乳铁蛋白基因的获取
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
摘要:本实验通过基因工程的方法进行编码目的基因的DNA的制备,主要通过以下形式:真核生物mRNA的获取、表达乳铁蛋白的mRNA获取纯化、通过mRNA反转录cDNA等一系列步骤完成。
关键字:目的基因获取基因工程乳铁蛋白
cDNA的制备PCR技术
目录
一、实验目的 (2)
二、真核生物组织中获取基因简介 (2)
三、RNA的获取 (3)
四、相应DNA的获取处理 (4)
五、获取编码目的基因的mRNA方法·4
六、cDNA获取 (5)
七、心得体会 (6)
八、参考文献 (6)
RT-PCR法获取人乳铁蛋白基因
一、实验目的
乳铁蛋白出现在动物乳,特别是初乳中,为婴幼儿提供多种生物功能,尤其是调节免疫和对病原微生物的抵御功能。
乳铁蛋白是从牛乳中提取的一种安全可靠的天然物质,其在食品方面的应用已得到许多国家和地区法律的承认。
随着乳铁蛋白作用机制的不断阐明和开发应用范围的扩大,乳铁蛋白在疾病防治、营养补充、食品和药品防腐、化妆品等方面有广阔的应用前途。
基于众多的研究成果和试验,在婴幼儿配方食品中添加乳铁蛋白带来重大意义。
在婴幼儿配方奶粉中添加乳铁蛋白,既可满足婴儿生长发育的需要,同时又对婴儿的健康起到保护作用。
目前在全球的农业发达国家像新西兰、瑞士、澳大利亚、荷兰等,不仅拥有着全球最优质的奶源,而且,更加注重免疫、吸收等功能效果。
在这些国家的高端婴幼儿配方奶粉当中,多数有添加乳铁蛋白这一重要的母乳成分,例如瑞士百立乐金装婴幼儿配方奶粉、美素奶粉等。
应用人群
1.孕产妇:孕产妇补充乳铁蛋白,可以提高其抵抗力,有效预防或治疗孕期、哺乳期的细菌、病毒性感染;同时,促进铁吸收,预防孕产妇贫血。
2.非母乳喂养、混合喂养的婴幼儿:乳铁蛋白是母乳中的核心免疫蛋白,能帮助婴幼儿抵抗细菌、病毒等有害微生物,预防病毒引起的呼吸道感染及腹泻等婴儿常见疾病;同时还可以促进婴儿的生长发育和增强造血功能,为婴儿构筑起健康成长的第一道防线,“吃母乳的宝宝少生病”正是这个道理。
遗憾的是,目前市场上的婴幼儿配方奶粉中很少有添加乳铁蛋白的产品,这也是配方奶粉与母乳的最本质区别。
因此,对非母乳喂养儿、混合喂养儿,食用配方奶粉的同时,额外补充乳铁蛋白,可以大大改善配方奶粉的不足,使其营养成分更趋向于母乳!
3.缺铁性贫血者:乳铁蛋白能高效促进铁吸收,临床试验证明,铁与乳铁蛋白结合后吸收率是单纯补铁的4倍。
缺铁性贫血者在补铁时配合摄入乳铁蛋白,可达到减少铁制剂摄入量,增强补铁效果的作用,同时,由于乳铁蛋白的摄入,还可以明显缓解铁对肠道的刺激。
4.免疫力低下者:体弱多病者大多抵抗力低下,乳铁蛋白能够帮助他们激发、建立、修复、完善免疫系统,增强抗病能力。
人体实验
1.有助于肠道比菲德氏菌的繁殖。
2.除了干扰素外,乳铁蛋白是第一个被发现具有抗C型肝炎的活性物质,可以减少血浆中HCV-RNA值(其值可作为C型肝炎病毒活性高低的评估)。
3.减少导致胃溃疡重要原因幽门螺旋杆菌
H.pylori的数目
二、真核生物中基因获取方法简介
目的基因制取策略有直接获取和间接获取。
对于一些低等的生物一般用直接法,而像人这样的高等动物,基因组比较复杂,而且还没有研究清楚,所以一般用间接获取法。
常用的有人工合成法,逆转录PCR法,构建基因文库法等。
其中以逆转录PCR(RT-PCR)法最常用。
逆转录PCR(RT-PCR)的基本步骤如下:
1,总RNA的提取
2,mRNA的纯化
3,第一链cDNA的合成
4,PCR扩增
三、RNA的获取
实验方案:用氯化锂-尿素从乳房组织中分离RNA。
此法成功的关键:组织匀浆时间短,能够在一分钟内完成。
这期间将试管浸没在冰水中。
1、实验前所有缓冲液和试管必须预冷到4℃,保证核酸酶的活性最低
2、将称量盘置于干冰上放置数分钟,使组织样品没有融合就可以精确称量
3、将适当重量的组织迅速转移到预冷的50ml锥形瓶中,加入10倍体积的氯化锂缓冲液
4、把锥形瓶置于冰水浴中,用Polytron匀浆器匀浆,总时间不超过一分钟。
5、把匀浆液转移到预冷的15ml聚丙烯锥形管中。
将装有匀浆液的试管-20摄氏度过夜。
