11-1 数量遗传学的基础 - 第四节 遗传参数

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《数量遗传学基础》课件

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03
人类健康与疾病研 究
利用数量遗传学方法研究人类复 杂疾病的发生机制,为疾病预防 和治疗提供新的思路和方法。
THANKS
感谢观看
3
疾病抵抗力增强
通过研究动物的疾病抗性基因,提高动物的疾病 抵抗力,降低养殖成本和动物疾病发生率。
人类遗传学研究
疾病预测与预防
利用数量遗传学方法,研究人类遗传性疾病的发病风险相关基因 ,为疾病的预测和预防提供科学依据。
个体差异研究
通过研究人类的数量性状基因,了解个体差异的遗传基础,为个性 化医疗和健康管理提供支持。
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• 数量遗传学概述 • 数量遗传学的基本概念 • 数量性状的遗传模型 • 数量遗传学的研究方法 • 数量遗传学的应用 • 展望与未来发展
01
数量遗传学概述
定义与特点
定义
数量遗传学是研究生物群体中数量性状遗传规律的科学。
特点
数量性状是受多基因控制的,其遗传变异规律比质量性状复 杂。
04
数量遗传学的研究方法
统计分析方法
统计分析方法
QTL分析
关联分析
元分析
这是数量遗传学中最为常见和 基础的研究方法。通过统计分 析,可以对遗传数据进行分析 和解释,探究遗传变异的来源 、分布和作用机制。
数量性状位点(QTL)分析是 利用统计学方法定位控制数量 性状的基因位点,分析基因位 点对表型变异的贡献。
表型组学研究
结合新一代测序技术和成像技术,对动植物表型组进行深入研究, 以揭示表型变异与遗传变异之间的关系。
未来发展方向与挑战
01
跨物种比较研究
比较不同物种间的遗传差异,以 揭示物种进化的机制和规律,为 生物多样性保护提供科学依据。

数量遗传学基础

数量遗传学基础



2 D


2
2 AA

2
2 DD


2 AD


1
1 2
1 4 1 8 1 4
1 2
1 4 1 4

24
第四节 数量性状参数分析
25
定量描述数量性状遗传规律有三个最基本的遗传参数: 重复力、遗传力和遗传相关
重复力(repeatability)
是衡量一个数量性状在同一个体多次度量值之间的相关 程度的指标。 对性状的终身表现产生的影响有:
遗传力概念和估计原理
广义遗传力 指数量性状基因型方差占表型方 差的比例,它反映了一个性状受遗传效应影响 有多大,受环境效应影响多大。 实现遗传力 指对数量性状进行选择时,通过 亲代获得的选择效果,在子代能得到的选择反 应大小所占的比值,这一概念反映了遗传力的 实质。
4
数量性状的特征
数量性状在个体间的差异体现在量上或程度 上,一般很难描述,需要度量; 在一个群体中,数量性状变异呈连续性; 数量性状受多基因控制; 数量性状对环境影响敏感。
5
第二节 数量性状遗传的多基因假说
6
微效多基因假说(Nilsson-Ehle)
主要论点如下: 数量性状是由许多效应微小的基因控制; 这些微效基因的效应相等且相加,故又称累加基因, 在世代相传中服从孟德尔原理,即分离规律和自由组 合规律,以及连锁互换规律; 这些基因间一般没有显隐性区别; 数量性状同时受到基因型和环境的作用,而且数量性 状的表现对环境影响相当敏感。
CovG
(X,
Y)



