贵州黑山羊和黔北麻羊MSTN基因DraI酶切多态性分析

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贵州地方山羊CPT-1A基因在不同品种和组织中的表达差异

浙江农业学报ＡｃｔａＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｅＺｈｅｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ，２０１５，２７（６）：９２１— ９２６
ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｚｊｎｙｘｂ．ｃｎ
杨家大．贵州地方山羊ＣＰＴ－１Ａ基因在不同品种和组织中的表达差异［Ｊ］．浙江农业学报，２０１５，２７（６）：９２１ — ９２６．
ｈｅａｒｔｓ，ｌｕｎｇｓ，ｌｏｎｇｉｓｓｉｍｕｓｍｕｓｃｌｅ，ａｍｎｉｏｎｍｕｓｃｌｅａｎｄｓｕｂｃｕｔａｎｅｏｕｓａｄｉｐｏｓｅｗｅｒｅｄｅｔｅｃｔｅｄｂｙｒｅ￣，ｔｉｍｅｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ
Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＩｎｏｒｄｅｒｔｏｒｅｖｅａｌｂｒｅｅｄｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓａｎｄｔｉｓｓｕｅｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓｏｆＣＰＴ－１ＡｍＲＮＡｌｅｖｅｌｓｉｎＧｕｉｚｈｏｕｎａｔｉｖｅｇｏａｔｓ
ｂｒｅｅｄｓ
ＹＡＮＧＪｉａ．ｄａ
（ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌａｎｄＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＫａｉｌｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｋａｉｌｉ５５６０１１，Ｃｈｉｎａ）

贵州4个山羊群体mtDNACytb基因多态性研究

贵州山羊是我国优良地方品种，具有肉质好，
板皮张幅大，应性、病性强，殖性能好等特适抗繁
ＧｅｔｃＤｉｅｓｔｎｅｉｖｒｉｙＡｎａｙｉ－ｌｓｓｏｆＡ
ＧｅｎｄＩｓＣｏｒｌｔｏｎｅａｔｒｅａｉｎｔｉｋＰｅｆｒａｅｉｏｈｒｈＭｌｒｏｍｎｃｎＳｕｔｅｎＣｈｉｅｅＨｏｓｅｎｎｓｌｔｉ
ｇｎｘｎ２ｘｎ４，ｅｏ６ｘｎ３ｎＣｈｎｓｌｔｉｏｕａｉｎｗａｅｅｔｄｕｉｇＰｅｅｅｏ，ｅｏｘｎ２，ｅｏ４ｉｉｅｅＨｏｓｅｎｐｐｌｔｓｄｔｃｅｓｎＣＲ —ＳＣＰｉｈｓｓｕｙｏＳｎｔｉｔｄ．
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Ａｓｒｃ：ａｙｃｎａｅ（ＡＮｐｙｅｐｒｎｌｉｍｍａａｔｙｔｓ．ｈｏｍｒｈｓｆＡＮｂｔａｔＦｔｉｓｔｓＦＳ）ｌｓｒｉｏａｔｏａｍｌｎｆｎｅｉＴｅｌｏｉｏＦＳｔａｄｙｈａｖｙｍｔｒｅｎｉａｓｈｓｐｙｐｍ
片段进行测序分析和比较。结果表明：５条山羊的Ｃｔ基因序列均为１１０ｐ的同源基因序列；５ｙｂ４ｂ总共发现１个１
变异住点，观察到１０种单倍型；４个山羊群体中单倍型多样性为０４２，８９核苷酸多样度为００１５＇０２。．，．，４＇８－０．４－．５贵０－００州山羊的遗传多样性处于中等水平；州山羊可分为两大类群，贵即贵州黑山羊和贵州麻羊２个群体为一类；州贵

山羊MSTN基因研究进展及其在甘肃本地山羊上的应用,检测报告

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山羊MSTN基因研究进展及其在甘肃本地山羊上的应用杨军祥(甘肃省畜牧兽医研究所，甘肃平凉744000)251345991摘要：肌肉生长抑制素（MSTN），又被称为生长分化因子8（GDF-8），是转化生长因子β超家族成员之一，广泛分布于脊椎动物体内，在维持动物机体组织稳态、胚胎发育、骨骼肌生长发育等方面发挥重要的调控作用，该基因的变异、缺失或抑制其表达量等可能会导致肌肉的过度肥大。

本文主要通过对M STN基因的结构和特征，生物学功能、多态性信息及调控机制等方面的研究进展进行简单综述，探讨MS TN基因与山羊生长性状的关系及其在经济性状标记辅助选择方面的应用前景，为相关领域的科研工作者提供参考。

关键词：肌肉生长抑制素（MSTN）；生物学特征；调控机制；研究进展[中图分类号] S827[文献标识码] AAbstract: MSTN gene, also known as growth differentiation factor 8 (GDF-8)，is the member oftran sforming growth factorbeta superfamily (TGF-βs), which widely distributes in vertebrates and plays the mp ortant regulatory roles in maintainingsteady state of animals, embryo development, skeletal muscle growth and development, etc.The mutation, deficiency and abnormal expression of MSTN gene may lead to hyp ertrophy of muscles. This study mainly summarizes the structure, characteristic, biology characteristic, pol ymorphism and regulatory mechanism of MSTN gene, to evaluate the relationship between MSTN genean dgrowth trait of goat, and the application prospect in marker assisted selection of economic trait, this stu dy may provide some foundation for researchers in related field.Keywords: MSTN gene; biology characteristic; regulatory mechanism; research progres肌肉生长抑制素（Myostatin，MSTN），又被称为生长分化因子8（growth differentiation factor 8，GDF-8），是转化生长因子β (transforming growthfactor-β，TGF-β)超家族成员之一，于1997年首次被发现。

