酵母双杂交酵母单杂交酵母三杂交完整ppt课件
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4、酵母细胞中,已分离的DNA结合域和 转录激活域不会相互作用,但诱饵蛋白若 能与待筛选的未知蛋白特异性地相互作用 ,则可激活报告基因的转录;反之,则不 能。利用4种报告基因的表达,便可捕捉
到新的蛋白质。
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13
• 酵母双杂交系统的应用
• 1、利用酵母双杂交发现新的蛋白质和蛋白质的新功能
•
当我们将已知基因作为诱饵,在选定的cDNA文库中筛选与诱饵
.
17
•
在酵母双杂交的基础上,又发展出了 酵 母单杂交、酵母三杂交和酵母的反向杂交 技术。它们被分别用于核酸和文库蛋白之 间的研究、三种不同蛋白之间的互作研究 和两种蛋白相互作用的结构和位点。
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•
酵母单杂交技术最早是从酵母双杂交技术发展
而来,酵母双杂交技术通过对报告基因的表型进行 检测以实现对蛋白质间相互作用的研究,而酵母单 杂交技术则通过对报告基因的表型检测,分析DNA、 蛋白之间的相互作用,以研究真核细胞内的基因表 达调控。
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•
3、利用酵母双杂交筛选药物的作用位点以及药物对蛋白 质之间相互作用的影响
酵母双杂交的报告基因能否表达在于诱饵蛋白与靶蛋 白之间的相互作用。对于能够引发疾病反应的蛋白互作可 以采取药物干扰的方法,阻止它们的相互作用以达到治疗 疾病的目的。例如:Dengue病毒能引起黄热病、肝炎等疾 病,研究发现它的病毒RNA复制与依赖于RNA的RNA聚合 酶(NS5)与拓扑异构酶NS3,以及细胞核转运受体BETAimportin的相互作用有关。研究人员通过酵母双杂交技术找 到了这些蛋白之间相互作用的氨基酸序列。如果能找到相 应的基因药物阻断这些蛋白之间的相互作用,就可以阻止 RNA病毒的复制,从而达到治疗这种疾病的目的。
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•
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这种改造后的酵母细胞的基因组中既不能产生 GAL4,又不能合成ADE、 HIS 、LEU、TRP,因 此,酵母在缺乏这些营养的培养基上无法正常生长。 当上述两种载体所表达的融合蛋白能够相互作用时, 功能重建的反式作用因子能够激活酵母基因组中的 报告基因ADE、 HIS、LACZ、MEL1,从而通过功 能互补和显色反应筛选到阳性菌落。将阳性反应的 酵母菌株中的AD-LIBRARY载体提取分离出来,从 而对载体中插入的文库基因进行测序和分析工作。
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2、利用酵母双杂交在细胞体内研究抗原和抗体的相互作用
利用酶联免疫(ELISA)、免疫共沉淀(CO-IP)技术都是 利用抗原和抗体间的免疫反应,可以研究抗原和抗体之间的相 互作用,但是,它们都是基于体外非细胞的环境中研究蛋白质 与蛋白质的相互作用。而在细胞体内的抗原和抗体的聚积反应 则可以通过酵母双杂交进行检测。
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2
• 反式转录激活因子 结构上是组
件式的, 即这些因子往往由两个或两 个以上相互独立的结构域构成, 其中 有DNA结合结构域(DNA binding domain, 简称为BD)和转录激活结构 域(activation domain, 简称为AD) 。
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• 这两个结合域将它们分开时仍分别具有功 能,但不能激活转录,只有当被分开的两 者通过适当的途径在空间上较为接近时, 才能重新呈现完整的转录因子活性,并可
.