2 A
(2.11)
因此,如果忽略基因的上位效应和显性效应,

数量遗传学知识点总结

数量遗传学知识点总结

第一章绪论一、基本概念遗传学:生物学中研究遗传和变异,即研究亲子间异同的分支学科。

数量遗传学:采用生物统计学和数学分析方法研究数量性状遗传规律的遗传学分支学科。

二、数量遗传学的研究对象数量遗传学的研究对象是数量性状的遗传变异。

1. 性状的分类性状:生物体的形态、结构和生理生化特征与特性的统称。

如毛色、角型、产奶量、日增重等。

根据性状的表型变异、遗传机制和受环境影响的程度可将性状分为数量性状、质量性状和阈性状3 类。

数量性状:遗传上受许多微效基因控制,性状变异连续,表型易受环境因素影响的性状,如生长速度、产肉量、产奶量等。

质量性状:遗传上受一对或少数几对基因控制,性状变异不连续,表型不易受环境因素影响的性状,如毛色、角的有无、血型、某些遗传疾病等。

阈性状:遗传上受许多微效基因控制,性状变异不连续,表型易受或不易受环境因素影响的性状。

有或无性状:也称为二分类性状 ( Binary traits)。

如抗病与不抗病、生存与死亡等。

分类性状:如产羔数、产仔数、乳头数、肉质评分等。

数量性状的特点:必须进行度量,要用数值表示,而不是简单地用文字区分;要用生物统计的方法进行分析和归纳;要以群体为研究对象;组成群体某一性状的表型值呈正态分布。

3. 决定数量性状的基因不一定都是为数众多的微效基因。

有许多数量性状受主基因(major gene)或大效基因(genes with large effect)控制。

果蝇的巨型突变体基因( gt);小鼠的突变型侏儒基因( dwarf, df);鸡的矮脚基因( dw);美利奴绵羊中的Booroola 基因( FecB);牛的双肌( double muscling)基因( MSTN);猪的氟烷敏感基因( RYR1)三、数量遗传学的研究内容数量性状的数学模型和遗传参数估计;选择的理论和方法;交配系统的遗传效应分析;育种规划理论。

四、数量遗传学与其他学科间的关系理论基础奠定:孟德尔遗传学+数学+生物统计学理论体系完善:与群体遗传学关系最为密切;学科应用:与育种学最为密切,是育种学的理论基础和方法论;学科发展:与分子生物学、生物进化学、系统科学和计算机科学密切结合,并产生了新的遗传学分支学科,如分子数量遗传学等。

第七章数量遗传学基础

第七章数量遗传学基础

性质二(间接原因)
1. Py.X3 = Py.x1 Px1.x3, Py.x4 = Py.x1 Px1.x4 2. dy.x1 = dy.x3 + dy.x4
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通径系数的性质(二)
P y.x3

x3

x3
x1
P.xy1P1.x3
y
x1
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通径系数的性质(三)
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通径系数的性质(三)
共同原因
ry1y2 = P2 P2(左) ry1y2 = rx2x3 P2 P3(中) ry1y2 = P2 P 2 + P3 P 3(右)
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通径系数的性质(四)
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例题
小梅山母猪产仔数记录
母猪

1
2
3
4


5
6
7
8
K
x
x2
9
10
11
6212 11
21
16
18
8
5
74 1206
2252 10
15
17
13
20
21
23
17
16
20
10 172 3098
4584 11
14
3
11
11
9
15
7
74 874
3720 6
6
2
12
72
2412 6
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第七章 数量遗传学基础
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数量遗传学-PPT课件

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永久性环境和暂时性环境的剖分 是针对重复测定性状而言的
均数、方差与协方差
数量性状表型方差的剖分
假定,遗传效应间、环境效应间及遗传及 环境效应间无互作,则:
VP = VA + VD + VI + VEg + VEs
群体平均基因型值和基因型值方差
显性水平 (Dominance level) 与显性度
设一对等位基因A1、A2的频率分别为p和q, 三种基因型A1A1、 A1A2 、A2A2的基因型值分别 为+a、d、和-a。其中d决定于基因的显性程度大 小,即显性水平。
不同显性水平下的d值
显性水平 负向超显性 负向完全显性 负向部分显性 无显性 正向部分显性 正向完全显性 正向超显性 显性基因
d
配子相(Gametic phase)或连锁相(Linkage phase)
两个基因座A和B,每个基因座两个等位基因, 分别为A1、A2和B1、B2:可形成4种配子: A1B1、A1B2、A2B1、A2B2 相引相(Coupling phase): A1B1/ A2B2 相斥相(Repulsion phase):A1B2/ A2B1
质量性状、数量性状与阈性状的比较
质量性状 数量性状 阈性状
性状主要 品种特征、 类 型 外貌特征 遗传基础 单个或少数 主基因 变异表现 间断型 方 式 考察方式 描述 环境影响 不敏感
研究水平 家系
生产、生长 性状 微效多基因
连续型
生产、生长性 状 微效多基因
间断型
度量 敏感
群体
描述 敏感或不敏感
连锁不平衡( Linkage disequlibrium ):一 个基因座上的一个等位基因与另一基因座上的 一个等位基因不相互独立,即不同基因座的等 位基因间存在非随机关联: p (AB) p (A) p(B) D= p (AB) - p (A) p(B) D的取值范围是-0.25~0.25。 连锁不平衡系数随世代的变化: Dt = Do (1-r) t

