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苯并[a]芘对生殖系统的毒性作用及其机制研究进展

生态毒理学报Asian Journal of Ecotoxicology第19卷第2期2024年4月V ol.19,No.2Apr.2024㊀㊀基金项目:国家自然科学基金项目(31960154);中央引导地方科技发展资金项目(2023ZY0004);内蒙古自治区草原英才工程青年创新创业人才项目(Q2022085);内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZZ23017);内蒙古自治区自然科学基金项目(2023QN03047);内蒙古医科大学面上项目(YKD2022MS033)㊀㊀第一作者:王惠增(1997 ),女,硕士研究生,研究方向为生殖毒理㊁分子诊断,E -mail:******************* ㊀㊀*通信作者(Corresponding author ),E -mail:*********************.cnDOI:10.7524/AJE.1673-5897.20230413002王惠增,刘秉春,陈红,等.苯并[a]芘对生殖系统的毒性作用及其机制研究进展[J].生态毒理学报,2024,19(2):165-183Wang H Z,Liu B C,Chen H,et al.Research progress on toxic effects of benzo(a)pyrene on reproductive system and its mechanism [J].Asian Journal of Ecotoxicology,2024,19(2):165-183(in Chinese)苯并[a ]芘对生殖系统的毒性作用及其机制研究进展王惠增1,刘秉春2,陈红1,徐沛欣1,郭鑫1,袁建龙1,*1.内蒙古医科大学附属医院检验科,呼和浩特0100502.内蒙古医科大学附属医院干细胞实验室/内蒙古自治区肿瘤细胞基因检测应用与研究工程实验室,呼和浩特010050收稿日期:2023-04-13㊀㊀录用日期:2023-11-02摘要:苯并[a]芘(benzo(a)pyrene,BaP)作为多环芳烃(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)的成员,是最早发现也是最具有代表性的环境污染物,通过空气㊁食物㊁水源等途径进入人体,引起细胞氧化应激损伤㊁DNA 损伤和基因异常表达导致细胞死亡㊂研究表明雄性与雌性动物经BaP 染毒后,其生殖器官㊁生殖细胞甚至激素水平均会受到影响,进而影响受精卵形成和胚胎发育,造成不良妊娠结局㊂因此,近年来BaP 的生殖毒性受到广泛关注,其作用机制包括改变胞内活性氧水平㊁诱导细胞DNA 损伤以及调控生殖发育相关基因㊁类固醇合成相关基因和促凋亡基因影响生殖发育㊂BaP 作为环境毒物,不仅可以影响生态环境的稳定性,还可以影响生物的生殖发育,损害生态环境中的物种多样性,从长远来看,BaP 的不良影响不但会威胁到陆地与海洋生物种群的稳定,还会破坏陆地和海洋生态系统的功能㊂本文将从生殖健康㊁配子与合子形成以及胚胎发育的角度,详细阐述BaP 染毒对生殖系统的毒性作用与机制,为预防BaP 引起的生殖危害㊁减少不良妊娠结局提供理论依据,旨在为BaP 的环境毒性行为和对生物的毒性研究提供有效借鉴,为合理预防和缓解因接触BaP 等环境毒物而带来的健康影响提供参考㊂关键词:苯并[a]芘(BaP);生殖细胞;生殖毒性;生殖器官;激素;细胞毒性文章编号:1673-5897(2024)2-165-19㊀㊀中图分类号:X171.5㊀㊀文献标识码:AResearch Progress on Toxic Effects of Benzo (a )pyrene on Reproductive System and Its MechanismWang Huizeng 1,Liu Bingchun 2,Chen Hong 1,Xu Peixin 1,Guo Xin 1,Yuan Jianlong 1,*1.Department of Laboratory Medicine,The Affiliated Hospital of Inner Mongolia Medical University,Hohhot 010050,China2.Stem Cell Research Center,The Affiliated Hospital of Inner Mongolia Medical University/Inner Mongolia Autonomous Region Tumor Cell Gene Detection Application and Research Engineering Laboratory,Hohhot 010050,ChinaReceived 13April 2023㊀㊀accepted 2November 2023Abstract :Benzo(a)pyrene (BaP),as a member of the polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs),is the earliest dis -covered and most representative environmental pollutant.It enters the human body through the air,food,and water,causing cellular oxidative stress damage,DNA damage,and abnormal gene expression,leading to cell death.Studies have shown that when male and female animals are exposed to BaP,their reproductive organs,cells,and hormone166㊀生态毒理学报第19卷levels are affected,which in turn will affect the formation of fertilized eggs and embryonic development,resulting in adverse pregnancy outcomes.Hence,the reproductive toxicity of BaP has received more attention in recent years.Its mechanism of action on reproductive development includes alteration of intracellular reactive oxygen species levels,induction of cellular DNA damage,and modulation of genetic changes related to reproductive development,steroid synthesis and pro-apoptosis.BaP,as an environmental toxicant,could influence the stability of the ecological environment,the reproductive development of organisms and destroy the diversity of species in the ecosystems.In this review,we will detailly elaborate on the toxic effects and mechanisms of BaP on the reproductive system,and provide a theoretical evidence for prevention reproductive harm caused by BaP and the reduction of adverse pregnancy outcomes,with the aim to providing an effective reference for the study of BaP s toxicity to the environment and organisms,and for the rational prevention and mitigation of the health effects of exposure to BaP or other environmental toxins.Keywords:benzo(a)pyrene;germ cell;reproductive toxicity;genital organ;hormone;cytotoxicity㊀㊀PAHs是由2个或2个以上的稠环芳烃组成的有机化合物[1],由于其化学性质稳定且具有疏水性[2],因此多环芳烃可以在环境中稳定存在,是常见的环境污染物,广泛存在于油炸烧烤食物㊁香烟烟雾[3]㊁汽车尾气[4]㊁煤炭燃烧[5]等中㊂人类可以通过空气㊁饮用水㊁食物等不同方式暴露于多环芳烃[6]㊂此外,多环芳烃的亲脂性有利于它们在水生生物的脂肪中积累[7],并随着食物链进入人体,对人类健康产生威胁㊂BaP是多环芳烃中最具有代表性也是毒性最大的致癌物[8],可以诱发肺癌[9]㊁乳腺癌[10]等癌症,危害人类健康㊂BaP广泛存在于人类生活环境中,2019年公布的美国毒物和疾病登记机构物质优先清单中,BaP被列为第8名,在污染的空气[11]㊁土壤[12]㊁水源[13]㊁食物[14]中均可以检测到BaP㊂近年来,越来越多研究表明BaP与胚胎畸形[15]和不良妊娠[16]有着密切的联系㊂在妊娠早期暴露于BaP会导致小鼠胎儿畸形率增高[17]㊂此外,一项病例对照研究表明,接触BaP与早孕流产之间存在联系,妊娠女性发生流产的风险与血中BaP-DNA加合物的浓度成正比,这进一步说明BaP除了致癌性也具有生殖毒性㊂目前对于BaP的研究多聚焦于其诱发癌症[18-19]尤其是肺癌[20]这一方面,虽有研究表明BaP 具有生殖毒性,其生殖毒性机理尚未研究透彻㊂本综述的目的是总结BaP生殖毒性相关文章,讨论BaP导致生殖毒性的潜在分子机制㊂1㊀BaP在生殖方面的主要致毒途径(The main toxic pathway of BaP in reproduction)近些年研究发现,BaP发挥其致毒作用主要有3种途径:(1)通过氧化应激影响细胞正常代谢;(2)BaP可以与DNA形成加合物,进而导致DNA损伤;(3)BaP可以通过调控基因表达,发挥其毒性作用㊂BaP致毒途径是多种机制相辅相成㊂由于生殖对繁育后代具有重要意义,因此研究BaP的生殖毒性已成为科学家们的研究重点,下文将重点总结BaP的生殖毒性机制㊂1.1㊀氧化应激(Oxidative stress)BaP进入细胞后,通过AHR途径诱导细胞发生氧化应激反应,其主要过程为:BaP刺激细胞质中的一种转录因子芳香族化合物受体(aryl hydrocar-bon receptor,AHR)[21],使其转入到细胞核后,再与芳香族化合物受体核转运蛋白(aryl hydrocarbon recep-tor nuclear transporter,ARNT)结合形成异二聚体[22],结合在下游靶基因上,激活细胞色素P450目标基因的异常表达,包括细胞色素P4501A1(cytochrome P450family1subfamily A member1,CYP1A1)㊁细胞色素P4501A1(cytochrome P450family1subfamily A member2,CYP1A2)㊁细胞色素P4501B1(cyto-chrome P450family1subfamily B member1, CYP1B1)[21,23],进而引起细胞产生大量活性氧(reac-tive oxygen species,ROS),使机体发生氧化应激反应,如果体内的活性氧产生过多,超出了细胞的清除能力,会影响细胞的正常代谢甚至会破坏细胞结构㊂低㊁高剂量的BaP均可导致小鼠卵母细胞功能障碍,降低精卵结合与融合率,这与线粒体ROS水平增加和卵膜脂质过氧化密切相关[24]㊂Zhang等[25]发现BaP可以削弱雌鼠的繁殖能力,通过增加雌鼠卵母细胞中ROS,扰乱纺锤体组装,染色体配对,阻滞卵母细胞减数分裂过程㊂BaP诱导的氧化应激不仅仅通过产生ROS这一条途径,还可以通过降低过氧第2期王惠增等:苯并[a]芘对生殖系统的毒性作用及其机制研究进展167㊀化氢酶(catalase,CAT)㊁抗坏血酸过氧化物酶(ascor-bate peroxidase,AP)㊁谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)㊁超氧化物歧化酶(superoxide dis-mutase,SOD)㊁谷胱甘肽还原酶(glutathione reductase, GR)等抗氧化酶的活性[26-27]以及促进炎症细胞因子表达[28]导致氧化应激的发生,最终引起细胞功能受损㊂1.2㊀BPDE引起DNA损伤(BPDE induces DNA damage)BaP进入体内经过一系列氧化代谢反应,生成二羟环氧苯并[a]芘(BaP-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide, BPDE),进而发挥其毒性,Penning[29]认为生成BPDE 的主要途径是在细胞色素P450酶的催化下,BaP末端的苯环上发生单加氧化反应,生成BaP-7,8-环氧化物(BaP-7,8epoxide),在环氧化物水解酶作用下转化为BaP-7,8-二氢二醇(BaP-7,8diol),该过程循环往复最终形成致癌物 BPDE[30-32]㊂BPDE可以与DNA共价结合形成加合物,造成DNA损伤㊂Shiizaki等[33]提出一个关于BaP-DNA加合物成因的假设,即CYP1A1是BaP被激活形成BPDE反应中的关键酶,这与Bukowska等[32]提出的观点一致㊂Einaudi等[34]通过建立BaP染毒的雌性小鼠模型,发现BaP可以导致卵母细胞与卵丘细胞DNA损伤,并且他们认为导致DNA断裂的主要原因是由于细胞中的修复机制对BPDE-DNA加合物切除和修复导致的㊂Zhan等[35]研究表明BaP形成的DNA加合物可以干扰DNA复制,进一步引起胚胎的DNA损伤,影响胚胎的发育㊂Zhan等[35]进一步研究发现DNA加合物与ROS共同造成基因组严重损伤,还可以引起卵裂球的端粒功能障碍,最终引起胚胎的异常㊂Miao等[36]发现BaP会引起猪卵母细胞纺锤体组装缺陷进一步引起减数分裂停滞,而导致这一结果的原因可能是DNA加合物引起的㊂Zhang 等[25]将小鼠卵母细胞暴露于BaP后,发现纺锤体的组装㊁染色体的排列和着丝点-微管附着均被破坏,这可能与DNA加合物的形成有关联,与Miao的设想一致㊂1.3㊀基因表达调控(Regulation of gene expression)基因表达调控是生物学研究的重要内容之一,在细胞分化发育的不同时期,基因表达的种类和强度各不相同,共同决定着细胞的形态与功能;细胞为了适应环境变化改变自身的基因表达有利于生存,因而基因表达调控十分重要㊂海洋污染问题日趋严重,BaP具有水生生物生殖毒性,是造成海洋污染的重要原因之一,受到广泛关注㊂有研究发现BaP生殖毒性的潜在分子机制是通过调控相关基因表达㊂数字基因表达技术表明BaP对雄性栉孔扇贝睾丸中的生殖基因有影响,其中热休克蛋白90㊁细胞色素P4503A㊁凋亡抑制蛋白3个基因的改变会引起睾丸组织损伤,此外BaP与性激素合成和睾丸发育相关基因有密切联系[37]㊂Albornoz-Abud等[38]研究表明苯并芘可以通过调控GH/IGF轴发挥其生殖毒性,急性暴露于BaP会导致尼罗罗非鱼睾丸中内分泌相关基因:胰岛素样生长因子1(insulin-likegrowth factor1,IGF1)和生长激素受体基因1(growth hormone receptor1,GHR1)基因表达降低,并造成发育问题㊂BaP通过基因调控引起的生殖毒性不仅仅在海洋生物中体现,陆地生物也同样受这一机制调控㊂BaP通过影响父本基因,最终影响胚胎发育㊂用BaP染毒的雄性小鼠进行体外受精后,发现在8-细胞期和囊胚期存在基因表达异常,包括调控细胞周期以及DNA修复的基因[39]㊂妊娠黄体可以分泌雌孕激素,在生殖系统中发挥重要作用,黄体的发育与血管内皮生成因子有着密切联系[40]㊂苯并芘可以使血管内皮生成因子相关基因,如血管生成素-1(an-giopoietin-1,Ang-1)㊁血管内皮细胞生长因子受体(vascular endothelial growth factor,VEGFR)㊁内皮细胞TEK酪氨酸激酶表达下调,并增加抗血管生成因子血小板反应蛋白(recombinant thrombospondin1, THBS1)的表达,还影响了对黄体血管系统建立至关重要的基因Notch1㊁DLL4㊁Jag1和Hay2的表达,破坏了黄体血管网络系统的形成,最终影响了妊娠过程中黄体的内分泌功能[41]㊂综上所述,在3种BaP发挥致毒作用的机制中(图1),BaP诱导生殖发育相关基因表达异常或提高促凋亡基因表达起主导作用,也是目前研究较为透彻的机制(图2),下面将从雄性生殖㊁雌性生殖以及胚胎发育3个角度详述BaP的毒性机制㊂2㊀BaP的雄性生殖毒性(Male reproductive toxici-ty of BaP)2.1㊀BaP对雄性激素的毒性(Toxicity of BaP to an-drogens)BaP作为内分泌干扰物主要影响睾酮水平[42],睾酮主要是由睾丸间质细胞合成分泌的,其主要成分为类固醇㊂BaP可以降低睾酮的转化率[43]和(或)睾酮的浓度[44]㊂有研究表明睾丸巨噬细胞分泌的白介素1β(interleukin-1β,IL-1β)和肿瘤坏死因子α168㊀生态毒理学报第19卷(tumor necrosis factor α,TNF α)通过抑制类固醇生成急性调节蛋白(steroidogenic acute regulatory protein,STAR)表达进一步抑制间质细胞合成睾酮[45]㊂Zheng 等[46]发现BaP 通过增加IL -1β的表达,显著抑制雄性大鼠睾酮的产生,他们还发现BaP 可以改变睾丸巨噬细胞亚群,激活ED2+睾丸巨噬细胞并促进了IL -1β的产生,最终抑制雄性大鼠睾酮合成㊂此外,3β-羟基类固醇脱氢酶(3β-hydroxysteroid dehy -drogenase,3β-HSD)与细胞色素P450胆固醇侧链裂解酶(cholesterol side -chain lyase P450scc,P450scc)在间质细胞合成睾酮中起着重要作用[47],其表达改变时会影响睾酮水平;STAR 