丙型肝炎病毒基因分型与临床分子诊断
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血后 非 甲非 乙型肝 炎 的主要 病原 体 ， 据世 界卫 生组 织
＞ ２区 ＞ １Ｅ２ Ｅｌ ３ＵＴ 区 【。 ＮＳ ＮＳ ／ 、 ＞ ’ Ｒ
５ Ｒ区 的序列 最为保 守 ， 系变 化程 度及 进化 ＇ ＵＴ 种
（ Ｏ） ＷＨ 估计 ， 全世 界 ＨＣ Ｖ感 染 率平 均约 为 ３ 而 ％， 且 每年 仍有 ３０万 ￣ ０ ０ ４０万新 发病 例 。ＨＣ Ｖ感 染 率在 不 同国 家 和地 区有 很 大 差异 ， 国 ＨＣ 我 Ｖ感 染 率也 相 当高 ， 一 Ｖ 的 阳性率 平 均 为 ３ ％， 抗 ＨＣ ． 略高 于 全球 平 ２
［ Ｓ Ｒ Ｃ－ Ｇ ｎ ｔｐｎ ｏ ｅ ａ ｔ ｉ ｓｉ ｗｉ ｌ ｕ ｅ ｒｍｏｅｕａ ｐｄｍｉｌｇｃｌｓｒｅ， ＡＢ Ｔ Ａ ｒ ］ ｅｏ ｉ ｆｒｈｐ ｔｉ Ｃ ｖｒ ｓ ｄ ｙ ｓｄｆ ｌ ｌ ｅｉｅ ｏｏ ｉ ｕｖ ｙ ｙ ｇ ｉｓ ｕ ｅ ｏ ｃ ｒ ａ
ｐ ｅ ｉｔ ｇｔ ｅ ｃｉ ｉ ａ ｕ ｃ ｍｅ ｏ ｒ ｎ ｃＨＣＶ ｆ ｃｉ ｎ ａ ｄｔ ｅｒ ｓ ｏ ｓ ｎ ｉｉａ ｅ ａ ｙ Ｔ ｅｐ ｅ ｅ ｔ ｒ ｃｅ ｒ ｄ ｃ ｉ ｌ ｃ ｌ ｔ ｏ ｆ ｈ ｏ ｉ ｎ ｈ ｎ ｏ ｃ ｉ ｅ ｔ ｎ ｅ ｐ ｎ ｅｔ ａ ｔ ｒ ｌ ｈ ｒ ｐ ． ｈ ｒ ｓ ｎ ｔ ｌ ｎ ｏ ｈ ｏ ｖ ｔ ａｉ ａｍ ｓ ｏｒ ｖ ｅ ｔ ｅｃ ｉｉ ａ ｉ ｎ ｆ ａ ｃ ， ｔ ｏ ｓａ ｄ ａ ｐ ｉ ａｉ ｎ ｏ ＨＣＶ ｅ ｏｙ ｉ ｇ ｉ ｉｗ ｌ ｃ ｌ ｇ ｉ ｃ ｎ ｅ ｍｅ ｈ ｄ ｎ ｐ ｌ ｔ ｆ ｔ ｅ ｈ ｎ ｓ ｉ ｃ ｏ ｇ ｎ ｔｐｎ ．
均水 平 。ＨＣ Ｖ基 因分 型有助 于判断 治疗 难易 程度 ， 确
率 都很 低 】可用 于 区 分 主要 基 因型 ， １型和 ６型 ， 但
在 该 区序 列 相 似 ， 要 通 过 其 他 区 域 进 行 区分 ［。 需 ３ 】
ＮＳｂ区变 异 较 大 ， 于 区分 不 同病 毒 株 ， ５ 易 常被 选 作 亚 型 区分 依 据 。Ｓｍｍｏｄ 等 选 择 ＮＳｂ作 为 分型 ｉ ｎｓ ５ 区， 利用 核 酸测 序及 系 统进 化 分析 ， 最终 确立 为 国际
重 要 的意 义 。 本 文 就 近 年 来 丙 型 肝 炎 基 因 分 型 的 意 义 、 法 和 临 床应 用 情 况 作 简 要 述 评 。 方
【 关键词 】 丙 型肝炎病毒 ； 因分型 ； 基 分子诊断
Ｇｅ ｏ ｙ ｉ ｇ ｏ ｅ ａ ｉ ｓ Ｃ ｉ ｓ ｉ ｌ ｉ ａ ｏ ｅ ｕ ａ ｉ ｇ ｏ ｔ ｓ ｎ ｔ ｐ ｎ ｆｈ ｐ ｔ ｉ ｔ ｖｒ ｃｉ ｃ ｌ ｕ ｎ ｎ ｍ ｌｃ ｌｒ ａ ｎ ｓｉ ｄ ｃ
分子诊断与治疗杂志
２ １ ９月第 ２卷第 ５期 ０ ０年
ＪＭｏ Ｄｉ ｎ Ｔ ｅ，Ｓ ｐｅ ｅ ０ ０ Ｖ １ ． ｌ ａ ｈｒ ｅｔｍｂｒ １ ． ｏ． Ｎｏ ５ ｇ ２ ２
．８ ２ ９．
・Leabharlann Baidu
述
评 ・
丙 型肝炎病毒基 因分型与临床 分子诊断
张 太松 李明
【 摘
要 】 丙型肝炎基 因分型对于分子流行病学研究 、 预测慢性丙型肝炎病情和抗病毒治疗效果具有
ＨＣ Ｖ是 一 种 单 股 正 链 Ｒ ＮＡ病 毒 ， 于 基 因 型 由
不 同 ， 各 地 分 离 的 ＨＣ 从 Ｖ基 因 组 长 度 也 不 一 致 ，
一
