Nature Microbiology：植物根系分泌物影响菌群结构

Nature Microbiology：植物根系分泌物影响菌群结构

Introduction1、rhizolsphere与microbiota① Rhizosphere在生态中存在的意义② 在rhizosphere中，植物与微生物co-evolution上亿年，二者存在interaction，并且形成某些pattern③ rhizosphere effect指2个方面：① 植物有选择的富集土壤微生物；②植物根的生长活性④ 目前关于rhizosphere与微生物的研究现状：植物的发育影响土壤微生物的组成和功能，很少有人研究植物分泌物的分子化学机理对rhizosphere microbiota的影响2、plant exudates 与microbiota① plant exudates虽然种类很多，但大部分都是photosynthesis-derived carbon【11-40%】② plant exudates的组成会受到植物自身与环境的影响③ 已有的研究表明：plant exudates影响植物rhizosphere microbiota 的组成：会吸引有益微生物，提高植物对环境的适应性④ 已有的研究已经证实很多小的信号分子影响rhizosphere中植物与微生物的互作，但这些小分子只是exudates中的一小部分，而对于root exudate chemistry与microbial substrate preferences 之间的interaction还不清楚，作者希望研究这种interaction，找到rhizosphere中微生物群体的组成和演化的patternResult 1：分离培养了土壤中的细菌1、分菌的理论支持土壤是一个微生物的bank，植物的微生物全部来源

于此；rhizosphere对微生物的选择不是随机的，是有pattern 的。为了研究燕麦root exudates与微生物间的关系，获得微生物是关键。2、细菌的分离培养【图1】① 用多种培养基【暗示土壤中的细菌的生长需求不同】去分离soil【来源于燕麦的主产区】中的细菌【他们分离获得了Acidobacteria】② 获得了289株细菌，其中39株测了基因组【16s可区分，覆盖全部phylum，实际环境中丰度高】3、将39株菌进行实际功能注释借助之前环境样品的数据，将39株菌分为【图2】：Group在燕麦生长过程中的表现方式Phylum组成positive responderIncreased【19】Proteobacteria 和Actinobacterianegative responderDecreased【8】Actinobacteria和Firmicutes