11-1 数量遗传学的基础 -第五节 数量性状基因座(QTL)

11-1 数量遗传学的基础 -第五节 数量性状基因座(QTL)
QTL本身的问题; 数量性状记录的准确性; 样本大小。
在畜牧生产中哪些QTL有确定 的生产意义?
还是有一些基因,如 五、已知几种家畜的QTL
表8-4 畜禽部分经济性状的主基因或QTL
———————————————————————————————————
畜种 基因
染色体 相关的表型性状
数量遗传学理论,改进育种方法,更深入地了解生 物进化的历程。
二、QTL的检测方法
1. 偏离正态分布检验法 2.主基因指数法(Im>1)
n
Im i1
P0
P0 PSD PS P0


PD


P0 , PSD , PS , PD分别为子女,双亲, 父亲,母亲的表型值。
猪 IGF2 (胰岛素样生长因子II)
与生长发育有关
(Van-Laere et al. 2003)
绵羊 GDF8 (肌肉生长抑制素,Myostatin)
与肌肉和脂肪性状有关 (Clop et al. 2006)
牛ABCG2(ATP结合运转蛋白G2)
与产奶性状有关
(Hanne Gro Olsen et al.
(2) 从 QTL 到 QTG/QTN ① 几个概念
QTL (Quantitative Trait Loci) QTG (Quantitative Trait Gene)
QTN (Quantitative Trait Nucleotides) 从核苷酸水平上来确认对数量性状真正起作
用的基因位点(核苷酸序列多态位点)。
3.分离分析法 已确定的基因有影响猪肉质的RN 基因和肌内脂肪基因等。
4.候选基因法 已确定的基因有猪的ESR、FSHβ等。

数量遗传学基础

数量遗传学基础
• 性质 • 在二倍体遗传平衡群体中, 杂合子频率值永
远不会超出0.5。 • 杂合子频率是两个纯合子频率乘积平方根2
倍, 即H=2√(DR)
数量遗传学基础
第6页
哈代 - 温伯格定律应用
• 计算基因频率
– 共显性及不完全显性
• 基因型与表型一致
– 完全显性
• 杂合子与显性纯合子表型相同;隐性纯合子基因型 与表型一致。
能够度量 呈连续变异 易受环境影响 多基因控制
数量遗传学基础
第13页
表9-1 质量性状与数量性状比较
质量性状
数量性状
性状主要类型 遗传基础
变异表现方式 考查方式 环境影响 研究水平 研究方法
品种特征、外貌特征 少数主基因控制 遗传关系简单 间断型 描述 不敏感 家庭
系谱分析、概率论
生产、生长性状 微效多基因 复杂 连续型 度量 敏感 群体
数量遗传学基础
第24页
设有n组数据,每组有k个数据:
组别 第一组 第二组 X..
……. … 第n组
变量取值 X11 X12 … X21 X22 …


Xn1 Xn2 …
组均数 总均数
X 1k
X1..
X 2k
X2.


X nk.
Xn.
数量遗传学基础
第25页
三、重复率预计
重复率就是以个体分组, 以个体度量值 为组内组员, 计算得到组内相关系数。这 时组间方差就是个体间方差, 组内方差就 是个体内度量间方差。
• 随机交配、平衡群体
数量遗传学基础
第1页
基因频率与基因型频率之间关系
• 设群体某一基因座位上存在两个等位基因A和a, 各自基因频率分别设为p和q; 群体内个体在该基 因座位上含有三种基因型,即AA, Aa, aa,各自 概率分别设为D.H、R; 则存在以下等式:

遗传参数的名词解释

遗传参数的名词解释

遗传参数的名词解释遗传参数是遗传学领域中一个重要的概念,指代遗传特征在群体中的表达和遗传传递的定量度量。

随着现代遗传学研究的深入,人们对于遗传参数的研究和应用也愈发广泛。

本文将对遗传参数的概念、分类及其应用进行解释和介绍。

一、遗传参数的概念遗传参数是用来表示和描述遗传特征在遗传传递过程中所占比例和强度的参数。

它可以用于描述遗传特征的表现型和基因型频率在群体中的分布和变异程度,从而揭示遗传现象的规律和机制。

遗传参数可以由多个指标来衡量,常用的有遗传方差、遗传相关和遗传力等。

它们提供了研究遗传特征传递方式和变异程度的定量指标,为遗传学研究提供了基本的理论和方法。

二、遗传参数的分类根据遗传参数的特点和应用领域,可以将其分为多个不同的分类。

以下是一些常见的遗传参数分类:1. 遗传方差参数:遗传方差是衡量个体间遗传差异程度的参数,用以描述遗传特征对总变异的贡献比例。

它由遗传方差(VA)和环境方差(VE)组成,反映了遗传和环境在个体遗传特征变异中的相对作用。

2. 遗传相关参数:遗传相关是衡量两个遗传特征之间相关性的参数,用以描述这些遗传特征之间的遗传关系。

例如,相关系数可以用来表示两个性状间的遗传相关性,从而揭示这些性状之间的遗传联系。

3. 遗传力参数:遗传力是衡量遗传因素对于遗传特征在群体中表达的程度的参数,用以描述遗传因素对于表现型变异的贡献。

它可以通过计算遗传力的比例来评估遗传因素在总变异中的相对重要性。

三、遗传参数的应用遗传参数在遗传学和进化生物学的研究中具有广泛的应用。

以下是几个常见的应用领域:1. 遗传变异和遗传进化:遗传参数可以用来描述和量化不同遗传特征的遗传变异和个体间的遗传差异,从而揭示物种遗传进化的模式和机制。

2. 遗传改良和育种:通过分析和评估遗传参数,可以帮助农业生产者和育种专家理解和改良作物和家畜的遗传特征。

基于遗传参数的分析,可以选择出具有良好遗传背景的亲本,并进行合理的杂交和选择,以达到育种的目的。

第七章数量遗传学基础

第七章数量遗传学基础

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数量性状遗传机制的发展
传统观点: 基于多基因假说认为数量性状均受微效、等效的微
效基因控制 采用分子标记对基因效应的研究发现,数量性状: 可能是受微效基因控制 也可能受少数几对主效基因控制,加上环境作用而 表现连续变异 有时由少数主基因控制,但另外存在一些微效基因 (修饰基因,modifying gene)的修饰作用 微效基因的效应值(对性状的影响)也不尽相等
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多基因假说要点
微效基因对环境敏感,因而数量性状的表现容易受环境因素的 影响而发生变化。微效基因的作用常常被整个基因型和环境的 影响所遮盖,难以识别个别基因的作用
多基因往往有多效性,多基因一方面对于某一个数量性状起微 效基因的作用,同时在其他性状上可以作为修饰基因(改变其他 基因效果的基因)而起作用,使之成为其他基因表现的遗传背景
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两个变量间的关系:
因果关系: 单箭头线,方向由因到果,称为通径线 平行关系:双箭头线,称为相关线
每条线的相对重要性称为系数
通径线的系数称为通径系数 相关线的系数称为相关系数
猪的屠宰体重(Y),由一长速度(X1)和4月龄体重(X2) 决定,而它们又是由饲养条件(X3)决定
一个群体内,环境对不同个体施加影响,从而使个体的表型值偏离基因 型值,称之为“离差”。有时也称为“环境效应”
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n
P P1 P2 Pn
Pi
i
n
n
n
n
Gi
Ei
G i ,E i
n
n
若E与G之间相互独立,在一个随机交配的大群体中

数量遗传

数量遗传

第十三章数量遗传第一节群体的变异生物群体的变异→表现型变异+遗传变异。

数量性状的遗传变异→群体内各个体间遗传组成的差异。

当基因表达不因环境的变化而异:个体表现型值(P)是基因型值(G)和随机机误(e)的总和,P=G+e其中:随机机误(e)是个体生长发育过程所处小环境中的随机效应。

在数理统计分析中,通常采用方差(variance)度量某个性状的变异程度。

遗传群体的表现型方差(phenotypic variance,V p ) →基因型方差(genotypic variance, V G )+机误方差(error variance, V e ) 。

