3.2.5.质谱谱图数据库

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各类化合物的质谱

各类化合物的质谱

5. 酰胺类化合物 1分子离子峰较强& 2 α 裂解; γ-氢重排
6. 氨基酸与氨基酸酯
小结:
羰基化合物中 各类化合物的 麦氏重排峰
醛、酮:58+14 n 酯: 74+14 n 酸: 60+14 n 酰胺: 59+14 n
§7 质谱图中常见碎片离子及其可能来源
质谱图的解析
§1 质谱图解析的方法和步骤
6.尽可能推测结构单元和分子结构 7.对质谱的校对、指认
§2 质谱解析实例
1. 请写出下列化合物质谱中基峰离子的形成过程&
① 1;4-二氧环己烷
基峰离子 m/z 28 可能的形成过程为:
② 2-巯基丙酸甲酯 基峰离子 m/z 61 可能的形成过程为:
③ E-1-氯-1-己烯 基峰离子 m/z 56 可能的形成过程为:
34H2S+的峰&
2.硫醚 1硫醚的分子离子峰较相应的硫醇强& 2 α 断裂、碳-硫 σ 键裂解生成 CnH2n+1S+ 系列含硫的
碎片离子&
§4 胺类化合物
1.脂肪胺 1分子离子峰很弱;往往不出现& 2主要裂解方式为 α 断裂和经过四元环过渡态的氢重排& 3出现 30、44、58、72…系列 30+14 n 的含氮特征碎片离子峰&
m/z = 101
C2H4
CH3CH OH m /z =45
CH3
CH3
H C OH
(2)
C4H9 C OH
C2H5
α
C2H5
C HCΒιβλιοθήκη HC2H5m/z = 101
C4H9 rH
CH3CH OH

化学行业免费的谱图数据库18个

化学行业免费的谱图数据库18个

化学专业免费的谱图数据库18个1、【名称】ChemExper化学品目录CDD (包括MSDS、5000张红外谱图)【资源简介】The database contains currently more than 70 000 chemicals, 16000 MSDS, 5000 IR spectra and more than 20 suppliers. It is the only chemical database that lets you SUBMIT your own data! 【检索途径】You can find a chemical by its molecular formula, IUPAC name, common name, CAS number, catalog number, substructure or physical characteristics【地址】http://www.chemexper.be/【名称】 (NMR谱图数据库及NMR谱图预测)【资源简介】This is a web-based approach implementing a new java applet that enables to assign a chemical structure to the corresponding NMR spectrum by simply drawing lines between atoms and automatically characterized signals.This NMR predictor allows to predict the spectrum from the chemical structure based on Spinus (Structure-based Predictions In NUclear magnetic resonance Spectroscopy), which is an on-going project for the development of structure-based tools for fast prediction of NMR spectra developed by Gasteiger (http://www2.chemie.uni-erlangen.de/services/spinus/index.html). SPINUS - WEB currently accepts molecular structures via a Java molecular editor, and estimates 1H NMR chemical shifts.【地址】/2、【名称】BioMagResBank (BMRB): 多肽、蛋白质、核酸等的核磁共振数据存储库【资源简介】IntroductionBioMagResBank (BMRB) is the publicly-accessible depository for NMR results from peptides, proteins, and nucleic acids recognized by the International Society of Magnetic Resonance and by the IUPAC-IUBMB-IUPAB Inter-Union Task Group on the Standardization of Data Bases of Protein and Nucleic Acid Structures Determined by NMR Spectroscopy. In addition, BMRB provides reference information and maintains a collection of NMR pulse sequences and computer software for biomolecular NMR. Access to data in BMRB is free directly from its web site (URL ) and ftp site () and will remain so as public funding permits. The concept of a biomolecular NMR data bank developed under a five-year research grant awarded to the University of Wisconsin-Madison from the National Library of Medicine, National Institutes of Health. This grant was phased out after that period, and a Request for Applications was issued by the NIH for future support of this activity. BMRB at t he University of Wisconsin-Madison won this competition, has been supported since 1 September 1996 by the National Library of Medicine, NIH under grant 1 P41 LM05799. The current award for five years expires on 31 August 2004.AimsIn collaboration with the Protein Data Bank (PDB, Brookhaven National Laboratories) and Nucleic Acid Data Bank (NDB, Rutgers University), BMRB aims to develop into the collection site for structural NMR data in proteins and nucleic acids. Steps are being taken at BMRB to achieve this capability, which will include transmission of all relevant data to the PDB and NDB collections. In addition, BMRB has the goal of archiving NMR-specific data including assigned chemical shifts, J-couplings, relaxation rates, and chemical information derived from NMR investigations (for example, hydrogen exchange rates and pKa values). In developing these collections BMRB intends to be responsive to the needs and priorities of the scientific community. The operating policy at BMRB is monitored and shaped by its Advisory Board which meets once each year to review progress and set priorities. The Advisory Board is composed ofrepresentatives from laboratories that originate and/or use data within the BMRB p urview.【地址】/3、【名称】NIST Chemistry WebBook【资源简介】The November 1998 release of The NIST WebBook is the fifth edition of the NIST Chemistry WebBook. It contains thermochemical data for over 5000 organic and small inorganic compounds, reaction thermochemistry data for over 8000 reactions, IR spectra for over 5000 compounds, mass spectra for over 10,000 compounds, electronic / vibrational spectra for over 3000 compounds, constants ofdiatomic molecules (spectroscopic data) for over 600 compounds, Ion energetics data for over 14,000 compounds, and thermophysical property data for 16 fluids There are many avenues for searching the database. Structures are given for most species, as well as common and commercial names.【检索途径】Formula NamePartial formulaCAS registry numberStructure basedIon energeticsVibrational and electronic spectraMolecular weightAuthor【地址】/chemistry4、【名称】粉末衍射模式数据库PowBase (Powder Patterns Database)【资源简介】PowBase is a "minimum database" of constant wavelength powder patterns. The data files (zipped) contain either a CIF file or a .dat file (the latter can be viewed by WinPLOTR, option INSTRM=0).The search output produces entry numbers with hyperlink to the raw data (zipped files), the formula, wavelength, a comment, and a reference with email address. Some pertinent hyperlinks may be added, and also a VRML 3D view, sometimes.【地址】http://sdpd.univ-lemans.fr/powbase/5、【名称】上海有机化学所:化学数据库【资源简介】上海有机化学研究所的化学专业数据库由多个数据库组成,注册后可免费使用。

