中国大鲵5个野生种群的AFLP分析

合集下载

相关主题

1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。

ｖｒｉｅｉｅｉｉｐｐｌｉｓ（７９％）ｉＡＶｎｌｓｓｏｅｅｉｄｆｒｎｉｔｎｗｓｅｓｙｒｓｄｗｔｎｏｕａｏｔｄｈｔｎ９．４ｎＭＯＡａａｅ．Ａｌｇｎｔｉｅｅｔｉａｙｗｃｆａｏ
４ｃａｏｅｅＨｉａｎｖｒｉ，ａｋｕ５０２，ｈｎ）．ＯｅｎＣｌｇ，ａｎｎＵｉｓｙＨｉｏ７２８Ｃｉａｌｅｔ
Ａｂｓｒｃｔａｔ：ＧｅｅｉｖｒｉｎｉｅｅｔａｉｎｏａｕａｏｕａｉｎｆＡｎｉｓｄｖｄａｕｎＳｃａｎｔｄｉｅｓｔａｄｄｆｒｎｉｔｏｆｎｔｒｌｐｐｌｔｓｏｄｒａａｉｉｎｓｉｉｈｕｎ．ｃｙｆｏＧｕｚｏｉｈｕ，Ｈｕｅ，ＳａｘｎｎｎｗａｏｒｈｅｓｖｌｅｅｍｉｄｕｉｂｉｈｎｉａｄＨｅａｓｃｍｐｅｎｉｅｙｄｔｒｎｅｓｎｇＡＦＬＰｍａｋｒ．Ｓｉｔｎｖｄｒｅｓｘｙｉｄｉｉ — ｕｌｒｍｖａｕａｐｌｔｎｒｅｎＡＦＬＰａａｙｅ．ＮｉｅｐｉｅｉｓｉＬＰａａｙｅｒ．ａｓｆｏｆｅｎｔｒｌｐｏｕａｉｓｗｅｅｕｓｄｉｉｏｎｌｓｓｎｒｍｒｐａｒｎＡＦｎｌｓｓｐｏｄｃｄ５ｃｒｂｅｂｎｓ，ｏｉｈ３４ｗｅｅｐｌｍｏｐｉ．Ｔｈｅｅｅｉｉｅｓｔｒｍｅｅｓ：ｔｅ－ｕｅ０７ｓｏａｌａｄｆｗｈｃ５ｒｏｙｒｈｃｒｅｇｎｔｃｄｖｒｉｐａａｔｒｙｈｅｐｒ
测中国大鲵由北向南进行扩散。
关键词：中国大鲵；遗传多样性；遗传分化；ＡＬ；系统地理学ＦＰ
中图分类号：Ｑ８３
文献标志码：Ａ
文章编号：５９６７２１）０ — ０９００２ — ５９（０１２０９ — ６
ＡＦＬＰａｙｉｆＦｉｅＮａｕｒｌＰｏｕａｉｎｓｏｎｒａｓｄｖｄａｓＡｎｌｓｓｏｖｔａｐｌｔｏｆＡｄｉａｉｉｎｕ
ｖｒｉｆＡ．ｄｖｄａｕｇｅｄｗｉｈｉｓｌｅｈｓｏｒｉｎｅｇａｈｃｌｄｓｒｂｔｏ．Ｍｏｔｏｅｔｃｄｉｅｓｔｏｙａｉｉｎｓａｒｅｔｔｉｉｔｒｔａｔａｄｇｏｒｐｉａｉｔｉｕｉｎｆｙｓｓｆｇｎｅｉ —
中国大鲵５野生种群的ＡＬ个ＦＰ分析
杨丽萍一，蒙子宁，刘晓春，张勇，黄俊海，黄景，林浩然
（．中山大学水生经济动物研究所 ∥广东省水生经济动物良种繁育重点实验室，广东广州５０７；１１２５２．西南林业大学－南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明６０２；ｉｔ５２４３．珠海金鲵野生动物养殖有限公司，广东珠海５９１；１０５４．海南大学海洋学院，海南海口５０２）７２８
