或蛋白质的化学修饰与基因表达
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由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失,所以,高等 真核生物中CG序列远远低于其理论值。哺乳类基因组 中约存在4万个CG islands,大多位于转录单元的5‘区。
没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用,就可能被氧 化成为U,被DNA修复系统所识别和切除,恢复成C。 已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法 被区分。因此, CpG序列极易丢失。
因为甲基化对转录的抑制强度与MeCP1 (methylCpG-binding protein1)结合DNA的能力 成正相关,甲基化CpG的密度和启动子强度之间 的平衡决定了该启动子是否具有转录活性。DNA 甲基化对基因转录的抑制直接参与了发育调控。 随着个体发育,当需要某些基因保持"沉默"时, 它们将迅速被甲基化,若需要恢复转录活性,则 去甲基化。
2.甲基化抑制基因转录的机制
甲基化导致某些区域DNA构象变化, 从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,抑 制了转录因子与启动区DNA的结合效率。
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对弱启动子来说,少量甲基化就能使其完全
失去转录活性。当这类启动子被增强时,即使不 去甲基化也可以恢复其转录活性。甲基化密度较 高时,即使增强后的启动子仍无转录活性。
dependent protein kinase),包括胞内 第二信使或调节因子 依赖性蛋白激酶及激 素(生长因子)依赖 性激酶两个亚类;
非信使依赖型蛋 白激酶。
蛋白质的磷酸化反应是指通过酶促反应把 磷酸基团从一个化合物转移到另一个化合物上的 过程,是生物体内存在的一种普遍的调节方式, 在细胞信号的传递过程中占有极其重要的地位。
已经发现在人体内有多达2000个左右的蛋白质 激酶和1000个左右的蛋白质磷酸酶基因。蛋白质的 磷酸化是指由蛋白质激酶催化的把ATP或GTP上γ位 的磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基上的过程, 其逆转过程是由蛋白质磷酸酶催化的,称为蛋白质 脱磷酸化。
雌性胎生哺乳类动物细胞中两条X染色体 之一在发育早期随机失活,以确保其与只有 一条X染色体的雄性个体内X染色体基因的剂 量相同。一旦发生X染色体失活,使该细胞有 丝分裂所产生的后代都保持同一条X染色体失 活。
科学家发现,在X染色体上存在一个与X染色体 失活有密切联系的核心部位称为X染色体失活中 心(X-chromosome inactivation center,Xic), 定位在Xq13区(正好是Barr氏小体浓缩部位)。
染色质对于核酸酶或限制性内切酶的敏感 度下降,更容易与组蛋白H1相结合,说明 甲基化与非甲基化DNA在构象上有差异。 已经分离纯化了数个与甲基化DNA特异结 合的蛋白质。MeCP1可以与至少12个对称 的甲基化CpG结合,而MeCP2仅同单个甲 基化的CpG序列结合。
3.DNA甲基化与X染色体失活
真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:一
种被称为日常型(mainte-nance)甲基转移酶, 另一种是 从头合成(denovo synthesis)甲基转 移酶。前者主要在甲基化母链(模板链)指导下 使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶 相对应的胞嘧啶甲基化。日常型甲基转移酶常常 与DNA内切酶活性相耦联,有3种类型。II类酶活 性包括内切酶和甲基化酶两种成分,而I类和III类 都是双功能酶,既能将半甲基化DNA甲基化,又 能降解外源无甲基化DNA。
被磷酸化的主要氨基酸残基:丝氨酸、苏氨酸和酪 氨酸。组氨酸和赖氨酸残基也可能被磷酸化。
2. 真核细胞主要跨膜信号转导途径
3. 蛋白激酶的种类与功能
根据底物蛋白质被磷酸化的氨基酸残基的 种类可分为三大类: 第一类为丝氨酸/苏氨酸型。这类蛋白激酶 使底物蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基磷酸 化
Xi-specific transcript (Xist)基因只在失活的X 染色体上表达,其产物是一功能性RNA,没有 ORF却含有大量的终止密码子。实验证明,Xist RNA分子能可能与Xic位点相互作用,引起后者 构象变化,易于结合各种蛋白因子,最终导致X 染色体失活。
二、 蛋白质磷酸化与基因表达
第二类为酪氨酸型。被磷酸化的是底物的 酪氨酸残基。 第三类是"双重底物特异性蛋白激酶(dualspecificity protein kinase),既可使丝氨酸 和苏氨酸残基磷酸化又可使酪氨酸残基磷 酸化。
根据是否有调节物来 分又可分成两大类: 信使依赖性蛋白
质激酶 (messenger-
一、 DNA甲基化与基因表达 二、 蛋白质磷酸化与基因表达 三、 基因重排的分子机制
一、 DNA甲基化与基因表达
DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一, 可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化 能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导 了基因的重新活化和表达。
1.DNA甲基化的主要形式
5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基 鸟嘌呤。在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要 出现在CpG和CpXpG中,原核生物中 CCA/TGG和GATC也常被甲基化。
1. 蛋白质磷酸化在细胞信号转导中的作用 (1). 在胞内介导胞外信号时具有专一应答特点。与
信号传递有关的蛋白激酶类主要受控于胞内信使, 如cAMP,Ca2+,DG(二酰甘油,diacyl glycerol)等,这种共价修饰调节方式显然比变构 调节较少受胞内代谢产物的影响。 (2).蛋白质的磷酸化与脱磷酸化控制了细胞内已有的 酶“活性”。与酶的重新合成及分解相比,这种方 式能对外界刺激做出更迅速的反应。 (3).对外界信号具有级联放大作用; (4).蛋白质的磷酸化与脱磷酸化保证了细胞对外界信 号的持续反应。
I. DNA甲基化抑制基因转录的直接机制 某些转录因子的结合位点内含有CpG序列, 甲基化以后直接影响了蛋白质因子的结合 活性,不能起始基因转录。
II. 甲基化抑制转录的间接机制 CpG甲基化,通过改变染色质的构象或者 通过与甲基化CpG结合的蛋白因子间接影 响转录因子与DNA的结合。
与不含甲基化的染色质相比,甲基化后