
运输&保存条件全程干冰运输。
收到产品后,请于-80℃保存,避免反复冻融,使用前于4℃融化。
我们强烈建议在收到病毒后按照每次用量进行分装,避免反复冻融。
订购须知ViGene Biosciences的产品仅限用于研究,不可用于包括人类体外诊断和治疗在内的其他用途。
ViGene Biosciences的产品,不得修改和转售给任何第三方,未经ViGene Biosciences的书面批准,不得将产品用于向其他第三方提供服务或用于制造商品化产品。
ViGene Biosciences的全长cDNA克隆来自人类cDNA。
我们70%的克隆与RefSeq 和GenBank数据库中序列完全一致,部分cDNA克隆序列中含有SNPs,可能与RefSeq数据库的序列存在一个或多个核苷酸的差异。
建议购买者在购买前仔细核对克隆序列。
根据GenBank2013数据库的序列信息,产品中每个克隆包含一个完整的开放阅读框(ORF),随着RefSeq序列的不断变化,GenBank的数据也在不断更新。
腺病毒包装操作手册
汉恒重组腺病毒操作手册目录腺病毒安全使用和注意事项腺病毒储存与稀释的注意事项一、整体实验流程二、实验材料三、腺病毒包装和浓缩四、重组腺病毒滴度(PFU)的测定五、重组腺病毒感染目的细胞六、重组腺病毒用于动物实验附1:汉恒生物腺病毒载体附2:腺病毒感染细胞最佳MOI的摸索(表达荧光的病毒) 附3:汉恒生物常见三种病毒感染目的细胞比较腺病毒安全使用和注意事项➢腺病毒安全使用注意事项(*非常重要*)1) 腺病毒相关实验请在生物安全柜(BL-2级别)内操作。
2) 操作病毒时请穿实验服,佩戴口罩和手套,尽量不要裸露双手及手臂的皮肤。
3) 操作病毒时需要特别小心病毒溅出。
如果操作时超净工作台有病毒污染,请立即用70%乙醇加 1%的SDS溶液擦拭干净。
4) 接触过病毒的枪头、离心管、培养板及培养瓶请用84消毒液浸泡后统一处理。
5) 如实验过程中需要离心,应使用密封性好的离心管,必要时请用封口膜封口后离心。
6) 病毒相关的废弃物需要特殊收集,统一经高温灭菌后处理。
7) 实验完毕后请用香皂清洗双手。
➢腺病毒储存与稀释的注意事项1)腺病毒的储存收到病毒液后若在短期内使用,可将病毒放置于 4℃保存(一周内使用完最佳);如需长期保存请分装后放置于 -80 ℃ 。
注:a.反复冻融会降低病毒滴度(每次冻融会使病毒滴度降低10%~50%),因此在病毒使用过程中尽量避免反复冻融。
汉恒生物对病毒已进行分装(200 μl/tube),收到后请直接放置-80℃冰箱保存即可。
b.若病毒储存时间超过6个月,汉恒生物建议在使用前重新测定病毒滴度(参见附表2-慢病毒滴度测定方法)。
2)腺病毒的稀释需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用PBS或培养目的细胞用的无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后置于 4℃保存(一周内使用完最佳)。
重组腺病毒是一种复制缺陷的腺病毒载体系统,在基因治疗、基础生命科学研究等领域被广泛应用。
腺病毒载体操作手册1407
腺病毒载体操作手册一、实验流程制备腺病毒穿梭质粒,分别高纯度无内毒素抽提腺病毒穿梭质粒和骨架质粒,共转染293A细胞,转染后6h更换为完全培养基,培养十几天,在中间四五天左右更换一次新鲜培养基,然后收集细胞和1ml培液置于15ml离心管后,液氮/37度冻融三次(冻-融要彻底),2000rpm离心5分钟,取上清即为病毒液初代原液。
连续三代反复扩增收集病毒后,行病毒的大量扩增,然后通过CsCl密度梯度离心-透析联用法纯化病毒。
二、实验材料(一)腺病毒载体、包装细胞和菌株该病毒包装系统为两质粒系统,组成为穿梭质粒(包括pHBAd-CMV-IRES-GFP,pHBAd-CMV-IRES-RFP,pHBAd-U6-GFP, pHBAd-U6-RFP)和骨架质粒pBHGlox(delta)E1,3Cre。
