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内部信号锚定序列(internal signal-anchor sequence, SA ):位于新生肽链内部的疏水序列,既是信号序列,又是肽 链跨膜锚定在脂双层中的序列。
内部停止转移锚定序列(internal stop-transfer anchor sequence, STA):位于新生肽链内部的疏水序列,既是肽 段终止转移,又是肽链跨膜锚定在脂双层中的序列。
多次跨膜蛋白:含有多个SA和多个STA的肽链将成为多次跨 膜蛋白。
跨内质网膜肽段的取向:一般而言,带正电荷氨基酸残基多
的一端,或带正电荷氨基酸残基多的一侧,朝向细胞质基质
一侧(外侧)。
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线粒体、叶绿体和过氧化物酶体的蛋白质的信 号序列特称为导肽(leader peptide),其基本 的特征是蛋白质在细胞质基质中的游离核糖体 上合成以后再转移到这些细胞器中,因此称这 种翻译后再转运的方式为翻译后转运(posttranslational translocation)。这种转运方式 在蛋白质跨膜过程中不仅需要消耗ATP使多肽 去折叠,而且还需要跨膜后由分子伴侣帮助蛋 白质再正确折叠形成有功能的蛋白。
核基因编码的蛋白质的分选大体可分2条途径:
(1)共翻译转运(cotranslational translocation)途径:即 蛋白质合成在游离核糖体上起始之后,由信号肽和与之结合 的SRP引导转移至糙面内质网,然后新生肽边合成边转入糙 面内质网腔或定位在ER膜上,经转运膜泡运到高尔基体加工 包装再分选至溶酶体、细胞质膜或分泌到细胞外。这种蛋白 在信号肽引导下边翻译边跨膜转运的过程称为共翻译转运。
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在非细胞系统中蛋白质的翻译过程与SRP、 DP和微粒体的关系(表8-1)
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分泌性蛋白的合成与跨越内质网膜的共翻 译转运图解(图8-3)
共翻译转运(cotranslational translocation):分泌 蛋白向rER腔内的转运是同蛋白质翻译过程偶联进行的,这 种蛋白在信号肽引导下边翻译边跨膜转运的过程称为共翻译 转运。
左:共翻译转运 . 右:翻译后转运
根据蛋白质分选的机制或转运方式不同,又可将蛋白质 转运分为4类: (1)跨膜转运(transmembrane transport):指共翻译转 运途径中蛋白质边合成边转运进入内质网腔或插入内质网膜 ;另指翻译后转运途径中蛋白质在合成后依不同机制转运到 线粒体、叶绿体和过氧化物酶体等细胞器。 (2)膜泡运输(vesicular transport):蛋白质被不同类型 的转运膜泡从糙面内质网合成部位转运至高尔基体进而再分 选转移至细胞的不同部位,其中涉及供体膜出芽形成不同的 转运膜泡、膜泡运输和转运膜泡与靶膜的融合等过程。 (3)选择性门控转运(gated transport):在游离核糖体上 合成的蛋白质通过核孔复合体在核-质间双向选择性地完成 核输入或核输出。 (4)细胞质基质中蛋白质的转运:蛋白质在细胞质基质中的 转运显然与细胞骨架系统密切相关,其它不明。
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膜蛋白的共翻译转运机理
膜蛋白的共翻译转运涉及几个问题:(1)靠疏水区滞留在内 质网膜上;(2)单次跨膜和多次跨膜;(3)跨膜段的定向 。
开始转移序列(start transfer sequence):位于新生肽链 N端的信号序列(信号肽)(最终不保留),既可被SRP识 别,又可引导新生肽链开始穿膜转移。
信号肽(signal peptide):信号肽位于蛋白质的N端,一 般由16~26个氨基酸残基组成,其中包括信号肽疏水核心区 、N端和C端等3部分;原核细胞某些分泌性蛋白的N端也具 有信号序列。值得注意的是,信号肽似乎没有严格的专一性 。
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信号肽的一级结构序列(图8-1)
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信号识别颗粒(signal recognition particle,SRP ):信 号识别颗粒是由6种不同蛋白质和一个7S小RNA分子构成的 RNP颗粒。SRP含有2种结构域,即信号肽识别结构域和核 糖体结合结构域,其中信号肽识别结构域中的p54蛋白是一 种包含成簇Met残基的GTP酶,Met侧链与信号肽的疏水核 心结合;当SRP与信号肽结合后,核糖体结合结构域中的 p9和p14蛋白复合体阻断新生肽链的翻译。 SRP通常存在 于细胞质基质中,等待信号肽从多核糖体上延伸暴露出来, SRP既可与新生信号肽序列和核糖体大亚基结合,又可与 内质网膜上SRP受体结合,指导新生多肽及核糖体和mRNA 附着到内质网膜上。
第八章 蛋白质分选与膜泡运输
第一节 细胞内蛋白质的分选 第二节 细胞内膜泡运输
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第一节 细胞内蛋白质的分选
真核细胞中绝大多数蛋白质都是由核基因编码,起始合 成均发生在游离核糖体上,然后或在细胞质基质中游离核糖 体上完成翻译过程,或在粗面内质网膜结合核糖体上完成合 成。之后蛋白质各就各位并组装成结构与功能的复合体,参 与实现细胞的各种生命活动。这一过程称蛋白质分选 (protein sorting)或蛋白质寻靶(protein targeting)。 蛋白质分选主要依靠蛋白质自身信号序列,从蛋白质起始合 成部位转运到其功能发挥部位的过程。
信号识别颗粒的受体(又称停泊蛋白,docking protein, DP):DP是内质网膜的整合蛋白,由α和β亚基组成,可特 异地与SRP结合。α亚基可结合GTP。
信号肽酶(signal peptidase ):内质网腔面上蛋白水解 酶,负责切除并快速降解新生多肽的N端信号肽序列。
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信源自文库识别颗粒(SRP)的结构示意图(图 8-2)
一、信号假说与蛋白质分选信号 二、蛋白质分选转运的基本途径与类型 三、蛋白质向线粒体、叶绿体和过氧化酶体的分选
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一、信号假说与蛋白质分选信号
细胞质的游离核糖体产生非分泌蛋白,内质网附着核糖体产 生分泌蛋白。
信号假说(signal hypothesis):分泌蛋白可能携带N端短 信号序列,一旦该序列从核糖体翻译合成,结合因子和蛋白 结合,指导其转移到内质网膜,后续翻译过程将在内质网膜 上进行。该过程需要蛋白质N端的信号肽、信号识别颗粒和 内质网膜上信号识别颗粒的受体(又称停泊蛋白)等因子共 同协助完成的。
继信号假说提出与确证后,人们又发现一系列
蛋白质分选信号序列,统称信号序列(signal
sequence),而且有些信号序列还可形成三维
结构的信号斑(signal patch),指导蛋白的靶
向转运和定位。
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指导蛋白质从细胞基质转运到细胞器的靶 向序列的主要特征(表8-2)
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二、蛋白质分选转运的基本途径与类型
(2)翻译后转运(post-translational translocation)途径: 即蛋白质在细胞质基质游离核糖体上合成以后,再转移到膜 围绕的细胞器,如细胞核、线粒体、叶绿体和过氧化物酶体 ,或者成为细胞质基质的可溶性驻留蛋白和骨架蛋白。
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真核细胞蛋白质分选的主要途径与类型( 图8-5)