细菌的分类与命名

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细菌的分类与命名

细菌的分类与命名

只确定属名, 只确定属名,未确定种名的某一株细菌
Salmonella sp.
只确定属名, 只确定属名,未确定种名的若干菌株
Salmonella spp.
亚种用subsp.表示 表示 亚种用
Pasteurella multocida subsp. septica
第三节 细菌的分类体系
目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 描述了各个属的性状及属内各种的简明比较 。 “国际系统与进化微生物学杂志”(International 国际系统与进化微生物学杂志” Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSEM)是细菌分类命名的世界公认 ) 的权威期刊。 的权威期刊。
第四节 细菌的鉴定
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。 一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的 分子水平的 鉴定主要限于专业实验室或作研究之用 。 1.形态学检查:标本涂片镜检 形态学检查: 形态学检查 2.病原菌分离鉴定 病原菌分离鉴定 分离培养:一般 ℃ 分离培养:一般37℃ 16-24h 细菌鉴定:菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 细菌鉴定:菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 血清学试验
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。 细菌命名与书写的基本原则。
Escherichia coli 属名 种名 属名+种名 Salmonella pullorum (S. pullorum)
几种不同的书写情况: 几种不同的书写情况:
属名重复出现,可缩写 属名重复出现,
大肠杆菌); 如:E.coli (大肠杆菌);
S. pullorum(鸡白痢沙门氏菌) 鸡白痢沙门氏菌)

细菌的分类与命名-微生物命名规则

细菌的分类与命名-微生物命名规则

细菌得分类与命名细菌分类学细菌分类学(taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与鉴定得一门学科。

它得任务就是在全面了解细菌得生物学特征得基础上,研究它们得种类,探索其起源、演化以及与其她类群之间得亲缘关系,进而提出能反映自然发展得分类系统,并将细菌加以分门别类.它包括三个方面:分类(classification)、命名(nomenclature)与鉴定(identification)。

一、基本概念1、细菌分类就是根据每种细菌各自得特征,并按照它们得亲缘关系分门别类,以不同等级编排成系统。

分类有两种:①以细菌得形态与生理生化特性为依据得表型特征分类法,包括有传统分类法(classicalclassification)与数值分类法(numerical classification);②用化学分析与核酸分析,以细菌大分子物质(核酸、蛋白质)结构得同源程度进行分类称种系分类(phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。

2、细菌命名在分类基础上,给予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中相互交流成为可能。

按照细菌命名得法规,能保证所有得科研工作者以同样方式给予细菌命名。

3、细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置与已知细菌比较其相似性,用对比分析方法确定细菌得分类地位。

若与已知细菌相同即采用已知菌得名称,不同者则按命名原则确定一个新名称。

二、分类等级细菌得分类等级与其她生物相同,依次为界(kingdom)、门(division)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species)。

细菌属于原核生物界(procaryotae),包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体.分类等级拉丁字尾比较固定,表示方法如下:目—ales、亚目-ineae、科-aceae、亚科—oideaae、族—eae、亚族-inae。

细菌的分类及命名[知识研究]

细菌的分类及命名[知识研究]

着研究的深入科属的划分会发生变动
专业知识
8
1、属(genus)性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属,与其他属有明 显差异。
2、种(species)是细菌学分类的最基本 单元,生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 ( strain ) 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
专业知识
1
一、细菌分类学——对细菌进行分类, 命名与鉴定的 一门学科。
任务:
•在全面了解细菌生物学特征的基础上, 研究它们的种类,探索其起源,演化以 及与其他类群之间的亲缘关系,进而提 出能反映自然发展的分类系统,并将细
专业知识
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例如 大肠埃希菌的学名全名是:
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli,Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
专业知识
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金黄色葡萄球菌的学名为:
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ,后 Smith 重新定为现名。
专业知识
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3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时,拉丁文可缩写,用 第一个字母,为避免混肴,也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
专业知识
15
5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌, 其拉丁文学名可在属名之后加sp.(正体字); 如果同属未定种名的若干菌株,则用 spp. (species 的缩写, sp. 表示单数,spp. 表示复数 ) , 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种, Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。