麻城黑山羊微卫星标记多态性分析

麻城黑山羊微卫星标记多态性分析摘要：为了解麻城黑山羊群体的遗传多样性，选择了位于不同染色体上、具有较高多态性的10个微卫星标记，对麻城黑山羊群体进行研究。

结果表明，BM1329等10个微卫星标记共检测到171个等位基因，每个标记都检测到9个以上（平均为17.1个）的等位基因，有效等位基因数为7.1～18.1个，基因频率最高的是OarAE101标记的100 bp片段（0.239 1）；10个微卫星标记多态信息含量（PIC）都在0.95以上，均为高度多态标记，遗传多样性丰富，其中BMS1591标记的多态信息含量（PIC）最高，为0.996 9，各标记的平均杂合度在0.707 4～0.976 5之间，遗传杂合度在0.859 0～0.944 6之间，平均遗传杂合度为0.906 7，属于高度杂合标记和高度杂合品种，遗传变异大。

关键词：微卫星标记；遗传多态性；麻城黑山羊麻城黑山羊产于大别山及其周边的广大地区，主产区在湖北麻城市，是优良的黑色地方品种资源。

对于麻城黑山羊的相关研究，过去多限于体型外貌、体尺测量、生产性能测定等方面，很少在分子水平上开展研究，品种的选育尚停留在常规育种领域，严重阻碍了该品种的选育提高和进一步发展。

微卫星（Microsatellite）是广泛分布于生物基因组中的简单重复序列，20世纪80年代，Miesfeld等[1]在人类基因组的研究中首先发现了微卫星DNA，它一般由2～6个碱基组成核心单元，重复几次至几十次不等，数量庞大且分布均匀，在染色体上平均每10kb就出现一个，同时具备保守性、等显性遗传、多态性丰富、易被检测、进化所受选择压力小等特点，在物种遗传图谱构建、品种遗传多样性分析、种间遗传距离估测、亲子鉴定、数量性状基因座（QTL）的检测与定位、杂交优势预测等方面具有很大的应用价值，也使之成为继RFLP之后的第二代分子标记技术，被广泛应用于羊的遗传育种领域，为羊育种开辟了一条新的途径。

会理黑山羊肌肉生长抑制素基因编码序列的克隆与多样性分析

会理黑山羊肌肉生长抑制素基因编码序列的克隆与多样性分析张文丽【摘要】为探究会理黑山羊遗传分化状况,试验参考普通山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因设计引物,采用PCR方法扩增、克隆会理黑山羊MSTN基因编码区,并与其他物种相应基因编码区核苷酸序列进行比对分析.结果表明,会理黑山羊MSTN 基因完整编码序列长度为1128 bp,由外显子1(372 bp)、外显子2(375 bp)和外显子3(381 bp)组成;会理黑山羊与建昌黑山羊、黔北麻羊同源性最高,均达97.4％,聚为一簇,亲缘关系最近,与牛、恒河猴、狗等物种的同源性最低,亲缘关系远;会理黑山羊MSTN基因编码区共编码375个氨基酸,会理黑山羊MSTN基因编码的各种氨基酸含量相差较大,其中以亮氨酸含量最丰富,达8.80％.本研究为会理黑山羊的遗传资源保护、开发与利用提供了分子遗传学研究基础.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2013(040)012【总页数】5页(P146-150)【关键词】会理黑山羊;肌肉生长抑制素基因;多样性分析【作者】张文丽【作者单位】西昌学院动物科学学院,四川西昌 615013【正文语种】中文【中图分类】S827.9+2肌肉生长抑制素（myostatin，MSTN）又称为生长分化因子8（growth differentiation factor-8，GDF8），是转化生长因子（transforming growth factor beta，TGF-β）超家族成员。

研究结果表明，肌肉生长抑制素是一种分泌蛋白，作为负调节骨骼肌生长的活性因子，直接或间接控制肌细胞生长发育且能控制肌肉量的增长（Gay等，2012）。

科学家对小鼠、猪、牛、鸡、鸭及鹅的MSTN基因做了大量研究（李聚才等，2012；李帅等，2011），一致认为该基因的多态性与生长发育相关，且负调控肌细胞生长发育，在MSTN基因缺失的动物模型中除影响骨骼肌发育外，还对脂肪沉积起抑制作用，因此，MSTN基因的多态性可作为选择肌肉性状和胴体性状的分子标记（Bellinge等，2005）。

贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析

中图分类号： Q811. 4 ； Q343. 1 + 12 ； Q343. 1 + 7 文献标识码： A doi： 10． 3969 / j． issn． 1004 － 311X． 2014． 04． 0087
Bioinformatics Analysis on the SNP of Promoter Ｒegion of TFB1 M Gene in Local Goat in Guizhou Province
贵州本地山羊 TFB1 M 基因启动子区多态性生物信息学分析
孙岩岩，罗卫星，谢海强，宋桃伟，刘彬，蔡惠芬
*
（贵州大学动物科学学院 / 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室，贵州贵阳 550025 ）摘要：目的：采用 DNA 池结合 PCＲ技术，筛选 TFB1 M 基因启动子区 SNP 位点，并分析其对启动子区的影响。方法：利用多 CpG 岛。结果： TFB1 M 基因启动子区发现 1 个 SNP 位转录因子结合位点、种生物信息学软件预测 TFB1 M 基因核心启动子范围、点 G － 234A。TFSEAＲCH 软件预测结果显示 TFB1M 基因启动子区转录因子 ADＲ1 与 Sp1 位置调换，且 ADＲ1 位置的提前导致 TFB1 M 基因转录效率增高。结论： G － 234A 位点可能影响 TFB1 M 基因转录，试验结果为进一步分析 TFB1 M 基因启动子区功能奠定基础。关键词： TFB1 M； SNP；启动子
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贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异

贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异杨家大【摘要】[目的]揭示贵州地方山羊瘦素基因(Leptin)表达水平的组织分布规律及品种差异,为研究Leptin基因与山羊肉质的关系提供参考依据.[方法]以黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊4个贵州地方山羊为研究对象,南江黄羊为对照,采用TaqMan实时荧光定量PCR对其肝脏、肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中的Leptin基因表达水平进行测定.[结果]Lptin基因在不同山羊品种的肝脏、肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中呈高表达,均以皮下脂肪的Leptin基因表达水平最高,且在黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊4个贵州地方山羊品种中,皮下脂肪中的表达水平显著高于心脏、肺脏、背最长肌和半膜肌(P＜0.05).除肝脏内Leptin基因表达水平在各品种间无显著差异(P＞0.05)外,在肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌、皮下脂肪中的表达水平均存在品种差异,且以贵州白山羊最高.[结论]贵州地方山羊品种Leptin基因表达的组织分布规律相似,均以皮下脂肪最高,在品种方面则以贵州白山羊的整体表达水平较高.【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2015(046)005【总页数】6页(P876-881)【关键词】贵州地方山羊;Leptin基因;组织分布;品种差异【作者】杨家大【作者单位】凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里556011【正文语种】中文【中图分类】S827.890 引言【研究意义】贵州地方山羊品种资源丰富，如贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、黔东南小香羊等。

这些山羊品种适宜山地放牧、抗逆性强、繁殖力高、育肥性能好、肉质优良，在我国山羊品种资源中占据重要位置，尤其是黔东南小香羊膻味轻、肉质细嫩多汁，是山羊肉产品之上品（陈祥等，2004）。

因此，研究贵州地方山羊品种的肉质形成机制对大力发展贵州生态养羊业具有重要意义。

我国主要地方山羊品种MSTN基因的MnlⅠ酶切多态性分析

在编码区发现了1个ct的沉默突变并没有导致氨基酸的变化810j而驴g虽是沉默突变但其与猪的背膘厚呈显著相关11在羊的研究中marcq等16j分析了比利时texel双肌绵羊的可能遗传机制与普通绵羊romanov相比双肌羊的mstn基因的编码区虽然没有碱基的差异但采用该基因侧翼序列的微卫星标记进行连锁分析表明在绵羊染色体2q远端区存在1个对肌肉发育产生效应的qtl数量性状遗传位点该基因座可能就是mstn基因据此推断影响该基因表达的区域很可能在c端或n端的非翻译区域或内含子部分
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河南农业科学
我国主要地方山羊品种ＭＳＮ基因的ＴＭ工酶切多态性分析ｎｌ
刘铮铸１，祥龙，，李２，巩元芳李金泉，
（．１河北科技师范学院动物科学系，河北昌黎０６０；２内蒙古农业大学动物科学与医学学院，６６０．内蒙古呼和浩特００１；１０８３河北农业大学动物科技学院，．河北保定０１０）７０１
ｆａｍｅｔｗｅｅｃｏｅｎｅｕｎｅ．Ｔｈｅｕｔｈｗｅｈｔｉ７ｂＢｇｎｔｐａｎｕｓｉ — ｒｇｎｒｌｎｄａｄｓｑｅｃｄｅｒｓｌｓｏｄｔａｎ３９ｐ，Ｂｅｏｙｅｈｄｏｅｓｂｔｔｕ
ｒｇｏｓｏＳｅｉｎｆＭＴＮｅｅｇｎ．
Ｋｅｏｄ：Ｇａ；ＭＳｙｗｒｓｏｔＮ：Ｇｎｔｌｒｈｓ；ＦＰ；ｎｅｅｉｐｙｐｉｃｏｍｏｍＲＬＭｌＩ
肌肉抑制素基因（ｏｔｔ，Ｔ又称生长ＭｙｓｉＭＳＮ）ａｎ

