博奥晶典科研服务产品介绍

芯片+测序 预制+定制
高通量筛选+低通量验证 DNA+RNA+蛋白质+调控
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目 录
part 2
晶芯TM微阵列服务技术平台：国际认可
点样
杂交
扫描
图像分析
生物信息学
1 、作为亚洲唯一被邀请 的单位，博奥生物的系统 化微阵列生物芯片和相关 仪器设备平台技术在 2006 年美国 FDA 组织实 施的微阵列芯片质控项目 中取得了令人满意的结果， 两篇相关文章发表在 2006 年 9 月 的 Nature Bio-technology 上。
临床科研---新热点 新方向
循环肿瘤细胞（circulating tumor cell，CTC）
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2015 TOP10 -Celsee System
速度快： 分选分析自动分离仅需6min，细胞特征分析2.5hr,
效率高： 独创微流控芯片分选技术，分选效率高达85%以上，
高通量： 自动化多通道设置，一次可同时处理四个样本，
regulatory RNAs 具有调控功能的 RNAs microRNA siRNA piRNA lncRNA
Housekeeping RNAs 管家性RNAs tRNA rRNA snoRNA scaRNAs Telomerase RNA
circRNA
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mRNA主要检测平台
平台 特点 物种 单/双通道 Affymetrix 探针设计方式 多 较齐全 单通道 Agilent 定制灵活 较齐全 单/双通道 CBC 应用转化 家蚕，白念 单/双通道
完整性高： 100%细胞无需离心、细胞裂解、添加任何标签，
需求量少： 仅需2ml全血，
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肿瘤基础及临床应用
肿瘤基础研究 CTCs分离、分型、分析 CTCs全基因组测序 CTCs基因突变检测 CTCs的FISH检测 CTCs的培养与研究
临床应用 肿瘤早期筛查 肿瘤个体化用药 疗效评估 复发检测 实时动态监测
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晶芯®人类lncRNA芯片 V4.0
陈润生院士团队领衔打造 权威团队保驾护航，专业设计省时省力
晶芯®人类长链非编码RNA （lncRNA）芯片 V4.0
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晶芯大鼠/小鼠lncRNA芯片
更新时间为： 2015年3月3日
晶芯®大鼠lnຫໍສະໝຸດ BaiduRNA芯片
22020 lncRNA 30254 mRNA lncRNA探针数量最多 lncRNA序列来源数据库最新
---Biomarker、基础及临床研究
晶芯®人类环状RNA（circRNA）芯片 v 1.0
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circRNA：从实验室到临床
Am J Cancer Res 2015;5(2):472-480
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ncRNA研究意义
组织特异性和稳定性
寻找疾病生物标志物
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ncRNA研究意义
竞争性内源（ceRNA）特征
2 、 Nature 全球推荐， 入选国际主流技术平台， 已成功为国际制药企业 等数百家公司和大学提 供高质量服务。
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自主知识产权
自主知识产权的生物芯片和生命科学技术 创新
获得专利授权共计216项
近6成实现商业转化
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国内外产品注册和认证证书112项
医疗器械注册证39项
CE认证19项
FCC认证5项
Affy
SNP6.0，OncoScan，CytoScan
Capitalbio
家蚕，大肠杆菌，白色念珠菌，酵母
ABI
Taqman CNV检测
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目标区域测序 vs. 全基因组测序
全基因组测序 ► Sequence 5 Genomes OR
目标区域测序 ► Sequence 50 Exomes
外显子组指基因组所有的外显子，是基因组中1％的功 能最相关的区域，是许多突变的集中区域。
GS认证2项
WEEE认证1项
CE-IVD认证8项
ICES认证5项
cTUVus认证7项
CB认证7项
调控重要的生物过程 分化
表观遗传改变
染色质修饰 DNA 甲基化 ……
调控 基因 表达
发育 异常突变 肿瘤 (其他疾病）
PNAS (2008)
Nature Genetics (2009)
PLOS One (2010)
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甲基化检测平台产品 • Illumina 人850K芯片
•全基因组甲基化测序
• MeDIP-Seq •ChIP-Seq •Sequenom技术
Methylation
mRNA lncRNA sRNA
Protein
