标书CB具有重要生物活性的天然产物的化学合成
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项目名称:具有重要生物活性的天然产物的化学合
成
首席科学家:马大为中国科学院上海有机化学研究
所
起止年限:2010年1月-2014年8月
依托部门:上海市科委
一、研究内容
本项目的关键科学问题是针对具有重要生物活性的复杂天然产物,发展高效和实用的合成路线,以及阐明它们的结构–活性关系和作用机制。
本项目的将选择一批具有抗癌、抗炎、抗病毒和免疫等活性的生物碱、环酯肽、皂甙和萜类天然产物为研究对象,在综合运用化学各学科新概念、新知识和新技术的基础上,根据目标分子的结构进行巧妙设计,发展高效、高选择性的合成策略,实现一系列具有生物活性复杂天然产物的化学合成。在合成方式上将重点发展基于串联反应、多组分反应、无保护基合成、原子经济性、催化反应的应用和仿生合成等新合成策略。通过合成建立天然产物和其类似物的化合物库,与生物学家合作进行活性测试,总结相关天然产物的结构-活性关系。在此基础上发展用于化学生物学研究的天然产物分子探针,以发现相应天然产物的作用靶点。对于所发现的活性和选择性更好的化合物,我们将深入探索其成为治疗重要疾病药物的可能性。在进行目标分子的合成和相关生物学研究的同时,也将关注合成中的反应方法学问题,发展一些高效、选择性好、具有普适性的新合成方法。本项目具体的研究内容的如下:
1.开展一些具有具有抗癌、抗炎、抗菌、抗病毒等活性,结果新颖,目前还没
有全合成的报道,有一定的合成挑战性的天然产物进行全合成研究,争取实现它们的第一次全合成。这样的工作也为加快后续的构效关系研究和结构优化打下基础。所涉及的目标分子包括具有抗癌、抗炎、抗菌、抗病毒等活性的生物碱类化合物PF1270A/ B/C, Longeracinphyllin A, Sie b oldine A和Haouamine A/B;环肽类化合物Piperazimycin A, Chloptosin和Celogentin C;皂甙和萜类化合物Sepositoside A, Solanoeclepin A, Micrandilactone A, Maoecrystal V 和Ainsliatrimer A/B等。
2.以天然产物全合成为目标,发展和运用有机合成的新概念、新方法和新技术,
从而巧妙设计、发展具有普适性的高效、高选择性的天然产物合成策略和全新全合成方法。重点研究基于计算化学、自由基反应、碳正离子中间体、烯酮中间体,包含串联反应、多组分反应、无保护基合成、原子经济性、有机小分子催化反应等的新合成策略,成功实现一系列具有生物活性复杂天然产物的化学合成。所涉及的对象包括:发展全新的基于不对称[(5+2)+1]反应
构建八元碳环骨架的天然产物全合成方法学,完成天然产物Asteriscanolide和截短侧耳素(Pleuromutilin)的全合成;发展自然启发的、基于合成砌块含哌啶环天然产物全合成方法学,建立生物碱Chaetominine,Haouamines A和B,以及stemocurtisin类百部生物碱如Stemocurtisine和Sessilifoliamide J的全新合成路线;发展分子内自由基偶联和环合反应策略,实现多聚吲哚类生物碱如Chimonanthine和吲哚类生物碱如Lapidilectine B的全合成;发展基于碳正离子重排反应,完成海洋天然产物Spiniferin-1,Cortistatin A和Isocyclocitrinol A的合成等。
3.在现有有机化学理论的指导下,结合相关生物合成研究的成果,通过非酶催
化,仿酶催化和酶催化三种不同类型反应的应用,实现若干具有重要生理(生物)活性复杂天然产物的仿生合成,并探索和解决仿生合成中存在的化学选择性、区域选择型和立体选择性等关键问题。同时,通过对基因克隆、基因功能以及相关酶学机制等关键科学问题的研究,探索几类复杂天然产物的生物合成途径和机理,及其组合生物合成的可行性,为仿生合成和未来的新药研发研究提供必要的理论支持和试验方法。同时揭示相关天然产物的生源合成机制。所研究的对象包括具有调控神经作用的麦角生物碱、强抗菌作用的平板霉素、强抗肿瘤作用的双四氢异喹啉生物碱Et–743和吲哚生物碱Communesin A,以及具有强抗肿瘤或抗菌等活性的阿进霉素(Azinomycin)、谷田霉素(Yatakemycin)、Kosinostatin、Sanglifehrin A、硫肽类抗生素、Tetrocarcin–A (TC-A)和Chlorothricin(CHL)等天然产物。
4.在以上三个工作的的基础上,利用自己发展的合成策略和合成方法,开展上
述天然产物的多样性和生物活性导向的合成研究。为研究天然产物的活性机制以及结构–活性关系提供结构多样性和高内涵的类天然产物化合物库。5.在以上四个工作的的基础上,研究一些具有抗癌、抗炎、抗病毒等活性天然
产物的结构–活性关系。在此基础上通过在分子中引入生物素,荧光片段等方法,发展一些寻找其可能靶分子的的“分子探针”,以了解这些高活性天然产物的可能作用机制,在揭示自然界生物活性规律的同时为新药研究提供先导化合物和药物筛选靶标。
6.利用现代天然产物全合成以及相关方法学研究的良好基础,针对某些资源稀
缺的药用天然产物资源消耗过大,环境成本较高和日益增长的需求等问题,以化学合成途径为研究切入点,发展高效,简洁的化学全(半)合成方法与路线,从而提供对于某些资源稀缺的药用天然产物的更经济性的获取途径,同时为基于这些天然产物的结构-活性关系研究和创新药物开发研究奠定基础。高产率、易操作、绿色环保的合成路线是这个课题追求的目标。所选择的一些资源有限但是具有药用前景的对象包括具有抗肿瘤活性的喜树碱(Camptothecin)、长春藤碱 (Vinbrastine)和小檗胺(berbamine)、云南白药中的主要活性成分喷脑皂甙(Pennogenin)、具有免疫抑制作用的雷公藤内酯醇(Triptonide)、具有镇痛作用的帽柱木碱等。