遗传学第三章
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交变脉冲场凝胶电泳(PFGE):1984年,Schwartz和
Centor发明;这项技术采用定时改变电场方向的交变电源, 每次电流方向改变后持续1s到5min左右,然后再改变电流方 向,反复循环,所以称之为脉冲式交变电场。
• 正交变电场凝胶电泳(OFAGE) • 电场转换凝胶电泳(FIGE) • 等高加压均匀电场(CHEF)
Mapmaker Version 3.0
Joinmap Version 3.0
3. 遗传作图
3.3 遗传连锁是遗传作图的基础 C. 用于关联分析的软件
TASSEL
Structure
4. 物理作图
遗传图谱的局限性: 1. 遗传图谱的分辨率依赖
于所得到的交换数目; 2. 遗传图谱的准确率有限
酿酒酵母第3号染色体遗 传图谱与物理图谱的比较
• 在过去,探针必须是相当长的DNA的分子,通常至 少是40kb的克隆片段;随着荧光信号放大技术的应 用,现在最小可以检测500bp的DNA片段。
荧光原位杂交
(fluorescent in situ hybridization,FISH)
荧光原位杂交 (fluorescent in situ hybridization,FISH)
4.2 荧光原位杂交(FISH) A. 用荧光探针进行原位杂交
• 用于原位杂交的探针的标记要同时满足高灵敏度和 高分辨率两个条件,非放射性的DNA荧光标记技术 能满足这一要求。
• 现已设计出具有不同发光特性的荧光标记物,可以 将一组不同的探针与单个染色体杂交,并分辨出每 种杂交信号,从而检测出各探针的相对位置。
可用该技术构建原核生物和低等真核生物(酵母和真菌)等染色 体较小的生物的限制图谱。限制性作图不能用于大型基因组。
4.1 限制性作图
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
如果用普通琼脂糖凝胶电泳来分离大片段DNA分子, 电泳分辨率会大大降低。
4.1 限制性作图
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
稀有酶:
(1) 选用识别序列为7或8碱基的限制性内切酶进行 切割。如:Sap I (7);Sgf I (8)。
(2) 选用识别序列所含基序在靶DNA分子中稀少的 酶。如人类基因组中,5’-CG-3’序列就比较稀少 ,如果选用Not I(5’-GCGGCCGC-3’)进行消 化,平均约10 Mb才有一个切点。
人的基因组中大约 有4x106个SNP; 绝大多数SNP是双 等位基因; 有的能形成RFLP ,绝大多数不能。
a. 通过寡核苷酸杂交分析检测SNP
寡核苷酸是在试管中合成的长度小于50 bp的DNA分子 ,在高严谨杂交条件下,寡核苷酸只有与待测DNA分子 形成完全的碱基配对时,二者才能杂交;如果有一个碱 基错配,杂交体会非常不稳定,不能形成杂交信号。
A. 限制性片段长度多态性 (restriction fragment length polymorphism,RFLP) 用限制性内切酶酶切基因组DNA时,在同一种生物的不 同个体间出现含同源序列的酶切片段长度的差异。
人的基因组中大 约有105个RFLP
确 定
R
F
L
P
的
酶切扩增多态性序列(C1eaved Amplified Polymorphic Sequences,CAPS)
习题:一个环状双链DNA分子,有8Kb长,用各种限 制性内切酶酶切后电泳结果如图示,请判断这一环状 DNA分子中各种内切酶的切点位置。
分子量 8Kb 4Kb 2Kb
EcoRI -
Hind III BamHI
-
-
-
E+H
-
B+H -
E+B -
多克隆位点(multiple cloning sites, MCS):指多个限制性 内切酶的单一切点,由许多限制酶切位点组成。MCS往 往是人工合成的一段外源基因的插入部位的DNA序列。
• 形态标记 • 细胞学标记 • 生化标记 • DNA分子标记
所有的标记都必须具有多态性!
