转录和转录组学
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2.4 核酶：
分三类：异体催化的剪切型；自 体催化的剪切型；内含子的自我剪 接型。
二级结构：锤头结构；13（或11） 个保守核苷酸。
• 核酶的发现
1982年Cech在研究低等真核生物四膜 虫的rRNA加工成熟过程中发现其rRNA 前体有自我剪接作用，即酶的作用，故 把有催化活性的RNA称核酶。
Review article
Boeger, H., Bushnell, D.A., Davis, R., Griesenbeck, J., Lorch, Y., Strattan, J.S., Westover, K.D. and Kornberg, R.D. (2005). Structural basis of eukaryotic gene transcription. FEBS Lett. 579, 899-903.
Gnatt, A.L., Cramer, P., Fu, J., Bushnell, D.A. and Kornberg, R.D. (2001) Structural basis of transcription: An RNA polymerase II elongation complex at 3.3 Å resolution. Science 292, 1876-1882.
Original scientific articles
Cramer, P., Bushnell, D.A. and Kornberg, R.D. (2001) Structural basis of transcription: RNA polymerase II at 2.8 ångstrom resolution. Science 292, 1863-1876.
Bushnell, D.A., Westover, K.D., Davis, R.E. and Kornberg, R.D. (2004) Structural basis of transcription: An RNA polymerase II – TFIIB cocrystal at 4.5 angstroms. Science 303, 983988.
• 1.单链小分子； • 2.含有稀有碱基或修饰碱基； • 3. 5′端总是磷酸化， 5′末端往往是pG； • 4. 3′端是CpCpAoH序列； • 5.三叶草结构； • 6.三级结构是倒L型。
三级结构呈倒L形
2.3 rRNA：
• 原核生物：70S--由50S和30S 组成 • 真核生物：80S--由60S和40S 组成
转录和转录组学
Thanscription and Transcriptomics
吕社民, M.D., Ph.D.
西安交通大学医学院遗传学与分子生物学系 电话:82657764
Email: lushemin@mail.xjtu.edu.cn
Replication
DNA
Transcription
Replication
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1959
"for their discovery of the mechanisms in the biological synthesis of ribonucleic acid and deoxyribonucleic acid"
一、核糖核酸的类型、结构和功能
1. 类型 • 编码蛋白质：编码RNA和非编码RNA • 功能：rRNA, tRNA, mRNA • 小RNA (snRNA, snoRNA, scRNA)
2.核糖核酸的结构和功能
4种核苷糖以磷酸二酯键连接的长链, A、U、 C、G；戊糖是核糖。
2.1 mRNA
2.1.1.原核生物mRNA结构的特点：
Roger D. Kornberg Stanford University, CA, USA
"for his studies of the molecular basis of eukaryotic transcription".
Roger D. Kornberg, born 1947 (59) in St Louis, MO, USA (US citizen). PhD from Stanford University, CA, USA. Mrs. George A. Winzer Professor in Medicine at Stanford University School of Medicine, CA, USA.
Stanford University bS. t1a9n1fo8rd, CA, USA
2006年诺贝氏生理医学奖得主 Dr. Fire A and Dr Mello C
主要内容
一、核糖核酸的类型、结构和功能 二、RNA的合成 三、真核细胞转录后修饰 四、转录水平的基因表达调控 五、RNA分析 六、转录组学
Severo Ochoa
1/2 of the prize USA New York University, College of Medicine New York, NY, USA b. 1905 (in Luarca, Spain) d. 1993
Arthur Kornberg
1/2 of the prize USA
• （1）多顺反子； • （2） mRNA 5′端无帽子结构，3′端无多聚
A尾；
• （3） mRNA一般没有修饰碱基。
2.2.2.真核生物mRNA结构的特点：
（1） 5′端有帽子结构； （2） 大多3′端有多聚A尾； （3）分子中可能有修饰碱基：主要有甲化； （4）分子中有编码区与非编码区。
2.2 tRNA
RNA
Reverse Transcription
Translation
中心法则
（the central dogma） Protein
The Royal Swedish Academy of Sciences has decided to award the Nobel Prize in Chemistry for 2006 to
2.4 核酶：
分三类：异体催化的剪切型；自 体催化的剪切型；内含子的自我剪 接型。
二级结构：锤头结构；13（或11） 个保守核苷酸。
• 核酶的发现
1982年Cech在研究低等真核生物四膜 虫的rRNA加工成熟过程中发现其rRNA 前体有自我剪接作用，即酶的作用，故 把有催化活性的RNA称核酶。
Review article
Boeger, H., Bushnell, D.A., Davis, R., Griesenbeck, J., Lorch, Y., Strattan, J.S., Westover, K.D. and Kornberg, R.D. (2005). Structural basis of eukaryotic gene transcription. FEBS Lett. 579, 899-903.
