HBV基因分型的检测方法及临床意义

病毒致病性
HBV基因型与肝硬化的关系
病毒致病性
HBV基因型和肝细胞癌的关系
KAO等在进一步对67 例无症状HBV携带,103 例慢性肝
炎,32 例肝硬化,20 例肝细胞癌患者进行基因分型研究中发现,
各组均以B/ C 型为主,C基因型所占比例按上述顺序逐渐增大, 而B 基因型的比例逐渐减小;与B 基因型比较,C 基因型在肝硬 化及50 岁以上的肝细胞癌患者中比例较高,而B 基因型与50 岁 以下,特别是35 岁以下的肝细胞癌患者有关。
Patients Without HBsAg Seroclearance (n = 50)
1 (3.3) 16 (53.3%) 10 (33.3%) 2 (6.7) 1 (3.3) -
2 (4) 15 (30%) 32 (64%) 1 (2)
Among patients with single genotype B or C, those with HBsAg seroclearance had a higher proportion of genotype B and lower proportion of genotype C when compared to controls; odds ratio 3.41; (95% CI, 1.26-9.28); P = .014.
HBV基因型与抗病毒药物敏感性的关系
不同基因型HBV 感染对干扰素治疗的反应有差别
Kao 对58 例慢性乙型肝炎患者给予干扰素治疗48周,B 基因型和C 基因型的完全应答率(血清ALT 恢复正常,HBeAg 消除,HBV DNA 转阴) 分 别为41％和15％ ,说明干扰素对B基因型治疗效果较好。
88.9
50
42.7
81.4
40%
20%
11.1
25
32.8
17.2
沈阳
北京
广州
上海
HBV基因型的临床意义
近年来研究发现, HBV基因型具有如下意义
HBV标志物清除 病毒致病性 乙型肝炎的病程及转归 药物敏感性
与HBV血清型比较,HBV 基因型具有更加重要的意义。
HBV标志物清除
HBV基因型和ＨＢｅＡｇ的清除的关系
HBV基因分型检测方法及其意义
杭州博赛基因诊断技术有限公司
HBV的基因型和分布
1. 根据ＨＢＶ全基因核苷酸序列异源性≥８％或者Ｓ基因 区核苷酸序列异源性≥４％，将不同病毒株分为不同的 基因型，迄今为止，ＨＢＶ可以分为８个基因型，即Ａ、 Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｇ和Ｈ型。 2. A B D E F G H 型：西欧,北欧、北美洲及非洲地区; 型和C 型：亚洲,澳大利亚; 型：中东、北非和南欧; 型：非洲撒哈拉沙漠地带; 型：美国; 型：法国和美国; 型：尼加拉瓜、墨西哥,及美国加里弗尼亚地区。
核酸序列测定法检测HBV基因 分型方法

首先采用末端终止法，获得待检样本的 核酸序列，通常按照国际惯例选择HBV S 区基因进行扩增，获得HBV S区的序列， 然后将该序列与国际基因库中HBV 各个 基因型的标准序列进行比对，建立亲缘 树，分析待检HBV与何种基因型的遗传 距离最近，即判断为该种基因型。
临床资料显示，ＨＢｅＡｇ的清除可能与ＨＢＶ基因型有关。
与Ｂ基因型相比，Ｃ基因型有更高的ＨＢｅＡｇ阳性率，分别为 １６％与５３％。
Baidu Nhomakorabea
Ｂ基因型的自发性ＨＢｅＡｇ清除要比C基因型早１０年，并且在 ＨＢｅＡｇ清除后，肝脏生物化学指标持续正常。
HBV标志物清除
HBeAg累积清除率
Journal of Medical Virology 70:350–354 (2003)
HBV标志物清除
HBV基因型与HBsAg转阴 的关系
No. of Patients Single genotype* A (%) B (%) C (%) D (%) Mixed genotypes A + D (%) B + C (%)
*
Patients With HBsAg Seroclearance (n = 30)
HBV的基因型和分布
亚洲部分地区的基因型分布
100% 80%
32 81.4
HBV基因型B
84.7
60% 40%
53
HBV基因型C 其他基因型
20%
17.2 12.2
0% 中国 (上海） 台湾 日本
国内部分地区基因型分布
100%
25
2.5 23
1.4 其它基因型 B、C混合型 C型 B型
80%
60%
HBV 亲 缘 树 分 析
B基因型
C基因型
B、C混合型

荧光PCR检测特点：



1.准确性好:与核酸序列测定分型比较，两者结 果吻合率100%。 2.有效防污染: PCR反应和分析在完全闭管条件 下进行，同时采用了d-UTP-UNG系统，有效防范 PCR产物污染，提高检测结果的可靠性。 3.操作简单、耗时短、结果判断直观明确 :试 剂在荧光PCR检测仪上进行扩增和分型分析，不 需进行电泳、核酸纯化、紫外灯观测、测序反 应等步骤。只需0.5~1.2小时即可完成PCR过程， 有利于提高报告速度。只需根据双通道荧光增 长曲线或Ct值即可直接判断HBV基因型。
Hepatology. 2004 Jun;39(6):1694-701.
HBV 基因型与病毒致制病性的关系
• 日本学者Shiina分析了1 744 例HBsAg 阳性者的基因
型与肝功能异常的关系后发现,与B 基因型相比,C 基 因型的肝功能异常更为常见。
• C 基因型引起的临床表现及组织学损伤更严重。
Kao JH, et al. J Hepatol 2000;33:998–1002.
核苷类药物疗效与HBV基因型的关系。
注：最近文献倾向于没有两者没有差异，但是基因型B除外。 Intervirology 2003;46:373–376
检测基因分型的常见方法

基因测序法 PCR-RFLP ELISA 生物芯片 实时荧光PCR法