细菌的分类与命名

细菌的分类与命名

细菌的分类方法
传统分类法是临床细菌学检验的基础和依据。这种分
类法的参考书是:
Bergey’s manual of systemic bacteriology
Manual of clinical microbiology
世界畅销书
Diagnostic microbiology
全国临床检验操作规程
中文教科书
标准菌株的用处
(1)标准菌株的典型特征是实验室菌株分 类和鉴定的依据,其种名也是实验室菌 株命名的依据。 (2)标准菌株是临床细菌学检验质量控制 的标准。 (3)在科研中,如涉及细菌,必须使用标 准菌株作为参考菌株或直接使用标准菌 株作为实验材料,否则论文不能公开发 表或不能参加科研成果评定。
2.细菌的命名
(2)数值分类法:分类标记不分主次,而是同等重要看
待(等重要原则)。一般要选用50项以上的生物学特
征作为分类的依据,此分类法是细菌鉴定仪器化、自
动化、电算化的基础和原则,此法称数值分类法。
2.遗传学分类法:CDC分类系统
(1)DNAG+Cmol%测定:用加热变性法测定 两株菌G+Cmol%鉴别 1)不同属:两株菌DNAG+Cmol%相差1015%及以上 2)同属:两株菌DNAG+Cmol%之差<10-15% 3)同种不同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 ≤4-5% 4)同种同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 <2%
因为细菌的分类常使用科、属、种、型等分类单位,
细菌的科、属、种、型的数量大,为满足细菌分类需
要,常要求对细菌的科、属、种等进行命名,如
沙门
福氏志贺菌
志贺菌属 鲍特志贺菌

细菌的分类与命名-微生物命名规则

细菌的分类与命名-微生物命名规则

细菌的分类与命名-微生物命名规则细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学 (taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与判定的一门学科。

它的任务就是在全面认识细菌的生物学特色的基础上,研究它们的种类 ,探究其发源、演化以及与其她类群之间的亲缘关系,从而提出能反应自然发展的分类系统,并将细菌加以分门别类。

它包含三个方面:分类 (classification)、命名 (nomenclature)与鉴定 (identification) 。

一、基本观点1、细菌分类就是依据每种细菌各自的特色,并依照它们的亲缘关系分门别类 ,以不一样样级编排成系统。

分类有两种 :①以细菌的形态与生理生化特征为依照的表型特色分类法 ,包含有传统分类法 (classical classification)与数值分类法(numerical classification);②用化学剖析与核酸剖析,以细菌大分子物质 (核酸、蛋白质 )构造的同源程度进行分类称种系分类 (phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。

2、细菌命名在分类基础上 ,赐予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中互相沟通成为可能。

依照细菌命名的法例,能保证全部的科研工作者以相同方式赐予细菌命名。

3、细菌判定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适合地点与已知细菌比较其相像性 ,用对照剖析方法确立细菌的分类地位。

若与已知细菌相同即采纳已知菌的名称 ,不一样者则按命名原则确立一个新名称。

二、分类等级细菌的分类等级与其她生物相同,挨次为界 (kingdom)、门(division) 、纲 (class)、目(order)、科 (family) 、属 (genus)、种 (species)。

细菌属于原核生物界 (procaryotae),包含有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体。

细菌的分类及命名

细菌的分类及命名

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球菌 杆菌
葡萄球菌 链球菌 粪肠球菌 微球菌
产芽胞
梭菌 芽胞杆菌 炭疽杆菌
抗酸染色阳性
分支杆菌
牛分支杆菌和禽分支杆菌 鼠麻风杆菌 副结核分支菌
无芽胞
抗酸染色阴性
棒状杆菌 化脓放线菌 马红球菌
产单核李氏杆菌
猪丹毒杆菌
丝状或树枝状
MZN染色阴性
牛放线菌 粘性放线菌
MZN染色pp阳t课件性完整
星形奴卡菌 刚果嗜皮菌
科及科以上的划分在细菌不太完善,且随
着研究的深入科属的划分会发生变动
ppt课件完整
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1、属(genus)性状相近、关系密切的若 干菌种组成一个菌属,与其他属有明显 差异。
2、种(species)是细菌学分类的最基本 单元,生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3、菌株(strain)是不同来源的某一种 细菌的纯培养物。
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1、分类方法 数值分类法:根据细菌的各种性状的数值
分析,借助计算机,将拟分类的细菌按其 性状的相似程度归类定位。
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在进行数值分类时
需要选择分类单位(菌株、种或属)→将 性状编码→按公式计算出相似度(S矩阵) →进行系统聚类→画出相似矩阵图→最后 转绘树状普(dendrogam)
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5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌, 其拉丁文学名可在属名之后加sp.(正体字); 如果同属未定种名的若干菌株,则用 spp. (species 的缩写, sp. 表示单数,spp. 表示复数 ) , 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种, Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。

