多模态神经影像与脑连接组学

会议简介

人脑连接组学（Human Connectome）已成为当前神经科 学领域最受关注的研究热点和前沿方向之一，目前采用 不同模态的神经成像技术，提取活体人脑的全脑结构与 功能连接模式，运用图论分析法揭示脑网络组织形式及 其拓扑属性。这种计算和分析框架可以用于神经发育、 老化及神经精神等疾病的研究
03 脑功能连接组学分析软件Gretna详解

4.19-01 基于结构MRI的脑连接组学计算方法与应用 02 神经影像连接组学相关文章撰写与评审
03 脑连接组学可视化软件Brainnet Viewer详解与实例操作
人脑连接组学研究概况

2005年，印第安娜大学Olaf Sporns教授正式提出 ‚Connectome‛概念。将其定义并描述为大脑内神经连 接网络的‚地图‛ 2009年，美国国立卫生研究院（NIH）正式宣布实施‚人 脑连接组学计划‛（Human Connectome Progect,HCP）

网络参数是否可重复？个体差异
基于DTI的脑白质网络的应用研究

复杂网络的拓扑属性描述
大脑正常发育研究

正常发育研究发现'between-module strength'在0--20岁研 究组内随年龄增长而增强，支持大脑发育的表现

正常发育研究发现结构连接（SC）和功能连接(FC)两者的 相关性（Correlation）在0--20岁组内随年龄增长而加强
小世界网络

小世界网络（Small-world network）具有较高的全局效率 和局部效率，是网络信息传递效率最高的网络形式。而 经研究证明人脑网络符合小世界网络属性
复杂网络的拓扑特性

模块化（Module）分布相对稀疏但是联系十分紧密的节 点集团即为模块化

层级性（Hierarchy）各个节点集团之间存在明显的层级 关系，上下级之间联系紧密，信息传递效率极高，但不 同层级之间只能通过更高层次的节点相互联系，信息传 递效率较低


第五步：综合数据分析讨论

基本流程示意图Ⅰ（单个数据纤维追踪和特征化处理）

基本流程示意图Ⅱ（数据总体处理步骤）

基本流程示意图Ⅲ（复杂网络拓扑属性统计检验）

基本流程示意图Ⅳ（数据结果生成）
基于DTI研究脑白质纤维网络的问题与挑战

脑节点选取方案无同一标准

边权重的定义概念模糊，难以标准化


数据采集（Data Acquisition）利用磁共振采集数据，设置 相关序列及参数

网络构建(Constrution of network) 将磁共振采集的数据利 用Matlab、GRETNA、PANDA等软件进行处理，生成相关 数据矩阵

网络可视化（Network Visulization）利用Brainnet Viewer、 Tracvis等软件将数据矩阵转换成可视化图片，可以直观 的反映网络形式
相关软件

数据处理相关Matlab、GRETNA、PANDA、Brainnet Viewer、 Trackvis等软件具体操作过程暂不赘述。
基于DTI的脑白质网络计算方法及应用研究
基于DTI的脑白质网络计算方法


传统脑白质研究方法
示踪剂追踪（Axonal tracing） 缺点：有创性，操作复杂，只能用于 活体动物实验，追踪纤维有限，同一个体难以多次追踪 外科解剖剥离(Surgical dissection) 缺点：只能用于尸体解剖和动物实 验，仅能够分离出粗大明显的纤维束

图论分析法
Graph theoretical analysis
图论知识基础

Application of Graph theoretical analysis in Human connectome 图论分析法在脑连接组学中的应用
图论分析法的由来

图论分析法（Graph theoretical analysis）是源自瑞士数学家欧拉的 《哥尼斯堡七桥理论》，这个理论不仅解决了当地居民关于能否在 不重复走同一座桥的前提下一次性走完哥尼斯堡七桥的困扰，同时 开创了数学领域的全新分支——图论和几何拓扑
Graph is made up of 'nodes' and lines called edges that connect them

衡量网络属性的指标


全局度量 （Global metrics）
稀疏度 （Sparsity） 平均路径长度 (Average path length) 丛集系数 (Clustering coefficient) 全局效率 (Global efficiency) 局部效率 (Local efficiency)
什么是“网络”？

网络是由相互分离的多重元素组成，但相互联系并且协同工作的系 统

Network is a system consists of multiple elements which are connected and operated together
网络图论

在图论分析法中构成网络的最基本元来自百度文库为‚点‛（Nodes） 和连接点的‚边‛(Edges)
参会目的

基于多模态神经影像与 脑连接组研究具备巨大 科研价值和应用潜力， 同时由于该类研究属于 交叉学科，需要研究者 具备多个学科的基础和 背景知识，所以作为临 床医疗机构，本实验室 需要参加此类会议以实 现诸多繁琐的计算方法 和步骤，从而最终达到 提高本实验室的神经科 学研究水平的目的
课程设置
fNRIS研究结果与fMRI相比具有一致性