ｐｎｏ分光光度计测定ＤＡ纯度与浓度。ｅｄｒｆＮ
１２ＡＬ．ＦＰ扩增及数据分析
群遗传分化与片段化分布之间存在联系
Ｊ。
中国大鲵Ａｄｉａｉｉｎｓ属于两栖纲Ａ．ｎｒｓｖａｕ隶ａｄｄｍｐｉｉ，有尾目Ｃｕａａｈｂａａｄｔ，隐鳃鲵科Ｃｙｔｂａｈｄｅｒｐｏｒｃｉａ，
第５Ｏ卷第２期２１年３月０１
中山大学学报（自然科学版）
ＡＣＡＳＩＴＡＲＵＭＮＡＵＲＡＬＵＭＵＮＶＥＲＩＡＴＳＳＴＣＥＮＩＴＩＩＳＴＩＵＮＹＡＳＮＩＴＥ
Ｖｏ＿０Ｎｏ２ｌ５．Ｍａ．ｒ２０１ｌ
ＹＡＮＧｉｎ，ＥＮＧＺｉｉｇ，ＩＸｉｏｈｕ，ＬｐｉｇＭｎｎＬＵａｃｎＺＨＡＮＧｏｇＹｎ，
ＨＵＡＮＧＪｎａＨＵＮＧＪｎＬＮｏａｕｈｉ，Ａｉｇ，ＩＨａｒｎ ’
（．ＩｓｔｔｏｑａｃＥｏｏｃＡｉａｓ／ｕｎｄｎｒｖｎｉｅ１ｎｔｕｅｆｕｔｃｎｍｉｎｍｌ／ＧａｇｏｇＰｏｉｃｌｙｉＡｉａＫ
ＬｂｒｔｒｏｕｔｏｍｉａｏａｏｙｆｒＡｑａｉＥｃｎｏｃＡｎｉａｓ，ＳｎＹａ —ｅｉｅｓｔＧｕｎｚｏ０７５，ＣｈｎｃｍｌｕｔｓｎＵｎｖｒｉｙ，ａｇｈｕ５１２ｉａ；２．ＹｕｎａｒｖｎｃａｙＬａｏａｏｙｏｒｓｓｓｅａｎｎｎｎｒｌｎｎＰｏｉｉｌＫｅｂｒｔｒｆＦｏｅｔＤｉａｔｒＷｒｉｇａｄＣｏｔｏ，ＳｕｈｓｏｅｔｉｅｓｔＫｕｍｉｇ，６５２４，ＣｈｎｏｔｗｅｔＦｒｓｒＵｎｖｒｉｙ，ｙｎｎ０２ｉａ；３．ＤｏｍｅｌｅａａｎｅｕｔｃｎｌｇｉｉｄＣｏｕｎＧｏｄｎｓｌｍａｄｒＡｑａｉＴｅｈｏｏｙＬｍｔｍｐａｙ，Ｚｈｈｉ５１０，Ｃｈｎｃｅｎｕａ９１０ｉａ；
物种种群问遗传分化产生原因通常可通过系统
地理学研究获得。系统地理学是研究物种及物种内不同种群现有分布格局的历史成因和演化过程的一门学科。许多自身迁徙力较差物种，由于地理分隔以及人为影响等造成的基因流阻断，随着时间的积累产生了种内（种群）遗传差异。因而，地理亚
ｃａａｔｉｄｂｓ（）ｈｒｃｒｅｙｔｑｓｅｚｔ＝００，．２Ｐ＜．０）ｎｔｅＵＧｅｄｏｒｍｂｓｄｏｅｇｎｔｉ１００．ＩＰＭＡｄｎｒｇａａｅｎｔｅｅｃｄｓ１ｈｈｉ．ｔｃ，．ｄｖｉｎｓｐｐｌｉｎｅｅｓｐｒｔｔｔｏｍｊｒｌｓｒ．ＡａｉａｕａｕｐｓｄｔａｅＡａｉａｕｏｕａｏｓｒｅａａｄｉｏｗａｏｕｔｓ．ｄｖｉｎｓｓｐｏｅｎｄｔｗｅｎｃｅｄｗｓｏ
摘要：采用ＡＬ技百度文库对中国大鲵四川、贵州、湖北、陕西及河南五个野生种群的遗传多样性和遗传分化水ＦＰ