其中穿梭质粒pHBAd-CMV-IRES-GFP和pHBAd-U6-GFP能表达绿色荧光蛋白(GFP)。
pHBAd-CMV-IRES-RFP和pHBAd-U6-RFP能表达红色荧光蛋白(RFP)。
1、载体信息1) 腺病毒克隆载体图谱如下:各载体用途如下表:2)骨架质粒信息如下:2、细胞株293A,腺病毒的包装细胞,为贴壁依赖型成上皮样细胞,经培养生长增殖形成单层细胞,生长培养基为DMEM(含10% FBS)。
3、菌株大肠杆菌菌株DH5α。
用于扩增腺病毒载体和腺病毒骨架载体质粒。
三、包装细胞293A细胞的培养(一)293A细胞的冻存293A细胞来源于一个用作空斑测定的亚克隆,具有易使用和易转染的特性。
该细胞株对于高细胞密度很敏感,当细胞超过70%汇合时,一些细胞可能会丢失它们的表型。
若细胞密度持续在70%以下,QBI-293A细胞则能连续培养3~4个月维持原有细胞特性。
若以购买得到的293A作为第一代,则30代内能得到最佳结果。
随着传代的次数增加,293A细胞会出现生长状态下降、突变等。
为了防止此类现象的出现,我们需要在开始就对细胞进行大量冻存,以保证实验的稳定性和持续性。
(整理)腺病毒载体操作手册1407-R2
腺病毒载体操作手册一、实验流程制备腺病毒穿梭质粒,分别高纯度无内毒素抽提腺病毒穿梭质粒和骨架质粒,共转染293A细胞,转染后6h更换为完全培养基,培养十几天,在中间四五天左右更换一次新鲜培养基,然后收集细胞和1ml培液置于15ml离心管后,液氮/37度冻融三次(冻-融要彻底),2000rpm离心5分钟,取上清即为病毒液初代原液。
连续三代反复扩增收集病毒后,行病毒的大量扩增,然后通过CsCl密度梯度离心-透析联用法纯化病毒。
二、实验材料(一)腺病毒载体、包装细胞和菌株该病毒包装系统为两质粒系统,组成为穿梭质粒(包括pHBAd-CMV-IRES-GFP,pHBAd-CMV-IRES-RFP,pHBAd-U6-GFP, pHBAd-U6-RFP)和骨架质粒pBHGlox(delta)E1,3Cre。
其中穿梭质粒pHBAd-CMV-IRES-GFP和pHBAd-U6-GFP能表达绿色荧光蛋白(GFP)。
pHBAd-CMV-IRES-RFP和pHBAd-U6-RFP能表达红色荧光蛋白(RFP)。
1、载体信息1) 腺病毒克隆载体图谱如下:各载体用途如下表:2)骨架质粒信息如下:2、细胞株293A,腺病毒的包装细胞,为贴壁依赖型成上皮样细胞,经培养生长增殖形成单层细胞,生长培养基为DMEM(含10% FBS)。
3、菌株大肠杆菌菌株DH5α。
用于扩增腺病毒载体和腺病毒骨架载体质粒。
三、包装细胞293A细胞的培养(一)293A细胞的冻存293A细胞来源于一个用作空斑测定的亚克隆,具有易使用和易转染的特性。
该细胞株对于高细胞密度很敏感,当细胞超过70%汇合时,一些细胞可能会丢失它们的表型。
若细胞密度持续在70%以下,QBI-293A细胞则能连续培养3~4个月维持原有细胞特性。
若以购买得到的293A作为第一代,则30代内能得到最佳结果。
随着传代的次数增加,293A细胞会出现生长状态下降、突变等。
为了防止此类现象的出现,我们需要在开始就对细胞进行大量冻存,以保证实验的稳定性和持续性。
pAAV-MCS腺病毒载体说明(图)
pAAV-‐MCS编号 载体名称北京华越洋VECT10024 pAAV-‐MCSpAAV-‐MCS载体基本信息:载体名称: pAAVMCS, pAAV-‐MCS, p AAV M CS质粒类型: 腺病毒相关载体表达水平: 高启动子: CMV克隆方法: 多克隆位点,限制性内切酶载体大小: 4650 b p5' 测序引物及序列: CMV-‐F: 5'-‐CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG-‐3'3' 测序引物及序列: hGH-‐PA-‐R: C CAGCTTGGTTCCCAATAGA载体标签: -‐-‐载体抗性: 氨苄备注: -‐-‐稳定性: /组成型: -‐-‐病毒/非病毒: 