化学类相关专业数据库资源

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• 查询化合物性质的网站h ttp:/// • 有机化合物数据 库 /chemistry/cmp/cmp.html http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/cgibin/cre_index.cgi • 经典有机化学反 应 /organicreacti ons.htm • 有机合 成 /orgsyn/default.asp?formg roup=basenpe_form_group&dataaction=db&dbnam e=orgsyn
化学类相关专业数据库资源
国内的网站:
• 化学文献网 /
• 查询国内化学期刊资料的网站:中国期刊 网 • 重庆维普中文科技期刊全文 库 • 万方数字化全文期 刊
中科院化学专业数据库介绍
• 中科院化学专业数据库,由上海有机所建 设,网站地址 http://202.127.145.134/scdb http://202.127.145.134/default.htm。 网站需要注册,注册后即可免费使用所有 数据库。 • 化学专业数据库目前已经建设完成19个方 面的数据内容与技术。
• 欧洲专利、PCT及世界各国专利数据库 ( /) • Derwent专利数据库(http://)
• 收录了共16,000多家国内化学化工产品供应
厂商,以及共67,000多条化工产品信息。检
索途径为,供应厂商检索,产品检索以及
组合检索,可获取产品厂商,产品物化性 质,以及产品价格等信息。
毒性化合物数据库
• 收录了大约150,000个毒性化合物,检索途
径为化合物名称检索,化合物分子式检索,
CA登录号检索,主要包括了化合物物化性
者名检索,期刊名检索,发行机构名检索

质谱谱图解析

质谱谱图解析
2. 除了分子离子峰m/z 126为偶数外,其余碎片峰(m/z)都是奇数, 因此未知物不含N
3. 根据分子离子峰的同位素丰度,未知物含有2-3个O及5-6个C,分子 量为126的合理化学式只有三个:C5H2O4,C6H6O3,C7H10O2,由以 上判断,最有可能的化学式为C6H6O3
4. 根据C6H6O3计算环加双键值为4
至此,可排出可能的ห้องสมุดไป่ตู้构为呋喃甲酸甲酯,但无法确定是哪个异构体。 这两个异构体都能产生谱图中的重要峰
若有高分辨质谱数据,即可直接获得m/z 67,m/z 95的元素组成,使 解析大为简化
最后,还要合成这两个异构体,再根据这两个异构体的质谱图和色谱 保留时间最终确定未知物结构
两种异构体产生谱图中重要峰的途径如下:
例 12
这是一张由植物中提取的一种成分的质谱图,应用化学电离技术获得分 子量为151,由同位素丰度得到该分子元素组成为C9H13NO
7. 未知物化学式比色酮和香豆素多了一个O,即多一个羟基
8. 天然的色酮及香豆素衍生物类化合物中,取代基多位于A环:
9. 由香豆素及色酮的质谱图可看到两者都发生消除反应,失去[CO],产生 [M-28]碎片离子,但只有色酮发生失去乙炔的消除反应,产生[M-26]碎片 离子,而香豆素不发生这种反应
10. 未知物的谱图中只有[M-28]的碎片峰(m/z 118),而没有[M-26]的 碎片峰(m/z 120),因此排除了羟基色酮的可能
1. 未知物谱图中质量数最高的峰是m/z 254(偶数),与m/z 226相差28 u,为失去合理中性物,因此认定m/z 254为分子离子峰
2. 由m/z 254离子的元素组成C15H10O4计算其环加双键值为11 3. 分子离子峰为基峰环加双键值为11可产生[M-28]+显著碎片峰,具有

nist标准质谱数据库

nist标准质谱数据库

nist标准质谱数据库NIST标准质谱数据库。

NIST标准质谱数据库(NIST MS库)是由美国国家标准与技术研究院(NIST)开发的一套用于质谱数据分析的标准参考库。

该数据库收集了大量化合物的质谱数据,为科学家、化学家、药学家和环境科学家等提供了重要的参考信息。

NIST MS 库的建立旨在帮助用户识别和鉴定未知化合物,推动科学研究和工业应用的发展。

NIST MS库包含了各种类型的质谱数据,涵盖了不同化合物的碎片图谱、质谱谱图和质谱库等信息。

用户可以通过查询该数据库来获取化合物的质谱信息,从而进行化合物的鉴定和结构分析。

此外,NIST MS库还提供了丰富的质谱数据比对工具,帮助用户快速准确地分析和解释实验数据。

NIST MS库的应用领域非常广泛,主要包括但不限于以下几个方面:1. 化合物鉴定与结构分析,科学家可以通过NIST MS库快速准确地识别未知化合物的质谱信息,从而确定其分子结构和化学性质。

2. 药物研发与药物分析,药学家可以利用NIST MS库对药物进行质谱分析,帮助药物研发和药物质量控制。

3. 环境污染物分析,环境科学家可以利用NIST MS库对环境样品中的有机污染物进行质谱鉴定和定量分析,从而评估环境污染程度和影响。

4. 食品安全与质量控制,食品科学家可以利用NIST MS库对食品中的添加剂、农药残留和食品成分进行质谱分析,保障食品安全和质量。

总的来说,NIST MS库是一套非常重要的质谱数据库,为科学研究和工业应用提供了强大的支持。

通过利用NIST MS库,用户可以快速准确地获取化合物的质谱信息,推动科学研究和技术创新的发展。

希望NIST MS库能够继续完善和更新,为广大用户提供更加全面和可靠的质谱数据服务。

质谱介绍及质谱图的解析(来源小木虫)

质谱介绍及质谱图的解析(来源小木虫)

1 质谱介绍及质谱图的解析来源小木虫质谱法是将被测物质离子化按离子的质荷比分离测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法。

质量是物质的固有特征之一不同的物质有不同的质量谱——质谱利用这一性质可以进行定性分析包括分子质量和相关结构信息谱峰强度也与它代表的化合物含量有关可以用于定量分析。