表达的下调也可以导致睾酮合成减少[48-49]㊂雄性大鼠用BaP 灌胃90d 后,检测到BaP 下调间质细胞中的STAR ㊁3β-HSD 以及细胞色素P45017A1(cytochrome P450family 17subfamily A member 1,CYP17A1)表达,并上调P450scc 表达,进而降低大鼠睾丸间质细胞生成睾酮的能力[50]㊂Sheweita 等[51]发现BaP 降低类固醇合成酶CYP17A1和17β-羟基类固醇脱氢酶(17β-hydroxysteroid dehydrogenase,17β-HSD)蛋白表达,使大鼠血浆睾酮浓度降低㊂Banerjee 等[52]进一步验证了BaP 通过抑制类固醇生成蛋白表达,如细胞色素P450ⅡA1(cytochrome P450family Ⅱsubfamily A member 1,CYP ⅡA1)㊁STAR ㊁3β-HSD ㊁17β-HSD ,进一步降低血清睾酮水平,2021年Daoud 等[53]再一次证实了上述观点㊂Yang 等[54]发现BaP 也可以通过影响3β-HSD ㊁CYP17和17β-HSD 表达进一步扰乱雄性栉孔扇贝的激素水平㊂Booc 等[55]研究发现BaP 可降低雄性底鳉的睾酮水平,与其他动物不同的是BaP 并非通过调控类固醇相关基因表达造成这一结果,而是可能通过精原细胞包囊大小进而影响睾酮水平㊂综上所述,BaP 主要通过改变类固醇生成相关基因与酶的表达,抑制睾酮的生成,对雄性的生殖发育产生不利影响㊂epoxide(BPDE)图1㊀BaP 致毒途径机制注:AHR 表示芳香族化合物受体,ARNT 表示芳香族化合物受体核转运蛋白,HSP90表示热休克蛋白90,CYP450表示细胞色素P450,CYP17A1表示细胞色素P45017A1,STAR 表示类固醇生成急性调节蛋白,3β-HSD 表示3β-羟基类固醇脱氢酶,17β-HSD 表示17β-羟基类固醇脱氢酶,Caspase -3表示半胱氨酸蛋白酶-3,Caspase -9表示半胱氨酸蛋白酶-9,Bax 表示Bcl -2相关X 蛋白㊂Fig.1㊀Mechanism of BaP toxicity pathwayNote:AHR represents aryl hydrocarbon receptor,ARNT represents aryl hydrocarbon receptor nuclear transporter,HSP90represents heat shock protein 90,CYP450represents cytochrome P450family,CYP17A1represents cytochrome P450family 17subfamily A member 1,STAR represents steroidogenic acute regulatory protein,3β-HSD represents 3β-hydroxysteroid dehydrogenase,17β-HSD represents 17β-hydroxysteroid dehydrogenase,and Bax represents Bcl -2associated X protein.第2期王惠增等:苯并[a]芘对生殖系统的毒性作用及其机制研究进展169㊀图2㊀BaP通过基因调控引起生殖毒性注:GnRH2表示促性腺激素释放激素,GnRH3表示促性腺激素释放激素,IL-1β表示白介素1β,CYP17A1表示细胞色素P45017A1,STAR表示类固醇生成急性调节蛋白,3β-HSD表示3β-羟基类固醇脱氢酶,17β-HSD表示17β-羟基类固醇脱氢酶,CYP1A1代表细胞色素P4501A1, P450scc代表细胞色素P450胆固醇侧链裂解酶,Adcy-PKA代表上游腺苷环化酶-蛋白激酶,Caspase-3表示半胱氨酸蛋白酶-3,Caspase-9表示半胱氨酸蛋白酶-9,Bax表示Bcl-2相关X蛋白,Hsp90aB1代表90kDa热休克蛋白aB1,VTG代表卵黄蛋白原,CD34代表分化簇34, AMH代表抗缪勒管激素,CCND2代表细胞周期蛋白D2,FOXO1代表叉头框蛋白O1,HoxA10代表同源盒基因,BMP2代表骨形态发生蛋白-2,IBA1代表离子钙结合衔接分子1,SNCA代表重组人α-突触核蛋白,CYP19a代表细胞色素P450家族19亚家族a㊂Fig.2㊀BaP causes reproductive toxicity through gene regulationNote:GnRH2represents gonadotropin-releasing hormone2,GnRH3represents gonadotropin-releasing hormone3,IL-1βrepresents interleukin-1β, CYP17A1represents cytochrome P450family17subfamily A member1,STAR represents steroidogenic acute regulatory protein,3β-HSD represents3β-hydroxysteroid dehydrogenase,17β-HSD represents17β-hydroxysteroid dehydrogenase,CYP1A1represents cytochrome P450family1subfamily A member1,P450scc represents cholesterol side-chain lyase P450scc,Adcy-PKA represents adenylate cyclase-protein kinase,Bax represents Bcl-2associated X protein,Hsp90aB1represents recombinant heat shock protein90kDa alpha B1, VTG represents vitellogenin,CD34represents cluster designation34,AMH represents anti-Müllerian hormone, CCND2represents cyclin-D2,FOXO1represents forkhead box O1,HoxA10represents homeobox A10,BMP2represents bone morphogenetic protein-2,IBA1represents ionized calcium-binding adapter molecule1,SNCA representsrecombinant human alpha-synuclein,CYP19a represents cytochrome P450family19subfamily a.2.2㊀BaP对精子的毒性(Toxicity of BaP to sperm) 2.2.1㊀BaP减少精子生成(BaP reduces spermato-genesis)哺乳动物雄性生殖器官主要有睾丸㊁附睾㊁输精管等,其中睾丸的主要作用是生成精子和产生雄性激素,BaP主要通过损害睾丸进一步影响精子生成㊂BaP通过氧化应激或基因调控介导睾丸细胞凋亡,影响睾丸功能受损,减少精子数量㊂Banerjee等[52]证实BaP激活P38蛋白激酶(P38mitogen activated protein kinase,P38MAPK)通路来增加睾丸细胞内ROS,并降低细胞中的抗氧化酶活性[56],使睾丸细胞氧化应激损伤,减少精子的生成㊂Sheweita等[51]研究发现BaP通过降低睾丸组织中抗氧化酶CAT㊁SOD㊁GPX的活性,增加ROS水平,导致睾丸细胞线粒体膜破裂,进而引起睾丸组织凋亡㊂BaP还可通过AHR途径降低睾丸中CAT㊁SOD活性,升高H2O2含量,诱导睾丸细胞氧化应激,影响睾丸功能[57]㊂上述均为BaP对小鼠的生殖毒性,Tian等[58]发现BaP通过可引起雄性栉孔扇贝精巢氧化应激损伤,进一步减少精子生成㊂此外,BaP可以通过基因调控诱导睾丸细胞凋亡,提高睾丸细胞内的凋亡蛋白半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)和半胱氨酸蛋白170㊀生态毒理学报第19卷酶-9(Caspase-9)表达;促进细胞色素C转位到细胞质,启动线粒体凋亡途径,导致睾丸细胞凋亡,进一步导致精子生成减少[52,59]㊂BaP不仅通过影响睾丸功能减少精子生成,而且可以直接影响精子生成过程㊂Verhofstad等[60]的研究表明在精子发育各个阶段均可以检测到BPDE 导致的精子DNA损伤,这也是精子数量减少的原因之一㊂BaP可以导致雄鼠精子功能缺陷以及生育能力下降,并且Mohamed等[61]的实验证明了BaP的生殖毒性具有遗传性,但毒性随着子代数增加逐渐减弱㊂BaP可以减少精母细胞和次级精母细胞进入中晚期粗线期,阻止减数分裂过程的完成,导致精子生成减少[62]㊂此外,BaP诱导的氧化应激会降低精原细胞的存活率,并且通过下调基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)水平以及上调促凋亡因子Caspase-3和Caspase-9表达促进精原细胞凋亡[63]㊂BaP作为广泛存在于生态系统中的环境污染物,不仅使陆地雄性动物精子生成异常,还影响水生生态系统中的雄性动物的精子生成㊂BaP可以通过基因调控扰乱雄性栉孔扇贝的精子发生相关基因:细胞周期蛋白D2(cyclin-D2,CCND2),联会复合体3㊁核呼吸因子1和水通道蛋白9,进一步减少精子生成[54]㊂斑马鱼胚胎暴露于BaP后,其睾丸中生殖细胞特异基因的启动子发生甲基化上调,进一步下调相关基因表达,最终抑制精子生成,影响雄性斑马鱼的生殖能力[64]㊂2.2.2㊀BaP降低精子活力(BaP reduces sperm motility)BaP可以损害睾丸和附睾的内分泌功能,从而导致储存的精子活力下降[65-67]㊂睾丸的质量和大小与精子的数量和活力成正比[68],雄性小鼠用BaP连续灌胃60d,检测到小鼠的睾丸质量明显降低,精子的活力也随之降低[69]㊂小鼠暴露于BaP后,其睾丸支持细胞和间质细胞均凋亡,进而影响精子发生过程,最终导致精子活力减弱[69]㊂畸形精子的活力及存活率显著低于正常精子,BaP暴露会导致精子形态异常,畸形精子大幅增加,主要异常表现为无尾㊁双头㊁中段弯曲[57]㊂Xu等[59]验证了BaP可导致精子活动力降低,精子头㊁尾部畸形率以及总畸形率均显著升高㊂最新研究表明BaP改变睾丸激素水平引起雄性交配强度减弱,降低精子质量,引起畸形精子增多[70-71]㊂有研究表明精子短端粒可能是导致男性不育的原因之一[72],Ling等[73]研究发现BaP可以使精子端粒变短,且与剂量成反比㊂3㊀BaP的雌性生殖毒性(Female reproductive toxicity of BaP)3.1㊀BaP对雌性激素的毒性(Toxicity of BaP to es-trogen)BaP作为一种常见的环境污染物,是海洋环境污染原因之一,影响水生动物的繁殖㊂雌孕激素对雌性发育有不可或缺的作用,而BaP作为内分泌干扰物可以降低水生动物血浆中的孕酮㊁雌激素和催乳素浓度[74]㊂为进一步探究其发生机制,Tian等[58]用不同浓度的BaP处理雌性栉孔扇贝,发现BaP可以导致类固醇合成相关酶(3β-HSD㊁CYP17㊁17β-HSD)表达下降,并呈剂量依赖性;高浓度的BaP还可抑制AHR㊁ARNT㊁CYP1A1以及17β-雌二醇-雌激素受体转录,2种机制相辅相成,共同抑制雌孕激素的生成㊂BaP通过干扰激素膜受体降低三疣梭子蟹的雌二醇(estradiol,E2)浓度[75]㊂斑马鱼胚胎暴露于BaP会导致成年雌鱼卵巢中E2水平下降,其机制为雌鱼脑中促性腺激素释放激素(gonadotropin-releasing hormone,GnRH)基因中的GnRH3的甲基化水平显著升高,并下调GnRH3mRNA表达,从而影响E2的产生[76]㊂与斑马鱼报道相反的是BaP可促进雌性海马GnRH2和GnRH3mRNA的表达,并导致血浆中E2水平显著下降[77]㊂2种相反结果可能与BaP的浓度㊁作用时间以及实验对象不同有关㊂Yang等[78]发现BaP抑制雌性栉孔扇贝的上游腺苷环化酶-蛋白激酶(adenylate cyclase-protein ki-nase,Adcy-PKA)信号通路,下调促性腺激素受体转录水平,如促卵泡激素受体(follicle-stimulating hor-mone receptor,FSHR)和黄体生成素/绒毛膜促性腺激素受体(luteinizing hormone/choriogonadotropin re-ceptor,LHCGR),导致类固醇生成酶(3β-HSD㊁CYP17㊁17β-HSD)表达减少,最终引起抗雌激素效应㊂Kennedy和Smyth[79]发现雌鲑鱼体内E2的减少并非是通过常规的BaP作用于类固醇机制,而是通过其他内分泌干扰机制来对抗雌激素的方式改变了血浆E2的浓度,这种机制有待进一步研究㊂综上所述,BaP主要通过基因表达调控这一途径降低雌性体内E2和孕酮水平,进而影响雌性的生殖发育㊂3.2㊀BaP对卵巢的毒性(Toxicity of BaP to ovary)卵巢是雌性生殖发育中最重要的生殖器官,具有排卵和内分泌功能,对维持雌性激素水平至关重要,暴露于BaP会扰乱卵巢的结构与功能,进一步第2期王惠增等:苯并[a]芘对生殖系统的毒性作用及其机制研究进展171㊀影响生育㊁妊娠㊂高剂量的BaP可以导致卵巢细胞退化并出现管状结构,而这些组织学变化属于癌前病变[80]㊂Rahmani等[81]发现BaP通过氧化应激导致卵巢表面上皮内陷㊁细胞堆积㊁管状结构形成,卵巢间质出现间质水肿㊁出血等病理学改变,并且BaP 诱导卵巢中Caspase-3表达升高,影响卵巢的生理功能,与睾丸相比,BaP对卵巢的危害更严重,这是因为在BaP处理后,胎儿卵巢中促细胞凋亡蛋白Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2associated X protein,Bax)表达增加,并激活下游Caspase-3和Caspase-9,导致卵巢细胞凋亡[82]㊂卵黄蛋白原(vitellogenin,VTG)和CCND2是雌激素介导的卵巢发育相关基因[83],BaP可以下调VTG和CCND2表达,造成雌性栉孔扇贝卵巢受损,组织学检查发现,BaP可引起卵巢发育延迟和卵母细胞退化,并且卵巢的病变情况随着染毒时间和染毒剂量的增加而严重[78]㊂研究发现BaP可以抑制脂联素受体1(adiponectin receptor protein1,AdipoR1)和脂联素受体2(adiponectin receptor protein2,AdipoR2)表达,进而影响卵巢功能[84]㊂最新研究表明,BaP及其代谢产物BPDE可抑制妊娠小鼠卵巢中腺嘌呤核苷酸转运体1(adenine nucleotide translocator1,ANT1)的表达,进一步研究发现ANT1的过表达可以修复BPDE引起的有丝分裂缺陷,恢复卵巢功能[85]㊂3.3㊀BaP对雌性生殖细胞的毒性(Toxicity of BaP to female germ cells)3.3.1㊀BaP影响卵泡发生和发育(BaP affects folli-cular genesis and development)卵泡发育是女性正常的生理过程,卵泡的发育情况直接关系到后代繁殖㊂卵泡作为卵巢的功能单位,支持卵母细胞的发育和成熟[86]㊂卵泡的生长发育过程相当复杂,原始卵泡经历初级卵泡㊁窦前㊁窦卵泡才能发育为成熟卵泡[87-88]㊂有报道称BaP作为卵毒物质,可以破坏原始卵泡[89],或者使原始卵泡迅速枯竭[90],BaP还可以通过香烟烟雾进入卵泡液中,对卵泡发育产生不利影响[91]㊂Sobinoff等[24]研究了BaP卵毒性的机制,连续用BaP处理雌性小鼠7d会导致卵巢中的原始卵泡显著减少,卵泡闭锁,其具体机制为BaP通过干扰AHR发育信号破坏卵泡形成㊂有报道称BaP不仅可以减少或耗尽原始卵泡和初级卵泡的数量[89-90],还可以抑制卵泡生长发育,即BaP处理过的卵泡均发育不到窦前阶段[92]㊂Sadeu和Foster[93]将小鼠卵泡暴露于不同浓度的BaP,发现卵泡存活率均降低,其中高浓度的BaP会抑制窦卵泡发育,使卵泡停滞于窦前卵泡阶段,窦卵泡比例显著减少㊂抗缪勒管激素(anti-Müllerian hormone,AMH)浓度增加与卵泡发育停滞有关[94-95]㊂有研究表明BaP可以通过减少AMH生成,促进卵泡募集到卵泡池中,最终加快卵泡枯竭的速度[96]㊂Sadeu和Foster[93]进一步探索了BaP诱导卵泡发育异常的关键分子途径,发现BaP暴露通过激活窦前㊁窦卵泡和成熟卵泡中AHR信号通路,进一步促进促凋亡因子Bax激活,此外,BaP暴露还会导致90kDa热休克蛋白aB1(recombinant heat shock protein90kDa alpha B1,Hsp90aB1)基因表达上调,导致卵泡生长延迟和存活率下降㊂卵泡生长和卵泡发育在雌性哺乳动物生殖中有着重要地位,BaP不但可以通过基因表达调控导致卵泡生长发育异常,还可能通过氧化应激影响卵泡发育㊂3.3.2㊀BaP影响卵母细胞功能(BaP affects oocyte function)BaP可使卵母细胞线粒体内ROS水平升高,导致精-卵结合和融合障碍,影响动物的繁殖[24,36]㊂BaP可导致卵母细胞和卵丘细胞DNA断裂,细胞功能障碍,影响卵母细胞进一步发育,精卵融合失败[34],这也是BaP生殖毒性机制之一㊂卵母细胞的减数分裂在卵母细胞成熟与成功受精中起着重要作用[97],BaP诱导卵母细胞减数分裂异常,卵母细胞功能障碍,不利于动物繁殖㊂BaP可以阻滞猪卵母细胞减数分裂,使部分卵母细胞停滞在MⅡ期,进一步检测发现BaP通过降低乙酰化α-微管蛋白,导致微管不稳定,损害纺锤体组装,从而干扰卵母细胞减数分裂过程[36]㊂Sui等[98]通过将雌鼠暴露于BaP检测其对子代的影响,验证了BaP对卵母细胞的遗传毒性:生发泡破裂(germinal vesicle breakdown, GVBD)是卵母细胞成熟的关键事件,母体暴露BaP 会降低子代GVBD率[99];并且BaP会扰乱子代卵母细胞的纺锤体组装和染色体配对,使卵母细胞减数分裂停滞;最后,雌鼠暴露于BaP可导致子代卵母细胞基因组高甲基化,损害卵母细胞的发育能力㊂综上所述,母系BaP暴露损害了子代卵母细胞的进一步发育,这与上文Miao等[36]研究结果相一致㊂4㊀BaP对胎儿或胚胎的生殖毒性(Reproductive toxicity of BaP to the fetus or embryo)4.1㊀BaP的胚胎发育毒性(Embryonic developmen-tal toxicity of BaP)早有研究表明,吸烟损害身体健康,还对孕妇以。