微生物检验知识之细菌的分类与命名

微生物检验知识之细菌的分类与命名

微生物检验知识之细菌的分类与命名微生物检验知识之细菌的分类与命名细菌如何分类你知道吗?你对细菌的分类了解吗?下面是yjbys店铺为大家带来的关于细菌的分类的知识,欢迎阅读。

一、微生物在生物化学分类中的地位(一)细菌与原核生物界细菌、衣原体、立克次体、螺旋体、放线菌、支原体归属于原核生物界其分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种(二)真菌与真菌界真菌是真核细胞型微生物,归属真菌界(三)病毒与病毒界病毒没有典型的细胞结构,归属于病毒界病毒的`分类等级依次为科、属、种二、细菌的分类单位、系统和命名(一)细菌的分类单位细菌的分类等级为界、门、纲、目、科、属、种。

临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。

种是细菌分类的基本单位。

形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种;性状相近、关系密切的若干菌种组成属;相近的属归为科,依次类推。

标准菌株:具有该种细菌典型特征的菌株在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据标准菌株也可作为质量控制的标准(二)细菌的命名采用拉丁文双命名法:属名 (名词大写) + 种名 (形容词小写)(印刷用斜体)例: Mycobacterium tuberculosis中文名: 种名 + 属名例: 结核分枝杆菌(三)细菌的分类系统目前国际上普遍采用伯杰分类系统。

也有采用CDC(美国疾病预防和控制中心)分类系统。

三、细菌的分类方法(一)生理学与生物化学分类法1.传统分类法原则:生物的基本性质主次原则。

按细胞形态、革兰染色性、鞭毛及代谢特点作为较高一级分类依据。

科、属、种的分类主要依靠生化特性和抗原结构。

2.数值分类法原则:细菌的基本性质同等重要原则采用标准化、成品化和配套生化反应试剂条,检测细菌的数十个生理生化特性。

阴阳性结果—数字—电子计算机进行计算—比较、测定相似度—区分细菌的种群—确定细菌亲缘关系(二)遗传学分类法以细菌的核酸、蛋白质等在组成上的同源程度分类。

目前较为稳定的遗传学的分类方法有下列几种:1.DNA G+C mol测定,简称G-C比。

细菌的分类与命名

细菌的分类与命名

志”(IJSEM)原名“国际系统细菌学杂志” (IJSB)发表,如在其他杂志发表,必须提
交论文副本给该杂志公布,两年后无异议,
所提出的新细菌名称才能生效。
第二节 细菌的命名
• 细菌的命名依据国际细菌命名法规采用 “双名法”命名。即用“属名”加“种名” 来表示一个生物的学名。
• 书写时“属名”在前,用拉丁文或拉丁化 的名词表示,且第一个字母大写;“种名” 在后,用拉丁文或拉丁化的形容词或名词 所有格,小写。译成中文时,种名在前, 属名在后。
最重要和最基本的分类单元
• 在微生物分类中种是最重要和最基本 的分类单元,相似的种划归到一起构 成属,相似属构成科,依此类推,最 高的分类单元为界。
• 目前科和科以上的划分在细菌学中还 不太完善,而且随着研究的深入,科、 属的划分还会发生变动。
三、种和种以下分类单位及含义
1、种(species)
第1卷 一般医学和工业方面重要的G-细菌(1984年) 第2卷 放线菌以外的G+细菌(1986年) 第3卷 古细菌、蓝细菌及其他G-细菌(1989年) 第4卷 放线菌(1989 年)
• 从2001年开始发行第2版,共分5卷,计划在数 年内出齐,内容将反映分子水平的细菌分类。
• 该书的姐妹篇是“伯吉氏细菌鉴定手册”
目前分类主要的依据 • 主要是根据种系发生关系,即分析其 基因的同源性,从而确定分类地位。 方法主要采用三种: 测定DNA分子中碱基(G+C)mol% 核酸分子杂交 16SrRNA寡核苷酸编目
五、细菌的分类体系
• 《伯吉氏系统细菌学手册》(Bergey’s Manual of Systematic Bacterology),由美国细菌学家Holt 主编,共四卷:

第七章 微生物的分类命名及鉴定.