质谱仪一般由四部分组成进样系统——按电离方式的需要将样品送入离子源的适当部位离子源——用来使样品分子电离生成离子并使生成的离子会聚成有一定能量和几何形状的离子束质量分析器——利用电磁场包括磁场、磁场和电场的组合、高频电场、和高频脉冲电场等的作用将来自离子源的离子束中不同质荷比的离子按空间位置时间先后或运动轨道稳定与否等形式进行分离检测器——用来接受、检测和记录被分离后的离子信号。

一般情况下进样系统将待测物在不破坏系统真空的情况下导入离子源10-610-8mmHg离子化后由质量分析器分离再检测计算机系统对仪器进行控制、采集和处理数据并可将质谱图与数据库中的谱图进行比较。

一、进样系统和接口技术将样品导入质谱仪可分为直接进样和通过接口两种方式实现。

1. 直接进样在室温和常压下气态或液态样品可通过一个可调喷口装置以中性流的形式导入离子源。

吸附在固体上或溶解在液体中的挥发性物质可通过顶空分析器进行富集利用吸附柱捕集再采用程序升温的方式使之解吸经毛细管导入质谱仪。

对于固体样品常用进样杆直接导入。

将样品置于进样杆顶部的小坩埚中通过在离子源附近的真空环境中加热的方式导入样品或者可通过在离子化室中将样品从一可迅速加热的金属丝上解吸或者使用激光辅助解吸的方式进行。

这种方法可与电子轰击电离、化学电离以及场电离结合适用于热稳定性差或者难挥发物的分析。

目前质谱进样系统发展较快的是多种液相色谱/质谱联用的接口技术用以将色谱流出物导入质谱经离子化后供质谱分析。

主要技术包括各种喷雾技术电喷雾热喷雾和离子喷雾传送装置粒子束和粒子诱导解吸快原子轰击等。

质谱解析基础 ppt课件

质谱解析基础 ppt课件
i断裂和α断裂同时存在, α断裂的几率大于i断裂。但由于α断裂生成的m/z 59还 有进一步的断裂,因此,在乙醚的质谱中,m/z 59 并不比m/z 29强。
(2)诱导断裂
• 酮类也经常会发生下面的i-断裂
•卤素有很强的i断裂反应的趋势
如1-溴丁烷发生i-断裂 产生的碎片(C4H9+, 57) 是丰度最大的基峰
•醛、酮、羧酸、酯、酰胺、碳酸酯、磷酸酯、肟、 腙、烯、炔以及烷基苯等的含有γ-H的有机化合物 很容易发生麦氏重排
以长链羧酸甲酯为例,裂解过程如下:
(2)逆迪尔斯-阿尔德重排(retro Diels-Alder fragmentation,
三、EI有机化合物裂解的一般规律
(一)、影响有机化合物在质谱仪中裂解的主要因素 • 1.裂解产物(包括碎片离子、中性分子、自由基)的稳
定性以及产生这一稳定碎片离子所需要能量的高低。碎片 离子的稳定性越大,其相对强度越高。 • 2.电荷自由基定域理论(Charge Localization)
假定电离后,在分子离子上的电荷或自由基被认为是 定域在分子离子中的某一特定位置上,由它通过转移一个 电子或两个电子而使裂解反应发生。 • 3.键断裂的难易程度,键越弱越容易断裂。 • 4.产生五、六元环过渡态的难易程度。一般形成五元或 六元环的过渡态,随后消除一个中性分子的裂解反应较易 发生。 • 5.丢失最大烃基规则(Loss of Largest Alkyl Group)
三、EI有机化合物裂解的一般规律
• EI质谱除分子离子峰外,可观察到极丰富的碎片 离子
• 碎片离子峰的相对丰度,与分子中键的相对强度、 断裂产物的稳定性及原子或基团的空间排列有关, 其中裂解产物的稳定性是主要因素
• 由于碎片离子峰,特别是相对丰度大的碎片离子 峰,与化合物的分子结构有密切的关系,因此研 究分子离子的裂解规律和裂解机理有助于推测和 解析化合物的结构

探秘蛋白质测序技术原理与流程

探秘蛋白质测序技术原理与流程

探秘蛋白质测序技术原理与流程1. 蛋白质测序技术概述蛋白质测序技术是指确定蛋白质的氨基酸序列的方法。

它可以帮助我们了解蛋白质的结构、功能和相互作用,从而推动药物研发、疾病诊断和治疗等领域的发展。

目前常用的蛋白质测序技术主要包括质谱法和测序法两大类。

1.1 质谱法质谱法是一种基于质量-电荷比的测序技术,主要包括质谱仪器和质谱数据分析两个步骤。

质谱仪器可以将蛋白质分子转化为离子,并通过质谱分析得到离子的质量-电荷比。

质谱数据分析则利用计算方法将离子质谱图转化为蛋白质的氨基酸序列。

1.2 测序法测序法是一种直接测定蛋白质氨基酸序列的技术,主要包括Sanger测序和高通量测序两种方法。

Sanger测序是一种经典的测序技术,通过DNA合成反应逐个测定蛋白质的氨基酸序列。

高通量测序则利用并行测序技术,可以同时测定多个蛋白质的序列。

2. 质谱法的原理和流程质谱法是目前应用最广泛的蛋白质测序技术之一,其原理和流程如下:2.1 原理质谱法基于质量-电荷比的原理,通过将蛋白质分子转化为离子,并在质谱仪器中进行分析,得到离子的质量-电荷比。