Gnatt, A.L., Cramer, P., Fu, J., Bushnell, D.A. and Kornberg, R.D. (2001) Structural basis of transcription: An RNA polymerase II elongation complex at 3.3 Å resolution. Science 292, 1876-1882.
Original scientific articles
Cramer, P., Bushnell, D.A. and Kornberg, R.D. (2001) Structural basis of transcription: RNA polymerase II at 2.8 ångstrom resolution. Science 292, 1863-1876.
Bushnell, D.A., Westover, K.D., Davis, R.E. and Kornberg, R.D. (2004) Structural basis of transcription: An RNA polymerase II – TFIIB cocrystal at 4.5 angstroms. Science 303, 983988.
• 1.单链小分子； • 2.含有稀有碱基或修饰碱基； • 3. 5′端总是磷酸化， 5′末端往往是pG； • 4. 3′端是CpCpAoH序列； • 5.三叶草结构； • 6.三级结构是倒L型。
三级结构呈倒L形
2.3 rRNA：
• 原核生物：70S--由50S和30S 组成 • 真核生物：80S--由60S和40S 组成
转录和转录组学
Thanscription and Transcriptomics
吕社民, M.D., Ph.D.
西安交通大学医学院遗传学与分子生物学系 电话:82657764
Email: lushemin@mail.xjtu.edu.cn
Replication
DNA
Transcription
Replication
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1959
"for their discovery of the mechanisms in the biological synthesis of ribonucleic acid and deoxyribonucleic acid"
一、核糖核酸的类型、结构和功能
1. 类型 • 编码蛋白质：编码RNA和非编码RNA • 功能：rRNA, tRNA, mRNA • 小RNA (snRNA, snoRNA, scRNA)
2.核糖核酸的结构和功能
4种核苷糖以磷酸二酯键连接的长链, A、U、 C、G；戊糖是核糖。
2.1 mRNA
2.1.1.原核生物mRNA结构的特点：
Roger D. Kornberg Stanford University, CA, USA
"for his studies of the molecular basis of eukaryotic transcription".
Roger D. Kornberg, born 1947 (59) in St Louis, MO, USA (US citizen). PhD from Stanford University, CA, USA. Mrs. George A. Winzer Professor in Medicine at Stanford University School of Medicine, CA, USA.
Stanford University bS. t1a9n1fo8rd, CA, USA
2006年诺贝氏生理医学奖得主 Dr. Fire A and Dr Mello C
主要内容
一、核糖核酸的类型、结构和功能 二、RNA的合成 三、真核细胞转录后修饰 四、转录水平的基因表达调控 五、RNA分析 六、转录组学
Severo Ochoa
1/2 of the prize USA New York University, College of Medicine New York, NY, USA b. 1905 (in Luarca, Spain) d. 1993
Arthur Kornberg
1/2 of the prize USA
• （1）多顺反子； • （2） mRNA 5′端无帽子结构，3′端无多聚
A尾；
• （3） mRNA一般没有修饰碱基。
2.2.2.真核生物mRNA结构的特点：
（1） 5′端有帽子结构； （2） 大多3′端有多聚A尾； （3）分子中可能有修饰碱基：主要有甲化； （4）分子中有编码区与非编码区。
2.2 tRNA
RNA
Reverse Transcription
Translation
中心法则
（the central dogma） Protein
The Royal Swedish Academy of Sciences has decided to award the Nobel Prize in Chemistry for 2006 to