基因与环境交互作用

公共卫生策略的优化和创新
基于基因-环境交互作用的研究成果，公共卫生策略将不断优化和创新，更加注重针对不同人群和环境的个性化预防和治疗措施。
伦理和法律问题的探讨
随着基因-环境交互作用研究的广泛应用，相关的伦理和法律问题也将逐渐凸显，需要进行深入探讨和制定相应的规范。
XX
REPORTING
2023 WORK SUMMARY
农业生产管理优化
智能农业
结合物联网、大数据和人工智能等技术，对农业生产环境进行实时监测和调控，提高农业生产效率和质量。
精准施肥
根据土壤养分含量和作物需求，制定个性化施肥方案，减少化肥使用量，提高肥料利用率。
生物防治
利用天敌、昆虫不育技术等生物防治方法，控制农作物病虫害，减少化学农药使用量。
药物研发与优化
药物靶点发现
研究基因与环境交互作用有助于发现新的药物靶点，为药物研发提供新的思路。
药物设计与优化
通过分析基因和环境因素对药物代谢和药效的影响，可以指导药物的设计和优化，提高药物的疗效和安全性。
临床试验策略
基因与环境交互作用的研究可以为临床试验提供更精准的患者分层和入组标准，提高临床试验的效率和成功率。
的表达。
代谢物介导的机制
03
环境因素可以影响生物体内的代谢过程，产生具有生物活性的
代谢物，这些代谢物可以作为信号分子调控基因的表达。
PART 03
基因与环境交互作用研究方法
基因组学技术
基因测序
利用高通量测序技术对基因组进行测序，获得基因组的完整序列信息，为基因与环境交互作用研究提供基础数据。
代谢组学技术
代谢物检测与分析
利用质谱、核磁共振等技术对生物样本中的代谢物进行检测和分析，研究代谢物的种类、数量和功能，以及基因与环境交互作用对代谢水平的影响。

LncRNA：LncRNA的前世今生以及临床思路分析

LncRNA：LncRNA的前世今生以及临床思路分析前言：近年来，LncRNA相关研究在国内外的热度居高不下，早在1991年，Xist 调控X染色体的失活就登上Nature，但当时认为这只是一种特殊情况。

2007年Howard Chang在Cell上发表题为“Functional demarcation of active and silent chromatin domains in human HOX loci by noncoding RNAs”的论文（图1），正式开启了LncRNA火热的十年。

接下来从以下8个方面来介绍：LncRNA的定义、LncRNA的发现、LncRNA的分类、LncRNA的功能、LncRNA的作用模式、LncRNA的争议、LncRNA的常用数据库以及LncRNA的研究模式。

图1图2-谷歌学术显示该文章引用量高达2854次一、LncRNA的定义LncRNA(Long non-coding RNA)，是长度大于200个核苷酸的非编码RNA，一些LncRNAs，长度超过90kb，也被称为macroRNA，如Airn 和KCNQ1OT1。

标准“非编码”是指在转录本中缺少开放阅读框和/或保守密码子，2011年Cell发表论文表明LncRNA可以被核糖体吸引，其中一些能翻译产生小肽（图3）。

编码肽的能力与转录产物充当功能性RNA的能力并不一定冲突，事实上，越来越多的证据表明双功能转录产物既可以作为蛋白质模板，也可以作为LncRNAs。

图3-Cell论文证实LncRNA能翻译产生小肽二、LncRNA的发现LncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II 转录的副产物，不具有生物学功能。

然而，1991年，Nature等杂志刊文证实Xist参与X染色体失活的调控（图4）。

此后越来越多的研究表明，LncRNA在众多生命活动过程中发挥重要作用，LncRNA开始引起人们广泛的关注。

肝细胞肝癌中AOC4P表达和临床意义

肝细胞肝癌中AOC4P表达和临床意义何倩倩;王浩联;张金平;李东颖;李建生【摘要】Objective:This study investigates the expression of long non-coding RNA termed amine oxidase, copper containing 4, pseudo-gene (AOC4P) in hepatocellular carcinoma (HCC) and its relationship with clinicopathological factors and patient prognosis. Methods:The expression of AOC4P in 106 HCC tissues and adjacent non-tumor tissues were detected using qRT-PCR. The relationship between AOC4P expression and clinicopathological factors, as well as patient prognosis, in HCC was analyzed. Results:The relative expression of AOC4P in the cancer tissues was 0.66±0.34, which was significantly lower than the relative expression in adjacent non-tumor tissues, i. e., 1.45±0.63 (P<0.05). Univariate analysis showed that low AOC4P expression was correlated with tumor size, lymph node metastasis, and TNM stage (P<0.05). The group with high AOC4P expression levels has longer survival time compared with the group with low AOC4P expression levels. Cox multivariate regression analysis showed that AOC4P expression, lymph node metastasis, and vascular in-vasion were all independent factors that affect prognosis of patients. Conclusion:AOC4P expression was reduced in HCC tissues, and AOC4P may play crucial roles in the occurrence and development of HCC. For patients with poor prognosis, low AOC4P expression is an independent risk factor for patients with HCC. Thus, AOC4P expression may be used as a molecular marker for HCC.%目的：探讨肝细胞肝癌（hepatocellularcarcinoma，HCC）组织中长链非编码RNA含铜胺氧化酶4的假基因（amine oxidase copper containing 4 pseudogene，AOC4P）表达及其临床意义。

利用生物信息技术分析喉癌的关键基因

利用生物信息技术分析喉癌的关键基因董周威王启威张丽萍林丽红徐丹摘要目的利用生物信息技术探讨喉癌的发生机制，寻找用于喉癌诊断和治疗的关键基因。

方法本研究从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载基因芯片数据集GSE51985和GSE59102,筛选差异表达基因，并进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析，使用STRING在线数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)，并利用CyLoscape进行了模块分析，筛选关键基因。

然后用Oncomine数据库对关键基因进行泛癌分析,从癌症和肿瘤基因图谱数据库(The Cancer Genome ALlas,TCGA)下载喉癌相关基因表达数据和临床资料,对关键基因进行基因表达差异和生存分析。

结果共筛选出差异基因218个o KEGG途径分析显示，差异基因主要富集于唾液分泌、ECM受体相互作用、细胞周期等途径。

利用CysLoscape软件筛选关键基因，筛选出CHEK1、SERPINE1、SPP1、COL1A1、FOXM1、MMP9、CXCL12和MMP1共8个基因为关键基因。

将关键基因输入GEPIA数据库寻找相似基因,将所有基因输入MeLascape进行富集分析,主要富集于细胞外组织结构、PID整合素1途径、有丝分裂染色体分离等。

利用TCGA数据库数据进行关键基因在喉癌组织与正常组织表达差异分析,8个关键基因差异均有统计学意义，在生存分析中，笔者发现COL1A1和MMP1的表达与喉癌总生存率显著相关。