根据离子的质量-电荷比,可以推断出蛋白质的氨基酸序列。

2.2 流程质谱法的流程主要包括样品制备、质谱仪器分析和数据分析三个步骤。

2.2.1 样品制备样品制备是质谱法的关键步骤,它要求样品纯度高、浓度适宜,并且需要进行前处理步骤,如蛋白质的消化、分离和纯化等。

2.2.2 质谱仪器分析质谱仪器分析是质谱法的核心步骤,它包括离子化、质谱分析和离子检测等过程。

离子化可以通过电喷雾、MALDI等方法实现,质谱分析则利用质谱仪器对离子进行分析,离子检测则将质谱信号转化为电信号。

2.2.3 数据分析数据分析是质谱法的最后一步,它包括质谱图的解析和蛋白质序列的推断。

质谱图的解析可以通过计算方法和数据库比对等手段实现,蛋白质序列的推断则是根据质谱图中离子的质量-电荷比进行推断。

3. 测序法的原理和流程测序法是一种直接测定蛋白质氨基酸序列的技术,其原理和流程如下:3.1 原理测序法通过直接测定蛋白质的氨基酸序列来揭示蛋白质的组成和结构。

质谱分析实验报告

质谱分析实验报告

质谱分析实验报告1. 引言实验目的:通过质谱分析仪器对待测样品进行分析,获得其质谱图谱,并对样品的组成和结构进行解析。

实验原理:质谱是通过将待测样品转化为离子,并在磁场中进行运动,利用离子质荷比的差异,将离子分离和检测的一种分析技术。

2. 实验步骤2.1 样品制备首先,将待测样品溶解于适当的溶剂中,制备出待测溶液。

确保溶液的浓度适中,以获得清晰的质谱图谱。

2.2 仪器设置根据待测样品的性质和目的,调整质谱仪的参数,如加热温度、离子化方式等。

确保仪器处于稳定的工作状态。

2.3 样品进样将待测溶液以适当的速率进样到质谱仪的离子化室中。

注意避免气泡的产生,并确保样品进入离子化室前已被均匀雾化。

2.4 质谱分析开始采集质谱图谱数据。

根据实验要求,选择质谱扫描模式和质谱图谱的范围。

将采集到的数据进行处理和记录。

3. 实验结果与分析通过质谱分析仪器测得的质谱图谱,可以得到对应的峰位、峰强度和峰的区域。

根据质谱图谱的特征,可以进行如下分析:3.1 总离子流图总离子流图显示了离子强度与质量电荷比的关系。

通过分析总离子流图,可以确定样品的主要成分和相对丰度。

3.2 特征离子峰在质谱图谱中,可以观察到特定的离子峰。

通过对这些离子峰的质荷比和相对丰度进行分析,可以确定样品的结构和组分。

3.3 质谱图谱解析根据待测样品的特性和实验目的,比对已知化合物的质谱图谱数据库,并与实验测得的质谱图谱进行对比分析,以获得更详细的结构信息。

4. 结论通过质谱分析实验,获得了待测样品的质谱图谱,并对其组成和结构进行了解析。

实验结果表明,样品中含有XXX成分,并且其结构为XXX。

实验结果与已知数据吻合度较高,证明了质谱分析的准确性和可靠性。

5. 实验总结本实验利用质谱分析仪器对待测样品进行了分析,通过质谱图谱的解析,得到了样品的组成和结构信息。

然而,在实验过程中仍存在一些问题和不足之处,如样品制备的精确度和质谱仪器的灵敏度等。

为了进一步提高实验结果的准确性和可靠性,有必要在样品制备和仪器操作方面进行更深入的研究和优化。

质谱仪操作指南说明书

质谱仪操作指南说明书

质谱仪操作指南说明书1. 简介质谱仪是一种用于分析物质组成和结构的科学仪器。

该操作指南说明书旨在为用户提供质谱仪的操作方法,以确保准确、有效地使用质谱仪进行实验研究。

2. 仪器安装在开始操作质谱仪之前,首先需要正确安装仪器。

以下是仪器安装的步骤:2.1 检查仪器包装和运输过程中是否损坏。

2.2 根据仪器安装手册,将质谱仪的各个部件正确连接。

2.3 确保仪器连接稳定,各部分功能正常。

3. 仪器操作3.1 打开质谱仪的电源,并进行预热。

根据仪器型号和厂商提供的说明,设置合适的预热时间和预热温度。

3.2 启动质谱仪的操作系统,并进行初始化。

根据仪器型号和操作系统,选择合适的初始化程序进行操作。

3.3 调整仪器的参数设置,包括扫描速率、电离方式、碰撞能量等。

根据实验需要,灵活选择参数设置。

3.4 根据待测物质的性质,选择合适的样品制备方法。

样品制备要求根据具体实验目的而定。

3.5 将待测样品放入质谱仪的样品室,并按照仪器操作手册正确设置进样方式。

3.6 进行质谱实验,并观察仪器的数据输出。

根据实验需要,可调整仪器参数以获得更精确的结果。

3.7 实验结束后,关闭质谱仪的电源,并进行仪器的清洁和维护。

4. 数据分析通过质谱仪获取的数据需要进行进一步的分析和解读。

以下是数据分析的步骤:4.1 使用专门的数据分析软件将质谱仪输出的原始数据进行处理,包括数据校准、去噪、数据对比等。

4.2 对处理后的数据进行峰识别和峰面积计算,以确定样品中各组分的相对含量。

4.3 利用质谱图谱库或相关数据库,对质谱数据进行解释和标识,以确定样品中各组分的结构和化学信息。

4.4 对数据分析结果进行统计和图表展示,以便更直观地展示实验结果。

5. 安全使用为了保障实验人员和设备的安全,使用质谱仪时需要注意以下事项:5.1 确保实验室内通风良好,及时处理有害化学品废液和废料。

5.2 在操作过程中佩戴个人防护装备,如手套和护目镜。

5.3 注意仪器运行过程中的温度和电压等参数,避免发生设备过热或电击等危险。

质谱碎片峰数值参考-定义说明解析

质谱碎片峰数值参考-定义说明解析

质谱碎片峰数值参考-概述说明以及解释1.引言1.1 概述质谱碎片峰数值参考是质谱分析中一个重要的参数,它用于描述质谱图中的碎片峰数量。

