第一章蛋白质化学
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第一章蛋白质化学
蛋白质的元素组成
所有蛋白质都含有 C、H、O、N 四种元素,大多数蛋 白质还含有少量的 S,有些蛋白质还含有一些其它元素,
如 P、Fe、Cu、Mo、I、…….. 。
各种蛋白质的含氮量都很接近,都在16%左右,因 此可通过测定生物样品中的含氮量计算出样品中蛋 白质的含量。
1克氮就相当于6.25克蛋白质
+ OH +H
pK1=2.34
pK2=9.69
pI = (pK1+pK2)/2 = (2.34+9.69)/2 = 6.0
第一章蛋白质化学
如何计算氨基酸的等电点?
2、R基团解离的氨基酸
H3N+H3HN+3CRCCNC+OHHRCCCO32OHRCCCHHO3OHHHO3++pHHOHK++ +H+O1+HK=+H-OH11+H-.8H- 83HN+3HN+3N+HCRCC3HCRCCNH+O3HOCRHCC3NCO+3OHO3HH-N+RCCHC3O-2OHRCCHC-O3OHRCCC+HHO3++OH+HHO+OOH3+Hp++HHHHO++KH+O+KH-H-++H2OH2++-=+H-OH3HH-+.H22H6HNN-253HNN+3HN+CHRCCCRCC3H3OCHRCCON+CRCCN3OHO3HOOCRCCCH3O-H3OH-OHCRHCCR-CCHC3O-HO2OHH-3OO3 HHH-+++O+Hp++HO++HKOH+HK-+O+H2H-3=H+-9H- .2H6HN203HNN+2NCRCCHOCRCCCRCC3OHOHOCRCCCH3O-3OHOHH-H3O-2H-
第一章蛋白质化学
氨基酸(Amino acid)
氨基酸的通式
第一章蛋白质化学
L-Alanine
D-Alanine
蛋白质水解得到的氨基酸都是L-型α-氨基酸
第一章蛋白质化学
氨基酸的结构
中性氨基酸
第一章蛋白质化学
第一章蛋白质化学
酸性氨基酸
第一章蛋白质化学
碱性氨基酸
第一章蛋白质化学
芳香族氨基酸
1、R基团不解离的氨基酸
H3HN+H3N+3N+HRCCC3OHN+RCCCO3RCCCOHHHOH3RCCCO3HHOHHH++O3OH++HH+++HOHKOH+-H1+++H-OH-H+H3HN+-H3N+3N+HCRCCH3HON+CRCC33ON+CRHCCOHHO3-CRCC3OH-HROCCCH-3OOH++HO3-O+HHH++HO++HO-H++H+++H-+KOHOH-2H+HH+2H--NH2N2HNHCR3CC2N+HONCRCC3OCHRCCOHHO3-CRCCCRCC3OHHO-HOH3-O3OH-H-
+ OH + H+
COO
COO
COO-
COO-
H
H
Asp+
Asp+-
Asp-
Asp--
pI = (pK1+pK2)/2 = (1.88+3.65)/2 = 2.77
第一章蛋白质化学
如何计算氨基酸的等电点?
2、R基团解离的氨基酸
3N+HHH33N+R3CCCN+N+OHO3RCCC(RHHCCCCRCCCOHOHHOHO3O3++2O3HH)HH4OHHHp+H+++K+++-OH1OHK=HOH+H+2H13+HH.-N+1-3-8N+HH3HRCCCHN+33N+OHCR3CCN+N+OH3ORHHCC3CO(CRCCOHCRHCC-CRHCCOOH3O++HO32OHH3O)OH3O4H-H-++HH-+p++O-KHOHH2++K=++H++H+-82O+OH-.3OH9HNH++HH5+HH-+3H-N-+23NCRCCN+HHOHH2RCC3CO(2NC2RCCNOHCRHCCN-HOOH3O32OHH3O)CRCC4CHRCC-CHRHCCO-+HO+pHO+3+OO3OK3HOHOH-KHH3-H+=-++H3+-1O-0H.H5+H3H-23NN+H(2CRCCNCRCCHOHO32O3O)4CRHCC-H-HO3O
第一章蛋白质化学
杂环氨基酸
第一章蛋白质化学
L-谷氨酸-γ-半醛
脯氨酸
第一章蛋白质化学
氨基酸的分类
(1)按侧链R基的结构
第一章蛋白质化学
氨基酸的分类
(2) 按侧链R基的极性
第一章蛋白质化学
氨基酸的一般性质 溶解性:
一般能溶于水(胱氨酸、半胱氨酸、酪氨酸除外); 在稀酸、稀碱中溶解性好; 一般不溶于有机溶剂(脯氨酸除外)。
第一章 蛋白质
第一章蛋白质化学
什么是蛋白质(Protein)?