第七章 微生物的分类命名及鉴定.

其特点是随机的和非系统的。
2、数值分类法
又称表现型分类法。其原理是将多种分类依据如形态、着色性、 有无鞭毛和芽孢、生化反应、营养需要及致病性等全部等同编号, 并将全部数据输入计算机,进行运算和比较,从数字角度来计算细 菌间的相似值,从而确定各种细菌间的亲缘关系。即将拟分类的细 菌按其性状相似程度归类定位。其特点是采用多项分类依据。
菌株
是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可以有许多菌株,其主 要性状应完全相同,其次要性状可稍有差异。
(三) 细菌的分类方法
1、传统分类法
该方法是采用传统的双歧法进行分类,即主要依据形态特征,
其次是生理生化特征,然后在细菌的各种性状中,选择一项或数 项被认为是最主要的基本性质,作为分类指征,在最高一级的分 类等阶上将细菌分成若干类别;然后在这些类别中选择数项次要 性状为指征,将细菌作次一等阶分类,依此类推,一直划分到种。
及蓝细菌、紫色光合细菌等。
(二) 细菌分类单元
细菌分类单位和动植物一样,也有纲、目、科、属、种,种是最基本的分 类单元,其次是属。

是具有共性的若干种的组合,应与其他属有明显的差异。不同属之间的 16SrRnA序列有较大的差异,但尚未提出差异的量化标准。

是微生物学分类的最基本单元,种可认为是一群性质相似的菌株,它 与其他菌株群体有明显差异。凡是16SrRNA序列同源性大于 97%的两株细菌 即可确定为同一种。
形 态 学 检 查
病 原 学 检 查
血 清 学 检 查
报告鉴定结果
(二)细菌的分离与鉴定
1、病料的采集
正确采集病料是细菌分离鉴定的重要环节。采集病料时力求在濒死时或 死后数小时内无菌或尽量减少杂菌污染进行采集。通常可根据所怀疑病的类型 和特性来决定采取哪些器官或组织的病料。一般要求采取病原微生物含量多、 病变明显的部位,同时易于采取,易于保存和运送。如果缺乏临诊资料,剖检 时又难于分析诊断可能属何种病时,应比较全面地取材,例如血液、肝、脾、 肺、肾、脑和淋巴结等,同时要注意带有病变的部分,如怀疑炭疽,则非必要 时不准作尸体剖检。

第6章细菌分类与命名

第6章细菌分类与命名
兽医微生物学
第六章
细菌的分类与命名
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
目的要求
掌握细菌学常用的分类单位; 掌握细菌的命名及鉴定; 了解细菌分类鉴定的标准及其分类方法。
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
主要内容
细菌的分类地位(重点) 细菌的命名(重点) 细菌分类鉴定的标准(了解) 细菌的分类方法(了解) 细菌的分类体系(了解) 细菌的鉴定(重大的是
《伯杰氏手册》。所以该书目前已成为对细菌 进行分类鉴定的主要参考书。
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
DNA分子水平的鉴定主要限于专业实验室。 目前常用的细菌鉴定方法为表型特征鉴定法。 鉴定工作分三个步骤: ①获得该微生物的纯培养物 ②测定一系列必要的鉴定指标 ③查找权威性的鉴定手册。
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
(一)形态学和生理生化特征
1.形态学特征 (1)细菌形态:形状、大小、排列 (2)培养特征:菌落特征 (3)特殊结构:鞭毛、芽孢、荚膜、孢子 (4)染色反应:革兰、抗酸 (5)内含物:异染颗粒、伴孢晶体 (6)运动性:
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
在出版物中排成斜体。
而中文译名与拉丁文名顺序正好相反,即种名在前,属名在后。
如金黄色葡萄球菌: Staphylococcus aureus
(属名)
葡萄球菌
(种名)
金黄色
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
只确定属名,未确定种名的某一株细菌,则在属名后加sp. (正体字);如同属未定种名的若干菌株,则用spp. (species复数的简写)代替sp.。 如果是新种,则在学名后加上“sp. Nov.”,如 Lawsonia intracellularis gen. nov.,sp. nov.,译 为胞内劳森菌,新属,新种。 亚种用ssp.或subsp.(正体字),如Pasteurlla multocida ssp. septica,译为多杀性巴氏杆菌败血亚 种。
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第五章 细菌的分类与命名
夏佩莹 陈登宇
概 述
细菌分类学(Bacterial taxonomy)是微生物分类 学的一个分支,是对细菌进行分类 分类(classification) 分类 鉴定(identification)、命名 鉴定 命名(nomenclature)的一任务是通过收集大量的个体资料,经 过科学的归纳、整理,使之形成一个完整的 分类系统。
分类等级:
界(Kingdom ) 门(Division) 纲(class ) 目(Order ) 科(Family ) 属(Genus ) 种(Species )
命名法
细菌科学名称(学名)的命名法采用生物双名法 (binominal nomenclature)。具备拉丁化文字的形 式和明确的分类等级两个特点,即由一个属名和一个 种名构成。 细菌学名的中文译名:种名在前,属名在后。 如:Mycobecterium tuberculosis(结核分枝杆菌) Salmonella typhi(沙寒沙门菌)。
26 27 28 29 30 31 32 33
诺卡菌形放线菌 多腔孢囊放线菌 游动放线菌 链霉菌和有关菌属 马杜拉菌 高温单胞菌有有关菌属 高温放线菌 其他属