在质谱分析中,通过对待测物质进行电离,将其转化为带电的离子,并利用质谱仪进行进一步分析。

在质谱分析的过程中,待测物质会经历一系列的分解反应,形成各种不同的碎片峰。

这些碎片峰的数值参考对于准确的质谱分析结果至关重要。

质谱碎片峰数值参考是指在质谱图中,用于表示待测物质分解产物的峰的数量。

这些分解产物峰的数值参考可以通过质谱仪的数据分析软件来获取。

根据待测物质的性质和分解机制,不同的质谱图中会出现不同数目的碎片峰。

因此,质谱碎片峰数值参考是一个具有选择性的参考指标,能够反映待测物质的化学结构和分解反应途径。

质谱碎片峰数值参考在许多领域具有广泛的应用。

在药物研发领域,通过分析药物的质谱图,可以确定药物的分解产物,从而评估药物的稳定性和药效。

在环境和食品安全领域,质谱碎片峰数值参考可以用于分析有机污染物和农药的降解产物,以评估其对环境和人体的潜在危害。

此外,质谱碎片峰数值参考还可以应用于生物医学研究、食品鉴定和法医学等领域。

随着质谱技术的不断发展,质谱碎片峰数值参考也在不断进步和完善。

新的分析方法和算法的引入,使得质谱碎片峰数值参考的获取更加准确和可靠。

未来,我们可以期待质谱碎片峰数值参考在更多领域的应用,为科学研究和实际应用提供更为可靠的质谱分析结果。

同时,对于质谱碎片峰数值参考的研究和探索也将推动质谱技术的发展,为我们更深入地了解物质的分解反应和化学性质提供更多的有价值信息。

1.2文章结构文章结构的主要目的是为读者提供一个整体的框架,使其能够清晰地了解文章的组织结构和内容安排。

本文的结构分为引言、正文和结论三个部分。

引言部分将提供对质谱碎片峰数值参考的概述,介绍该主题的重要性和目的,并对全文进行总结。

这一部分的主要目的是为读者提供对整篇文章的概括,引起读者的兴趣,使其理解本文的研究背景和问题。

液相色谱质谱联用原始数据处理_概述说明

液相色谱质谱联用原始数据处理_概述说明

液相色谱质谱联用原始数据处理概述说明1. 引言1.1 概述液相色谱质谱联用技术(LC-MS)是一种广泛应用于分析化学领域的强大工具。

该技术结合了液相色谱(LC)和质谱(MS),能够同时获取分子的保留时间和质荷比信息,以实现高灵敏度与高选择性的分析。

然而,在进行液相色谱质谱联用实验后获得的原始数据需要进行处理和解释,以充分利用这些数据。

本文将对液相色谱质谱联用原始数据处理进行概述和说明。

1.2 文章结构本文共分为五个部分。

引言部分(第1节)将介绍文章的背景和目的。

第2节将详细阐述液相色谱质谱联用原始数据获取、预处理以及解析与分析方法等方面的内容。

第3节将通过生物医药、环境监测和食品安全三个领域的应用案例来展示液相色谱质谱联用原始数据处理技术在实际中的应用价值。

在第4节中,我们将讨论该领域中面临的挑战,并展望未来相关软件工具发展、数据共享与标准化的问题和前景。

最后,我们在第5节中总结本文的主要观点,并提出对未来研究方向的展望。

1.3 目的本文旨在全面介绍液相色谱质谱联用原始数据处理技术及其应用案例。

首先,我们将详细探讨液相色谱质谱联用实验中原始数据获取的方法和技巧。

其次,我们将介绍常见的数据预处理方法,如去噪、信号校正和数据对齐等,在处理原始数据时起到重要作用。

此外,我们还将探究目前常用的数据解析与分析方法,例如基于统计学模型或机器学习算法的定性分析和定量分析。

从而帮助读者更好地理解该领域中液相色谱质谱联用原始数据处理所设计和采用的各种策略与方法。

随着科学研究和工业实践对高通量、高灵敏度、高精确度分析结果需求不断增加,液相色谱质谱联用技术在各个领域都得到了广泛应用。

因此,在文章接下来的部分,我们将通过一些典型应用案例详细介绍该技术在生物医药、环境监测和食品安全领域中的应用。

同时,我们将探讨液相色谱质谱联用原始数据处理所面临的挑战,并对未来相关软件工具发展、数据共享与标准化等问题提出一些建议。

通过阅读本文,读者将能够全面了解液相色谱质谱联用原始数据处理的基本概念、方法和应用。

蛋白组学质谱数据分析报告

蛋白组学质谱数据分析报告

蛋白组学质谱数据分析报告1. 引言蛋白组学质谱数据分析是一项重要的研究领域,通过质谱技术可以快速、高效地鉴定和定量蛋白质样本中的成分。

本报告将对蛋白组学质谱数据分析的方法和结果进行详细介绍。

2. 实验设计与方法2.1 样本准备样本准备是蛋白组学研究的关键步骤之一。

在本次实验中,我们使用了XXX细胞系培养物作为样本,经过细胞裂解和蛋白质提取后,采用XXX方法进行样品的预处理。

2.2 质谱分析在本次实验中,我们使用了XXX质谱仪进行蛋白质样品的分析。

质谱分析可以将样品中的蛋白质分子通过质量-电荷比(m/z)的测定进行鉴定和定量。

2.3 数据分析蛋白组学质谱数据分析包括鉴定和定量两个主要的步骤。

在本次实验中,我们使用了XXX软件对质谱数据进行处理和分析。

具体的数据分析流程如下:1.数据预处理:包括峰提取、去噪、质量校正等步骤,以获得高质量的质谱数据。

2.蛋白鉴定:通过与已知蛋白质数据库进行比对,确定质谱谱图中的峰对应的蛋白质。

鉴定的结果包括蛋白质的名称、序列、覆盖率等信息。

3.蛋白定量:根据质谱峰的相对强度或面积,确定样品中不同蛋白质的含量。

定量结果可以反映样品中蛋白质的相对丰度。

3. 结果与讨论3.1 数据预处理结果经过数据预处理,我们得到了质谱数据的峰列表。

每个峰对应一个蛋白质,通过与已知蛋白质数据库的比对,我们成功鉴定了XXX个蛋白质。

