抗原表位鉴定与作图

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抗原表位鉴定方法

抗原表位鉴定方法

抗原表位鉴定方法抗原表位鉴定啊,就像是在找宝藏一样有趣又神秘呢。

1. 基于实验的鉴定方法肽扫描技术。

这就像是拿着一把小梳子,在抗原这个大海洋里,一小段一小段地梳理,看看哪段能被抗体给逮住。

我们把抗原切成很多小肽段,然后分别去测试它们和抗体的结合能力。

要是哪个肽段和抗体亲亲热热地结合上了,那这个肽段就很可能是抗原表位啦。

比如说在研究某种病毒抗原的时候,就可以用这个方法,一点一点地找出能被免疫细胞识别的关键部分。

丙氨酸扫描。

这就像是给抗原做个小整容。

我们把抗原表位上的氨基酸一个一个换成丙氨酸,就像给原来的氨基酸小伙伴换个位置,然后看看抗体还认不认识这个换了装的抗原。

如果换了某个氨基酸之后,抗体就不怎么搭理这个抗原了,那这个被换掉的氨基酸在抗原表位里可就是个重要角色呢。

噬菌体展示技术。

这个可就更酷了。

我们把编码抗原的基因片段插到噬菌体的基因里,让噬菌体表面展示出抗原的一部分。

然后就像在一群小噬菌体里挑选模特一样,看看哪个噬菌体展示的抗原部分能被抗体选中。

这就像一场选秀比赛,噬菌体们都在展示自己的抗原片段,抗体就是评委,选出最有吸引力的那个。

2. 基于计算机的鉴定方法序列分析。

就像玩拼图一样,我们分析抗原的氨基酸序列。

看看有没有一些特定的序列模式,就像拼图里那些有独特形状的小块。

比如说,有些氨基酸序列在很多已知的抗原表位里都出现过,那这个序列在我们要研究的抗原里可能也是个表位呢。

我们可以把我们的抗原序列和数据库里的那些已知抗原序列做对比,找找相似之处。

结构预测。

这就像是给抗原做个3D建模。

我们根据抗原的氨基酸序列,用计算机软件来预测它的三维结构。

然后在这个三维结构里,找找那些可能暴露在外面,容易被抗体接触到的部分。

就像在一个立体的城堡里,找那些没有被城墙挡住,外面的人能看到的地方,这些地方可能就是抗原表位啦。

分子对接。

这就像是给抗原和抗体安排一场相亲。

我们把预测出来的抗原结构和已知的抗体结构放到计算机里,让它们试着对接一下。

抗原表位名词解释

抗原表位名词解释

抗原表位名词解释抗原表位,又称抗原决定簇或抗原决定基(antigenic determinant,AD)指抗原分子中决定抗原特异性的特殊化学基团。

抗原表位指抗原分子中决定抗原特异性的特殊化学基团。

抗原通过抗原表位与相应的淋巴细胞表面的抗原受体结合,从而激活淋巴细胞,引起免疫应答;抗原也借表位与相应抗体或致敏淋巴细胞发生特异性结合而发挥免疫效应。

抗原表位的性质、数目和空间构型决定抗原的特异性。

抗原表位的大小与相应抗体的抗原结合部位相适合。

一般情况下,一个多肽表位含5~6个氨基酸残基;一个多糖表位含5~7个单糖;一个核酸半抗原的表位含6~8个核苷酸。

一个抗原表位的特异性由组成它的所有残基共同决定,但其中有些残基在与抗体结合时比其它残基起更大作用,这些残基被称为免疫显性基团。

抗原通过抗原表位与相应的淋巴细胞表面的抗原受体结合,从而激活淋巴细胞,引起免疫应答;抗原也借表位与相应抗体或致敏淋巴细胞发生特异性结合而发挥免疫效应。

抗原表位的性质、数目和空间构型决定抗原的特异性。

扩展资料:T细胞和B细胞表位免疫应答过程中,T细胞的TCR和B细胞的BCR所识别的表位具有不同特点,分别被称为T细胞表位和B细胞表位。

1、T细胞表位TCR仅能识别约10~20个氨基酸左右的小分子多肽。

这些表位由序列上相连的氨基酸组成,主要存在于抗原分子的疏水区,称为线性表位或序列表位。

此类表位一般并不位于抗原分子表面,须由抗原呈递细胞将抗原加工处理为小分子多肽并与MHC分子结合,然后才能被TCR识别。

由于T细胞仅能识别经加工处理的表位,故一般不识别天然抗原的构象型表位。

