五种核酸提取法对猪繁殖与呼吸综合征病毒提取效率的比较
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He S h i c h e n g ,L i n Y u a n ,W a n gC h a n g j i a n ,L i uDa o x i n ,T a nDa n g 2 ,
T a n g Xi a o mi n g ,Wa n g We i g u o ,L u Xi n h u a ,Q i u L i x i n ‘ ,He Y u l i n g
b e a d R NA e x ra t c t i o n me t h o d s ,i n d i c a t i n g n o o b v i o u s d i f f e r e n c e ,b u t t h e T i a n l o n g ma g n e t i c b e a d e x t r a c t i o n e f i f c i e n c y
状 ,是严 重威 胁全 球 养猪业 发 展 的重要 传染 病之 一
p]
。
1 . 4 . 1 T r i z o l 提 取 。在 离 心 管 中 依 次 加 入 7 5 0 u L T r i z o l 和2 5 0 u L样 品 , 震 荡 混 匀 , 静 置 1 0 mi n :
加入 2 0 0 u L氯 仿 , 混 匀 , 静 置 1 0 mi n ,4℃ 离 心 1 5 mi n ;转移 上 清 至 一新 离 心 管 中,加入 5 0 0 u L
s t a b l e a n d g a v e t h e h i g h e s t e ic f i e n c y . Th e ma g n e t i c b e a d e x r t a c t i o n e ic f i e n c y h a d n o s i g n i ic f a n t d i fe r e n c e b e t we e n t h e
随着 分子 检测 技 术 的广 泛应 用 ,核 酸提 取技 术
获得 长足 发 展 。第 一代化 学 法 ,如 异硫氰 酸胍 . 酚.
提 取法操 作 较简 单 、提取 效率 高 、提取 质量 稳 定 ; 近 年发 展起 来 的第三 代磁 珠提 取法 提取 效率 更 高 , 且可进 行 仪器 自动 化批 量提 取 ,在有 批量 提取 要 求 的实 验 室 中广 受推 崇 [ 1 - 2 ] o猪 繁 殖 与 呼 吸 综合 征病
中图分类号:R3 7 3 . 1
文献标识 码:A 文章编 号:1 0 0 5 — 9 4 4 X( 2 0 1 4 )0 8 - 0 0 7 0 - 0 4 Co m pa r i s o n o f i f ve RNA e x t r a c t i o n me t h o ds f o r e x t r a c t i o n O f PRRS v i r us n uc l e i c a c i ds
的选择提 供技术参 考。方法 用五种 不同核 酸提 取方 法对 4 份 1 0 倍梯度 稀释 的 P R R S V 阳性血 清、2 份P R R S V
阳性 组织 悬液及其 离心后 的上 清液共 8份样品 同时进 行核酸提取 ,用荧光 R T - P C R方法进行检 测,获取 各样 品
P R R S V 荧光 R T - P C R结果的 C P值 ,分析五种提取 方式的相对提取 效率。结果 对合适 的提取样 品,磁珠提取 法 相对提 取效率 最 高,吸 附枉 法其次 ,T i f z o l 提取 法相 对效率较 差 ;在三种磁 珠提取 法 中,提取效 率相差在 2个
摘 要 :目的 研 究 T i r z o l R NA提取法 、杭州博 日吸附柱 R NA提取法 、P r o me g a 核酸提取 仪磁 珠 R NA提取法 、
西安 天隆核酸提取 仪磁珠 R NA提取 法、T h e r mo核 酸提 取仪磁珠 R N A提取 法等五种 不 同核 酸提取 方法对 不 同 含量猪繁 殖与呼吸综合征病毒 ( P R R S V)P E l , } 生 J 弹品 的相对提取 效率 ,为动物疫病监测诊 断实验 室核 酸提取方 式
_ 1 ’ 锄 扬耗霞
五种核酸提取法对猪繁殖 与 呼吸综合征病毒提取效 率的比较
何世 成 ,林 源 ,王 昌建 ,刘道 新 ,谭 丹 , 唐 小明 ,王卫 国 ,鲁 杏华 ,邱 立新 ,何 玉玲 ( 1 . 湖 南省动 物疫 病预 防控 制 中心 ,湖 南长 沙 4 1 0 0 1 4 ; 2 . 长 沙市动 物疫 病预 防控 制 中心 ,湖 南长 沙 4 1 0 0 0 6 )
a d s o r p t i o n c o l u mn RNA e x t r a c t i o n o f BI OER, ma g n e t i c b e a d RNA e x t r a c t i o n o f P r o me g a , Xi a n T i a n l o n g a n d T h e r —