3.2 蛋白鉴定结果经过蛋白鉴定步骤,我们获得了每个鉴定蛋白质的详细信息。

其中包括蛋白质的名称、序列、预测功能等。

通过进一步的分析,我们发现XXX蛋白质在样本中的表达量较高。

3.3 蛋白定量结果根据质谱峰的相对强度或面积,我们成功确定了样品中不同蛋白质的含量。

定量结果表明XXX蛋白质在样品中的相对丰度最高,说明其在细胞中的重要作用。

4. 结论通过蛋白组学质谱数据分析,我们成功鉴定和定量了样品中的蛋白质成分。

这些结果为进一步研究细胞的功能和调控机制提供了重要的基础。

质谱-ppt

质谱-ppt

200 pg 六氯苯 71
107 142 179 214 249
60 ng 六氯苯 107 100 142 177 150 214 200 249 250
在TRACE MS EI/70获得的结果
CI谱图
Scan EI+
100
% 51 0 100 % 0
105 77 76 78 182 苯甲酮, EI
99 113
142 m/z
正癸烷
EI的优缺点
• 优点 • 1.高的灵敏度 • 2.有达10万个化合物的 数据库可快速检索 • 3.可根据碎片方式鉴定 未知物 • 4.从碎片离子判定结构 • 缺点 • 1.质量范围小 • 2.有可能汽化前发生解 离 • 3.碎片过多有时看不到 分子离子
(2)化学电离源
2 质谱仪的发展史
1912年:
40年代:
世界第一台质谱装置
质谱仪用于同位素测定
50年代: 分析石油 60年代: 研究GC-MS联用技术 70年代: 计算机引入
90年代:由于生物分析的需要,一些新的离子 化方法得到快速发展,如快原子轰击离子源, 基质辅助激光解吸电离源,电喷雾电离源,大 气压化学电离源等。 目前:出现了比较成熟的液相色谱-质谱联用 仪,感应耦合等离子体质谱仪,富立叶变换质 谱仪等。质谱分析法已广泛地应用于化学、化 工、材料、环境、地质、能源、药物、刑侦、 生命科学、运动医学等各个领域。
特点:
得到一系列准分子离子(M+1)+,(M-1)+, (M+29)+等等; CI源的的碎片离子峰少,图谱简单,易于解释; 不适于难挥发成分的分析。
甲烷 异丁烷 氨
I35 / I18 = 0.05 I57 / I43 = 1 I35 / I18 = 0.05

气相色谱-质谱联用技术

气相色谱-质谱联用技术

气相色谱-质谱联用技术气相色谱-质谱联用技术,简称质谱联用,即将气相色谱仪与质谱仪通过接口组件进行连接,以气相色谱作为试样分离、制备的手段,将质谱作为气相色谱的在线检测手段进行定性、定量分析,辅以相应的数据收集与控制系统构建而成的一种色谱-质谱联用技术,在化工、石油、环境、农业、法医、生物医药等方面,已经成为一种获得广泛应用的成熟的常规分析技术。

1、产生背景色谱法是一种很好的分离手段,可以将复杂混合物中的各种组分分离开,但它的定性、鉴定结构的能力较差,并且气相色谱需要多种检测器来解决不同化合物响应值的差别问题;质谱对未知化合物的结构有很强的鉴别能力,定性专属性高,可提供准确的结构信息,灵敏度高,检测快速,但质谱法的不同离子化方式和质量分析技术有其局限性,且对未知化合物进行鉴定,需要高纯度的样本,否则杂质形成的本底对样品的质谱图产生干扰,不利于质谱图的解析。

气相色谱法对组分复杂的样品能进行有效的分离,可提供纯度高的样品,正好满足了质谱鉴定的要求。

气相色谱-质谱联用(gas chromatography-mass sepetrometry , GC-MS)技术综合了气相色谱和质谱的优点,具有GC的高分辨率和质谱的高灵敏度、强鉴别能力。

GC-MS可同时完成待测组分的分离、鉴定和定量,被广泛应用于复杂组分的分离与鉴定。

2、技术原理与特点气相色谱技术是利用一定温度下不同化合物在流动相(载气)和固定相中分配系数的差异,使不同化合物按时间先后在色谱柱中流出,从而达到分离分析的目的。

保留时间是气象色谱进行定性的依据,而色谱峰高或峰面积是定量的手段,所以气相色谱对复杂的混合物可以进行有效地定性定量分析。

其特点在于高效的分离能力和良好的灵敏度。

由于一根色谱柱不能完全分离所有化合物,以保留时间作为定性指标的方法往往存在明显的局限性,特别是对于同分异构化合物或者同位素化合物的分离效果较差。

质谱技术是将汽化的样品分子在高真空的离子源内转化为带电离子,经电离、引出和聚焦后进入质量分析器,在磁场或电场作用下,按时间先后或空间位置进行质荷比(质量和电荷的比,m/z)分离,最后被离子检测器检测。

第十二章 液质联用

第十二章 液质联用

第十二章液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)12.1 概述LC-MS联用的研究起步于20世纪70年代。

多数质谱仪具有对样品纯度要求较高、可进行有效定性分析的特点;色谱是分离复杂混合物中不同组分最常用的方法之一,但是在定性、定量结构分析方面相对质谱仪较差。

因此,将色谱技术和质谱技术联用既可以充分发挥色谱法高分离效率的优点又可以充分发挥质谱法高定性专属性的能力的优点,这为科研工作者提供了一种可以对复杂化合物进行高效定性定量分析的工具。

在色谱-质谱联用仪中,气相色谱-质谱(GC-MS)联用仪是最早开发的色谱联用仪器,但在自然界和人工合成的化合物中,不挥发或热不稳定的化合物约占80%,只能用液相色谱分离。

液相色谱-质谱联用(LC-MS)比气相色谱-质谱联用困难得多,主要是因为液相色谱的流动相是液体,如果让液相色谱的流动相直接进入质谱,则将严重破坏质谱系统的真空,也将干扰被测样品的质谱分析。

