双向电泳--标准操作(完整版)
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
细胞裂解(蛋白质提取)
一、试剂配置:
PBS配方
氯化钠(MW 58.44) 130mM 8g
氯化钾(MW 74.5) 2.7mM 0.2g
十二水和磷酸氢二钠(MW 358) 10 mM3.63g
磷酸二氢钾(MW 136) 2 mM0.24g
加水至1L配好后进行高压灭菌。
Washing buffer(500mL)配方
Tris(MW 121.1) 10mM 0.605g
蔗糖(MW 342) 250mM 42.75g
加水溶解,用HCl调pH至7.0后用孔径为0.22µm滤膜过滤(使用1M盐酸略高于2750uL调pH)
裂解储液配方(细胞):
尿素(MW 60.06) 7M 4.2g
硫脲(MW 76.12) 2M 1.52g
CHAPS(MW614.89) 4%(W/V)0.4g 加超纯水定容至10mL后经0.22µm一次性滤膜过滤,过滤后分装成20小管,每小管500uL,-20℃冰箱保存。
裂解储液配方(组织):
尿素(MW 60.06)5M3g
硫脲(MW 76.12) 2M1.52g
CHAPS(MW614.89) 2% 0.2g
Tris(MW 121.1)40mM 0.048g
加超纯水定容至10mL后经0.22µm一次性滤膜过滤,过滤后分装成20小管,每小管500uL,-20℃冰箱保存。
裂解液:
裂解液储液 100uL
IPG buffer(pH可选) 2% 2uL
Pi 2uL
NucLease mix(100×) 1uL
PMSF(100mM:20mg/mL) 1mM 1uL
DTT(0.411g/mL) 40mM 1.5uL
Pi:每片使用200uL超纯水溶解后按10 uL分装
考马斯亮蓝G-250:
考马斯亮蓝G-250 0.01% 100g
95%乙醇 4.7% 50ml
H3PO4 8.5% 85g 将考马斯亮蓝G-250溶于50ml95%乙醇中,与用水溶解的100ml H3PO4混合后稀释至1000ml,之后使用滤纸过滤。
二、实验准备:
1、准备冰盒,细胞裂解过程均在冰盒内进行(4℃);
2、准备4℃离心机,开机降温,保证温度下降至4℃;
3、取出置于-20℃保存的试剂,需冰上融化,最后取出细胞样品。
三、样品制备:
(一)细胞
细胞裂解准备:
1、收集细胞,使用大于500g转速离心5min;
2、弃去上清,使用washing buffer重悬细胞沉淀,震摇待
细胞完全打散后,继续用大于500g转速离心5min;
3、重复步骤2两次,并使用转速2000rpm离心5min,弃上清。
细胞可置于-80冰箱保存数周,或使用裂解液裂解。
细胞裂解:
1、配置裂解液:注意先不要加入DTT。临用前加入PMSF后,
立即将细胞裂解液加入待裂解的细胞中。
2、加入裂解液的细胞置于冰盒内,每隔5-7min取出,于漩
涡振荡器上震摇数秒,并再次放于冰盒中,保证细胞裂解
时的温度为4℃。
3、裂解15-20min后加入DTT。
4、裂解完成后,置于4℃离心机中,以最大转速13200rpm离
心30min,取上清,弃沉淀。上清所含提取的蛋白。
5、使用bradford法测定提取蛋白浓度。
(二)、组织:
组织裂解准备:
1、提取动物组织。提取时务必保证组织的纯度,尽量减少组织
混杂,尤其注意血液的混入。
2、使用washing buffer冲洗组织2-3遍,洗净组织的血液、体
液、和其他影响实验结果的残留成分。
3、准备研钵,洗净并且烘干,准备适量的组织裂解液,准备充
足的液氮,石英砂适量。
组织裂解:
1、配置裂解液:注意先不要加入DTT、 PMSF。
2、将适量石英砂加入到研钵中,加入液氮冷却。
3、将组织放入装有液氮的研钵中,研磨组织,在研磨过程中保
证样品在低温状态下。
4、研磨完成后将样品及石英砂收集到离心管中,在裂解液中迅
速加入PMSF,混匀后将裂解液加入含有样品的离心管中。保持4℃,震荡混匀,每隔5-7min取出,于漩涡振荡器上震摇数秒,并再次放于冰盒中。
5、裂解15-20min后加入DTT。
6、使用2000g离心10min,吸取上清即为所提取的蛋白,下层
石英砂及组织碎片则丢弃。将上清使用13200g转速离心,弃去沉淀。
(三)、血清:
血清样品可直接用于双向电泳实验。
但样品中含有大量的IgG和白蛋白,需要使用试剂盒去除。四、试剂说明:
裂解液成分:
溶液中还原剂的含量不要超过20mM。
尿素/硫脲:变性剂,中性促溶剂,促进样品溶解,破坏氢键等次级结构,使所有离子基团暴露在溶液里。硫脲可以促进膜蛋白的溶解。尿素在30℃以上容易降解,降解产物异氰酸盐可使样本中蛋白质甲氨酰化,对蛋白质进行修饰,造成等电点改变,形成人为地“斑点串”。
CHAPS:两性表面活性剂,CHAPS是一种非变性的zwitterionic 去垢剂、蛋白质裂解液,用于增溶膜蛋白和裂解蛋白-蛋白之间的相互作用。CHAPS是两性离子去垢剂,分子结构中具有一个胆酸和硫代甜菜碱。在紫外区的低吸光性成为用紫外方法检测膜蛋白的首选去垢剂,CMC值均为8 mM。常用于于双向电泳等实验。原理:CHAPS保护蛋白质的天然状态,可溶解膜蛋白,从而互作用。透析可除去。
SDS:(FW 288.38)离子型去垢剂,裂解力强,基本可以把细胞完全破坏掉。并且使蛋白变性失活。不得与强氧化剂混合。它也可以用于核酸抽提操作中破坏细胞壁及裂解核酸蛋白复合物。NP-40:乙基苯基聚乙二醇(Nonidet P40;)很温和的非离子型去垢剂,1%浓度的基本可以破坏掉胞膜,而对核膜破坏的作用弱,结合特定的buffer可以获得胞浆蛋白。与蛋白结合力强,用于防止物质分子疏水间相互作用,确保蛋白的充分溶解和结构稳定。尤其用于膜蛋白的非变性条件下的溶解。