临床PCR检验标本的采集、处理、保存及核酸提取方法

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确与否 临床PCR检验操作中最易出问题的环节
精品课件
标本采集
标本采集时间对扩增检测结果的影响(过早或
过晚都可能会出现假阴性结果)
标本采集部位的准备(适度消毒) 标本的类型和采集量 (衣原体 上皮细胞) 采样质量的评价(评价方法:肉眼观察、显微镜下观察和化
学分析)
采样及运输容器(一次性无菌器材,防腐剂,抗凝剂) 标本采集中的防污染(一次性无菌容器,防止混入操作
对于用于非分枝杆菌测定的脓液标本,如过于粘 稠,则加入适量生理盐水,充分振荡后,静置,取上 清立即离心,沉淀用于DNA提取;如为水样,则按上 述直接离心取沉淀即可。
沉淀标本的保存条件同精样品课件为-70℃。
体液
临床体液标本包括胸水,腹水,脑脊 液,尿液等,可按水样标本的方式离 心取沉淀后,提取核酸。沉淀样本 的保存同上。
(2)0.05%Tween 80。 (3)10%Chelex-100( 含0.03% Triton X-100和0.3%
Tween 20)
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一定体积的痰 1.5倍体积的USP溶液,震荡30-40s 10-15ml蒸馏水,室温放置5-10min 5000g室温离心10-15min,弃上清 500ul无菌0.05%Tween80溶解或重悬 20000g室温离心10-15min,弃上清 加入5倍10%chelex-100,混匀,90℃温育40min
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棉拭子
在使用PCR方法检测性病病原体时,临 床标本一般为棉拭子,可将棉拭子置于 适量生理盐水中,充分震荡洗涤后,室温 静置5~10分钟,待大块状物下沉后,取上 清立即离心,其后的沉淀即可用于DNA 提取。
如不立即用于核酸提取,则需保存于70℃下.
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脓液
脓液的处理依情况而定,如用于分枝杆菌(如结核 杆菌)核酸测定的标本,粘稠的脓液可采用痰标本 的处理模式,先进行液化,再离心取沉淀提取 DNA;水样的脓液则直接离心,沉淀用生理盐水 洗2~3次后,即可用于DNA提取。
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全血
以全血作为待测标本时,必须注意抗凝剂的 选择,一般使用EDTA-Na2或枸椽酸钠,不可 使用肝素。
全血样本如用于DNA提取检测,可4℃下短期 保存,如用于RNA检测,则应在取血后,尽 快提取RNA 。
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外周血单个核细胞
外周血单个核细胞可从抗凝全血制备,主 要有两条途径,一是使用淋巴细胞分离液 分离制备;二是使用红细胞裂解液,裂解全 血中的红细胞,经生理盐水数次洗涤,即可得 到单个核细胞。
外周血单个核细胞如暂不提取核酸,可保存 于-70℃下.
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痰属于分泌物,临床上常用作为结核杆菌DNA测定 标本。
痰标本中含有大量粘蛋白和杂质,故在核酸提取时, 需对样本进行初步处理,即用1 mol/L NaOH或变 性剂液化。
如用于非结核杆菌如肺炎支原体的PCR检测,痰 标本只能室温悬浮于生理盐水中,充分振荡混匀, 促使大块粘状物下沉,取上清离心,所得到的沉 淀物即可用于核酸提取。
取5ul用于PCR检测
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痰标本处理中要注意的问题
痰标本在没有加入内标以控制假阴性的情 况下,不能采用异硫氰酸胍盐(GuSCN) 方法提取。采用这种方法提取,有可能会 在提取过程中,出现一种可修饰DNA的酶, 在最后一步提取中,与核酸一起洗提出来, 从而抑制其后的扩增。
在PCR主反应混合液中,加入α-酪蛋白 (alpha-casein)、白蛋白等,有防止此 类抑制物产生的效果。
临床PCR检验标本的采集、 处理、保存及核酸提取方法
江西省肿瘤医院 陈文学
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检验误差的发生率
1997年,一位意大利著名检验专家对急诊检验 误差发生的种类和发生率进行了统计。结果显 示,约有68.2%的检验误差发生在检验前期, 而来自检验中期和检验后期的误差率分别为 13.3%和18.5%。
者头发,表皮等,如玻璃容器要高压灭菌)
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标本运送
样本一经采集,则应尽可能快的送至检测 实验室。
样本中如加入了适当的稳定剂,如用于RNA 测定加入GITC的血清(浆)样本和用于DNA测 定的EDTA抗凝血等,则可在室温下运送或 邮寄。
实验室应根据待测靶核酸的特性,对各种 临床样本的运送条件作出相应的规定。
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临床标本的处理和保存
血清(浆) 全血 外周血单个核细胞 痰 棉拭子 脓液 体液 乳汁 组织
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血清(浆)
DNA测定,可按照一般的血清标本处理程 序,对测定影响不大。
RNA测定,标本的获取和保存方式对测定 结果,可能有决定性影响。最好是使用 EDTA抗凝(严禁使用肝素,因其对PCR扩增有抑制, 且很难在核酸提取过程中完全去除)全血标本,抗凝 后6小时内分离血浆,如使用血清标本,则 需尽快(2小时内)分离血清,标本的短期 (1~2周)保存可在-20℃下,较长期保存 应在-70℃下。
20000g室温离心5min取5ul用于PCR扩增
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痰标本处理简单模式
试剂:(1)裂解液:含终浓度0.1 mol/L NaOH、50μg蛋白 酶K和0.05% Triton X-100
50ul痰
6000g离心10分钟,弃上清
加入裂解液50ul,60℃温育30min
90℃温育30min 加入Tris-HCl中和以上反应混合物
2007年,这位专家又进行了类似的统计,结果 显示,检验前期的误差发生率仍高达61.9%
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正确采集、运送、保存临床标本 的重要性
质量保证关键性环节 解决涉及实验室检验的医患纠纷的方
法之一
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核酸提取的重要性
核酸提取是临床PCR检验最为关键的部分 核酸提取的成败关系到临床PCR检验的正
液化标本如不立即用于核酸提取,可保存于-70℃
下。
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痰标本处理的基本模式
通用模式 ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ简单模式
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痰标本处理通用模式
(1)通用标本处理(Universal sample processing, USP)溶液: 4-6 mol/L盐酸胍(GuHCl) 50 mmol/L Tris-HCl, pH7.5 25 mmol/L EDTA 0.5%十二烷基肌酸钠(Sarkosyl ) 0.1~0.2 mol/L β-巯基乙醇。
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