凝胶电泳操作步骤
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琼脂糖凝胶电泳
(一)材料
(二)试剂
1、1*TAE
2、EB溶液:100mL水中加入1g溴化乙啶,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,分装,室温避光保存。
3、DNA加样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,50%甘油(w/v)。
4、RNA甲醛变性胶上样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,1mM EDTA(PH8.0),50%甘油(w/v),用DEPC水配制,高压灭菌备用。
常使用,深黄色应弃用。
波炉中将琼脂糖融化均匀。在加热过程中要不时摇动,使附于瓶壁上的琼脂糖颗粒进入溶液;加热时应盖上封口膜,以减少水份蒸发。
胶槽底面保持1mm左右的间隙,待胶溶液冷却至50℃左右时,加入最终浓度
溶液浸泡染色15分钟),摇匀,轻轻倒入电泳制胶板上,除掉气泡;待凝胶冷
缓冲液液面刚高出琼脂糖凝胶面;
3.加样:点样板或薄膜上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1X。用10 μL微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面。(注意:加样前要先记下加样的顺序和点样量)。
4.电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,DNA的迁移速度与电压成正比,最高电压不超过5V/cm。当琼脂糖浓度低于0.5%,电泳温度不能太高。样品由
围降低。当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳。
5.观察和拍照:电泳完毕,取出凝胶。在波长为254nm的紫外灯下观察染色
条带。于凝胶成像系统中拍照并保存之。
(二)在含有甲醛的凝胶上进行的RNA电泳(选做)
配制23 mL甲醛电泳胶:0.336g琼脂糖溶于20mL DEPC水中,冷却至60?C,加入5mL的5x甲醛变性胶电泳缓冲液和5.5mL的甲醛,在通风橱内倒胶,冷
却30分钟后使用。
甲醛变性胶RNA样品的制备:1μL RNA,5?甲醛变性胶电泳缓冲液0.5μL,甲
的EB。
步骤:
4.小心地进行点样,记录样品次序与点样量;然后开始电泳,电压为3-4V/cm。
步骤
1.称量琼脂糖,转入耐热广口瓶内,加TAE用微波炉熔化。
2.用胶布封住电泳槽两端,插入梳子,平放于水平台上。
3.凝胶冷却到50°C-60°C(手能触摸的温度)后倒入电泳槽。
4.凝胶凝固后撕下胶布,直接(带上梳子)转移到电泳槽中。
5.加电泳缓冲液至充分没过凝胶。拔梳子时应谨慎。
6.阴极(黑色)一般位于右侧,阳极(红色)一般位于左侧。
7.DNA样品中加入点样缓冲液,混合均匀。然后小心加入到凝胶孔中。DNA
样品;6*点样缓冲液=5:1
8.恒压电泳(6cm*9cm、0.7%凝胶用80-100V电泳1h。溴酚蓝迁移到33%-66%
时停止电泳)。
9.浸泡于溴化乙锭溶液中。
10.电泳完毕后,将胶浸入到EB溶液中10-30min。
11.在紫外发光仪上铺上保鲜膜,放入凝胶,打开紫外灯开关,观察。
12.拍照。
【注意事项与提示】
(1)EB是强诱变剂并有中等毒性,易挥发,配制和使用时都应戴手套,并且
不要把EB洒到桌面或地面上。凡是沾污了EB的容器或物品必须经专门处理后才能清洗或丢弃。简单处理方法为:加入大量的水进行稀释(达到0.5mg/mL
以下),然后加入0.2倍体积新鲜配制的5%次磷酸(由50%次磷酸配制而成)和0.12倍体积新鲜配制的0.5mol/L 的亚硝酸钠,混匀,放置1天后,加入过
量的1mol/L碳酸氢钠。如此处理后的EB的诱变活性可降至原来的1/200左右。(2)由于EB会嵌入到堆积的碱基对之间并拉长线状和带缺口的环状DNA,使DNA迁移率降低。因此,如果要准确地测定DNA的分子量,应该采用跑完电泳后再用0.5μg/ml的EB溶液浸泡染色的方法。
(3)总RNA的分析:哺乳动物的RNA由28S rRNA、18S rRNA和mRNA以及其它小分子RNA组成,28S和18S rRNA处为明显的亮带(相当于4.5kb和1.9kb),28S/18S应为1.5-2.5/1;植物、昆虫、酵母和两栖动物的RNA带分布较小,约为0.5-3.0kb左右;假如28S/18S小于1/1,或者出现拖带,说明RNA已经有