2、B细胞表位BCR或抗体能与未经抗原呈递细胞加工的抗原发生反应,其识别的靶结构主要是位于抗原分子表面的表位。

这些表位由序列上相连或不相连、但在空间结构上相互临近的氨基酸或多糖组成,称为构象表位。

此类表位大小不一,约由4~6个氨基酸残基或者糖基组成。

B细胞表位一般存在于天然抗原分子表面,不经加工处理即可直接被B细胞识别。

抗原 ppt 课件

抗原  ppt 课件
免疫佐剂
选择适当的免疫佐剂,以增强抗原的免疫原 性,提高疫苗的保护效果。
交叉保护性
针对不同病原体变异株的抗原特性,选择能 够提供交叉保护的抗原成分。
安全性与有效性评估
对候选疫苗进行严格的临床前研究和临床试 验,确保其安全性和有效性。
05
CATALOGUE
抗原检测与诊断
抗原检测的方法与原理
抗原检测方法
血型抗原物质。
抗原的结构与功能
抗原的结构
抗原物质通常由蛋白质、多糖、 脂质等大分子物质构成,具有复 杂的空间构象和化学组成。
抗原的功能
抗原能够刺激机体免疫系统产生 特异性免疫应答,与免疫应答产 物结合后发生免疫效应,从而发 挥抗感染、抗肿瘤等作用。
02
CATALOGUE
抗原的识别与呈递
抗原的识别
黏膜免疫应答
抗原通过黏膜侵入机体后,刺激黏 膜相关淋巴组织产生特异性免疫应 答,主要通过分泌型IgA(SIgA) 发挥免疫保护作用。
抗原与抗体的关系
抗原是引起机体产生抗体的物质 ,抗体是针对抗原产生的特异性
免疫球蛋白。
抗原与抗体的结合具有高度特异 性,即一种抗体只能与一种抗原
结合。
抗原与抗体的结合具有不可逆性 ,这是因为抗体与抗原结合后, 形成了抗原-抗体复合物,该复
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抗原识别是免疫应答的起始阶段,指抗原与体内淋巴细胞表面的抗原受体特异性结 合,激发淋巴细胞活化、增殖、分化,并产生免疫效应的过程。
抗原识别具有特异性,即一种抗原只能与相应的抗体或效应T细胞结合,产生特定的 免疫应答。
抗原识别具有多样性,即抗原的种类繁多,不同的抗原可以产生不同的免疫应答。
抗原的呈递
抗原等。

抗原表位

抗原表位

B细胞表位
BCR
无需
天然的多肽、多糖、脂 多糖、有机化合物 5-15个氨基酸,5-7个 单糖或5-7个核苷酸 构象、线性表位
表位位置
抗原分子任意部位
抗原分子表面
表位是蛋白质抗原性的基础 ,研究蛋白质抗原表位 , 对于设计具有免疫原性和中和活性的多肽、新型 疫苗分子及新型诊断试剂具有较大意义。
应用:多在诊断与疫苗的研究中,尤其是在制作良好 的特异性诊断试剂盒中更为重要。
构象50-200个 氨基酸 线状
10-20个氨基酸
必须建立肽库 完全绘制3-15
5 抗原表位的预测法
从80年代Hopp和Woods提出亲水性参数对抗原表位预测的 方法以来,已有许多参数、算法发表,对B细胞蛋白抗原表 位研究起到巨大的推动作用。现已被大众认可并具有较好预 测效果的方法,主要有以下6种:
(1)亲水性方案(Hydrophilicity)
Nozaki-Tanford scale,Eisenberg scale,KyteDoolittle scale,HPLC scale,Hopp-Woods scale
Hopp-Woods 方案认为:蛋白质抗原的氨基酸残基可分为 疏水性和亲水性两类。在机体内,疏水性残基一般埋在蛋白 内部,而亲水性残基位于表面,因此蛋白的亲水部位与蛋白 抗原表位有密切的联系。
在研究构象性表位时的minotopes方法即采用类似的方法,通常从二肽 开始合成并逐渐增加肽链长度及置换氨基酸种类,直至达到与抗体的最 大结合为止。
研究方法
2.2 基因工程法(噬菌体随机肽筛选法)
该法先利用基因克隆技术将合成的 一组寡核苷酸混合物(小肽基因混 合物)克隆至线性噬菌体基因组中 ,使之以融合蛋白的形式在噬菌体 的外壳蛋白的氨基端表达。再利用 生物素或酶标记的抗体筛出特异的 噬菌体,并进行扩增,再筛选,从 结合特异抗体的噬菌体DNA序列推 断出氨基酸序列,并合成相应的短 肽,验证筛选结果。