结论本研究中发现的差异基因和关键基因有助于深入了解喉癌发生、发展的分子机制，为喉癌的诊断和治疗提供新的候选靶点。

关键词喉癌生信分析关键基因差异分析中图分类号R76文献标识码A DOI10.11969/j.issn.1673-548X.2021.01.021Analysis of the Hub Genes in Laryngeal Carcinoma by Bioinformatics.Dong Zhouwei,Wang Qiwei,Zhang Liping,et al.Department of Otolaryngology,the Fourth Hospital of Harbin,Heilongjiang150020,ChinaAbstract Objective To explore Lhe mechanism of laryngeal cancer by using bioinformaLics and Lo find Lhe key genes for diagnosis and LreaLmenL of laryngeal cancer.Methods In Lhis sLudy,gene chip daLaseLs GSE51985and GSE59102were downloaded from Gene Expression Omnibus(GEO)Lo screen differentially expressed genes,and funcLional enrichmenL analysis of Gene OnLology(GO)and KyoLo Encyclopedia of genes and genomes(KEGG)was carried ouL.The proLein-proLein inLeracLion neLwork(PPI)was consLrucLed by using STRING online daLabase,and Lhe key genes were screened by using Lhe module analysis of CyLoscape.Then,Oncomine daLabase was used for pan一cancer analysis of key genes,and Lhe gene expression daLa and clinical daLa relaLed Lo laryngeal cancer were downloaded from Lhe Cancer Genome ALlas(TCGA)Lo conducL gene expression differences and survival analysis of Lhe key genes.Results ToLally218differ-enLial genes were screened ouL.KEGG paLhway analysis showed LhaL Lhe differential genes were mainly enriched in salivary secreLion,ECM recepLor inLeracLion,cell cycle and oLher pathways.The key genes of CHEK1,SERPINE1,SPP1,COL1A1,FOXM1,MMP9,CXCL12 and MMP1were screened ouL by using cysLoscape software.The key genes were inpuL inLo GEPIA daLabase Lo search for similar genes, and all genes were inpuL inLo MeLascape for enrichmenL analysis,mainly concenLraLed in exLracellular Lissue sLrucLure,PID inLegrin1paLh-way,miLoLic chromosome separation,eLc.The differences of expression of key genes in laryngeal cancer Lissues and normal Lissues were analyzed using TCGA daLabase daLa,and all key genes had sLaLisLical significance.In Lhe survival analysis,we found LhaL Lhe expressions of COL1A1and MMP1were significanLly correlated wiLh Lhe overall survival raLe of laryngeal cancer.Conclusion The differenLial genes and key genes found in Lhis sLudy can help us Lo understand Lhe molecular mechanism of laryngeal cancer and provide a new candidate Lar-geL for Lhe diagnosis and LreaLmenL of laryngeal cancer.Key words Laryngeal cancer；BioinformaLics analysis；Key genes；Differential analysis基金项目：黑龙江省卫生健康委员会科研基金资助项目(2019-225)；黑龙江省卫生和计划生育委员会科研基金资助项目(2018019)作者单位：150020哈尔滨市第四医院耳鼻喉科(董周威、张丽萍、林丽红、徐丹)；150001哈尔滨医科大学附属第一医院耳鼻咽喉头颈外科(王启威)通讯作者：王启威，电子信箱:aaaqww@喉癌的发生率在呼吸道肿瘤中位居第2位，仅次于肺癌，每年新增病例超过15万，大多数的喉癌患者处于临床m期和N期才被发现，喉癌的发生率和病死率较高，这就要求通过有针对性的筛查寻找用于喉癌早期诊断的分子标志物和治疗靶点[l]o喉癌的病因复杂，与环境和生活方式有关,如吸烟、饮酒、接触有・97・毒物质、饮食习惯、辐射、乳头状瘤病毒感染和咽喉返流等⑵。