因此,液相色谱-质谱联用技术发展的比较缓慢。

进入20世纪90年代,液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术的发展最为引人注目。

这是因为LC-MS中的MS应是“软的”多级串联质谱(MS n)。

一般情况下,LC-MS检测的是非挥发或热不稳定的样品,因此需要找到一种能将低浓度样品分子传到气相中的方法。

另外,热不稳定性化合物的检测应该采取“软电离”的方式以避免因失去分子离子峰而得不到化合物的分子量信息。

20世纪末发现的电喷雾接口(ESI)和大气压下电离接口(APCI),不仅解决了使用LC-MS时对液相色谱流动相的诸多限制,而且大大提高了检测的灵敏度。

此外,还可以根据“软电离”方式产生的准分子离子峰并结合多级质谱产生的丰富结构碎片,准确地推断未知化合物的结构。

利用MS-MS进行选择反应检测(SRM),具有很高的选择性,因而具有很高的定量灵敏度和可靠性。

通过大气压下的接口,液相色谱不仅可以与四级杆质谱联用,而且还可以与当今最先进的正交飞行时间质谱、基质辅助飞行时间质谱以及离子阱质谱联用。

质谱网站

质谱网站

质谱, 网站, 大搜罗The NIST Chemistry WebBook (免费)/chemistryNetSci的计算化学软件目录/Resources/Software/The Encyclopedia of Mass Spectrometry/inca/publications/store/6/2/1/4/1/1/...Internet Resources for Mass Spectrometry(Internet质谱资源介绍) (免费) /articles/jms_intres.pdfSDBS: NIMC有机物谱图库,*** (免费)http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.htmlAnnual Workshop on SIMS/Bio-Rad推出可检索80万张谱图的Internet版数据库(03-09-2004) /Spy/basehtml/SpyH/1,1181,4-1-...European Journal of Mass Spectrometry (EJMS) (免费,摘要)/ems.htmlCritical Reviews in Analytical Chemistry (免费,摘要)/ejournals/issues/issue_years.asp?...HighChem, Ltd. (质谱软件)/ (Mass Spectrometry's web address)/International Journal of Mass Spectrometry (Former title: International Journal of Mass Spectrometry and Ion Processes)(免费,摘要)/locate/ijmsipIntroduction to Organic Chemistry, Revised Printing, 4/E/catalog/academic/product/0,4096,0139... /cinf/milne.htmElectrospray Mass Spectrometry at the University of Leeds/Facil/mass.htmJEOL USA, Inc. 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(质谱仪和气相色谱服务商)/Shula Levin's Homepage of HPLC and LC-MS Since 1997 (HPLC, LC/MS和IR相关教学资料和网络资源链接)/Spectroscopy Letters (免费,摘要)/servlet/product/productid/SLSPEX CertiPrep, Inc.样品制备仪器和标准参考物质(元素溶液)目录及MSDS/crmmain/msds/msds.htmThe Analyst (免费,目录)/is/journals/current/analyst/about.htmThe Complex Carbohydrate Research Center (复杂碳水化合物研究中心)/The LC/MS Home Page & The LC/MS Bookstore 液相色谱法/质谱法) /TIMS List热电离质谱学)/archives/tims-l.htmlUsenet Mass Spectrometry Newsgroup (质谱学) (免费)/stms/Waters Corporation (高效液相色谱、质谱)/Wiley Registry of Mass Spectral Data, 7th Edition (质谱数据库) /html/wap-pr.htm爱尔兰质谱学会(IMSS)http://www.imss.ie/index.htm澳大利亚分离科学研究中心(ACROSS).au/澳大利亚墨尔本大学:化学学院.au/澳大利亚与新西兰质谱学会(ANZSMS).au/anzsms/比利时安特卫普大学化学系http://sch-www.uia.ac.be/en/index.html比利时根特大学:毒物学实验室http://allserv.rug.ac.be/~wlambert/表面科学常用缩略语及相关解释词汇目录/tech/list.html表面科学建模、分析和可视化软件与数据库指南(部分免费)/software.html#1波兰质谱学会(PMSS)http://ptsm.ibch.poznan.pl/PTSM_main.htm德国University of Erlangen-Nuremberg计算机化学中心:Johann Gasteiger教授http://www.chemie.uni-erlangen.de/gasteiger/德国柏林技术大学化学学院有机化学系:Schwarz的研究小组http://www.chem.tu-berlin.de/AK-Schwarz/第16届国际质谱学大会(16th IMSC)(2003-08-31)/17届国际质谱学大会(2006-08-27)/第19届阿撒拉墨质谱会议-生物分子相互作用:蛋白质复合物的鉴定与特征描述(2003-10-17)/confAsilomar2003.php第20届法国质谱学会议(2003-09-16)http://amsterdam.ipbs.fr/20jfsm/anglais/home.htm第6届健康与生命科学领域分子与细胞蛋白质组学质谱国际大会(2003-08-24)/symposium/分析技术描述(Evans Analytical Group相关专业分析技术的教材,检测极限列表和几种分析仪器优缺点对比)/tech.htm分子反应动力学国家重点实验室中国科学院化学研究所http://159.226.64.133/复杂碳水化合物谱图库(Proton NMR、GC-EIMS) (免费)/web/specdb/specdbframe.html国际质谱学会(IMSS)http://www.imss.nl/荷兰Twente大学:Nico N. M. Nibbering教授的研究小组(质谱)http://smct.ct.utwente.nl/people/nicon/nicon.html荷兰质谱学会(NVMS)http://www.denvms.nl/加拿大曼尼托巴大学物理学与天文学系Kenneth G. Standing教授(质谱)http://www.physics.umanitoba.ca/people/faculty/standing.html检索质谱文献库Mass Spectrometry Bulletin/is/database/msbhome.htm链接部分国家的质谱学会/esms/ESMSlink.htm美国爱荷华州立大学化学系:R. S. Houk教授的研究组(无机质谱)/faculty/Robert_Houk/homepage.htm...美国东北大学Barnett研究中心:Barry L. Karger教授的研究小组/KargerRG/美国范德比尔特大学:质谱研究中心(Mass Spectrometry Research Center (MSRC) at the Vanderbilt University Medical Center in Nashville)/美国佛罗里达州立大学化学与生物化学系:Alan G. Marshall教授的研究小组/faculty/marshall.htm美国加利福尼亚大学欧文分校化学系:Barbara J. Finlayson-Pitts教授的研究小组/people/faculty/bjfinlay/美国加州理工学院化学系:Jesse L. Beauchamp教授的研究小组/美国洛克菲勒大学质谱学与气体离子化学实验室:Brian T. Chait教授/research/abstract.php?id=18美国马里兰大学化学与生物化学系:Catherine C. Fenselau教授的研究小组(生物质谱) /biochem/fenselau/index.html美国史蒂文斯理工学院化学与化学生物学系:A. K. Ganguly教授(合成有机化学) /chem_chembio/People/Faculty/A...美国学术性质谱网站链接导航/index/referenc/academicsites.html美国印第安那大学:Hites分析环境化学实验室/~hiteslab/美国犹他大学化学系:Peter B. Armentrout教授的研究小组/faculty/armentrout/armentrout.html美国质谱学会(ASMS, American Association for Mass Spectrometry)/南非质谱协会(SAAMS)http://www.saams.up.ac.za/欧洲质谱学会(ESMS)/esms/岛津公司:Koichi Tanaka (2002年诺贝尔化学奖获得者)/about/nobel/***高纯度化学研究所http://www1m.mesh.ne.jp/kojundo/e/index.htm***质谱学会(MSSJ)http://www.mssj.jp/瑞典质谱学会(SMSS)http://www.smss.uu.se/瑞士质谱组(SGMS)http://www.sgms.ch/生物技术中的质谱仪器相关资源/以色列巴依兰大学:化学系http://www.biu.ac.il/ESC/ch/印度质谱学会(ISMAS)/英国表面分析论坛英国伦敦大学比克贝克学院生物与化学学院:分析科学研究小组/~chm_tgc/英国曼彻斯特理工大学化学系:J. Philip Day的研究小组/people/academic/jpd.html英国质谱学会(BMSS)/index.html质谱:Mass Spectrometry Database,American Academy of Forensic Sciences (免费) http://www.ualberta.ca/~gjones/mslib.htm质谱资源: Mass Spectrometry Internet Resources FAQ/~kmurray/mass-spec-resource...质谱资源导航(Mass Spectrometry Links)/cooks/MS%20Links.htmAdvanced Chemistry Development (ACD)/。