般 为 ９４０左 右个 核 苷 酸 。 基 因组 ５和 ３端 分别 ０ ’ ’
为 非 编 码 区 （ ｎｒｎ ｌ ｅ ｇ ｉｎ ＵＴ ， ｕ ｔ ｓ ｔｄｒ ｅｏ ， Ｒ） 中央 部 分 ａ ａ ｅ
【Ｅ Ｋ Ｙ ＷＯＲＤ 】 Ｈｅａｉｓ ｉ ｓ Ｖ ； ｅ ｏ ｐｎ ； ｌ ｕａ ｉ ｎ ｓｃ Ｓ ｐｔｉＣｖｒ （ ｔ ｕ ＨＣ ）Ｇ ｎ ｔ ｉｇ Ｍｏｅ ｌ ｄａ ｏｔ ｓ ｙ ｃ ｒ ｇ ｉ
丙 型肝 炎病毒 （ ｅａｔ ｉ ｓＨＣ ） 引起 输 ｈｐｔｉＣｖ ｕ， Ｖ 是 ｉｓ ｒ
通 用 的 ＨＣ 分 型命 名 ， 将 ＨＣ 分 为 ６种 主要 基 Ｖ 即 Ｖ 因型及 一 系列 亚 型 。 对 两个 以上 的区域 如 ５ Ｔ ＇ Ｒ与 Ｕ
定抗病毒疗程和个体化治疗方案 ， 本文就 Ｈ Ｖ基 因 Ｃ
分 型的意 义、 常用方 法 和ｌ 临床应用情 况作简要 述评 。
１ Ｈ Ｖ分 子 生物学特 征及 基 因分型 基础 Ｃ
ＺＨ ＡＮ Ｇ ｉｏ Ｔａ ｓ ｎｇ， ｉ ＬＩＭ ｎｇ
（ ａ ｅ ｅＤ ａ ｎ ｓ ｃＣ ｎｅ ｏ ｎ ａ— ｎＵ ｉｅｓｙ Ｇｕ ｎ ｄ ｎ ， ｕ ｎ ｚ ｏ １ ６ ５ Ｃ ｉａ Ｄ ＡｎＧ ｎ ｉｇ ｏ ｔ ｅ ｔｒ ｆ ｕ ｔ ｅ ｎｖ ｒｉ ， ａ ｇ ｏ ｇ Ｇ ａ ｇ ｈ ｕ５ ６ ， ｈ ） ｉ Ｓ Ｙ ｓ ｔ ０ ｎ
水 平 的遗 传 变 异 性 ： （ｙ ｅ ）、 型 （ｕ ｔ ｅ ） 型 ｔｐｓ 亚 ｓｂｙ ｓ ｐ 和 准 病 毒 株 （ｕ ｓｐ ｃ ｓ 。ＨＣ 至 少 可 分 为 ６个 ｑａｉ ｅｉ ） ｓ ｅ Ｖ
基 因 型 （ ＶＩ ６型 ） 包 含 超 过 １０个 基 因 亚 型 ＨＣ ￣ ， ０ （ １ 、ｂ １、 ａ ２ 如 ａ １ 、 ｃ ２ 、 ｂ等 ） 各 型 核 酸 序 列 之 间 相 。 差 ３ ％～ ４ 而 亚 型序 列之 间相 差 约 ２ ％－ ３ 准 １ ３ ％， ０ ２ ％， 病 毒 株 序 列 之 问 相 差 １ １ ％［。 最 多 的差 别 序 列 ％～ ０ ６ 】
Ｃ 区 、Ｅ １与 ＮＳｂ区 或 Ｅ ５ １与 Ｃ区 直 接 进 行 测 序 和 系统 进 化 分 析 ， 可 使 分 型范 围更 广 ， Ｈ Ｖ 分 型 则 是 Ｃ
的 “ 金标 准 ” Ｊ 。 目前 根 据全世 界 不 同地 区分离 的 ＨＣ Ｖ不 同株 的 全部 或 部 分 基 因组 的 系统 进 化 分析 ， Ｖ呈 现 三个 ＨＣ
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５ Ｒ区 的序列 最为保 守 ， 系变 化程 度及 进化 ＇ ＵＴ 种
（ Ｏ） ＷＨ 估计 ， 全世 界 ＨＣ Ｖ感 染 率平 均约 为 ３ 而 ％， 且 每年 仍有 ３０万 ￣ ０ ０ ４０万新 发病 例 。ＨＣ Ｖ感 染 率在 不 同国 家 和地 区有 很 大 差异 ， 国 ＨＣ 我 Ｖ感 染 率也 相 当高 ， 一 Ｖ 的 阳性率 平 均 为 ３ ％， 抗 ＨＣ ． 略高 于 全球 平 ２
［ Ｓ Ｒ Ｃ－ Ｇ ｎ ｔｐｎ ｏ ｅ ａ ｔ ｉ ｓｉ ｗｉ ｌ ｕ ｅ ｒｍｏｅｕａ ｐｄｍｉｌｇｃｌｓｒｅ， ＡＢ Ｔ Ａ ｒ ］ ｅｏ ｉ ｆｒｈｐ ｔｉ Ｃ ｖｒ ｓ ｄ ｙ ｓｄｆ ｌ ｌ ｅｉｅ ｏｏ ｉ ｕｖ ｙ ｙ ｇ ｉｓ ｕ ｅ ｏ ｃ ｒ ａ
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均水 平 。ＨＣ Ｖ基 因分 型有助 于判断 治疗 难易 程度 ， 确