6、第二天早晨,将管子置于离心机的转子内,以5000×g于4离℃心75分钟。
7、离心后,倒出上清液,用无尘纸吸干离心管的溶液。
8、每管加入8~10ml冷的3mol/L氯化锂,涡旋半分钟。
9、样品以5000×g于4离心℃45min。
10、重复步骤6~8。
11、将沉淀重新悬浮于2.5mlTE缓冲液或SDS缓冲液(10mmol/Ltris,0.1mmol/LEDTA,0.5%SDS)中。
12、加入150微升5mol/L氯化钠,温和涡旋混匀。
13、如果第一步的材料是装在15ml聚丙烯塑料管中,加入等体积修改后的酚。
否则必须将其转移到离心管中。
然后小心涡旋将其混匀。
(修改后的酚缓冲液是等体积的Tris—SDS缓冲液(100mmol/T氯化钠,1mmol/TEDTA,10mmol/LTris,0.5%SDS))
14、与4℃1000×g离心10min。
15、将上层水样移至新的聚丙烯塑料管中。
16、水相中加入等体积的酚:氯仿:异戊醇,小心涡旋混匀。
17、于4 ℃1000×g离心10min。
18、将上层水相移动到新的聚丙烯塑料管中,如果有蛋白质界面,切勿转移界面。
19、最后用等体积氯仿:异丙醇(24;1)抽提一次。
于4℃以1000×g 离心样品3min。
20、将上层水相移至已经在冰上预冷的不含RNased的玻璃管中,加入3倍体积的100%乙醇。
21、将玻璃管置于-20℃℃过夜,最大量的回收RNA。
22、将玻璃管置于橡皮套管中,置于预冷的离心机转子中于4℃9000×g离心30min。
23、离心结束后,小心倒出上清液。
24、用75%乙醇,25%25无RNase的水洗涤RNA沉淀。
温和涡旋玻璃管,于4℃9000×g离心15min。
25、重复步骤22~24俩次,总共洗涤3次。
26、用5ml无水乙醇再洗涤RNA沉淀一次,温和涡旋于4℃以9000×g离心10min。
27、在空气中干燥玻璃管中的RNA沉淀。
但不可以干燥的太彻底。
28、尽可能用最少体积的无菌水或TE缓冲液(10mmol/L Tris,PH 7.5,0.1mmol/LEDTA
)悬浮RNA。
29、取1微升RNA溶液,用分光光度计测量RNA溶液浓度。
然后用适量的RNA溶液上变性琼脂凝胶,根据电泳结果判断分离RNA的样品。
30、RNA溶液分装,置于-80℃。
四、编码目的基因的mRNA获取
(一)、实验方案;用磁珠纯化mRNA
(1)、从总的RNA中分离mRNA。
1)、75微升总的RNA估计含有1~4微克的mRNA。
将总的RNA 溶解于100微升不含RNase的水或TE缓冲液中。
如果RNA样品的浓度低于75ug/100ul,加入等体积的2×结合缓冲液(1mol/LLIcl,20mmol/Ltris-cl,PH7.5,2mmol/LEDTA)2)、在65℃加热RNA溶液2min。
3)、当样品加热变性时,从重悬的储备液中取出1mgDynabeadsoligo(dt)25并转移到不含有RNase的微型离心管中。
将离心管置于磁铁架。
30s后再离心管依然置于磁铁架时用微型移液管彻底除去上清液。
(2)、磁珠纯化mRNA
1)、将100ul2×结合缓冲液加入到含有磁珠的微型离心管中,同样,在离心管置于磁铁架时彻底除去上清液。
2)、从磁铁架取出离心管,放在微型离心管架上。
将100ul2×结合缓冲液加入到磁珠中,轻轻弹动磁珠重悬,如果RNA样品在第一步开始时已经在结合缓冲液中稀释,这一步就不必加结合缓冲液了。
3)、将热变性RNA加入磁珠悬浮缓冲液中,温和混合。
在室温下杂交5min。
然后进行RNA回收。
以备下步用。
五、获取表达乳铁蛋白的mRNA
一、实验方案:S1核酸酶保护法定量测定特定的mRNA
(一)、基本原理:核酸酶保护实验是定量特异转录产物非常灵敏和精确的方法。
在这种方法中探针和靶RNA间的杂交是在高严谨度条件下的溶液杂交的方式进行的。
杂交反应产物随后用一种单链特异的核酸酶消化,这种核酸酶一般没有双链分子的亲和力。
因此,任何未掺入双链的分子都会被降解,最终被保护的片段可以用乙醇沉淀回收。
(二)、实验步骤
1、戴手套。
整个实验过程都要使用无RNase的材料、试剂、技术。
