荧光原位杂交 FISH 操作方法

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荧光原位杂交(FISH)

1.样品处理与固定(约4h,可提前准备)

(1)用纯水清洗样品数次,加1×PBS,涡旋悬浮样品,离心(2000r/min)5min 弃去上清液;

(2)在样品中加入4%多聚甲醛(终浓度4%),置于4℃固定3小时左右;(3)离心(12000r/min)5min,弃去上清液;

(4)加1×PBS摇匀清洗3次,离心(10000r/min)5min弃去上清液;

(5)加0.5mL1×PBS和0.5mL乙醇,重悬样品,-20℃可保存6个月。

2.载玻片涂层处理(约2.5h,可提前准备)

(1)将载玻片用盐酸乙醇溶液中(1份盐酸2份乙醇)浸洗10min,然后用自来水水充分清洗,再用纯水清洗2-3遍,100%乙醇中贮存备用;

(2)拿出玻片晾干后,滴一滴poly-L-lysine(0.1mg/mL)溶液于载玻片上,覆盖样品孔,室温放置10-30min分钟;

(3)吸去多余的溶液,用无菌水冲洗表面数次;

(4)接种前至少室温干燥1小时或过夜晾干。

3.透化与脱水(约1h)

现配proteinase k buffer:50mL

1M Tris/HCl0.5mL0.5M EDTA1mL

5M NaCl1mL10%SDS 2.5mL

dd H2O to50mL pro.k(20mg/mL)25μL

(1)取适量固定后样品于载玻片上(可提前超声破碎),放入46℃孵育箱中烘干10分钟;

(2)将样品浸入蛋白酶k缓冲液中,37℃,20min,然后浸入灭菌水中清洗3次,每次1min。

(3)再依次浸入50%、80%、100%乙醇中脱水,每次3min,最后在空气中晾干。

4.杂交(约2h)

(1)加9μL杂交缓冲液到载玻片的样品上,尽量让样品全被覆盖;

(2)(此步之后,保证样品充分避光)在杂交缓冲液上加1μL探针(终浓度

5ng/μL);

(3)将载玻片水平放在有2×SSC的湿盒中,盖盖,然后一起放入46℃孵育箱中,杂交1.5小时;

(4)将冲洗缓冲液预热到48℃,备用。

5.冲洗(约1h)

(1)杂交后,迅速(防止载玻片变冷)小心用预热的冲洗液冲洗载玻片1~2次;

(2)然后快速将载玻片放入48℃冲洗液中,在48℃放置20min;

(3)用灭菌水润洗载玻片3次,最后在空气中晾干。

6.镜检与拍照(约2h)

(1)晾干后,滴一滴抗荧光衰弱剂,小心盖上盖玻片,使样品被抗荧光衰弱剂覆盖,排除气泡,吸去多余液体,然后用指甲油封边。

(2)及时进行镜检,紫外易使荧光猝灭,应在同视野下最后观看。

(3)镜检后,样品可于-20℃暗处保存。

试剂配制与说明

(1)10×PBS:称取12.9g(Na2HPO4·12H2O)、2.2g(NaH2PO4·2H2O)、37.7g (NaCl)溶于500mL纯水中,高温高压灭菌保存。稀释至1×使用,pH7.2。(2)4%多聚甲醛:将44.5mL纯水加热到60℃,称取2g多聚甲醛加入其中,加2滴NaOH使其溶解,冷却至室温,加5mL10×PBS,以上均在通风橱中进行,用HCl调整pH到7.2,用0.22μm滤膜过滤,4℃避光保存。(3)盐酸乙醇溶液:1份浓盐酸和2份乙醇混合,清洗液,主要用于去除带颜色的有机染料。

(4)Poly-L-lysine溶液:Cat.NO.:E607015,规格为1mL,5mg/mL,可储存于-20℃保存12个月,取80μL加无菌水稀释50倍(0.1mg/L),分装储存于5mL离心管,-20℃保存。

(5)梯度乙醇:配制50%、80%、100%梯度乙醇,现配现用。

(6)探针:探针暗处用铝箔纸包裹放于冰上,12000r/min离心5min,加适量DEPC处理水,于暗处振荡5~10min溶解,吸取10μL,加DEPC水稀释

至100μL,分装于无菌EP管,每份10μL,包裹锡箔纸,-20℃保存。(7)5M NaCl:称取29gNaCl分多次溶于约90mL水中,等待完全溶解,高温高压灭菌。

(8)1M Tris/HCl:称取12.11g Tris溶于80mL水中,溶解后用浓盐酸调pH 至7.2,定容到100mL,高温高压灭菌。

(9)Formamide:通风橱内封装2mL甲酰胺,4℃保存。

(10)10%SDS:称取10g SDS于水中,静置放置,约20min后溶解,定容至100mL。

(11)0.5M EDTA:称取18.6g EDTA二钠溶于80mL水中,用NaOH颗粒调pH至7.2,定容到100mL,高温高压灭菌。

(12)20×SSC:称取17.52g NaCl、8.82g二水柠檬酸钠溶解于80mL纯水中,用NaOH调节pH至7.0,定容至100mL,过滤除菌。

(13)杂交缓冲液:

Stock reagent Volume final concentration

5M NaCl360μL900mM

1M Tris/HCl40μL20mM Formamide%depending on probe

distilled H2O add to2mL

10%SDS2μL0.01%

(add SDS last to avoid precipitation)

Considered Formamide:AOB,20%;PAO/GAO,35%.

(14)冲洗缓冲液:

Stock reagent Volume final concentration

5M NaCl concentration depending

on buffer(see table A in

appendix)%formamide in hybridization

1M Tris/HCl1mL20mM

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