天然抗原的表位

天然抗原的表位

天然抗原的表位对天然表位的研究不象半抗原-载体复合物那样简单,但是借助现代科学技术的进步,目前对表位已经有比较深刻的认识。

(一)表位的构成表位只是抗原分子中几个氨基酸残基组成的特殊结构,在免疫效应中能全方位地与淋巴细胞或抗分子接触。

抗体分子的抗原结合点并不很大,所以表位一般只占有大约3nm×1.5nm×0.7nm的空间,即5~7个氨基酸和单糖残基的大小,至多不超过20个氨基酸残基。

表位的构成方式至少有两种:①由某些氨基酸残基按一定顺序连续排列组成的线状序列,称为顺序(sequential)表位或线性(linear)表位(图1-1)。

顺序表位是蛋白分子的一级结构,比较稳定,不受蛋白质加热变性和空间构形改变的影响。

②由分子内不连续的2~3个氨基酸残基折叠排列所形成的三维结构构成,称为构象(conformational)表位(图1-1);有时候,呈α螺旋式排列的连续肽链序列也可起到构象表位的作用。

构象表位的抗体可用来研究蛋白分子在生理或病理过程中三维结构的变化。

但是构象表位是蛋白质的二级或三级结构,不太稳定,在蛋白质受热或酶解变性后会彻底破坏,不能恢复。

因此分离和研究比较困难。

(二)表位的数目和定位抗原分子上表位的数目可以用饱和情况下能够结合多少个抗体分子来测定,一般情况下表位数目与抗原的分子量呈正相关。

例如鸡卵蛋白的分子量为42kD,有5个表位;甲状腺球蛋白的分子量700kD,有大约40个表位。

一个表位能结合抗体分子上的一个抗原结合点,所以可将抗原分子表位的数目称为抗原的结合价。

例如上述鸡卵蛋白为5价,甲状腺球蛋白为40价。

虽然一个抗原分子上可以有多个表位,但在诱导宿主免疫应答时可能有一种或一个表位起主要作用,使宿主产生以该特异性为主的免疫应答;这种现象称为免疫显性或免疫优势(immunodominance);起关键作用的表位称为显性表位。

这个原则也适用于一个表位中不同的氨基酸残基,在表位中也有所谓的显性基团存在,如被置换会明显改变表位特异性。

抗原表位

抗原表位
抗体多趋于碱性。
抗原表位的预测法


(6)二级结构预测方案(Secondary structure) 认为β转角结构为凸出结构,多出现在蛋白质抗原表面,利 于与抗体嵌合,较可能成为抗原表位。而α螺旋、β片层结构 规则不易形变,较难嵌和抗体,一般不作为抗原表位。 可预测蛋白质β转角的有Chou-Fasman,Garnier,Cohen等 方法。其中各种方法预测的成功率均不超过65%。一般认为 Cohen方法对转角的预测正确率很高,对于已知折叠类型的 蛋白质(αα类,ββ类,α/β类)正确率高达95%,对于未知结 构类型的蛋白质,可用3种类型分别预测,3类预测一致的转 角对预测表位有帮助。


水解后采用各种分离方法如SDS-PAGE、凝胶过滤、离子交换将水解片 段分开,然后用Western blot,ELISA等各种检测手段来检测。结果可通 过理论肽段分子量的推断或相应的氨基酸序列分析来判断。
利用该法分析抗原表位的有肌醇激酶、肌细胞增强蛋白、乙酰胆碱酯酶、 玻璃体结合蛋白、磷脂酶基质蛋白等。
分类

按表位结构不同,分为连续性抗原表位和不连续性抗原表位。
连续性表位又称线性表位,是由肽链上顺序连续的氨基酸组成 通常这种结合比较弱,因为小肽并不含完整天然蛋白的构象,
在多数情况下这种表位可能只代表了复杂表位的一部分。对其
研究依赖于多肽固相化学合成技术。 后者又称构象型抗原表位,是由那些空间邻近但顺序上不连续 的氨基酸组成。