2、在一个微量离心管中,混合20~30ug的细胞RNA和足量的载体RNA,是总量达到100ug,加入大约1×106cpm的探针(该探针可以用化学合成法合成,也可以体外转录,在此不详细说明)。
用二乙醇基焦炭酸酯处理的水
吧反应体积调到100ug。
一定要准备一个只含有载体RNA和探针的负对照,负对照应该没有保护片段。
3、加入11ug 、PH5.2、3mol/L乙醇钠和250ug冰冷的95%的乙醇共沉淀样品。
载体和探针。
-20℃过夜。
4、离心收集沉淀。
弃上清液,沉淀用70%乙醇洗涤。
弃乙醇,倒置离心管晾干沉淀。
5、沉淀重新溶于20ugS1杂交缓冲液中(80%新鲜的去离子甲醛胺,40mmol/LPIPES,PH 6.4,400mmol/LNacl,1mmol/LEDTA,PH 8.0)。
上下吸吹样品至少20次,确保完全溶解。
6/85℃水浴加热RNA样品10min,使其完全变性。
6、快速离心5s将杂交混合物收集到管底。
把离心管立刻置于预热好的50℃水浴保温3h。
7、用160ugDEPC处理的水稀释反应混合液。
加入20ug10×的随S1核酸酶买来的缓冲液。
8、加入足够的S1核酸酶到酶的终止浓度为200~400u/ml。
9、短暂离心将所有液体收集到管底,37摄氏度温浴1h。
抽提反应物
10、用等体积的酚:氯仿:异丙醇(25:24:1)抽提反应物。
最高离心速度离心2min分层。
11、小心地把水相(上层)转移到一个新的离心管中。
加入1ul 20mg/ml 的糖原。
加入2.5倍体积95%乙醇,沉淀在核酸酶消化反应中被保护的杂交分子。
12、将离心管在干冰上放置15min。
13、离心收集沉淀。
以备下步用。
六、cDNA的获取
(一)、AMV催化的cDNA的第一链的合成
1、准备混合反应液1
组分每个反应的量
水5ul
dNTP(10mmol/L)1ul
随机引物(1.0ug/ul)1ul
Oligo(dT)1ul
2、将8ul混合反应液1加到反应罐中。
3、加2ulRNA。
4、反应管70℃加热5min,冰上放置2min。
这步使RNA变性。
5、准备混合反应液2
组分每个反应的量
水2ul
10×第一链反应液1ul
RNasin(20ug/ul)1ul
AMV反转录酶(20ug/ul)1ul
6、将10ul的混合液2加到变性RNA的管中。
7、2℃5温育5min。
8、37或42℃温育60min。
9、样品在99摄氏度加热5min灭活反转录酶。
(二)、PCR反应扩增cDNA
1、购买PCR试剂,用来制备PCR总反应液。
通常要制备50ul的反应体系:取5ul10×PCR缓冲液,3ul25mmol/LMgcl2,终浓度为0.1umol/L的上游引物,终浓度为0.1umol/L的下游引物,0.5ulTaqNDA聚合酶,加水至48ul
2、将总的混合液装到一定数量的反应管中,每管48ul。
3、在每个反应管中加入2ul相应的cDNA第一链的产物。
4、如果没有热盖的热循环仪时,则在每个反应管中加入30ul的矿物油覆盖反应液。
5、使用以下的通用循环程序。
起始模板的解链94℃2min
循环:30轮
变性94℃30s
退火55℃30s
延伸72℃1min
最终的延伸72℃5min
保存4℃直到用
七、心得体会
通过本次课程设计,我感触颇多但是由于篇幅有限,在此就从简概括了。
首先,我深深得体会到,我们本科阶段所学的知识相当的有限而且只是理论,用本科所学不能解决实际的实验问题。
其次,从真核生物特别是人的组织中提取RNA是相当得复杂和麻烦的。
而且有相当多的干扰因素如RNA酶等。
所以提取真核生物组织中的RNA时必须严格遵守实验教程。
最后,本次设计我通过查阅大量的资料,学到了相当多的知识,这些知识是在本科的教材上无法学到的。
所以这样的课程设计是很有意义的,应该继续开展下去。
八、参考文献
1[美]R.E.法雷尔.RNA分离与鉴定实验指南—RNA研究方法. 北京:化学工业出版社, 2008
2屈伸,刘志国. 分子生物学实验技术. 北京:化学工业出版社, 2008
3 吴乃虎. 基因工程原理. 北京::科学出版社, 2010
4 贺淹才. 基因工程概论. 北京:清华大学出版社, 2010
5 孙明. 基因工程. 北京: 高等教育出版社,2006。