根据相关对比研究证明fNRIS同样可以用于网络属性分析
展望与希冀
fNRIS与fMRI相比具有相似的功能，同时又具有价格便 宜，操作简便，高时间分辨率、设备无噪音，头动要求低， 患者被试易合作，婴幼儿和体内金属植入者都可以使用等 明显优势。目前国内此领域研究刚刚起步，只有极少数医 院引进此类设备，希望我科室能够引起足够重视，可作为 科研设备或者常规检查仪器引入


节点度量 (Nodal metrics)
度 (Degree) 度分布 (Degree distribution) 介数 (Betweenness) 节点效率 (Nodal efficiency)
复杂网络

小世界网络 (Small-world network) 无标度网络 (Scale-free network)
智力水平相关性研究

正常智力水平研究组，全局效率（Global Efficiency）随着 IQ值得增加而增长，支持智力水平高者脑信息处理的高 效率。
神经系统疾病研究

Alzheimer's Disease病人在全局效率、相关‘hubs’的度 及介数等拓扑属性指标和健康人相比成下降趋势，支持 AD病人大脑认知功能下降的临床表现
多通道fNRIS机 探头的数量可以根据研究实际人为的减少或增加，可操作性 强
fNRIS工作原理 激活的脑区脱氧血红蛋白含量增高，对近红光的吸收增加， 反射量减少，从而产生信号差异
fNRIS与fMRI相比的优缺点
fNRIS用于静息态功能连接（RSFC）的研究方法

根据光密度的改变分析Oxy-Hb和Deoxy-Hb的含量差异，识 别出激活脑区，最后做相关分析
多模态神经影像与脑连接组学专题会议
会议时间：2015-04-17— 04-19 会议地点：北京师范大学 认知神经科学与学习 国家重点实验室/ 麦戈文脑研究院 参会人员：夏春生 张栋
Special sessions for Multi-modeling imaging and Human connectome
功能性近红外光谱成像在脑连接组学中的研究

Functional Near Infrared Spectroscopy(fNRIS) Imaging.
什么是近红外线？

近红外线波长长，穿透力好,不易被组织吸收，反射量大
fNRIS的构成

发射源：发射近红光
探头：接收组织发射回的近红光
计算机：数据处理分析
优点：可以有效解决纤维交叉问题 缺点：计算耗时，结果是一种概 率性估计，成像效果不及确定性追踪，追踪纤维走向扔有待进一步解 剖验证
基于DTI的脑白质纤维网络构建基本流程

第一步：分别采集DTI和结构像数据 第二步：用PANDA软件处理DTI数据，得出全脑纤维网络 第三步：运用GRATNA软件将全脑纤维网络数据和结构像 数据相配对，并选取ROI 节点，进行特征化处理 第四步：分别用以上方法处理所有病人组和对照组数据， 再做统计学检验，最后通过Brainnet Viewer或Trackvis软 件生成纤维网络图及相关复杂网络拓扑属性指标统计数 据

基于弥散张量成像（DTI）研究白质纤维

弥散张量成像（Diffusion tensor imaging,DTI）利用水分子 在脑白质中的异向性扩散特性来追踪重建白质纤维走向
优点：无创，可直接用于活体人类，操作相对简单，能够得到具体 的网络拓扑属性数据，成像质量可靠，可广泛用于各种疾病的研究
DTI纤维追踪原理

计算机利用DTI数据把大脑分成无数个体素，并且建立每 个体素内的水分子弥散张量模型，通过模型内各个方向 的异向性系数估计纤维走向。
DTI的两种追踪方法

确定性纤维追踪 (Deterministic Fiber Tracking)
缺点：无法解决纤维交叉问
优点：计算消耗时间短，纤维成像清晰 题

概率性纤维追踪 (Probabilistic Fiber Tracking)

4.16
注册、领取材料、软件安装等。（脑成像中心）
4.17-01 人脑连接组学研究概况
02 图论知识基础
03 磁共振成像基本原理、数据采集及注意事项 04 DTI的脑结构连接组学计算方法与应用研究
05 脑结构连接组学分析软件PANDA详解

4.18-01 fMRI的脑功能连接组学计算方法与应用研究 02 fNIRS的脑功能连接组学计算方法与应用研究

枢纽中心节点（Rich club ，huds）网络中存在一些与其 他诸多节点联系非常机密，在整个网络信息传输中起到 关键作用的节点，类似与交通网络中的枢纽
网络图论的应用

利用网络的模块化、层级性和中心节点等属性，定义功 能节点和感兴趣区，再通过计算机数据分析构建脑网络， 从而可以直观的呈现出脑网络结构特性。为进一步的疾 病脑网络异常分析提供有效依据 模块定义 (Module Definition) 根据研究目的定义研究模块 及感兴趣区

精神分裂症（Schizophrenia）与Health controls 相比， Rich-club level呈下降趋势，支持该类患者认知功能下降， 并且存在结构连接和功能连接相关性（SC-FC Coupling） 下降的现象
功能性近红外光谱成像在脑连接组学中的研究
Functional Near Infrared Spectroscopy(fNRIS) Imaging