现代微生物遗传学课件
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现代微生物遗传学课件第一授课单元
微生物遗传学
单击此处添加正文,文字是您思想的提炼, 请尽量言简意赅的阐述观点。
01
教材:
陈三凤.现代微生物遗传学.化学工业出版社,2003
主要参考书
盛祖嘉. 微生物遗传学(三版).科学出版社,2007 沈萍、陈向东,微生物学,高等教育出版社,2006 陶文沂. 工业微生物生理与遗传育种学. 中国轻工业出版社,1997
变量实验(fluctuation analysis):波动实验、彷徨实验
对噬菌体T1敏感的E.coli 对数期培养物,稀释至103/mL,分装两试管,各10 mL
与甲管分装的各小管同时保温24~36h
甲管
乙管
变量实验(fluctuation analysis)Salvador Luria & Max Delbruck(1943)
教材和主要参考书
微生物遗传学理论课的要求
掌握基本概念 熟悉经典实验 领悟科研方法
单击此处添加副标题
第一节 DNA结构和复制
第二章 微生物遗传物质
第一章 绪论
第一节 微生物遗传学发展简史 第二节 朊病毒的发现和思考 第三节 微生物作为遗传学材料的优越性 第四节 微生物遗传控制与发酵工业
第一授课单元
第一章 绪论
单击此处添加正文,文字是您思想的提炼, 请尽量言简意赅的阐述观点。
02
第一节 微生物遗传学的发展简史
01
微生物遗传学是一门以病毒、细菌、放线菌、小型真菌及单细胞藻类、原生动物为研究对象的遗传学的分支学科。
02
40年代以前:微生物遗传学的研究是不系统的、局限的,遗传学基本研究只限于动物和植物。 研究对象:只限于进行有性生殖,特别是产生有性孢子 微生物(酵母菌、草履虫、脉孢菌); 研究内容:只限于形式遗传学分析 (基因重组和定位)
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01
教材:
陈三凤.现代微生物遗传学.化学工业出版社,2003
主要参考书
盛祖嘉. 微生物遗传学(三版).科学出版社,2007 沈萍、陈向东,微生物学,高等教育出版社,2006 陶文沂. 工业微生物生理与遗传育种学. 中国轻工业出版社,1997
变量实验(fluctuation analysis):波动实验、彷徨实验
对噬菌体T1敏感的E.coli 对数期培养物,稀释至103/mL,分装两试管,各10 mL
与甲管分装的各小管同时保温24~36h
甲管
乙管
变量实验(fluctuation analysis)Salvador Luria & Max Delbruck(1943)
教材和主要参考书
微生物遗传学理论课的要求
掌握基本概念 熟悉经典实验 领悟科研方法
单击此处添加副标题
第一节 DNA结构和复制
第二章 微生物遗传物质
第一章 绪论
第一节 微生物遗传学发展简史 第二节 朊病毒的发现和思考 第三节 微生物作为遗传学材料的优越性 第四节 微生物遗传控制与发酵工业
第一授课单元
第一章 绪论
单击此处添加正文,文字是您思想的提炼, 请尽量言简意赅的阐述观点。
02
第一节 微生物遗传学的发展简史
01
微生物遗传学是一门以病毒、细菌、放线菌、小型真菌及单细胞藻类、原生动物为研究对象的遗传学的分支学科。
02
40年代以前:微生物遗传学的研究是不系统的、局限的,遗传学基本研究只限于动物和植物。 研究对象:只限于进行有性生殖,特别是产生有性孢子 微生物(酵母菌、草履虫、脉孢菌); 研究内容:只限于形式遗传学分析 (基因重组和定位)
《微生物遗传》课件
微生物遗传育种与改良
04
自然选育
利用自然变异选择有益的变异体,通过遗传稳定性和生产性状的鉴定,培育出新的菌种。
微生物遗传学应用
05
工业发酵是微生物遗传学应用的重要领域之一,通过利用微生物的遗传特性,实现大规模生产各类发酵产品,如酒精、醋酸、酵母、抗生素等。
工业发酵中,通过遗传育种和基因工程手段改良微生物菌种,提高发酵效率和产物质量,降低生产成本。
详细描述
总结词
介绍基因表达的概念、基因表达的调控机制以及基因表达的改变对微生物的影响。
详细描述
基因表达是DNA中的遗传信息转录为RNA并翻译为蛋白质的过程。基因表达受到多种因素的调控,包括DNA的甲基化、染色质构象以及转录和翻译水平的调控。基因表达的改变可能影响微生物的生长、代谢和致病性等方面。
微生物基因突变与重组
19世纪末期
遗传学奠基人摩尔根提出基因概念,为遗传学的发展奠定了基础。
20世纪初期
DNA双螺旋结构发现,开启了分子生物学时代。
20世纪50年代
人类基因组计划启动,推动了基因组学的发展。
20世纪70年代
微生物遗传物质基础
02
介绍DNA的基本结构,包括碱基、磷酸和脱氧核糖,以及DNA的双螺旋结构。
总结词
工业发酵的微生物菌种通常具有特殊生理功能和代谢途径,通过研究其遗传机制,有助于发现新的发酵产品和工艺。
生物制药是利用微生物或其代谢产物作为药物成分,治疗和预防人类疾病的领域。
通过遗传工程手段,可以改良微生物细胞工厂,高效表达具有药效的蛋白质或其他活性分子。