细菌的分类方法主要有两类:人为分类法和 系统分类法。系统分类法以细菌的核酸、蛋白质 等组成的同源程度进行分类,更具科学性和稳定 性。其中16S rRNA寡核苷酸分析,由于其核苷 酸数目适中、信息量大、具有高度稳定性、易于 提取和分析,成为理想的研究工具。
细菌分类命名系统
一、细菌分类系统概况 二、伯杰(Bergey)细菌分类系统及命名
卷次及主要细菌种类 第1卷 1~11组 1~11组 包括医学、工业 、农业重要的革兰阴 性细菌
群 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
细菌属/ 细菌属/类群 螺旋体 革兰阴性、需氧、微需氧、有 动力、螺形菌 革兰阴性、无动力、弯曲菌 革兰阴性、需氧、杆菌或球菌 革兰阴性、兼性厌氧、杆菌 革兰阴性、厌氧、杆菌或螺形 菌 异化还原硫酸盐的细菌 革兰阴性、厌氧球菌 立克次体和衣原体 支原体 内共生菌
2、命名: 、命名:
在分类基础上,给予每种细菌一个科学名称, 使之在生产实践、临床实践和科学研究工作中相互 交流成为可能。按照细菌命名的法规,能保证所有 的科研工作者以同样方式给予细菌命名。
3、鉴定 、
将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位 置和已知细菌比较其相似性,用对比分析方法确定 细菌的分类地位。若与已知细菌相同即采用已知菌 的名称,不同者则按命名原则确定一个新名称。
细菌的分类法
一、生物学特性分类法——人为分类法 生物学特性分类法 人为分类法 (一)传统分类法 (二)数值分类法
二、遗传学分类法——系统分类法 遗传学分类法 系统分类法
(一)DNA 碱基比例的测定(G+C mol% )
(二)核酸分子杂交法(hybridization of acids) (三)rRNA寡核苷酸分析(oligonucleotide catalog)
分类方法:
(1)人为分类法: 以细菌形态和生理生化特征为依据,分为: 传统分类法(classical classification) 数值分类法 (numerical classification) (2)系统分类法: 将化学分析和核酸分析方法引入细菌分类,使细 菌种群的划分更为客观。以细菌大分子物质(核酸、 蛋白质)结构的同源程度进行分类,称为种系分类 (phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。
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不产氧光合细菌 产氧光合细菌 需氧、化能自氧菌及有关细 菌 出芽和(或)有附属物的细 菌 鞘细菌 非光合、无子实体的滑行细 菌 形成子实体的滑行细菌—— 形成子实体的滑行细菌—— 粘细菌 古生菌
第4卷 26~33组 26~33组 包括可形成菌丝 体的放线菌
本章制作: 夏佩莹 陈登宇
第2卷 12~17组 12~17组 包括除放线菌以 外的革兰阳性细 菌
12 13 14 15 16 17
革兰阳性球菌 革兰阳性、形成芽胞的球菌 和杆菌 革兰阳性、规则的无芽胞杆 菌 革兰阳性、不规则的无芽胞 杆菌 分枝杆菌 诺卡菌形的细菌
第3卷 18~25组 18~25组 包括光合细菌、 古细菌、蓝细菌 、其他革兰阴性 细菌
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