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在 该 区序 列 相 似 ， 要 通 过 其 他 区 域 进 行 区分 ［。 需 ３ 】
ＮＳｂ区变 异 较 大 ， 于 区分 不 同病 毒 株 ， ５ 易 常被 选 作 亚 型 区分 依 据 。Ｓｍｍｏｄ 等 选 择 ＮＳｂ作 为 分型 ｉ ｎｓ ５ 区， 利用 核 酸测 序及 系 统进 化 分析 ， 最终 确立 为 国际
重 要 的意 义 。 本 文 就 近 年 来 丙 型 肝 炎 基 因 分 型 的 意 义 、 法 和 临 床应 用 情 况 作 简 要 述 评 。 方
【 关键词 】 丙 型肝炎病毒 ； 因分型 ； 基 分子诊断
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分子诊断与治疗杂志
２ １ ９月第 ２卷第 ５期 ０ ０年
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．８ ２ ９．
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述
评 ・
丙 型肝炎病毒基 因分型与临床 分子诊断
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【 摘
要 】 丙型肝炎基 因分型对于分子流行病学研究 、 预测慢性丙型肝炎病情和抗病毒治疗效果具有
ＨＣ Ｖ是 一 种 单 股 正 链 Ｒ ＮＡ病 毒 ， 于 基 因 型 由
不 同 ， 各 地 分 离 的 ＨＣ 从 Ｖ基 因 组 长 度 也 不 一 致 ，
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丙 型肝 炎病毒 （ ｅａｔ ｉ ｓＨＣ ） 引起 输 ｈｐｔｉＣｖ ｕ， Ｖ 是 ｉｓ ｒ
通 用 的 ＨＣ 分 型命 名 ， 将 ＨＣ 分 为 ６种 主要 基 Ｖ 即 Ｖ 因型及 一 系列 亚 型 。 对 两个 以上 的区域 如 ５ Ｔ ＇ Ｒ与 Ｕ
定抗病毒疗程和个体化治疗方案 ， 本文就 Ｈ Ｖ基 因 Ｃ
分 型的意 义、 常用方 法 和ｌ 临床应用情 况作简要 述评 。
１ Ｈ Ｖ分 子 生物学特 征及 基 因分型 基础 Ｃ
ＺＨ ＡＮ Ｇ ｉｏ Ｔａ ｓ ｎｇ， ｉ ＬＩＭ ｎｇ
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水 平 的遗 传 变 异 性 ： （ｙ ｅ ）、 型 （ｕ ｔ ｅ ） 型 ｔｐｓ 亚 ｓｂｙ ｓ ｐ 和 准 病 毒 株 （ｕ ｓｐ ｃ ｓ 。ＨＣ 至 少 可 分 为 ６个 ｑａｉ ｅｉ ） ｓ ｅ Ｖ
基 因 型 （ ＶＩ ６型 ） 包 含 超 过 １０个 基 因 亚 型 ＨＣ ￣ ， ０ （ １ 、ｂ １、 ａ ２ 如 ａ １ 、 ｃ ２ 、 ｂ等 ） 各 型 核 酸 序 列 之 间 相 。 差 ３ ％～ ４ 而 亚 型序 列之 间相 差 约 ２ ％－ ３ 准 １ ３ ％， ０ ２ ％， 病 毒 株 序 列 之 问 相 差 １ １ ％［。 最 多 的差 别 序 列 ％～ ０ ６ 】
Ｃ 区 、Ｅ １与 ＮＳｂ区 或 Ｅ ５ １与 Ｃ区 直 接 进 行 测 序 和 系统 进 化 分 析 ， 可 使 分 型范 围更 广 ， Ｈ Ｖ 分 型 则 是 Ｃ
的 “ 金标 准 ” Ｊ 。 目前 根 据全世 界 不 同地 区分离 的 ＨＣ Ｖ不 同株 的 全部 或 部 分 基 因组 的 系统 进 化 分析 ， Ｖ呈 现 三个 ＨＣ