山羊MSTN基因EcoRV酶切多态性分析

关键词：山羊；Ｔ遗传多态性：ＦＰＥｏＶＭＳＮ：ＲＬ；ｃＲ中图分类号：８７２￥２．文献标识码：Ａ
ＰｏｙｏｐｉｍａｙｉｆｔｅＭＳｌｍｒｈｓＡｎｌｓｓｏｈＴＮｎＧｅｅＤｉｅｔｄｗｉｏｇｓｅｔＥｃｈＲＶｆＧｏｔａｔｎｆｉｌｃｅｃ，ＨｅｅｒｃｌｒｌＵｉｅｓｙａｄｎ７０１Ｃｉａ１０８，ｈｎ；．ｐｒｍｅｔｍａｉｎｅｏＡｎＳｂｉｉｕｔａｎｖｒｉ，Ｂｏｉｇ０１０，ｈｎ）Ａｇｕｔ
ｇｎｔｐｈｒｓｏｅｓｂｔｕｉｎｍｕａｉｎａｅ３７３ｓｔ（Ｃ）Ｔｅｒｓｌａｏｅ—ｍｅｔｎｄｆｓｃｎｅｏｙｅｔｅｅｗａｎｕｓｉｔｔｔｔｈ８ｉＴｔｏｏｔｅ．ｈｅｕｔｂｖｎｉｅｒｔｏ－ｏｉｉｄｔａｔｅｅｗｒｏｙｒｈｓｎｉｔｏ６６ｂｆｍｅｈｔｈｒｅｅｐｌｍｏｐｉｍｓｉｎｒｎ２（７ｐ）ｒｇｏｆＭＳＮｇｎ．ｒｅｉｎｏＴｅｅ
Ｃｈｎ２Ｃｏｌｇｏｉｌｉａ；．ｌｅｅｆＡｎｍａＳｃｅｃａｄＭｅｉｉｅ，ＩｎｒｏｇｌＡｇｉｕｔｒｌｉｎｅｎｄｃｎｎｅＭｎｏｉａｒｃｌａＵｎｖｒｉｕｉｅｓｔｙ，Ｈｕｅａｔｈｈｏｅ
测到３种基因型．酶切位点分别由２种共显性基因控制：该片段的纯合型（Ａ、Ｂ分别测序发现，Ｂ型其对ＡＢ）Ｂ

体外产气法评定黔北麻羊常用饲料营养价值研究

体外产气法评定黔北麻羊常用饲料营养价值研究韩晓洁;李凌云;莘海亮;田兴舟;段永邦;赵丽丽;吴文旋【摘要】试验以黔北麻羊为瘤胃液供体,以麦麸、DDGS、鱼粉、玉米皮、米糠、豆腐渣和青干草、麦冬草、黑麦草、高羊茅草为精粗饲料,应用瘤胃体外产气法检测累积产气量(GP)、发酵参数(a、b、c)和有机物消化率(OMD),评定其营养价值.结果表明,精饲料、粗饲料GP均随时间的延长而增加(P＜0.05).至发酵72 h结束,精饲料中GP、OMD值以玉米皮(63.89 mL、64.70％)、麦麸(57.07 mL、61.75％)、豆腐渣(56.36 mL、60.01％)较高,具有较高的营养价值,DDGS(47.59 mL、46.38％)次之,鱼粉(30.51 mL、32.47％)、米糠(10.85 mL、18.87％)相应较低(P＜0.05);粗饲料中GP、OMD值以黑麦草(44.31 mL、49.63％)最高,营养价值最高;高羊茅草(37.01 mL、41.32％)、青干草(34.21 mL、40.97％)次之;麦冬草(28.82 mL、35.08％)最低(P＜0.05).精饲料中玉米皮、豆腐渣和麦麸营养价值较高,粗饲料中黑麦草营养价值较高.本研究结果可为黔北麻羊日粮配制提供参考.【期刊名称】《家畜生态学报》【年(卷),期】2014(035)004【总页数】5页(P40-44)【关键词】瘤胃体外产气;产气量;有机物消化率;饲料;黔北麻羊【作者】韩晓洁;李凌云;莘海亮;田兴舟;段永邦;赵丽丽;吴文旋【作者单位】贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;凯里畜牧兽医办公室,贵州凯里556000;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】S811.6羊作为反刍动物，在营养生理上与单胃动物存在很大的区别，最突出表现在其瘤胃的独特功能。

海南黑山羊MSTN基因的表达差异与发育性变化研究

海南黑山羊MSTN基因的表达差异与发育性变化研究管凇;周汉林;侯冠彧;王东劲;徐铁山【摘要】采用SYBR Green实时荧光定量PCR技术检测了MSTN基因在2、3、4月龄和12月龄海南黑山羊腿肌、腰肌和背肌组织中mRNA表达发育性变换规律,为揭示MSTN基因的生物学功能及其对肉质的表达调控机理提供参考依据.结果表明,在海南黑山羊的四个生长阶段,MSTN基因均在背肌里的表达量最高,腿肌里的表达量较低,表达模式为:背肌＞腰肌＞腿肌;腿肌和腰肌在2月龄时,表达量较低,3月龄时极显著升高(P＜0.01),4月龄时又极显著下降(P＜0.01),12月龄时又极显著升高(P＜0.01);表达模式为:12月龄＞3月龄＞4月龄＞2月龄;背肌在2月龄时表达量也较低,3月龄时极显著升高(P＜0.01),达到最高水平,4月龄时又极显著下降(P ＜0.01),12月龄时有所上升,但差异不显著(P＞0.05),表达模式为:3月龄＞12月龄＞4月龄＞2月龄.【期刊名称】《家畜生态学报》【年(卷),期】2013(034)011【总页数】5页(P15-19)【关键词】肌肉生长抑制素;mRNA表达;荧光实时定量PCR;海南黑山羊【作者】管凇;周汉林;侯冠彧;王东劲;徐铁山【作者单位】中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737【正文语种】中文【中图分类】S811.6肌肉生成抑制素(Myostatin, MSTN)是一种能够对肌肉生长起负调控作用的分泌蛋白[1]，经研究发现，MSTN基因编码的蛋白质对骨骼肌有负调控作用，主要是控制和维持骨骼肌细胞的数量和体积[2]。