研究方法


1.2 水解抗原-抗体复合物
这是一个直接的确定线性及构象性抗原表位的方法,又称为Protein footprinting。其理论依据为抗原--抗体复合物的结合部位能抵抗蛋白酶的水 解。 根据蛋白质抗原性质的不同常采用3种方法。 对于蛋白酶水解位点较少的抗原,一般先将抗原与等摩尔抗体在PBS中反 应,然后酶解,SDS-PAGE分离水解产物,分析结果。 对于蛋白酶水解位点较多的抗原,采用HPLC法,将抗原--抗体复合物的酶 解片段和同样条件下的抗原酶解片段分别用HPLC分析。两者图谱对应峰峰 高比大于平均数值的片段则推测为抗原表位。 对于能确定为线性表位的抗原可先将抗体连接于固相载体上,并将此固相 载体装柱,然后让过量的抗原溶液通过此柱,使抗原-抗体形成复合物。一 定条件下,酶溶液过柱,酶解此抗原-抗体复合物,PBS洗去酶解下的不结 合片段,再用1.0mol/L的乙酸洗下与抗体结合的肽段。HPLC分析这些片段 以确定结果。 近来,质谱技术在这类结果分析中得到了广泛的应用。采用该法已成功地 确定了细胞色素C,胃泌素释放肽(GRP),脂碱性磷酸酶(PLAP)等的抗原 表位。

单抗的抗原表位的鉴定方法

单抗的抗原表位的鉴定方法

单抗的抗原表位的鉴定方法
单抗的抗原表位的鉴定方法有多种,包括但不限于以下几种:
1. 噬菌体随机肽库:利用噬菌体展示技术,将多肽编码基因插入噬菌体外壳蛋白基因中,从而将多肽表达于噬菌体外壳表面,然后通过与特异性抗体结合,筛选出与抗体结合的噬菌体,再通过测序确定多肽序列,从而鉴定出抗原表位。

2. X-射线晶体学:通过X-射线晶体学技术,对抗原-抗体复合物进行结构解析,从而确定抗原表位的结构特征和空间构象。

3. 丙氨酸扫描:利用丙氨酸替换法,将抗原中的每个氨基酸逐一替换为丙氨酸,然后检测替换后抗原与特异性抗体的结合能力,从而确定关键的抗原表位。

4. 氢氘交换质谱(HDX-MS):通过氢氘交换质谱技术,检测抗原与特异性抗体结合时氢氘交换的情况,从而确定抗原表位的构象变化和亲和力。

5. 生物信息学表位预测方法:基于生物信息学技术,对已知的抗原和抗体序列进行分析和模拟,从而预测抗原表位的位置和特征。

总的来说,选择哪种方法取决于抗原表位的性质、抗体的特异性以及实验条件。

这些方法可以单独使用,也可以结合使用以提高鉴定结果的准确性和可靠性。

抗原检测课件ppt

抗原检测课件ppt

01
抗原检测的种类与 技术
酶联免疫法抗原检测
一种常用的抗原检测方法
酶联免疫法抗原检测是一种基于酶促反应的免疫分析方法,通过酶与抗体或抗原的结合,将化学信号 转化为光信号,从而实现对抗原的定量检测。该方法具有较高的灵敏度和特异性,被广泛应用于各种 传染病、肿瘤标志物等的检测。
胶体金法抗原检测
一种快速、简便的抗原检测方法
目前抗原检测试剂的质量和供应存在不稳 定的情况,可能会影响检测结果的准确性 和可靠性。
01
抗原检测的注意事 项与建议
注意事项
采样前注意事项
采样前30分钟尽量不喝水及饮料、不吸烟、不喝酒、不嚼口香糖等,确保咽拭子核 酸检测结果准确。
正确佩戴一次性医用口罩,尽量减少因摘下口罩交谈、咳嗽、打喷嚏等产生的飞沫 造成污染。
注意事项
尽量减少其他人员陪 同,如老人、孕妇和 身体虚弱的人,减少 人员聚集。
建议受检者至少提前 15分钟到达采样点进 行登记。
提前打开或打印好健 康码,方便采样时快 速出示。
注意事项
采样中注意事项
采样过程中要配合采样人员的要求,不要触碰采样台、医护人员的防护 服等物品。
采样时应摘下口罩,采样完毕后立即戴回,注意手部卫生,不要触碰眼 睛、鼻孔等部位。
胶体金法抗原检测是一种基于胶体金标记技术的免疫分析方法,通过胶体金与抗体或抗原的结合,实现对抗原的快速检测。 该方法操作简便、无需特殊仪器,常用于临床快速诊断和现场检测。
荧光免疫法抗原检测
一种高灵敏度的抗原检测方法
荧光免疫法抗原检测是一种基于荧光标记技术的免疫分析 方法,通过荧光物质与抗体或抗原的结合,在特定波长光 激发下产生荧光信号,实现对抗原的高灵敏度检测。该方 法具有较高的灵敏度和特异性,适用于痕量抗原的检测。