生物制药中,对微生物的遗传特性和表达调控机制的研究,有助于发现和开发新的药物候选分子。
生物环保是利用微生物的降解和转化能力,处理和治理环境污染的领域。
04
自然选育
利用自然变异选择有益的变异体,通过遗传稳定性和生产性状的鉴定,培育出新的菌种。
微生物遗传学应用
05
工业发酵是微生物遗传学应用的重要领域之一,通过利用微生物的遗传特性,实现大规模生产各类发酵产品,如酒精、醋酸、酵母、抗生素等。
工业发酵中,通过遗传育种和基因工程手段改良微生物菌种,提高发酵效率和产物质量,降低生产成本。
详细描述
总结词
介绍基因表达的概念、基因表达的调控机制以及基因表达的改变对微生物的影响。
详细描述
基因表达是DNA中的遗传信息转录为RNA并翻译为蛋白质的过程。基因表达受到多种因素的调控,包括DNA的甲基化、染色质构象以及转录和翻译水平的调控。基因表达的改变可能影响微生物的生长、代谢和致病性等方面。
微生物基因突变与重组
19世纪末期
遗传学奠基人摩尔根提出基因概念,为遗传学的发展奠定了基础。
20世纪初期
DNA双螺旋结构发现,开启了分子生物学时代。
20世纪50年代
人类基因组计划启动,推动了基因组学的发展。
20世纪70年代
微生物遗传物质基础
02
介绍DNA的基本结构,包括碱基、磷酸和脱氧核糖,以及DNA的双螺旋结构。
总结词
工业发酵的微生物菌种通常具有特殊生理功能和代谢途径,通过研究其遗传机制,有助于发现新的发酵产品和工艺。
生物制药是利用微生物或其代谢产物作为药物成分,治疗和预防人类疾病的领域。
通过遗传工程手段,可以改良微生物细胞工厂,高效表达具有药效的蛋白质或其他活性分子。
生物制药中,对微生物的遗传特性和表达调控机制的研究,有助于发现和开发新的药物候选分子。
生物环保是利用微生物的降解和转化能力,处理和治理环境污染的领域。
现代微生物遗传学-第三单元授课-课件
在DNA复制过程中,由 于DNA聚合酶的错误, 导致碱基对的增添、缺
失或替换。
化学诱变
物理诱变
生物诱变
某些化学物质可以引起 碱基对的替换,导致基
因突变。
某些物理因素如紫外线、 X射线等可以引起基因突
变。
某些病毒或细菌可以引 起基因突变。
基因重组过程
01
02
03
同源重组
指两个同源DNA分子之间 的重组,涉及到DNA的断 裂、交换和修复。
基因突变
基因突变产生遗传变异,为微生物提供进化基础。
3
基因重组
微生物通过基Βιβλιοθήκη 重组,交换遗传物质,加速进化 过程。
系统发育分析方法
分子生物学方法
01
利用分子生物学技术,如DNA测序和基因组学分析,研究微生
物的系统发育关系。
形态学特征
02
通过比较微生物的形态学特征,如细胞形态、染色特性等,进
行系统发育分析。
级联调节
通过一系列的级联反应,使基因 表达得到精细调控。
基因表达调控应用
疾病治疗
通过调控特定基因的表达,治疗遗传性疾病和癌 症等疾病。
生物工程
通过调控微生物的基因表达,改良微生物生产性 能,生产药物和生物燃料等。
生物进化研究
通过研究基因表达的调控机制,揭示生物进化的 奥秘。
04
微生物进化与系统发育
生物地理学方法
03
利用生物地理学方法,研究微生物在全球范围内的分布和演化
历程。
系统发育研究意义
揭示生命起源与演化
系统发育研究有助于揭示生命起源与演化的历程,理解生物多样 性的形成机制。
疾病防控与治疗
通过系统发育分析,有助于发现病原微生物的演化规律,为疾病 防控和治疗提供科学依据。
失或替换。
化学诱变
物理诱变
生物诱变
某些化学物质可以引起 碱基对的替换,导致基
因突变。
某些物理因素如紫外线、 X射线等可以引起基因突
变。
某些病毒或细菌可以引 起基因突变。
基因重组过程
01
02
03
同源重组
指两个同源DNA分子之间 的重组,涉及到DNA的断 裂、交换和修复。
基因突变
基因突变产生遗传变异,为微生物提供进化基础。
3
基因重组
微生物通过基Βιβλιοθήκη 重组,交换遗传物质,加速进化 过程。
系统发育分析方法
分子生物学方法
01
利用分子生物学技术,如DNA测序和基因组学分析,研究微生
物的系统发育关系。
形态学特征
02
通过比较微生物的形态学特征,如细胞形态、染色特性等,进
行系统发育分析。
级联调节
通过一系列的级联反应,使基因 表达得到精细调控。
基因表达调控应用
疾病治疗
通过调控特定基因的表达,治疗遗传性疾病和癌 症等疾病。
生物工程
通过调控微生物的基因表达,改良微生物生产性 能,生产药物和生物燃料等。
生物进化研究
通过研究基因表达的调控机制,揭示生物进化的 奥秘。
04
微生物进化与系统发育
生物地理学方法
03
利用生物地理学方法,研究微生物在全球范围内的分布和演化
历程。
系统发育研究意义
揭示生命起源与演化
系统发育研究有助于揭示生命起源与演化的历程,理解生物多样 性的形成机制。
疾病防控与治疗
通过系统发育分析,有助于发现病原微生物的演化规律,为疾病 防控和治疗提供科学依据。
《微生物遗传与变异》课件
倒位突变
指DNA分子中一段碱基对的倒位,导致基因 结构的改变。
基因突变机制
自发突变
指在没有任何外界因素的影响 下,DNA复制过程中偶然出 现的差错导致的基因突变。