利用mtDNA Cytb基因分析湘黔川五个山羊品种系统发育

利用mtDNA Cytb基因分析湘黔川五个山羊品种系统发育黄勤华
【期刊名称】《贵州畜牧兽医》
【年(卷),期】2014(038)001
【摘要】试验对四川板角山羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、贵州麻羊及湖南马头山羊5个山羊品种,共计69个个体的Cytb基因片段进行测序分析比较.结果显示,69个山羊Cytb基因序列均为长1 140 bp的同源基因,共发现17个变异位点,观察到14种单倍型;5个山羊品种的群体遗传多样性在0.442～0.889之间,核苷酸多样度从0.001 45 ～0.002 53.表明5个山羊遗传多样性属于中等;5个山羊品种可分为2大类群,即:贵州黑山羊、贵州麻羊、贵州白山羊和湖南马头山羊4个品种为一类,四川板桥山羊1个品种为另一类.
【总页数】4页(P4-7)
【作者】黄勤华
【作者单位】贵州六盘水职业技术学院,贵州六盘水553000
【正文语种】中文
【中图分类】S827.8
【相关文献】
1.不同四川黑山羊品种mtDNA D-loop区遗传多样性分析 [J], 江昱;王杰;金鑫燕
2.应用mtDNA Cytb基因全序列分析中国5个马鹿群体的遗传多样性和系统发育[J], 张丽;滚双宝;雷天云;刘丽霞;秦大伟;赵世峰
3.黔湘渝4个山羊品种亲缘关系的RAPD分析 [J], 杨家大;简承松;朱文适;魏泓;金稀
4.河南省3个山羊品种mtDNA D-loop区的序列变异与系统发育关系研究 [J], 李婉涛;刘延鑫;李新正;赵绪永
5.喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA Cytb遗传多样性及系统发育分析 [J], 李静;王莉;道敏;胡平;肖逸;韩建林;王玉涛
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山羊肌生成抑制素(MSTN)基因的克隆及生物信息学分析

山羊肌生成抑制素(MSTN)基因的克隆及生物信息学分析金鑫燕【摘要】试验对山羊肌生成抑制素(myostatin,MSTN)基因序列进行了克隆及生物信息学分析,旨在为该基因的深入研究提供理论依据.结果表明,山羊MSTN基因序列长1128 bp,编码375个氨基酸,GenBank登录号为GU183368.山羊MSTN蛋白序列与绵羊、猪、兔、马、人、牛、鼠同源性依次为93％、89％、88％、88％、88％、87％、85％,同源性较高,说明该基因高度保守；疏水性分析结果表明,该蛋白大多数氨基酸为疏水性氨基酸；蛋白跨膜结构及方向显示,从内向外和从外向内分别含有1个强跨膜螺旋区；信号肽预测显示,信号肽序列长度为70;亚细胞定位预测发现,该蛋白是一个Ⅱ型膜蛋白,大部分定位于高尔基体、质膜和内质网膜,内质网腔内也有少量分布；结构功能域预测发现N-肉豆蔻酰化位点3个,N端糖基化位点2个,蛋白激酶C磷酸化位点5个,酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点5个,络氨酸激酶磷酸化位点1个,EF-hand钙结合结构域1个,亮氨酸拉链1个,TGF家族标记1个；二级结构预测显示,α螺旋占25.33％,β折叠占3.20％,随机卷曲占50.13％,延伸链占21.33％.%In this article, myostatin (MSTN)gene of goat were cloned and bioformatics analysis were studied to provide theoretical reference for further research. The results showed that the length of MSTN gene was 1128 bp which encoding 375 amnio acid,and GenBank accession number was GU183368. MSTN protein sequence of goat had highly homology compared with sheep, pig, rabbit, horse, human, bovin,which was93%,89%,88% ,88%,88% ,87% and 85%, respectively. The gene had highly conservation; hydrophobic analysis showed that most amino acid were hydropathicity amino acids; protein transmem-brane helices analysisshowed that there were one transmembrane helices each in inside to outside helices and outside to inside helices; signal peptide analysis showed that signal peptide sequence length was 70;protein localization sites prediction showed that it was a type II membrane protein and most of the protein located in golgi body, plasma membrane and endoplasmic reticu-lum membrane,some in endoplasmic reticulum. The structure and function domain forecasting showed that there were 3 N-myristoylation site,2 N-glycosylation site, 5 protein kinase C phosphorylation site, 5 casein kinase Ⅱ phosphorylation site,l tyrosine kinase phosphorylation site, 1 EF-hand calcium-binding domain, 1 leucine zipper pattern, and 1 TGF-beta family signature. Secondary structure predictions showed that there were 25. 33% alpha helix,3. 20% beta turn,50. 13% random coil, 21. 33% extended strand.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2011(038)009【总页数】4页(P111-114)【关键词】山羊;MSTN基因;克隆;生物信息学【作者】金鑫燕【作者单位】青海省畜牧兽医科学院,青海西宁810016【正文语种】中文【中图分类】Q78肌肉细胞分化、生长是由一些正向调控因子和负向调控因子进行双向调节。

贵州白山羊肌肉生长抑制素（MSTN）基因生物信息学预测与系统进化分析

Special Wild Economic Animal and Plant Research 特产研究16DOI ：10.16720/ki.tcyj.2023.144贵州白山羊肌肉生长抑制素（MSTN ）基因生物信息学预测与系统进化分析宋兴超，孟金柱，赵园园，吴震洋，安清明（铜仁学院农林工程与规划学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室，贵州铜仁554300）摘要：本研究旨在解析贵州白山羊肌肉生长抑制素（）基因的结构特性，为该基因功能探究提供理论依据。

基于生物信息学及比较基因组学方法，对NCBI 数据库中已登录的贵州白山羊基因完整编码区序列（CDS ）核苷酸组成特性及编码蛋白的相关结构开展预测及分析，构建了15个物种基因系统进化树。