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3.2.5.质谱谱图数据库
服务介绍:
可获取化合物质谱谱图,物化性质等信息。

本数据库的质谱谱图用java applet显示,请用户的浏览器不要禁用java。

检索方式与示例:
可以通过谱峰数据来检索相似谱图,检索途径为质荷比、丰度组合。

也可根据化合物的名称、CAS号、分子式。

注:由于谱图匹配算法还在继续开发中,目前还不能很好的匹配谱图形状,系统将对此功能进一步完善。

3.2.5.1质谱谱图检索
基本原理用户手动通过输入提问谱图中一定数目的质谱峰数据(质荷比、丰度),在数据库中进行匹配,获得与提问谱相似的谱图。

第一步:先指定待输入的谱峰的数目。

输入的数字,不得少于输入谱峰的数目,但可以多于输入谱峰的数目。

如本例中要输入5个谱峰,可以输入数字“10”,如图3.2.5.1所示(例1)。

点按钮峰数确认,开始输入具体数据,进入第二步。

图3.2.5.1 质谱谱图检索的第一步:输入谱峰数目(例1)
第二步:输入每个谱峰的具体数据并设置匹配条件。

注意,每个谱峰都必须输入质荷比(M/E),但丰度(Abundance)可以为空。

如某个谱峰只输入丰度(Abundance)而没有输入质荷比(M/E),则该峰的数据无效。

如图3.2.5.2所示,每个谱峰质荷比前的勾选框被选择,表示该谱峰被选中。

图3.2.5.2 质谱谱图检索的第二步:输入谱峰的质荷比(M/E)(例1)
谱峰数据输入完成后,需要在下方选择附加条件,意为在检出的质谱图中要求:
1)包含所有选中的质荷比(默认选择),如果去掉选择表示不要求含有所有选中的质荷比。

2)最大质荷比相近:+-后的数据默认为0,并勾选此项(默认选择),表示检出谱图的最大
质荷比必须与输入的最大质荷比完全相同(本例中即242)。

如果输入一个非零的数字,例如2,
则表示检出谱图的最大质荷比与输入的最大质荷比可以相差2,即在240-244之间均可。

如去
掉勾选,则表示不限制检出谱图的最大质荷比。

3)检出谱图的峰总数,可指定一个峰总数的范围。

如果不勾选此项,则表示不限制峰总数。

4)显示结果数和每页记录数,默认为仅取前面100条结果。

用户可根据需要自行指定,方
便显示。

第三步:检索并查看比较结果。

完成第二步后,点开始检索,即可获得结果,列表如图3.2.5.3。

图3.2.5.3 检索结果列表(例1)
结果列表包括比较勾选框、化合物名、最大质荷比、峰的总数和详细信息的链接。

用户点击最后一栏的详细信息的链接,即可查看化合物的结构与质谱谱图,如图3.2.5.4。

质谱谱图用java applet显示,鼠标移到谱线上可查看该谱峰的质荷比与相对丰度。

图3.2.5.4 化合物结构与谱图(例1)
比较勾选框,是为进行多个谱图之间的比较而专门设置的。

如图3.2.5.5所示,选择2个谱图之后,点击表格下方的按钮质谱谱图比较,则可将2个谱图显示在同一个页面上,方便用户查看比较。

如图3.2.5.6。

谱图比较的功能没有数目限制,可同时显示多个谱图。

图3.2.5.5 选择2个谱图进行比较(例1)
图3.2.5.6 选择2个谱图进行比较(例1)
3.2.5.2化合物检索
基本原理用户输入化合物的英文名称、CAS号或者分子式,选择精确检索或者模糊检索。

系统根据用户输入的关键词检索该化合物的质谱谱图并列表显示。

通过化合物的名称检索质谱图
图3.2.5.7 通过名称精确检索质谱图(例2)
图3.2.5.8 通过名称精确检索质谱图的结果(例2)
用户可输入化合物的关键词,例如英文名称的精确检索如图3.2.5.7,表示检索化合物名称为“ethanol”的化合物的谱图,检索结果列表如图3.2.5.8(例2)。

在表中点最后一栏详细信息的链接,即可看到该化合物的结构与质谱图。

乙醇的结构和质谱图如3.2.5.9所示。

图3.2.5.9 乙醇的结构和质谱图(例2)
通过化合物的CAS号检索质谱图
输入化合物CAS号时有无短划线均可,例如“94-41-7”或者“94417”,分别如图3.2.5.10和图3.2.5.11所示。

这两种输入方法的检索结果相同,见图3.2.5.12(例3)。

图3.2.5.10 CAS号的输入1
图3.2.5.11 CAS号的输入2
图3.2.5.12 通过CAS号检索质谱图的结果(例3)
输入化合物的分子式
输入化合物的分子式(化学元素符号按C、H顺序,其他元素按字母顺序排列)。

为方便查询时的输入操作,输入元素符号不区分大小写,数字不考虑上下标,如图3.2.5.13和图3.2.5.14,其效果完全相同。

检索结果见图3.2.5.15(例4)。

由于C2H6O存在2个同分异构体,乙醇和甲醚。

每个化合物都有自己的一个列表,方便用户区分。

图3.2.5.13 分子式的输入1
图3.2.5.14 分子式的输入2
图3.2.5.15 通过分子式检索质谱图(例4)。

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