DNA分子标记
简称分子标记 指在DNA水平,具有相对差异的等位基因的DNA多
态性标记,是DNA水平上遗传变异的直接反映。
优点: ❖ 不受时间和环境的限制 ❖ 遍布整个基因组,数量无限 ❖ 不影响性状表达 ❖ 变异丰富,多态性好 ❖ 大部分为共显性,能鉴别纯合体和杂合体
当淬灭复合物与荧光染料相 邻时,无荧光发出;如果寡 核苷酸与待测DNA能够杂交 ,则会破坏环形结构,此时 淬灭复合物远离荧光染料, 有荧光发出。
b. 通过耐扩增突变系统检测SNP (Amplification Refractory Mutation System, ARMS)
将SNP位点引入PCR引物3’端的 最后一个碱基,直接进行PCR扩 增。 在严谨的PCR条件下,存在SNP 的引物对不能扩增出目的条带。
一种封闭探针重复序列的方法
4.2 荧光原位杂交(FISH)
B. FISH应用的局限性
• 中期染色体是高度凝聚的,每条染色体都具有可识 别的形态。
• 使用中期染色体的缺点在于,由于它的高度浓缩的 性质,只能进行低分辨率作图,两个标记间至少相 隔1 Mb才能分辨出来。
• 因此,中期染色体FISH主要用于确定新标记在染色 体上的大概位置,为更精细的作图做准备。
两
种
方
法
B. 简单重复序列
Simple sequence repeat, SSR, Microsatellite (微卫星) 指重复单位相对较小(2-6bp的基序),由于重复单位 数目的变化而形成的多态性。
SSR
人的基因组中大 约有5x105个SSR
PCR+平板PAGE 电泳
PCR+毛细管电泳
引物需要荧光标记 可获得片段的准确长度
Tm=4x(G+C)+2x(A+T) C
(1) DNA芯片技术:应用面积为2 cm2 或更小的玻璃或硅质晶片,在上面高 密度的排列着许多寡核苷酸,待测 DNA用荧光标记后与芯片杂交,再用 荧光显微镜检测,发出荧光的表明寡 核苷酸与待测DNA杂交上了。
此方法在一次实验中可以检测许多个 SNP。
(2) 液相杂交技术:在微量滴 定板的孔中进行,每个孔中 含有一种不同的寡核苷酸; 寡核苷酸的一端与荧光染料 连接,另一端与荧光淬灭复 合物连接,且其两个末端可 以形成碱基配对;
QuickTime?an d a decompres sor
are neede d to see this picture.
SSR的检测方法
C. 单核苷酸多态性
(Simple nucleotide polymorphism, SNP) 基因组中的某些位点上,有些个体只有一个核苷酸与 其它个体不同,这种分散在基因组中的单个碱基的差 异就称为SNP。
2) 部分酶解+完全酶解
完全酶解
1200bp 1000bp
部分酶解
3000bp 2200bp 1800bp 1200bp 1000bp
800bp
800bp
800bp 1000bp
* 1200bp
R
Rຫໍສະໝຸດ Baidu
部分酶解
3000bp 2200bp
3)末端标记+部分酶解
1200bp
3) 末端标记+部分酶解
4.1 限制性作图
基因组测序的两种方法
2. 遗传图谱和物理图谱
遗传图谱:指应用遗传学技术(遗传重组)构建的能在 基因组上显示基因和其它序列特征位置的线性排列 图,反映了基因或标记间的相对距离和顺序。cM
物理图谱:指应用分子生物学技术直接分析DNA分子 ,从而构建的能显示包括基因在内的序列特征位置 的图谱,它反映了基因或标记间的实际距离。 bp,kb,Mb
Chapter 3 Mapping Genomes
内容
1. 概述 2. 遗传图谱和物理图谱 3. 遗传作图 4. 物理作图
1. 概述
• 测序工作中有一个局限性:在一个测序反应中一般只 能测出1 kb左右的准确序列。这就意味着长的DNA分 子必须由一系列短的序列拼接而成,即需将大分子分 解为片段,测出每一段的序列,再用计算机寻找重叠 的部分,从而拼接成长的序列-鸟枪法(shotgun)。
3. 遗传作图
3.3 遗传连锁是遗传作图的基础
A. 遗传群体的构建
• 分离群体
P1 P2
P3
连续回交 F1