结果表明，贵州白山羊基因CDS 长度为1128bp ，共编码375个氨基酸，由3个外显子和2个内含子构成，其AT 含量均高于GC 。

贵州白山羊MSTN 蛋白属混合型二级结构，存在无规则卷曲、延伸链和螺旋，为弱碱不稳定亲水蛋白质；包括1个18个氨基酸的潜在信号肽，无跨膜区，形成5对二硫键，含有16个磷酸化位点；278~375位氨基酸为转化生长因子样结构域。

贵州白山羊基因与绵羊、牛等牛科动物的亲缘关系较近，与鸡形目原鸡和绿头野鸭的亲缘关系较远。

本研究可为贵州白山羊基因分子遗传学及其表达调控研究奠定理论基础。

关键词：贵州白山羊；肌肉生长抑制素基因；编码蛋白；比较基因组学；肌肉发育中图分类号：S827;Q754文献标识码：A 文章编号：1001-4721（2023）05-0016-06Bioninformatics Prediction and Phylogenetic Analysis of MSTN Gene inGuizhou White GoatSONG Xingchao,MENG Jinzhu,ZHAO Yuanyuan,WU Zhenyang,AN Qingming(Guizhou Provincial Key Laboratory for Biodiversity Conservation and Utilization in the Fanjing Mountain Region,Collegeof Agroforesry Engineering and Planning,Tongren University,Tongren 554300,China )Abstract :In order to analyze thestructuralcharacteristics of myostatin （）gene in Guizhou white goat and provide theoretical basis for exploring its function.The nucleotide composition of the complete coding region sequence and the related structure oftheencodedpro-tein of gene in Guizhou white goat registered in NCBI database were predicted andanalyzed.The phylogenetictree ofgeneamong 15species was constructed based on bioinformatics and comparative genomic methods The results showed that thelengthofcodingregion ofgene in Guizhou white goat was 1128bp,encoding 375amino acids,including three exons and two introns,and the ATcontent was significantly higher than that of GC.Further analysis revealed that the mixed secondary structure of MSTN protein was mainly composed ofrandom coil,extend strand and -helix,which was a weakly alkaline unstable hydrophilic protein.The MSTN protein of Guizhou white goat contained one signal peptide composed of 18amino acids,no transmembrane region,forming 5disulfide bonds,inclu-ding 16phosphorylation sites.278~375aminoacids are transforming growthfactor--like domains.The gene of Guizhou white goatis closely related to sheep and cattle,and is relatively distant to chicken and mallard.The research would lay the foundation formoleculargeneticsandexpression study of gene in Guizhou white goat.Keywords:Guizhouwhite goat;gene;encoding protein;comparative genomics;muscle development我国山羊遗传资源较为丰富，贵州白山羊属肉用型优良地方山羊品种，该品种已被列入《贵州地方畜禽遗传资源志》《中国畜禽遗传资源志羊志》和农业农村部最新颁布的《国家畜禽遗传资源目录》[1,2]，因其具有收稿日期：2023-03-02基金项目：铜仁市科学技术局博士人才项目（铜市科研〔2020〕126号）；铜仁学院博士科研启动基金项目（trxyDH2001）；铜仁市科学技术局博士人才项目（铜市科研〔2023〕4号），贵州省科技计划项目（黔科合基础〔2020〕1Y138）作者简介：宋兴超（1982-），男，河北博野人，博士，副教授，主要从事特种畜禽遗传育种研究。

黔北麻羊MSTN基因的多态性分析

黔北麻羊MSTN基因的多态性分析冯会利;田兴贵;朱红刚;主性;刘若余【摘要】In order to provide the basic information and scientific proof to breed conservation of genetic resources and further breeding about the Qianbei Ma goat, the polymorphism of intro l,extro 2 and partial intro 2 in MSTN of Qianbei Ma goat with BsmAI,MspⅠ,EcoRⅠ,MvaⅠ,XmnⅠ,MnⅡ six kinds of restriction enzymes were studied. The results showed that the sequence of 1 241 bp in MSTN gene contains four restriction enzyme cutting sites which were BsmAⅠ, EcoRⅠ, MvaⅠ and MnⅡ, b ut all of them have no polymorphism, while MsplⅠ、XmnⅠ restriction sites were not found.%为给黔北麻羊品种遗传资源的保护及进一步选育提供科学依据,利用BsmAⅠ、MspⅠ、EcoRⅠ、MvaⅠ、XmnⅠ、MnⅡ等6种限制性内切酶对黔北麻羊MSTN基因部分内含子1、2和外显子2进行PCRRFLP多态性分析.结果表明:在扩增的MSTN基因1 241 bp序列中含有BsmAⅠ、EcoRJ、MvaⅠ和MnⅡ4个酶切位点,但均不具有多态性；未发现MspⅠ和XmnⅠ酶切位点.【期刊名称】《贵州农业科学》【年(卷),期】2011(039)010【总页数】3页(P131-133)【关键词】黔北麻羊;MSTN基因;PCR-RFLP;多态性【作者】冯会利;田兴贵;朱红刚;主性;刘若余【作者单位】贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】S826肌肉生长抑制素(Myostatin，MSTN)属于转化生长因子-β(transforming growth factor beta，TGF -β)超家族成员，是骨骼肌中广泛存在的一种糖蛋白[1]，已被证明是骨骼肌生长发育的负调控因子，其基因的缺失或突变均会导致肌细胞的增生和肌纤维的肥大，是目前研究发现的影响畜禽生长性能的重要因子之一。