腺病毒pAAV-‐MCS载体质粒图谱和多克隆位点信息pAAV-‐MCS载体序列:ORIGIN1 C CTGCAGGCA G CTGCGCGCT C GCTCGCTCA C TGAGGCCGC C CGGGCAAAG C CCGGGCGTC 61 G GGCGACCTT T GGTCGCCCG G CCTCAGTGA G CGAGCGAGC G CGCAGAGAG G GAGTGGCCA 121 A CTCCATCAC T AGGGGTTCC T GCGGCCGCA C GCGTGGAGC T AGTTATTAA T AGTAATCAA 181 T TACGGGGTC A TTAGTTCAT A GCCCATATA T GGAGTTCCG C GTTACATAA C TTACGGTAA 241 A TGGCCCGCC T GGCTGACCG C CCAACGACC C CCGCCCATT G ACGTCAATA A TGACGTATG 301 T TCCCATAGT A ACGTCAATA G GGACTTTCC A TTGACGTCA A TGGGTGGAG T ATTTACGGT 361 A AACTGCCCA C TTGGCAGTA C ATCAAGTGT A TCATATGCC A AGTACGCCC C CTATTGACG 421 T CAATGACGG T AAATGGCCC G CCTGGCATT A TGCCCAGTA C ATGACCTTA T GGGACTTTC 481 C TACTTGGCA G TACATCTAC G TATTAGTCA T CGCTATTAC C ATGGTGATG C GGTTTTGGC 541 A GTACATCAA T GGGCGTGGA T AGCGGTTTG A CTCACGGGG A TTTCCAAGT C TCCACCCCA 601 T TGACGTCAA T GGGAGTTTG T TTTGCACCA A AATCAACGG G ACTTTCCAA A ATGTCGTAA 661 C AACTCCGCC C CATTGACGC A AATGGGCGG T AGGCGTGTA C GGTGGGAGG T CTATATAAG 721 C AGAGCTCGT T TAGTGAACC G TCAGATCGC C TGGAGACGC C ATCCACGCT G TTTTGACCT 781 C CATAGAAGA C ACCGGGACC G ATCCAGCCT C CGCGGATTC G AATCCCGGC C GGGAACGGT 841 G CATTGGAAC G CGGATTCCC C GTGCCAAGA G TGACGTAAG T ACCGCCTAT A GAGTCTATA 901 G GCCCACAAA A AATGCTTTC T TCTTTTAAT A TACTTTTTT G TTTATCTTA T TTCTAATAC961 T TTCCCTAAT C TCTTTCTTT C AGGGCAATA A TGATACAAT G TATCATGCC T CTTTGCACC1021 A TTCTAAAGA A TAACAGTGA T AATTTCTGG G TTAAGGCAA T AGCAATATT T CTGCATATA 1081 A ATATTTCTG C ATATAAATT G TAACTGATG T AAGAGGTTT C ATATTGCTA A TAGCAGCTA 1141 C AATCCAGCT A CCATTCTGC T TTTATTTTA T GGTTGGGAT A AGGCTGGAT T ATTCTGAGT1201 C CAAGCTAGG C CCTTTTGCT A ATCATGTTC A TACCTCTTA T CTTCCTCCC A CAGCTCCTG1261 G GCAACGTGC T GGTCTGTGT G CTGGCCCAT C ACTTTGGCA A AGAATTGGG A 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pAAV-‐minCMV-‐mCherry。