平进行了评估。９对引物组合在５个野生种群中共扩增出５７条带，其中多态性条带为３４０５。多态位点比例（９８％）６．２、香农信息指数（．６）和基因多样性指数（．４）等参数均较高，显示中国大鲵遗传多样性０３２９０２１４水平较为丰富。ＡＶＭＯＡ分析发现，中国大鲵遗传多样性绝大部分位于种群内（７９％）９．４。种群间遗传分化较弱（）（ｓ／ｔ＝００１．２，Ｐ＜．０）００１。根据种群间遗传距离构建的ＵＧＰＭＡ树基本依照流域进行聚类，结合化石证据，推
部少量肌肉组织，置于液氮保存，运回实验室后放
入一０Ｃ８Ｃ超低温冰柜备用。
取出保存备用的大鲵肌肉样品，剪取约５０ｍｇ
组织，采用常规酚一氯仿抽提法提取基因组ＤＡ。ＮＷ＝．％琼脂糖凝胶电泳检测ＤＡ的完整性，Ｅ．０８Ｎｐ
ｌ００
中山大学学报（自然科学版）
第５０卷
ｄｉｐｅｓｏｔｗａｄｆｏｎｒｈｗｉｈｔｅｓｌｍａｄｅｏｓｌｐｏｆｓｒｅｓｕｈｒｒｍｏｔｔｈａａｎｒｆｓｉｒｏ
．
Ｋｅｒｓ：Ａｎｒａａｉｉｎｕｙｗｏｄｄｉｓｄｖｄａｓ；ｇｎｔｉｅｓｔｅｅｉｄｖｒｉｃｙ；ｇｎｔｃｄｆｅｅｔｔｎ；ＡＦＬ；ＰｙｏｅｇａｈｅｅｉｉｒｎｉｉｆａｏＰｈｌｇｏｒｐｙ
０１４收稿日期２０ —０ —０１
基金项目广东省科技计划资助项目（０４２０１８）广东省教育部产学研结合资助项目（０６９２４０）２０Ｂ６０３；１２０Ｄ０００２；中
山大学青年教师科研启动基金资助项目作者简介：杨丽萍（９０年生）１８，女，讲师；通讯作者：林浩然；Ｅｍｉｓｌｒｍｉｓｓ．ｄ．ｎ — ａ：ｌｈ＠ａｌｙｕｅｕｃｌｓ．
１材料和方法
１１实验材料及ＤＡ提取．Ｎ
中国大鲵各地理种群样品由珠海斗门金鲵水产
科技有限公司在各原产地获得，采样地及所属流域
见表１和图１，包括５个种群共６个体。剪取尾０个
格局往往可以反映种内亚种群之问的遗传关系¨ 。Ｊ
ｓｔ０２１４）ａｌｉｄｃｔｄｔａｉｙ（．４ｌｎｉａｅｈｔＡ．ｄｖｉｎｓｗａｔｕｓｎｉｌｖｒａｉｎａｉａｕｓｗｉｓｂｔｔａｉｔ．Ｈｉｈｌｖｌｏｅｅｉｉｄｈａａｏｇｅｅｆｇｎｔｄ．ｃ
两栖类生活史特殊，对水环境依赖性很强，自身扩散能力又非常有限，当环境变化时很难迁徙至合适地区，因此两栖类的群体遗传结构通常可以反映相应历史事件』。有研究发现，赤背蝾螈Ｐｅｏｏｌｈｄｎｔ
ｃｅｕ和俄勒冈陆巨螈Ｄｃｍｔｄｎｔｅｒｓｓ的种ｉｒｓｎｅｉｐｏｏｎｂｕａｅｏ
ｃｎａｅｏｏｍｒｈｃｌｉ６．２）ｔｅＳａｎｎｆｒｔｎｉｄｘ（．６）ａｄｔｅＧｎｉｅ— ｅｔｆｌｏｐｉｏ（９８％，ｈｈｎｏ ’ｉｏｍａｏｅ０３２９ｎｅｅｄｖｒｇｐｙｃＳｎｉｎｈ