山羊MSTN基因多态性与主要经济性状的关联分析

山羊MSTN基因多态性与主要经济性状的关联分析闵令江;丰艳妮;李兰;李美玉【期刊名称】《畜牧兽医学报》【年(卷),期】2015(0)9【摘要】为研究山羊生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因的多态性及其与主要经济性状的关系,以山羊为材料,利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测了MSTN基因的多态性,分析了其群体遗传结构,并探讨了基因多态性与多个体重、体尺及屠体性状的关系.结果表明,MSTN基因5'调控区-662 bp处C→T转换导致7个群体有Taq Ⅰ多态,表现CC、CT、TT 3种基因型.波尔山羊CC基因型频率比3个地方品种的CC频率要高,而TT型相反.波尔山羊的等位基因C频率较T高,而地方品种T 比C高.除纯种波尔山羊外,其他5个群体均处于Hardy-Wein-berg非平衡状态(P ＜0.01);SSCP检测外显子3后发现,7个群体均存在NN、NM、MM 3种基因型,均没有CT-NN和CT-NM型个体,并且在波尔山羊中也没TT-NN和TT-NM型,F1也没有TT-NM型,3个地方品种中也未检测到TT-MM型个体.MSTN基因的5'调控区对断奶重、净肉重有极显著影响(P＜0.01),CC型极显著或显著大于TT型;该位点与后躯肉重也有关(P＜0.01),但基因型间差异均不显著(P＞0.05).以上3个指标上均发现有CC＞CT＞TT的规律.同时该位点对肝重也有显著影响(P＜0.05),CT型显著大于TT型(P＜0.05).MSTN基因的外显子3对净肉重、后躯肉重和肝重有极显著效应(P＜0.01),MM极显著或显著地大于NN型,并且在数值上表现为MM＞NM＞NN;5'调控区和外显子3的交互作用对断奶重、后躯肉重和肝重有显著影响(P＜0.05),CC-MM型比其他组合基因型表现更重的断奶重、后躯肉重和肝重.以上结果表明:MSTN基因的5'调控区和外显子3的不同分子特征,可用于山羊相应肉用性状的分子标记辅助选择,加速育种进程.【总页数】10页(P1515-1524)【作者】闵令江;丰艳妮;李兰;李美玉【作者单位】青岛农业大学动物科技学院,青岛266109;青岛农业大学动物科技学院,青岛266109;青岛农业大学动物科技学院,青岛266109;青岛农业大学动物科技学院,青岛266109【正文语种】中文【中图分类】S827;S813.3【相关文献】1.绵羊CLPG和MSTN基因多态性及其与生长性状的关联分析 [J], 胡师金;张淑珍;袁泽湖;轩俊丽;马晓萌;张莉;赵福平;魏彩虹;杜立新2.草鱼MSTN-1基因多态性及与早期生长性状和肌肉成分关联分析 [J], 张猛;陈勇;沈玉帮;傅建军;徐晓雁;孙俊龙;胡默俨;李家乐3.特哈杂交羔羊MSTN基因多态性与体重、体尺关联分析 [J], 吐来力江·哈木太; 刘宜勇; 郭小萍; 杨光维; 刘建明; 陈春华4.济宁青山羊PRLR基因的多态性及其与主要经济性状的关联分析 [J], 张圆;袁婧;高一珊;康贝宁;李增宽;赵勇;闵令江5.东佛里生羊MSTN基因多态性及其与生长性状的关联分析 [J], 张磊;李丹妮;王钰晨;杨丽春;何静;宋宇轩因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