腺病毒载体AVV的分类
腺病毒载体AVV的分类
腺病毒载体AVV是一种高分子(36 KB)双链没有涂布DNA病毒。
通过受体介导的内吞作用进入细胞,然后转移到细胞核内的腺病毒基因组,保持在染色体外,不整合到宿主细胞基因组。
一般将E1或E3基因缺失被称为代腺病毒载体,腺病毒载体这类载体能使身体产生强烈的炎症反应和**反应,表达外源基因的时间很短。
E2A或E4基因缺失的腺病毒载体被称为**代腺病毒载体,**反应其载体能力薄弱和安全也改善了很多。
第三代腺病毒载体缺失(没有病毒载体,没有生气的向量)或大部分腺病毒基因(微腺病毒载体、mini Ad),只能保留ITR和包装信号序列。
第三代腺病毒载体可以插入到大35 KB基因,病毒蛋白表达的细胞**反应,从而进一步减少,引入核基质附着区基因载体可以保持长期使外源基因表达,并增加载体的稳定性。
载体系统需要一个腺病毒突变体作为辅助。
慢病毒、腺病毒、腺相关病毒(AAV)、逆转录病毒系统介绍
度
高 峰 , 在 体 水 平 在体水平表达较差,
用
物水平需要表达 2 周
约 72hr 达到高峰 约需要 96hr 表达
维持表达时间 3 周
稳定表达
稳定表达,有被 silence 的 稳定表达 6 月以上
风险
滴度
1011 PFU/ml
108 TU/ml
107 TU/ml
1012 v.g./ml
克隆容量
他血清型表达效率弱 非常适合 极低免疫原性
表 1. 四种主流病毒载体系统的特点比较。图表来源:汉恒生物组织整理。
图 3. AAV 基因组结构与 Capsid(Cap)高频突变位点示意图。A. Capsid 晶体结构示意图。其中蛋白 VP1 表面不同颜色的氨基酸基团代表 Cap 高频突变位点。B. Cap 基因结构。其中 Cap ORF 编码 3 个蛋白VP1、VP2 和 VP3。高频突变区域用不同颜色的箭头表示,并对应到图 A 中 Cap 表面不同颜色的氨基酸基 团。C. AAV 基因组结构。图片来源:汉恒生物组织整理。
图 4. 不同的 AAV 血清型对组织或脏器的偏爱性。图片来源:汉恒生物组织整理。
我们综合比较下四种病毒载体系统的特点(表 1):
病毒表达系统 腺病毒表达系统 慢病毒表达系统 逆转录病毒
腺相关病毒
病毒基因组 dsDNA
ssRNA
ssRNA 病毒
ssDNA
是否整合
不整合
随机整合并稳定遗传 随机整合并稳定遗传
实验室常用的慢病毒(Lentivirus)载体是以 HIV-1 (人类免疫缺陷 1 型病毒)为基础 发展起来的基因治疗载体。具有感染谱广泛、可以有效感染分裂期和静止期细胞、长期稳
定表达外源基因等优点,因此成为导入外源基因的有力工具。现在慢病毒系统已经被广泛 应用到各种细胞系的基因过表达、RNA 干扰、microRNA 研究以及活体动物实验中。
sunbio AAV产品手册 最终版
上海生博AAV产品手册(2017版)一、AAV背景知识1.1AAV概况腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV),是一类无包膜的细小病毒,属于微小病毒科(Parvoviridae)的依赖病毒属(Dependoparvovirus),透射电镜(transmission electron microscope,TEM)下,AAV病毒本身呈二十面体结构。
AAV 基因组为约4.7kb的线性单链DNA(single strand DNA,ssDNA),只含两个基因,Rep(Replication)基因和Cap(Capsid)基因。
AAV为目前发现的基因组最简单的复制缺陷型病毒,也因此,AAV被作为病毒载体广泛应用。