1. 平台技术体系全面，产品线丰富（基因组、转录组、表观遗传组、靶向测序） 2. 严格的质量控制和标准化操作流程（源自17025检测实验室资质认证规范要求） 3. 全面的高质量服务体系和完善的整体解决方案（源自15年高品质的技术服务经验）
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目 录 RNA水平--
基因表达调控机理的研究
--- mRNA表达谱 --- non-coding RNA
RNA水平高/低通量检测种类
RNA Transcripts (RNA转录本)
Protein – coding mRNA (编码蛋白的mRNA)
Non – coding RNA (非编 码RNA)
检测样本（test）和对照（reference）基因组间的DNA拷贝数变异 （copy number variation）
Deletion
缺失
Duplication
Translocation
重复/复制
易位
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CNV检测产品
公司 Agilent CGH芯片 产品 人，小鼠，大鼠，牛，犬鸡，黑猩猩，水稻，恒河猴
肠道微生 物样本 提取基因 组DNA 鸟枪法 建库 MiSeq PE 测序 生物信息 数据分析
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应用领域
农业
1.性状相关关联位点
及功能基因定位 2.遗传多样性与群体 进化
临床
1.疾病易感位点(基
因) 2.分子标志物（药物 靶点）
1. 品质资源鉴定 2. 分子育种
1.疾病预警与检测 2.个体化用药
二代测序
开放 所有物种 na
适用范围
1.品牌认可； 2.到货周期短
1.品牌认可； 低密度定制 2.双通道实验设计： 芯片 3. 高密度定制芯片
所有检测
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Affx vs Agilent目录芯片产品
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Affymetrix 目录芯片产品
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转录组测序
OR
有参考基因组的分析
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De novo分析
Haas & Zody, 2010
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临床科研---新热点 新方向
肠道菌群
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人类肠道微生物群落
22
肠道菌研究热潮
800
700
Number of publications
600
500
400
300
200
100
0
Cancer
IBD
Obesity
Diarrhea
T2D
CD
癌症
炎症型肠道病
肥胖
腹泻
II型糖尿病
慢性病
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肠道菌和疾病
呼吸 系统
内分泌 系统
神经 系统
免疫 系统
消化 系统
生殖 系统
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肠道菌群研究技术平台
16s rRNA 宏基因组测序 （数据文件大小 5～10M）
肠道微生 物样本 提取基因 组DNA 16sRNA基 因扩增
Ion Torrent 测序
生物信息 数据分析
shotgun 宏基因组测序 （数据文件大小 5～10G）
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靶向测序解决方案
通量
中低通量， PCR-reseq
测序平台
ABI 3730XL
原理
Sanger法
测序长度
1000bp
数据量/实验
96kb
耗时/实验
2小时
可逆性链终止合 2*100bp 中高通量， Solexa/Illumina 成测序 PCR-reseq SeqCap Ion Torrent 半导体芯片测序 200-400bp
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疾病研究进入到多层次信息整合的网络时代
DNA
SNP
CNV
Methylation
RNA
lncRNA
lncRNA&mRNA共相关分析
mRNA
miRNA
Protein
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Protein
疾病易感位点/发病机制研究、肿瘤标志物研究、调控网络……
博奥晶典科研服务：一站式解决方案
SNP、InDel、CNV
检 测
检 测
靶 向 测 序
表 观 遗 传 检 测
√
微 生 物 鉴 定
√ √ √ √
技 术
检 测
√ √ √
检 测
√ √ √ √ √ √ √ √ √
检 测
√ √ √ √ √
检 测
√ √ √ √
可 变 剪 切 检 测 蛋
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CNV
DArT
mRNA
miRNA
lncRNA
circRNA
白 质 组 学
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简单蛋白样品， 定性检测
47
质谱平台应用领域
1、相对定量蛋白质组学检测； 2、绝对定量蛋白质组学检测； 3、蛋白修饰检测； 4、蛋白复合物定性检测
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质谱定量蛋白质组学
