申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白的结构分析与功能预测

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ＨＵＡＮＧＨｕｉｑｕ，Ｚａ— ｉ ’ ＨＯＮＧＺＹｉ，ＨＡＯＪｎ。ＨＡＮＧＪｎＵＮＪｕｆｎＺｉｇ，Ｚｉｇ，Ｓｉ—ｅｇ，ＨＡＮＧＸｉｏｈｉ，ａ－ｕＹＵＡＮＬ —ａｉｎｙ
（．ｅａｍｎｅｍａｌｇｎｅｅｅｌｙＴｅｈｒｆｌｔｏｐｔ，ｕａｓｎＵｉｒｔ，ｕｎｚｏ１６０Ｃｉａ１ｐｒｅｔｆｒｔｏｙｄＶｎｒｏｇ，ｈｉＡｆｉｅＨｓｉｌＳｎＹｔｅｎｅｓｙＧａｇｈｕ５０３，ｈｎ；ＤｔｏＤｏａｏＴｄｉａｄａ — ｖｉ
中图分类号：３９９Ｒ７．文献标志码：Ａ文章编号：６２３５（０２０ — ４４０１７ —５４２１）０５ — ６４
ＭｏｅｕｌｒＳｒｔｅＡｎｌｓｓａｌｃａｔｕｃｕｒａｙｉｎｄＦｕｎｔｏｅｃｉｎｏＳｒｔｒｘｓｈｅｃｉｃｉｎＰｒｄｉｔｏｎｐｏｏｈｉｃｎｋｉＴｒｎｌｔｏＩｎｒｌｅｍｏｏｅｎａｓａｉｎａｌＣｏｔｏｌｄＴｕｙｒＰｒｔｉ
信息学分析软件包，申克孢子丝菌全长ｃＮ从ＤＡ质粒文库中识别ＴＴＣＰ的基因及其编码区，析、分预测该基凶编码的蛋白结
构特征和功能。【果】ＴＴ结ＣＰ基因全长６１ｐ２，编码区具有２７氨基酸。在Ｇｎａｋ同源序列巾，其与蓝菌属真菌ｂ０个ｅＢｎ
ＴＴ进化关系最近。【ＣＰ结论】应用生物信息方法筛选出申克孢子丝菌ＴＴ的ｃＮｃＰＤＡ全长序列并预测其结构与功能、潜在抗
原表位，为进一步实验研究该蛋白生物学特性提供了依据。关键词：申克孢子丝菌；翻译控制肿瘤蛋白（ＣＰ；ＴＴ）生物信息学
５０４）１０５
摘
要：【目的】ｃＮ从ＤＡ中识别申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白（ＣＰ的基因并分析预测其结构功能和应用前ＴＴ）
景。【方法】利用ＮＢ和ＥＰＳＣＩｘＡｙ网站中的各种基因和蛋白的序列结构信息分析Ｔ具，结合ＤＡｔ和ＶｅｒＴｕｔＮｓｒａｅｔＮＩｉｏｓｅ生物
第３３卷
２１０２年
第４期
７月
中山大学学报（医学科学版）
ＪＵＮＬＯＵＡ．ＥＮＶＲＩＹＭＤＣＬＳＩＮＥ）ＯＲＡＦＳＮＹＴＳＮＵＩＥＳＴ（ＥＩＡＣＥＣＳ
Ｖｏ．３Ｎｏ．Ｉ３４
Ｊ１２１ｕ．０２
（ｒｓａｎ。ａｉｍ）ＣＰ氨基酸序列一致性达到７％。理论预测分子质量为６５１ｕＧｏｍｎｉｌｇ。ｙｅＴＴ８４８．ｋ。无质体和线粒体定位序列。预４
测结果显示编码蛋白含有１跨膜区、亲水性部位和５个主要Ｂ细胞表位。与蓝菌属真菌及球毛壳霉（．ｏｏｕ的个７个Ｃｇｂｓｍ）ｌ
２．ｅａｔｎｆｒቤተ መጻሕፍቲ ባይዱａｏｏｙａｄＶｅｅｅｌｇＤｐｒｍｅｔｍｔｌｇｎｎｒｏｏｙ，ＳｎＹａ— ｅｍｏｉｌｓｉｌｕｔｓｎＵｎｖｒｉｏＤｅｕｔｓｎＭｅｒａＨｏｐｔ，ＳｎＹａ —ｅｉｅｓｔａｙ，Ｇａｇｈｕ５０２ｕｎｚｏ１１０，Ｃｉａｈｎ；３ＤｅａｔｎｆＰｒｓｔｌｇ，ＳｎＹａ —ｅｉｅｓｙ．ｐｒｍｅｔｏａａｉｏｙｕｔｓｎＵｎｖｒｉ，Ｇｕｎｚｏ１０９，Ｃｉａ．ａｇｏｇＳｉｓａｅａｄＳＤＰｅｅｔｎｏｔａｇｈｕ５０８ｈｎ；４ＧｕｎｄｎｋｎＤｉｓｎＴｒｖｎｉｅｏ
申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白的结构分析与功能预测
黄怀球，钟毅，赵静，张静，孙九峰，张晓辉，袁立燕
（．１中山大学附属第三医院皮肤性病科，广东广州５０３；．１６０２中山大学附属孙逸仙纪念医院皮肤性病科，广东广州５０２；１１０３中山大学中山医学院热带病防治研究教育部重点实验室，．广东广州５０８；．东省皮肤病防治研究所，１００４广广东Ｆ，－，ＪＩ ’ Ｉ
Ｉｓｔｔ，ｕｎｚｏ１０５Ｃｉ）ｎｔｕｅＧａｇｈｕ５０４，ｈｎｉａ
Ａｓａｔ【ｂｃｖ】ｈｒｃｒａｄｒｅｉｏｔｎｏｉｏｉｏｔａｓｔｎｌｎｏｅｔｏｐｔｎ（ＣＰｂｔｃ：ＯｊｔｅＴｅｔｔｅｎｏｒｅａｕｅｃｄｇｒｅｅｒｌｉａｙｏｔｌｄｕｒｒｅＴＴ）ｒｅｉｓｕｕｐｐｔｓｂｎｐｔｎｆｈｔｎａｏｌｃｒｌｍｏｉｆｍｏｔｉｓｈｎｋｅａｚｄｐｄｔｙｉｎｒａｃ．【ｅｏｓＡｆｌｅｇＮｑｅｃｃｄｇＣＰｒｒｈｘｃｅｃｉｗｒａｌｅａｒｉｅｂｏｆｍｔｓｏｏｒｉｅｎｙｄｎｅｃｄｂｉｏｉＭｔｄ】ｌｌｔｃＡｓｕｎｅｎｏｉＴｈｕ —ｎｈＤｅｅｎｒ