V P =V G + V e控制数量性状的基因具有各种效应,主要包括:加性效应(additive effect,A ):基因座(locus)内等位基因(allele)的累加效应;显性效应(dominance effect,D ):基因座内等位基因之间的互作效应。

基因型值是各种基因效应的总和。

1、加性-显性模型:基因型值:G=A+D表现型值:P =G+e =A+D+e群体表现型方差→分解为加性方差、显性方差和机误方差。

表现型方差:V P=V A+V D+V e2.加性-显性-上位性模型:对于某些性状,不同基因座的非等位基因之间可能存在相互作用,即上位性效应(epitasis effect,I)。

基因型值: G=A+D+I表现型值: P=A+D+I+e群体表现型变异(方差):V P=V A+V D+V I+V e假设只存在基因加性效应(G=A ),4种基因数目的F2群体表现型值频率分布列于下图。

当机误效应不存在时:如性状受少数基因(如1-5对)控制,表现典型的质量性状;但基因数目较多时(如10对)则有类似数量性状的表现。

当存在机误效应时:表现型呈连续变异,当受少数基因(如1-5对)控制时,可对分离个体进行分组;但基因数目较多(如10对)则呈典型数量性状表现。

多基因(polygenes)控制的性状一般均表现数量遗传的特征。

第七章数量遗传学基础

第七章数量遗传学基础
第二十三页,编辑于星期四:二点 二十四分。
表8-1 群体基因型值平均数的估计
_________________________________________________________
基因型 频率(f) 基因型值(x) 频率x值(fx)
——————————————————————————————————

VG=VA+VD +VI
(CovAD= CovAI = CovDI =0)
3. 环境方差的剖分
由于
E=Eg+Es VE=VEg+VEs
(CovEgEs=0)
第三十四页,编辑于星期四:二点 二十四分。
所以,当各种效应无互作时,它们
的协方差为零,就有 VP=VA+VD+VI+VEg+VEs 或 VP=VA+VR
通过对小麦籽粒颜色的遗传研究发现有三对不同 的基因控制着小麦籽粒的红色与白色。
第六页,编辑于星期四:二点 二十四分。
第一类杂交试验:
P 红色籽粒 x 白色籽粒
F1
粉色籽粒
F2 1/4红色,2/4粉色,1/4白色
这是一对无显隐性关系(共显性)基因控制
的性状,子1代为中间性,子2代以1:2:1的表型 比例分离。
t MSb MSw MSb (k 0 1)MSw
MSb:组间均方 MSw:组内均方 k0:样本数不等时的加权平均数
k0
1 n 1
(
ki
k
2 i
)
ki
n:组数 k:各组头数
i:1,2,…n
第三十七页,编辑于星期四:二点 二十四分。
2.计算方法举例 为了便于说明重复力的具体计算方法,这里只取了5

第二章数量遗传学基础

第二章数量遗传学基础
作用
①可以利用分子遗传标记对数量性状基因型进行标记 辅助选择; ②将转基因技术用于数量性状的遗传操作; ③能够鉴别由多因素引起的遗传疾病,为基因治疗和 改进预防措施提供依据; ④对家畜育种实践的指导更为科学合理。
数量遗传学基础 因为基因型与所测的抗原类型一致,因此这三种基因型频率 D、H和R分别为:
M和N的基因频率分别为p和q:
数量遗传学基础
基本概念—随机交配
随机交配(random mating),其基本含义是 指在一个有性繁殖的群体中,任何个体与所 有异性个体都有相同的交配机会,即任何一 对异性个体的结合都是随机的。
一个个体在群体中存在的时间是有限的,除非 发生突变,其遗传基础是终生不变的。一个群 体则是可以长期存在的,群体可大可小、分布 可广可窄,其遗传结构由所有个体的遗传基础 决定,并受到各种各样的因素影响,可以随时 发生变化。
数量遗传学基础
基本概念—基因频率
基因频率(gene frequency):在一个群 体中某一等位基因的数量与占据同一基 因座的全部等位基因总数的比例。
q R 0.980.98,9p 90.0101
数量遗传学基础
性连锁基因
性连锁基因与基因型频率
数量遗传学基础
数量遗传学基础
数量遗传学基础
性连锁基因频率在群体中的变化
数量遗传学基础
复等位基因
基因频率与基因型频率的关系为:
数量遗传学基础
实例
控制兔毛色有三个等位基因(C、ch、c),C对后 两者显性,ch对c显性,只要有C基因就表现为有 色,chch和chc表现为“八点黑”,即喜马拉亚白化 (全身白色,耳、鼻、尾、脚为黑色),cc为白 化(全身白色,眼球粉红)。据调查,在一随机 交配的大兔群中,有色兔占75%、“八黑”兔占9 %、白化兔占16%,试估计三种基因频率。

