分子生物学复习提纲
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分子生物学复习提纲
题型包括名词解释(20分)、选择题(30分)、判断题(10分)及简述题(40分)
一、名词解释
1、冈崎片段亲代DNA的两条链极性相反,而子代链的双条链合成的方向总是5`→3`方向延伸,因此3`→5`方向亲代链合成子代链时是连续的,而5`→3`方向的的亲代链合成子代时是先倒退着复制,形成5`→3`方向的短的岗崎片段(Okazaki fragment)
2、复制起点DNA复制从分子的特定位点开始,称为复制原点(origin)
3、复制叉DNA分子中正在进行复制的分叉部位称为复制叉,又称复制眼。
4、增色效应指由于DNA变性引起的光吸收增加,尤其是在A260nm处。
5、核小体核小体是染色体的基本单位,由DNA双螺旋分子缠绕在组蛋白八聚体上1.75圈(~146bp)形成-核心颗粒,核心颗粒之间由DNA和组蛋白H1连接。
6、端粒TTGGGG(T2G4)序列高度重复的末端
7、DNA损伤是指正常DNA分子的化学结构或物理结构在某些物理因素、化学因素(如射线和化学试剂)以及细胞自发产生的基因毒素等干扰作用下发生改变的现象。
8、直接修复
1. 单链断裂修复
DNA单链断裂是损伤的一种常见形式,可以通过DNA连接酶的重接而修复。
2、光分解酶(光复活酶)直接修复二聚体
形成嘧啶二聚体→光复活酶结合于损伤部位→酶被可见光激活→修复后释放酶
3、直接修复烷基化碱基
4.直接插入嘌呤
DNA链上嘌呤的脱落造成无嘌呤位点,能被DNA嘌呤插入酶(insertase)识别结合,催化游离的嘌呤碱基与DNA无嘌呤部位形成糖苷键。且催化插入的碱基有高度专一性、与另一条链上的碱基严格配对,使DNA完全恢复。
9、DNA重组是指在真核生物减数分裂过程中,细菌细胞的转化中,病毒转导中等发生的DNA片段的交换或插入。
10、同源重组发生在同源DNA序列之间
11、转座子基因组上不必借助于同源序列和重组酶就可以移动的DNA片段
12、启动子指能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。
13、终止子是在一个基因编码区下游的可被RNA聚合酶识别和停止合成RNA的一段DNA 序列。
14、密码子mRNA上每3个核苷酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸,这3个核苷酸称为密码,也叫三联子密码。
15、内含子真核生物基因中,不为蛋白质编码的、在mRNA加工过程中消失的DNA序列。
16、信号肽常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移的N-末端氨基酸序列。
17、操纵子是基因表达的协调单位,由启动子、操纵基因及其所控制的一组功能上相关的结构基因所组成。
18、分子伴侣(百度)细胞核内能与组蛋白结合并能介导核小体有序组装的核质素
(nucleoplasmin )称为分子伴侣。
19、单顺反子mRNA 只编码一个蛋白质的mRNA。
20、顺式作用元件真核生物基因上游调节区中能与特异型转录因子结合而影响转录的DNA序列称...
21、反式作用因子指能直接或间接地识别或结合在各顺式作用元件8~12 bp核心序列上,参与调控靶基因转录效率的一组蛋白质。
22、转录因子真核生物RNA聚合酶起始转录需要各种蛋白质辅助因子统称为转录因子。
23、操纵基因是DNA上的一小段序列(仅为26 bp),是阻遏物的结合位点
24、重叠基因同一段DNA能携带两种以上不同蛋白质的信息
二、简答题
1.DNA的Tm值一般与什么因素相关?
(1)在A, T, C, G 随机分布的情况下,决定于GC含量
GC%愈高→Tm值愈大GC%愈低→Tm值愈小
(2)DNA的均一性
片段愈短,变性愈快,Tm值愈小
(3)变性液中含有尿素,甲酰胺等;离子强度
尿素,甲酰胺与碱基间形成氢键→改变碱基对间的氢键
(4)极端pH条件的影响
改变氢键的形成与结合力
2.何谓DNA的半保留复制、何谓DNA的半不连续复制?