11
综上:酵母双杂交系统通过两个杂交
蛋白在酵母细胞中的相互结合及对报告基 因的转录激活来捕获新的蛋白质,其大致
步骤为:
1、视已知蛋白的cDNA序列为诱饵 (bait),将其与DNA结合域融合,构建成
诱饵质粒。
2、将待筛选蛋白的cDNA序列与转 录激活域融合,构建成文库质粒。
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3、将这两个质粒共转化于酵母细胞中。
AD的基因和cDNA文库的基因构建在
AD-LIBRARY表达载体上,在酵母中
表达两者的融合蛋白。
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8
如果诱饵蛋白和靶蛋白能够相互作用,那
么GAL4 DNA 结合结构域和GAL4激 活结构域就会相互作用,从而激活lacZ 报道基因的表达。所以我们可以通过转
化的酵母的表型来确定诱饵蛋白和靶蛋白 是否有相互作用。
蛋白相互作用的蛋白,从筛选到的阳性酵母菌株中可以分离得到AD-
LIBRARY载体,并从载体中进一步克隆得到随机插入的cDNA片段,
并对该片段的编码序列在GENEBANK中进行比较,研究与已知基因
在生物学功能上的联系。
•
另外,也可作为研究已知基因的新功能或多个筛选到的已知基
因之间功能相关的主要方法。
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4、利用酵母双杂交建立基因组蛋白连锁图
众多的蛋白质之间在许多重要的生命活动中都是彼此 协调和控制的。基因组中的编码蛋白质的基因之间存在着 功能上的联系。通过基因组的测序和序列分析发现了很多 新的基因和EST序列,HUA等人利用酵母双杂交技术,将 所有已知基因和EST序列为诱饵,在表达文库中筛选与诱 饵相互作用的蛋白,从而找到基因之间的联系,建立基因 组蛋白连锁图。对于认识一些重要的生命活动:如信号传 导、代谢途径等有重要意义
酵母双杂交
• 是在真核模式生物酵母中进行的,研究活 细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间微 弱的、瞬间的作用也能够通过报告基因的 表达产物敏感地检测得到,它是一种具有 很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。
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1
酵母双杂交系统的建立是基于对真核 生物调控转录起始过程的认识。细胞
起始基因转录需要有反式转录 激活因子的参与
株 具有许多优点: 〈1〉 易于转化、便于回收扩增质粒。 〈2〉具有可直接进行选择的标记基因和特
征性报道基因。 〈3〉酵母的内源性蛋白不易同来源于哺乳
动物的蛋白结合
.
6
根据这个特性,将编码DNA-BD的基因与
已知蛋白质Bait protein的基因构建在同 一个表达载体上,在酵母中表达两者的
BD-Bait protein融合蛋白。将编码
.
19
•
原理用于酵母单杂交系统的酵母GAL4蛋白即是一种典型的Biblioteka Baidu录因
激活上游激活序列(upstream activating sequence, UAS)的下游启 动子,使启动子下游基因得到转录。
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4
酵母双杂交
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5
酵母双杂交系统的另一个重要的元件
报道株指经改造的、含报道基因(reporter gene)
的重组质粒的宿主细胞。 最常用的是酵母细胞, 酵母细胞作为报道
到新的蛋白质。
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• 酵母双杂交系统的应用
• 1、利用酵母双杂交发现新的蛋白质和蛋白质的新功能
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当我们将已知基因作为诱饵,在选定的cDNA文库中筛选与诱饵
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在酵母双杂交的基础上,又发展出了 酵 母单杂交、酵母三杂交和酵母的反向杂交 技术。它们被分别用于核酸和文库蛋白之 间的研究、三种不同蛋白之间的互作研究 和两种蛋白相互作用的结构和位点。
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酵母单杂交技术最早是从酵母双杂交技术发展
而来,酵母双杂交技术通过对报告基因的表型进行 检测以实现对蛋白质间相互作用的研究,而酵母单 杂交技术则通过对报告基因的表型检测,分析DNA、 蛋白之间的相互作用,以研究真核细胞内的基因表 达调控。
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3、利用酵母双杂交筛选药物的作用位点以及药物对蛋白 质之间相互作用的影响
酵母双杂交的报告基因能否表达在于诱饵蛋白与靶蛋 白之间的相互作用。对于能够引发疾病反应的蛋白互作可 以采取药物干扰的方法,阻止它们的相互作用以达到治疗 疾病的目的。例如:Dengue病毒能引起黄热病、肝炎等疾 病,研究发现它的病毒RNA复制与依赖于RNA的RNA聚合 酶(NS5)与拓扑异构酶NS3,以及细胞核转运受体BETAimportin的相互作用有关。研究人员通过酵母双杂交技术找 到了这些蛋白之间相互作用的氨基酸序列。如果能找到相 应的基因药物阻断这些蛋白之间的相互作用,就可以阻止 RNA病毒的复制,从而达到治疗这种疾病的目的。
