不同血清型变形链球菌表面蛋白可变区（extended-V）的同源性分析

不同血清型变形链球菌表面蛋白可变区（extended-V）的同

源性分析

不同血清型变形链球菌表面蛋白可变区(extended-V)的同源性分析

目的分析不同血清型变形链球菌表面蛋白可变区(extended-V)的基因及蛋白质的同源性,探讨该区在防龋疫苗研制中的作用.方法以变形链球菌血清型c、d、f、g参考株及部分c型临床株为模板,PCR扩增SrV+区片段,通过内切酶Dde Ⅰ进行限制性片段长度多态性分析并测序,将其测序结果在NCBI服务器上用blastn搜索软件进行同源性比较.结果在相同条件下血清c、f型菌株均扩增出约1.13 kb左右的片段,酶切后出现5种基因型(A、B、C、D、E).选取所占比例较多的A、B、C 型代表株进行测序,经比较显示其基因型间的同源性达92%-98%.血清d、g型无扩增产物,将g型6715表面蛋白SpaA全片段基因同OMZ175的产物序列在blastn上进行比较,有3个大小不一的片段出现同源性;血清d型OMZ176的表面蛋白基因序列在GeneBank上未能查出,故无法比较,但其相应蛋白质的同源性也在77%-82%之间,显示出相当高的同源性.结论就c、f型菌株来说,可以将该区纳入疫苗的研究范畴;d、g型虽未能扩增出相应产物,但其基因还是存在部分区域的相似性,且其蛋白质同源性很高,也可以考虑利用d、g型上同c、f型共有的某些肽段进行疫苗的研制.

作者：何奎芳刘建国刘天佳杨德琴庄姮李颂 HE Kui-fang LIU Jian-guo LIU Tian-jia YANG De-qin ZHUANG Heng LI Song 作者单位：何奎芳,HE Kui-fang(温州医学院附属口腔医院口腔内科) 刘建国,杨德琴,LIU Jian-guo,YANG De-qin(遵义医学院附属口腔医院,口腔内科,贵州,遵义,563003)

刘天佳,庄姮,李颂,LIU Tian-jia,ZHUANG Heng,LI Song(四川大学华西口腔医院,牙体牙髓科,四川,成都,610041)

刊名：华西口腔医学杂志ISTIC PKU英文刊名：WEST CHINA JOURNAL OF STOMATOLOGY 年，卷(期)：2006 24(4) 分类号：

Q523 关键词：变形链球菌血清型 extended-V区同源性分析