诱变因素
指某些物理、化学、生物因素 可以诱导基因突变的产生,如 紫外线、X射线、化学诱变剂
等。
修复缺陷
指DNA损伤修复过程中的缺 陷可以导致基因突变的产生。
基因重组也可以帮助微生物抵 抗抗生素等外部压力,提高生 存能力。
04 微生物基因表达调控
基因表达调控概念
基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制过程,是生物体内基因活动的一个重 要环节。
基因表达调控主要发生在转录水平,即RNA聚合酶通过转录起始、延伸、终止等过 程控制基因的表达。
基因表达调控对于生物体的生长、发育、代谢以及应激反应等生理过程具有重要意 义。
表观遗传修饰
表观遗传修饰是指DNA序列不变的情况下,基因表达的可遗传变化, 包括DNA甲基化、组蛋白修饰等。表观遗传修饰可以影响转录因子的 活性,从而调控基因的表达。
基因表达调控对微生物的影响
微生物的适应性
基因表达调控是微生物适应环境变化的重要机制。通过调控特定基因的表达,微生物可以适应不同的生长条件、营养 需求以及环境压力。
遗传物质
携带遗传信息的物质, 可以是DNA或RNA。
微生物遗传学重要性
基础研究
01
揭示生命本质,探索生物进化机制。
应用研究
02
改良微生物菌种,提高工业生产效率。
疾病控制
03
研究病原微生物的遗传特性,为疾病防治提供依据。
微生物遗传学发展历程
19世纪
孟德尔遗传定律的发现,奠定遗传学基础。
指DNA分子中一段碱基对的倒位,导致基因 结构的改变。
基因突变机制
自发突变
指在没有任何外界因素的影响 下,DNA复制过程中偶然出 现的差错导致的基因突变。
诱变因素
指某些物理、化学、生物因素 可以诱导基因突变的产生,如 紫外线、X射线、化学诱变剂
等。
修复缺陷
指DNA损伤修复过程中的缺 陷可以导致基因突变的产生。
基因重组也可以帮助微生物抵 抗抗生素等外部压力,提高生 存能力。
04 微生物基因表达调控
基因表达调控概念
基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制过程,是生物体内基因活动的一个重 要环节。
基因表达调控主要发生在转录水平,即RNA聚合酶通过转录起始、延伸、终止等过 程控制基因的表达。
基因表达调控对于生物体的生长、发育、代谢以及应激反应等生理过程具有重要意 义。
表观遗传修饰
表观遗传修饰是指DNA序列不变的情况下,基因表达的可遗传变化, 包括DNA甲基化、组蛋白修饰等。表观遗传修饰可以影响转录因子的 活性,从而调控基因的表达。
基因表达调控对微生物的影响
微生物的适应性
基因表达调控是微生物适应环境变化的重要机制。通过调控特定基因的表达,微生物可以适应不同的生长条件、营养 需求以及环境压力。
遗传物质
携带遗传信息的物质, 可以是DNA或RNA。
微生物遗传学重要性
基础研究
01
揭示生命本质,探索生物进化机制。
应用研究
02
改良微生物菌种,提高工业生产效率。
疾病控制
03
研究病原微生物的遗传特性,为疾病防治提供依据。
微生物遗传学发展历程
19世纪
孟德尔遗传定律的发现,奠定遗传学基础。
《微生物遗传》PPT课件 (2)
第八章 微生物遗传
教学内容
1.掌握遗传变异的物质基础
2.掌握基因突变和诱变育种
3.了解原核生物和真菌的基因重组
4.了解基因工程原理
5.了解菌种的保藏与复壮
ppt课件
1
遗传(Heredity or Inheritance)与变异(Variation)是生物界 最本质的属性之一。
遗传是指亲代生物将自身的一整套遗传因子(基因,Gene)传 递给子代的行为或功能,它具有极其稳定的特性。
ppt课件
8
(3)S型菌的无细胞提取液试验
培养皿培养
活R菌 + S菌无细胞抽提液
长出大量R菌和少量S菌
实验说明:加热杀死的S型细菌,在其细胞内可能存在一种转 化物质,它能通过某种方式进入R型细胞,并使R形细胞获得表达S 型荚膜性状的遗传特性。
ppt课件
9
1944年,O.T.Avery等利用单细胞成分进一步证明了转化因子是DNA。
ppt课件
18
2.原核生物的质粒(Plasmid)
一种独立于微生物染色体外,能进行自主复制的细胞质遗传因 子,只控制微生物的次要性状。
(1)质粒的构型
质粒一般以共价闭合环状(covalently closed circle,简称CCC) 的超螺旋双链DNA分子存在于细胞中。
粒和R近N年A质来粒在。疏螺旋体、链霉菌和酵母菌中发现了线型双染链D色NDA体NA质
(2)质粒的大小
质粒分子的大小范围从1kb左右到1000kb,细菌质粒多在10kb
以内。每个质粒含有几个到数百个基因。每一个质细粒胞可含有1—几
百个质粒。
ppt课件
DNA
19
(3)质粒的特性
a.是细菌非必须的遗传物质。
教学内容
1.掌握遗传变异的物质基础
2.掌握基因突变和诱变育种
3.了解原核生物和真菌的基因重组
4.了解基因工程原理
5.了解菌种的保藏与复壮
ppt课件
1
遗传(Heredity or Inheritance)与变异(Variation)是生物界 最本质的属性之一。