2011年度浙江省自然科学基金资助项目表剖析

附件：2011年度浙江省自然科学基金资助项目表一、重点项目（57项）项目编号项目名称申请者依托单位Z1110741基于改进Unscented卡尔曼滤波的电池组非线性动态模型与SOC联合在线估计高明煜杭州电子科技大学Z1110937GaN HEMT毫米波单片集成功率放大器关键技术研究程知群杭州电子科技大学Z4110503激光诱导击穿光谱中等离子状态及定量分析研究季振国杭州电子科技大学Z3110443植物细胞钙感受体响应酸雨的分子机理研究裴真明杭州师范大学Z6110033一类稀土过渡金属氧化物的电子结构和新奇量子态戴建辉杭州师范大学Z1111219三值钟控传输绝热数字集成电路设计技术研究汪鹏君宁波大学Z3110211乳酸菌胞外多糖的硒化修饰及其免疫调节作用机制研究潘道东宁波大学Z3110482曼氏无针乌贼黑色素形成与调控的分子机理研究王春琳宁波大学Z4110072基于Gd2O3:Ce3+高性能闪烁玻璃的研究张约品宁波大学Z4110347白光LED用新型高效单晶荧光材料中若干基础科学问题研究向卫东温州大学Z2110521基于Solexa测序的全基因组启动子区DNA甲基化检测方法的研发孙中生温州医学院Z2110700MicroRNA在大脑皮质投射神经元发育中的表达和功能陈捷光温州医学院Z1110057基于纳米碳管薄膜制备技术的大面积场发射显示器的研究王淼浙江大学Z1110154群组动画关键技术研究金小刚浙江大学Z1110168基于表面声波的细胞粉碎器的研究骆季奎浙江大学Z1110189血泵流体动压支承悬浮机理及血液相容性研究阮晓东浙江大学Z1110190异型腔计量泵优化设计与实验鲁阳浙江大学Z1110196利用同步辐射LIGA技术开展光热微驱动器的研究和应用张冬仙浙江大学Z1110222基于热致声原理的隧道LED照明系统散热机理研究黄志义浙江大学Z1110276单电极无跳模调谐半导体激光器研制何建军浙江大学Z1110330CMOS工艺兼容的表面等离子激元微纳器件及集成技术的基础研究李尔平浙江大学Z1110393基于声操纵的三维自动微装配理论与实践研究杨克己浙江大学Z2110006人巨细胞病毒长独特序列128功能及其作用尚世强浙江大学Z2110056"miR-29-TF-E6、E7"在人乳头瘤病毒癌基因致癌中的作用及分子机制研究吕卫国浙江大学Z2110059细胞内外前B细胞克隆增强因子在脑缺血急性损伤中的作用研究张纬萍浙江大学Z2110063人类卵子发生的表观遗传重编程及其调控机制研究黄荷凤浙江大学Z2110230监测诱导多功能干细胞（iPSC）治疗的双模式分子影像技术开发张宏浙江大学Z2110449基于调控胶质细胞糖代谢防治癫痫的药物新靶标研究连晓媛浙江大学Z2110591信号转导蛋白Smad7在肿瘤转移中的作用和分子机理冯新华浙江大学Z2110655有机小分子诱导胚胎干细胞定向分化为类肝细胞及作用机理研究俞永平浙江大学Z3110004植物根毛细胞形成及伸长的重要功能基因RHF的克隆和功能鉴定甘银波浙江大学Z3110054青藏高原一年生野生大麦啤用品质特异基因的鉴定与利用研究张国平浙江大学Z3110057赤霉病菌毒素合成调控途径上药靶的挖掘和利用马忠华浙江大学Z3110115家禽肝-卵巢轴对卵黄沉积和胚胎发育调控作用的研究张才乔浙江大学Z4110019基于表面纳米结构的微流控循环肿瘤细胞分析系统王敏浙江大学Z4110040渗流型纳米导电相/介电相复合高性能介电薄膜的原位形成制备及性能研究杜丕一浙江大学Z4110056通过内旋转受阻诱导荧光增强标记方法研究大分子的近程结构变化孙景志浙江大学Z4110126催化剂的相转变对氧电化学还原过程的作用研究李洲鹏浙江大学Z4110186生物质能微生物电催化转化的机制研究成少安浙江大学Z5110094生物脱氮过程特性及其微生物学机理研究郑平浙江大学Z6110066基于全球产业链治理的我国农业产业安全研究马述忠浙江大学Z1110551主观性文本的情感倾向性分析方法研究厉小军浙江工商大学Z1111051基于关联增量模型的广域离散多摄像机系统目标交接关键技术研究王慧燕浙江工商大学Z3110399新型乳酸菌细菌素生物合成的基因调控机制顾青浙江工商大学Z6110519政府投入与医院效率的监管设计：基于取消药品加成和增设药事服务费许冰浙江工商大学Z1110794圆柱滚子超精密加工新方法的研究袁巨龙浙江工业大学Z1110893含电动汽车并网的智能微电网关键技术研究张有兵浙江工业大学Z3110487木质纤维素的结构调控及脱除海洋蛋白水解液中重金属的应用研究欧阳小琨浙江海洋学院Z1110695自激热声脉动强化传热的机理研究郑友取浙江科技学院Z1110123带有超空泡的气液两相流流动机理研究及水中航行体超空泡减阻技术开发施红辉浙江理工大学Z1110750压电选针单元动力学建模与自检测方法的研究袁嫣红浙江理工大学Z6110334面向复杂产品设计的可拓自适应知识服务研究潘旭伟浙江理工大学Z3110223高含水率木（竹）材胶接及机理研究刘志坤浙江农林大学Z3110509水稻BR相关基因DLH(t)的功能分析与育种利用汪得凯浙江省农业科学院Z6110203专业市场演化博弈机制与转型升级研究——以“中国小商品城”和“中国轻纺城”为例陆立军浙江师范大学Z6110786图的染色及其应用朱绪鼎浙江师范大学Z2111261TGF-β信号通路参与骨性关节炎发病的分子机制研究陈棣浙江中医药大学二、省杰出青年科学基金项目（53项）项目编号项目名称申请者依托单位R1110003 面向下一代高频高速无线通信的集成天线研究罗国清杭州电子科技R1110006 视频内容管理关键技术研究陆哲明浙江大学R1110033 大推力双边型永磁直线伺服电机的关键技术研究卢琴芬浙江大学R1110089 生物质分级转化为高品位液体燃料的基础研究王树荣浙江大学R1110261 复杂生物网络集中的频繁模式挖掘技术研究刘文斌温州大学R1110377 支持复杂机电装备产品系统层创新的设计与仿真集成研究刘玉生浙江大学R1110416 宽带移动多用户空时频分集传输理论与技术研究郑紫微宁波大学R1110443 分数阶非线性系统的渐近稳定性齐冬莲浙江大学R1110502 可重构全自动蔬菜嫁接机器人的关键技术研究武传宇浙江理工大学R1110646 高速列车空心车轴多楔同步精密轧制成形理论研究束学道宁波大学R1110679 机器人自主视觉行为规划和复杂环境三维建模陈胜勇浙江工业大学R1111149 燃料电池双极板表面微结构的功能设计及其制造基础研究文东辉浙江工业大学R2110025 联合使用C16多肽与神经营养因子多靶点治疗多发性硬化的研究韩曙浙江大学R2110125 HOTAIR表观遗传调控肝癌侵袭转移的分子机制研究吴健浙江大学R2110159 解偶联蛋白在非酒精性脂肪性肝炎中的作用机制与miRNA调控网络研究金希浙江大学R2110231 新型砷代谢产物对急性早幼粒细胞NB4细胞系分化及PML-RARα融合蛋白的影响研究那仁满都拉浙江大学R2110269 CDC42调控间充质干细胞成软骨的发育机制研究吴希美浙江大学R2110297 新型AChE抑制剂-H3受体拮抗剂/反向激动剂的设计、合成和药理学研究盛荣浙江大学R2110298 转录因子ThPOK在T细胞分化发育中的作用及调控机制汪洌浙江大学R2110323 Caveolin-1与Nrf2的相互反应及其对急性肺损伤的调控机制研究陈志华浙江大学R2110374 多孔纯钛表面纳米掺杂羟基磷灰石薄层的制备及生物学评价何福明浙江大学R2110503 受Dicer调节的非编码RNA在慢性乙型病毒性肝炎恶性转化过程中的作用唐开福温州医学院R2110569 DNA损伤检验点蛋白TopBP1 在FA信号通路中的作用及分子机理研究黄俊浙江大学R2110588 TRAF6催化具激酶激活活性的多泛素链合成的机制夏总平浙江大学R3110049 寄生蜂多DNA病毒的基因表达及其对寄主小菜蛾脑激素肽的调控时敏浙江大学R3110085 甘氨酸亚铁对仔猪小肠吸收关键跨膜转运蛋白影响机制研究冯杰浙江大学R3110096 希瓦氏菌呼吸转换调控的机制研究高海春浙江大学R3110131 肝脏干细胞激活的分子机制研究仓勇浙江大学R3110155 腈水解酶序列、结构与功能关系及催化机理研究柳志强浙江工业大学R3110209 SlMAPK参与高温下番茄果实类胡萝卜素代谢调控的机制研究卢钢浙江大学R3110345 对虾鲜度表征蛋白的筛选与特性研究王彦波浙江工商大学R4110021 功能性笼型硅氧烷低聚物在制备高性能芯片粘接膜中的多重作用研究李勇进杭州师范大学R4110030 洁净能源用大规模、高质量、厚度均匀的石墨烯薄膜的可控生长徐明生浙江大学R4110055 官能化2-亚胺基氧杂环丁烷的构建及其重排反应马成浙江大学R4110092 利用计算设计提高酯酶手性选择性的基础研究于洪巍浙江大学R4110175 功能化石墨烯的液晶行为研究高超浙江大学R4110189 用于印刷电子的ZnO基纳米晶：成分、结构与能带工程研究金一政浙江大学R4110195 β-D-阿拉伯呋喃糖苷的合成研究朱向明浙江师范大学R4110199 伴有水解缩合反应的细乳液聚合机理及动力学模型化单国荣浙江大学R4110294 过渡金属催化C-H键对C-杂不饱和键的加成反应研究成江温州大学R4110345 硼、氮掺杂碳纳米管负载金铂、金钯加氢催化的理论与实验研究王建国浙江工业大学R5110004 表面改性对纳米材料的聚合沉降性能及吸附水中典型污染物性能的影响杨坤浙江大学R5110012 不同降雨条件下土壤侵蚀机理研究冉启华浙江大学R5110031 土壤铜分子形态转化和吸收耦合的根尖微环境调控机制施积炎浙江大学R5110036 基于非模态项分解和固有模态识别技术的海洋立管结构瞬态振动特性研究陈正寿浙江海洋学院R5110079 稻田中多环芳烃迁移转运的界面脱毒机制及其在污染修复中的应用何艳浙江大学R5110215 海底天然气水合物的形成与破坏对全球气候变化的调控作用研究韩喜球国家海洋局第二海洋研究所R5110230 纳米金比色法快速检测重金属污染离子研究吴爱国中国科学院宁波材料技术与工程研究所R6110115 低维磁电功能材料的性能调控研究王杰浙江大学R6110132 产业集群情境下企业超本地网络嵌入、知识重构与能力跃迁魏江浙江大学R6110175 有限温度下的低维冷原子性质研究高先龙浙江师范大学R6110362 极速高气压热处理新技术及其在氮化物强磁研发中的应用司平占中国计量学院R6110518 关于f(T)引力理论的研究吴普训宁波大学三、一般项目（793项）项目编号项目名称申请者依托单位Y1110644 面向海洋遥感地理信息系统的海量不确定时空概率查询技术研究蒋国昌国家海洋局第二海洋研究所Y5110014 舟山渔场附近海域营养盐补充与再分配的数值研究宣基亮国家海洋局第二海洋研究所Y5110065 高温消毒下海水基体的营养盐环境质控样稳定性的研究杨丹国家海洋局第二海洋研究所Y5110131 象山港浮游植物群落结构的空间异质性特征及其环境指示作用研究江志兵国家海洋局第二海洋研究所Y5110166 重金属在浙江海域海水、底质及海洋食物链中的传递过程研究及其风险评价孙维萍国家海洋局第二海洋研究所Y5110171 浙江沿海表层沉积物有机质活性及生态意义王奎国家海洋局第二海洋Y5110185 长江口低氧区硝化微生物和厌氧氨氧化微生物的多样性研究张东声国家海洋局第二海洋研究所Y5110187 浙江省强潮海区流场的大面积同步观测与预测预报研究吴清松国家海洋局第二海洋研究所Y3110441 无机氮素形态影响毛竹根鞭养分高效利用生理机制研究杜旭华国家林业局竹子研究开发中心Y5110267 氮输入对酒竹能源林碳平衡的影响李伟成国家林业局竹子研究开发中心Y1110078 具有慢光效应光纤光栅耦合器开关与传输特性的研究李齐良杭州电子科技大学 Y1110232 自然和谐人机交互关键技术研究——人脸表情识别付晓峰杭州电子科技大学 Y1110620 基于PDF 的两相湍流理论与算法的若干问题研究徐江荣杭州电子科技大学 Y1110831 支持泛在应用的进化型数据流挖掘与表示关键技术研究傅婷婷杭州电子科技大学 Y1110991 毫米波段低电压振荡器相位噪声优化关键技术研究周明珠杭州电子科技大学 Y1110992 GHz 薄膜变压器的电路建模及其参数提取优化算法的研究胡晓萍杭州电子科技大学 Y1111019 面向3D 视频传输的高效错误隐藏研究周洋杭州电子科技大学 Y1111044发动机气门座圈磨损寿命评价方法研究刘忠民杭州电子科技大学Y1111063无线多媒体传感器网络实时可靠数据收集问题研究冯云霞杭州电子科技大学Y1111085基于自适应无网格法气固两相流全尺度模拟研究丁宁杭州电子科技大学Y1111101基于草图的三维数字浅浮雕设计研究计忠平杭州电子科技大学Y1111189基于脑电和肌电融合的仿生机器人交互技术研究张启忠杭州电子科技大学Y1111192虚拟网嵌入与调整策略研究汤景凡杭州电子科技大学Y1111213面向兴趣区域和具有自适应特性的彩色图像实时超分辨率重建方法研究陈华华杭州电子科技大学Y1111220无线传感器网络智能信息处理关键技术研究张乐杭州电子科技大学Y1111229三维图像立体感质量评价模型研究韦学辉杭州电子科技大学Y2110775基于细胞三维组装技术的肿瘤细胞侵袭转移模型研究葛亚坤杭州电子科技大学Y4110499新型纳米PEC结构光催化剂的设计及光催化性能研究殷好勇杭州电子科技大学Y4110580基于能量色散X射线荧光光谱的三维化学计量学研究夏阿林杭州电子科技大学Y4110581A8TxSb46-x的高压合成与热电性能研究霍德璇杭州电子科技大学Y5110051典型拟除虫菊酯诱导海马神经细胞凋亡的对映体选择性及其机制陆娴婷杭州电子科技大学Y6110289支持新服务开发的知识协同网络与管理机制研究卜心怡杭州电子科技大学Y6110298全球制造网络中的浙江中小企业渐进性创新动态演化研究胡保亮杭州电子科技大学Y6110524氯气离子分子高分辨光谱的同位素效应研究吴玲杭州电子科技大学Y6110644核物质对称势的高密行为研究高远杭州电子科技大学Y6110648基于B2C网络卖家生命周期特征的信用评价机理研究：以淘宝商城服装卖家为例刘大为杭州电子科技大学Y6110687浙江内生型产业集群西部根植和网络化生长机制研究钟立新杭州电子科技大学Y6110730非常规突发事件情景演化的概率性生长与应对决策研究杨伟杭州电子科技大学Y6110764服务工作结构分析及其对生产率的影响研究刘广杭州电子科技大学Y6110803低碳经济视角下浙江CDM项目绩效与政策研究文绪武杭州电子科技大学Y6110811空间视角下的制造业集群间分工与生产性服务业不平衡发展研究黄洁杭州电子科技大学Y1110591基于情境感知QoS的个性化服务推荐机制研究邝砾杭州师范大学Y1110820基于SOA的高校复合型人才培养分析与设计研究缪健美杭州师范大学Y2110381需要满足影响不公平厌恶的神经机制吴燕杭州师范大学Y2110416归巢障碍及归巢后凋亡在肝衰竭肠IgA阳性淋巴细胞减少中的机制研究付金龙杭州师范大学Y2110620SIAH1上调Bim的分子机制及其对乳腺癌细胞失巢凋亡的影响温媛媛杭州师范大学Y2110703高效测定药用植物中关键酸碱成分解离常数的新方法研究卢丹杭州师范大学Y2110776PAK5磷酸化P48抑制E-cadherin表达并促进乳腺癌细胞转移的机制研究柯强杭州师范大学Y2110864γδT细胞对小鼠溃疡性结肠炎相关癌的作用及机制研究叶月芳杭州师范大学Y2111051Rock上调MST1诱导血管内皮细胞凋亡在动脉粥样硬化中的作用研究张邢炜杭州师范大学Y2111111TLR4/MyD88在急性肺损伤炎症反应中作用机制研究徐长青杭州师范大学Y2111122iPS细胞自体移植治疗脊髓损伤动物模型的研究杨俊林杭州师范大学Y2111209HDPR1调控δ-catenin的分子机制及对肺癌细胞侵袭和凋亡的影响杨志强杭州师范大学Y3110175基于人工锌指核酸酶抗双生病毒体系的建立与评价程晓非杭州师范大学Y3110276黄喉拟水龟性别决定过程中的母体效应及其适应意义陆洪良杭州师范大学Y3110327线粒体反向调控榨菜细胞质雄性不育系中根与下胚轴伸长机制研究刘训言杭州师范大学Y4110243桥联聚硅氧烷对改性聚芴类材料热发光稳定性能的调控机理研究边高峰杭州师范大学Y4110297Prins成环反应新策略在天然产物合成中的应用陈巍峰杭州师范大学Y4110331新型高效有机硼类光电功能材料的合成与应用赵祖金杭州师范大学Y4110369介孔锗-碳纳米复合锂离子电池负极材料的制备与性能研究施益峰杭州师范大学Y4110386嗜热光合绿丝菌生产3-羟基丙酸关键技术研究辛越勇杭州师范大学Y4110460新型Ladder-type低能隙共轭聚合物光伏材料的设计合成万俊华杭州师范大学Y4110570苯并-1,3-唑磷稀土金属有机化合物的合成及其对二氧化碳的活化皮承富杭州师范大学Y5110143堆肥化过程碳素损失原位控制的影响因子研究周根娣杭州师范大学Y5110144水华微囊藻毒素对两栖动物的雄性生殖毒效应及分子致毒机理研究贾秀英杭州师范大学Y6110017清洁发展机制下浙江企业低碳技术创新的效率提升：理论、模拟与机制设计罗堃杭州师范大学Y6110105省际科技创新协同的机理与对策研究：以江浙为例陈丹宇杭州师范大学Y6110156基于伦理领导的中小企业组织创新和绩效提升研究赵立杭州师范大学Y6110177黑洞似正规模与黑洞相变的研究贺喜杭州师范大学Y6110178网络交易信用的模糊逻辑评价与计算方法梁锡坤杭州师范大学Y6110271各向异性介质和粒子系统的散射特性及其应用研究杜新悦杭州师范大学Y6110287非线性算子方程与变分不等式解的迭代算法研究谷峰杭州师范大学Y6110317面向网络社会的独立信用评价机制和模型研究章剑林杭州师范大学Y6110470德西特时空下的量子物理特性和规律的研究李康杭州师范大学Y6110673心理弹性对冠脉介入患者实践治疗性行为方式改变(TLC)的作用机制及其健康管理模型研究杨芳杭州师范大学Y6110778电弱新物理模型的低能检验和现象学研究陈驰一杭州师范大学Y6110782与伪随机数列相关的若干数论问题及其应用研究沈忠华杭州师范大学Y2110983南方红豆杉水提物逆转肺癌干细胞耐药作用机制研究李萍杭州市第二人民医院Y2111316NKT细胞在糖脂诱导的幼年大鼠及成年大鼠NAFLD模型中的活化机制及功能差异刘红杭州市第六人民医院Y2110782肿瘤干细胞标记物CD133预测直肠癌放疗敏感性的研究杨关根杭州市第三人民医院Y2111279痤疮丙酸杆菌在进行性斑状色素减少症中致病性的研究尉晓冬杭州市第三人民医院Y2111310茶多酚治疗白癜风的作用机制研究欧阳杰杭州市第三人民医院Y1110969移动云计算环境下的海量多媒体医学影像的自适应协同检索及优化存储的关键技术研究蒋楠杭州市第一人民医院Y2111329靶向Notch1基因的siRNA对前列腺癌PC3细胞成瘤性的影响邓刚杭州市第一人民医院Y2110708Th9/Treg平衡在乙肝病毒感染炎症过程中的变化及健脾补肾中药对其的影响刘肄辉杭州市红十字会医院Y2111294大鼠KLF2、KLF4的表达及急性肺损伤早期预测的相关性研究杨勇杭州市中医院Y2110945离子色谱-蒸发光散射\电喷雾检测双膦类药物技术研究陈郁杭州职业技术学院Y5110158以超临界CO2一步法合成DMC为途径的CO2资源化利用徐明仙杭州职业技术学院Y1110944面向手持设备MID的移动GIS时空数据模型研究李祖欣湖州师范学院Y1111000基于市场机制的云服务适配模型及SLA执行策略研究吴小红湖州师范学院Y2111181中期因子与磷脂混杂酶1相互作用及其对rRNA转录活性的影响陆永良湖州师范学院Y3110432精原干细胞介导的肌肉生长抑制素基因剔除转基因罗非鱼的研究李景芬湖州师范学院Y4110641蛋白质等电聚焦间隙式分级柱研究曹枫湖州师范学院Y4110665纳米颗粒致肝脏损伤及其分子机制的研究谢广平湖州师范学院Y5110067转基因（MT）芦竹修复湿地镉污染的研究韩志萍湖州师范学院Y5110136噬藻体的分离鉴定及其抑藻作用规律研究徐秀芳湖州师范学院Y5110186太湖流域经济发展与环境变迁关系研究（755-1912）—以人类“应对”自然环境为中心钱克金湖州师范学院Y5110353应用基因表达芯片研究蓝藻毒素抑制植物生长发育的分子机理陈建中湖州师范学院Y6110043Hermitian型约束矩阵方程问题的理论与算法研究蔡静湖州师范学院Y6110094Choquet型积分的性质及其在非线性系统中的应用欧阳耀湖州师范学院Y6110494大规模网络谣言的危机管理研究刘荣湖州师范学院Y6110502非线性问题的奇摄动理论、方法与应用欧阳成湖州师范学院Y6110775Teugel鞅驱动的正倒向随机微分方程及其应用唐矛宁湖州师范学院Y6110789有跳跃的倒向随机发展方程及其在随机控制中的应用孟庆欣湖州师范学院Y6110841浙江产业集群专利协同的机理和路径研究王宪云湖州师范学院Y2111250氨基羟丙醚甲壳素的合成及其作为基因递送载体的研究钟婧湖州市中心医院Y1110313半主动振动控制系统的减振抗冲机理及其一体化研究胡红生嘉兴学院Y1110808基于QCA的低功耗多值纳米数字集成电路设计研究肖林荣嘉兴学院Y2110124抗耐药肿瘤多功能树状聚合物纳米载体的研究傅应华嘉兴学院Y2110158老年对小鼠骨髓源细胞CXCR4表达及其对SDF-1反应的影响曾宪智嘉兴学院Y2110873小鼠卵泡发育过程中FGF-10与BMP信号交流调控细胞增殖及激素合成徐营嘉兴学院Y2110934喹诺酮类药物对糖尿病兔的致心律失常作用及预防研究江力勤嘉兴学院Y2111003脊髓胶质细胞IL-18信号通路参与痛觉中枢敏化的机制研究褚玉霞嘉兴学院Y4110545基于电纺丝技术构建受生物启发的制氢催化电极的研究刘海清嘉兴学院Y4110555基于双噻吩吡咯的窄带隙聚合物合成、能级结构调控及光伏性能研究邓丹嘉兴学院Y4110606聚乳酸纳米纤维膜表面的类肝素化及其LDL识别作用研究兰平嘉兴学院Y5110231环杭州湾区域土壤有机质与硝基多环芳烃微观作用机制研究张跃进嘉兴学院Y6110382基于企业家异质性的浙江民营企业商业信用融资行为研究王喜嘉兴学院Y6110436几类非自治时滞微分方程反周期解与概周期解的相关问题研究王立娟嘉兴学院。