由20种左右的氨基酸通过肽键相互连接而成的一类 具有特定空间构象和生物学活性的高分子化合物
第一章蛋白质化学
蛋白质的生物学意义
1、是生物体形态结构的物质基础; 2、生物体的新陈代谢所包含的化学反应,几乎都是由酶 来催化的; 3、参与物质的运输; 4、生物的运动; 5、生物的防御体系。 ……………………….. 总而言之,一切生命活动都离不开蛋白质,蛋白质 是生命现象的最基本的物质基础。
As an acid(proton donor):
CO- O +
H3N C H
CO-O H2N C H+H+
R
R
As a base(proton acceptor):
CO-O
+
H3N
C
H+H+
COOH
+
H3N C H
R
第一章蛋白质化学
R
不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在:
+ + + + O O O H O H + H + H H -H - H H H H H 3 H 3 3 N 3 3 + N + N 3 + N N + N +R C C R C C R C C R R C C C C R C CO O H O H -O O H H H -O H+ + O + + + + O O + + O O + O O H + + O O H H + O H O + H O H + + H H H + H H H -H + H H --+ H ---H H H H 3 H 3 3 N H + 3 N N + + 2 N + 2 N N R C C R R C C C C R C C R C C R C C O H O O -H H O --H O -H O -H -O O O + O + + + O + + + O O + O O H O H H H H H + H + + H + ----
C C C CO O O -O --- O O O O
H H H H 2 2 2 N 2 N N NC C C CH H H H R R R R
正离子
两性离子
负离子
氨基酸所带静电荷为“零”时,溶液的pH值称为该氨基 酸的等电点(isoelectric point),以pI表示。
第一章蛋白质化学
如何计算氨基酸的等电ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ?
第一章蛋白质化学
氨基酸的一般性质
紫外吸收:
Tyr: 275-278nm Phe:257-259nm Trp:279-280nm
第一章蛋白质化学
两性解离和等电点
氨基酸的形式
COOH H2N C H
R
中性分子形式
CO-O +
H3N C H R
两性离子形式
第一章蛋白质化学
氨基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质
蛋白质的元素组成
所有蛋白质都含有 C、H、O、N 四种元素,大多数蛋 白质还含有少量的 S,有些蛋白质还含有一些其它元素,
如 P、Fe、Cu、Mo、I、…….. 。
各种蛋白质的含氮量都很接近,都在16%左右,因 此可通过测定生物样品中的含氮量计算出样品中蛋 白质的含量。
1克氮就相当于6.25克蛋白质
+ OH +H
pK1=2.34
pK2=9.69
pI = (pK1+pK2)/2 = (2.34+9.69)/2 = 6.0
第一章蛋白质化学
如何计算氨基酸的等电点?
2、R基团解离的氨基酸
H3N+H3HN+3CRCCNC+OHHRCCCO32OHRCCCHHO3OHHHO3++pHHOHK++ +H+O1+HK=+H-OH11+H-.8H- 83HN+3HN+3N+HCRCC3HCRCCNH+O3HOCRHCC3NCO+3OHO3HH-N+RCCHC3O-2OHRCCHC-O3OHRCCC+HHO3++OH+HHO+OOH3+Hp++HHHHO++KH+O+KH-H-++H2OH2++-=+H-OH3HH-+.H22H6HNN-253HNN+3HN+CHRCCCRCC3H3OCHRCCON+CRCCN3OHO3HOOCRCCCH3O-H3OH-OHCRHCCR-CCHC3O-HO2OHH-3OO3 HHH-+++O+Hp++HO++HKOH+HK-+O+H2H-3=H+-9H- .2H6HN203HNN+2NCRCCHOCRCCCRCC3OHOHOCRCCCH3O-3OHOHH-H3O-2H-
第一章蛋白质化学
氨基酸(Amino acid)
氨基酸的通式
第一章蛋白质化学
L-Alanine
D-Alanine
蛋白质水解得到的氨基酸都是L-型α-氨基酸
第一章蛋白质化学
氨基酸的结构
中性氨基酸
第一章蛋白质化学
第一章蛋白质化学
酸性氨基酸
第一章蛋白质化学
碱性氨基酸
第一章蛋白质化学
芳香族氨基酸
1、R基团不解离的氨基酸
H3HN+H3N+3N+HRCCC3OHN+RCCCO3RCCCOHHHOH3RCCCO3HHOHHH++O3OH++HH+++HOHKOH+-H1+++H-OH-H+H3HN+-H3N+3N+HCRCCH3HON+CRCC33ON+CRHCCOHHO3-CRCC3OH-HROCCCH-3OOH++HO3-O+HHH++HO++HO-H++H+++H-+KOHOH-2H+HH+2H--NH2N2HNHCR3CC2N+HONCRCC3OCHRCCOHHO3-CRCCCRCC3OHHO-HOH3-O3OH-H-
+ OH + H+
COO
COO
COO-
COO-
H
H
Asp+
Asp+-
Asp-
Asp--
pI = (pK1+pK2)/2 = (1.88+3.65)/2 = 2.77
第一章蛋白质化学
如何计算氨基酸的等电点?