遗传是指亲代生物将自身的一整套遗传因子(基因,Gene)传 递给子代的行为或功能,它具有极其稳定的特性。
ppt课件
8
(3)S型菌的无细胞提取液试验
培养皿培养
活R菌 + S菌无细胞抽提液
长出大量R菌和少量S菌
实验说明:加热杀死的S型细菌,在其细胞内可能存在一种转 化物质,它能通过某种方式进入R型细胞,并使R形细胞获得表达S 型荚膜性状的遗传特性。
ppt课件
9
1944年,O.T.Avery等利用单细胞成分进一步证明了转化因子是DNA。
ppt课件
18
2.原核生物的质粒(Plasmid)
一种独立于微生物染色体外,能进行自主复制的细胞质遗传因 子,只控制微生物的次要性状。
(1)质粒的构型
质粒一般以共价闭合环状(covalently closed circle,简称CCC) 的超螺旋双链DNA分子存在于细胞中。
粒和R近N年A质来粒在。疏螺旋体、链霉菌和酵母菌中发现了线型双染链D色NDA体NA质
(2)质粒的大小
质粒分子的大小范围从1kb左右到1000kb,细菌质粒多在10kb
以内。每个质粒含有几个到数百个基因。每一个质细粒胞可含有1—几
百个质粒。
ppt课件
DNA
19
(3)质粒的特性
a.是细菌非必须的遗传物质。
现代微生物遗传学-第三章质粒课件
质粒在生物能源开发中的应用
要点一
总结词
要点二
详细描述
质粒在生物能源开发中具有重要作用,可以用于构建高效 生物燃料生产菌株。
质粒可以携带与生物燃料生产相关的基因,将其转移至微 生物中,从而构建出能够高效生产生物燃料的菌株。例如 ,可以利用质粒将油脂合成酶基因转移至酵母菌中,构建 出能够高效生产生物柴油的菌株。此外,质粒还可以用于 提高微生物对光能的利用率,从而构建出能够高效生产太 阳能的微生物。因此,质粒在生物能源开发中具有重要作 用。
详细描述
20世纪60年代,科学家们开始对质粒进行更深入的研究,探索其复制机制和遗传特性。他们发现质粒可以在细菌 细胞内独立于染色体复制,并且可以在不同细菌之间转移和遗传。这些发现为后来的基因工程和分子生物学研究 奠定了基础。
质粒的遗传学研究
总结词
质粒的遗传学研究涉及到多个方面,包括质粒的复制、转录、表达以及质粒与宿主细胞 的相互关系等。
代谢能力
质粒携带的基因可以影响细菌的 代谢能力,帮助细菌在特定环境 下生存和繁殖。
质粒与细菌的进化
基因水平转移
质粒是细菌间基因水平转移的主要载体,有 助于细菌获得新的遗传物质和进化。
协同进化
质粒上的基因与其他细菌基因协同进化,形成复杂 的基因网络,影响细菌的进化方向。
适应性进化
质粒携带的基因可以促进细菌的适应性进化 ,使其更好地适应不断变化的环境。
终止子的作用
终止子是一个特殊的DNA序列,它能够终止复制子的复 制,确保质粒的复制不会无限进行下去。
质粒的复制
复制的起始
复制的调控
质粒的复制起始于复制起始位点,该 位点通常是一个特定的DNA序列,能 够被质粒编码的复制蛋白识别并与之 结合。
现代微生物遗传学课件
04 微生物突变与进化
突变类型与机制
点突变
DNA分子中单个碱基对的替换 、增添或缺失,导致基因结构
的改变。
插入突变
DNA片段的插入导致基因结构 的变异。
缺失突变
DNA片段的缺失导致基因结构 的变异。
倒位和转座
染色体结构的变异,影响基因 的表达。
突变在微生物遗传学中的应用
抗生素抗性研究
通过突变研究细菌对抗生素的抗性机制,为新药研发 提供依据。
03 微生物基因表达调控
基因表达调控概述
基因表达调控是生物体为了适应 环境变化和生长发育需要,对基
因表达进行的有序调节过程。
基因表达调控对于生物体的正常 生长、发育、代谢以及应激反应
等都起着至关重要的作用。
基因表达调控是遗传信息从 DNA转录到蛋白质过程中重要 的环节,是生物工程和基因工程
中的重要研究对象。
微生物进化
基因组学研究可以揭示微生物的进化历程和演化规律,有助于理解生 物多样性的形成和演化机制。
微生物生态学
通过分析环境样本中的微生物基因组序列,可以了解微生物在生态系 统中的作用和相互关系,为环境保护和资源利用提供科学依据。
微生物生理学和代谢途径
基因组学研究可以揭示微生物的生理特征和代谢途径,有助于发现新 的生物催化剂和药物先导化合物。
系统生物学与合成生物学
整合多层次数据,从系统生物学角度 全面理解微生物生命活动;合成生物 学将为设计和构建具有特定功能的微 生物提供强大工具。
人类微生物组研究
深入探索人体微生物组的结构、功能 及其与人类健康的关联,为疾病诊断 和治疗提供新思路。
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现代微生物遗传学课件
关于微生物遗传课件课件
假单胞菌: 具有降解一些有毒化合物, 如芳香簇化合物(苯)、农 药(2,4 dichlorophenoxyacetic acid)、辛烷和樟脑等的能 力。
6、隐秘质粒(cryptic plasmid)
隐秘质粒不显示任何表型效应,它们的存在只 有通过物理的方法,例如用凝胶电泳检测细胞抽 提液等方法才能发现。 它们存在的生物学意义,目前几乎不了解。
表型是由遗传型所决定,但也和环境有关。
微生物是遗传学研究中的明星:
微生物细胞结构简单,营养体一般为单 倍体,方便建立纯系。
很多常见微生物都易于人工培养,快速、 大量生长繁殖。
对环境因素的作用敏感,易于获得各类 突变株,操作性强。
研究微生物遗传学的意义
• 微生物是研究现代遗传学和其它许多主要的 生物学基本理论问题中最热衷的研究对象。
在应用上,很多隐秘质粒被加以改造作 为基因工程的载体 (一般加上抗性基因)
三、质粒的不亲和性
(参见 P214)
质粒之间的不亲和性、以及质粒拷贝数 的多少、能适应的宿主范围的宽窄等特 性均与质粒的复制控制类型有关
四、转座因子的类型和分子结构
是一类能在DNA分子内和DNA之间移动位置 的一段DNA序列。
2、真核微生物(啤酒酵母)的基因组
1)典型的真核染色体结构; 啤分2酒布)酵在没母1有6基条明因染显组色的大体操小中纵为。子1结3.构5×;106bp,
3)有间隔区(即非编码区)和内含 子序列;
4)重复序列多;
第三节 质粒和转座因子
质粒(plasmid):
(参见 P211)
一种独立于染色体外,能进行自主复制的细胞质 遗传因子,主要存在于各种微生物细胞中。
二、微生物基因组结构的特点
现代微生物遗传学
基因表达调控机制
转录水平调节
通过转录因子的作用,调节基因的转录起始 和效率,从而控制基因的表达水平。
转录后水平调节
通过影响mRNA的剪接、编辑、转运和稳定 性等过程,调节基因的表达水平。
翻译水平调节
通过影响蛋白质的合成速度和合成量,调节 基因的表达水平。
翻译后水平调节
通过影响蛋白质的修饰、定位和降解等过程, 调节基因的表达水平。
现代微生物遗传学
目录
• 微生物遗传学概述 • 微生物基因组学 • 微生物基因表达调控 • 微生物进化与物种形成 • 微生物遗传学应用
01 微生物遗传学概述
微生物遗传学定义
微生物遗传学是一门研究微生物基因 组结构、功能和演化的科学,主要关 注微生物的遗传物质、基因表达调控 、基因突变和重组等过程。
与基因组学相互补充,共同揭示微生物的生 物学功能。
基因组学应用
基础研究
生物技术
深入了解微生物的进化、分类和系统发育 等基础生物学问题。
改良微生物菌种,提高发酵产物的产量和 品质,推动工业生物技术的发展。
生物医药
环境科学
发掘新的药物靶点,发现具有生物活性的 小分子化合物,为新药研发提供支持。
研究微生物在生态系统中的作用,了解其 在污染物降解、环境修复等方面的功能。
3
利用现代生物技术,如高通量测序和生物信息学 分析,可以更深入地揭示物种形成的分子机制和 演化过程。
物种形成应用
01
02
03
物种形成研究在生态保 护和生物多样性保护方 面具有重要意义,有助 于深入了解生物多样性
的形成和演化过程。
物种形成研究还与农业 、林业和渔业等领域密 切相关,有助于培育新 品种和改良现有品种。
微生物遗传学课件
基因组学定义
基因组学是研究生物体基因组的学科,包括基因的发现、基因组结构、基因表达调 控以及基因组进化的研究。
基因组学研究旨在揭示生物体的遗传信息,以及这些信息如何影响生物体的表型和 功能。
基因组学研究对于理解生命的本质、疾病的发生和发展机制以及新药的研发等方面 具有重要意义。
基因组学研究方法
基因组测序
生物修复
生物修复
利用微生物对环境污染进行治理和修复的 技术,具有处理效果好、成本低等优点。
生物修复的应用
在土壤、水体、空气等污染治理领域广泛 应用,有效解决了许多环境问题,改善了
人类生存环境。
生物修复的原理
通过微生物对污染物的降解、转化和富集 等作用,将污染物转化为无害或低毒性的 物质,降低其对环境和人体健康的危害。
程,涉及到多种酶的参与。
转座重组
指DNA分子内部的转座元件在不 同位置之间移动的重组过程。转 座重组需要转座酶的催化,实现 DNA片段在不同位置的复制和移
动。
Hale Waihona Puke 突变与重组在微生物遗传学中的应用
基因工程
通过突变和重组技术,可以对微 生物进行基因敲除、敲入和基因 修饰,实现基因表达的调控和代
谢途径的改造。
微生物遗传学课件
目 录
• 微生物遗传学概述 • 微生物基因组学 • 微生物突变与重组 • 微生物基因表达调控 • 微生物进化与系统发育 • 微生物遗传学应用
01 微生物遗传学概述
微生物遗传学定义
微生物遗传学定义
微生物遗传学是一门研究微生物遗传、变异和演化的科学,主要关注微生物的基因组结构 、基因表达调控、基因突变与进化等基本问题。
通过调节翻译起始和翻译过程 来控制蛋白质的合成,如核糖 体结合位点的选择和mRNA的 稳定性等。
微生物遗传学 第二章PPT课件
❖ 碱基置换诱变剂包括碱基类似物(5-溴尿嘧 啶、2-氨基嘌呤)和碱基改造剂(亚硝酸、 羟胺、烷化剂)
14
天然碱基结构类似物- 5-溴尿嘧啶
5-溴尿嘧啶是胸腺嘧啶(T)的甲基集团 被溴原子取代后形成的结构类似物,通过分 子的互变异构显示出其诱变活性。
见图示:
15
16
17
18
19
化学诱变剂
❖ 将FC40菌株涂布在以乳糖为惟一碳源的平板 上培养时,第二天出现1~2个lac+ 回复突变 的菌落,继续培养至第7天时lac+ 回复突变的菌 落就会达到40多个。见下图:
50
51
适应突变的分子机制是什么?