回交群体(NIL)
• 收集的品种群体
组织培养
三交群体 F2
单倍体
连续自交 染色体加倍
RIL
DH
3. 遗传作图
f2 backcross ri self
3.3 遗传连锁是遗传作图的基础
B. 用于绘制遗传图谱的软件
1) 双酶解
2.9 kb的DNA片段 EcoR I+BamH I
EcoR I BamH I
1.0 0.5
1.2
1.5 KB 1.4 KB
1.2 KB 1.0 KB 0.7 KB
E
1.2 KB 1.0 KB 0.5 KB
BE E
0.5 0.2
B
EB
0.2 KB
0.2
BE
1
2
1.0 0.5 0.2 1.2 B EB 限制酶切图谱
• 一旦得到了基因组图谱,基因组计划中的测序阶段可 以采用下面两种方法之一进行:
(1) 全基因组鸟枪法(whole-genome shotgun):使用 基因组图谱上的显著特征为界标,指引着将用鸟枪 法获得的大量短序列拼接成主序列。
(2) 克隆重叠群法(clone contig):将基因组打断成长 度为数百kb或数个Mb的大片段,将这些大片段定位 到基因组图谱上并拼接成重叠群,利用鸟枪法对大 片段分别测序后再进行拼接。
• 这种鸟枪法是小的原核生物测序的标准方法,但是对 于较大的真核生物基因组来说是相当困难的,特别是 当分析基因组的重复区域时会发生错误。
几十个碱基
鸟枪法组装序列
丢失 鸟枪法中遇到的问题-串联重复DNA
错误拼接 鸟枪法中遇到的问题-基因组范围内的重复
1. 概述
• 因此,必须首先建立一个基因组的图谱,通过标明基 因或其他显著特征的位置,为测序提供指导。
3. 遗传作图
3.1 基因是首先被利用的标记
• 最初的遗传图谱是在20世纪初针对果蝇等生物使用基 因作为标记构建的。
• 一个基因必须以指定一个表型的两种替换形式存在或 以等位基因形式存在,才能用于遗传学分析。比如豌 豆茎的高与矮,果蝇眼睛颜色的红与白等。
果 蝇 连 锁 图
3. 遗传作图
3.2 用于遗传学作图的遗传标记 遗传标记:可以示踪染色体、染色体某一片段、某个 基因座在家系中传递的任何一种遗传特征。
1992
4. 物理作图
物理作图的常用方法:
1) 限制性作图:在DNA分子上定位限制性内切酶酶 切位点的相对位置;
2) 荧光原位杂交(FISH):将分子标记与完整染色 体杂交来确定标记的位置;
3) 序列标签位点(STS)作图:通过对批量的基因组 片段进行PCR和(或)杂交分析,来对短序列进 行定位作图。
正交变电场凝胶电泳
两对电极间的电场可以改变,每对电极与凝胶长度方向成45度角; 电场的每次改变都迫使DNA分子重新排列,从而提高分辨率。
4. 物理作图
4.2 荧光原位杂交(FISH)
A. 用荧光探针进行原位杂交
原位杂交是以标记的DNA分子 为探针,检测完整染色体的一 甲酰胺 种杂交分析方法。
分裂中期染色体
• 操作较繁琐,数据积累速度太慢。
4.2 荧光原位杂交(FISH)
B. FISH应用的局限性 更精细作图的两种途径:
通过荧光标记显示出DNA探针在染色体上的位置
如果探针中含有一 些重复序列,它可 能会和染色体上的 多个位点发生非特 异性杂交; 因此,探针在使用 前要和来自被研究 组织中的未标记 DNA混合; 用于混合的未标记 DNA可以是总的 核DNA,但最好 是富含重复序列的 DNA片段。
这时探针只与特异序列发生杂交
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
• 如果使用的限制酶在DNA上切点相对较少,构建限 制性图谱就比较容易。
• 限制性作图更适用于小分子。如果DNA分子小于50 kb,通常选用6碱基识别序列的限制性酶来构建限 制图谱。
• 对于大于50 kb的DNA分子,可以选用“稀有酶” 进行构建。
4.1 限制性作图
4. 物理作图
4.1 限制性作图 (Restriction mapping)
4.1 限制性作图
A. 限制性作图的基本方法
1) 双酶解(double digest) Key:分析重叠片段