2、R基团解离的氨基酸
3N+HHH33N+R3CCCN+N+OHO3RCCC(RHHCCCCRCCCOHOHHOHO3O3++2O3HH)HH4OHHHp+H+++K+++-OH1OHK=HOH+H+2H13+HH.-N+1-3-8N+HH3HRCCCHN+33N+OHCR3CCN+N+OH3ORHHCC3CO(CRCCOHCRHCC-CRHCCOOH3O++HO32OHH3O)OH3O4H-H-++HH-+p++O-KHOHH2++K=++H++H+-82O+OH-.3OH9HNH++HH5+HH-+3H-N-+23NCRCCN+HHOHH2RCC3CO(2NC2RCCNOHCRHCCN-HOOH3O32OHH3O)CRCC4CHRCC-CHRHCCO-+HO+pHO+3+OO3OK3HOHOH-KHH3-H+=-++H3+-1O-0H.H5+H3H-23NN+H(2CRCCNCRCCHOHO32O3O)4CRHCC-H-HO3O
第一章蛋白质化学
杂环氨基酸
第一章蛋白质化学
L-谷氨酸-γ-半醛
脯氨酸
第一章蛋白质化学
氨基酸的分类
(1)按侧链R基的结构
第一章蛋白质化学
氨基酸的分类
(2) 按侧链R基的极性
第一章蛋白质化学
氨基酸的一般性质 溶解性:
一般能溶于水(胱氨酸、半胱氨酸、酪氨酸除外); 在稀酸、稀碱中溶解性好; 一般不溶于有机溶剂(脯氨酸除外)。
第一章 蛋白质
第一章蛋白质化学
什么是蛋白质(Protein)?
由20种左右的氨基酸通过肽键相互连接而成的一类 具有特定空间构象和生物学活性的高分子化合物
第一章蛋白质化学
蛋白质的生物学意义
1、是生物体形态结构的物质基础; 2、生物体的新陈代谢所包含的化学反应,几乎都是由酶 来催化的; 3、参与物质的运输; 4、生物的运动; 5、生物的防御体系。 ……………………….. 总而言之,一切生命活动都离不开蛋白质,蛋白质 是生命现象的最基本的物质基础。
As an acid(proton donor):
CO- O +
H3N C H
CO-O H2N C H+H+
R
R
As a base(proton acceptor):
CO-O
+
H3N
C
H+H+
COOH
+
H3N C H
R
第一章蛋白质化学
R
不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在:
+ + + + O O O H O H + H + H H -H - H H H H H 3 H 3 3 N 3 3 + N + N 3 + N N + N +R C C R C C R C C R R C C C C R C CO O H O H -O O H H H -O H+ + O + + + + O O + + O O + O O H + + O O H H + O H O + H O H + + H H H + H H H -H + H H --+ H ---H H H H 3 H 3 3 N H + 3 N N + + 2 N + 2 N N R C C R R C C C C R C C R C C R C C O H O O -H H O --H O -H O -H -O O O + O + + + O + + + O O + O O H O H H H H H + H + + H + ----
C C C CO O O -O --- O O O O
H H H H 2 2 2 N 2 N N NC C C CH H H H R R R R
正离子
两性离子
负离子
氨基酸所带静电荷为“零”时,溶液的pH值称为该氨基 酸的等电点(isoelectric point),以pI表示。
第一章蛋白质化学
如何计算氨基酸的等电ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ?
第一章蛋白质化学
氨基酸的一般性质
紫外吸收:
Tyr: 275-278nm Phe:257-259nm Trp:279-280nm
第一章蛋白质化学
两性解离和等电点
氨基酸的形式
COOH H2N C H
R
中性分子形式
CO-O +
H3N C H R
两性离子形式
第一章蛋白质化学
氨基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质