❖ 对早期和后期出现的lac+ 回复突变子的突变 机制分析发现,这两类是不一样的。
❖ 后期出现的lac+ 回复突变子被认为是适应突 变所产生,大多是在lac 基因区段发生了单一 碱基的缺失,既发生了-1的移码突变,使原 来+1的移码突变得到了修正,表型为lac+ 回 复子;
❖ 波动实验借助于统计学原理设计。见实验过 程图示:
38
39
波动实验原理
❖ 适应学说预期:噬菌体的存在诱发了抗性细菌的出 现。把正生长的、对T1敏感的细菌(tons)培养物 与T1接触后,所出现的抗T1细菌(tonr)的数量在 任何生长条件下都应该是常数,既平均数=方差。
❖ 变异学说预期:抗T1细菌(tonr)是在接触T1之前 的生长过程中,由于基因自发突变而产生的,则 tonr出现的频率将依据1.抗性是否出现,2.出现时间 的早晚而呈现巨大的波动,既平均数≠方差。
基因符号表示:双冒号表示插入
lac Z 21::Tn3 ,
gal T 135::Is4 ,
14
天然碱基结构类似物- 5-溴尿嘧啶
5-溴尿嘧啶是胸腺嘧啶(T)的甲基集团 被溴原子取代后形成的结构类似物,通过分 子的互变异构显示出其诱变活性。
见图示:
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化学诱变剂
❖ 将FC40菌株涂布在以乳糖为惟一碳源的平板 上培养时,第二天出现1~2个lac+ 回复突变 的菌落,继续培养至第7天时lac+ 回复突变的菌 落就会达到40多个。见下图:
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适应突变的分子机制是什么?
❖ 对早期和后期出现的lac+ 回复突变子的突变 机制分析发现,这两类是不一样的。
❖ 后期出现的lac+ 回复突变子被认为是适应突 变所产生,大多是在lac 基因区段发生了单一 碱基的缺失,既发生了-1的移码突变,使原 来+1的移码突变得到了修正,表型为lac+ 回 复子;
❖ 波动实验借助于统计学原理设计。见实验过 程图示:
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波动实验原理
❖ 适应学说预期:噬菌体的存在诱发了抗性细菌的出 现。把正生长的、对T1敏感的细菌(tons)培养物 与T1接触后,所出现的抗T1细菌(tonr)的数量在 任何生长条件下都应该是常数,既平均数=方差。
❖ 变异学说预期:抗T1细菌(tonr)是在接触T1之前 的生长过程中,由于基因自发突变而产生的,则 tonr出现的频率将依据1.抗性是否出现,2.出现时间 的早晚而呈现巨大的波动,既平均数≠方差。
基因符号表示:双冒号表示插入
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正。
• 四、质粒的分离、检测与纯化 – 质粒分离方法:碱变性法 • 菌体的培养和收集 • 溶菌 • 碱变性处理 • 离心分离 • 有时为了快速提取质粒DNA,可以在提取液碱变性 后,用pH4.8的醋酸钠高盐缓冲液调节pH到中性, 这时染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构, 而即使变性的质粒可以恢复到原来的构型,再通过 离心,这样可以缩短提取质粒的时间。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 2.复制起点区oriV的 功能和pBR322质粒 • 复制起点区oriV 功能与质粒载体 的构建、寄主范 围
– 6.致病性质粒: • 根癌土壤农杆菌的Ti质粒;以及破伤风梭菌、肉毒 梭菌和大肠杆菌等都存在致病性质粒。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 7. 共生固氮质粒 • 根瘤菌普遍喊有该类质粒。 • 包括共生质粒和非共生质粒,非共生质粒对共生作 用可有正或负的调节作用。
– 8. 隐蔽质粒(cryptic plasmid) • 酵母的2m质粒(p171) – 长为2m的6kb的环状双链DNA分子 – 位于酵母细胞核内,50~100拷贝 – 只携带与复制和重组有关的4 个基因,无遗传表 型 – 质粒上有两个600bp长的IR,被一个2.7kb区域和 一个2.3kb小区域所间隔 – 两个IR上都有一个专一重组位点(FRT),经过重 组,可使质粒互变异构成A型和B型。
• 附加体:整合在染色体上,或游离,并能携带宿主的 染色体基因。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 一、质粒的发现 – F质粒(1946年),第一个被发现的质粒 – 20世纪50-70年代:抗性质粒的大量研究,以及其他 质粒的发现 – 20世纪70年代后,质粒广泛应用于遗传工程和分子 生物学研究中。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 二、质粒的复制 – 1.质粒复制的方式(P120)
• 质粒的复制起点称 为oriV,大肠杆菌为 oriC。
• 复制主要通过型复
制和滚环复制之一
进行。其中以型复
制为主(包括单向 和双向)。
• 质粒只编码一种或 少数几种与复制有 关的蛋白质,其他 复制蛋白都来自宿 主。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 2.原生质体消除法 • 使待消除质粒的菌株在一定条件下形成原生质体, 在再生后生长的菌株中可出现高频率质粒消除菌。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 二、遗传转移 – 将质粒导入已经消除了该质粒的原宿主细胞,比较 导入前后表型性状的差异或恢复程度。