基于GEO_和TCGA_数据库对肺腺癌差异表达基因的生物信息学分析

第 49 卷第 6 期2023年 11 月吉林大学学报（医学版）Journal of Jilin University（Medicine Edition）Vol.49 No.6Nov.2023DOI：10.13481/j.1671‑587X.20230612基于GEO和TCGA数据库对肺腺癌差异表达基因的生物信息学分析叶汇, 孙哲, 周丽婷, 齐雯, 叶琳（吉林大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生教研室，吉林长春130021）［摘要］目的目的：采用生物信息学方法筛选影响肺腺癌（LUAD）的关键基因，分析其生物学功能及其对LUAD预后的影响。

方法方法：于高通量基因表达（GEO）数据库下载GSE118370和GSE136043芯片数据，癌症基因组图谱（TCGA）数据库筛选LUAD相关数据。

采用R软件分析共同表达的差异表达基因（DEGs）。

采用clusterProfile R包对DEGs进行基因本体（GO）功能富集分析，DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络。

采用Cytoscape筛选连接度排名前10位的关键基因，GEPIA数据库和人类蛋白质图谱（HPA）数据库分析正常肺组织和LUAD组织中关键基因mRNA和蛋白表达情况及不同分期LUAD组织中关键基因表达情况。

关键基因免疫浸润分析和生存分析获取关键基因表达与患者生存期的相关关系。

结果：共筛选DEGs 428个。

GO分析，LUAD的DEGs在主要富集于上皮-间质转化（EMT）等生物过程（BP）方面、细胞基部等细胞组分（CC）方面和细胞外基质（ECM）结构形成等分子功能（MF）方面。

KEGG分析，LUAD的DEGs主要富集于细胞因子受体相互作用通路等方面。

筛选DNA拓扑异构酶Ⅱα（TOP2A）、果蝇纺锤体异常基因（ASPM）、细胞周期蛋白B1（CCNB1）、人类细胞分裂周期相关基因8（CDCA8）、含杆状病毒IAP重复序列蛋白5（BIRC5）、苏氨酸激酶（AURKA）、驱动蛋白超家族成员20A（KIF20A）、中心体相关蛋白55（CEP55）、着丝粒蛋白F（CENPF）和微管组织因子（TPX2）为关键基因。

生物信息学分析胰腺癌组织关键基因表达及其意义

基金项目：国家自然科学基金资助项目（８１９６０５１６）作者单位：７３００００　兰州大学第一临床医学院、兰州大学第一医院通讯作者：朱克祥，电子信箱：ｆｌｅｘｚｈｕ６９１０＠ｓｉｎａ．ｃｏｍ生物信息学分析胰腺癌组织关键基因表达及其意义王乾合　赵立然　朱克祥摘　要　目的　利用生物信息学方法对ＧＥＯ数据库进行探索，获取胰腺癌发生、发展的核心基因，分析胰腺癌发生、发展的潜在机制。

方法　使用ＧＥＯｑｕｅｒｙ包从ＧＥＯ数据库获取胰腺癌相关芯片数据（ＧＳＥ６２４５２），利用Ｌｉｍｍａ包进行差异分析，结合ｃｌｕｓｔｒｅＰｒｏｆｉｌｅｒ包对上调基因和下调基因分别进行ＧＯ功能和ＫＥＧＧ通路分析，利用Ｓｔｒｉｎｇ在线网站对差异基因进行蛋白互作网络分析，利用Ｃｙｓｔｏｓｃｏｐｅｓ软件筛选出核心基因，最后借助ＴＣＧＡ数据库和芯片数据（ＧＳＥ２８７３５）对核心基因进行再次验证。

结果利用生物信息学方法共获得２８６个差异基因，其中包含上调基因１８９个，下调基因９７个。

富集分析结果显示上调基因涉及细胞组织黏附、细胞外基质组织构成等功能以及蛋白消化与吸收、ＰＩ３Ｋ－Ａｋｔ等信号通路相关。

下调基因与脂类消化、细胞壁破裂等功能和胰腺分泌等信号通路密切相关。

通过蛋白互作网络筛选出２０个关键基因，利用ＧＥＰＩＡ数据库对关键基因进行生存分析验证，发现３个基因（ＭＭＰ１１、ＬＡＭＢ３、ＰＬＡＵ）与胰腺癌预后明显相关。

结论　通过生物信息学方法最终筛选出３个核心基因，为胰腺癌的诊断和预后提供了新的思路。

关键词　胰腺癌　靶向治疗　ＧＥＯ中图分类号　Ｒ７３文献标识码　ＡＤＯＩ　１０．１１９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７３５４８Ｘ．２０２１．０５．００９ＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎｄＳｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅｏｆＫｅｙＧｅｎｅｓｉｎＰａｎｃｒｅａｔｉｃＣａｎｃｅｒＴｉｓｓｕｅｓ：ＡＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓ．　ＷａｎｇＱｉａｎｈｅ，ＺｈａｏＬｉｒａｎ，ＺｈｕＫｅｘｉａｎｇ．ＴｈｅＦｉｒｓｔＣｌｉｎｉｃａｌＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｇｅ，ＬａｎｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＴｈｅＦｉｒｓｔＨｏｓｐｉｔａｌｏｆＬａｎｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇａｎｓｕ７３００００，ＣｈｉｎａＡｂｓｔｒａｃｔ　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　Ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｏｍｎｉｂｕｓ（ＧＥＯ）ｄａｔａｂａｓｅｓｗａｓａｎａｌｙｚｅｄｂｙｕｓｉｎｇｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｔｏｓｃｒｅｅｎｔｈｅｋｅｙｇｅｎｅｓ，ａｎｄｔｏａｎａｌｙｚｅｔｈｅｐｏｔｅｎｔｉａｌｍｅｃｈａｎｉｓｍｓｏｆｐａｎｃｒｅａｔｉｃｃａｎｃｅｒ．Ｍｅｔｈｏｄｓ　ＭｉｃｒｏａｒｒａｙｄａｔａｏｆＧＳＥ６２４５２ｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄｆｒｏｍＧＥＯｄａｔａｂａｓｅｓｕｓｉｎｇＧＥＯｑｕｅｒｙｐａｃｋａｇｅａｎｄｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓｗｅｒｅｓｃｒｅｅｎｅｄｕｓｉｎｇＬｉｍｍａｐａｃｋａｇｅ．ＷｉｔｈｔｈｅｃｌｕｓｔｒｅＰｒｏｆｉｌｅｒｐａｃｋａｇｅ，ＧＯｆｕｎｃｔｉｏｎａｎｄＫＥＧＧｐａｔｈｗａｙａｎａｌｙｓｉｓｗｅｒｅｃａｒｒｉｅｄｏｕｔｆｏｒｕｐ－ｒｅｇｕｌａｔｅｄｇｅｎｅｓａｎｄｄｏｗｎ－ｒｅｇｕｌａｔｅｄｇｅｎｅｓｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．ＰｒｏｔｅｉｎｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｎｅｔｗｏｒｋａｎａｌｙｓｉｓｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓｗａｓａｎａｌｙｚｅｄｕｓｉｎｇＳｔｒｉｎｇｏｎｌｉｎｅｗｅｂｓｉｔｅｓ，ａｎｄＣｙｓｔｏｓｃｏｐｅｓｓｏｆｔｗａｒｅｗａｓｕｓｅｄｔｏｓｃｒｅｅｎｃｏｒｅｇｅｎｅｓ．Ｆｉｎａｌｌｙ，ｔｈｅｃｏｒｅｇｅｎｅｓｗｅｒｅｖｅｒｉｆｉｅｄｗｉｔｈＴＣＧＡｄａｔａｂａｓｅａｎｄｃｈｉｐｄａｔａ（ＧＳＥ２８７３５）．Ｒｅｓｕｌｔｓ　Ａｔｏｔａｌｏｆ２８６ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓｗｅｒｅｅｘｔｒａｃｔｅｄｂｙｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ１８９ｕｐ－ｒｅｇｕｌａｔｅｄｇｅｎｅｓａｎｄ９７ｄｏｗｎ－ｒｅｇｕｌａｔｅｄｇｅｎｅｓ．Ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔａｎａｌｙｓｉｓｒｅｖｅａｌｅｄｔｈａｔｕｐｒｅｇｕｌａｔｅｄｇｅｎｅｓｗｅｒｅｃｌｏｓｅｌｙａｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈｔｈｅｆｕｎｃｔｉｏｎａｎｄｐａｔｈｗａｙｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔｓｕｃｈａｓｃｅｌｌｕｌａｒｔｉｓｓｕｅａｄｈｅｓｉｏｎ，ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒｍａｔｒｉｘｔｉｓｓｕｅｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ，ｐｒｏｔｅｉｎｄｉｇｅｓｔｉｏｎａｎｄａｂｓｏｒｐｔｉｏｎ，ａｎｄＰＩ３Ｋ－Ａｋｔｓｉｇｎａｌｉｎｇｐａｔｈｗａｙｓ．Ｄｏｗｎ－ｒｅｇｕｌａｔｅｄｇｅｎｅｓａｒｅｃｌｏｓｅｌｙｒｅｌａｔｅｄｔｏｌｉｐｉｄｄｉｇｅｓｔｉｏｎ，ｃｅｌｌｗａｌｌｒｕｐｔｕｒｅａｎｄｐａｎｃｒｅａｔｉｃｓｅｃｒｅｔｉｏｎｓｉｇｎａｌｉｎｇｐａｔｈｗａｙｓ．Ｔｗｅｎｔｙｃｏｒｅｇｅｎｅｓｗｅｒｅｓｃｒｅｅｎｅｄｕｓｉｎｇｔｈｅｐｒｏｔｅｉｎｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｎｅｔｗｏｒｋ，ａｎｄｓｕｒｖｉｖａｌａｎａｌｙｓｉｓｏｆｋｅｙｇｅｎｅｓｗｅｒｅｐｅｒｆｏｒｍｅｄｕｓｉｎｇｔｈｅＧＥＰＩＡｄａｔａｂａｓｅ．Ｗｅｆｏｕｎｄｔｈａｔｔｈｒｅｅｇｅｎｅｓ（ＭＭＰ１１，ＬＡＭＢ３，ＰＬＡＵ）ｗｅｒｅｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙｃｏｒｒｅｌａｔｅｄｗｉｔｈｔｈｅｐｒｏｇｎｏｓｉｓｏｆｐａｎｃｒｅａｔｉｃｃａｎｃｅｒ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ　Ｔｈｒｅｅｃｏｒｅｇｅｎｅｓｗｅｒｅｓｅｌｅｃｔｅｄｂｙｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｍｅｔｈｏｄ，ｗｈｉｃｈｐｒｏｖｉｄｅｄａｎｅｗｉｄｅａｆｏｒｔｈｅｄｉａｇｎｏｓｉｓａｎｄｐｒｏｇｎｏｓｉｓｏｆｐａｎｃｒｅａｔｉｃｃａｎｃｅｒ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ　Ｐａｎｃｒｅａｔｉｃｃａｎｃｅｒ；Ｔａｒｇｅｔｅｄｔｈｅｒａｐｙ；ＧＥＯ胰腺癌（ｐａｎｃｒｅａｔｉｃｃａｒｃｉｎｏｍａ）是一种恶性程度极高的消化道肿瘤，在恶性肿瘤中是导致癌症相关死亡的第３大原因。

基因环境交互作用分析方法在流行病学研究中的应用

垦堕垦堂童生皇堕塑查垫!!竺!旦第42卷第1期Int J Med Parasit Dis，January 2015，V01．42，No．1 ·49··综述·基因一环境交互作用分析方法在流行病学研究中的应用何健杨坤+【摘要】基因一环境交互作用(gene．environment interac ti on)分析方法适合探讨流行病学中遗传和环境多种因素对于疾病发生或传播的作用，并逐渐成为流行病学研究的重要研究手段。

该文从基因．环境交互作用方法的研究设计和统计学方法两方面，综述此方法的最新国内外研究进展．期望拓展在寄生虫病等研究领域的应用。

【关键词1基因．环境交互作用；流行病学；统计学分析Applic ation of ge ne·en vi ro nm en t in t er a c ti o n an a l ys i s in epide miol ogica l st udie s He Ji an，Ya ngKun*．Jiangsu Institute of Parasitic Di s e a s e s，K e y L a b o r a t o r y of Parasitic D i se a s e Control a nd Prevention，Min蠡try of Heal th，J ia rt gsu Provincial Key Laboratory ofParasite Molecular Biolog y,Wu xi 214064,C h i na+Corresponding author：Yang Kun,Em ail：ji pdy k@163．comSu pp on ed b y N a t i o n a l N a t u r a l S c i en c e F o u n d a t i o n of China(81101275)【Abstract】Gen e．en vironm ent interaction anal ysi s，as me tho d of m uh i．fa ct or s tu dv，c an explore the roleof genetic and envi ronment al factors in the prevalenc e an d transmission of di s e a se s，a n d it has be c o meveryi m p or t a n t m eans of ep i d e m i o l o g i c al s t u d y．R e s e a r c h d e s i g n a n d statistical met hods of g e n e—e n v i ro n m e nt inter-action metho d were revie we d in this paper,aiming at pro vi di n g re f er en c e in the flied of parasitic d i s e a se ss tu d y．【Key words】Gene-environment inte ra ct io n；E pi dem io lo gy；St at is tic al a na ly si s随着人们对于疾病发生认识的改观，发现诸互作用分析方法的进展，以期为流行病学病因研如癌症[I之]、慢性病[3-4]、精神疾病[5-6]、媒介传播究提供参考。