数量遗传学基础

数量遗传学基础

第九章数量遗传学基础(总25页)--本页仅作为文档封面,使用时请直接删除即可----内页可以根据需求调整合适字体及大小--第九章数量遗传学基础概述一、质量性状和数量性状的遗传动物的遗传性状,按其表现特征和遗传机制的差异,可分为三大类:一类叫质量性状(Qualitative trait ), 一类叫数量性状(Quantitative trait ), 再一类叫门阈性状(Threshold trait)。

动物的经济性状(Economic trait)大多是数量性状。

因此,研究数量性状的遗传方式及其机制,对于指导动物的育种实践,提高动物生产水平具有重要意义。

质量性状:是指那些在类型间有明显界限,变异呈不连续的性状。

例如,牛的无角与有角,鸡的芦花毛色与非芦花毛色,等等。

这些性状由一对或少数几对基因控制,它不易受环境条件的影响,相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表现完全服从于三大遗传定律。

数量性状:是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性变异的性状,如产奶量、产卵量、产毛量、日增重、饲料利用率等。

门阈性状:是指由微效多基因控制的,呈现不连续变异的性状。

这类性状具有潜在的连续分布遗传基础,但其表型特征却能够明显的区分,例如,产子数,成活或死亡,精子形态正常或畸形,这类性状的基因效应是累积的,只有达到阈值水平才能表现出来。

二、数量性状的一般特征数量性状表现特点表明,数量性状受环境因素影响大,因此其表型变异是连续的,一般呈现正态分布(Normal distribution),很难分划成少数几个界限明显的类型。

例如,乳牛的产奶量性状,在群体中往往从3000kg至7000kg范围内,各种产量的个体都有。

由于数量性状具有这样的特点,所以对其遗传变异的研究,首要的任务是对性状的变异进行剖分,估计出数量性状变异的遗传作用和环境的影响程度。

具体地说,对数量性状遗传的研究必须做到以下几点:第一,要以群体为研究对象;第二,数量性状是可以度量的,研究过程要对数量性状进行准确的度量;第三,必须应用生物统计方法进行分析;第四,在统计分析基础上,弄清性状的遗传力以及性状间的相互关系。

七章节动物数量遗传学基础

七章节动物数量遗传学基础
因此有:G
= A + D + I;P = A + D + I + E.
表型值 P = 育种值 A + 剩余值 E
其中,D 与 I 不具有可加性,合称为非加性效应。
4.4 遗传方差分解

由于群体遗传变异有三种类型,其遗传方差也可进而
分解为三种方差分量:
加性方差(VA):个体间加性效应差异导致的群体变异方差;
数量性状—定义
象人的身高,体重以及家畜的大 小,体重等这些性状,其变异是连续 的,描述它们只有通过测量的方法。 这样的性状叫做数量性状,它们的差 异表现在量上或程度上
研究数量性状的方法的特点
必须进行度量
必须应用统计方法进行分析归纳
研究数量性状以群体为对象才有意义
2、阈性状
2.1 定义
表型相关=遗传相关+环境相关;
遗传相关为育种值间的相关;环境相关为剩余值或 该性状环境偏差间的相关;

“+”、“/-”表示正负相关; 举例:鸡的体重与径长呈现较强正相关;
5.2 遗传相关的估计(了解)
rA =
covAxAy
σAxσAy
5.3 畜禽主要经济性状间的遗传相关;
(表197~198 表)
80千克
F1
130千克
F2 >140千克或<80千克
越亲遗传现象的解释
(A=200g;a=100g) P A1A1A2A2a3a3 × a1a1a2a2A3A3 (1000) (800) F1 A1a1A2a2A3a3 (900)
F2 A1A1A2A2A3A3 or a1a1a2a2a3a3 (1200) (600)
5.4 遗传相关的应用
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问题:
4、育种学中认为“遗传力是性状遗传 给后代的能力”。设奶牛产奶量的 遗传力为0.3,这意思是:
(1)奶牛的产奶量有30%是遗传造成的;
还是(2)选择差部分有30%可以遗传给后代。
四、遗传相关(genetic correlation)
1.概念
(1)数量遗传学概念 性状育种值之间的相关。
rA