• 三、分子杂交 – 在初步确定某菌株可能含有质粒的情况下,利用已 知表型性状的基因片段作探针进行分子杂交,来检 测其菌株是否含有该种质粒。
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第二节 质粒编码的遗传表型
• 大多数质粒均控制着宿主细胞的一种或几种特殊性状, 具有一定的表型,质粒可依据其表型不同可划分为以 下几类: – 1.致育质粒 – 2.抗药性质粒 • 组成:转移区和抗性决定子 • 抗药的机制:改变抗生素作用的靶点;修饰抗生 素;组织抗生素进入;产生一种酶能代替宿主细 胞中被抗生素作用的靶点。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 3.产生抗生素的质粒 • 细菌素:细菌产生的一般只能抑制或杀死种内不同 亚种或菌株中敏感细菌的特殊多肽类代谢产物。 • Col质粒:10种,有非接合型和接合型之分。
– 4.产生毒性的质粒(BT) – 5.降解质粒:
• 假单胞菌属是一类能广泛利用有机化合物进行生长 的细菌。其体内含有大量的降解质粒。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 二、质粒的命名原则 – 最初发现的质粒由研究者根据表型、大小等特征自行 命名。(F因子、R质粒、Col质粒等) – 1976年Novick提出了质粒命名原则: • 质粒名称一般由三个英文字母及编号组成; • 第一个字母一律小写p表示(plasmid) • 后两个字母要大写,可以采用发现者人名、实验室 名称、表型性状或其他特征的英文缩写。 • 编号为阿拉伯数字,用于区分同一类型的不同质粒。 (pUC18, pUC19等)
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第三节 质粒的检测
• 检测质粒的方法主要根据质粒的(遗传学特性)和 (分子结构特性)。 – 遗传特性:独特的表型、转移、人为消除等。 – 分子结构:cccDNA和染色体相比对理化因子有更 强的抗性。
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• 一、质粒消除(理化因子和生物学方法) – 理化因子消除法 • 消除剂:吖啶类,EB,某些抗生素,高温,UV等 • 如何判断某一遗传性状的丧失是质粒消除的结果还 是染色体基因突变的结果呢? – 回复突变情况 – 突变率 • 理化因子消除质粒的作用机制: – 对质粒本身的复制和分离产生抑制作用,在生长 中被淘汰 – 选择性抑制带有质粒的菌的生长。
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第一节 质粒的发现和命名
• 质粒: – 存在于细菌、真菌等微生物细胞中、独立于染色体 外、能进行自我复制的遗传因子。 – 对于宿主,一般是非必需的 – 通常是共价(covalent)、闭合(closed)、环状(circular) 双链DNA.(但也有例外:线状DNA,RNA)
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– 纯化和检测方法 • 琼脂糖凝胶电泳(质粒3种构型泳动速度不同,琼 脂糖浓度,EB染色,分子量的判断) • 氯化铯-EB密度梯度离心 • 电镜观察
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第四节 质粒的复制与调节
• 一、质粒的大小和拷贝数 – 1.大小测定 • 表示方式:MD或kb,1MD的双链DNA≈1.65kb。 • 测定方法:电泳、电镜、测序。 • 大小范围:1~200kb,个别800~1000。 – 2.质粒的拷贝数 • 严紧型质粒(stringent plasmid)或低拷贝质粒; • 松弛型质粒(relaxed plasmid)或高拷贝质粒。(氯霉 素可抑制细胞分离,终止染色体复制,但松弛型质 粒可持续复制,其拷贝数可达到1000~3000)。
• 四、质粒的分离、检测与纯化 – 质粒分离方法:碱变性法 • 菌体的培养和收集 • 溶菌 • 碱变性处理 • 离心分离 • 有时为了快速提取质粒DNA,可以在提取液碱变性 后,用pH4.8的醋酸钠高盐缓冲液调节pH到中性, 这时染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构, 而即使变性的质粒可以恢复到原来的构型,再通过 离心,这样可以缩短提取质粒的时间。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 2.复制起点区oriV的 功能和pBR322质粒 • 复制起点区oriV 功能与质粒载体 的构建、寄主范 围
– 6.致病性质粒: • 根癌土壤农杆菌的Ti质粒;以及破伤风梭菌、肉毒 梭菌和大肠杆菌等都存在致病性质粒。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 7. 共生固氮质粒 • 根瘤菌普遍喊有该类质粒。 • 包括共生质粒和非共生质粒,非共生质粒对共生作 用可有正或负的调节作用。
– 8. 隐蔽质粒(cryptic plasmid) • 酵母的2m质粒(p171) – 长为2m的6kb的环状双链DNA分子 – 位于酵母细胞核内,50~100拷贝 – 只携带与复制和重组有关的4 个基因,无遗传表 型 – 质粒上有两个600bp长的IR,被一个2.7kb区域和 一个2.3kb小区域所间隔 – 两个IR上都有一个专一重组位点(FRT),经过重 组,可使质粒互变异构成A型和B型。