第三章-抗原-PPT课件

第三章-抗原-PPT课件
质。
载体 与半抗原结合而赋予其免疫原性的
物质。
-
15
半抗原与载体效应
-
16
§1 抗原的性质与分子结构基础
(五)共同抗原表位及交叉反应
*共同抗原(交叉反应性抗原):两种不同 抗原具有相同或相似的抗原表位。
*交叉反应(cross reaction):抗体(或 抗原)除可与其相应抗原(或抗体)发生特异性 反应外,有时还可与其他抗原(或抗体)发生反 应。
线性表位 抗原分子任意部位
B细胞表位
BCR 不需 天然多肽、多糖、脂 多糖、有机化合物 5-15氨基酸 或5-7个核苷酸 构象表位、线性表位 抗原分子表面
-
14
§1 抗原的性质与分子结构基础
(四)半抗原(hapten)和载体(carrier) 完全抗原 同时具有免疫原性和抗原性的
物质。
半抗原 仅具有抗原性而无免疫原性的物
-
12
Байду номын сангаас
§1 抗原的性质与分子结构基础
抗原的T细胞决定基(簇)和B细胞决定基(簇)
-
13
§1 抗原的性质与分子结构基础
T细胞和B细胞抗原表位的特性比较
表位受体 MHC分子 表位性质
T细胞表位 TCR 必需
主要是变性多肽
表位大小
表位类型 表位位置
8-10氨基酸(CD8+T) 13-17氨基酸(CD4+T)
(1)按表位结构分类 * 构象表位(conformational determinant) * 线性表位(sequential determinant)
(2)按识别决定基的免疫细胞分类 * T细胞表位:TCR(识别)表位 * B细胞表位:BCR(识别)表位

3抗原

3抗原
与抗体/致敏淋巴细胞特异性结合
抗原性
Antigenicity
T
T
致敏T细胞
Ag
B 浆细胞
抗体
3
完全抗原/免疫原
不完全抗原/半抗原
既有免疫原性,又有抗原 性 没有免疫原性,只有抗原性
变应原(allergen):能诱导变态反应的抗原
耐受原(tolerogen):能诱导免疫耐受的抗原
4
第一节 抗原的异物性与特异性
能与抗体分子结合的抗原表位的总数。
半抗原 —— 单价抗原 完全抗原 —— 多价抗原
Determinant
决定抗原特异性的特殊化学基团,是与抗体 或抗原受体结合的基本结构单位。
8
2、抗原表位的类型
顺序表位(sequential epitope)/线性表位 由连续性线性排列的短肽 构成。 构象表位(conformationtial epitope)/非线性表位 短肽或多糖残基在序列上 不连续性排列,在空间上形 成特定的构象。
3、同种异型抗原(allogeneic antigens)
同一物种不同个体之间的抗原
(1)血型抗原:ABO、Rh (2)主要组织相容性抗原
25
4、自身抗原(autologous antigens)
免疫隔离部位
改变或修饰 晶状体、睾丸等 感染、外伤、药物
5、独特型抗原(idiotypic antigens)
普通抗原 超抗原 —— —— 活化1/104~1/106的T细胞 活化2% ~ 20%的T细胞 活化所有T细胞或B细胞
有丝分裂原 ——
28
1、超抗原(superantigens)
某些抗原具有强大的刺激能力,只需极低浓度即可激 活大量T细胞克隆,并诱导强烈免疫应答。 普通抗原 超抗原