为了便于说明重复力的具体计算方法,这里只取了5
头猪的产仔纪录(表14),在实际工作中,样本应当扩大。
表8-2 由5头母猪的产仔纪录计算产仔数的重复力
———————————————————————————
母猪编号
胎次 1
2
3
4
5
总计
———————————————————————————
1
8
10
7
9 13
2
8
10
8
9 14
3
9
11
8 11
9
4
9
11 10 11
9
5
10
12
———————————————————————————
Σx
44
54 23 40 45
216
Σx2
390 586 277 404 527
2184
( Σx)2/ki 387.2 583.2 272.3 400 506.3 2149
—————————————————————————————————————————
第十四章 数量遗传学基础
第四节 遗传参数
概念 遗传参数:指为了进行基因型选择而估计育种值时
所必须参考的一些常数。 重复率(repeatability):指对同一个体某一性
状多次重复度量值之间的相关程度。用统计学语言 表达,是指同一个体不同次生产记录的组内相关系 数。 遗传率(heritability):指性状的遗传方差在总 方差(表型方差)中所占的比率。



w
nh
2 n
Pn Pn

n

w
i
h
2 i
i 1
Pi Pi
I :选择指数
n :选择性状数
wi :第i个性状的经济权重 hi2 :第i个性状的遗传力 Pi :个体第i个性状的表型值
Pi :个体第i个性状的平均值
问题:
1、是否所有数量性状都可以计算遗传力?
2、在医学上,曾对各种疾病作遗传力估 计,你认为何种疾病的遗传力最高, 何种疾病的遗传力最低?
答:
1、只能有一次度量值的性状不能计算 重复力。
2、多次度量值相同的性状不必计算重 复力(re=1)。
三、遗传力(heritability)
1.概念 (1)数量遗传学概念
表型方差中遗传方差所占的比率
H2 VG 此为广义遗传力;
VP
表型方差中加性方差所占的比率
h2 VA VP
此为狭义遗传力。
Aˆ x :个体x的估计育种值
Px :个体x的表型值 P :群体平均数 h2 :遗传力
如个体有k次记录,则
h2 (k )

kh2 1 (k 1)re
h(2k) :k次记录的遗传力
re :k次记录的重复力
(4)制定性状间无相关时的选择指数
I

w 1h 12
P1 P1

w
2h
2 2
P2 P2


3.重复力的应用
(1)确定度量次数
重复力低的性状,增加度量次数对
准确度改进的作用大;
重复力高的性状,增加度量次数对
准确度改进的作用小。
表8-3不同重复力性状所需要的度量次数(参考值)
————————————————————
重复力 (re)
度量次数
————————————————————
0.9以上
1
遗传相关(genetic correlation):指生 物个体或性状育种值之间的相关程度。
亲属间的遗传相关:指有亲缘关系的两个体同一 性状育种值之间的相关程度,用相关系数rA表示。
性状间的遗传相关:指同一个体两个不同性状育 种值之间的相关程度,也用相关系数rA(xy)表示。
一、数量性状方差的剖分
1. 遗传方差与环境方差 设 P=G+E (符号定义同前) 则 VP=VG+VE (CovGE=0)
2. 遗传方差的剖分
由于 G=A+D+I

VG=VA+VD +VI
(CovAD= CovAI = CovDI =0)
3. 环境方差的剖分
由于
E=Eg+Es VE=VEg+VEs (CovEgEs=0)
(2)制定性状间有相关时的选择指数
I b1P1 b2P2 bnPn
n
biPi i 1
I :选择指数 n :选择性状数 Pn :性状表型值 bi :待定系数
待定系数b的的计算:
b=P-1 G w
b :待定系数向量 P :表型方差、协方差矩阵 G :遗传方差、协方差矩阵 w :经济权重向量 P-1 :P的逆矩阵
=
28 7.0 4
组间平方和 组内均方=
组间自由度
=
35 17