• 附加体:整合在染色体上,或游离,并能携带宿主的 染色体基因。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 一、质粒的发现 – F质粒(1946年),第一个被发现的质粒 – 20世纪50-70年代:抗性质粒的大量研究,以及其他 质粒的发现 – 20世纪70年代后,质粒广泛应用于遗传工程和分子 生物学研究中。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 二、质粒的复制 – 1.质粒复制的方式(P120)
• 质粒的复制起点称 为oriV,大肠杆菌为 oriC。
• 复制主要通过型复
制和滚环复制之一
进行。其中以型复
制为主(包括单向 和双向)。
• 质粒只编码一种或 少数几种与复制有 关的蛋白质,其他 复制蛋白都来自宿 主。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 2.原生质体消除法 • 使待消除质粒的菌株在一定条件下形成原生质体, 在再生后生长的菌株中可出现高频率质粒消除菌。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 二、遗传转移 – 将质粒导入已经消除了该质粒的原宿主细胞,比较 导入前后表型性状的差异或恢复程度。
• 三、分子杂交 – 在初步确定某菌株可能含有质粒的情况下,利用已 知表型性状的基因片段作探针进行分子杂交,来检 测其菌株是否含有该种质粒。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
第二节 质粒编码的遗传表型
• 大多数质粒均控制着宿主细胞的一种或几种特殊性状, 具有一定的表型,质粒可依据其表型不同可划分为以 下几类: – 1.致育质粒 – 2.抗药性质粒 • 组成:转移区和抗性决定子 • 抗药的机制:改变抗生素作用的靶点;修饰抗生 素;组织抗生素进入;产生一种酶能代替宿主细 胞中被抗生素作用的靶点。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 3.产生抗生素的质粒 • 细菌素:细菌产生的一般只能抑制或杀死种内不同 亚种或菌株中敏感细菌的特殊多肽类代谢产物。 • Col质粒:10种,有非接合型和接合型之分。
– 4.产生毒性的质粒(BT) – 5.降解质粒:
• 假单胞菌属是一类能广泛利用有机化合物进行生长 的细菌。其体内含有大量的降解质粒。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 二、质粒的命名原则 – 最初发现的质粒由研究者根据表型、大小等特征自行 命名。(F因子、R质粒、Col质粒等) – 1976年Novick提出了质粒命名原则: • 质粒名称一般由三个英文字母及编号组成; • 第一个字母一律小写p表示(plasmid) • 后两个字母要大写,可以采用发现者人名、实验室 名称、表型性状或其他特征的英文缩写。 • 编号为阿拉伯数字,用于区分同一类型的不同质粒。 (pUC18, pUC19等)
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
第三节 质粒的检测
• 检测质粒的方法主要根据质粒的(遗传学特性)和 (分子结构特性)。 – 遗传特性:独特的表型、转移、人为消除等。 – 分子结构:cccDNA和染色体相比对理化因子有更 强的抗性。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
• 一、质粒消除(理化因子和生物学方法) – 理化因子消除法 • 消除剂:吖啶类,EB,某些抗生素,高温,UV等 • 如何判断某一遗传性状的丧失是质粒消除的结果还 是染色体基因突变的结果呢? – 回复突变情况 – 突变率 • 理化因子消除质粒的作用机制: – 对质粒本身的复制和分离产生抑制作用,在生长 中被淘汰 – 选择性抑制带有质粒的菌的生长。
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
第一节 质粒的发现和命名
• 质粒: – 存在于细菌、真菌等微生物细胞中、独立于染色体 外、能进行自我复制的遗传因子。 – 对于宿主,一般是非必需的 – 通常是共价(covalent)、闭合(closed)、环状(circular) 双链DNA.(但也有例外:线状DNA,RNA)
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
– 纯化和检测方法 • 琼脂糖凝胶电泳(质粒3种构型泳动速度不同,琼 脂糖浓度,EB染色,分子量的判断) • 氯化铯-EB密度梯度离心 • 电镜观察
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
第四节 质粒的复制与调节
• 一、质粒的大小和拷贝数 – 1.大小测定 • 表示方式:MD或kb,1MD的双链DNA≈1.65kb。 • 测定方法:电泳、电镜、测序。 • 大小范围:1~200kb,个别800~1000。 – 2.质粒的拷贝数 • 严紧型质粒(stringent plasmid)或低拷贝质粒; • 松弛型质粒(relaxed plasmid)或高拷贝质粒。(氯霉 素可抑制细胞分离,终止染色体复制,但松弛型质 粒可持续复制,其拷贝数可达到1000~3000)。