大肠杆菌的λ-噬菌体

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基因工程实验中使用的受体是具有琥珀型突变
体校正功能的菌株。
4、加装选择标记
野生型λ-DNA上缺少合适的选择标记,因此加 装选择标记是λ-DNA克隆载体构建的重要内容。
选择标记主要有两类: 免疫功能类标记 颜色反应类标记
(1)免疫功能失活标记 (cI筛选)
加装选择标记cI基因 cI基因编码一种阻止λ-噬菌体进 入溶菌循环的阻遏物。 含有完整标记基因的λ-载体进入 受体细胞后,建立溶源状态,细 菌生长缓慢,形成混浊斑;
cI基因:编码阻遏蛋白,是感染了λ噬菌体的寄主细胞进 入溶源化的必要条件。cI基因失活或缺失的λ噬菌体无法 使寄主细胞发生溶源化效应。
DNA重组技术一般需要噬菌体处于溶源状态。
λ噬菌体DNA的整合与删除:
噬菌体基因组可以整合到大肠杆菌染色体DNA上, 成为原噬菌体。 适当条件下,原噬菌体又可以脱离寄主染色体, 重新变成独立的复制子,这种过程叫做ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ噬菌体 的删除作用。 超感染免疫性 溶源性细菌,由于含有原噬菌体,故不能再 次被同种噬菌体感染。溶源性细菌所具有的这种 抗御同种噬菌体再感染的特性叫做超感染免疫性。
•当外源DNA插入到标记基因中, 基因灭活, λ-重组分子便进入 溶菌循环,形成透明斑。
(2)加装选择标记lacZ(蓝白斑筛选)
lacZ基因编码β-半乳
糖苷酶,能催化无色的
X-gal生成蓝色化合物。 当外源基因插入到lacZ 基因中,基因灭活,不能 合成蓝色化合物;
而空载体λ-DNA则产
插入可供选择的标记基因;
建立体外包装系统。
1、缩短长度 野生型:上限51kb λ-DNA:48.5kb,外源基因2.5kb λ-DNA上有40-50%的DNA是复制,裂解所不必需的, 切除便提高装载量。
根据切除的多少,将λ-DNA分为两大类载体: 插入型载体、取代型载体
插入型载体(insertion vector)
(1)功能相近的基因在基因组中聚集在一起 目前已经被确定的基因至少61种,一半为必需 基因
(2)线状双链DNA,两端各有一个12bp的互补单链 (粘性末端,cohesive-end site),称λcos site ,粘性末端粘连接变成环状DNA。
λcos位点是噬菌体包装必需序列。
48.5kb
λ噬菌体基因大致分为3个区:
第一节
克隆载体
1. 质粒载体(plasimid vectors)
2. 噬菌体载体(phage vectors)
3. 柯斯质粒载体(cosmid vectors)
4. 人工染色体载体(B/Y/HAC)
噬菌体简介
Bacteriophage(phage) 是比细菌还小得多的微 生物,噬菌体侵犯细菌,可 以认为它是细菌里的“寄生 虫”。 组成:蛋白质、核酸. 结构:蛋白质外壳、尾巴
噬 菌 体 的 溶 源 和 裂 解
入侵E.coli后,可以按裂解或建立溶原两种生活方式生存和繁殖。 侵犯细菌时,只是DNA侵入,然后利用细菌的酶来复制、转录、翻译。
λ-DNA载体的构建
λ噬菌体的缺陷: • 基因组太大(48.5kb);
• 酶切点太多,它有5个BamH1位点(G↓GATCC),6个 BgⅠ位点(A↓GATCT),5个EcoRⅠ位点 (G↓AATTC)。
• 野生型只能接纳一定长度的DNA。若相当于λ噬菌体 的75-105%,那么只能接纳48.5kb×5%=2.425kb的 DNA。 • 重组的λDNA分子难于直接导入宿主细胞—利用体外 包装成病毒颗粒,然后通过感染的方法注入DNA。
构建λ噬菌体克隆载体的基本策略:
切去部分非必须的区域;
抹去多余的限制性内切酶切割位点;
尾巴上的微丝可以把噬菌 体的DNA注入细菌内。
噬菌体或病毒的DNA能被开发
成为基因工程的有用载体,因为:
1.高效率的感染性能使外源基
因高效导入受体细胞;
2.自主复制繁殖性能使外源基
因在受体细胞中高效扩增。
大肠杆菌的λ-噬菌体
(一) λ-噬菌体的生物学特性 1、由外壳包装蛋白和λ-DNA组成 2、 λ-DNA的物理图谱
必须携带标记基因
经改造后只具有一个可供外源DNA插入的克隆位点,长度 为37kb,为包装的下限,它本身也能被包装,允许插入 片段最大为14kb.
取代型载体(substitution vector)
具有成对的克隆位点,空载的载体DNA只26kb,不能被包 装,无法进入受体细胞中去,不需要标记基因.
应用:
•结构区:A~ J19个基因,编码头、 尾部蛋白质 •非必须区: 非必须,基因重组int(intagrate) 及xis(excision)
•功能区:裂解相关S和R,复制相关O和P
3、感染周期(溶菌循环)
•λDNA复制早期:一个ori ,双向复制 •晚期:滚环复制--多个λDNA分子形成线状多联体
包装
E
头部包装蛋白首先结合在cos区的附近,形成包 装启动复合物,A蛋白切割cos位点。
4、溶源状态的建立
噬菌体感染大肠杆菌后,DNA直接整合到宿 主细胞染色体DNA上,并不裂解细胞,这种情况 称为溶源状态。
整合主要由cI和int基因的产物所激活,这两个基因的开放
与关闭取决于宿主细胞本身的性质。
插入型载体只能承受较小分子量(一般在
10kb以内)的外源DNA片段的插入,广泛 应用于cDNA及小片段DNA的克隆。
替换型载体可承受较大分子量的外源
DNA片段的插入,所以适用于克隆高等 真核生物的染色体DNA。
2、酶切位点的删除或增加 删除重复的酶切位点:野生型λDNA链上有
5个EcoRI位点和7个HindIII位点,不利于重
组操作,必须删除至1-2个.
为了便于各种来源的DNA片段的克隆,还
需要增加一些单一的酶切位点.
采用定点突变技术或甲基化酶处理必 需区内的酶识别序列使其失活。
3、灭活某些与裂解周期有关的基因
将无义突变引入噬菌体裂解周期所需的基因, 如将头部包装蛋白基因的CAG突变成UAG。这些 噬菌体只能在具有特异校正基因编码产物的菌株内 繁殖。 当这种λDNA进入一般大肠杆菌菌株后,不能合 成有活性的头部蛋白,也就不能被包装和裂解细 菌,可阻止有害重组体的生物污染及扩散。
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