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这种改造后的酵母细胞的基因组中既不能产生 GAL4,又不能合成ADE、 HIS 、LEU、TRP,因 此,酵母在缺乏这些营养的培养基上无法正常生长。 当上述两种载体所表达的融合蛋白能够相互作用时, 功能重建的反式作用因子能够激活酵母基因组中的 报告基因ADE、 HIS、LACZ、MEL1,从而通过功 能互补和显色反应筛选到阳性菌落。将阳性反应的 酵母菌株中的AD-LIBRARY载体提取分离出来,从 而对载体中插入的文库基因进行测序和分析工作。
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2、利用酵母双杂交在细胞体内研究抗原和抗体的相互作用
利用酶联免疫(ELISA)、免疫共沉淀(CO-IP)技术都是 利用抗原和抗体间的免疫反应,可以研究抗原和抗体之间的相 互作用,但是,它们都是基于体外非细胞的环境中研究蛋白质 与蛋白质的相互作用。而在细胞体内的抗原和抗体的聚积反应 则可以通过酵母双杂交进行检测。
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• 反式转录激活因子 结构上是组
件式的, 即这些因子往往由两个或两 个以上相互独立的结构域构成, 其中 有DNA结合结构域(DNA binding domain, 简称为BD)和转录激活结构 域(activation domain, 简称为AD) 。
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• 这两个结合域将它们分开时仍分别具有功 能,但不能激活转录,只有当被分开的两 者通过适当的途径在空间上较为接近时, 才能重新呈现完整的转录因子活性,并可
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综上:酵母双杂交系统通过两个杂交
蛋白在酵母细胞中的相互结合及对报告基 因的转录激活来捕获新的蛋白质,其大致
步骤为:
1、视已知蛋白的cDNA序列为诱饵 (bait),将其与DNA结合域融合,构建成
诱饵质粒。
2、将待筛选蛋白的cDNA序列与转 录激活域融合,构建成文库质粒。
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3、将这两个质粒共转化于酵母细胞中。
AD的基因和cDNA文库的基因构建在
AD-LIBRARY表达载体上,在酵母中
表达两者的融合蛋白。
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如果诱饵蛋白和靶蛋白能够相互作用,那
么GAL4 DNA 结合结构域和GAL4激 活结构域就会相互作用,从而激活lacZ 报道基因的表达。所以我们可以通过转
化的酵母的表型来确定诱饵蛋白和靶蛋白 是否有相互作用。
蛋白相互作用的蛋白,从筛选到的阳性酵母菌株中可以分离得到AD-
LIBRARY载体,并从载体中进一步克隆得到随机插入的cDNA片段,
并对该片段的编码序列在GENEBANK中进行比较,研究与已知基因
在生物学功能上的联系。
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另外,也可作为研究已知基因的新功能或多个筛选到的已知基
因之间功能相关的主要方法。
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4、利用酵母双杂交建立基因组蛋白连锁图
众多的蛋白质之间在许多重要的生命活动中都是彼此 协调和控制的。基因组中的编码蛋白质的基因之间存在着 功能上的联系。通过基因组的测序和序列分析发现了很多 新的基因和EST序列,HUA等人利用酵母双杂交技术,将 所有已知基因和EST序列为诱饵,在表达文库中筛选与诱 饵相互作用的蛋白,从而找到基因之间的联系,建立基因 组蛋白连锁图。对于认识一些重要的生命活动:如信号传 导、代谢途径等有重要意义
酵母双杂交
• 是在真核模式生物酵母中进行的,研究活 细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间微 弱的、瞬间的作用也能够通过报告基因的 表达产物敏感地检测得到,它是一种具有 很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。
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酵母双杂交系统的建立是基于对真核 生物调控转录起始过程的认识。细胞
起始基因转录需要有反式转录 激活因子的参与
株 具有许多优点: 〈1〉 易于转化、便于回收扩增质粒。 〈2〉具有可直接进行选择的标记基因和特
征性报道基因。 〈3〉酵母的内源性蛋白不易同来源于哺乳
动物的蛋白结合
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根据这个特性,将编码DNA-BD的基因与
已知蛋白质Bait protein的基因构建在同 一个表达载体上,在酵母中表达两者的
BD-Bait protein融合蛋白。将编码
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原理用于酵母单杂交系统的酵母GAL4蛋白即是一种典型的Biblioteka Baidu录因
激活上游激活序列(upstream activating sequence, UAS)的下游启 动子,使启动子下游基因得到转录。
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酵母双杂交
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酵母双杂交系统的另一个重要的元件
报道株指经改造的、含报道基因(reporter gene)
的重组质粒的宿主细胞。 最常用的是酵母细胞, 酵母细胞作为报道