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对该序列进行多态性分析。结果表明：ＥＰＲ扩增片段２７ｂ处存在唧０ｐ
合野生型（）从为优势基因型，杂合型（Ｂ和纯合突变型（Ｂ为非优势基因型，Ａ）Ｂ）Ａ等位基因为优势基因；黔北麻羊纯合野生型（ｃ为优势基因型，ｃ）杂合型（Ｄ和纯合突变型（Ｄ为非优势基因型，Ｃ）Ｄ）ｃ等位基因为优势基因。关键词：贵州黑山羊；黔北麻羊；ＳＮ基因；Ｃ —ＦＰ多态性ＭＴＰＲＲＬ；
自从Ｍｈｒｎ等首次在小鼠骨骼肌中发现了ｃＰｅｏｒＭＳＮ基因并确定其表达产物具有特异的抑制骨骼Ｔ肌生长发育的功能以来… ，已有众多国内外学者对猪、 ’ 、牛一羊 ’ 鸡 ’ｌ、。和鱼的ＭＳＮ基因Ｔ做了大量研究，并发现其多态性与动物生长发育有极显著相关性。但到目前为止，贵州黑山羊和黔对北麻羊ＭＳＮ基因Ｄａ酶切多态性的研究未见报ＴｒＩ
西
南
农２５卷１期
Ｖ０５Ｌ２Ｎｏ１．
ＳｕｈｓｉａＪｕｎａｆＡｇｉｕｔｒｌＳｉｎｅｏｔｗｅｔＣｈｎｏｒｌｏｒｌａｃｅｃｓｃｕ
文章编号：０１— ８９２１）１２２４１０４２（０２０ —０８一ｏ
中图分类号：８７Ｓ２文献标识码：Ａ
ＰｏｙｏｐｉｍａｙｉｆＭＳｌｍｒｈｓＡｎｌｓｓｏＴＮｎｇｓｅｔＧｅｅＤｉｅｔｄｗｉｈ
ＤｒＩｏｉｈｕＢａｋＧｏｔａｄＱｉｎｅａａｆＧｕｚｏｌｃａｎａｂｉＭａＧｏｔ
ｇａＷｄａｔｇｅｏｐｈｌｅｒｚｇｕｐＡａｄｈｍｚｇｕｕａｔｙｅ（Ｂｅｅｄｓｄａｔｇｅｏｙｅ．ｅｅｗｇａｏｔａａｖｎａｅｇｎｔｅｉｈｔｏｙｏｓｙｅ（Ｂ）ｏｏｙｏｓｍｔｎｐＢ）ｗｒｉｖａｅｇｎｔｓＡｇｎａｇｙｗｅｅｔｎｔａｎｐ
ＡｂｔａｔＢａｋＣａｎｉｎｅｏｔｅｅｔｅｓｔｒｌｉｉｕｙｒｒｗｓｄｓｎｄｂｓｄｏｏｔＭＳＮｇｎｔｅｓｒｃ：ｌｃｏｔｄＱａｂｉＧａｗｒｋｎａｅａｔｓｔａ，ａｐｍｅａｅｉｅａｅｎｇａｓ＇ｅｅｃ８－ａＭａａｍａｉｓｎｈｓｉｇＩｉｑｅｃｓＧｎａｋｒｇｔｔｎｎｍｅ：Ｅ５８３）ａｄＰＲＲＬｅｈｄｗｇｕｅｏａａｙｅｔｅｓｑｅｃｓｐｌｒｈｓＴｅｒｓｌｕｎｅ（ｅＢｎｉｒｉｕｂｒＦ８０５，ｎＣ・ＦＰｍｔｏａｓｄｔｎｌｚｅｕｎｅｏｙｐｉｅｓａｏｈｍｏｍ．ｈｕｔｅｓ
ｐｏｏｅｅｒｔｇｎ；ＭｅｗｈｌｈｍｏｙｏｓｗｌｐｆｉｂｉＭａＧａ（Ｃ）Ｗ８ａｖｔｅｇｎｔｐｉｅｅｙｏｓｙｅ（Ｄ）ｄｈｍｚ－ｎａｉｏｚｇｕｉｔｅｏａｅｅｄｙＱｎｏｔＣ８ｄａａｅｏｅｗｈｌｈｔｍｚｇｕｐＣａｏｏｙｎｇｙｅｔｎｇｕｕａｔｙｅｆ）ｏｓｍｔｎｔＤＤｐｄｓｄａｔｅｇｎｔｐｓａｄＣｇｎａｍｔｇｎ．ｉｖａｅｏｅｎｅｅｗｇａｐｏｅｅａｎｇｙ
Ｋｅｒｓ：ａＭＳＮｅｅ；ＰＣＲＦＬｙｗｏｄＧｏｔ；ＴｇｎＲ・Ｐ；Ｐｌｍｏｐｉｍｏｙｒｈｓ
肌肉生长抑制素（ｙｓｔＭＳＮ）Ｍｏｔｉａｎ，Ｔ属于转化生
长因子一（ｒｎｆｍｉｒｔａｔｅ，Ｇ．）１ＴａｓｒｎＧｏｈＦｃｒｂｔＴＦＢ３ｏｇｗｏａ
道。为此，笔者采用ＰＲＲＬＣ —ＦＰ方法分析贵州黑山
超家族成员，是一种在骨骼肌中广泛存在的糖蛋白。
羊和黔北麻羊ＭＴＳＮ基因５侧翼区的遗传多态性，为研究ＭＴＳＮ基因与山羊生长性能相关的多态性位点提供分子遗传学资料，同时为其选育提供理论基础。
ｓｏｄｈｔｔｅ唧ｈｗｅｔａｈ＾ｉｓｒｘｓｅｎ２７ｂ１ｄｔｅｅｒｅｃａｎｙｏｙｒｈｓｓｔ．ｍｏｙｏｓｗｉｙｆｂａｋｎｅｔｉｔｉ０ｐ．ｅｏｔｍｅｇｎｅｏａＤｒＩｅｚｍｅｐｌｍｏｐｉｍｉＨｏｚｇｕｌｔｐｅｏｌｃｅｄｈｆｅｄ
ＦＮＧＨｉｉＳＩｈｏｙｎ，ＩＮＸｎ－ｕ‘，ＵＹｅｘｕＺｉｇＬＵＲｏｙＥｕ－，Ｈａ－ｉｇＴＡｉｇｇｉＱｕ－ｉ，ＨＵＸｎ。Ｉｕ－ｕｌＺ
（ｏｌｅｏｉａＳｉｃ，ｕｚｏｎｖｒｔ，ｕｚｏｕｙｎ５０５，ｈｎ）ＣｌｇｆｍｌｃｅｅＧｉｕＵｉｅｓｙＧｉｕＧｉａｇ５０２ＣｉｅＡｎｎｈｉｈａ
贵州黑山羊和黔北麻羊ＭＴＳＮ基因Ｄａ酶切多态性分析ｒＩ
冯会利，照应，石田兴贵，月秀，曲主性，若余刘
（贵州大学动物科学学院，贵州贵阳５Ｏ２）５０５
摘
要：以贵州黑山羊和黔北麻羊为材料，根据山羊ＭＴＳＮ基因序列（ｎａｋ登录号：Ｆ８０５设计ｌ对引物，ＰＲＩＰ法ｏＧＢｎＥ５８３）用Ｃ－Ｌ＾的插入，导致出现１Ｄａ酶切多态性位点，个ｒＩ黑山羊纯