2) 部分酶解+完全酶解:比较分析这两种情况下的片 段大小。
3) 末端标记+部分酶解 a) 利用放射性的同位素标记DNA的3’端或5’端 b) 部分酶解 c) 放射自显影
Centor发明;这项技术采用定时改变电场方向的交变电源, 每次电流方向改变后持续1s到5min左右,然后再改变电流方 向,反复循环,所以称之为脉冲式交变电场。
• 正交变电场凝胶电泳(OFAGE) • 电场转换凝胶电泳(FIGE) • 等高加压均匀电场(CHEF)
Mapmaker Version 3.0
Joinmap Version 3.0
3. 遗传作图
3.3 遗传连锁是遗传作图的基础 C. 用于关联分析的软件
TASSEL
Structure
4. 物理作图
遗传图谱的局限性: 1. 遗传图谱的分辨率依赖
于所得到的交换数目; 2. 遗传图谱的准确率有限
酿酒酵母第3号染色体遗 传图谱与物理图谱的比较
• 在过去,探针必须是相当长的DNA的分子,通常至 少是40kb的克隆片段;随着荧光信号放大技术的应 用,现在最小可以检测500bp的DNA片段。
荧光原位杂交
(fluorescent in situ hybridization,FISH)
荧光原位杂交 (fluorescent in situ hybridization,FISH)
4.2 荧光原位杂交(FISH) A. 用荧光探针进行原位杂交
• 用于原位杂交的探针的标记要同时满足高灵敏度和 高分辨率两个条件,非放射性的DNA荧光标记技术 能满足这一要求。
• 现已设计出具有不同发光特性的荧光标记物,可以 将一组不同的探针与单个染色体杂交,并分辨出每 种杂交信号,从而检测出各探针的相对位置。
可用该技术构建原核生物和低等真核生物(酵母和真菌)等染色 体较小的生物的限制图谱。限制性作图不能用于大型基因组。
4.1 限制性作图
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
如果用普通琼脂糖凝胶电泳来分离大片段DNA分子, 电泳分辨率会大大降低。
4.1 限制性作图
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
稀有酶:
(1) 选用识别序列为7或8碱基的限制性内切酶进行 切割。如:Sap I (7);Sgf I (8)。
(2) 选用识别序列所含基序在靶DNA分子中稀少的 酶。如人类基因组中,5’-CG-3’序列就比较稀少 ,如果选用Not I(5’-GCGGCCGC-3’)进行消 化,平均约10 Mb才有一个切点。
人的基因组中大约 有4x106个SNP; 绝大多数SNP是双 等位基因; 有的能形成RFLP ,绝大多数不能。
a. 通过寡核苷酸杂交分析检测SNP
寡核苷酸是在试管中合成的长度小于50 bp的DNA分子 ,在高严谨杂交条件下,寡核苷酸只有与待测DNA分子 形成完全的碱基配对时,二者才能杂交;如果有一个碱 基错配,杂交体会非常不稳定,不能形成杂交信号。
A. 限制性片段长度多态性 (restriction fragment length polymorphism,RFLP) 用限制性内切酶酶切基因组DNA时,在同一种生物的不 同个体间出现含同源序列的酶切片段长度的差异。
人的基因组中大 约有105个RFLP
确 定
R
F
L
P
的
酶切扩增多态性序列(C1eaved Amplified Polymorphic Sequences,CAPS)
习题:一个环状双链DNA分子,有8Kb长,用各种限 制性内切酶酶切后电泳结果如图示,请判断这一环状 DNA分子中各种内切酶的切点位置。
分子量 8Kb 4Kb 2Kb
EcoRI -
Hind III BamHI
-
-
-
E+H
-
B+H -
E+B -
多克隆位点(multiple cloning sites, MCS):指多个限制性 内切酶的单一切点,由许多限制酶切位点组成。MCS往 往是人工合成的一段外源基因的插入部位的DNA序列。
• 形态标记 • 细胞学标记 • 生化标记 • DNA分子标记
所有的标记都必须具有多态性!