DNA复制的半保留性是指在DNA聚合酶的作用下,以一个亲代DNA分子的两条链为模板,合成两个结构上完全相同的子代DNA分子的过程。
DNA的半不连续性复制亲代DNA的两条链极性相反,而子代链的双条链合成的方向总是5`→3`方向延伸,因此3`→5`方向亲代链合成子代链时是连续的,而5`→3`方向的的亲代链合成子代时是先倒退着复制,形成5`→3`方向的短的岗崎片段(Okazaki fragment),随后岗崎片段再连接成完整的DNA链,因此DNA的复制是半不连续性的。
3.比较原核生物和真核生物的DNA复制的异同。
相同点1. Semi-conservative replication 半保留复制
2. Semi-discontinuous repliction 半不连续复制
3. DNA helicase, Ssb DNA解旋酶,SSB蛋白
4. RNA priming RNA引物
5. 校正阅读(Proofreading)
不同点1. 复制起点(单、多)
2. 复制子(大小、多少)
3.复制起始的许可因子的控制
4. 复制叉移动的速度(900/50 nt/S)
5. 冈崎片段的大小
6. 端粒和端粒酶
7. DNA聚合酶Polymerases
4.以细菌为例论述原核生物基因组的特点。
(1)不具备明显的核结构,只有类核,即DNA相对集中的区域。
(2)基因组小,一般只有一个染色体,大多为双链环状,少数为单链或线型。
(3)染色体DNA并不与蛋白质固定地结合,不具有核小体结构
(4)结构简练,重复序列和非编码序列很少,体现经济原则
(5)功能密切相关的基因构成转录单元,并常转录成含多基因信息的mRNA分子,称为多顺反子mRNA
(6)有重叠基因:同一段DNA片段可以编码2-3中蛋白质分子
5.简述原核生物RNA聚合酶各组成部分的主要功能。
全酶= 核心酶+ σ因子
亚基基因相对分子量亚基数组分功能
αrpoA 36500 2 核心酶核心酶组装,启动子识别
βrpoB 151000 1 核心酶β和β'共同形成RNA合成的活性中心
β' rpoC 155000 1 核心酶
ωrpoZ 11000 1 核心酶可能参与保护β'亚基
σrpoD 70000 1 σ因子存在多种σ因子,用于识别不同的启动子
6.比较同源重组、位点专一性重组和转座重组的特征。
同源重组特征:
涉及同源序列间的联会配对,且交换的片段较大
涉及DNA分子在特定的交换位点发生断裂和错接的生化过程异源双链区的生成
存在重组热点;需要重组酶
单链DNA分子或单链DNA末端是交换发生的重要信号
位点专一性重组特征:
在特定的结合序列部位,有专一的酶催化断裂重接--产生精确的DNA重排
都具有整合作用的两个基本特征:
a、典型的保守性重组---交换是相互的和保存原先的DNA
b、发生在噬菌体和细菌DNA短同源序列的专一性核苷酸上
转座重组特点
a) 不依赖供体序列与靶位点间序列的同源性
b) 转座不是简单的转移,涉及转座子的复制
c) 转座插入的靶位点并非完全随机(插入专一型)Hotspots (热点)
d) 某些转座因子(Tn3)对同类转座因子的插入具有排他性(免疫性)
e) 靶序列在转座因子两侧会形成正向重复
f) 转座因子的切除与转座将产生复杂的遗传学效应
7.原核与真核生物mRNA的特征比较。
原核生物mRNA的特征:半衰期短;多以多顺反子的形式存在,5’端无“帽子”结构,3’端没有或只有较短的poly(A)结构。
真核生物mRNA的特征:5’端存在“帽子”结构;多数mRNA 3’端具有poly(A)尾巴(组蛋白除外);以单顺反子的形式存在
8.比较原核生物与真核生物RNA转录后加工的异同。