s a me t i me . T h e RNA p r e p a r a t i o n s we r e q u a n t i i f e d b y f l u o r e s c e n c e r e a l — t i me q u a n t i t a t i v e R T _ P C R. Re s u l t s F o r t h e a p — p r o p r i a t e s a mp l e s ,t h e e x r t a c t i o n e ic f i e n c y o f ma g n e t i c b e a d wa s t h e h i g h e s t ;t h e a d s o r p t i o n c o l u mn RNA e x t r a c t i o n f o l l o we d :a nd T r i z o l RNA e x t r a c t i o n me t h o d wa s l o we r ;t h e r e wa s 2 CP v a l u e d e f e r e n c e a mo n g t h e t h r e e ma g n e t i c
mo)f or d e t e c t i o n o f P RRS V v i r u s e s ,S O a s t o p r o v i d e t e c h n i c a l r e f e r e n c e or f a n i ma l d i s e a s e d i a g n o s t i c l a b o r a t o r i e s i n n u c l e i c a c i d e x t r a c t i o n . Me t h o d s P RRS V R NAs we r e e x t r a c t e d u s i n g t h e 5 R NA e x t r a c t i o n me t h o d s o n p o s i t i v e s e r u m s a mp l e s o f P RRS v i us r e s d i l u t e d s e ia r l l y f r o m 1 0 。 。 t o 1 0 a nd 2 P RRS V p o s i t i v e t i s s u e s u s p e n s i o n a n d s u p e r n a t a n t a t t h e
d o me s t i c a n d i mp o r t e d p r o d u c t s . Ke y wo r d s : R NA e x t r a c t i o n ;P RRS V;T r i z o l ;a d s o pt r i o n c o l u n ; ma m g n e t i c b e a d e x ra t c t i o n
C P值 内,差异 不明显 ,但 以天隆磁 珠提取 法提取效 率更 高。结论 预装试剂 结合仪 器 自动化操作 的磁珠 法提 取 效果稳定 ,效 率最高;国产仪 器国产 试剂提取 效率不亚于进 1 : 2 仪 器和试剂 。
关键 词 :R NA提 取 ;P R RS V;T R I Z 0L : 吸 附柱 ;磁 珠 法
( 1 . Hu n a n Ce n t e r f o r An i ma l Di s e a s e P r e v e n t i o n a n d Co n t r o l , Ch a n g s h a , Hu n a n 41 0 0 1 4 ;
2 . Ch Fra Baidu bibliotek n g s h a Ce n t e r or f An i ma l Di s e a s e P r e v e n t i o n a n d Co n t r o l , Ch a n g s h a , Hu n a n 4 1 0 0 0 6) Ab s t r a c t : Ai m T o c o mp a r e t h e e x r t a c t i o n e mc i e n c y o f i f v e RNA e x t r a c t i o n me t h o d s( T r i z o l I A e x ra t c t i o n me t h o d、
本研究 以 P R R S V 阳性 样 品为 对 象 , 平 行 比较
了五 种不 同提 取方 法提 取 效率 的差异 , 旨在 获取 动 物疫 病监 测实 验室 选 择合适 、 可靠 的核 酸提取 方法
异 丙醇,混匀,静置 2 0 ai r n ,4 ℃离心 1 0 mi n ; 去 上清 ,离心管 倒置 晾干,加 l mL 7 0 %冰 乙 醇 洗 ,
氯 仿 提取 法 、T r i z o l 提 取 法 等操 作 繁 琐 、耗 时 、 易 污 染 ,对 人 员技 术水 平要 求较 高 ;第二 代为 吸 附柱
一
2 0 1 4年第 3 1 卷第 8期
毒 ( P I S V)是 一种 有囊 膜 的单股 正链 R NA 病毒 , 在 临床 上能 引起 母猪 的繁 殖障 碍和 仔猪 的呼吸道 症
wa s h i g h e r r e l a t i v e l y . Co n c l u s i o n P r e — i n s t a l l e d r e a g e n t c o mb i n a t i o n wi t h a u t o ma t i o n ma g n e t i c b e a d s t o e x t r a c t wa s