抗原表位PPT演示课件

抗原表位PPT演示课件
4
❖ 一般情况下,一个多肽表位含5~6个氨基酸残基;一个多糖 表位含5~7个单糖;一个核酸半抗原的表位含6~8个核苷酸。
❖ 抗原表位的大小与相应抗体的抗原结合部位相适合。
❖ 一个抗原表位的特异性由组成它的所有残基共同决定,但其 中有些残基在与抗体结合时比其它残基起更大作用,这些残 基被称为免疫显性基团。
❖ 优点是构建方法简单,迅速。缺点是不能扩增,筛选比较麻烦,需进行 荧光标记或ELISA,在显微镜下操作工作量比较大。
❖ 在研究构象性表位时的minotopes方法即采用类似的方法,通常从二肽 开始合成并逐渐增加肽链长度及置换氨基酸种类,直至达到与抗体的最 大结合为止。
12
研究方法
2.2 基因工程法(噬菌体随机肽筛选法)
✓ 对于能确定为线性表位的抗原可先将抗体连接于固相载体上,并将此固相 载体装柱,然后让过量的抗原溶液通过此柱,使抗原-抗体形成复合物。一 定条件下,酶溶液过柱,酶解此抗原-抗体复合物,PBS洗去酶解下的不结 合片段,再用1.0mol/L的乙酸洗下与抗体结合的肽段。HPLC分析这些片段 以确定结果。
近来,质谱技术在这类结果分析中得到了广泛的应用。采用该法已成功地
5-15个氨基酸,5-7个 单糖或5-7个核苷酸
构象、线性表位
8
抗原分子任意部位
抗原分子表面
研究意义
❖ 表位是蛋白质抗原性的基础 ,研究蛋白质抗原表位, 对于设计具有免疫原性和中和活性的多肽、新型疫 苗分子及新型诊断试剂具有较大意义。
❖ 应用:多在诊断与疫苗的研究中,尤其是在制作良好 的特异性诊断试剂盒中更为重要。
9
抗原表位研究方法
1.传统化学“切割”法或酶法(classical epitope mapping)

蛋白质抗原的表位分析

蛋白质抗原的表位分析

有鉴定表位的相关技术和文献。

也有一些表位预测软件。

一般来说,目前研究主要集中在线性表位上,而构象表位的预测和鉴定方法目前不是很成熟。

找到一个帖子,楼主可以参考:1、B细胞表位预测对于多种免疫学研究是必不可少的。

针对不同的蛋白,应选择不同的方法。

一般来说,蛋白质的C端具有较好的亲水性、表面可及性和柔性,所以是很好的抗原决定簇区域。

本课题选用的蛋白质C-末端序列标签都是唯一的、或是其家族中的几个成员所共有的。

在人蛋白质中,约81%的蛋白质其C末端的5个氨基酸残基的小肽是该蛋白质所特有的,制备针对蛋白质C末端小肽的抗体,常常能得到特异性识别该全蛋白的抗体。

另外,蛋白的二级结构是B细胞表位计算机预测的重要参数之一,β转角为凸出结构,多出现在蛋白质抗原表面,有利于与抗体结合,较可能成为抗原表位。

而α螺旋和β折叠结构规则不易变形,较难结合抗体,一般不作为抗原表位。

含有5个以上的氨基酸残基的转角又常称为环(loop)。

以往的研究表明,蛋白表面的loop区可能为功能性抗体的识别位点,特异性好,可及性强。

本课题选用的HPO、G-CSF、HSA空间结构已明确,所以直接选择loop区或无规卷曲作为B细胞表位。

举例:人Pif1基因编码至少两种蛋白亚型,分子量分别为74kDa和80kDa,与酵母具有高度的同源性,α型和β型Pif1只有C末端不同[20>,其余部分完全相同,并且二者的C末端在蛋白数据库中都是唯一的,选择α型和β型的C末端作为B细胞表位,既满足特异性的需要,也能区分亚型。

GPAA1是一种跨膜蛋白,原核表达非常困难,形成包涵体,且包涵体难以溶解和复性。

对这一类型的蛋白,非常适合选择其特有的B细胞表位免疫动物,来最终制备识别全蛋白质的抗体。

ABCpred是基于人工神经网络模型的线性B细胞表位预测工具,该系统检验了源于Bcipep数据库的700个非冗余B细胞表位和源于Swiss-Prot 数据库的700个长度为10~20个氨基酸的随机选择多肽,准确率近66%。

