微生物活性测定方法综述
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第36卷第8期2016年4月生态学报ACTAECOLOGICASINICAVol.36,No.8Apr.,2016基金项目:国家自然科学基金项目(41230750);中国科学院战略先导专项B课题(XDB05010200)
收稿日期:2014⁃10⁃26;㊀㊀网络出版日期:2015⁃㊀⁃㊀
∗通讯作者Correspondingauthor.E⁃mail:cuixy@ucas.ac.cn
DOI:10.5846/stxb201410262093
车荣晓,王芳,王艳芬,邓永翠,张静,马双,崔骁勇.土壤微生物总活性研究方法进展.生态学报,2016,36(8):㊀⁃㊀.
CheRX,WangF,WangYF,DengYC,ZhangJ,MaS,CuiXY.Areviewonthemethodsformeasuringtotalmicrobialactivityinsoils.ActaEcologicaSinica,2016,36(8):㊀⁃㊀.土壤微生物总活性研究方法进展
车荣晓1,2,王㊀芳1,王艳芬1,邓永翠3,张㊀静1,马㊀双1,崔骁勇1,∗
1中国科学院大学,北京㊀100049
2格里菲斯大学,布里斯班㊀4111
3南京师范大学,南京㊀210023摘要:微生物总活性是指在某一时段内微生物所有生命活动的总和,它直接决定着微生物行使生理㊁生态功能的能力,是微生物学研究的热点,也是难点㊂迄今为止,还没有建立直接测定微生物总活性的方法,只能用一些相关指标来间接反映它㊂目前常用的指标主要包括微生物的呼吸速率㊁生长速率以及胞内RNA含量等㊂与其它一些基质和环境相比,测定土壤中的微生物总活性更为困难㊂通过总结研究土壤微生物总活性常用的三种方法,在简略概括传统的土壤微生物呼吸测定法的基础上,详细介绍了放射性同位素标记法和RNA直接表征法的原理和操作流程,整理归纳了一些重要应用案例,比较分析了不同方法的优缺点,以期为选择研究土壤微生物总活性的适宜方法提供依据㊂
关键词:土壤微生物;微生物总活性;土壤微生物呼吸;微生物生长活性;土壤RNA
Areviewonthemethodsformeasuringtotalmicrobialactivityinsoils
CHERongxiao1,2,WANGFang1,WANGYanfen1,DENGYongcui3,ZHANGJing1,MAShuang1,
CUIXiaoyong1,∗1UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing100049,China2GriffithUniversity,Brisbane4111,Australia3NanjingNormalUniversity,Nanjing210023,China
Abstract:Totalmicrobialactivity(TMA)insoilsisvitalforunderstandingtherolesofmicroorganismsinecosystemprocesses.Itcanbedefinedasthesumofphysiologicalactivitiesofallthemicrobesatagivenmoment.AsTMAisdifficulttomeasuredirectly,aseriesofproxies,suchasrespirationrates,growthrates,andcellularRNAconcentration,havebeenproposed.Here,methodsusedtomeasuresoilTMAaresynthesizedandcompared.(1)Respirationmaybetheprocessmostcloselyrelatedtolifeactivities.Thus,respirationratesarethemostcommonlyusedproxiesofsoilTMA.Themainlimitationisthatcurrentmethodstodeterminerespirationratesusuallycannotaccuratelyreflectactualrespirationrates.WhenrespirationratesaremeasuredusingCO2productionorO2consumptionrates,theyindicatecarbonmineralizationoraerobicrespirationrates,respectively.(2)Microbeswithhighergrowthratesareusuallymoreactive.Thus,growthratesarealsowidelyusedtoindicatesoilTMA.Asbiomacromoleculesynthesisisapproximatelyproportionaltomicrobialgrowthrates,incorporationofradioactiveisotopelabeledprecursors(i.e.,thymidine,leucine,andacetate)canbeemployedtoestimatemicrobegrowthrates.Generally,traceradioactivelylabeledprecursorsareaddedtoslurries(traditionalmethods)orextractedmicrobialsuspensions(Bååthᶄsmethods).Afterabriefincubation,microbesarekilledandthecorrespondingbiomacromoleculesareextractedtomeasuretheirradioactivity.Thymidineandleucineincorporationarecommonlyusedto网络出版时间:2015-08-24 09:59:53
网络出版地址:/kcms/detail/11.2031.Q.20150824.0959.002.html