DNA高甲基化介导FOXO1转录表达下调促进鼻咽癌细胞增殖和侵袭能力

DNA高甲基化介导FOXO1转录表达下调促进鼻咽癌细胞增殖和侵袭能力于鹏;金金欣;冀火金;黄兰川;刘进;蔡永林【期刊名称】《广西医科大学学报》【年(卷),期】2024(41)3【摘要】目的:探索叉头盒O1(FOXO1)在鼻咽癌(NPC)中异常表达的分子机制,及其对NPC细胞恶性生物学行为的影响。

方法:采用GEO数据集分析NPC中FOXO1表达水平,采用R4.2.1软件进行基因集富集分析。

构建FOXO1过表达的NPC细胞系5-8F、HONE1(FOXO1-5-8F、Ctrl-5-8F、FOXO1-HONE1、Ctrl-HONE1)。

分别通过CCK-8法、划痕实验、Transwell侵袭实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力,流式细胞术分析细胞周期。

通过重亚硫酸氢盐基因测序技术进行DNA甲基化测序。

结果:FOXO1 mRNA在NPC细胞和组织中表达下调。

FOXO1过表达组的细胞增殖能力和细胞迁移能力明显低于对照组(P<0.05),相同时间内,空白对照组的细胞侵袭数量高于FOXO1过表达组(P<0.05),FOXO1过表达抑制细胞周期(P<0.05)。

在NPC组织中,FOXO1 DNA启动子区域存在甲基化位点,其甲基化水平明显高于非癌组织(P<0.05)。

结论:NPC中FOXO1基因DNA高甲基化导致其转录下调,由此促进肿瘤细胞的增殖和侵袭。

FOXO1可能是NPC的肿瘤抑制基因。

【总页数】9页(P364-372)【作者】于鹏;金金欣;冀火金;黄兰川;刘进;蔡永林【作者单位】桂林医学院临床医学院;梧州市红十字会医院医学检验科;右江民族医学院公共卫生与管理学院;广西卫生健康委员会鼻咽癌分子流行病学重点实验室〔梧州市红十字会医院〕【正文语种】中文【中图分类】R739.6【相关文献】1.SATB1高表达通过促进上皮-间充质转化而介导鼻咽癌细胞侵袭和转移2.miR-27a下调肾癌细胞FOXO1表达并促进其细胞增殖3.慢病毒介导shRNA靶向下调Cx26表达对人高侵袭性肝癌细胞上皮间质转化及侵袭的影响4.下调HOX转录反义RNA对三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖、周期及侵袭能力的影响5.miR-493-5p下调METTL3表达影响鼻咽癌细胞增殖、迁移和侵袭的研究因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基于TCGA数据库胃癌LincRNA生物标志物筛选及生物学功能分析

基于TCGA数据库胃癌LincRNA生物标志物筛选及生物学功能分析摘要：目的：预测与胃癌相关的LincRNA，及与其相关的信号通路，并筛选出特定的LincRNA作为胃癌预后潜在的生物标志物。

方法：第一步，从TCGA（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库中下载375例胃腺癌组织和32例癌旁组织的RNA-seq数据（HTseq-RNA Counts）及胃癌患者相关临床信息，并分别提取相关的LincRNA和mRNA。

第二步，使用R语言/Bioconductor的edgeR包分别筛选出差异表达的LincRNA、mRNA。

第三步，使用加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法对数据进行加权，得到与胃癌临床特征相关性最大的模块及相对应的临床特征。

第四步，通过CytoHubba 软件寻找关键基因，得到与胃癌发生相关性最大的关键LincRNA。

第五步，对所得到的关键基因LincRNA进行靶基因预测及生物学功能分析，研究与胃癌发生、转移有关的LincRNA与mRNA的相关性，并使用Cytoscape构建LincRNA与mRNA的共表达网络。

第六步，将得到的胃癌关键LincRNA使用Kaplan-Meier软件进行生存分析，以研究LincRNA与胃癌患者的总体存活之间的关联。

结果：1.此研究筛选出2200个差异表达的LincRNA以及4623个差异表达的mRNA；2.得到与肿瘤分级相关性最大的MEbrown模块、MEturquoise模块（模块中为基因群）；3.筛选出LincRNA相关性最大模块中的5个关键基因（Hub基因），分别是BARX1-AS1、CARMN、FENDRR、GAS1RR、LINC01354；4.得到胃癌发病可能相关的MAPK Signaling Pathway、CELL CYCLE Signaling Pathway、P53 Signaling Pathway、P13K-AKT Signaling Pathway、WNT Signaling Pathway、TGF-BETA Signaling Pathway、ADHERENS JUNCTION Signaling Pathway七条主要的KEGG生物信号通路；5.构建LincRNA 与mRNA共表达网络；6.BARX1-AS1、CARMN、FENDRR、GAS1RR、LINC01354高表达组生存率均较低表达组低。

HOTAIR-siRNA通过miR-21对肝癌侵袭、转移的影响

HOTAIR-siRNA通过miR-21对肝癌侵袭、转移的影响王永玲;高建芝;闫姝洁;王琼;韦立新【摘要】目的探讨长链非编码HOTAIR靶控miR-21对肝癌细胞侵袭的影响及相关机制.方法采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术检测30例肝癌组织中miR-21的表达,及其与临床病理特征的相关性;HOTAIR的siRNA转染人肝癌HepG2细胞,采用Transwell小室法检测HepG2细胞的侵袭活性;应用qRT-PCR法检测HepG2细胞中miR-21的表达;采用Western blot法检测MMP-2蛋白的表达,并分析其与miR-21的相关性.结果 qRT-PCR检测发现miR-21在肝癌组织中的表达水平均明显高于癌旁组织(P ＜0.05);miR-21表达与肿瘤恶性程度、分化程度及侵袭转移均呈正相关;与患者AFP、肿瘤大小及肿瘤数目无关.沉默HOTAIR基因后,HepG2细胞侵袭能力下降,miR-21基因和MMP-2蛋白的表达均下调且两者呈正相关.结论 miR-21在肝癌组织中呈高表达,并与肝癌恶性程度、肿瘤分化、门静脉癌栓及侵袭转移有关;HO-TAIR可能通过靶控miR-21的表达抑制肝癌细胞的侵袭与转移.%Purpose To study the role of lnc-HOTAIR and its target-controlled miR-21 on invasion and metastasis of hepatocellular carcinoma cells (HCC) and its related mechanisms.Methods The expression of miR-21 in 30 cases of HCC was detected by quantitative real-time PCR (qRT-PCR),and correlation with clinical pathology was also analyzed.siRNA of lncHOTAIR was transfected to HCC HepG2 cell (HepG2),invasive activities of HepG2 was detected by Transwell,the expression of miR-21 was determined by qRT-PCR,the expression of protein MMP-2 was determined by Western blotting,and the correlation with miR-21 expression was analyzed.Results Compared with pericarcinoustissue,the expressions of miR-21 in tumor tissue increased apparently (P ＜0.05).The expressions of miR-21 correlated positively with malignancy degree,differentiation degree and invasion and metastasis respectively,and correlated negatively with tumour size,tumour number and level of AFP respectively.After silencing the HOTAIR gene,the invasive activities of HepG2 were suppressed,the expression of miR-21 gene and MMP-2 protein were down regulated,and both of them were positively correlated.Conclusion High expressions of miR-21 in liver cancer correlate positively with malignancy degree,differentiation degree,intrahepatic and extrahepatic metastases and portal vein tumor thrombus respectively.HOTAIR may inhibit the invasion and metastasis of HCC by controlling the expression level of miR-21.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2017(033)007【总页数】4页(P720-723)【关键词】肝肿瘤;长链非编码RNA;miR-21;侵袭和转移;MMP-2【作者】王永玲;高建芝;闫姝洁;王琼;韦立新【作者单位】新乡医学院基础医学院,新乡453003;中国人民解放军总医院合作医院涿州市医院肿瘤科,涿州 072750;中国人民解放军总医院病理科,北京100080;中国人民解放军总医院合作医院涿州市医院肿瘤科,涿州 072750;中国人民解放军总医院病理科,北京100080;中国人民解放军总医院病理科,北京100080【正文语种】中文【中图分类】R735.7原发性肝癌是病死率极高的恶性肿瘤之一，除早期手术切除外，采用放、化疗均不能取得较好疗效。

前列腺癌血清中lncRNA HOTAIR的表达及临床意义研究

前列腺癌血清中lncRNA HOTAIR的表达及临床意义研究刘锐;张鹏;程龙;徐振宇;彭辉【摘要】目的:探讨前列腺癌血清中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)HOTAIR的表达和临床意义.方法:收集经病理组织学确诊的前列腺癌患者血清样本62例,正常体检对照血清样本62例,采用TRIzol LS分离血清样本中的RNA;采用qRT-PCR法检测所有血清样本中HOTAIR的表达水平,统计分析血清中HOTAIR水平与前列腺癌临床病理组织参数之间的关系.结果:前列腺癌血清中HOTAIR表达水平高于正常对照组,两组结果之间差异具有统计学意义(P<0.01),TNMⅢ/Ⅳ期的前列腺癌血清中HOTAIR的表达水平高于正常对照组(P<0.05),且Ⅲ/Ⅳ期前列腺癌血清中HOTAIR的表达水平高于Ⅰ/Ⅱ期的表达水平(P<0.05);在有淋巴结转移的前列腺癌患者血清中,HOTAIR的表达水平均高于无淋巴结转移患者(P=0.006);血清中HOTAIR的表达值诊断前列腺癌的灵敏度为69.4％,特异度为71.0％,曲线下面积0.709;且血清中HOTAIR的表达与PSA值呈正相关(P<0.001,r=0.48).结论:前列腺癌患者血清中HOTAIR的表达水平升高,提示HOTAIR可能参与了前列腺癌的发生发展进程.【期刊名称】《皖南医学院学报》【年(卷),期】2019(038)003【总页数】4页(P243-246)【关键词】前列腺癌;血清;长链非编码RNA;HOTAIR【作者】刘锐;张鹏;程龙;徐振宇;彭辉【作者单位】皖南医学院第一附属医院弋矶山医院检验科,安徽芜湖241001;皖南医学院第一附属医院弋矶山医院检验科,安徽芜湖241001;皖南医学院第一附属医院弋矶山医院检验科,安徽芜湖241001;皖南医学院第一附属医院弋矶山医院药学部,安徽芜湖241001;皖南医学院第一附属医院弋矶山医院出入院管理科/重大疾病非编码RNA实验中心,安徽芜湖241001【正文语种】中文【中图分类】R446.11;R737.25前列腺癌是一种常见的男性泌尿系统恶性肿瘤，占所有男性肿瘤总发病率的第二位和病死率的第六位[1]。

天冬酰胺合成酶通过促进β-catenin核转位驱动胆管癌转移

天冬酰胺合成酶通过促进β-catenin 核转位驱动胆管癌转移*褚珍珍1，2，周栩萱1，2，刘力豪1，张鲍欢3△，姚楠1，2△（1暨南大学基础医学院病理生理学系，广东广州 510632；2国家中医药管理局病理生理科研实验室，广东广州510632；3暨南大学基础医学院形态学实验教学中心，广东广州 510632）［摘要］目的：检测天冬酰胺合成酶（ASNS ）在胆管癌（CCA ）中的表达情况，探讨ASNS 在CCA 转移中的作用及其机制。

方法：通过公共数据库分析各肿瘤组织中ASNS 的mRNA 表达；收集CCA 患者病理组织（n =27），构建硫代乙酰胺诱导的大鼠自发CCA 模型和左中位胆管结扎联合二乙基亚硝胺诱导的小鼠自发CCA 模型，通过免疫组化、Western blot 和免疫荧光法检测ASNS 蛋白表达。

采用CCK8、划痕和Transwell 实验检测ASNS 对人CCA 细胞HuCCT1和HCCC -9810增殖、迁移和侵袭的影响。

构建ASNS 稳定敲减的CCA 细胞株HuCCT1shNC 、HuCCT1shASNS 、HCCC -9810shNC 和HCCC -9810shASNS ，通过肝原位种植和尾静脉注射研究ASNS 对CCA 细胞肝内生长和肺转移的影响。

利用公共数据库富集与ASNS 相关的信号通路，并用免疫荧光和Western blot 验证相关分子机制。

结果：无论在人或动物CCA 组织中，ASNS 表达水平均高于癌旁组织（P <0.01）。

ASNS 以酶活性非依赖性方式促进CCA 细胞HuCCT1和HCCC -9810的增殖、迁移与侵袭。

生物信息学分析显示，β-catenin 在ASNS 高表达的CCA 组织中富集，ASNS 通过促进β-catenin 核转位，启动CCA 细胞上皮-间充质转化（EMT ）。