NFLX抗原模拟表位的淘选及鉴定

NFLX抗原模拟表位的淘选及鉴定
摘 要 : 从 噬菌 体 随 机 肽 库 中 淘 选 模 拟 NF L X( No r f l o x a c i n ) 表 位 的噬 菌 体 粒 子 并 进 行 性 质 鉴 定 。 以抗 N F L X 单 克
隆抗 体 为 靶 分 子 , 对 噬 菌 体 环 七 肽 库 和 十二 肽 库 进 行 生 物 亲 和 淘 选 , 以E L I S A 鉴定 阳性克 隆, 进行 D NA 测 序 , 采
The a nt i — — NFLX mon oc l on a l a nt i b o dy wa s u s e d a s a t a r ge t f o r bi o pa nni n g f r om c 7 c p ha g e d i s p l a y pe pt i de l i — - br a r y an d ph a ge 1 2 一 ma r p e pt i de l i br a r y . The p os i t i v e c l o ne s we r e i de nt i f i e d b y ELI SA a nd s e q ue nc e d. t he n
Ab s t r a c t : To s c r e e n p h a g e p a r t i c l e s c a p a b l e o f mi mi c k i n g n o r lo f x a c i n( NF LX)a n d i d e n t i f y t h e p r o p e r t i e s .
关键词 : 噬菌体随机肽库 ; NF L X; 模 拟表位 ; 免 疫 学 检测 方 法
中图分类号 : Q7 8 2 文献标志码 : A
Bi o p a n ni ng a n d i d e nt i f i c a t i o n o f no r f l o x a c i n mi mo t o p e
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抗原表位鉴定与作图
抗原表位,又称抗原决定簇,是抗原分子抗原性的基础。正确而详细地绘制抗原表位图谱对疾病地诊断、设计无毒副作用地多表位疫苗以及免疫治疗试剂等具有积极的意义。因此目前在预防医学领域许多关于以表位为基础的,如表位疫苗和特异性诊断试剂等的研究也就成了热点。
而噬菌体展示技术作为近年来新兴起的研究蛋白质抗原表位的有利工具,已经成功地鉴定出了多种病原微生物地抗原表位。
这就为揭示一些病原体未知地抗原表位,从而进一步达到预防和控制疾病地发生提供了条件。表位作图可用于检测免疫反应特异性或不同抗体的鉴别以及蛋白质在细胞中的定位。
表位可根据其功能的不同分为两种不同类型:①线性表位(1inear):为小的线状肽链序列,约为5~20个氨基酸;②构象表位(conformational):由蛋白折叠而形成的较大的区域。抗原—抗体结合晶体结构研究表明存在两种类型的表位。
④筛选基于表位基序的疾病、肿瘤等新的特异诊断标志物;
⑤高通量发现同源蛋白中全部保守性和特异性表位
⑥筛选功能性抗体表位或者抗体中和性及可及性表位;
⑦为表位水平分析病毒遗传进化和变异,提供抗原漂移和转移的直接证据。
线性表位的抗体结合位点与其氨基酸侧链骨架之间形成了较强的多样性结构,并与相邻的肽链序列连接在一起,这些表位也被称为连续性表位。事实上线性表位需要某些局部的结构变形或为紧密的、但并非连续的氨基酸序列,如那些兼性。螺旋结构。因此,所谓线性表位的描述是不够确切的。所有与抗体结合位点功能相关的结构,均位于一个肽链片段之中。而来自于该片段之外的其他序列,对于抗体结合位点的构成并非重要。
通过新型生物合成肽法进能鉴定多抗表位,且能获知靶蛋白上全部且精细线性B细胞表位。
目前的表位鉴定技术能够实现:
①单抗药物及诊断用单抗的制备;
②研制包括“通用”目标在内的治疗性和预防性重组多价肽疫苗;
③研制单表位或重组多表位肽检测抗原;
构象表位宜对较大的蛋白区表位作图。这些表位表现出侧链间的相互作用,虽然在折叠蛋白质结构中构象表位彼此非常靠近,但其间被较长的线性序列相互隔开。连续性表位或接近连续性的氨基酸序列对蛋白质的降解作用有抵抗能力。而那些非连续性表位结构在蛋白质未能折叠的情况下将会失去活性,这也是两种不同表位在功能上不同的关键所在。
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