质谱定量方法
化学标记法 (in vitro)
代谢标记法 (in vivo)
TMT 标记定量
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iTRAQ 标记定量
SILAC 标记定量
miRNA芯片产品
血清、血浆、FFPE样本：ABI> Agilent /Affymetrix
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Illumina –small RNA测序
建库起始样品total RNA质量要求：
• 提取方法非过柱 • RIN≥7，Ratio≥1.5 • 总量≥10ug • A260/280在1.8~2.0 • 建库起始用量：3ug
博奥晶典科研服务产品介绍
北京博奥晶典生物技术有限公司 博 奥 生 物 集 团 有 限 公 司 生物芯片北京国家工程研究中心
目录 科研服务产品简介
科研服务转化应用
目 录
Part 1
科学发现
4
打造最完善高通量分子检测平台
CNV： Copy Number Variation;
SNP
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中 通 量
芯片
订制芯片
低 通 量
ELISA
修饰检测
液相芯片
抗体制备
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质谱检测平台
质谱仪 型号
LTQ Orbitrap Velos (LC-MS/MS)
应用
复杂蛋白样品， 定性与定量检测
Q Exactive (LC-MS/MS)
复杂蛋白样品，小分子，定 性与定量检测
AB Sciex 4800 (MALDI-TOF/TOF)
晶芯®小鼠lncRNA芯片
58809 lncRNA 39027 mRNA lncRNA探针数量最多 lncRNA序列来源数据库最新
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发现新型circRNA，circRNA-Seq是您的不二选择！
---发现鉴定新型circRNAs、基础研究
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探索circRNA功能，circRNA芯片是您的理想选择！
基因组学
转录 反转录
转录组学
翻译
蛋白质组学
代谢
代谢组学
DArT： Diversity Array Technology
高通量测 序平台 博奥 Illumina Thermo 博奥 高通量 芯片/质谱 筛选平台 Affy Illumina Agilent 博奥 验证平台 3730XL 7900HT Sequenom
药物研发提供新思路
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应用领域
细胞分化发育 调控机制机理 药（毒）理机制研究 药物靶点筛选
疾病标志物寻找
疾病的分子诊断
表达谱
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目 录
质谱技术、抗体芯片、 抗体制备
蛋白水平
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博奥蛋白质组学研究平台
1. 质谱平台
定性检测
2. 芯片平台
RayBiotech
3. 传统平台
Western
高 通 量
定量检测
探针 合成
捕获
测序 实验
结果 分析
实验
客户只需提出想法， 提供样品，即可拿 到实验结果
Roche/Agilent(eArray) 负责探针设计、探针合成
捕获测序实验以及 数据分析由博奥负 责完成
博奥将全程参与，为您提供全面优质的服务，以及高效专业的技术支持！
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甲基化
为什么要进行表观遗传和染色质结构研究？
100-600G
1G
11天
2小时
•PCR-reseq：PCR产物重测序 •SeqCap：序列捕获，可以针对100k-96M连续的或非连续的靶标区域进行检测
可根据靶标区域大小、位点数目、样品数目等 选择合适的检测平台！
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人外显子捕获产品比较
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定制捕获服务流程
确定实 验方案
确定捕 获区域
探针 设计
蛋
白 芯 片
抗 体 制 备
小 分 子 检 测
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√
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√
√
产品划分
按照检测内容和平台划分：
近40项
6
新产品/平台
7
8
目 录 DNA水平
生物进化、鉴定及遗传多样性的研究
--- SNP检测技术 --- CNV检测技术 --- 甲基化检测技术 --- 捕获测序技术
DNA水平－SNP检测
单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因 组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性 • • • • • 高密度 功能性 遗传稳定性 易于检测 ……
10
基于SNP标记的高中低通量检测平台
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12
DNA拷贝数变异（CNV）