β-catenin 抑制剂XAV -939可显著抑制CCA 细胞的侵袭与迁移。

长链非编码RNA的调控机制及其在原发性肝癌中的研究进展

长链非编码RNA的调控机制及其在原发性肝癌中的研究进展常磊;刘志苏【摘要】Long non-coding RNA (lncRNA)has been a focal point of biomedical researches in recent years.Long noncoding RNAs (lncRNAs)are a class of transcripts of over 200 nucleotides with limited protein coding potential.Recent researches have shown that lncRNA played a key role in gene regulation.Some abnormally expressed lncRNAs could regulate gene expression at the levels of pre-transcription,transcription,post-transcription and epigenetics.This review summarized the biological characteristics,regulatory mechanisms and advances of hepatocellular carcinoma.%长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是近年来生命科学领域研究的热点,它是指一类转录本长度超过200 nt 的非蛋白编码序列。

近年来的研究表明,lncRNA 具有基因调控的功能。

某些 lncRNA 在肿瘤中的表达也是失调的,可以在转录前、转录、转录后及表观遗传学等多个层面发挥作用,本文就lncRNA 生物学特点和调控机制及其在原发性肝癌中的研究进展作一综述。

【期刊名称】《腹部外科》【年(卷),期】2015(000)001【总页数】5页(P60-64)【关键词】长链非编码RNA;调控;原发性肝癌【作者】常磊;刘志苏【作者单位】430071 武汉，武汉大学中南医院肝胆胰外科;430071 武汉，武汉大学中南医院肝胆胰外科【正文语种】中文【中图分类】R657.3经典的中心法则“DNA-RNA-蛋白质”揭示基因的信息储存于编码蛋白质的基因组中。

2021卵巢上皮性癌耐药相关ceRNA的生物信息学分析及临床验证(全文)

2021卵巢上皮性癌耐药相关ceRNA的生物信息学分析及临床验证（全文）卵巢癌是妇科生殖系统常见的恶性肿瘤，临床上卵巢癌的治疗首选手术治疗联合术后化疗，但是尽管手术及化疗技术不断进步，卵巢癌的死亡率仍然很高。

主要是由于诊断时偏晚期及卵巢癌耐药所致。

因此，早期发现卵巢癌耐药相关的标志物及有效的治疗靶点显得尤其重要。

近年来，学者们对lncRNA的研究越来越多。

一、HOTAIR基因在肿瘤中的生物学功能及临床意义HOTAIR基因是lncRNA的一员，长度为2158nt，在恶性肿瘤如乳腺癌、肝癌、卵巢癌等组织中表达上调。

HOTAIR位于染色体12q13.13，是同源框C 聚类中的一个调控边界。

已有研究表明，HOTAIR是预测恶性肿瘤转移的标志物，与上皮间质转化（epithelial－mesenchymal transition，EMT）有关［5］。

1项荟萃分析显示，HOTAIR 高表达是恶性肿瘤转移的独立预后因素，与肿瘤大、总生存率低、手术病理分期晚有关［6］。

也有研究报道，HOTAIR表达与临床耐药、转移和复发有关［7］。

尽管HOTAIR的临床意义已被发现，但潜在的分子机制和调控网络仍然大部分未知。

HOTAIR 与多梳抑制复合体2（PRC2）相互作用，并调节染色体中的果蝇zeste 基因增强子的人类同源物2（EZH2）的表达，参与DNA 甲基化从而抑制其他基因转录，EZH2 也可甲基化组蛋白H3 第27位赖氨酸。

EZH2的甲基化活性促进异染色质的形成从而使基因沉默，是PRC2的组分之一并导致Hox基因的组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化的染色质沉默，从而促进恶性肿瘤细胞的发展和转移［8］。

但为何HOTAIR 与侵袭、转移、EMT和耐药有关仍然知之甚少。

近年来，关于HOTAIR 的耐药机制在其他恶性肿瘤中已有报道。

有研究表明，HOTAIR通过下调野生型p53蛋白激活因子（WAF1）和细胞周期蛋白依赖性激酶相互作用蛋白1（CIP1；因上述基因的序列基本一致，故按其编码蛋白的相对分子质量统一命名为p21WAF1/CIP1）的表达，从而增强肺腺癌细胞对顺铂的耐药性。

不同部位脑梗死华勒变性的特点及对神经功能的影响

［8］涂梦恬，李良平.肝细胞核因子受体4α在非酒精性脂肪性肝病中的研究现状［J］.国际消化病杂志，2017，37（3）：144-147.Tu MT，Li LP.Research status of hepatocyte nuclear factor receptor4αin nonalcoholic fatty liver disease［J］.Int J Gastroenterol，2017，37（3）：144-147.doi：10.3969/j.issn.1673-534X.2017.03.003.［9］Thayer TE，Lino Cardenas CL，Martyn T，et al.The role of bone morphogenetic protein signaling in non-alcoholic fatty liver disease ［J］.Sci Rep，2020，10（1）：9831.doi：10.1038/s41598-020-66770-8.［10］Cariou B，Byrne CD，Loomba R，et al.NAFLD as a metabolic disease in humans：A literature review［J］.Diabetes Obes Metab，2021，23（5）：1069-1083.doi：10.1111/dom.14322.［11］Theofilatos D，Anestis A，Hashimoto K，et al.Transcriptional regulation of the human liver X receptorαgene by hepatocyte nuclear factor4α［J］.Biochem Biophys Res Commun，2016，469（3）：573-579.doi：10.1016/j.bbrc.2015.12.031.［12］Vespasiani-Gentilucci U，Dell'Unto C，De Vincentis A，et al. Combining genetic variants to improve risk prediction for NAFLD and its progression to cirrhosis：a proof of concept study［J］.Can J Gastroenterol Hepatol，2018，2018：7564835.doi：10.1155/2018/ 7564835.［13］Khalid YS，Dasu NR，Suga H，et al.Increased cardiovascular events and mortality in females with NAFLD：a meta-analysis［J］. Am J Cardiovasc Dis，2020，10（3）：258-271.［14］Trépo E，Valenti L.Update on NAFLD genetics：From new variants to the clinic［J］.J Hepatol，2020，72（6）：1196-1209.doi：10.1016/ j.jhep.2020.02.020.［15］Matsuo S，Ogawa M，Muckenthaler MU，et al.Hepatocyte nuclear factor4alpha controls iron metabolism and regulates transferrin receptor2in mouse liver［J］.J Biol Chem，2015，290（52）：30855-30865.doi：10.1074/jbc.M115.694414.［16］Chi X，Wei X，Gao W，et al.Dexmedetomidine ameliorates acute lung injury following orthotopic autologous liver transplantation in rats probably by inhibiting Toll-like receptor4-nuclear factor kappa B signaling［J］.J Transl Med，2015，13：190.doi：10.1186/ s12967-015-0554-5.［17］Wang L，Yao M，Zheng W，et al.Insulin-like growth factor I receptor：a novel target for hepatocellular carcinoma gene therapy ［J］.Mini Rev Med Chem，2019，19（4）：272-280.doi：10.2174/ 1389557518666181025151608.（2020-10-23收稿2021-01-17修回）（本文编辑李鹏）不同部位脑梗死华勒变性的特点及对神经功能的影响王冬梅，蔡桂淑，刘立生△摘要：目的探讨不同部位脑梗死华勒变性的特点及对神经功能的影响。

白介素1β及白介素6基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关联

白介素1β及白介素6基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关联杨静;陈璐;刘燕子;祝金冉;王胜根【期刊名称】《西南医科大学学报》【年(卷),期】2024(47)3【摘要】目的分析人白介素1β(interleukin 1β,IL-1β)、白介素6(interleukin6,IL-6)基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关联,并探讨其生理病理的调控作用。

方法选取新乡医学院第三附属医院2019年1月~2022年7月收治的115例食管癌患者为研究对象,根据放疗后是否出现感染分为感染组(n=28)和非感染组(n=87),检测IL-1β基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点-511C/T(rs16944)、-31C/T(rs1143627)和IL-6基因单核苷酸多态性位点IL-6-572C/G(rs1800796)、IL-6-174G/C(rs1800795)的多态性,采用Spearman相关检验分析IL-1β、IL-6基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关系,多因素Logistic回归分析影响食管癌放疗后肺部感染的相关因素。

结果两组患者性别、年龄、BMI、临床分期等基线资料比较,差异无统计学意义(P>0.05);放疗时间、肿瘤长度、肿瘤位置比较差异有统计学意义(P<0.05);IL-1β基因的rs16944、rs1143627位点,IL-6基因的rs1800796、rs1800795位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05);两组IL-1β基因rs16944位点基因型频率,CC、CT、TT基因型频率,C、T等位基因频率,差异均无统计学意义(P>0.05);rs1143627位点CC、CT、TT基因型频率,C、T等位基因频率差异均有统计学意义(P<0.05);IL-6基因rs1800796位点CC、CG、GG基因型频率,C、G等位基因频率差异均有统计学意义(P<0.05),rs1800795位点CC、CG、GG基因型频率,C、G等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);Spearman相关检验分析显示,IL-1βrs1143627(C/T)位点、IL-6 rs1800796(C/T)位点基因多态性与食管癌放疗后肺部感染具有显著相关性(P<0.05);多因素Logistic回归分析显示,放疗时间、肿瘤长度、肿瘤位置、IL-1βrs1143627位点、IL-6 rs1800796位点单核苷酸多态性是影响食管癌患者放疗后肺部感染的多因素(P<0.05)。

lncRNAHOTAIR及肿瘤标志物联合检测与肺癌病理分期的相关性

lncRNA HOTAIR 及肿瘤标志物联合检测与肺癌病理分期的相关性肺癌是目前世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。

非小细胞肺癌在肺癌中约占80%-85%近年来，其5年生存率约为11%。

非小细胞肺部癌之所以有如此高的死亡率，是因为早期缺乏特异性的诊断方法而难以发现，确诊时70%-80%的患者已出现远处转移，失去手术机会。

因此寻找一种有效的早期诊断、治疗及指导预后分子标记物，是非常必要的。

近年来的大量研发现，lncRNA HOTAIR与肿瘤标志物检测方法在肺癌疾病早期筛查中具有重要的作用，可有效判断肿瘤发展变化状况。

本文对lncRNA HOTAIR与血清肿瘤标志物联合检测，与肺癌病理分期的相关性作一综述。

【关键词】lncRNA HOTAIR；肿瘤标志物；肺癌；病理分期；相关性1 lncRNA HOTAIR生物学特性1.1.lncRNAlncRNA是一类长度超过200个碱基的RNA分子，并且是一类不参与编码形成蛋白质的分子，在旱期的观点中普遍认为lnc。

目前研究证实，lncRNA在多种人类肿瘤疾病中，部分特异性地lncRNA分子的表达水平在疾病发生中发生了显著变化。

最近发现的一种lncRNA HOTAIR介导的染色质改变和癌症转移之间的关系进一步说明了lncRNA 与人类疾病之间的关系[1]。

lncRNAS在癌症的发生发展过程中发挥重要作用，与癌症的生物学过程有关，比如癌症的形成、浸润和转移过程[2]。

IncRNAS表达失调在许多类型的癌症中被发现，如乳腺癌、前列腺癌、肺癌[3]、肝癌等。

1.1.HOTAIRHOTAIR是由John.L.Rinn在2007年发现的一种lncRNA。

HOTAIR只有一条单链，该lncRNA是一个从6449bp基因转录出的2364bpRNA,由6个外显子组成，位于色体12q13.13，是同源基因盒C（HOXC）的一个调节区域[3]。

Wang[4]等人的研究表明HOTAIR负调控mir-326来调控肺组织细胞的增殖和迁移。

基于网络药理学分析青蒿鳖甲汤治疗癌性发热的作用机制

基于网络药理学分析青蒿鳖甲汤治疗癌性发热的作用机制谭琴;黄礼明;肖雪;郑周波【期刊名称】《临床合理用药杂志》【年(卷),期】2024(17)11【摘要】目的采用中药网络药理学初步分析青蒿鳖甲汤在治疗癌性发热方面的作用与机制。

方法借助TCMSP及HERB数据库初步筛查出青蒿鳖甲汤相关优效活性成分,利用Swiss Target Prediction和PubChem平台预测优效活性成分的相关作用靶点并在GeneCards上筛选治疗癌性发热的相关作用靶标,后在韦恩图上进行映射。

通过STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件构建PPI网络以获取青蒿鳖甲汤在治疗癌性发热方面的关键靶点,最后借助DAVID数据库对青蒿鳖甲汤抗癌性发热作用的关键靶点进行GO和KEGG富集分析。

结果得到青蒿鳖甲汤药物成分与癌性发热疾病共132个共同靶点,KEGG通路125条。

结论本研究初步分析出青蒿鳖甲汤中含有槲皮苷、山奈酚、木犀草素、淫羊藿素等多种成分,这些成分可能作用于VEGFA、CASP3、AKT1、MMP9、TNF、HIF1A、EGF、TP53、PTGS2、IL6等治疗靶点上,并通过调控TNF、IL-17、PI3K-Akt等信号通路发挥治疗癌性发热的作用,为临床运用青蒿鳖甲汤提供了理论参考和依据。

【总页数】6页(P6-10)【作者】谭琴;黄礼明;肖雪;郑周波【作者单位】贵州中医药大学;贵州中医药大学第二附属医院【正文语种】中文【中图分类】R28【相关文献】1.基于网络药理学和分子对接技术探讨柴胡-黄芩药对治疗癌性发热的作用机制2.基于Meta分析桥接网络药理学耳聋胶囊治疗突聋的疗效评价及作用机制3.基于网络药理学探讨青蒿鳖甲汤及补中益气汤治疗癌性发热的“同病异治”分子作用机制4.基于网络药理学联合加权基因共表达网络分析探究雷公藤治疗系统性红斑狼疮的免疫作用机制5.基于网络药理学及分子对接分析扶正解毒汤治疗膀胱癌的作用机制因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。