DNA分子标记
简称分子标记 指在DNA水平,具有相对差异的等位基因的DNA多
态性标记,是DNA水平上遗传变异的直接反映。
优点: ❖ 不受时间和环境的限制 ❖ 遍布整个基因组,数量无限 ❖ 不影响性状表达 ❖ 变异丰富,多态性好 ❖ 大部分为共显性,能鉴别纯合体和杂合体
当淬灭复合物与荧光染料相 邻时,无荧光发出;如果寡 核苷酸与待测DNA能够杂交 ,则会破坏环形结构,此时 淬灭复合物远离荧光染料, 有荧光发出。
b. 通过耐扩增突变系统检测SNP (Amplification Refractory Mutation System, ARMS)
将SNP位点引入PCR引物3’端的 最后一个碱基,直接进行PCR扩 增。 在严谨的PCR条件下,存在SNP 的引物对不能扩增出目的条带。
一种封闭探针重复序列的方法
4.2 荧光原位杂交(FISH)
B. FISH应用的局限性
• 中期染色体是高度凝聚的,每条染色体都具有可识 别的形态。
• 使用中期染色体的缺点在于,由于它的高度浓缩的 性质,只能进行低分辨率作图,两个标记间至少相 隔1 Mb才能分辨出来。
• 因此,中期染色体FISH主要用于确定新标记在染色 体上的大概位置,为更精细的作图做准备。
两
种
方
法
B. 简单重复序列
Simple sequence repeat, SSR, Microsatellite (微卫星) 指重复单位相对较小(2-6bp的基序),由于重复单位 数目的变化而形成的多态性。
SSR
人的基因组中大 约有5x105个SSR
PCR+平板PAGE 电泳
PCR+毛细管电泳
引物需要荧光标记 可获得片段的准确长度
Tm=4x(G+C)+2x(A+T) C
(1) DNA芯片技术:应用面积为2 cm2 或更小的玻璃或硅质晶片,在上面高 密度的排列着许多寡核苷酸,待测 DNA用荧光标记后与芯片杂交,再用 荧光显微镜检测,发出荧光的表明寡 核苷酸与待测DNA杂交上了。
此方法在一次实验中可以检测许多个 SNP。
(2) 液相杂交技术:在微量滴 定板的孔中进行,每个孔中 含有一种不同的寡核苷酸; 寡核苷酸的一端与荧光染料 连接,另一端与荧光淬灭复 合物连接,且其两个末端可 以形成碱基配对;
QuickTime?an d a decompres sor
are neede d to see this picture.
SSR的检测方法
C. 单核苷酸多态性
(Simple nucleotide polymorphism, SNP) 基因组中的某些位点上,有些个体只有一个核苷酸与 其它个体不同,这种分散在基因组中的单个碱基的差 异就称为SNP。
2) 部分酶解+完全酶解
完全酶解
1200bp 1000bp
部分酶解
3000bp 2200bp 1800bp 1200bp 1000bp
800bp
800bp
800bp 1000bp
* 1200bp
R
Rຫໍສະໝຸດ Baidu
部分酶解
3000bp 2200bp
3)末端标记+部分酶解
1200bp
3) 末端标记+部分酶解
4.1 限制性作图
基因组测序的两种方法
2. 遗传图谱和物理图谱
遗传图谱:指应用遗传学技术(遗传重组)构建的能在 基因组上显示基因和其它序列特征位置的线性排列 图,反映了基因或标记间的相对距离和顺序。cM
物理图谱:指应用分子生物学技术直接分析DNA分子 ,从而构建的能显示包括基因在内的序列特征位置 的图谱,它反映了基因或标记间的实际距离。 bp,kb,Mb
Chapter 3 Mapping Genomes
内容
1. 概述 2. 遗传图谱和物理图谱 3. 遗传作图 4. 物理作图
1. 概述
• 测序工作中有一个局限性:在一个测序反应中一般只 能测出1 kb左右的准确序列。这就意味着长的DNA分 子必须由一系列短的序列拼接而成,即需将大分子分 解为片段,测出每一段的序列,再用计算机寻找重叠 的部分,从而拼接成长的序列-鸟枪法(shotgun)。
3. 遗传作图
3.3 遗传连锁是遗传作图的基础
A. 遗传群体的构建
• 分离群体
P1 P2
P3
连续回交 F1
回交群体(NIL)
• 收集的品种群体