FIG1 AAV的3D构象图FIG2 AAV病毒颗粒的组分构成FIG1和FIG2文献出处:Mingozzi, F. and K.A. High.Blood, 2013. 122(1): p. 23-36.FIG3 AAV TEM图Zinn, E., et al.. Cell Rep, 2015. 12(6): p. 1056-68.1.2AAV的ITR区AAV基因组的5’和3 ’端各有一个长度为145bp的倒转重复序列(inverted terminal repeat,ITR),是AAV复制和包装所必需的最少的自身序列。
ITR区富含GC(>80%),可折叠为一个自我互补的T型发卡结构,其中的Rep蛋白结合位点(Rep binding elements,RBE)、RBE’和末端解链位点(terminal resolution site,TRS)是AAV 基因组的复制起始的关键。
另外ITR区还含有包装信号,是AAV整合、复制和包装所必须的顺式作用元件,并具有转录启动子活性。
FIG4 AAV基因组结构图Nance, M.E. and D. Duan. Hum Gene Ther, 2015. 26(12): p. 786-800.FIG5 AAV ITR区的二级结构图(以AAV2序列为例)Daya, S. and K.I. Berns. Clin Microbiol Rev, 2008. 21(4): p. 583-93.1.3AAV的ORFAAV含有两个开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),Rep基因和Cap基因。
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pAAV-‐hSyn-‐EGFP编号 载体名称 北京华越洋VECT10002 pAAV-‐hSyn-‐EGFPpAAV-‐hSyn-‐EGFP载体质粒图谱和多克隆位点信息pAAV-‐hSyn-‐EGFP载体序列ORIGIN1 C ATGTCCTGC A GGCAGCTGC G CGCTCGCTC G CTCACTGAG G CCGCCCGGG C GTCGGGCGA 61 C CTTTGGTCG C CCGGCCTCA G TGAGCGAGC G AGCGCGCAG A GAGGGAGTG G CCAACTCCA 121 T CACTAGGGG T TCCTGCGGC C GCACGCGTG T GTCTAGACT G CAGAGGGCC C TGCGTATGA 181 G TGCAAGTGG G TTTTAGGAC C AGGATGAGG C GGGGTGGGG G TGCCTACCT G ACGACCGAC 241 C CCGACCCAC T GGACAAGCA C CCAACCCCC A TTCCCCAAA T TGCGCATCC C CTATCAGAG301 A GGGGGAGGG G AAACAGGAT G CGGCGAGGC G CGTGCGCAC T GCCAGCTTC A GCACCGCGG 361 A CAGTGCCTT C GCCCCCGCC T GGCGGCGCG C GCCACCGCC G CCTCAGCAC T GAAGGCGCG 421 C TGACGTCAC T CGCCGGTCC C CCGCAAACT C CCCTTCCCG G CCACCTTGG T CGCGTCCGC481 G CCGCCGCCG G CCCAGCCGG A CCGCACCAC G CGAGGCGCG A GATAGGGGG G CACGGGCGC 541 G ACCATCTGC G CTGCGGCGC C GGCGACTCA G CGCTGCCTC A GTCTGCGGT G GGCAGCGGA 601 G GAGTCGTGT C GTGCCTGAG A GCGCAGTCG A GAAGGTACC G GATCCGCCA C CATGGTGAG 661 C AAGGGCGAG G AGCTGTTCA C CGGGGTGGT G CCCATCCTG G 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