2.06
(5)计算k0
1
52 52 42 42 42
k0 5 1 (22
22
) 4.4
(6)计算组内相关系数
t

re

MS b MS w MS b (k 0 1)MS W
7.0 2.06 0.35 7.0 (4.4 1)2.06
(1)列表并作必要的计算
列表 见表14上半部分 计算 Σx,Σx2,(Σx)2/ki
见表14下半部分
而且 n=5, N=22, 校正项 C=(ΣΣx)2/N
=(216)2/22 =2121
(2)计算平方和
总平方和= ΣΣx2-C =2184-2121 =63
组间平方和=

( X)2
ki
C
=2149-2121 =28 组内平方和=总平方和-组间平方和 =63-28 =35
(3)分析自由度
总自由度= N-1 = 22-1 = 21 组间自由度= n-1 = 5-1 = 4
组内自由度=总自由度-组间自由度 =21-4 =17
(4)计算均方
组间均方=
组间平方和 组间自由度
(定义同前)
“交叉协方差”的算术平均数
rA

Cov x1y2 Cov x2y1 2 Cov x1x2 Cov y1y2
(2)同胞相关分析法
rA
MPs(xy) MPw(xy) (MS s(x) MS w(x) )(MS s(y) MS w(y) )
MPs(xy) :公畜间性状x和y的均积
0.7~0.8
2~3
0.5~0.6
4~5
0.3~0.4
6~7
0.1~0.2
8~9
(2)估计个体终生最可能生产力
Px

1
kre (k 1)re
(Pk

P)

P
Px:个体X的终生可能生产力 Pk:个体X的k次度量均值 P :全群平均数 k: 度量次数
re: 重复力
问题:
1、是否所有数量性状都可以计算重复力? 2、有哪些性状不需要计算重复力?
rA :性状x和y的遗传相关
Cov x1y2 :亲代性状x和子代性状y间的协方差 Cov x2y1 :子代性状x和亲代性状y间的协方差 Cov x1x2 :亲子两代性状x的协方差
Cov y1y2 :亲子两代性状y的协方差
2.计算公式 (1)亲子相关分析法 “交叉协方差”的几何平均数
rA
Cov x1y2 Cov x2y1 Cov x1x2 Cov y1y2
3.遗传力的应用
(1)预测选择效果
R=Sh2
R:选择反应 S:选择差(留种群体与供选
群体平均数之差)
h2:性状遗传力
(2)确定选择方法
遗传力高的性状个体选择有效
遗传力低的性状家系选择优于个体 选择
如结合个体成绩与家系成绩,就有 合并选择
(3)估计个体的育种值
Aˆ x h2 (Px P) P
(2)生物统计学概念 育种值对表型值的回归系数
h2 = bAP
A:育种值 P:表型值
子代记录,P :双亲记录均值
(2) h2=2bOP (3) h2=2t(FS)
P:单亲记录 t(FS):全同胞记录的组内相关系数
(4) h2=4t(HS) t(HS):半同胞记录的组内相关系数
MPw(xy) :公畜内性状x和y的均积
MSs(x) :公畜间性状x的均方
MSw(x) :公畜内性状x的均方 MSs(y) :公畜间性状y的均方 MSw(y) :公畜内性状y的均方
3.遗传相关的应用
(1)间接选择 利用易度量的性状对不易度量的性状 的遗传相关作间接选择;
利用幼畜某些性状与成畜主要经济性 状的遗传相关作早期选种。
等于1时表明表型变异完全是由遗传的因素决定的,当等于0时 表型变异由环境所造成,我们不难看出,人类的身长,智商及
精神分裂症中的一种类型受遗传控制的程度较大;相反像数学 的天赋等遗传传的作用很小,主要是依靠后天的努力和培养
问题:
3、遗传力的高低是否有统一的划分标 准?试列举畜禽的高遗传力性状、 中等遗传力性状和低遗传力性状。
计算这些矩阵所需要的参数:
1、性状的标准差(σP) 2、性状的遗传力 (h2) 3、性状间的表型相关 (rP) 4、性状间的遗传相关 (rA) 5、性状的经济权重 (w)
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