组织培养
三交群体 F2
单倍体
连续自交 染色体加倍
RIL
DH
3. 遗传作图
f2 backcross ri self
3.3 遗传连锁是遗传作图的基础
B. 用于绘制遗传图谱的软件
1) 双酶解
2.9 kb的DNA片段 EcoR I+BamH I
EcoR I BamH I
1.0 0.5
1.2
1.5 KB 1.4 KB
1.2 KB 1.0 KB 0.7 KB
E
1.2 KB 1.0 KB 0.5 KB
BE E
0.5 0.2
B
EB
0.2 KB
0.2
BE
1
2
1.0 0.5 0.2 1.2 B EB 限制酶切图谱
• 一旦得到了基因组图谱,基因组计划中的测序阶段可 以采用下面两种方法之一进行:
(1) 全基因组鸟枪法(whole-genome shotgun):使用 基因组图谱上的显著特征为界标,指引着将用鸟枪 法获得的大量短序列拼接成主序列。
(2) 克隆重叠群法(clone contig):将基因组打断成长 度为数百kb或数个Mb的大片段,将这些大片段定位 到基因组图谱上并拼接成重叠群,利用鸟枪法对大 片段分别测序后再进行拼接。
• 这种鸟枪法是小的原核生物测序的标准方法,但是对 于较大的真核生物基因组来说是相当困难的,特别是 当分析基因组的重复区域时会发生错误。
几十个碱基
鸟枪法组装序列
丢失 鸟枪法中遇到的问题-串联重复DNA
错误拼接 鸟枪法中遇到的问题-基因组范围内的重复
1. 概述
• 因此,必须首先建立一个基因组的图谱,通过标明基 因或其他显著特征的位置,为测序提供指导。
3. 遗传作图
3.1 基因是首先被利用的标记
• 最初的遗传图谱是在20世纪初针对果蝇等生物使用基 因作为标记构建的。
• 一个基因必须以指定一个表型的两种替换形式存在或 以等位基因形式存在,才能用于遗传学分析。比如豌 豆茎的高与矮,果蝇眼睛颜色的红与白等。
果 蝇 连 锁 图
3. 遗传作图
3.2 用于遗传学作图的遗传标记 遗传标记:可以示踪染色体、染色体某一片段、某个 基因座在家系中传递的任何一种遗传特征。
1992
4. 物理作图
物理作图的常用方法:
1) 限制性作图:在DNA分子上定位限制性内切酶酶 切位点的相对位置;
2) 荧光原位杂交(FISH):将分子标记与完整染色 体杂交来确定标记的位置;
3) 序列标签位点(STS)作图:通过对批量的基因组 片段进行PCR和(或)杂交分析,来对短序列进 行定位作图。
正交变电场凝胶电泳
两对电极间的电场可以改变,每对电极与凝胶长度方向成45度角; 电场的每次改变都迫使DNA分子重新排列,从而提高分辨率。
4. 物理作图
4.2 荧光原位杂交(FISH)
A. 用荧光探针进行原位杂交
原位杂交是以标记的DNA分子 为探针,检测完整染色体的一 甲酰胺 种杂交分析方法。
分裂中期染色体
• 操作较繁琐,数据积累速度太慢。
4.2 荧光原位杂交(FISH)
B. FISH应用的局限性 更精细作图的两种途径:
通过荧光标记显示出DNA探针在染色体上的位置
如果探针中含有一 些重复序列,它可 能会和染色体上的 多个位点发生非特 异性杂交; 因此,探针在使用 前要和来自被研究 组织中的未标记 DNA混合; 用于混合的未标记 DNA可以是总的 核DNA,但最好 是富含重复序列的 DNA片段。
这时探针只与特异序列发生杂交
B. 限制性作图的规模受限于限制性片段的大小
• 如果使用的限制酶在DNA上切点相对较少,构建限 制性图谱就比较容易。
• 限制性作图更适用于小分子。如果DNA分子小于50 kb,通常选用6碱基识别序列的限制性酶来构建限 制图谱。
• 对于大于50 kb的DNA分子,可以选用“稀有酶” 进行构建。
4.1 限制性作图
4. 物理作图
4.1 限制性作图 (Restriction mapping)
4.1 限制性作图
A. 限制性作图的基本方法
1) 双酶解(double digest) Key:分析重叠片段
2) 部分酶解+完全酶解:比较分析这两种情况下的片 段大小。
3) 末端标记+部分酶解 a) 利用放射性的同位素标记DNA的3’端或5’端 b) 部分酶解 c) 放射自显影