red同源重组步骤
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Red同源重装步骤
1.制备BL21及HMS的red同源重组大肠杆菌。
(1)目前有pKD46质粒,BL21化学感受态,HMS174电击感受态。
(2)实验准备
①LB液体培养基(无抗/氨苄抗性),LB固体培养基(4个),氨苄抗生素,甘油
(3)实验操作
①化学转化
1)-80℃取出一只感受态(100ul),手指融化后插入冰上,放置5min。
2)在超净台内,加入2ul连接好的pKD46质粒,用手指轻柔的拨动使其混匀,
然后插入冰中静置30min;
3)42℃热激90s,重新插回冰中放置5min;
4)在超净台内每支EP管中各加1mL的LB液体培养基,30℃、200rpm摇晃
培养1h;
5)然后在常温、3000rpm条件下,离心5min。
弃部分上清,留100μL左右
留作吹悬,涂布在含有氨苄青霉素()的LB固体培养基上,30℃倒置培
养过夜。
6)次日,挑选合适大小的单菌落至含有氨苄青霉素抗性的LB液体培养基中,
在30℃、220rpm条件下摇晃培养至合适浓度,加15%-30%甘油保菌,保
存至-80℃冰箱中。
②电击转化
1)-80℃取出一只感受态(100ul),手指融化后插入冰上,放置2min。
2)在超净台内,加入2ul连接好的pKD46质粒,用手指轻柔的拨动使其混匀,
然后插入冰中静置2-3min;
3)电击2500v后,立即加入提前预热好的培养基,30℃、200rpm摇晃培养
1h;
4)然后在常温、3000rpm条件下,离心5min。
弃部分上清,留100μL左右
留作吹悬,涂布在含有氨苄青霉素()的LB固体培养基上,30℃倒置培
养过夜。
5)次日,挑选合适大小的单菌落至含有氨苄青霉素抗性的LB液体培养基中,
在30℃、220rpm条件下摇晃培养至合适浓度,加15%-30%甘油保菌,保
存至-80℃冰箱中。
2.red同源重组电击感受态制备
(1)实验准备
①泡酸:两个250mL锥形瓶,一个培养皿。
②灭菌:
1)活化培养基25ml(1mL*3*2)
2)50*2感受态培养基
3)一个过滤L-阿拉伯糖的滤器
4)100ml左右去离子水
5)150ml左右15% 甘油(22.5mL甘油)
6) 1.5ml ep管枪尖(黄枪尖要剪)50ml离心管*4
③试剂:
1)Amp 抗生素()
2)10M的L-阿拉伯糖(1.80g加入1.2ml水中,过滤。
)按1:100稀释。
(2)实验操作
①将平板上的生长的30℃,200rpm 过夜活化,次日按1:100转接摇瓶。
(50
加0.5)
(3)OD在0.25左右,加入L-阿拉伯糖至终浓度为100mM,诱导1.5-2h。
(菌浓度不宜
太过)
(4)将培养好的菌液转入到50mL离心管里,4000rpm,15-20min 去上清。
(5)每个离心管内加入20mL ddH2O悬起清洗,4000rpm,15-20min 去上清。
(6)20mL 15%甘油悬起清洗,4000rpm,15-20min 去上清。
(7)重复(5)
(8)最终沉淀用1mL 15%甘油悬起,分装100uL/支,液氮速冻然后转-80℃保存备用。
3.打靶片段扩增
(1)实验准备
①PCR扩增:上下游引物,模板(氯霉素基因),primer star,pcr仪
②胶回收:1%琼脂糖凝胶,胶回收试剂盒,去离子水。
(2)实验操作
①根据待敲基因上下游的序列和cat基因序列分别设计上下游同源臂和cat基因
PCR上下游引物。
以及设计将各段拼接起来的打靶序列全长上下游引物。
送公
司合成以上引物。
②加相应体积的纯水溶解各引物,按水33μL,DNTP4μL,5×buffer 10μL,primer
star 0.5μL,上下游引物各1μL,模板0.5μL比例配置PCR反应液,每支分装
50μL。
根据各自的退火温度、延长时间和循环数进行扩增。
③配置25mL1%的琼脂糖凝胶:称取0.25g琼脂糖凝胶至三角瓶中,加30mL 1×
TAE。
微波炉加热大约1分钟左右,使其全部熔化。
④然后自然冷却到60-70摄氏度,将其缓慢的倒入已经插好梳子的制胶模具中。
加入2μL溴化乙锭(EB)并搅拌均匀。
⑤向50μL体系的PCR产物中加入6μL 10×loading buffer ,用震荡仪器将其
震荡均匀。
⑥待凝胶凝固后,垂直轻拔梳子,将带凝胶的胶床置于单用槽中,点样孔位于电
场负极。
添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板1-2mm为止。
⑦每孔上样55μL ,在一个孔内加入5μL 相相匹配的DNA marker。
⑧140V恒压电泳,溴酚蓝迁移到33%-66%时停止。
在紫外发光仪内打开紫外灯,
观察确认相应条带位置,切割下相应的凝胶放入1.5mLEP管中;
⑨用琼脂糖凝胶回收试剂盒进行胶回收。
获得以上相对的的扩增产物。
4.Red同源重组
(1)实验准备
①灭菌
1)SOC活化培养基
2)5个氯霉素LB平板
3)25mL培养基*3
4)甘油
5)10ml离心管
(2)实验操作
①保存于-80℃冰箱中的诱导表达重组酶的BL21和HMS174大肠杆菌感受态从
-80℃冰箱中各取一支出,快速插在冰上,静置1-2min;
②在超净台内向两支感受态各加入2μL左右(可以相应增加)的线性打靶片段,
用手指轻柔的拨动使其混匀,放置2-3min;
③电击2500v后,立即加入1mL的SOC培养基,37℃、220rpm摇晃培养2h;
④然后在常温、3000rmp条件下,离心5min。
弃部分上清,留100μL左右留作
吹悬,涂布在含有氯霉素的LB固体培养基上,37℃倒置培养过夜。
⑤次日,挑选合适大小的单菌落至含有氯霉素的1ml LB液体培养基的1.5mlEP
管中,在37℃、220rpm条件下摇晃培养至合适浓度,取一部分进行菌液PCR ⑥将鉴定合适的,按1:100接种到5ml的含氯霉素LB培养基的10ml离心管中培
鉴定。
养至OD600约为0.4时。
⑦取一部分加甘油,使其终浓度为15%-30%,保存至-80℃冰箱中。